כאן, אנו מציגים פרוטוקול להחדרת בדיקות כימיות באופן ספציפי לתוך מקטע נוגדנים על ידי שילוב גנטי של חומצת אמינו המכילה אזיד, ולאחר מכן צימוד האזיד עם בדיקה כימית על ידי תוספת ציקלו-אזיד-אלקין המקודמת על ידי זן (SPAAC).
מאמר שיטה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| <חזק>1. בניית פלסמיד | |||
| פלסמיד pBAD_HerFab_L177TAG | אופציונלי להכיל את קודון העצירה הענבר (TAG) במיקום הרצוי. Ko, W. et al. תיוג נוגדנים יעיל וספציפי לאתר על ידי תוספת ציקלו-אזיד-אלקין המקודמת על ידי זנים. BKCS. 36 (9), 2352-2354, doi: 10.1002/bkcs.10423, (2015) | ||
| פלסמיד pEvol-AFRS | Young, T. S., Ahmad, I., Yin, J. A., and Schultz, P. G. מערכת משופרת למוטגנזה לא טבעית של חומצות אמינו ב-E. coli. J. Mol. Biol. 395 (2), 361-374, doi: 10.1016/j.jmb.2009.10.030, (2010) | ||
| DH10B | Invitrogen | C6400-03 | מארח |
| פלסמיד מיני ערכת הכנה | Nucleogen | 5112 | 200/pack |
| Agarose | Intron biotechnology | 32034 | 500 גרם |
| אתידיום ברומיד | אלפא Aesar | L07482 | 1 גרם |
| מרק LB | BD Difco | 244620 | 500 g |
| <חזק>2. הכנת תרבית | |||
| <חזק>2.1 אלקטרופורציה | |||
| מיקרו פולסר | BIO-RAD | 165-2100 | |
| מיקרו פולסר | קובטה BIO-RAD | 165-2089 | 0.1 ס"מ פער אלקטרודות, חבילה של 50 |
| אמפיצילין נתרן | וואקו | 018-10372 | 25 גרם |
| כלורמפניקול | אלפא Aesar | B20841 | 25 גרם |
| אגר | SAMCHUN | 214230 | 500 גרם |
| SOC בינוני | סיגמא | S1797 | 100 מ"ל |
| <חזק>3. ביטוי וטיהור של HerFab-L177AF | |||
| 3.1 ביטוי של Herfab-L177AF | |||
| p-azido-L-phenylalanine (AF) | Bachem | F-3075.0001 | 1 גרם |
| L(+)-Arabinose, 99% | Acros | 104981000 | 100 גרם |
| חומצה הידרוכלורית, 35~37% | SAMCHUN | H0256 | 500 מ"ל |
| <חזק>3.2 ליזיס תאים | |||
| טריס(הידרוקסימתיל)אמינומתאן, 99% | SAMCHUN | T1351 | 500 גרם |
| EDTA דיסודיום מלח דיהידרט, 99.5% | SAMCHUN | E0064 | 1 ק"ג |
| סוכרוז | סיגמא | S9378 | 500 גרם |
| ליזוזים | סיאקו | 126-0671 | 1 גרם |
| <חזק>3.3 Ni-NTA כרומטוגרפיה של זיקה | |||
| שרף Ni-NTA | QIAGEN | 30210 | 25 מ"ל |
| עמוד פוליפרופילן | QIAGEN | 34924 | 50/אריזה, קיבולת 1 מ"ל |
| אימידזול, 99% | SAMCHUN | I0578 | 1 ק"ג |
| נתרן פוספט מונובסיסי, 98% | SAMCHUN | S0919 | 1 ק"ג |
| נתרן כלורי, 99% | SAMCHUN | S2907 | 1 ק"ג |
| <חזק>4. צימוד של HerFab-L177AF מטוהר עם בדיקות אלקין באמצעות Azide-alkyne Cycloaddition (SPAAC) | |||
| Cy5.5-ADIBO | FutureChem | FC-6119 | 1 מ"ג |
| <חזק>5. טיהור מסננים צנטריפוגליים מסומנים HerFab | |||
| Amicon Ultra 0.5 מ"ל | MILLIPORE | UFC500396 | 96/חבילה, 500 ו-#956; קיבולת L |
| <חזק>6. ניתוח SDS-PAGE של HerFab וסריקת ג'ל פלואורסצנטי | |||
| 1,4-Dithio-DL-threitol, DTT, 99.5% | Sigma | 10708984001 | 10 גרם |
| NuPAGE LDS מאגר דגימה, 4x | Thermofisher | NP0007 | 10 מ"ל |
| MES מאגר ריצה | Thermofisher | NP0002 | 500 מ"ל |
| Nupage Novex 4-12% SDS PAGE ג'לים Thermofisher | NO0321 | 12 בארות | |
| Coomassie Brilliant Blue R-250 | Wako | 031-17922 | 25 גרם |
| טייפון 9210 מצלמת מצב משתנה | Amersham Biosciences | ||
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה