| 1% BSA (ללא רב) | פישר סיינטיפיק | BP1600-100 | למטרה זו (חסימת תאי TIRF), BSA מושעה מחדש ב- ddH20 ומסונן דרך מסנן 0.22 מיקרומטר. |
| 1× BRB80 | תוצרת בית | | 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 עם KOH |
| 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 עם KOH | Sigma Aldrich Inc , סנט לואיס, מיזורי | G2133-50KU | בשילוב עם קטלאז, aliquot ולאחסן ב -80 oC עד לשימוש |
| 100 מיקרומטר טובולין | Cytoskeleton Inc, דנוור, קולורדו | T240 | טובולינים תוצרת בית יש למחזר לפני השימוש כדי להסיר טובולין לא כשיר פילמור (Hyman et al. (1992)29; לי ומור (2020)30 ). טובולינים הזמינים מסחרית הם לעתים קרובות מדוללים מדי למחזור אך מתפקדים היטב אם הם מושהים מחדש בהתאם להוראות היצרן ומנוקים מראש באמצעות אולטרה-צנטריפוגה (278,000 × גרם) למשך 60 דקות, לפני השימוש. |
| 100 מילימטר ATP | גולד ביוטכנולוגיה בע"מ, אוליבט, מיזורי | א-08 | מושעה מחדש ב-ddH20 (pH 7.5) ומעוקר מסנן. |
| 100 מילימטר GTP | פישר סיינטיפיק | AC226250010 | מושעה מחדש ב-1× BRB80 (pH 6.8) ומעוקר בסינון. |
| לייזר מצב מוצק של 120-150 mW | לייקה מיקרוסיסטמס | 11889151 11889148 | |
| 2 מ"ג/מ"ל קטלאז | Sigma Aldrich Inc , סנט לואיס, מיזורי | C40-100 | בשילוב עם גלוקוז אוקסידאז, aliquot ולאחסן ב -80 oC עד לשימוש |
| 2× חיץ TIRF | הומאד | | 2× BRB80, 100 mM KCl, 20 mM DTT, 80 mM גלוקוז, 0.5% (v/v) methylcellulose (4,000 cp); הערה: 1 μL של 0.1M GTP ו-1 μL של 0.1M ATP נוספו בנפרד לתגובות TIRF כדי למנוע מחזורי הקפאה-הפשרה חוזרים ונשנים. |
| 24 × 60 מ"מ, #1.5 זכוכית כיסוי | פישר סיינטיפיק, וולת'הם, מסצ'וסטס | 22-266882 | יש לשטוף את זכוכית הכיסוי באופן נרחב לפני השימוש (Smith et al. (2014)22 ) |
| בלוק חום של 37 מעלות צלזיוס | | | |
| אמבט מים 37 מעלות | | | |
| 5 מ"ג/מ"ל סטרפטווידין (600x מלאי) | Avantor , פילדלפיה, PA | RLS000-01 | מושעה מחדש ב-Tris-HCl (pH 8.8); יש לדלל את ה-aliquot ל-1× במאגר HEK ביום השימוש |
| 5 דקות שרף אפוקסי ומקשה | Loctite , רוקי היל, קונטיקט | 1365736 | שילוב של שרף וקשיח עשוי להימשך עד 30 דקות לריפוי. |
| 50% זרעי מיקרוטובולה ביוטינילציה-GpCpp | Cytoskeleton Inc; תוצרת בית | T333P | (אופציונלי) זרעי מיקרוטובולים מיוצבים GppCpp או Taxol יכולים לתווך פילמור מיקרוטובולי בצורה יעילה יותר. טקסול ו-GppCpp מייצבים מיקרוטובולים בדרכים שונות שיכולות להשפיע על מבנה סריג המיקרוטובולים ועל יכולתם של חלבוני בקרה מסוימים להיקשר לחלק המיוצב של המיקרוטובול. שיטה לייצור סוגים שונים של זרעי מיקרוטובול מתוארת ב- Hyman et al. (1992). |
| אינקובטור 70 C | | | |
