הפרוטוקולים שתוארו כאן למדוד חישה של תאי T נגועים בוירוסים מתויג GFP HIV-1 שנבדלים רק ביכולתם להביע את פעולת ה- Vpu, כפי שתוארו בדו"ח האחרון שלנו 18. עם זאת, יכולים היו בקלות להיות שונה בשיטות אלה כדי ללמוד חישה של וירוסים לא מתויגים כמו גם וירוסים חסרי גנים נגיפיים אחרים שעלולים לווסת חישה מולדת. אם הווירוסים משמשים לא להביע GFP, אחוז תאי יעד הנגועים צריכים להיקבע על ידי אמצעים אחר לפני תרבות משותפת, כגון p24 (קפסיד) מכתימה תאית וcytometry זרימה או על ידי p24 ELISA. יתר על כן, ניתן להשתמש בפרוטוקולים אלה עם תאי T היעד שונים, כוללים מגוון רחב של שורות תאים זמינות ותאים ראשוניים.
יש השיטות שתוארו בכתב היד הזה יש מספר היתרונות בהשוואה לשיטות המוקדמות נהגו ללמוד חישת HIV-1. בראש ובראשונה את זה כבר נקבע על ידי מספר הקבוצות שp HIV-1-תא ללאמאמרים מעוררים עניים מהסוג-אני IFN 2,13,14. יתר על כן, מחקרים מוקדמים הסתמכו על שיטות מבוססות ELISA IFNα מבוגרות לכמת את כמות סוג אני IFN מיוצרת. הגבלה של טכניקת זיהוי זה היא שרוב ערכות IFNα ELISA המבוגרות למדוד רק סוג אחד של IFNα, בעוד שמשקיף סוגי IFNα וIFNβ האחרים. השימוש בשורות תאי הכתב תיארו מתגברת על מגבלה זו כריכוז של כל הצורות ביו של IFNs סוג-אני האנושי ניתן למדוד בפעם אחת. הטכניקה היא רגישה מאוד, יקרה פחות מהדור החדש של ערכת ELISA IFN ולתורמים רבים כמויות גדולות של הסוג-IFN אני יכול בקלות להיות מזוהות. עם זאת, פרוטוקול זה ניתן להתאים בקלות לשימוש עם סוג אני IFN שיטות אחרות לקריאה החוצה כגון ELISAs.
צעדים קריטיים: חשוב שהאיכות של כל המרכיבים התאיים (המטרות והן effectors) להיות מבוקרת היטב. זיהום פוטנציאלי, גם כאשר asymptomatic, צריך להיות במעקב ובשליטה. כפי שהזכרנו קודם לכן, אנטיביוטיקה בשליטת זיהום חיידקים ללא תסמינים, ופתוגנים תאיים פוטנציאלי אחרים כגון mycoplasma, יכולים ליצור תגובה חיסונית דומה לאלה שנצפו לאחר הדבקת HIV-1, כלומר ייצור של הסוג-אני IFN. יתר על כן, כל חומרים כימיים צריכים להיות חופשי של LPS או אנדוטוקסינים פוטנציאליים אחרים. כמו כן, ניטור של PBMCs וpDCs חשוב גם כן לעתים קרובות יכולות להיות דרוכים דגימות אנושיות על ידי זיהומים מתמשכים הבסיסיים, אשר עשוי להשפיע חישה נורמלית. אנחנו תמיד ממליצים כוללים בקרות שליליות המוצעות, כגון העדר תאי יעד, כמו גם שיתוף תרבויות עם תאים נגועים מדומים. כדאיות של תאים נגועים היא גם חשובה לחישה נכונה PDC מאז סוג אני IFN אינו מיוצר הבא תרבות משותפת עם תאים אפופטוטיים 2,14.
מגבלה חשובה אחת של הטכניקה היא את הצורך בתאים ראשוניים מבודדים טרי. הליך זה לא היה נבדק באמצעות PBMCs או pDCs שהוקפאו או נשמר בתרבות או בעבר. הבידוד של PBMCs הוא עבודה אינטנסיבית ויש לי תאים אלה אורך חיים מוגבלים מאוד. יתר על כן, יש להשתמש בפרוטוקולים סטנדרטיים להגנה מפני פתוגנים שמקורן בדם בעת שעבדו עם דם אנושי. לעתים קרובות יש כמה מקורות שונות הקשורים בעבודה הכרוכה בתאים אנושיים מבודדים טרי. ביניהם ההליכים השונים יושמו לבודד תאים אלה, וההשתנות בירושה נתקלו מתורם לתורם הם. בעוד שאי אפשר להימנע משונות בין תורם, השימוש בפקדים חיוביים הציעו, כגון מדידת תגובה לאגוניסטים ידועים של מסלולי TLR7 וTLR9, יספק בקרה פנימית חשובה לניסויים אלה. אנחנו הבחנו שתגובה חזקה לאגוניסטים של מסלול TLR9 יכולה להיות מתואמות עם תגובת PDC בריאה, ואילו נדרש מסלול TLR7 מגיב לתגובה הולמת נגד HIV-1 3.
ss = "jove_content"> בהתבסס על תצפיות שנעשו על ידי אותנו ואחרים 2, העשרת pDCs מPBMCs לעתים קרובות אין צורך. עם זאת, אם עיצוב ניסיוני דורש את זה (למשל בהקשר שבו יש צורך בדלדול של סמני משטח PDC ספציפיים) סלקציה שלילית עדיף על בחירה חיובית, כמו תאים להישאר חופשיים של נוגדן לאחר תהליך הבחירה. pDCs המבודד עובר אפופטוזיס המהיר בתרבות. לניסויים הדורשים תאים אלה להיות מתורבתים לתקופה ארוכה של זמן, יכולה להיות בתוספת תקשורת ותרבות עם IL-3. ציטוקינים זה גורם התפשטות PDC ומעכב אפופטוזיס 16. עם זאת, IL-3 שימוש צריך להיות מבוקר היטב שכן הוא עלול להוביל להתבגרות או בידול PDC.
השיטה המתוארת כאן משלבת יעד HIV-1 תאים נגועים בPBMCs או pDCs המבודדים טרי כדי לשחזר מעורבים בחישה מולדת הצעדים הראשוניים. שיטה זו תהיה ללא ספק להיות שימושית לExplorאירועי הדואר מוקדמים מולדים חיסוניים קשורים לזיהום HIV. למרות שהפרוטוקולים הנלווים מכוונים מדידה מסוג אני IFN, הם יכלו בקלות להיות שונה כדי למדוד מולקולות ביו אחרות שוחררו מpDCs בעת ההכרה של תאים נגועים. אלו יכולים לכלול: סוג III-IFN (IFN-λ), ציטוקינים פרו-דלקתיים (כגון TNF-α ו- IL-6) וCXCL10 כמוקינים, CCl4, וCCL5 17.