RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Sarah H. Shahmoradian1, Mauricio R. Galiano2, Chengbiao Wu3, Shurui Chen4, Matthew N. Rasband2, William C. Mobley3, Wah Chiu4
1Department of Molecular Physiology and Biophysics,Baylor College of Medicine, 2Department of Neuroscience,Baylor College of Medicine, 3Department of Neuroscience,University of California at San Diego, 4National Center for Macromolecular Imaging, Verna and Marrs McLean Department of Biochemistry and Molecular Biology,Baylor College of Medicine
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
כדי לשמר את התהליכים עצביים לניתוח ultrastructural, אנו מתארים פרוטוקול לציפוי של נוירונים העיקרי ברשתות במיקרוסקופ אלקטרונים ואחרי הבזק הקפאה, מניב דגימות טהורים בשכבה של קרח זגוגי. ניתן לבחון דגימות אלה עם מיקרוסקופ אלקטרונים cryo-לדמיין מבנים בקנה המידה ננומטרי.
Neurites, גם דנדריטים ואקסונים, הם תהליכים תאיים עצביים המאפשרים ההולכה של דחפים חשמליים בין תאי עצב. הגדרת המבנה של neurites היא קריטית להבנה כיצד תהליכים אלה להעביר חומרים ואותות שתומכים בתקשורת הסינפטי. במיקרוסקופ אלקטרונים (EM) כבר משמש באופן מסורתי כדי להעריך את תכונות ultrastructural בתוך neurites, עם זאת, החשיפה לממס אורגני במהלך התייבשות והטבעת שרף יכולה לעוות מבנים. מטרה שלא סופקו חשובה היא גיבוש נהלים המאפשרים להערכות מבניות אינם מושפעות מממצאים כאלה. הנה, הקמנו פרוטוקול מפורט ולשעתק לגידול וneurites כל הקפאה-הבזק של נוירונים עיקרי שונה ברשתות במיקרוסקופ אלקטרונים ואחרי הבדיקה שלהם עם טומוגרפיה האלקטרונים cryo-(cryo-ET). טכניקה זו מאפשרת להדמיה 3-D של neurites הקפואה, התייבשות ברזולוציה ננומטר, בהנחיית assessment של ההבדלים מורפולוגיים שלהם. הפרוטוקול שלנו מניב תצוגה חסרת תקדים של הגנגליון הגבי שורש neurites (DRG), ויזואליזציה של neurites בהיפוקמפוס במדינה הקרובה למולדתם. ככזה, שיטות אלה ליצור בסיס למחקרים עתידיים בneurites של שני נוירונים נורמלים ואלה מושפעים מהפרעות נוירולוגיות.
נוירונים להקים חיוני מעגלים המורכבים לתפקוד של מערכת העצבים המרכזית ואת הפריפריה על ידי לפרט דנדריטים לקבל מידע ואקסונים, לעתים קרובות די ארוך, כדי לתקשר עם הנוירונים במורד הזרם. התוצאה neurite ממלאת תפקיד מהותי במהלך התפתחות עוברית והתמיינות ותחזוקה של neurites עצביות תומכת באופן ביקורתי את התפקוד של מערכת העצבים. תהליכים מדלקת עצבים גם תכונה קריטית בפגיעה עצבית והתחדשות, כמו גם הפרעות במערכת עצבים. לימודי אדריכלות עצבית הוא חיוניים כדי להבין הן את המוח הבריא והחולה. למרבה המזל, מערכות תרבית תאים עצביות רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית קיימות שיכול לשחזר מבנים תאיים מורכבים והטרוגנית. בהתבסס על הבהרה של פלטפורמות ניסיוניות מוצקות, אסטרטגיות יעילות להדמיה המאפשרות ניתוחים איכותיים וכמותית של מורפולוגיה עצבית יש צורך. שימושי במיוחד הייתלהיות מתודולוגיה מפורטת המספקת פלטפורמה אחידה המאפשרת הדמית neurites, שני אקסונים ודנדריטים בקנה המידה ננומטרי.
