כאן, אנו מציגים פרוטוקול לשימוש ב-RNA מפריע קטן ספציפי לחלבון הלם חום 27 (HSP27) כדי להעריך את תפקודו של HSP27 במהלך ריפוי פצעי אפיתל בקרנית. הפרעות RNA הן השיטה הטובה ביותר להפיל ביעילות ביטוי גנים כדי לחקור את תפקוד החלבון בסוגי תאים שונים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
כאן, אנו מציגים פרוטוקול לשימוש ב-RNA מפריע קטן ספציפי לחלבון הלם חום 27 (HSP27) כדי להעריך את תפקודו של HSP27 במהלך ריפוי פצעי אפיתל בקרנית. הפרעות RNA הן השיטה הטובה ביותר להפיל ביעילות ביטוי גנים כדי לחקור את תפקוד החלבון בסוגי תאים שונים.
RNA מפריע קטן (siRNA) הוא בין שיטות הפרעות ה-RNA הנפוצות ביותר להשתקה לטווח קצר של גנים מקודדי חלבון. siRNA הוא דופלקס RNA סינתטי שנוצר כדי למקד באופן ספציפי תעתיק mRNA כדי לגרום לפירוקו והוא שימש לזיהוי מסלולים חדשים בתהליכים תאיים שונים. קיימים מעט דיווחים לגבי תפקידו של חלבון הלם חום זרחני 27 (HSP27) בריפוי פצעי אפיתל בקרנית. כאן, תאי אפיתל קרנית אנושיים מתורבתים חולקו לקבוצה מקושקשת של siRNA וקבוצה שעברה טרנספטציה של siRNA ספציפית ל-HSP27. לאחר מכן בוצעו בדיקות פציעה כיווניות הנגרמות על ידי שריטות, וכתמים מערביים וזרימה ציטומטרית. אנו מסיקים כי ל-HSP27 יש תפקידים בריפוי פצעי אפיתל בקרנית שעשויים לכלול אפופטוזיס ונדידה של תאי אפיתל. כאן ניתנים תיאורים שלב אחר שלב של הכנת הדגימה ופרוטוקול המחקר.
תאי אפיתל קרניים (CECs) הם לשפוך ברציפות לתוך שכבת דמעות, בזמן שהם מוחלפים בו זמנית על ידי תאים מן לימבוס ושכבות הבזליים אפיתל קרניים. 1 לחצים חיצוניים שונים יכולים לגרום אפופטוזיס קלוף של CECs. 2 חלבוני הלם החום (HSPs) שמורים מאוד ניתן לחלק לשתי משפחות לפי גודל מולקולרי. 3 מש' HSP הגדולה כולל Hsp90, HSP70, ו HSP60, והמשפחה הקטנה כולל HSP27. 4 זירחון של HSP27 ידוע לשחק תפקיד חשוב בהישרדות תא והוא נחוץ לצורך נדידת תאים עקב התפקיד של חלבון זה שיפוץ יקטין. 5-7 לכן, ניסינו לבחון את התפקיד הפוטנציאלי של זירחון HSP27 גירת CEC ו אפופטוזיס מודל במבחנה של ריפוי פצע אפיתל.
התערבות RNA (RNAi) באף אחת קטנה או קצר RNAs התערבות (siRNA) יש geעניין nerated בשתי ביולוגיה בסיסית ויישומים, כפי שהוא עשוי לאפשר את הביטוי של כל גן של עניין להיות דפק למטה. 8 בזאת, השתמשנו siRNA ספציפי-HSP27 להעריך את התרומה של HSP27 לריפוי אפופטוזיס פצע CEC. שיטות RNAi מסורתית עבור הגן לדפוק למטה בתאים להשתמש דופלקסים RNA סינתטיים, לרבות שני oligonucleotides 21-mer ללא שינוי, אשר ניתן לקבץ ליצור siRNAs. RNAi siRNA כי השתמשנו במחקר הנוכחי הוא שיטה פשוטה ויעילה מאוד transfect תאים, מגיב זה עובד עם שורות תאים הנציחו שונות. במחקר הנוכחי, אנחנו מדגימים את השיטות בהן השתמשו בניתוח זה, כולל assay הפצע כיוונית הנגרמת מאפס, סופג המערבי, assay transfection siRNA, assay immunofluorescence, cytometry הזרימה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
שורת תאים 1.
2. ניתוח כתם המערבי לאחר יצירת פצעים Scratch אפיתל
3. siRNA Transfection Assay 10
4. Assay כתם המערבי עבור תאים-טרנספקציה siRNA 11
5. נגרמת Scratch ערכת Assay פציעה כיוונית של נדידת תאי 12
6. ניתוח cytometry זרימה של אפופטוזיס
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הביטוי של HSP27 פוספורילציה גדל באופן משמעותי ב 5, 10, ו -30 דקות לאחר שריטה ופצע לעומת HCECs unwounded 13. ניתוח כתם המערבי גילה כי הביטוי של פוספורילציה HSP27 ו פוספורילציה Akt הופחתו הן באופן משמעותי, ואילו הביטוי של Bax הוגדל משמעותית HCECs-טרנספקציה siRNA ספציפיים-HSP27 (איור 1 א-ה). הביטוי HSP27 פוספורילציה הופחת ב -30% ו -40% ב 10 ננומטר ו -50 ננומטר של HSP27 ספציפי בתאי-טרנספקציה siRNA, בהתאמה, לעומת תאי-טרנספקצי...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
במחקר הנוכחי הערכנו את התפקיד הפוטנציאלי של HSP27 בפציעה אפיתל בקרנית באמצעות גישות מבחנה . השלבים הקריטיים כללו טרנספקציה של siRNA עבור נוק-דאון HSP27 כדי לצפות בתפקוד של HSP27 בתאים הנתונים ללחץ. יש לציין כי תפקידו של HSP27 התגלה בניסויים אלה בנדידת תאי אפיתל ואפופטוזיס במהלך ריפוי פצעי אפיתל בקרנית. בניגוד למחקרים קודמים10 שהשתמשו ב-siRNA ספציפי ל-HSP27 של חולדות כדי להעביר תאי שריר חלק בכלי הדם, השתמשנו בטכניקת טרנספקציה של siRNA כדי לשנות את ביטוי הגנים ב-CECs אנושיים כדי להפיל ביעילות ביטוי גנים...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
יש המחברים שום אינטרסים כלכליים או קניינים כל חומר או שיטות שהוזכר במחקר זה.
