-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

FR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

French

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Extraction d’acides désoxyribonucléiques par génome entier à partir d’espèces de Mycobacteriu...
Extraction d’acides désoxyribonucléiques par génome entier à partir d’espèces de Mycobacteriu...
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Whole-Genome Deoxyribonucleic Acid Extraction from Mycobacterium Species via the Cetyltrimethylammonium Bromide Technique

Extraction d’acides désoxyribonucléiques par génome entier à partir d’espèces de Mycobacterium via la technique du bromure de cétyltriméthylammonium

Full Text
950 Views
06:46 min
December 12, 2025

DOI: 10.3791/68409-v

Shatha Omar1, Brendon Mann1

1DST/NRF Centre of Excellence for Biomedical Tuberculosis Research, South African Medical Research Council (SAMRC), Centre for Tuberculosis Research, Division of Molecular Biology and Human Genetics, Faculty of Medicine and Health Sciences,Stellenbosch University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study addresses the challenges of extracting high-quality DNA from mycobacteria, particularly due to their robust cell walls composed of mycolic acids. The main outcome is the CTAB method, which effectively produces DNA suitable for various molecular studies.

Key Study Components

Research Area

  • Genetic characterization of mycobacteria
  • Mycobacterial diseases and interactions in co-infections
  • Pathogenic speciation and drug resistance

Background

  • Mycobacteria have structurally complex and tough cell walls, complicating DNA extraction.
  • Focus on nontuberculosis mycobacteria and their relationship with tuberculosis.
  • Challenges faced in extracting DNA due to lipid-rich cell walls.

Methods Used

  • CTAB method for DNA extraction
  • Mycobacterial species as the biological system
  • Enzymatic digestion and organic extraction techniques

Main Results

  • Yield of DNA ranged from 190 to 600 nanograms per microliter with high purity ratios.
  • Visualization of intact high molecular weight DNA through gel electrophoresis.
  • Some species yielded lower DNA amounts indicating variations in extraction efficiency.

Conclusions

  • The study establishes a reliable method for extracting high-quality DNA from mycobacteria.
  • This methodology enhances the potential for further research into mycobacterial genetics and diseases.

Frequently Asked Questions

What are mycobacteria?
Mycobacteria are a group of bacteria, some of which are pathogenic and responsible for diseases such as tuberculosis.
Why is DNA extraction from mycobacteria challenging?
Their thick, lipid-rich cell walls make it difficult to effectively lyse the cells and release genomic DNA.
What is the CTAB method?
The CTAB method is a protocol for extracting DNA that involves enzymatic digestion and organic extraction techniques.
How does the quality of extracted DNA ensure reliability in research?
High-quality DNA is essential for accurate sequencing and molecular studies, ensuring reliable results in research.
What are the purity ratios achieved in this study?
The 260/280 absorbance ratio ranged between 1.9 and 2.0, and the 260/230 ratio ranged from 1.8 to 2.2, indicating high DNA purity.
What is the significance of this research?
This research contributes to improved methodologies for studying mycobacterial genetics and their associated diseases, enhancing our understanding and potential treatment pathways.

Ce protocole décrit la méthode CTAB pour extraire de l’ADN de haute qualité des mycobactéries, surmontant les défis posés par leurs parois cellulaires solides et riches en acide mycolique. Le processus implique la digestion enzymatique, la lyse cellulaire avec CTAB, et la purification de l’ADN par extraction organique et précipitation d’éthanol. Cette méthode produit de l’ADN adapté à des études moléculaires et fiable pour la recherche sur les mycobactériens.

Nos recherches portent sur la caractérisation génétique des espèces mycobactériennes et la nature complexe des maladies mycobactériennes chez l’humain. Nous accordons une attention particulière aux mycobactéries non tuberculeuses et à leurs interactions avec les macrophages lors de la coinfection avec d’autres espèces, en particulier la tuberculose. De plus, nous nous concentrons sur la spéciation des mycobactéries pathogènes, l’identification des gènes associés à la virulence, et le polymorphisme du nucléotide unique lié à la résistance aux médicaments.

En raison de la paroi cellulaire épaisse, lipidique et hydrophobe des mycobactéries, l’extraction d’ADN a été difficile et nécessite des techniques de lyse spécialisées pour les décomposer et libérer efficacement l’ADN génomique. Dans notre protocole, nous abordons l’extraction d’ADN d’espèces mycobactériennes en utilisant la méthode CTAB comme une méthode robuste et efficace pour produire un ADN de haute qualité, adapté à toutes les techniques de séquençage génomique et autres techniques moléculaires. Pour commencer, tuez la culture liquide prise dans un tube de 15 millilitres à 80 degrés Celsius pendant une heure.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biologie numéro 226

Related Videos

Extraction d'ADN de haut poids moléculaire génomique par les sols et sédiments

11:24

Extraction d'ADN de haut poids moléculaire génomique par les sols et sédiments

Related Videos

26.5K Views

Extraction d'ADN de haut poids moléculaire de tapis microbiens

09:30

Extraction d'ADN de haut poids moléculaire de tapis microbiens

Related Videos

20.1K Views

Préparation de l'échantillon de Mycobacterium tuberculosis Extraits pour Magnétique Nucléaire études métabolomiques résonance

07:56

Préparation de l'échantillon de Mycobacterium tuberculosis Extraits pour Magnétique Nucléaire études métabolomiques résonance

Related Videos

15.9K Views

Séparation par chromatographie sur couche mince de variants d’acide mycolique : une méthode pour séparer les lipides de la paroi cellulaire mycobactérienne en fonction de la polarité

03:26

Séparation par chromatographie sur couche mince de variants d’acide mycolique : une méthode pour séparer les lipides de la paroi cellulaire mycobactérienne en fonction de la polarité

Related Videos

1.7K Views

Identification de marqueurs de Virulence de Mycobacterium abscessus de réplication intracellulaire dans les Phagocytes

08:34

Identification de marqueurs de Virulence de Mycobacterium abscessus de réplication intracellulaire dans les Phagocytes

Related Videos

9.2K Views

Modélisation de la tuberculose chez Mycobacterium marinum adultes infectés poisson zèbre

07:00

Modélisation de la tuberculose chez Mycobacterium marinum adultes infectés poisson zèbre

Related Videos

11.3K Views

Analyse de la composition lipidique des mycobactéries par chromatographie sur couche mince

07:42

Analyse de la composition lipidique des mycobactéries par chromatographie sur couche mince

Related Videos

9.3K Views

Isolement, propagation et identification d’espèces bactériennes ayant des propriétés métabolisant les hydrocarbures dans les habitats aquatiques

10:03

Isolement, propagation et identification d’espèces bactériennes ayant des propriétés métabolisant les hydrocarbures dans les habitats aquatiques

Related Videos

5.4K Views

Extraction d’ADN mycobactérien à l’aide d’un battage de billes dans un tampon personnalisé suivi d’un flux de travail NGS

09:18

Extraction d’ADN mycobactérien à l’aide d’un battage de billes dans un tampon personnalisé suivi d’un flux de travail NGS

Related Videos

983 Views

Extraction d’ADN basée sur la matrice pour un séquençage ciblé de nouvelle génération sur des échantillons d’expectorations décontaminés

06:07

Extraction d’ADN basée sur la matrice pour un séquençage ciblé de nouvelle génération sur des échantillons d’expectorations décontaminés

Related Videos

1.3K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code