במיקרוסקופ אלקטרונים מסורתי דורש שימוש בממס אורגני במהלך התייבשות והטבעת שרף, אשר יכולה לגרום לעיוותים בדגימות ממצבם האמיתי. עד כה, רוב האפיונים מבניים בקנה המידה ננומטרי מבוססים על תאים גדולים יותר או רקמות שנחשפים לכימיקלים קשים כגון - ובכך להגביל את הפרשנות של הממצאים 4,9,25. יתר על כן, לחדירת קרן אלקטרונים, חתך נדרש לאורגניזמים או בליטות סלולריות מציגים עובי גדול מ 1 מיקרומטר 12. לבסוף, מחולק או הסתובב תוצאות רקמות באוסף של ערכות נתונים פרוסה ספציפית בדידות, מה שהופך מסורבלת להגדרת התכונה המוארכת של neurites. אפילו לcryo-EM, שבו חתך דגימה קפוא התייבשות הוא אפשרי, השיטה מציגה artif דחיסהפועל 1.
בשנים האחרונות, חוקרים למדו איך לגדל תאי עצב בהיפוקמפוס ישירות על רשתות EM ו באתאן הנוזלי כדי לחזות בהמשך neurites באמצעות cryo-ET 8,10,18,23 הקפאת הבזק. עם זאת, מחקרים כאלה או להשתמש בהתקן מותאם אישית 10,23, או פרטי חוסר בצעד הסופג ליצירת קרח זגוגי מספיק דק להדמיה שגרתית 8,18. לדוגמא, מחקר אחד ממליץ על השימוש של 30-40 שניות לסופגים רשת EM 10, עם זאת, ערך זה הוא מותאם לא לשימוש כללי, אלא הוא ספציפי לאותו מכשיר ההקפאה לצלול בהזמנה אישית. שימוש במכשיר בהזמנה אישית ולא אחד 17 זמינים מסחרי לשמירה על לחות לפני מדגם ההקפאה לצלול יכול להוות מכשול לשחזור נרחב.
בעוד שמחקרים אלה היו פורץ באופן חזותי neurites ידי cryo-ET, נקטנו צעד נוסף כדי לחקור את applicability של cryo-ET למגוון רחב של דגימות עצביות (נוירונים בהיפוקמפוס וגנגליון השורש הגבי). בנוסף, אנו דנים בשתי תוצאות אופטימליות והכי מוצלחות, כמו גם חפצים הפוטנציאליים שאפשר להיתקל באמצעות cryo-ET לדגימות מסוג זה.
הגדרת טכניקה מפורטת לשימור באופן חזותי כל neurites בקנה המידה ננומטרי במצב כמעט טבעי היה לשפר את היכולת ליותר חוקרים לבצע מחקרי ultrastructural. לשם כך, אנו מתארים פרוטוקול יעיל ומפורט תוך שימוש בציוד זמין מסחרי כדי להכין נוירונים מבולבל, בלא כתם לדמיין neurites. זהו צעד ראשון חשוב לקראת המפרט את ultrastructure של neurites בריאה וכדי להניח את היסודות להבנה מה הבדלים מבניים קיימים בדגמי מחלה של מערכת עצבים. מאז cryo-ET יכול לפתור את תכונות neurite מבולבל, בלא כתם ב 3-D בקנה המידה ננומטרי, השיטה תגרום אפשרי כפי שמעולם לא יהיה זהביטוי להגדרת ארכיטקטורה מדלקת עצבים 12.
