Name: Explorer les interactions protéine-glycane : progrès de la résonance magnétique nucléaire (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-26T14:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 7 s
Description: Découvrez les interactions protéine-glycane par RMN pour la biologie structurale en étudiant le complexe intégrine-disintégrine. Cette méthode révèle la dynamique structurale et les forces de surface régulant la stabilité moléculaire.

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<table><tbody><tr><td>Glucose 13C</td><td>Laboratoire isotopique de Cambrige.</td><td>CLM-481</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure d’ammonium 15N</td><td>Laboratoire isotopique de Cambrige.</td><td>NLM-467</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de calcium</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. C4901</td><td></td></tr><tr><td>Coquetel inhibe la protéase</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>4693159001</td><td></td></tr><tr><td>D2O</td><td>Laboratoire isotopique de Cambrige.</td><td>DLM-4</td><td></td></tr><tr><td>D-Mannose</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M2069-5G</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de magnésium</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Référence M8266</td><td></td></tr><tr><td>NMRPipe</td><td></td><td></td><td>Lien vers le tutoriel du logiciel : https://www.ibbr.umd.edu/nmrpipe/demo.html</td></tr><tr><td>Chlorure de potassium (K2HPO4)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. P3786</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de potassium (KCl)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. P3911</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de potassium (KH2PO4)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. P0662</td><td></td></tr><tr><td>Tube Shigemi</td><td>Bruker</td><td>Z1Z10684A</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de sodium (NaCl)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. S9625</td><td></td></tr><tr><td>Phosphate de sodium (Na2HPO4)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>567545</td><td></td></tr><tr><td>Phosphate de sodium (NaH2PO4)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. S97263</td><td></td></tr><tr><td>Spectromètre Bruker 600 MHz</td><td>Bruker</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Spectromètre Bruker 800 MHz</td><td>Bruker</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tiamine</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Réf. T1270</td><td></td></tr><tr><td>Sonde TXI à triple résonance</td><td>Bruker</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tryptone</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>93657</td><td></td></tr><tr><td>Extrait de levure</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Y1625</td><td></td></tr></tbody></table>

explorer les interactions protéine-glycane : progrès de la résonance magnétique nucléaire

Exploring Protein-Glycan Interactions: Advances in Nuclear Magnetic Resonance

Dans le présent travail, nous avons présenté des expériences de RMN pour étudier les interactions protéine-glycane. La reconnaissance moléculaire protéine-glycane sous-tend de nombreux processus biologiques impliquant la matrice extracellulaire (MEC), y compris la régulation de l’adhésion cellulaire, de la migration, de la prolifération et de diverses autres formes de communication cellulaire.
Ici, nous avons choisi de travailler avec le monosaccharide D-mannose, qui est décrit comme un liant ...

Explorer les interactions protéine-glycane : progrès de la résonance magnétique nucléaire

Protein-glycan interactions are central to many biological processes and are increasingly recognized as promising targets for diagnostic strategies in ...

Nous étudions les interactions protéine-protéine et protéine-glycane, en nous concentrant sur le complexe intégrine-désintégrine. Notre modèle explore la dynamique structurelle et met en évidence le rôle de la force de surface dans la médiation de la formation complexe et de la stabilité de l’interaction. Notre groupe se consacre à l’étude du rôle des forces de surface dans la reconnaissance moléculaire et l’évolution des sites de liaison en étudiant les amas hydrophobes de surface présents dans les protéines.La solution RMN permet de détecter les interactions protéiques. Bien que les interactions faibles soient essentielles à la vie, il existe un biais vers les complexes de haute affinité, même s’ils sont présents dans de nombreuses fonctions biologiques importantes. Notre groupe se concentre sur l’utilisation d’approches de biologie structurale intégrative pour étudier les grands complexes protéiques.Nous utilisons la RMN comme outil principal pour étudier la dynamique et les aspects fonctionnels. Pour commencer, préparez une solution de quatre millimolaires de D-mannose dans un tampon de phosphate de sodium à pH 7,4 avec 50 millimolaires de chlorure de sodium et 5 % d’oxyde de d

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Cette vidéo décrit la technique de spectroscopie par résonance magnétique nucléaire permettant d’étudier les interactions protéine-protéine entre 15 protéines d’envoplakine de type sauvage et mutantes 15N-marquées et la protéine vimentine non marquée. L’interaction réussie entre l’envoplakine de type sauvage et la vimentine conduit à un élargissement important des raies et à la disparition des pics dans les spectres RMN, tandis que l’absence d’interaction entre l’envoplakine mutée et la...

La résonance magnétique nucléaire pour étudier les interactions protéine-protéine au niveau atomique

Structures des assemblages supramoléculaires protéine à résolution atomique sont de grande importance en raison de leur rôle crucial dans une variété de phénomènes biologiques. Ici, nous présentons un protocole pour effectuer des études structurales à haute résolution sur des ensembles de protéines macromoléculaire insoluble et non cristalline par magie-angle spinning spectroscopie RMN à l’état solide (MAS SSNMR).

Échelle atomique des études structurales des assemblages macromoléculaires par spectroscopie RMN à l’état solide

Nous présentons ici un protocole pour la production et la purification des protéines qui sont marqués avec des isotopes stables et ultérieure caractérisation des interactions protéine-protéine à l’aide de la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) et micro-échelle Expériences de thermophorèse (MST).

Mesurer les Interactions des protéines globulaires et filamenteuses par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) et thermophorèse a petite Echelle (MST)

Ce protocole illustre comment explorer, comparer et interpréter les glycomes de protéines humaines avec des ressources en ligne.

Ressources bioinformatiques pour l’étude des interactions protéiques médiées par le glycane

Nous présentons ici un protocole détaillant l’acquisition, le traitement et l’analyse d’une série d’expériences RMN visant à caractériser les interactions protéine-glycane en solution. Les méthodologies les plus courantes basées sur les ligands et les protéines sont décrites, qui contribuent sans aucun doute aux domaines de la glycobiologie structurale et des études de reconnaissance moléculaire.

Démêler les interactions glycanes-protéines : la résonance magnétique nucléaire (RMN) à la rescousse

Nous décrivons ici une méthode pour identifier les phosphorylations multiples d’une protéine intrinsèquement désordonnée par spectroscopie par résonance magnétique nucléaire (RMN), en utilisant la protéine Tau comme étude de cas. La protéine Tau recombinante est enrichie isotopiquement et modifiée in vitro par une kinase avant l’acquisition et l’analyse des données.

Spectroscopie par résonance magnétique nucléaire pour l&#39;identification des phosphorylations multiples de protéines intrinsèquement désordonnées

flexibilité conformationnelle joue un rôle essentiel dans la fonction des protéines. Nous décrivons ici l'utilisation de la spectrométrie de masse à ionisation par électronébulisation couplée à l'échange hydrogène-deutérium résolue dans le temps pour sonder les changements structurels rapides qui favorisent la fonction des protéines ordonné et désordonné.

Résolue en temps d&#39;échange hydrogène Ionisation ElectroSpray-deuterium spectrométrie de masse pour l&#39;étude de la structure des protéines et dynamique

Un protocole pour la préparation de 13C,15échantillons fongiques et plantes marquées N pour la spectroscopie RMN à l’état solide multidimensionnelle et enquêtes de polarisation nucléaire dynamique (DNP) est présenté.

Préparation de champignons et de matières végétales pour l’élucidation de la structure dynamique de polarisation nucléaire RMN à l’état solide

Les interactions des facteurs de transcription (TF) avec la polymérase d'ARN sont habituellement étudiées utilisant des essais de retrait. Nous appliquons une technologie d'interférométrie biocouche (BLI) pour caractériser l'interaction de GrgA avec la polymérase d'ARN chlamydial. Par rapport aux essais de retrait, BLI détecte l'association et la dissociation en temps réel, offre une sensibilité plus élevée et est très quantitatif.

Application de biocouches interferométrie (BLI) pour étudier les interactions protéines-protéines dans la transcription

Fourni ici est un protocole pour étudier les interactions entre la forme indigène, préfibrillaire, et les fibrilles amyloïdes matures de différents peptides et protéines avec des mitochondries isolées de différents tissus et diverses zones du cerveau.

Interactions avec et perméabilisation des membranes des mitochondries cérébrales par amyloïde Fibrils

Découvrez les interactions protéine-glycane par RMN pour la biologie structurale en étudiant le complexe intégrine-disintégrine. Cette méthode révèle la dynamique structurale et les forces de surface régulant la stabilité moléculaire.

Explorer les interactions protéine-glycane : progrès de la résonance magnétique nucléaire

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