כאן אנו מציגים פרוטוקול להערכת שאירים זרע, נביטה תרדמת בתנאי שדה באמצעות קבור, רצועות זרע שכותרתו כלוריד tetrazolium בדיקות כדאיות (ט"ז).
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
כאן אנו מציגים פרוטוקול להערכת שאירים זרע, נביטה תרדמת בתנאי שדה באמצעות קבור, רצועות זרע שכותרתו כלוריד tetrazolium בדיקות כדאיות (ט"ז).
אנו מתארים טכניקות לקירוב דינמיקת בנק זרעים לאורך זמן באמצעות Helianthus annuus כדוגמה למין מחקר. ניתן לקפל ולהדביק רצועות של בד פוליאסטר חדיר ודבק לבניית רצועה של תאים המכילים זרעים ומידע מזהה, תוך מתן אפשרות למגע עם תשטיף אדמה, מים, מיקרואורגניזמים וטמפרטורת הסביבה. רצועות עשויות להיבנות עם מגוון רחב של מספרי תאים וגדלים ולאפשר לחוקר לאכלס מגוון גנוטיפים בתוך מין יחיד, מינים שונים או זרעים שחוו טיפולים שונים. בניגוד לחבילות זרעים בודדות, רצועות נשלפות ביתר קלות כיחידה. בעוד שניתן לכלול מנות משוכפלות בתוך רצועה, רצועות שונות יכולות לשמש כבלוקים או שניתן לאחזר אותן בזמנים שונים לצורך תצפית על התנהגות הזרעים לאורך זמן. השתמשנו באקדח דבק בטמפרטורה גבוהה כדי לתחום תאים ואטמנו את הרצועות לאחר הכנסת הזרע והתגים המזהים את הבלוק וזמני ההסרה. לאחר מכן נקברו רצועות הזרעים בשדה בעומק הרצוי, כאשר המיקום סומן להסרה מאוחרת יותר. טורפי בעלי חיים מתחפרים הודרו למעשה על ידי שימוש בכיסוי של בד חומרה מרשת מתכת על פני האדמה. לאחר מרווח הזמן שנבחר לקבורה, נחפרו רצועות והזרעים הוערכו לנביטה, תרדמה ותמותה. בעוד שלעתים קרובות ניתן להבחין בין זרעים מתים בבירור לבין זרעים חיים לא מונבטים בעין, זרעים רדומים זוהו באופן חד משמעי באמצעות מבחן קולורימטרי סטנדרטי של טטרזוליום כלוריד לכדאיות זרעים.
המטרה הכללית של שיטה זו היא להעריך הישרדות זרע ובמהימנות לאורך זמן בתנאי שדה.
בנק זרעי קרקע הם עתודה התפזרו, זרעי קיימא עדיין ungerminated מופצים גם על פני הקרקע, בתוך חול משטח, או בתוך פרופיל הקרקע, אשר עשוי להימשך זמני או במשך שנים רבות 1,2. כאשר שיטות קבורות זרע דומה לזו המוצגת כאן יושמו מחקר 17 שנים באמצעות כמה עשרות מינים, זרעי קיימא נמצאו רבי מהמינים נבדקו 3. תרדמת זרעים היא לחסום זרע נביטה עד השילוב המתאים של תנאי שתיל הישרדות להתעורר 4. נותרים רדומים יכול להרשות זרעים לשרוד בתנאים קשים, כגון טמפרטורות חורף נמוכות, הגבלה מזינה, או בצורה עונתית, עד טריגר חיצוני עבור תרדמת שחרור מאפשר נביטה. מפעיל עבור שחרור תרדמת יכול להשתנות כתוצאה מחשיפת תרכובות קרות, הוארכו שהותירו fזעמם, או תקיפה פיזית על קליפת הזרע דרך שחיקה או במגע עם חומצות הקיבה חיה 5. כרמזי נביטה יכולים להיות סוגים או מינים ספציפיים לעתים קרובות תוצאה של ברירה טבעית בעבר, נביטת זרעים הסתגלותי הוא המתרחש בזמן לא מתאים, ועלול לגרום לתמותת זרע או שתיל או צמיחת שתיל מסכנה. בעוד תרדמת סווגה למספר סוגים על פני המנגנונים של שחרור תרדמת (למשל, תרדמת גופנית, תרדמת פיזיולוגית), 6 תרדמת זרעים נשארת אחד לפחות הבין נושאים בביולוגית צמח. לכן, מחקרים בתחום המאפשרים הערכה על המצב של זרעים בודדים או קבוצות של זרעים בתנאים אקולוגיים רלוונטיים יש כוח הסבר גבוה יותר מענפים פשוט לסמוך על בדיקות נביטת תקן במעבדה.