1. הכנת מאכלים עם EM רשתות עבור נוירונים העיקרי ציפוי
2. הכנה וPlating ראשי נוירונים בEM רשתות
3. Vitrifying נוירונים בEM רשתות
4. אוסף תמונה, עיבוד, וביאור
לפני הקפאה והדמיה באמצעות cryo-ET, יש לנקוט בתמונות מיקרוסקופ אור של רשת EM שבו נוירונים גדלים. Neurites צריכה להיות לעין בלי חפיפה משמעותית אחד עם השני. קופסא צבעונית באיור 3A מייצגת אזור זה זנק ב להראות בהגדלה גבוהה יותר באיור 3 ב, שבי neurites משתרעת על פני סריג של הרשת. כל רשת מרובע מורכב מסרט פחמן מחורר התומך בתאי העצב וneurites. חורים אלה הם לכאורה בתמונת cryo-EM במינון נמוך שנלקחה ב4k הגדלה, אשר מציגה את גוף תא העצב כאובייקט גדול יחסית, כהה, אלקטרונים צפופים (איור 3 ג), שממנו neurites פרויקט כלפי חוץ.
חלק ממנוחת neurite מעל חור בפחמן נבחר בקופסא צבעונית באיור 3C, ודהר-בהגדלה גבוהה (20k) באיור 3D. בהגדלה זו, מבנים הסלולר פנימיים ברורים הכוללים microtubules, שלפוחית, ומיטוכונדריה צריכים להיות ברורים באופן ברור (איור 3D), במיוחד בקרח בצורה אופטימלית הרזה כמו שנוצרו על ידי ביצוע פרוטוקול זה. המבנים השחורים הכהים במרכז התמונה (איור 3D) הם חלקיקי קרח משושה שנחשבים כזיהום וצריך בדרך כלל להימנע, עם זאת, בהתחשב בכך שהם מאוד דלילים ומחוץ לneurites עצמם, הם לא מתערבים עם שיקום וצבע יאור של המבנים הפנימיים לניתוח ופרשנות (איור 4). במינון נמוך, תמונה בהגדלה נמוכה נוספת היא שמוצגת באיור 5, שממנו יכול להיות ממוקם neurite, שלאחריו ניתן לקחת כמה תמונות 2-D ודיגיטלי מאוחה באמצעות תוכנת עיבוד תמונה כדי ליצור מונטאז (איור 6).
הראשוניריכוז נמוך ציפוי (50,000 תאים / מיליליטר לכל צלחת) של הנוירונים ברשתות EM מאפשר לתאי עצב שהם מרווחים מספיק רחוק זה מזה, כדי להבטיח להדמיה ברורה של neurites (איור 3 ג); ריכוזים גבוהים יותר ממומלץ (> 50,000 תאים / מיליליטר לכל צלחת ) יכול לגרום לתמונות הכי מוצלח של neurites הצפופה שקשה להתחקות אחר או תכונת מרכיבים תאיים (7 ב דמויות ו7C).

איור 1. ערכה לגידול הנוירונים ברשתות EM בתוך זכוכית תחתונה מנות. () זכוכית תחתונה מנות מוצגות, באופן חלקי עם תקשורת סלולרי (ורוד). (ב) כל מנה מכילה רשת EM זהב אחד, כפי שמבט קרוב יותר מגלה. ציפוי (C) של Eרשת M עם פולי-ליזין מוצגת כצד-cutaway קריקטורה. צלחת תחתית הזכוכית מורכבת מcoverslip זכוכית מרובע שמחובר לחלק התחתון של צלחת תרבות פלסטיק, המשתרע על פתח עגול שנחצב במקור מתוך בתחתית. מנות תחתית כוס אלה גמא מעוקר ומסחרי קנה כתערובת של עוגיות. לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.

איור 2. סכמטי סופג ידני של EM רשתות עם הנוירונים דבקו. () תקריב של החריץ של המכונה vitrification הזזה כניסה (חץ שחור) ללחות / הקאמרית סופג, שבו פינצטה תוכנס למחוק את הדגימה באופן ידני. (ב)ערכת קריקטורה המראה כיצד נייר הסינון ללא סידן (0.5 סנטימטר x 0.5 פנים סנטימטר) צריך להיות מטופלים באמצעות פינצטה שטוחה הנקודה ומוכנסת דרך חריץ הכניסה לתא הלחות של המכונה vitrification לסופג רשת EM שבו נוירונים הם דבקו (טיפה של תקשורת סלולרי ורודה מוצגת). רשת EM מוחזקת על ידי פינצטה מיוחדת עדינה נקודה בתוך תא הלחות. לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.

איור 3. חזותי נוירונים קפוא, התייבשות במיקרוסקופ אלקטרונים זהב רשתות (EM). (א) תמונת מיקרוסקופ אור בהגדלה של 10X השטח של רשת EM שבי נוירונים עיקרי חולדה היה Gro המרכזיכנף עבור 2 שבועות. (ב) הוגדלו-בתצוגה של התיבה אקווה שמוצגת ב( א '), שבו נוירונים ותחזיות neurite גלויים (חיצים הוורודים). (ג) אלקטרונים מיקרוסקופ בהגדלה של 4K neurite מקרין החוצה מהגוף תא העצב (חץ אדום). באופן סכמטי המתאים לאזור (כלומר התיבה האדומה) בתוך אחד מריבועי הרשת שמוצגים ב( ב '). קופסא הכחולה היא הצגה מקרוב ב( ד '), שבו התכונות הפנימיות של neurite נראות בבירור ב20k הגדלה (מיטוכונדריה חץ הירוקה; microtubules חץ כתום; חץ כחול שלפוחית). לחצו כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.

איור 4. שיקום 3-D וביאור של tomogram האקסון DRG חולדה. () פרוס טומוגרפית מתוך ערימה משוחזרת של תמונות שצולמו בזוויות הטיה שונות של האקסון DRG אחד. (ב) מקבילים ביאור 3-D של אותו האקסון. לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.

איור 5. תמונת cryo-EM 2-D של נוירון DRG עכברוש (מרכז שמאל) עם תחזיות אקסון (תיבה אדומה) בשעה 4k ההגדלה. לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.
<img alt="איור 6" fo:תוכן-width = "6in" עבור: רוחב src = "/ files/ftp_upload/50783/50783fig6highres.jpg" "> "500px"
איור 6. מונטאז' של ארבע תמונות cryo-EM 2-D של האקסון DRG חולדה אחת. כל תמונה צולמה ב20k ההגדלה. לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.

איור 7. תמונות 2-D cryo-EM של neurites. () האקסון DRG החולדה צילמו מקרוב בסמוך לסומה התא. (B, C) דוגמאות בשל צפיפות יתר של neurites ריכוז ציפוי גבוה של הנוירונים ברשתות EM. כל neurites היו שבועיים פלאש קפוא לאחר ציפוי ברשתות EM זהב. כל התמונות צולמו ב20k;. ההגדלה לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.

איור 8. שיקום 3-D וביאור של tomogram neurite היפוקמפוס חולדה. () פרוס טומוגרפית מתוך ערימה משוחזרת של תמונות שצולמו בזוויות הטיה שונות של neurite היפוקמפוס אחד. (ב) מקבילים ביאור 3-D של אותו neurite. לחץ כאן לצפייה בתמונה גדולה יותר.
החוקרים מצהירים כי אין להם אינטרסים כלכליים מתחרים.
כדי לשמר את התהליכים עצביים לניתוח ultrastructural, אנו מתארים פרוטוקול לציפוי של נוירונים העיקרי ברשתות במיקרוסקופ אלקטרונים ואחרי הבזק הקפאה, מניב דגימות טהורים בשכבה של קרח זגוגי. ניתן לבחון דגימות אלה עם מיקרוסקופ אלקטרונים cryo-לדמיין מבנים בקנה המידה ננומטרי.
מחקר זה כבר נתמך על ידי מענקי NIH (PN2EY016525 וP41GM103832). SHS נתמכה על ידי מענק מהתכנית ללימודי ההדרכה Nanobiology בינתחומי של מרכז קק WM להבינתחומי Bioscience הדרכה של חוף מפרץ קונסורציומים (NIH גרנט מס T32EB009379).
