פרוטוקול לקביעת צפיפות השלב הזגוגי של טיפות בגודל של מיקרו-פיקו-ליטר מתוארות בטמפרטורות קריוגניות.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
פרוטוקול לקביעת צפיפות השלב הזגוגי של טיפות בגודל של מיקרו-פיקו-ליטר מתוארות בטמפרטורות קריוגניות.
אנו מדגימים שיטה לקביעת צפיפות טמפרטורה קריוגנית שלב זגוגי של תערובות מימיות, ודגימות אחרות הדורשות קירור מהיר, כדי להכין את השלב הרצוי טמפרטורה קריוגני. Microliter כדי טיפות בגודל picoliter הם מקורר על ידי הקרנה לתוך תערובת חנקן נוזלי (N 2- AR) תערובת. השלב הטמפרטורה הקריוגני של הירידה מוערכת באמצעות assay חזותי כי בקורלציה עם מדידות עקיפה X- קרן. הצפיפות של N 2 נוזל תערובת נוזלי מותאם על ידי הוספת N 2 או Ar עד ירידה הופך נייטרלי ציפה. הצפיפות של תערובת זו ולכן של ירידה נקבע באמצעות מסה הבדיקה עקרון ארכימדס. עם טיפול הולם בהכנה טיפה, ניהול של גז מעל תערובת קריוגן נוזלי כדי למזער את הדובדבן, ערבוב קבוע של תערובת cryogenic כדי למנוע ריבוד צפיפות הפרדת פאזה, צפיפות מדויקת עד 0.5% של טיפות קטנה כמו 50 pL יכולייקבע בקלות. מדידות על תערובות cryoprotectant מימית לספק תובנה לפעולה cryoprotectant, ולספק נתונים כמותיים כדי להקל על ההתאמה תרמית תרמית ב cryopreservation ביולוגי.
המאפיינים הפיזיים של מים ותערובות מימיות בשלבים השונים שלהם הם בעלי עניין בסיסי, והם חשובים ב vivo ובבדיקות הבנה של מערכות ביולוגיות. ב cryobiology עכשווי cryopreservation ביולוגי, שלבי זגוגי או אמורפי של תערובות cryoprotectant מימיים הם בעלי עניין מיוחד 1 , 2 . נוקלאציה וצמיחה של גבישי קרח יכולים לשבש תאים ורקמות, ולקדם denaturation חלבון צבירה, כך פרוטוקולים cryopreservation כי מזין את הממס הפכו פופולריים יותר ויותר. ב קריסטלוגרפיה biomolecular, התגבשות של ממס בערוצים בין biomolecules משבש סריגים קריסטל ו degrades תכונות עקיפה. ויטריפיקציה מושגת באמצעות שילוב של קירור מהיר, התייבשות, וכן הוספת ממיסים cryoprotective כגון גליצרול, אתילן גליקול, פוליאתילן גליקולים (PEGs)אלכוהולים ומלחים.
ויטריפיקציה מגבילה את התגבשות הקרח וצמיחתו, אך אינה מבטלת את כל הנזק המדוייק הקשור לקירור. לדוגמה, פסיפס קריסטל (מדד של התפלגות האוריינטציות של המטוס הבדולח) עולה באופן שגרתי על ידי גורם של 10 עד 100 כאשר גבישי חלבון מתקררים למצב מבושל 3 , ושיעורי ההישרדות שלאחר ההפשרה של תאי זרע וביציות מזוקקים משתנים במידה רבה .
מנגנון נזק אחד הוא התכווצות דיפרנציאלית של חומר ממס וסובב במהלך קירור 3 , 4 , 5 . שיווי המשקל ריכוזי ממס ממסרים בתוך גביש, תא או רקמות הם תלויים הטמפרטורה, ואת ממס בתוספת המומס ואת החומר שמסביב יכול חוזה בחוזים שונים. הקירור המהיר עשוי למנוע החלוקה מחדש של הממס והחלץ לפני הזיקוק, וקבלנים שונים על עלול לגרום גדול, unhomogenous, nonequilibrium מדגיש לגרום נזק מדגם.
גישות רציונליות להקטנת הנזק הנגרם על ידי קירור יכולות, לפיכך, להפיק תועלת מהידע על צפיפות תלויה בטמפרטורה של תערובות מימיות נוזלות ומזוהמות. ב ריכוזי מומס מעל 50% משקל של מומס למשקל של פתרון (w / w), תערובות cryoprotectant מימית ביותר יכול להיות מבושל עם שיעורי קירור צנוע של 10 K / s או פחות, המאפשר ייצור של מדידות צפיפות באמצעות דגימות זגוגית גדולה 6 . צפיפות אז ניתן לקבוע באמצעות עקרון ארכימדס, על ידי מדידת המשקל הנראה של המדגם כאשר מושעה קריוגן נוזלי כמו חנקן. עם זאת, כמו ירידה ריכוזיות סולידית, שיעורי הקירור הדרושים זיקוק לגדול במהירות: שיעורי קירור של תערובות גליצרול מימיים עולה מ <10 K / s ב 50% משקל של מומס ב G כדי נפח הפתרון מ"ל (w / v) ל 1,000 K / s ב 25% w / vהתחת = "xref"> 7. העברת חום הופך גבול הגבול שכבת מוגבלת, כך השגת שיעורי קירור גדול דורש דוגמאות קטנות וקטנות יותר 8 .
