1. בדיקת נמק שריר Caenorhabditis elegans עם Aeromonas
הערה: כדי למנוע זיהום, יש לבצע את השלבים הללו במכסה זרימה למינרי.
- ביום שבו תולעי L1 מוזרעות על מדיום הצמיחה העשיר של נמטודות (ENGM) שהתפשט עם Escherichia coli OP50, יש לקטוף מושבה אחת מכל אחד מארבעת זני Aeromonas ו-E. coli OP50 ותרבית עם ציר 2 מ"ל Luria-Bertani (LB) כל אחד בטמפרטורה של 37°C למשך 16 שעות. הערה: כאן נעשה שימוש בזני החיידקים הבאים: E. coli OP50, מקור המזון הנורמלי של C. elegans. A. dhakensis AAK1, האיזול הקליני הפתוגני הראשון עם רצף מלא של A. dhakensis. A. hydrophila A2-066, A. veronii A2-007 ו-A. caviae A2-9307121 הם מבודדים קליניים מייצגים מבית החולים הלאומי צ'נג קונג.
- מדדו את ספיגתה-OD 600 של ציר החיידקים והתאימו את ציר החיידקיםל-OD 600 = 2.0 עם ציר LB. לאתר ולפיזר 30 מיקרו-ליטר של מרק חיידקים על פלטות NGM בגודל 6 ס"מ. תגדלו את הצלחות בטמפרטורת החדר במהלך הלילה.
- ביום שבו תולעי L1 גדלות לשלב L4, מעבירים 50 תולעים לכל לוח NGM עם כל אחד מארבעת זני Aeromonas או E. coli OP50. דגרו את לוחות ה-NGM בטמפרטורה של 20 מעלות צלזיוס. העבירו תולעים כל 24 שעות לצלחות NGM שהוכנו לאחרונה עם חיידקים.
- צלם תמונות שרירים באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי.
- תבחר באקראי 10 תולעים על ג'ל אגרוז 2% במידה M9 בינונית, על סלייד. השתק את התולעים באמצעות 2 מיקרוליטר נתרן 1% אזיד ב-M9 על אגרוז למשך פחות מ-5 דקות לפני צילום התמונה.
- הנח כיסוי וצילם את תמונות השרירים באמצעות פילטר חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) על מיקרוסקופ פלואורסצנטי עם מצלמת מכשיר עם מטען. צלם את תמונות השרירים ב-24, 48 ו-72 שעות אחרי שלב L4.
בצע ניתוח תמונה והכנת דמות באמצעות תוכנת עיבוד תמונה.
הערה: הגדרות הניקוד ורמות הנזק לשרירים מוצגות באיור 1, שבו הקריטריונים מפורטים כך: 3 נקודות על סיבי שריר חסרים; 2 נקודות עבור סיבי שריר קרועים או שבורים; נקודה אחת לסיבי שריר כפופים; 0 נקודות על סיבי שריר בריאים.