מאמר שיטה

טכנולוגיית אינטרפרומטריה ביו-שכבתית לזיהוי אינטראקציות בין ליגנד לאנליט

8 ביולי 2025

במאמר זה

תקציר

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

מקור: Desai, M., et al. יישום אינטרפרומטריה ביו-שכבתית (BLI) לחקר אינטראקציות חלבון-חלבון בשעתוק. J. Vis. Exp. (2019)

בסרטון זה, אנו מדגימים טכנולוגיית אינטרפרומטריה ביו-שכבתית (BLI) כדי לזהות את האינטראקציות הבין-מולקולריות בין ליגנדות ואנליטות מטרה בזמן אמת. BLI מודד שינויים בתבנית ההתאבכות של אור לבן המוחזר משכבה של ליגנדים משותקים על משטח ביו-סנסור בזמן שהם מתקשרים עם אנליטים בתמיסה.

פרוטוקול

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. הידרציה ביו-חיישנית והגדרת בדיקה

  1. הפעל את מכונת BLItz.
  2. ודא שההתקן מחובר למחשב באמצעות יציאת פלט נתונים מסוג USB בחלק האחורי של ההתקן.
  3. במחשב, פתח את התוכנה המשויכת (לדוגמה, BLItz Pro), ולחץ על Advanced Kinetics בצד שמאל של המסך.
  4. בתוכנה, הקלד את כל המידע המתאים על הניסוי (כולל שם הניסוי, תיאור, מזהה דגימה וריכוז חלבונים) תחת כל כותרת מתאימה.
  5. לחץ על Biosensor Type ובחר Ni-NTA מהתפריט הנפתח.
    1. תחת הכותרת הפעל הגדרות, ודא שה- Shaker מוגדר ל- Enable.
    2. תחת הכותרת רשימת סוג שלב, ודא שרשומים 5 פריטים: בסיס ראשוני, טעינה, קו בסיס, שיוך ודיסוציאציה.
      הערה: ניתן לשנות את משך הזמן של כל שלב מברירת המחדל לפי הצורך. לקבלת תוצאות מיטביות, השתמש במינימום של 30 שניות עבור 'תוכנית בסיסית ראשונית' ו'קו בסיס'; ו-120 שניות להתאגדות ודיסוציאציה. משך שלב ההעמסה (בין 120 ל-240 שניות) יהיה תלוי בריכוז הליגנד ובזיקה של תג ה-His-epitope על הליגנד ל-Ni-NTA-biosensor.
  6. הסר את הביו-חיישן Ni-NTA הלח מצינור ה-PCR והצמיד אותו לתושבת הביו-חיישן במכשיר על-ידי החלקת החלק הרחב של הביו-חיישן אל התושב.
    הערה: אל תתנו לביו-חיישן להתייבש במהלך הניסוי.
  7. מניחים צינור מיקרוצנטריפוגה שחור 0.5 מ"ל לתוך מחזיק הצינור של המכונה ופיפטה 400μL של חיץ BLI לתוכו.
  8. ודא שהמחוון של ההתקן ממוקם כך שמחזיק הצינור ממוקם לפני החץ השחור במכשיר.
  9. סגור את מכסה המכונה כך שקצה החיישן הביולוגי יהיה שקוע במאגר בצינור המיקרוצנטריפוגה.
  10. לחץ על הבא בתוכנה כדי להתחיל להקליט את הבסיס הראשוני.

2. העמסת ליגנד על ביוסנסור

  1. לאחר סיום ההקלטה של שלב הבסיס הראשוני, פתח את מכסה המכשיר.
  2. הזז את המחוון ימינה כך שמחזיק השחרור (במקום מחזיק הצינור) ימוקם לפני החץ השחור.
  3. פיפטה 4 μL של ליגנד מחויג His-tagged על מחזיק הטיפה ולסגור את המכסה של המכונה.
    הערה: הריכוז האופטימלי של הליגנד שבו יש להשתמש עשוי להשתנות עבור כל חלבון. ריכוז בין 1.0 ל-2.0 מ"ג/מ"ל מספיק בדרך כלל כדי להרוות את נת"ע בקצה הביוסנסור ב-240 שניות.
  4. בתוכנה, לחץ על הבא כדי להתחיל בטעינה.

3. שטיפת ליגנד נוסף

  1. לאחר שלב הטעינה סיים את ההקלטה, פתח את מכסה המכשיר.
  2. הזז את המחוון שמאלה כך שמחזיק הצינור ימוקם שוב לפני החץ השחור.
  3. סגור את מכסה המכונה וודא שקצה החיישן הביולוגי שקוע במאגר ה- BLI של הצינור במחזיק הצינור
  4. .
  5. לחץ על הבא שוב בתוכנה כדי להתחיל להקליט את קו הבסיס.

4. שיוך אנליטי לליגנד

  1. לאחר סיום ההקלטה של שלב הבסיס, פתח את מכסה המכשיר.
  2. הסר את מחזיק הטיפות ונקה אותו על ידי הוצאת כל חלבון ושטיפתו במים דה-יוניים כפולים (ddH2O) בסך הכל 5 פעמים.
    1. השתמשו במגבון טישו כדי לנקות את פני השטח של מחזיק הטיפות לאחר הכביסה.
  3. החלף את מחזיק הטיפה בחזרה למכשיר.
  4. הזז את המחוון במכשיר ימינה כך שמחזיק השחרור ימוקם שוב לפני החץ השחור.
  5. פיפטה 4 μL של אנליט מחויג על מחזיק הטיפה ולסגור את המכסה של המכונה.
  6. בתוכנה, לחץ על הבא כדי להתחיל שיוך.

5. דיסוציאציה של אנליט מליגנד

  1. לאחר ששלב ההתאגדות סיים את ההקלטה, פתח את עטיפת המכונה.
  2. הזז את המחוון במכונה ימינה כך שמחזיק הצינור ימוקם שוב לפני החץ השחור.
  3. בתוכנה, לחץ על הבא כדי להתחיל בדיסוציאציה.
  4. לאחר ששלב הדיסוציאציה סיים את ההקלטה, פתח את עטיפת המכונה.
  5. הסר את מחזיק הטיפות ואת מחזיק הצינורות.
  6. שטפו את שניהם עם ddH2O ביסודיות כדי לשטוף כל חלבון.
  7. הסר את החיישן הביולוגי והשלך אותו בבטחה.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
לא הוכרז על ניגוד עניינים.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
מכונת BLItzForteBio45-5000מכשיר
טבילה וקריאה של מגש ביוסנסור Ni-NTAForteBio18-5101ביו-חיישנים מוכנים לשימוש של Ni-NTA עבור חלבונים המתויגים בפולי-היס
מחזיק טיפהForteBio45-5004מכשיר
צינורות PCR (0.2 מ"ל)תומאס סיינטיפיקCLS6571כלי פלסטיק
צינורות מיקרוצנטריפוגות (שחור)תרמו פישר סיינטיפיק03-391-166כלי פלסטיק
מגבוניםתרמו פישר סיינטיפיק06-666אכלי פלסטיק
DTTתרמו פישר סיינטיפיק₪2000כימי
EDTAMilliporeSigmaE6758כימי
MgCl2MilliporeSigmaM8266כימי
NaClMilliporeSigmaS9888כימי
Tris-HClגולדביוT095100מאגר

הדפסות חוזרות והרשאות

בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה

בקש הרשאה

תגיות

Ni NTABLIBLItz

מאמרים קשורים