ניצול של מאפייני זרע ידועים יכול לספק תובנה לתוך המנגנונים של תרדמת. פיקוח על תרדמת זרעים הוא שיתוףmplex, לרבות הבקרה הגנטית של גורמים פיזיולוגיים מורפולוגיים. בעוד הבנה מלאה של הרוחב של מנגנוני תרדמת טרם הובהרה, מודל כללי התפתח, מעורב מערכת יחסים היזון חוזר בין שני ההורמונים הצמחיים Gibberellic החומצה (GA) ו abscisic חומצה (ABA) 7. במודל כללי זו לזרעים עם מרכיב פיסיולוגי התרדמת שלהם, GA משמש אות לשחרור תרדמת, בעוד ABA משמש כדי לשמור על במצב הרדום. השפעות גנטיות אימהיות כמו גם בסביבת הגידול האימהית יכול להשפיע תרדמת ותכונות זרע אחרות, כגון גודל, דרך רקמות שנוצרו אימהי ו -8 אותות התפתחותיים. אימהי שנוצר מבנים חיצוניים (או כיסויי זרע) תהא רשאית להותיר תרדמת, לעיתים בשילוב עם רמזים פיזיולוגיים. מאז כיסויי זרע נגזר אימהי נשלטים על ידי הגנים של הצמח האם, הם עלולים שלא לשקף את ההרכב הגנטי הגרעיני בפועל של הזרע. אנחנו צריכים אותנואד achenes annuus Helianthus מתוך מערך של היברידית יבול-בר חוצה כדי להקניט את השפעות גנטיות העובר לעומת אימהי אלה על מאפייני זרע 9,10. לפיכך, עיצובי מחקר הכוללים מינים שונים, סוגי צלב, או גנוטיפים יכולים ללקט מידע על אקולוגיה וגנטיקה של זרע תרדמת, נביטה והישרדות.
דוגמא חשובה של כמה פנוטיפים נביטה והישרדות זרע יכולים להשפיע דינמיקה באוכלוסייה ניתן לראות אזורי כלאי יבול-בר. בחירה במהלך הביות של צמחי מעובדים תבטל את רוב התרדמת ומפחיתה את יכולתו של זרע לשרוד מחוץ עונת הגידול. עם זאת זרימת גנים, או הכלאה בין הסוגים המעובדים ופרועים באזורים היברידיים יבול-בר יכולה לחדש אללים יבול (או וריאנטים גנטיים) לתוך אוכלוסייה בטבע, עם השפעות אפשריות על דינמיקת בנק זרעים. כלאיים בין קרובים טפחו ופרוע נמצאים פוטנציאל אזורי כלאיים-בר יבול עשוי להחזיקמגוון של פנוטיפים תרדמת ביניים, עם רק כמה פנוטיפים צפויים לשרוד בתנאים מחוץ הטיפוח (למשל, בחודשי החורף) 11.
מטרת כתב היד הזה היא להראות כיצד, בשיטת רצועת קבורת הזרע, אנחנו יכולים להעריך נביטה, תרדמת, והישרדות של מגוון רחב של זני זרעים בתקופות זמן שונים כדי לחקור השונות הטבעיות שלהם בתנאי שדה. בדוגמא שלנו, העסקנו גרעינים מ -15 סוגי צומח פרה היברידי צלב מאז אנו מעוניינים השפעות גנטיות אימהיות העוברות על מאפייני זרע.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. לאסוף זרע ממינים מרובים או מבוקרת צלבים של מין יחיד
הערה: זה זרע למשל בשימוש מ 15 סוגים הדדית בתוך annuus המינים Helianthus (חמניות) באמצעות פרא, היברידי, וסוגי יבול כמו (המייצר זרע) האימהי ההורה.
| האם אימהי | |||
| האם אבהי | Wild: WxW | F 1: WXC | יבול: CXC |
| Wild: WxW | 0% WxW | 25% F 1 XW † | 50% CxW † |
| BC: WxF1 או F1xW | 12.5% WxBC | 37.5% F 1 xBC | 62.5% CxBC |
| F 1: WXC | 25% WxF 1 † | 50% F 1 XF 1 | 75% CXF 1 † |
| F 2: F 1 XF 1 | 25% WxF 2 | 50% F 1 XF 2 | 75% CXF 2 |
| יבול: CXC | 50% WXC † | 75% F 1 XC † | 100% CXC |
טבלה 1. t צלב הוריםypes המופק אבקה ביד. סוגי צלב היברידיים יבול-בר חמניות יוצרו עם אבקה ביד לשימוש בניסוי קבורת זרע. מתאים לכל סוגי הצלב, ההורה האימהי המפורטים ראשון וההורה האבהי מפורט שני. סוגי צלב מסומנים † הם חלק זוגות סוג צלב גומלין עם אללים יבול באותה% אבל הורים אימהיים שונים. לוח שפורסם בעבר ב: פייס, BA et al. (2015) 15.
2. יצירת רצועות קבורות זרע מותאמים אישית
הערה: בדוגמא זו, היו לנו שלושה טיפולים להסרת תאריך 15 משכפל, כך אנו נדרשים 45 רצועות כוללות. דוגמה זו משתמשת ב -15 תאים לכל רצועת כך, אנו נדרשים מספיק בד או וכילה פוליאסטר מרושת בסדר לשכן 15, 7 x 10 תאים ס"מ. ראה איור 1.

איור 1. סכמטי זרע רצועת קבורה. דוגמה של רצועת קבורה מראה זיהוי סוג צלב לסלוני הפרט. ההורה אימהי מופיע ראשון עם ההורה האבהי המפורט שני. צבעים מצביעים הורות אימהית שונה,עם צהוב פראי, כחול היברידי F 1, ואדום לזריעה. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
3. Bury רצועות זרע בתחום
4. לחפור רצועות ולהעריך זרע
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
סוגים צלב עם אחוז אלל הורות ועל היבול אימהי מגוון (טבלה 1) שונים ברחבי תאריכי הסרה באחוזים מונבטים, ungerminated, וזרעים מתים (איור. 2 ו -3). באמצעות בדיקות TZ של זרעי ungerminated, מצאנו כמה זרעים רדומים באמת על סילוקו השני (בתחילת האביב) (טבלה 2), בעוד כל הזרעים ungerminated ידי ההסרה השלישית (האביב) נמצאו רדום באמת.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כאן אנו מציגים שיטות באמצעות רצועות קבורת הזרע להתבונן זרע נביטה, תרדמת ותמותה של מלאי מקור מגוונים בתקופות זמן שנבחרו מראש בתחום. היתרונות של שימוש רצועות ולא מנות בודדות לשכב (1) מהירות רצועה ובניית תא על בריאה של מנות בודדות; ו (2) הקלות והמהירות של הסרת תאים מרובים בתנועה אחת ללא הסכנה של השמטת חבילה או הסרה אחד שלא בכוונה. כפי שני מבין המועדים להסרת בדוגמה המוצגת כאן היו בחודשי החורף כאשר הקרקע היא קשה והן מבחינת התנאים הם קרים, שיטה זו מפחיתה הן העבודה ואת הפוטנציאל לטעויות ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין מה לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי תוכנית המענקים להערכת סיכונים ביוטכנולוגית מס' תחרותי 2006-39454-17438 ל- A. Snow, K. Mercer ו- H. Alexander ממשרד החקלאות של ארצות הברית, המכון הלאומי למזון וחקלאות. ניסויים בשיטה זו נערכו ונתמכו על ידי תחנת השדה של אוניברסיטת קנזס, יחידת מחקר של הסקר הביולוגי של קנזס ואוניברסיטת קנזס. המחברים רוצים להודות ל-P. Jourdan ו-E. Regnier על סקירות מועילות על גרסאות קודמות של כתב היד הזה. בנוסף, עבודה זו נעזרה בתרומות של הצוות בתחנת השדה של אוניברסיטת קנזס, חוות ווטרמן באוניברסיטת אוהיו סטייט (OSU), מרכז הגרמפלזמה של צמחי הנוי של USDA ב-OSU, והמעבדה לביולוגיה של זרעים במחלקה לגננות ומדעי הגידולים ב-OSU, במיוחד E. Renze, S. Stieve, A. Evans, ו-E. Grassbaugh, לתמיכה טכנית.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| מעטפות מטבעות קטנות | כל | ||
| מעטפות מטבע גדולות | כל | ||
| רשת יתושים פוליאסטר משורשת עדינה | כל | ||
| אקדח דבק בטמפרטורה גבוהה | כל | ||
| מקל דבק בטמפרטורה גבוהה ממלא | מחדש כל | ||
| סמן קבוע תעשייתי | כל | ||
| תוויות גינה | מפלסטיק כל | ||
| מספריים | כל | ||
| חפירה | כל | ||
| רשת מתכת בד קשה | כל | ||
| דגלי מודד, צבעים מרובים | כל | ||
| עיתון רטוב | כל | ||
| מצנן | כל | ||
| נייר כתמים | כל | ||
| צלחות פטרי | כל | ||
| טמפ' תא גידול מבוקר | כל | ||
| סכיני גילוח | כל | ||
| כלי פטרי | כל | ||
| טטרזוליום כלוריד | כל | ||
| מים | כל | ||
| חום חממה | כל |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.