מדידות הצפיפות של מים זגוגיים טהורים וקרח הושגו על ידי הפקדת טיפות קוטר מיקרומטר (femtoliter נפח) טיפות בתוך ואקום על גבי קירור cryogenically השטח כדי לבנות מדגם macroscopic (מסה גרם). הצפיפות של מדגם זה נקבעה על ידי cryoflotation בתערובת חנקן נוזלי ארגון, שבו צפיפות של נוזל cryogenic היה מותאם עד המדגם הפך נייטרלית ציפה 9 . עם זאת, יצירת דגימות גדולות ממספר גדול של טיפות קטנות בצורה שמפחיתה את נפח הריק - מקור חשוב לטעויות במדידות צפיפות פאזה זגוגיות קודמות - אינה טריוויאלית. עבור תערובות מימיות, התאדות דיפרנציאלי של מרכיבי פתרון במהלך aerosolization ותצהיר בתוך ואקום יכול להובילאי ודאויות משמעותיות בריכוזים שהופקדו.
פיתחנו שיטה, המבוססת על cryoflotation, המאפשר קביעת צפיפות מדויקת של תערובות מימיות באמצעות טיפות בודדים קטנים כמו 50 pL 10 . טיפות אלה יכולים להיות מקורר במהירות תוך שמירה על הריכוזים המקוריים שלהם, ואת מצב הטמפרטורה cryogenic שלהם (מזוקק או גבישיים) ניתן להעריך באמצעות assay חזותי פשוט כי בקורלציה עם מדידות עקיפה X- קרן. שיטה זו מיושמת באופן נרחב לתערובות מימיות ולא מימיות, וניתן להאריך אותה במגוון של דגימות ביולוגיות, כולל תאים ( למשל , גזע וביצה), דגימות רקמות וגבישי חלבון בעלי צפיפות טמפרטורה נמוכה בין 0.8 ל 1.4 גרם / מ"ל.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
זהירות: עיין בכל הגיליונות הרלוונטיים של נתוני בטיחות (MSDS) לפני השימוש. יש להשתמש בכל נוהלי הבטיחות המתאימים בעת שימוש בגזים דחוסים, כולל גופי גז מכוילים המתאימים לגז, ושסתומי גז מאושרים. מגע עם cryogens נוזלי יכול לגרום כוויות קור קשות נמק. השתמש בציוד מגן אישי מתאים (מגן פנים, כפפות, מעיל מעבדה, מכנסיים באורך מלא ונעליים סגורות), אשר כולם חייבים להיות בלתי חדירים לחנקן נוזלי. להישאר עומד ולהבטיח נתיב היציאה unobstructed מהמכשיר בעת שימוש cryogens נוזלי. להיות מודעים לסיכונים asphyxiation בעת שימוש בגזים דחוסים ו cryogens נוזלי, ולעבוד באזור מאוורר היטב עם איפור אוויר מספיק (מכסה קטר או שיעור גבוה מחזור האוויר בחדר).
1. הכנת פתרונות מימיים למדידות צפיפות
הערה: בגלל משקולות נמדדים בקלות רבה יותר לדיוק גבוה מאשר volאדים, ריכוזי הפתרון נמדדים ביחידות w / w. כל הצפיפויות והטמפרטורות הנמסות או הרתיחה מניחות לחץ אטמוספרי של 100 kPa. השלבים הבאים מתארים את ההכנה של 35% w / גליצרול פתרון W. אותו נוהל יכול לשמש ריכוזים אחרים וממסים.

2. הכנת חדר קירור הדגימה
3. קביעת נפח וצפיפות המסה הבדיקה ב- T = 298 K ו- T = 77 K


הכנת נוזל ראשוני N 2 -Ar תערובת
5. מדידת והתאמת הצפיפות של תערובת N 2- AR הראשוניTure

6. קירור טיפות של פתרון לדוגמה
7. הערכת מצב המדגם
8. קביעת צפיפות הדגימה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מדידות צפיפות ב T = 77 K עבור טיפות מזוקקים של גליצרול מימי ואתילן גליקול לעומת ריכוז cryoprotectant מוצגים באיור 1 A ו איור 1 B בהתאמה, ואת השינוי המקביל בנפח מסוים בין T = 298 K ו 77 K, מחושב באמצעות בעבר שנקבע T = 298 K צפיפות, מוצג באיור 2 . בריכוז גבוה cryoprotectant, החוזה פתרונות על קירור המדי...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המנגנון והשיטות הנוכחיים, שפותחו בעיקר על-ידי סטודנטים לתואר ראשון עם גישה מוגבלת לכלי ומכשירים לבניית מכשירים, מספקים בכל זאת מדידות צפיפות מדויקות ביותר עבור טיפות נוזלים בודדות קטנות כמו 50 pL. בטווח הריכוז ליד ומעל 50% w / w, כאשר שיעורי קירור קטנים מספיקים כדי לקבל דגימות מזוהמים, צפיפויות מסכים עם אלה שהתקבלו במדידות קודמות על דגימות בתפזורת. אקסטרפולציות של צפיפות הנוכחית ריכוז 0% - מים טהורים - גם מסכים די טוב עם הצפיפות המקובלת של צפיפות נמוכה אמורפי קרח ב 77 K
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין מה לגלות.
עבודה זו נתמכה על ידי NSF תחת פרס MCB-1330685. DWM מודה תמיכה חלקית של קורנל אוניברסיטת של אוניברסיטת מולקולרית ביופיסיקה הדרכה גרנט (NIH T32GM0082567).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| צינור צנטריפוגה | פלקון | 6029236 | 15 מ"ל צינור צנטריפוגה חרוטי |
| גליצרול, >99.5% | סיגמא | G9012-100 מ"ל | |
| אתילן גליקול, >99.8% | סיגמא | 324558-100 מ"ל | |
| מיקרו-איזון אנליטי | מטלר | AE240 | איזון אנליטי, רזולוציה של 0.01 מ"ג, בעל וו בתחתית לשקילה מתחת לאיזון |
| vortexer | Scientific Industries | SI-0236 | Vortex-Genie 2 |
| מארז מכשירים מסגור | Unistrut | 1-5/8 אינץ' מסגרת מתכת | 48 אינץ' רוחב x 24 אינץ' עומק x 40 אינץ' גובה |
| מארז מכשיר מחסום | כל יריעות פלסטיק שקופות | ||
| דיסק | קוטר 4 אינץ', בקבוק דיואר בעובי 1/8 אינץ' | ||
| Scilogix Dilvac | SS333 | 4.5 ליטר בקבוק dewar עם מארז פלדה ומכסה מהדק | |
| תא | נחושתחלק מיוצר זה מורכב מצינור נחושת בקוטר 1.43 אינץ' ובעובי דופן 0.017 אינץ' עם בסיס נחושת גלילי מוצק המולחם לאיטום קצה אחד. בסיס הנחושת הוא בגובה 0.87 אינץ' וגובה החדר הכולל הוא 7 אינץ'. | ||
| גז חנקן | Airgas | NI HP300 | 99.998% גז ארגון גז N2 טהור |
| Airgas | AR HP300 | 99.998% טהור Ar | |
| גז סיבוב | אומגה | FL3692ST | 2.52 ליטר / דקה |
| קצף | חלק זה מיוצר מקצף פוליאתילן צולב 4 lb/ft3 (מסופק על ידי Technifab, 1355 Chester Industrial Parkway, Avon, OH), ויש לו OD של 2.42 אינץ', ומזהה של 1.52 אינץ', ועובי של 0.79 אינץ'. | ||
| בדיקת PTFE | חלק מפוברק זה הוא גליל בקוטר 0.246 אינץ', בגובה 0.580 אינץ' עם חור בקוטר 0.060 אינץ' העובר בניצב ומצטלב עם ציר הצילינדר ~ 0.10 אינץ' מקצה אחד. | ||
| פלטפורמת מיקרו-איזון | Unistrut | 1-5/8 אינץ' מסגרת מתכת | 11 אינץ' רוחב x 24 אינץ' אורך x 24 אינץ' מסגרת מלבנית גבוהה עם יריעת אלומיניום עליונה המכילה חור למונופילמנט ומסת בדיקה תלויה |
| 2 מיל (50 אום) קו מונופילמנט | ברקלי | NF1502-CM | דיג ננופיל |
| ארגון צינורות סליל קירור מראש | VWR | 60985-512 | 1/8 אינץ' מזהה x 1/4 אינץ' OD צינורות PVC |
| מערבל רדיד נחושת מחורר | הכנס מוט בידוד תרמי קשיח בקוטר 1-2 מ"מ (פלסטיק או עץ) למרכז ותקן באמצעות אפוקסי לפי הצורך. | ||
| מזרק | BD | 309628 | 1 מ"ל Luer-Lok קצה |
| מחולל ואקום | Gast | VG-015-00-00 | אוויר דחוס ונטורי חד שלבי מחולל ואקום |
| תרסיס ציפוי הידרופובי RainX | 620036 | דוחה מים | |
| מפלסטיק באורך מוקד ארוך מיקרוסקופ סטריאו | Bausch and Lomb Stereozoom 6 | 0.67-4 x זום פוד עם עיניות 20X, מרחק עבודה 10 ס"מ& נ.ב.פ; | |
| תאורת טבעת LED | Amscope | LED144S | |
| תאורת ספוט LED | תאורת בית חדש | NHCLP-LED | 3W מנורת מהדק צוואר אווז |
| 1.8 מ"ל בקבוקון קריו | Nunc | V7634-500EA | כל 1.8 או 2 מ"ל קריוביאל מתאים |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.