זה וזמינותו מלכיט ירוק עם pT שימש למדידת פעילות PP2Ac כי זה קל יותר לביצוע מאשר השיטה הקלאסית המשתמשת 32מתויג P סובסטרטים. יתרון נוסף של assay הזה על מבחני רדיואקטיבי היא רדיואיזוטופים להוות סיכון מסוים, עשויה להיות יקרה, במיוחד 32מולקולות מתויג P זה יש חצי חייהם קצר, אשר מגביל את מספר מבחני אחד יכול לבצע לפני ריאגנטים לפוג. באמצעות מלכיט ירוק יותר מאשר רדיואקטיביות גם מבטל את הצורך להיפטר 32P פסולת. מבחני מלכיט ירוק הם גם מאוד רגיש כאשר מודדים את הפעילות של phosphatases סרין/תראונין בהשוואה assay ערכי צבע מוחלטים אחרת העושה את המצע p-nitrophenylphosphate (pNPP), וזו לא בררניים כפי שהוא יכול להיות dephosphorylated על ידי מספר רחב של אנזימים32.
קיטים מסחריים מלכיט ירוק כדי למדוד פעילות PP2A היו זמינים כבר כמה זמן, שימשו בעבר במעבדה. עם זאת, כאשר עושים מבחני מלכיט ירוק רבים, ערכות כאלה הפך יקר מדי. בנוסף, קיטים מסחריים לפעילות PP2A יציבים רק לשנה אחת, בעוד שיש ריאגנטים זמין בצורת אבקה, עם אחסון נאות, מספקים רכיבים זמינים assay יציבים מבחינה מבנית במשך פרקי זמן ארוכים.
לפני בדיקת bSyn ו- gSyn, aSyn שימש כפקד חיובי כדי לעורר פעילות PP2Ac, כדי לקבוע את כמות PP2Ac הדרושים עבור מבחני, גם כדי לוודא כי הנתונים המתקבלים יישארו על הסולם עם עקומת סטנדרטי (150-2400 pmol של פו4 ). ראוי לציין שאם aSyn מעוררת PP2Ac הנשים האלה, למרות התגובה היא בדרך כלל ליניארי, נתונים יכבה סולם, כימיקלים בפתרון ההנהלה לזרז, ואי אפשר למדוד כמויות מדויקות של חינם-פו שפורסמו4 עם צלחת הקורא.
בהתחשב בכך aSyn תורם PP2Ac פעילות בתוך vivo ו- in vitro לקשרי12,19,21,23,25, וכי כל synucleins יש הומולוגיה ניכרת, זה היה שיערו כי כל בני המשפחה synuclein עשוי להיות מסוגל לעורר PP2Ac בתוך התא מבחני חינם. באמצעות ערכי צבע מוחלטים וזמינותו המתוארת כאן, התברר כי אכן, כל synucleins רקומביננטי שלוש (aSyn, bSyn, gSyn) המרצת פעילות PP2Ac, מעלים את האפשרות כי כל synucleins שלוש עשויה לבצע פונקציות דומות במערכת העצבים. עם זאת, המוח של פרקינסון או דמנציה עם הגוף לוי מקרים יש פחות פעילות PP2Ac ברקמות המכילות מאוד המצטברים aSyn23. העכבר רקמות מחסה לוי פתולוגיה הגוף כמו גם ייתקלו צמצום פעילות PP2Ac25. ואת הנתונים החדשים באיור 3, כמו גם נתונים קודמים עכברים knockout aSyn12, ממליץ כי לא bSyn ולא gSyn יכול בדרך כלל לפצות על האובדן של aSyn מסיסים במוח, או לחלופין זה homologs synuclein האלה אולי לא לשייך PP2Ac כמו aSyn כמו שמוצג (איור 3). הרי האטלס המוח אלן מראה colocalization של mRNAs synuclein שלוש כל בתחומים רבים של המוח, למרות synuclein טריפל נוקאאוט עכברים היה שנוצר9,33, PP2Ac פעילות לא העריך במודל הזה. מעניין, aSyn זה הוא phosphorylated על Ser129 על ידי פולו דמוי קינאז 2, הוא פחות מסוגל להפעיל PP2Ac12, אבל הראיות המוצגות כאן עבור bSyn להציע את זרחון bSyn סביר לפגיעה פעילות PP2Ac, כפי bSyn מעט מאוד ירד עם PP2Ac במוח העכבר (איור 3). יחדיו, הנתונים מראים כי אנדוגני מאפננים פעילות PP2Ac, כמו aSyn, עשויה לתרום בריאות ומחלות.
פרוטוקול שמפורטות כאן היא טכניקה פשוטה אך רבת עוצמה כדי לקבוע את הקיבולת של PP2Ac כדי dephosphorylate מצע phosphopeptide בתגובה טיפולים שונים. למשל, ניתן להשתמש באותה מתודולוגיה זו לבחון אחרים מפעילים PP2Ac, כגון סרמידים, כמו גם פוטנציאל הריפוי34, או כדי להעריך את ההשפעה של PP2Ac מעכבי במבחנה. חשוב גם לציין כי מבחני דומה יכול למדוד את הפעילות של PP2Ac זה מבודד 1D 6 immunoprecipitation תמציות תאים או רקמות הגוף, כפי שצוין בעבר שתואר על ידי מחברים12,19, 25. העתיד יישומים עבור וזמינותו מלכיט ירוק קיים מעבר מדידת פעילות PP2Ac, כפי ATP פעילות ניתן גם לקבוע באמצעות כזה וזמינותו של.
שימו לב, עיקול רגיל להפיקם בכל פעם עבור כל assay PP2Ac עצמאית. זה הכרחי כדי להבטיח כי ריאגנטים כל שימוש חינם, פוספט מלחי חינם באופן מלאכותי להגדיל את האות רקע, לתוצאות שגויות ביום של וזמינותו זה חיוני כדי להכין פתרון ההנהלה טריים מספיק עבור כל דוגמאות להיות לבדיקה. גם, ההנהלה הוא רק טוב היום. זה עשוי, נוטה לזרז אחרי כמה שעות. PP2Ac נרכשה מספק חייב להיות aliquotted ומאוחסנים קפוא מיד לאחר קבלתו כדי למנוע מחזורים הפשרת ההקפאה להפחית את פעילותה. כמו אחרים phosphatases ניתן dephosphorylate המצע pT (למשל PP1 ו PP535), כאשר ניתוח תמציות תאים או רקמות שבו PP2Ac לא היה מבודד על ידי immunoprecipitation, דגימות חייבים להיות מועברים על עמודות כדי להסיר פוספטים חינם מעכבים ספציפיים של phosphatases צריך לשמש כדי לאשר ירידה לפרטים פוספטאז, כפי שתואר לעיל18.