1. מיקרוסקופיית סורקת בלייזר קונפוקלי של ביופילם A. baumannii S1
1. לגדל תרבית של 5 מ"ל של A. baumannii S1 במשקל LB בטמפרטורה של 30 מעלות צלזיוס בתנור ניעור (220 סל"ד) למשך 16 שעות.
2. להתאים את תרבית A. baumannii S1 ל-OD600 הרצוי של 0.8. באמצעות μ-Dish עם תחתית זכוכית בקוטר 35 מ"מ, החריקו את תרבית החיידקים (דילול של 1:100) ל-LB טרי המכיל 30 מיקרוליטר של אנזים GKL מטוהר (40 מ"ג/מ"ל); הכרך הסופי של The New Culture הוא 1 מ"ל.
3. כסו את צלחת ה-μ במכסה והניחו אותה במיכל פלסטיק אטום בנפח 10 ליטר. דגור את צלחת ה-μ בטמפרטורה של 30 מעלות צלזיוס למשך 3 שעות לפני הסרת המדיה בעדינות. הוסיפו 30 מיקרוליטר של אנזים GKL מטוהר ומדיום טרי, ומביאים את הנפח הכולל ל-1 מ"ל. דגרו עוד 21 שעות בטמפרטורה של 30 מעלות צלזיוס.
4. חזור על שלב 1.3 ודגר את צלחת ה-μ לעוד 24 שעות בטמפרטורה של 30 מעלות צלזיוס. לאחר מכן, הסר את המדיה בעדינות.
5. הוסף 500 מיקרוליטר של אגלוטינין חיטה (WGA) של Alex Fluo 488-conjugated בנבט חיטה (WGA) מומס בתמיסת המלח המאוזנת של האנק (HBSS) לצלחת ודגור בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס למשך 30 דקות; זה יצבע את הביופילם שנוצר. הסר את תמיסת הכתמים ושוטף את μ-Dish ב-2 מ"ל HBSS. חזור על שלב הכביסה עוד פעם אחת.
6. להוסיף 500 מיקרוליטר של 3.7% פורמלדהיד מומס ב-HBSS ולדגור בטמפרטורה של 37°C למשך 30 דקות; זה יקבע את הביופילם על צלחת ה-μ. שטפו את ה-μDish פעם אחת עם 2 מ"ל HBSS ואז הסרו את התמיסה לגמרי. הצלחת μ המקובעת בביופילם יכולה להיאחסן בחושך בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס לפני הדמיית CLSM.
7. להדמיה וניתוח CLSM, השתמשו בהגדלה של פי 63 ליצירת 97 ערימות לכל תמונה עם מרווח של 0.21 מיקרון לכל מחסנית.