SHS גזור, גדל ומזוגג DRG ותאים בהיפוקמפוס, שנאסף cryo-EM ונתונים cryo-ET של DRG ואקסונים בהיפוקמפוס; שוחזר וצבע-מבואר סדרת ההטיה. MRG גזור וסיפק תאים בהיפוקמפוס במעבדה של MNR. SC סייע בביאור סדרת הטיה. SHS הוכשר על ידי CW על כיצד לנתח ולגדול נוירונים. SHS, WCM והמקלחת הגו את הניסויים. SHS הכין את כתב היד עם קלט ממחברים אחרים.
וידאו זה צולם במרכז לסלולרי הדמיה וNanoAnalytics (C-Cina) של Biozentrum של tהוא באזל האוניברסיטה. C-Cina משתלב במחלקה לBiosystems מדע וההנדסה (D-BSSE) של המכון הטכנולוגי של ציריך, הממוקם בבאזל, שוויץ.
| Dumont #7 פינצטה | מדעי מיקרוסקופיה אלקטרונית | 72803-01 | לטיפול ברשתות EM |
| כלי תחתית מזכוכית | MatTek Corp. | P35G-1.5-10C | לגידול |
| מדגם רשתות מיקרוסקופיה אלקטרונית | Quantifoil | Holey Carbon, Au 200, R 2/2 | לגידול |
| מדגם נייר סינון נטול סידן | Whatman | 1541-055 | לדוגמא ספיגה |
| פינצטה ארוכה גדולה עם נקודה שטוחה | Excelta Corporation | E003-000590, 25-SA | לדוגמא ספיגה |
| מכשיר ויטריפיקציה ופינצטה | FEI | Vitrobot Mark III | להקפאת מדגם |
| קופסאות אחסון Minigrid | Ted Pella, Inc. | 160-40 | לאחסון רשתות EM |
| מחזיק העברת קריו | Gatan | 626 מחזיק העברת קריו חנקן נוזלי הטיה אחת | לדוגמאות הדמיה |
| תוכנת רכישה סדרת הטיה למחצה | אוטומטית SerialEM | http://bio3d.colorado.edu/SerialEM/ | לדוגמאות הדמיה |
| תוכנה לעיבוד תמונה | IMOD eTomo | http://bio3d.colorado.edu/imod/ | לעיבוד תמונה |
| מיקרוסקופ אלקטרונים שידור ל-cryoEM | JEOL, טוקיו | 200-kV JEM2100 LaB6 מיקרוסקופ אלקטרונים | להדמיה |
| 4k x 4k CCD מצלמה | Gatan | N/A | להדמיה |
| תוכנת הערות תלת מימד | Visage Imaging GmbH | Amira/Avizo | לעיבוד נתונים תלת מימדיים |
| תוכנה לתפירה דיגיטלית של תמונות דו-ממדיות | Adobe | Adobe Photoshop | לעיבוד נתונים דו-ממדיים |
| DMEM, גלוקוז גבוה | Invitrogen | 11965-118 | לתרבית היפוקמפוס |
| חומצה בורית | סיגמא אולדריץ' | B-0252 | לתרבית היפוקמפוס |
| נתרן טטרבוראט | סיגמא אולדריץ' | B-9876 | לתרבית היפוקמפוס |
| פולי-L-ליזין | סיגמא אולדריץ' | P2636-500MG | לתרבית היפוקמפוס |
| מערכת סינון | קורנינג | 430758 | לתרבית ההיפוקמפוס |
| מדיום נוירובזאלי | Invitrogen | 21103-049 | לתרבית DRG |
| תוסף B-27 | Invitrogen | 17504-044 | לתרבית DRG |
| פניצילין/סטרפטומיצין | Invitrogen | 15140-122 | לתרבית DRG |
| GlutaMAX | Invitrogen | 35050-061 | לתרבית DRG |
| חולדה רקומביננטית b-NGF | R& D Systems | 556-NG | לתרבית DRG |
| Uridine | Sigma | U3003-5G | לתרבית DRG |
| 5'-Fluoro-2'-deoxyuridine | Sigma | F0503-100MG | לתרבית DRG |
| Matrigel | BD Biosciences | 356234 | לתרבית DRG |