כאן, אנו מתארים בפירוט רב פרוטוקול מבוסס וחזק למיצוי גלוקוזינולטים מחומרים צמחיים טחונים. לאחר טיפול בסולפטאז על העמודה של התמציות, הדסולפוגלוקוזינולטים נפלטים ומנותחים על ידי כרומטוגרפיה נוזלית בלחץ גבוה.
Method Article
כאן, אנו מתארים בפירוט רב פרוטוקול מבוסס וחזק למיצוי גלוקוזינולטים מחומרים צמחיים טחונים. לאחר טיפול בסולפטאז על העמודה של התמציות, הדסולפוגלוקוזינולטים נפלטים ומנותחים על ידי כרומטוגרפיה נוזלית בלחץ גבוה.
גלוקוזינולטים הם קבוצה מגוונת ונחקרת היטב של תרכובות צמחיות טבעיות. הם ממלאים תפקידים חשובים בעמידות צמחים, איכות שמן לפתית, טעם מזון ובריאות האדם. הפעילות הביולוגית של גלוקוזינולטים משתחררת עם נזק לרקמות, כאשר הם מעורבבים עם האנזים מירוזינאז. התוצאה היא היווצרות תוצרי פירוק חריפים ורעילים, כגון איזותיוציאנטים וניטרילים. נכון לעכשיו, זוהו יותר מ-130 גלוקוזינולטים שונים מבחינה מבנית. המבנה הכימי של הגלוקוזינולט הוא גורם חשוב במוצר שנוצר, אשר בתורו קובע את פעילותו הביולוגית. האחרון עשוי לנוע בין מזיק (למשל, פרוגואיטרין) למועיל (למשל, גלוקורפנין). לכל מין צמחים המכיל גלוקוזינולט יש פרופיל גלוקוזינולט ספציפי משלו. מסיבה זו, חשוב לזהות נכון ולכמת באופן אמין את הגלוקוזינולטים השונים הקיימים בגידולי עלים, זרעים ושורשים או, לצורך מחקרים אקולוגיים, בקרוביהם הפראיים. כאן, אנו מציגים שיטה מתוקפת, ממוקדת וחזקה לניתוח פרופילי גלוקוזינולט במגוון רחב של מיני צמחים ואיברי צמחים. גלוקוזינולטים שלמים מופקים מחומרים צמחיים טחונים עם תערובת מתנול-מים בטמפרטורות גבוהות כדי להשבית את פעילות המירוזינאז. לאחר מכן, התמצית המתקבלת מובאת על עמוד חילופי יונים לטיהור. לאחר הטיפול בסולפטאז, הדסולפוגלוקוזינולטים נפלטים במים והאלואט מיובש בהקפאה. השאריות נקלטות בנפח מדויק של מים, אשר מנותח על ידי כרומטוגרפיה נוזלית בלחץ גבוה (HPLC) עם מערך פוטודיודות (PDA) או גלאי אולטרה סגול (UV). זיהוי וכימות מושגים על ידי ביצוע השוואות של זמני השמירה וספקטרום ה-UV של תקני ייחוס מסחריים. הריכוזים מחושבים על סמך עקומת ייחוס סיניגרין וגורמי תגובה מבוססים היטב. היתרונות והחסרונות של שיטה פשוטה זו, בהשוואה לשיטות מהירות ומתקדמות יותר מבחינה טכנולוגית, נדונים כאן.
הערכה היא כי צמחים מייצרים למעלה מ -200,000 סוגים שונים של תרכובות כימיות 1. רק המיעוט של תרכובת אלה נראה למלא תפקיד בחילוף החומרים העיקריים של הצמח, אשר דלקי גידול ורבייה; מה שנקרא הרוב הם מטבוליטים משניים. למרות שמם, מטבוליטים משניים הם לעתים קרובות קריטיים להישרדות צמח ורבייה, כפי שהם משרתים למשוך מאביקים או להגן על הצמח מפני פתוגנים ואוכלי עשב 1.
