מאמר שיטה

חיזוי השתקת ג 'ין באמצעות שליטה Spatiotemporal של siRNA שחרור מ תגובה תגובה פולימרית פולימרית

6.7K צפיות

DOI:

10.3791/55803

21 ביולי 2017

במאמר זה

סיכום

אנו מציגים שיטה חדשנית המשתמשת קופולימרים לחסום צילום תגובה עבור שליטה יעילה יותר spatiotemporal של השתקת הגן ללא תופעות לזיהוי מחוץ לגילוי. בנוסף, שינויים בביטוי גנים ניתן לחזות באמצעות מבחני שחרור siRNA פשוטים מודלים קינטיים פשוטים.

תקציר

חומרים חדשים ושיטות נדרשים כדי לשלוט טוב יותר מחייב לעומת שחרור של חומצות גרעין עבור מגוון רחב של יישומים הדורשים את הרגולציה המדויקת של פעילות הגן. במיוחד, חומרים חדשים עם תגובה לגירויים עם שליטה משופרת spatiotemporal על ביטוי גנים היה לפתוח פלטפורמות translatable של גילוי תרופות וטכנולוגיות רפואה משובי. יתר על כן, יכולת משופרת לשלוט על שחרור חומצות גרעין מחומרים תאפשר פיתוח של שיטות יעילות לחזות יעילות nanocarrier מראש , מה שמוביל לסקירה מואצת של כלי הלידה. להלן, אנו מציגים פרוטוקול לחיזוי יעילות השתקת גנים והשגת שליטה spatiotemporal על ביטוי גנים באמצעות מודולרי תגובה תגובה nanocarrier המערכת. RNA קטן המפריע (siRNA) הוא מורכב עם mPEG- b- פולי (5- (3 (אמינו) propoxy) -2-nitrobenzyl methacrylate) (mPEG- b -P (APNBMA)) פולימרים כדיRm יציב nanocarriers כי ניתן לשלוט עם אור כדי להקל על מתכוונן, on / off לשחרר siRNA. אנו מתאר שתי מבחני משלימים המעסיקים ספקטרוסקופיה מתאם פלואורסצנטי ג 'ל אלקטרופורזה עבור כימות מדויק של שחרור siRNA מ פתרונות חיקוי סביבות תאיים. מידע שנצבר מבחני אלה שולב לתוך הפרעה פשוטה RNAi (מודל RNAi) מודל קינטי לחזות את התגובות דינמי השתקה לתמונות שונות תמריצים התמונה. בתורו, אלה בתנאי הקרנה אופטימיזציה אפשרה חידוד של פרוטוקול חדש לשליטה spatiotemporally השתקת גנים. שיטה זו יכולה ליצור דפוסים סלולריים בביטוי גנים עם רזולוציה תאית לתא ולא תופעות לזיהוי היעד. יחדיו, הגישה שלנו מציעה שיטה קלה לשימוש לניבוי שינויים דינמיים בביטוי גנים ובדיוק שליטה על פעילות siRNA בחלל ובזמן. קבוצה זו של מבחני יכול להיות מותאם בקלות לבחון מגוון רחב של otשלה מגיבים מערכות הגירוי על מנת להתמודד עם אתגרים מרכזיים רלוונטי שפע של יישומים במחקר ביו רפואה ורפואה.

מבוא

קטן RNAs להפריע (siRNAs) לתווך שלאחר השתעת גן השתקה דרך מסלול RNAi קטליטי כי הוא ספציפי מאוד, חזק, ומותאם לכל גן יעד כמעט 1 . המאפיינים המבטיחים הללו אפשרו לתרופה siRNA להתקדם בניסויים קליניים בבני אדם לטיפול במחלות רבות, כולל מלנומה גרורתית ומופיליה 2 , 3 . עם זאת, בעיות משלוח משמעותיות נמשכות כי יש הפרעה תרגום 4 . בפרט, כלי אספקה ​​צריך להישאר יציב ולהגן על siRNAs מ השפלה תאיים, אך גם לשחרר את המטען לתוך הציטופלסמה 5 . יתר על כן, יישומים רבים RNAi דורשים שיטות משופרות כדי להסדיר השתקת גנים בחלל וב....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

1. ניסוח של niocarriers siRNA

  1. הכן פתרונות נפרדים של siRNA ו- mPEG- b- AP (APNBMA) עם כמויות שוות בדילול של 20 מ"מ -4 (2-hydroxyethyl) piperazine-1-ethanesulfonic חומצה (HEPES) חיץ ב pH 6.0.
    1. הוסף siRNA בריכוז של 32 מיקרוגרם / מ"ל ​​ל 20 מ"מ פתרון HEPES.
      הערה: ה- siRNA היה רצף בקרה שלילי לא ממוקד, אוניברסלי; עם זאת, siRNA יכול להיות מתוכנן להתמקד כל גן של עניין.
    2. ממיסים mP....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

