כתב יד זה מתאר כיצד ניתן לכמת ביעילות את שיעורי חילוף החומרים של קוטלי עשבים עם עלים שנכרתו מעשב דיקו, ובכך להפחית את השונות ולהסיר כל השפעות מבלבלות אפשריות של ספיגת קוטלי עשבים או טרנסלוקציה שנצפית בדרך כלל במבחני צמח שלם.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
כתב יד זה מתאר כיצד ניתן לכמת ביעילות את שיעורי חילוף החומרים של קוטלי עשבים עם עלים שנכרתו מעשב דיקו, ובכך להפחית את השונות ולהסיר כל השפעות מבלבלות אפשריות של ספיגת קוטלי עשבים או טרנסלוקציה שנצפית בדרך כלל במבחני צמח שלם.
על מנת לבודד ולקבוע במדויק את שיעורי חילוף החומרים של קוטלי עשבים בעשב דיקוט חוצה חובה, קנבוס מים (Amaranthus tuberculatus), פיתחנו בדיקת עלים כרותים בשילוב עם אסטרטגיית שיבוט וגטטיבית כדי לנרמל את ספיגת קוטלי העשבים ולהסיר טרנסלוקציה כגורמים תורמים באוכלוסיות קנבוס מים עמידות לקוטלי עשבים (R) ורגישות (S). ניתוחים ביוקינטיים של חומרי הדברה אורגניים בצמחים כוללים בדרך כלל קביעת קליטה, טרנסלוקציה (אספקה לאתר היעד), גורל מטבולי ואינטראקציות עם אתר היעד. מטבוליזם של קוטלי עשבים הוא פרמטר חשוב למדידה בעשבים עמידים לקוטלי עשבים וגידולים עמידים לקוטלי עשבים, והוא מושג בדרך כלל בבדיקות של צמח שלם באמצעות קוטלי עשבים עם תווית רדיו. עם זאת, קושי אחד בפירוש פרמטרים ביוקינטיים הנגזרים משיטות צמח שלם הוא שטרנסלוקציה מושפעת לעתים קרובות משיעורי חילוף החומרים של קוטלי עשבים, מכיוון שמטבוליטים קוטביים בדרך כלל אינם ניידים בתוך הצמח בעקבות תגובות ניקוי רעלים של קוטלי עשבים. היתרונות של הפרוטוקול המתואר בכתב יד זה כוללים קביעה ניתנת לשחזור, מדויקת ומהירה של שיעורי פירוק קוטלי עשבים באוכלוסיות R ו-S, ירידה משמעותית בכמות קוטל העשבים המסומן ברדיו הנצרכת, הפחתה גדולה בחומרים צמחיים עם תווית רדיו הדורשים טיפול וסילוק נוספים, והיכולת לבצע ניסויים בקוטלי עשבים עם תווית רדיו במעבדה או בתא גידול במקום בחממה. ככל שעמידות לקוטלי עשבים ממשיכה להתפתח ולהתפשט באוכלוסיות עשבים ברחבי העולם, שיטת בדיקת העלים הכרותים שפותחה ומתוארת כאן תספק טכניקה שלא תסולא בפז לחקירת עמידות מבוססת אתר שאינה מטרה עקב שיעורים משופרים של חילוף חומרים וניקוי רעלים.
התנגדות קוטל עשבים בעשבים מהווה איום רציני לייצור העולמי של 1,2 מזון והסיבים. נכון לעכשיו, אלפי אוכלוסיות וbiotypes עמידות מלמעלה ממאה מיני עשבים בעולם תועדו ולמד 3. מנגנון עיקרי שמקנה עמידות קוטל עשבים בצמחים הוא השינוי של גני קוטל עשבים יעד אתר וחלבונים, כוללים מוטציות גנטיות המשפיעות על קינטיקה מחייבת קוטל עשבים-חלבון או הגברה של גן מטרת אתר 2. ניקוי רעלים מטבוליים באמצעות פעילות מוגברת של monooxygenase ציטוכרום P450 (P450) או אנזימי -transferase S גלוטתיון (GST) הוא מנגנון אחר שמקנה עמידות קוטל עשבים בעשבים, שהוא נבדל במספר דרכים ממנגנונים מבוססי יעד אתר 2. יש התנגדות מבוססת חילוף חומרים השלכות משמעותיות עבור האם עלויות כושר צמח (aka עונשי כושר) יכולות לנבוע מmechanis קוטל עשבים-ההתנגדותמ ', כמו גם לגבי הפוטנציאל למנגנון ניקוי רעלים יחיד להקנות עמידות צולבת או מרובה-קוטל עשבים באוכלוסיות עשב 1,2,4. בדרך כלל, חילוף חומרים קוטלי עשבים בצמחים יכולים להיות מחולק לשלושה שלבים ברורים 5. שלב I כרוך המרת קוטל עשבים או הפעלה כגון hydroxylation תיווך P450 של טבעות ריחניות או קבוצות אלקיל, או על ידי N - או תגובות dealkylation O-, שהוביל לקוטביות גדלה ועשבים חלקיים גמילה 5,6. חדש הציג קבוצות פונקציונליות בשלב שאני יכול לספק אתרי הצמדה לנטייה לגלוטתיון מופחת על ידי GSTs או לגלוקוז על ידי glycosyltransferases UDP תלוי בשלב II 5,7. לדוגמא, המטבוליט הראשוני העיקרי של primisulfuron-מתיל בתירס הוא הידרוקסי-מתיל-primisulfuron 8, שבו ניתן מטבוליזם נוסף להידרוקסי-primisulfuron-glucoside (Phase II) ולאחר מכן הועבר לvacuole לאחסון לטווח ארוך או חילוף חומרים נוספים פרוcessing 5,6 (Phase III).