Glucosinolates הם קבוצה מגוונת מאוד של מטבוליטים משניים כי נחקרו למעלה מ -150 שנה 2. נכון להיום, יותר מ -130 glucosinolates שונים מבחינה מבנית זוהו 3. באופן כללי, glucosinolates נחלק לסוגים שונים המבוססים על חומצות אמיניות שממנו הם מסונתזים. glucosinolates אינדול, למשל, מסונתזים מן חומצת אמינוטריפטופן, פנילאלנין ואילו מספק את שלד הבסיס לסינתזה של glucosinolates ארומטיים 4. במסגרת שיעורים, יש רמה גבוהה של גיוון מבני, אשר מובא על ידי צעדי התארכות שרשרת רציפי מסלולי biosynthetic, כגון בכיתה של glucosinolates אליפטיות, או על ידי שינויי שרשרת צד (למשל, hydroxylation) 4, 5. אחת מיני צמחי glucosinolate עשויים להכיל עד 37 glucosinolates שונים השייכים כיתות מבניות שונות 6. למרות מיני צמחים יש פרופילים glucosinolate טיפוסי, וריאציה intraspecific עבור סוגי glucosinolates נמצא לעתים קרובות בקרב אנשים ואוכלוסיות 6, 7. Glucosinolates השלם מאוחסן vacuoles של תאי צמח ניתן למצוא בכל איבר עילי או belowground 7, 8, 9. עם תא קרע (למשל, על ידי herbivory), glucosinolates משתחררת מעורבבות עם האנזים myrosinase בקיזוז פצצת שמן חרדל 10. בשל הפעילות של myrosinase, ו בהתאם למבנה של glucosinolate, תנאי התגובה, ואת הנוכחות של אנזימי שינוי, תרכובות חריפות, רעילות או מזיקים שונות נוצרות, כגון nitriles ו (ISO) thiocyanates 11. מוצרי התגובה יש פעילויות ביולוגיות גבוהות; למשל, הם משמשים דוחים של אוכלי עשב חרק generalist 12. התורשתיות ואת biosynthetic המסלולים של glucosinolates נלמדים היטב, בעיקר בגלל חשיבותם אוכלי עשב והתנגדות הפתוגן, ערכם כרכיבי טעם ב חרדל וכרוב, והשלילי שלהם (progoitrin) וחיוביות (glucoraphanin) השפעות על בריאות אדם 5, 13, 14.
בגלל העניין הרב glucosinolates כמו תרכובות ביולוגיות אקטיביות, שיטות חילוץ וזיהוי מבוססות על כרומטוגרפיה הנוזלית התהפכו פאזיים בלחץ גבוה (HPLC) מצויד אולטרה סגול (UV) או מערך photodiode (PDA) גלאים כבר נפוצים מאז 1980 15 . בהתבסס על שיטה זו, הקהילה האירופית פרסמה פרוטוקול סטנדרטי אשר נבדק ומאומת בכמה מעבדות לניתוח של glucosinolates ב בוטנים (Brassica napus, כרוב הנפוס, קנולה 16). אחרים הוסיפו שיטה זו (למשל, על ידי קביעת גורמי מענה נוספים עבור glucosinolates שאינם נוכחים אונס זרעים להפקת שמן) 17. למרות הזמינות הגוברת של ספקטרומטריית מסה כרומטוגרפיה נוזלית (LC-MS) פלטפורמות ופרוטוקולים תפוקה גבוהה לניתוח glucosinolate 18 , 19, שיטת HPLC-UV / PDA המקורי עדיין נעשה שימוש נרחב על ידי מדענים. הסיבות העיקריות הן כי שיטה זו היא פשוטה, חסכונית, יחסית נגיש למעבדות ללא תשתית הידע הכימי-אנליטי נרחב. כדי לשרת את הקהילה הזו, אנחנו כאן בפירוט את הפרוטוקול עבור החילוץ של glucosinolates מחומרים הצמח ועל ניתוח desulfo-צורותיהם עם HPLC-PDA.
1. הכנת פתרונות דרושה עבור הפקת Glucosinolate
2. הכנת התקנת ההפקה
5 / 55425fig1.jpg "/>
איור 1: Rack להפקת glucosinolate. מבט מלפנים (משמאל) מבט מלמעלה (מימין) של מתלה טור מתוצרת עצמית ולחסום למיצוי glucosinolate. גובה: 100 מ"מ, המרחק בין מוזז חורים (להחזיק את העמודות פיפטה פסטר): 30 מ"מ (ציר x) x 15 מ"מ (ציר y). אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
3. הכנה של עמודות ואבובים Microcentrifuge
הפקת 4. של glucosinolates
5. מדידות HPLC של דוגמאות שחולצו
| זמן [min] | תזרים [mL / min] | % מים | % ב ACN |
| 1 | 0.750 | 98 | 2 |
| 35 | 0.750 | 65 | 35 |
| 40 | 0.750 | 98 | 2 |
| טמפרטורת טור 40 ° C. | |||
טבלה 1: שיפוע אצטוניטריל-מים להפרדה glucosinolate ו לניתוחים על HPLC פאזיים התהפך.
