אלח דם, תגובה דלקתית מערכתית לזיהום, מייצג גורם מוביל למוות בחולים ביקורתי חולים 1. זיהומי התוך בטני, לעתים קרובות מובילים לאלח דם polymicrobial, חשבון 20% מהמקרים אלח דם, שבו יש תמותה משמעותית של עד 60% 2. התמותה הקשורים אלח דם נובעת בעיקר מבעיות של מרובי איברים עם כשל איברים לאחר 3,4. יש צורך בחקירה נוסף לתוך המנגנון הפתוגני של מחלה זו בדחיפות כדי לקדם את הפיתוח של טיפולים חדשניים ויעילים יותר.
שיטת קשירה ולנקב cecal (CLP) היא הליך נפוץ לאלח דם דוגמנות in vivo. כcecum מלא בחיידקים, תוצאות לנקבו בדלקת הצפק polymicrobial, טרנסלוקציה של חיידקים לדם (בקטרמיה), הלם ספטי, תפקוד לקוי של איברים רב, וסופו של דבר, למוות 5. הדעה מקובלת היא שCLP משקף קלינימציאות בצורה מדויקת יותר מאשר טכניקות קודמות, כגון הזרקה של רעלן פנימי או חיידקים אפילו מטוהרים למכרסמים, וכך, CLP נחשבת את תקן זהב (אם כי לא בלי מגבלות) 6 לאינדוקציה ניסיוני, ולכן, החקירה של הפתוגנזה של אלח דם. במונוגרפיה זו, אנו מתארים פרוטוקולים נועדו להעריך אם מנגנונים פתוגניים של אלח דם כוללים autophagy.
Autophagy, תהליך סלולארי אבולוציונית שימור, מאפשר התחלופה של חלבונים ואברונים כגון המיטוכונדריה פגומים וממלא תפקיד חשוב בסילוק פתוגנים תאיים כוללים חיידקים 7,8. במהלך autophagy, חלבונים או אברונים cytosolic הם מוחרמים לתוך שלפוחית כפולה קרום הנכנס נקראת autophagosomes, אשר מועברות לאחר מכן לlysosomes לפירוק 9. מספר החלבונים זוהה כhomologues היונקים של גנים הקשורים לautophagy (ATG),זוהה במקור בשמרים, המסדירים את התהליך של autophagy. ההמרה של שרשרת אור microtubule הקשורים החלבון -1 3B (LC3B) (homologue של Atg8) מLC3B-I (בצורה חופשית) לLC3B-II (טופס phosphatidylethanolamine מצומדות) מהווה צעד חשוב בהיווצרות autophagosome 9. תפקוד לקוי autophagic הוא הקשורות להזדקנות ומחלות אנושיות, כולל סרטן ומחלות ניווניות 10. יתר על כן, autophagy משפיע על חסינות מולדת ובעלי כושר הסתגלות כגון מצגת אנטיגן, פיתוח הלימפוציטים והפרשת ציטוקינים על ידי תאי מערכת החיסון 8. לפיכך, נראה סביר שautophagy עשוי גם לשחק תפקיד בתגובה הדלקתית המערכתית לזיהום (כלומר באלח דם).
נכון להיום מספר שיטות שתוארו על מנת להעריך את התפקיד של autophagy בפגיעה ברקמות בגוף חי. אלה כוללים את השימוש בעכברים לבטא חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP)-LC3 וכימות של רכבphagosomes ברקמה על ידי מיקרוסקופית אלקטרונים (אלה שתי שיטות מתוארות במונוגרפיה זו). שיטות נוספות כוללות כימות של ביטוי חלבון autophagic בhomogenates רקמות, וניתוח של שטף autophagic (כפי שמתואר במקום אחר) 11-13. מטרת סקירה זו היא לספק פרוטוקולים הנוכחיים להערכת autophagy in vivo בהקשר של אלח דם ניסיוני.