מחקר זה נתמך על ידי מענק מחקר סטודנטים (13-14) של אוניברסיטת אולסן המכללה לרפואה, בסיאול, קוריאה ומענק (2014-464) ממכון אסאן למדעי החיים, בסיאול, קוריאה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| ארון בטיחות ביולוגי | CHC LAB ושות' בע"מ, דאג'און, הרפובליקה של קוריאה | CHC-777A2-06 | מחלקה II, סוג A2 |
| RNAi&trade חמקן; siRNA | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | RNAi siRNA; בקרה-siRNA מקושקשת ו-siRNA ספציפי ל-HSP27 | |
| BEGMTM | Lonza, Inc., Walkersville, MD | CC-3171, CC4175 | מדיום גידול אפיתל הסימפונות |
| מעכב פרוטאז | סיגמא-אולדריץ', בע"מ, סנט לואיס, מיזורי | P8340, P7626 | 1 & #956; M פפסטאטין A, 1 & #956; M Leupepettin, 0.1 μ M בדיקת חלבון אפרוטינין |
| ברדפורד | מעבדות ביו-ראד, הרקולס, קליפורניה | #500-0001 | בדיקת חלבון ברדפורד |
| מסנני ניטרוצלולוזה | אמרשם, ליטל צ'לפונט, בריטניה | RPN3032D | קרום הכתם המערבי |
| HSP27 | Abcam Inc., קיימברידג', MA | ab12351 | 1:1,000 דילול (סה"כ HSP27) |
| HSP27 זרחני (Ser85) | Abcam Inc., קיימברידג', MA | ab5594 | דילול 1:1,000 HSP27 היה זרחני ב-Ser85 |
| Lipofectamine® RNAiMAX reagent | Invitrogen, Carlsbad, CA | 13-778-075 | מגיב טרנספקציה |
| Phosphorylated Akt (Ser473) | טכנולוגיית איתות תאים, דנברס, MA | מס' 4060 | 1:1,000 דילול Akt היה זרחן ב-Ser473 (סמן הישרדות תאים) |
| Akt לא זרחני; | טכנולוגיית איתות תאים, דנברס, MA | מס' 4061 | דילול 1:1,000 (Total Akt) |
| חלבון X הקשור ל-Bcl-2 | טכנולוגיית איתות תאים, דנברס, MA | מס' 4062 | 1:1,000 (סמן חלבון אנטי-אפופטוטי) |
| GAPDH | סנטה קרוז ביוטכנולוגיה, סנטה קרוז, קליפורניה | מס' 4063 | 1:1,000 סמן בקרת העמסה (גן לשמירת בית) |
| חזרת פרוקסידאז מצומד נוגדנים נגד ארנב | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | NCI1460KR | 1:10,000 דילול |
| OPTI-MEM | Invitrogen, קרלסבד, קליפורניה | 31985 | מדיום סרום מופחת לטרנספקציה |
| תוכנה לניתוח תמונות | Olympus, Inc., טוקיו, יפן | Image-Pro Plus 5.0 | |
| אבקת חלב דל שומן | Carl Roth GmbH + Co. KG, Karlstruhe, גרמניה | T145.2 | |
| Tris | אמרסקו LCC, בע"מ סולון, אוהיו | מס' 0497 | |
| נתרן כלורי | Amresco LCC, Inc. Solon, OH | No-0241 | |
| צלחת תרבית שש בארות | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | 140675 קוטר 35.00 מ"מ / | |
| באר צלחת 24 בארות | Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, MA | 142475 | |
| שייקר אורביטלי | N-Bioteck, Inc., סיאול, דרום קוריאה | NB1015 | |
| אלבומין סרום בקר | סנטה קרוז ביוטכנולוגיהסנטה קרוז, קליפורניה | sc-2323 | |
| BDFACSCantoTM II | BD Biosciences, פרנקלין לייקס, ניו ג'רזי | ציטומטריית זרימה | |
| ציטומטריית רנטגן סרט רנטגן | קודאק, רוצ'סטר, ניו יורק | קלטת רנטגן רפואית עם מסך ירוק 400 | |
| ריאגנט לומינול ווסטרן בלוטינג | סנטה קרוז ביוטכנולוגיה, סנטה קרוז, קליפורניה | SC-2048 | |
| ערכת זיהוי אפופטוזיס FITC Annexin V I | BD Biosciences, פרנקלין לייקס, ניו ג'רזי | 556547 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.