| זמן [min] | תזרים [mL / min] | % מים | % ב ACN |
| 1 | 0.750 | 98 | 2 |
| 10 | 0.750 | 89.3 | 10.7 |
| 11 | 0.750 | 98 | 2 |
| טמפרטורת טור 40 ° C. | |||
טבלה 2: קיצור אצטוניטריל-מים שיפוע כימות מחמשת אזכור sinigrin המשמש כימות של glucosinolates.
6. זיהוי Glucosinolate וכימות

ספקטרום UV איור 2. של מעמדות glucosinolate הנפוצות ביותר. ספקטרום ספיג UV (200-350 ננומטר) של שישה desulfoglucosinolates (GSL), המבוסס על פתרונות עשויים תרכובות התייחסות זמינות מסחרי חילוץ כפי שמתואר כאן, המייצגים את המעמדות מבניות הנפוצות ביותר. השם הנפוץ, sשם tructural (בין סוגריים), ומעמד מבני מקבלים. (א) Sinigrin (2-propenyl GSL), alkenyl; (ב) glucoerucin (4-methylthiobutyl GSL), thioalkenyl; (C) glucoraphanin (4-methylsulfinlybutyl GSL), sulfinyl; (ד) glucobrassicin (indol-3-ylmethyl GSL), אינדול; (E) gluconasturtiin (2-phenylethyl GSL), ארומטי; (F) sinalbin (4-hydroxybenzyl GSL), ארומטי. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
(1)
(2)
(3) שיטה זו מאפשרת זיהוי והפרדה של desulfoglucosinolates נפוץ בכל הכיתות המבניות (איור 3). Progoitrin 2-hydroxyglucosinolate המזיק מגיע יחסית מוקדם הכרומתוגרמה מופרד בבירור מן glucoraphanin glucosinolate המועיל, את methylsulfinylglucosinolate רק מדגם זה. Sinigrin, gluconapin, ו glucobrassicanapin מהווים סדרה eluotropic של glucosinolates alkenyl עם הגדלת אורכי-שרשרת הצד (C3, C4, C5 ו, בהתאמה). סדרה הגיונית דומה גלויה לשני glucosinolates methylthioalkenyl, glucoiberverin (C3) ו glucoerucin (C4). הפסגות של שלושה glucosinolates אינדול, glucobrassicin ונגזרותיו 4-הידרוקסי ו 1-methoxyglucobrassicin (neoglucobrassicin), הם גם הפרדה ברורה. יצוין כי פסגות neoglucobrassicin ו glucoerucin, כמו גם gluconasturtiin, את גלוקו ארומטי רקsinolate במדגם זה, הם גבוהים במיוחד לחלץ Brassica זה נובע מהוספה של תמציות שורש לתערובת 9.

איור 3: הכרומתוגרמה של תמצית glucosinolate. פרט (1-32 דקות) של chromatogram HPLC הנובעים ניתוח של דגימות שורש לירות בשילוב מ nigra Brassica, ב Rapa, ו- B. oleracea. תוויות השיא לציין את זמן שמירה ואת הקיצורים עבור desulfoglucosinolates המזוהה (GSL). progoitrin PRO = (2-OH-3-butenyl GSL); ראף = glucoraphanin (4-methylsulfinlybutyl GSL); SIN = sinigrin (2-propenyl GSL), GNA = gluconapin (3-butenyl GSL); 4OH = 4-hydroxyglucobrassicin; IBV = glucoiberverin (3-methylthiopropyl GSL); GBN = glucobrassicanapin (4-pentenyl GSL); ERU = glucoerucin (4-methylthiobutyl GSL); GBC = glucobrassicin (indol-3-ylmethyl GSL); NAS = gluconasturtiin (2-phenylethyl GSL); NEO = neoglucobrassicin (1-MeOH-glucobrassicin). אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
Glucosinolates methylsulfinyl שרשרת ארוכים יותר, אשר מצויים לרוב צמח המודל ארבידופסיס, גם להראות סדרת eluotropic, כפי שניתן לראות תמצית שורש austriaca Rorippa. Glucohesperalin (C6), glucosiberin (C7), glucohirsutin (C8), ו glucoarabin (C9) להופיע במרווחי זמן קבועים על הכרומתוגרמה (איור 4). יחד עם ספקטרום UV של הפסגות, סדרה eluotropic הגיונית כאלה עשויות לשמש לסווג, ואת זמנים לזהות, glucosinolates הידוע.

איור 4: chromatogram (מסגרת 9-30 דקות) של desulfoglucosinolates בתמצית austriaca שורש Rorippa. תוויות השיא לציין את זמן שמירה ואת הקיצורים עבור desulfoglucosinolates המזוהה (GSL). הס = glucohesperin (6-methylsulfinylhexyl GSL); SBE = glucosiberin (7-methylsulfinylheptyl GSL); GBC = glucobrassicin (indol-3-ylmethyl GSL); HIR = glucohirsutin (8-methylsulfinlyoctyl GSL); ARA = glucoarabin (9-methylsulfinylnonylglucosinolate); NEO = neoglucobrassicin (1-MeOH-glucobrassicin). אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
| שם נפוץ | מבנה שרשרת צד | RT (דקות) * | 229 ננומטר | התייחסות# |
| aliphatiglucosinolates ג | ||||
| Glucocapparin | מתיל | 3.5 | 1 | חום |
| Sinigrin | 2-propenyl | 5.5 | 1 | בראון, EC |
| Gluconapin | 3-butenyl | 9.5 | 1.11 | EC |
| Glucobrassicanapin | 4-pentenyl | 13.5 | 1.15 | EC |
| Glucoiberverin | 3-methylthiopropyl | 10.9 | 0.8 | חום |
| Glucoerucin | 4-methylthiobutyl | 14.0 | 0.9 | חום |
| Glucoiberin | 3-methylsulfinylpropyl | 3.7 | 1.2 | חום |
| Glucoraphanin | 4-methylsulfinylbutyl | 4.9 | 0.9 | חום |
| Glucoalyssin | 5-methylsulfinylpentyl | 7.6 | 0.9 | חום |
| Glucohesperin | 6-methylsulfinylhexyl | 10.5 | 1 | חום |
| Glucosiberin | 7-methylsulfinylheptyl | 13.5 | 1 | חום |
| Glucohirsutin | 8-methylsulfinyloctyl | 16.8 | 1.1 | חום |
| Glucoarabin | 9-methylsulfinylnonyl | 20.5 | 1 | |
| Glucocheirolin | 3-methylsulfonylpropyl | 4.2 | 0.9 | חום |
| Progoitrin | 2 (R) -OH-3-butenyl | 4.5 | 1.09 | בוכנר, EC |
| Gluconapoleiferin | 2-OH-5-pentenyl | 8.3 | 1 | EC |
| glucosinolates אינדול | ||||
| 4-hydroxyglucobrassicin | 4-hydroxyindol-3-ylmethyl | 11.2 | 0.28 | בוכנר, EC |
| Glucobrassicin | indol-3-ylmethyl | 15.3 | 0.29 | בוכנר, EC |
| 4-Methoxyglucobrassicin | 4-methoxyindol-3-ylmethyl | 18.2 | 0.25 | בוכנר, EC |
| Neoglucobrassicin | 1-methoxyindol-3-ylmethyl | 22.5 | 0.2 | בוכנר, EC |
| glucosinolates ארומטיים | ||||
| Sinalbin | 4-hydroxybenzyl | 8.1 | 0.5 | בוכנר |
| Glucosibarin | 2 (R) -OH-2-phenylethyl | 12.1 | לראות הבא | |
| Glucobarbarin | 2 (S) -OH-2-phenylethyl | 12.7 | 0.95 | בוכנר |
| Glucotropaeolin | בנזיל | 13.8 | 0.95 | בוכנר, EC |
| Gluconasturtiin | 2-phenylethyl | 18.0 | 0.95 | בוכנר, EC |
| לא ידוע - אליפטי / ארומטיים כמו UV ספקטרום | 1 | EC | ||
| לא ידוע - אינדול כמו ספקטרום | 0.25 | EC | ||
| * זמן השמירה המשוער (RT) מעוגל 0.1 דק 'הקרוב (± 0.3 דקות תלוי טור, איכות eluent). פעמי שמירה נקבעות על פלטפורמות האולטימטיביות HPLC ThermoFisher / Dionex מצוידות עמודת 18 C (150 x 4.6 מ"מ, 3 מיקרומטר גודל חלקיקים) בתוספת C 18 בטבלה 1. | ||||