| מלאי תמהיל אקטין | תוצרת בית; פרוטוקול זה | | תערובת אקטין של 12.5 מיקרומטר המורכבת מאקטין מסומן (פלואורסצנטי וביוטינילציה) ואקטין לא מסומן עבור עד שש תגובות. 2 μL של מלאי משמש בתגובת TIRF הסופית. הריכוז הסופי של אקטין המשמש בכל תגובה הוא 0.5 מיקרומטר (10% Alexa-647; 0.09% מסומן ביוטין). |
| פקדי מאגר מתאימים | תוצרת בית | | שילוב של חוצצים מכל החלבונים המוערכים |
| ביוטין-PEG-סילאן (MW 3,400) | Laysan ביו Inc | ביוטין-PEG-SIL-3400 | ניתן ל-2-5 מ"ג aliquots, ממולא בחזרה בחנקן, פרפילם סגור, ומאוחסן ב -20 C עם חומר מייבש עד לשימוש |
| אקטין ביוטינילציה | Cytoskeleton Inc; תוצרת בית | AB07 | ביוטין-אקטין מיוצר על-ידי סימון על שאריות ליזין ולכן מניחים שהוא מסומן לפחות ב-100%, אבל משתנה עם כמויות גדולות / תכשירים שונים. ריכוזי אקטין אופטימליים של ביוטינילציה חייבים להיקבע אמפירית לשימושים מסוימים/תכנונים ניסיוניים. ריכוזים גבוהים יותר מאפשרים מעקב יעיל יותר, אך עלולים לעכב פילמור או אינטראקציות עם חלבונים רגולטוריים. כאן, אחוז קטן (0.09% או 900 pM) אקטין biotinylated נוכח בתגובת TIRF הסופית. |
| סבון כלים | שחר, פרוקטר אנד גמבל, סינסינטי, אוהיו | | מסיבות לא ידועות, הגרסה הכחולה מנקה את החלקות הכיסוי ביעילות רבה יותר מאשר צבעים זמינים אחרים. |
| קרח יבש | | | |
| אקטין מסומן באופן פלואורסצנטי | Cytoskeleton Inc; תוצרת בית | AR05 | אקטין תוצרת בית המסומן באופן פלואורסצנטי מאוחסן במאגר G בתוספת 50% גליצרול ב -20 C (Spudich et al. (1971) 47; Liu et al. (2022)48 ). אקטין עם תווית פלואורסצנטית מחויג כנגד חיץ G ומנוקה מראש באמצעות אולטרה-צנטריפוגה למשך 60 דקות במהירות של 278,000 × גרם לפני השימוש. |
| טובולין מסומן באופן פלואורסצנטי | Cytoskeleton Inc | TL488M, TLA590M, TL670M | משהה מחדש ב-20 μL 1× BRB80 (ריכוז סופי של 10 מיקרומטר) ומנוקה מראש באמצעות אולטרה-צנטריפוגה (278,000 × גרם) למשך 60 דקות, לפני השימוש. |
| חיץ G | תוצרת בית | | 3 mM Tris-HCl (pH 8.0), 0.2 mM CaCl2, 0.5 mM DTT, 0.2 mM ATP |
| HEK Buffer | תוצרת בית | | 20 mM HEPES (pH 7.5), 1 mM EDTA (pH 8.0), 50 mM KCl |
| קרח | | | |
| דלי קרח | | | |
| תא הדמיה | IBIDI , פיצ'בורג, ויסקונסין | 80666 | הזמינו תאים ללא תחתית לשימוש בציפויי כיסוי שונים |
| מצלמת EMCCD iXon Life 897 | אנדור, בלפסט, צפון אירלנד | 8114137 | |
| תוכנת מיקרוסקופ LASX Premium | לייקה מיקרוסיסטמס | 8114137 | |
| מתילצלולוז (4,000 cp) | סיגמא אולדריץ' בע"מ | M0512 | |
| בסיס מיקרוסקופ מצויד במודול TIRF | Leica Microsystems, Wetzlar, גרמניה | 11889146 | |
| mPEG-silane (MW 2,000) | | | |