Waterhemp (tuberculatus Amaranthus) הוא מין קשה לשליטה, dicot שנתי עשב שמעכב את הייצור של תירס (Zea Mays), סויה (מקסימום גליצין), וכותנה (Gossypium hirsutum) בארצות הברית. הרמה הגבוהה של מגוון הגנטי של waterhemp היא הקלה על ידי האבקת רוח הביולוגיה dioecious ומרחקים ארוכים שלה, וצמח waterhemp נקבה אחת יכול לייצר עד מיליון זרעים 9. זרעים אלה הם קטנים ולהתפשט בקלות, אשר באופן טבעי להעניק waterhemp עם מנגנון פיזור יעיל. Waterhemp מציג נביטה רציפה לאורך כל עונת גידול 9, וזרעיו יכולים לנבוט לאחר מספר שנים של תרדמת. Waterhemp הוא צמח C 4 שבעל שיעור צמיחה גבוה מרוב עשבי broadleaf במערכות חיתוך לעיבוד 10. בנוסף, אוכלוסיות waterhemp רבות עמידים בפני Fam מרובהilies של קוטלי עשבים 3.
אוכלוסייה של waterhemp (מיועד MCR) מאילינוי היא עמידה ל4-הידרוקסי-phenylpyruvate dioxygenase (HPPD) קוטלי עשבים -inhibiting 11, כגון mesotrione, כמו גם לאטרזין וsynthase acetolactate (ALS) -inhibiting קוטלי עשבים, כולל primisulfuron-מתיל , בשל מנגנונים מבוססים היעד הלא-אתר 12,13. אוכלוסייה שונה של waterhemp המיועדת 14 ACR, שהוא primisulfuron-מתיל-עמיד (עקב מוטציה בגן ALS) ואטרזין עמיד אבל רגיש לmesotrione, ואוכלוסיית waterhemp המיועדת 14 WCS שהוא רגיש לprimisulfuron-מתיל, mesotrione, ואטרזין שמשו בהשוואה לMCR במחקר שלנו לפני 12 וניסויים הנוכחיים (מסוכם בטבלה 1). מחקרים ראשוניים לא לזהות שינויים ברמות רצף גן HPPD או ביטוי, או ספיגת mesotrione מופחתת, בMCRאוכלוסייה בהשוואה לאוכלוסיות mesotrione רגישה 12. עם זאת, מחקרי חילוף חומרים עם כל צמחים הפגינו רמות נמוכות יותר באופן משמעותי של קוטל העשבים mesotrione ההורה בMCR לעומת ACR וWCS, אשר מתואם עם תגובות פנוטיפי קודמות לmesotrione 11,12.
| Waterhemp אוכלוסייה | קיצור | הפנוטיפ לMesotrione | מנגנון Mesotrione התנגדות | הפנוטיפ לPrimisulfuron | מנגנון Primisulfuron התנגדות |
| מקלין קאונטי-עמיד | MCR | עמיד | חילוף חומרים * | עמיד | חילוף חומרים |
| אדמס קאונטי-עמיד | ACR | Sensitאייב | - | עמיד | מוטציה יעד אתר ב -14 ALS |
| וויין קאונטי-רגיש | WCS | רגיש | - | רגיש | - |
* מנגנונים ללא יעד אתר התנגדות, מלבד חילוף חומרים משופרים, עשויים גם להעניק התנגדות mesotrione באוכלוסיית MCR 12.