| הפניות # לגורמי בתגובה: בוכנר, ר ב glucosinolates ב לפתית (ed JP Wathelet) 50-58 (מרטינוס Nijhoff Publishers, 1987); בראון, פ"ד, Tokuhisa, JG, Reichelt, M. & גרשנזון, J. וריאציה של הצטברות glucosinolate בין איברים שונים שלבי ההתפתחות של thaliana ארבידופסיס. Phytochemistry. 62 (3), 471-481, doi: 10.1016 / S0031-9422 (02) 00,549-6, (2003); EC. זרעי שמנים - קביעת glucosinolates בעל ביצועים גבוהים כרומטוגרפיה נוזלית. כתב העת הרשמי של הקהילה האירופית. 170/28 L. בנספח VIII 03.07.27-34 (1990). | ||||
טבלה 3: גורמי תגובה ביותר הנפוץ desulfo-glucosinolates ב תמציות צמחים פעמי השמירה המשוערות שלהם על C 18 עמודים. Eluents, gradient, טמפרטורת טור, ואת קצב זרימה כמו בטבלה 1.
היתרונות הגדולים של שיטה נרחבת והקימה זה נעשה שימוש הם שזה חזק, די פשוט, בעלות נמוכה יחסית לדגימה. רוב הציוד הנדרש לצורך מיצוי הניתוח צריך להיות זמין במעבדה רגילה או יכול להיות עצמית בנוי, למעט ה- PDA-HPLC. יתרון נוסף הוא כי desulfoglucosinolates מומס במים מבחינה כימי יציב למדי כאשר שמרו על קור רוח ועל צלוחיות אוויר חזק (HPLC), כך התמציות יכולות להישלח בקלות לניתוח HPLC במקום אחרת. בניגוד פלטפורמות LC-MS, אשר דורשת ידע או מומחיות וניסיון מעשי נרחב לניהול תוכנה וניתוח נתונים, HPLC-UV / מחשבי כף יד ניתן להפעיל בקלות לאחר תקופת הכשרה קצרה. זה לא רק מפחית את עלויות ההליך, אלא גם עושה בשיטה זו לנגישה יותר מגוון רחב של מדענים, כולל סטודנטים.
בדרך כלל, כאשר ההליכים מתוארים מתוארים לעיל carefully, כמה בעיות צריכות להתרחש. באופן כללי, פסגות glucosinolate מופרדות היטב את הכרומתוגרמה. אם זה אינו המקרה, תכנית השיפוע יכולה להיות מותאמת על ידי הפחתת שיעור עליית אצטוניטריל ב eluent. לחלופין, אם יוצר-מראש של עמודות חדשות (200-500 זריקות) או עמודה (1,500 -2000 זריקות) עשוי לפתור את הבעיה. לפעמים, chromatograms של דגימות יחידות באצווה עשוי להיראות מאוד קטן או ללא פסגות. זה בדרך כלל בגלל שגיאות pipetting בעת הוספת sulfatase (למשל, טור כבר דילג או sulfatase לא נשטף כראוי למטה לתוך הטור). לחלופין, ריכוז glucosinolate בחומרים הניסיוניים אולי נמוך מצפוי וחומר מעט מדי נעשה שימוש לצורך המיצוי. אם זו הבעיה, את עוצמת הזריקה ניתן להעלות עד 100 μL, או aliquot מדויק (למשל, 800 μL) של תמצית יכול להיות מרוכז. זו האחרונה יכולה להיות מושגת על ידי ייבוש על ידי קורing התמצית, המסת שאריות נפח קטן יותר (למשל, 100 μL) של מים, reinjecting באמצעות עקומת הפניה אותו. בחישובים עבור הריכוז המקורי של תמצית, המספרים צריך להיות מוכפל במקדם דילול. אם זה לא פותר את הבעיה, החומרים יש לנצל שוב באמצעות חומר-מוצא יותר. אם זה יותר מ -100 מ"ג, היקף ממסי החילוץ ואת הגודל של הצינורות צריכים להיות מותאם באופן יחסי לשמור על יעילות המיצוי.