בעקבות ניסוח של nanocarriers, מבחני שחרור siRNA נערכו כדי ליידע את תנאי הקרנה לשמש transfections במבחנה . מינונים שונים של אור יושמו כדי לקבוע את אחוז siRNA אשר שוחרר. Assay הראשון המשמש ג'ל אלקטרופורזה להפריד את מולקולות siRNA חינם מן מולקולות siRNA עדיין מורכבים / הקשורים עם הפולימר. Nanocarriers שלא טופלו באור נשאר יציב ולא לשחרר כל siRNA. כמו משך הזמן הקרינה גדל, עוצמת הקרינה של להקות siRNA חינם גדל. כימות של עוצמות הלהקה באמצעות ת.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

ישנם מספר צעדים בשיטה קריטיים במיוחד. כאשר ניסוח nanocarriers, את הסדר של תוספת רכיב מהירות ערבוב הם שני פרמטרים חשובים המשפיעים על יעילות 39 . פרוטוקול זה דורש כי רכיב cationic, mPEG- b- AP (APNBMA), נוסף מרכיב anionic, siRNA, בצורה dropwise בזמן vortexing. בהתאם נפח ניסוח הכולל, תהליך זה ערבוב לוקח 3-6 s. כדי לבדוק אם nanocarriers נוצרו כראוי, למדוד את התפלגות גודל באמצעות טכניקה כגון פיזור אור דינמי. MPEG- b- AP (APNBMA) / niocarriers s.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

המחברים מצהירים כי אין להם אינטרסים פיננסיים מתחרים.

תודות

המחברים מודים למוסד הלאומי למדעי הרפואה הכללית של המכונים הלאומיים לבריאות (NIH) לתמיכה כספית באמצעות פרס פיתוח מוסדי (IDeA) תחת מספר מענק P20GM103541 וכן מענק מספר P20GM10344615. ההצהרות המובאות כאן אינן משקפות את עמדות ה - NIH. כמו כן, אנו מכירים את המכון הביוטכנולוגי של דלאוור (DBI) ואת משרד הפיתוח הכלכלי של דלאוור (DEDO) לתמיכה כספית באמצעות פרס המרכז למדעי החיים (Bioscience CAT) (12A00448).

....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
siRNASigma-AldrichSIC001בקרה שלילית אוניברסלית לא ממוקדת,
mPEG-b-P (APNBMA)מסונתז במעבדה שלנוN/Aפולימר מגיב לאור
HEPESFisher ScientificBP310-100
נתרן דודציל סולפט Sigma-Aldrich
McMaster-Carr3788T21בעובי 0.5 מ"ל
 של Excelitas TechnologiesOmnicure S2000ומסנן 365 ננומטר בשימוש
באגרוזפישר סיינטיפיקBP160-100
אתידיום ברומידפישר סיינטיפיקBP1302-10
siRNA מסומן ב-Dy547GE Healthcare Dharmacon, Inc.הזמנה מותאמת אישיתפלואורופור מצומד לשקופית מיקרוסקופ גדיל קצה 5
פישר סיינטיפיק12-550-A3זכוכית מנוקה מראש
Secure-Seal SpacerLife TechnologiesS24735דבק דו צדדי
LSM 780 קרל זייסN/Aמיקרוסקופ קונפוקלי
ZEN 2010קרל זייסN/AFCS
MATLABMathWorksN/Aשפת תכנות
NIH/3T3 תאים ATCCATCC CRL-1658
DMEMMediatech10-013-CVגידול מדיה
סרום בקר עובריMediatech35-011-CV
פניצילין-סטרפטומיציןMediatech  30-002-CI
צלחות 6 בארותפישר סיינטיפיק08-772-1B
Opti-MEMLife Technologies11058021מדיה טרנספקציה
אטם גומי 436143 לייזר UV עדשת קולימציה ' תוכנת ניתוח מומת בחום

מקורות

  1. Forbes, D. C., Peppas, N. A. Oral delivery of small RNA and DNA. J Control Release. 162 (2), 438-445 (2012).
  2. Davis, M. E., et al. Evidence of RNAi in humans from systemically administered siRNA via targeted nanoparticles. Nature. 464 (7291), 1067-1070 (20....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה

בקש הרשאה

תגיות

RNAUVFCS

מאמרים קשורים