טבלת 1: תיאור של אוכלוסיות waterhemp מאילינוי השתמשו במחקר זה.
בנוסף לקביעת תעריפים של חילוף חומרים קוטלי עשבים בשתילי waterhemp שלמים, גישה ניסויית שונה פותחה ומועסק במחקר הקודם שלנו כדי לחקור את חילוף החומרים באמצעות assay נכרת waterhemp עלה 12 כמו גם מעכבי P450 שונים (לדוגמא, tetcyclacis ומלתיון). שיטה זו הותאמה במיוחד עבור waterhemp מpreviחקירת היחידות הארגוניות של חילוף חומרים primisulfuron-מתיל בתירס נכרת משאירה 15, מאז assay העלה נכרת עדיין לא דווח לביצוע מחקר חילוף חומרים קוטלי עשבים במפעל dicot. מלתיון החרקים organophophosate כבר משמש לעתים קרובות לin vivo ובמחקר קוטל עשבים-חילוף חומרים מבחנה כדי לציין את מעורבות P450 16. לדוגמא, סובלנות וחילוף חומרים מהירים של mesotrione בתירס נובעים hydroxylation טבעת זרז-P450, אשר אומת כאשר מלתיון רגישות מוגברת לתירס mesotrione 17. באופן דומה, מלתיון עכבות חילוף חומרים של מעכב primisulfuron-מתיל ALS בתירס נכרת משאיר 15. יתרון עיקרי של טכניקת העלה נכרתה הוא שהנתונים שנוצרו אינם תלויים בדפוסי טרנסלוקציה-שלם צמח, גורם חשוב להביא בחשבון כאשר בוחנים את חילוף החומרים של קוטלי עשבים מערכתיים, postemergence בצמחים. כתוצאה מכך, שיטה זו מאפשרת כמותיים וחילוף חומרים איכותיים מנתחים להתמקד בעלה טופל יחיד 12.
אסטרטגית שיבוט וגטטיבי, בשילוב עם פרוטוקול העלה הניכר, נוצלה בעבר בwaterhemp לבצע מחקרי חילוף חומרים 12. בשל אופי outcrossing של waterhemp (זכר נפרד וצמחי נקבה), ומידה רבה של שונות גנטיות בתוך מיני Amaranthus dioecious 9, פרוטוקול זה הבטיח כי שתילי waterhemp גנטי זהים נותחו בניסויים בזמן הקורס. מאמר זה מדגים את התועלת של שיטת העלה נכרת למדידת שיעורים של חילוף חומרים קוטלי עשבים בעשב dicot (waterhemp). כמות העשבים הורה שנותרה הייתה נחוש בכל נקודת זמן (איור 1) על ידי ניתוח רגרסיה ריבועים לפחות שאינו ליניארי, והייתה בכושר עם עקומה מסדר הראשון פשוט כדי להעריך את הזמן עבור 50% מקוטלי עשבים נקלטו להשפיל ( DT 50). נציגchromatograms מכרומטוגרפיה הפוך-שלב ביצועים גבוהים נוזלית (RP-HPLC) מוצגים לALS עמיד ואוכלוסיות waterhemp -sensitive, המצביעות על היעלמותו של קוטל עשבים הורה והיווצרות נלווית של המטבוליט קוטבי (ים) במהלך מחקר בזמן קורס (איור 2). המוקד של המאמר שלנו הוא לתאר ולהדגים את התועלת של assay העלה נכרת בשילוב עם שיטת שיבוט וגטטיבי לקביעת שיעורים מדויקים ושחזור של חילוף חומרים קוטלי עשבים בצמחי dicot, באמצעות קוטלי עשבים באופן אחיד שכותרתו טבעת (14 URL- C) ב שלוש אוכלוסיות waterhemp שונות בתגובות-הצמח כולם לHPPD- וקוטלי עשבים עיכוב ALS (טבלת 1).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. צמח חומר, תנאי גידול, וגטטיבי שיבוט
שים לב: שלוש אוכלוסיות waterhemp נחקרו במחקר זה: MCR (ממחוז מקלין, IL), ACR (ממחוז אדאמס, IL), וWCS (ממחוז ויין, IL) (טבלת 1).
2. מנהלת מחקר מטבוליזם עם נכרת Waterhemעלים עמ '
3. ניתוח HPLC של קוטל העשבים מטבוליזם בעלים נכרת
הערה: לפתור רדיואקטיביות לחילוץ כוללת למטבוליטים קוטל עשבים הורה ועשבים באמצעות תנאי RP-HPLC הבא 12.
4. נהלים סטטיסטיים

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הבדלים גדולים בשיעורים של חילוף החומרים mesotrione התגלו בין שני WCS או ACR וMCR (איור 1). בכל נקודת זמן, MCR שחילוף חומרי mesotrione מהירות רב יותר מאשר אוכלוסיות שתי mesotrione רגיש, WCS וACR, אשר בקורלציה עם תגובות פנוטיפי-כל מפעל קודם 11. על ידי שיבוט מספיק צמחי מצמח הורים יחיד מכל אוכלוסייה, ניתוחים בזמן קורס חילוף חומרים קוטלי עשבים הם אחידים ושחזור בשל חוסר ההשתנות גנטית בתוך כל קורס זמן 12. לדוגמא, במהלך הזמן לחילוף חומרי mesotrione ב...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
השיטה נכרת העלים המתוארים במסמך זה נעשתה שימוש בעבר במחקר חילוף החומרים primisulfuron בתירס משאיר 15, אבל התוצאות שלנו מראות כי בפרוטוקול זה הוא גם יעיל, מדויק, ושחזור למדידת חילוף חומרים קוטלי עשבים במיני עשבי dicot 12. יתרון עיקרי של טכניקת העלה נכרתה בהשוואה למחקרים-כל מפעל הוא שעלה נכרת אינו תלוי בדפוסים-צמח כל טרנסלוקציה של postemergence, קוטלי עשבים מערכתיים או הבדלים בספיגת קוטל עשבים בין צמחים או אוכלוסיות. בנוסף, שונות סביבתיות מצטמצמת מאז מבחני העלה...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין מה לחשוף.
אנו מודים לוונדי ז'אנג, אוסטין טום, ג'קי ג'אני, ארין למלי ובריטני ג'אני על הסיוע בגידול צמחים ומיצויים, לד"ר אנטולי ליגין על הסיוע בניתוחים כרומטוגרפיים, ולסינג'נטה להגנת הצומח על המימון.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| Agar | Sigma-Aldrich | A1296 | לזרעים מונבטים מראש |
| מדיום עציצים | Sun Gro Horticulture | 49040233 | לגידול צמחים |
| Nutricote | Agrivert | TOTAL BLEND 13-13-13 T100 | דשן בשחרור איטי |
| תא גידול E15 | סביבות מבוקרות מוגבלות | 20207 | גידול צמחים |
| Tris base | Fisher Scientific | BP152-500 | מאגר לעלים כרותים |
| HCl (מרוכז)Fisher | Scientific | A144500 | להתאים את ה-pH של |
| המאגר מלחי Murashige ו-Skoog (MS) | דגירה של Sigma-Aldrich | M0404 | של עלים כרותים |
| מתנול | פישר סיינטיפיק | A452-4 | שטיפת עלים לאחר הדגירה |
| אצטון | סיגמא-אולדריץ' | 179124 | תמציות צמחים |
| אצטוניטריל (דרגת HPLC) | מקרון כימיקלים עדינים | MKH07610 | שלב נייד HPLC |
| חומצה פורמית | Mallinckrodt MK259205 אנליטי | להחמצת פאזה ניידת pH | |
| מיקרו-צנטריפוגה | Eppendorf | 5417R | צינורות 1.5 או 2.0 מ"ל |
| צנטריפוגה (מבוקרת טמפרטורה) | Eppendorf | 5810R | צינורות 15 או 50 מ"ל |
| צינור צנטריפוגה פוליפרופילן | Corning Inc. | 430790 | 15 מ"ל, |
| מאייד סיבובי | סטרילי BÜ | דגימות צמחים מרוכזות | R200 |
| ספקטרומטריית נצנוץ נוזלי (LSS) | Packard Instruments | 104470 | מכמתים 14C |
| כרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים | פרקין אלמר | N2910401 | לפתור מטבוליטים של קוטלי עשבים |
| מנתח נצנוץ זרימה | מערכת LabLogic | 1103303 | לניתוח HPLC של 14C |
| Hypersil Gold C18 column | תרמו-סיינטיפיק | 03-050-522 | שלב הפוך |
| קוקטייל Ultima-Flo M | פרקין אלמר | 6013579 | עבור מנתח זרימה-נצנוץ |
| קוקטייל נצנוץ (ScintiVerse BD) | פישר סיינטיפיק | SX18 | ל-LSS; |
| הומוגנייזר מעבדה | Kinematica | CH-6010 | הומוגניזציה של דגימות עלים |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.