יתרון נוסף הוא כי שיטה זו כבר היטב תוקפת. זאת, משום שהיא תוארה שיטה סטנדרטית כימות של glucosinolates ב לפתית, עבורו הנהלים והדיוק אוששו מספר מעבדות 16. בנוסף, הרקע הגנטי, ביוסינתזה, והתפקידים ביולוגיים של glucosinolates כפופים מאמצי מחקר אינטנסיביים, ב modאל צמח מיני ארבידופסיס thaliana בין היתר 4, 6, 12. לכן, גורמים רבים בתגובת כימות המדויקת של desulfoglucosinolates ביחס sinigrin מוגדרים היטב לציבור רחב 15,17. למרות פרוטוקולים מבוססים LS-MS יותר תפוקה גבוהה, רגישים יותר, והם מסוגלים (בהיסוס) לזהות glucosinolates עבורו אין סטנדרטים זמינים 18, 19, 20, עדר גורמי תגובה אוניברסאלי-MS LC מגביל את כימות מדויק של ריכוזי glucosinolate 18. יתר על כן, שיטות אלה בדרך כלל אינן כוללות צעד ייבוש בהקפאה, ואת כמות מי החומר הצמחי הטרי הוא נעדר בחישובים, מה שהופך כימות מדויק קשה. לבסוף, בגלל שיטת החילוץ שלנו כרוכה טור מבוססטיהור צעד ריכוז, זה יכול לחול גם על דגימות "מלוכלכות" עם ריכוזים נמוכים של glucosinolates, כגון קרקעות 21.
בהשוואה לשיטות LC-מבוססות MS שבדרך כלל לחלץ חומרים קפוא טרי, השתמשו 96-גם צלחות להפקה, ואינו כוללים צעד sulfatase 18, 19, בשיטה שלנו היא יחסית זמן רב ועבודה אינטנסיבית. עם מתלי הטור המתואר במאמר זה, אדם אחד יכול לחלץ כ 100-150 דגימות ביום אחד. Elution (למחרת), להקפיא ייבוש (לילה), מחדש המסה יכולה להתקיים בתוך הימים הבאים. עם מזרק HPLC אוטומטי, זמן לרוץ איזון של 40-45 דקות לכל זריקה, ולא אירועים בלתי צפויים, זה ייקח 3-4 ימים כדי לרכוש את הנתונים עבור קבוצת מדגם זה. כשתוכנת HPLC מאפשרת כימות אוטומטית המבוססת על עקומת sinigrin, המחאה ידנית של chromatograms ו- PEהקצאות ak עבור 100 דגימות עשויות רק לקחת עוד h 1 או 2 לפני הנתונים ניתן להשתמש עבור ניתוחים סטטיסטיים.
למרות הזמינות הגוברת של סטנדרטים glucosinolate, רק חלק קטן של יותר מ -130 מועמדים יכולים כיום לקנות מסחרית. עם זאת, עם כמה הפניות לכל המעמדות biosynthetic; גישה למאגרי מידע בספרות המפרטת את תרכובות שנמצאו בעבר מיני צמחים (למשל, פאהי ואח 22.); ידע בסיסי של עקרונות chromatographic, כגון ההיגיון של סדרת eluotropic (למשל, עבור מספר גדל והולך של Cs על שרשרת הצד ב אליפטיות, איורים 3 ו -4); ואת האימות של דגימות יחידות על LC-MS 19 או glucosinolates מבודד על תמ"ג 23, אפשר בקלות להתגבר על מגבלה זו. רוב פרוטוקולי glucosinolate מנתח להשתמש עקומות התייחסות פנימיות(כלומר, ריכוז מסוים להפקת sinigrin או sinalbin החילוץ 16 ממס, 17, 19). בעיקר, עקומות התייחסות פנימיות במתכונת מותאמות יותר לתקן שגיאות עיבוד מדגם בודדות ולכן תיאורטית להניב דיוק גבוה. למרות יתרון זה, אנחנו מעדיפים להשתמש עקומת ייחוס חיצוני חמש נקודות, כמו שאנחנו בדרך כלל לנתח מינים ברים שונים, שחלקם מכילים רמות גבוהות של sinigrin (למשל, Brassica nigra 24) או sinalbin (למשל, חַרדָל alba 25), שתי התייחסויות glucosinolate עבורו גורמים בתגובה זמינות. יתר על כן, הוספת תקנים פנימיים מדגם זה מגדילה את עלות הניתוחים, כמו התייחסות לסטנדרטים glucosinolate בדרגה גבוהה הם בדרך כלל די יקרים.
לסיכום, למרות הצעדים זמן רב, פרוטוקול זהמספק שיטה פשוטה ונגישה לחלץ ולכמת glucosinolates בדגימות צמח. עם זאת, חשוב לקחת בחשבון כי רמות glucosinolate עצמם הן רק אינדיקציה לפעילות הביולוגית הפוטנציאל, כפי שניתן לראות את הצורך להגיב עם myrosinase, ו וריאציה את תוצרי התגובה יכולה לנבוע כתוצאת glucosinolate יחיד 11. מבחני אימות חייבות להתבצע על מנת לאשר את הרלוונטיות הביולוגיות.
למחברים אין מה לחשוף.
NMvD מודה לד"ר מיכאל רייכלט (מכון מקס פלאנק לאקולוגיה כימית, יינה, גרמניה) על שסיפק את דגימות הייחוס הראשונות כשהחלה להשתמש בשיטה זו לפני 16 שנים. Ciska Raaijmakers (NIOO-KNAW, Wageningen, הולנד), סבסטיאן קרוסה (B-Ware, ניימכן, הולנד) וכריסטיאן ריסטוק (iDiv, לייפציג) זוכים להכרה על שיפור הפרוטוקול במהלך השנים. מירקה מסל ומרטין הוברטי (אוניברסיטת טובינגן, גרמניה) זוכות להכרה על הרשאתן להשתמש בכרומטוגרמה של רוריפה. המחברים מודים בהכרת תודה על תמיכתו של המרכז הגרמני לחקר המגוון הביולוגי האינטגרטיבי (iDiv) Halle-Jena-Leipzig, הממומן על ידי קרן המחקר הגרמנית (FZT 118).
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| מתנול HiPerSolv CHROMANORM® דרגת שיפוע עבור HPLC כיתה | VWR | 20864.320 | |
| נתרן אצטט (NaOAc) | סיגמא-אולדריץ' | W302406-1KG-K | |
| HCl | VWR | 1.09057.1000 | |
| Sephadex | Sigma-Aldrich | A25120-10G | |
| (−)-Sinigrin hydrate מחזרת | סיגמא-אולדריץ' | S1647-500MG | |
| אריל סולפטאז | סיגמא-אולדריץ' | S9626-10KU | |
| אתנול | VWR | 20816.298 | |
| פיפטת פסטר | קארל רוט | 4518.1 | |
| צמר זכוכית | קארל רוט | 7377.1 | |
| מקל זכוכית/עץ | VWR | HERE1080766 | |
| צינורות תגובה של 2 מ"ל | VWR | 211-2120 | |
| מחט כריתה | קארל רוט | KX93.1 | |
| כלי מעבדה רוטילבו | קארל רוט | 0772.1 | מגש פסולת |
| קליפס איטום רוטילבו | קארל רוט | N217.1 | |
| מייבש הקפאה אזור חופשי 12 ליטר | Labconco | 7960030 | |
| אצטוניטריל סופר שיפוע | כיתה VWR | 83639.320 | |
| אמבט מים | VWR | 462-5112 | |
| אמבט אולטרסאונד | פישר סיינטיפי | FB 15061 | |
| PH אלקטרודה | תרמו פישר STARA2115 | ||
| צנטריפוגה הראוס מולטיפוגה X1 | תרמו פישר 75004210 | ||
| טרום טור | תרמו פישר סיינטיפיק | 69697 | עמודה C18 (4.6 x 10 מ"מ, 5 ומיקרו; מ', 300 וארינג;) |
| טור שבחים 300 | תרמו פישר סיינטיפיק | 60266 | C18 טור (4.6 x 150 מ"מ, 3 & מיקרו; מ', 300 וארינג;) |
| HPLC Ultimate 3000 | Thermo Fisher Scientific | עם תנור עמודים וגלאי UV או PDA | |
| בקבוק 1,000 מ"ל | VWR | 215-1595 | |
| תרכובות ייחוס גלוקוזינולט | Phytoplan | http://www.phytoplan.de/ שונות |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission