אנו מציגים שיטה חדשנית המשתמשת קופולימרים לחסום צילום תגובה עבור שליטה יעילה יותר spatiotemporal של השתקת הגן ללא תופעות לזיהוי מחוץ לגילוי. בנוסף, שינויים בביטוי גנים ניתן לחזות באמצעות מבחני שחרור siRNA פשוטים מודלים קינטיים פשוטים.
מאמר שיטה
אנו מציגים שיטה חדשנית המשתמשת קופולימרים לחסום צילום תגובה עבור שליטה יעילה יותר spatiotemporal של השתקת הגן ללא תופעות לזיהוי מחוץ לגילוי. בנוסף, שינויים בביטוי גנים ניתן לחזות באמצעות מבחני שחרור siRNA פשוטים מודלים קינטיים פשוטים.
חומרים חדשים ושיטות נדרשים כדי לשלוט טוב יותר מחייב לעומת שחרור של חומצות גרעין עבור מגוון רחב של יישומים הדורשים את הרגולציה המדויקת של פעילות הגן. במיוחד, חומרים חדשים עם תגובה לגירויים עם שליטה משופרת spatiotemporal על ביטוי גנים היה לפתוח פלטפורמות translatable של גילוי תרופות וטכנולוגיות רפואה משובי. יתר על כן, יכולת משופרת לשלוט על שחרור חומצות גרעין מחומרים תאפשר פיתוח של שיטות יעילות לחזות יעילות nanocarrier מראש , מה שמוביל לסקירה מואצת של כלי הלידה. להלן, אנו מציגים פרוטוקול לחיזוי יעילות השתקת גנים והשגת שליטה spatiotemporal על ביטוי גנים באמצעות מודולרי תגובה תגובה nanocarrier המערכת. RNA קטן המפריע (siRNA) הוא מורכב עם mPEG- b- פולי (5- (3 (אמינו) propoxy) -2-nitrobenzyl methacrylate) (mPEG- b -P (APNBMA)) פולימרים כדיRm יציב nanocarriers כי ניתן לשלוט עם אור כדי להקל על מתכוונן, on / off לשחרר siRNA. אנו מתאר שתי מבחני משלימים המעסיקים ספקטרוסקופיה מתאם פלואורסצנטי ג 'ל אלקטרופורזה עבור כימות מדויק של שחרור siRNA מ פתרונות חיקוי סביבות תאיים. מידע שנצבר מבחני אלה שולב לתוך הפרעה פשוטה RNAi (מודל RNAi) מודל קינטי לחזות את התגובות דינמי השתקה לתמונות שונות תמריצים התמונה. בתורו, אלה בתנאי הקרנה אופטימיזציה אפשרה חידוד של פרוטוקול חדש לשליטה spatiotemporally השתקת גנים. שיטה זו יכולה ליצור דפוסים סלולריים בביטוי גנים עם רזולוציה תאית לתא ולא תופעות לזיהוי היעד. יחדיו, הגישה שלנו מציעה שיטה קלה לשימוש לניבוי שינויים דינמיים בביטוי גנים ובדיוק שליטה על פעילות siRNA בחלל ובזמן. קבוצה זו של מבחני יכול להיות מותאם בקלות לבחון מגוון רחב של otשלה מגיבים מערכות הגירוי על מנת להתמודד עם אתגרים מרכזיים רלוונטי שפע של יישומים במחקר ביו רפואה ורפואה.
קטן RNAs להפריע (siRNAs) לתווך שלאחר השתעת גן השתקה דרך מסלול RNAi קטליטי כי הוא ספציפי מאוד, חזק, ומותאם לכל גן יעד כמעט 1 . המאפיינים המבטיחים הללו אפשרו לתרופה siRNA להתקדם בניסויים קליניים בבני אדם לטיפול במחלות רבות, כולל מלנומה גרורתית ומופיליה 2 , 3 . עם זאת, בעיות משלוח משמעותיות נמשכות כי יש הפרעה תרגום 4 . בפרט, כלי אספקה צריך להישאר יציב ולהגן על siRNAs מ השפלה תאיים, אך גם לשחרר את המטען לתוך הציטופלסמה 5 . יתר על כן, יישומים רבים RNAi דורשים שיטות משופרות כדי להסדיר השתקת גנים בחלל וב....
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. ניסוח של niocarriers siRNA
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בעקבות ניסוח של nanocarriers, מבחני שחרור siRNA נערכו כדי ליידע את תנאי הקרנה לשמש transfections במבחנה . מינונים שונים של אור יושמו כדי לקבוע את אחוז siRNA אשר שוחרר. Assay הראשון המשמש ג'ל אלקטרופורזה להפריד את מולקולות siRNA חינם מן מולקולות siRNA עדיין מורכבים / הקשורים עם הפולימר. Nanocarriers שלא טופלו באור נשאר יציב ולא לשחרר כל siRNA. כמו משך הזמן הקרינה גדל, עוצמת הקרינה של להקות siRNA חינם גדל. כימות של עוצמות הלהקה באמצעות ת.......
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ישנם מספר צעדים בשיטה קריטיים במיוחד. כאשר ניסוח nanocarriers, את הסדר של תוספת רכיב מהירות ערבוב הם שני פרמטרים חשובים המשפיעים על יעילות 39 . פרוטוקול זה דורש כי רכיב cationic, mPEG- b- AP (APNBMA), נוסף מרכיב anionic, siRNA, בצורה dropwise בזמן vortexing. בהתאם נפח ניסוח הכולל, תהליך זה ערבוב לוקח 3-6 s. כדי לבדוק אם nanocarriers נוצרו כראוי, למדוד את התפלגות גודל באמצעות טכניקה כגון פיזור אור דינמי. MPEG- b- AP (APNBMA) / niocarriers s.......
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים כי אין להם אינטרסים פיננסיים מתחרים.
המחברים מודים למוסד הלאומי למדעי הרפואה הכללית של המכונים הלאומיים לבריאות (NIH) לתמיכה כספית באמצעות פרס פיתוח מוסדי (IDeA) תחת מספר מענק P20GM103541 וכן מענק מספר P20GM10344615. ההצהרות המובאות כאן אינן משקפות את עמדות ה - NIH. כמו כן, אנו מכירים את המכון הביוטכנולוגי של דלאוור (DBI) ואת משרד הפיתוח הכלכלי של דלאוור (DEDO) לתמיכה כספית באמצעות פרס המרכז למדעי החיים (Bioscience CAT) (12A00448).
....הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| siRNA | Sigma-Aldrich | SIC001 | בקרה שלילית אוניברסלית לא ממוקדת, |
| mPEG-b-P (APNBMA) | מסונתז במעבדה שלנו | N/A | פולימר מגיב לאור |
| HEPES | Fisher Scientific | BP310-100 | |
| נתרן דודציל סולפט | Sigma-Aldrich | ||
| McMaster-Carr | 3788T21 | בעובי 0.5 מ"ל | |
| של Excelitas Technologies | Omnicure S2000 | ומסנן 365 ננומטר בשימוש | |
| באגרוז | פישר סיינטיפיק | BP160-100 | |
| אתידיום ברומיד | פישר סיינטיפיק | BP1302-10 | |
| siRNA מסומן ב-Dy547 | GE Healthcare Dharmacon, Inc. | הזמנה מותאמת אישית | פלואורופור מצומד לשקופית מיקרוסקופ גדיל קצה 5 |
| פישר סיינטיפיק | 12-550-A3 | זכוכית מנוקה מראש | |
| Secure-Seal Spacer | Life Technologies | S24735 | דבק דו צדדי |
| LSM 780 | קרל זייס | N/A | מיקרוסקופ קונפוקלי |
| ZEN 2010 | קרל זייס | N/A | FCS |
| MATLAB | MathWorks | N/A | שפת תכנות |
| NIH/3T3 תאים | ATCC | ATCC CRL-1658 | |
| DMEM | Mediatech | 10-013-CV | גידול מדיה |
| סרום בקר עוברי | Mediatech | 35-011-CV | |
| פניצילין-סטרפטומיצין | Mediatech | 30-002-CI | |
| צלחות 6 בארות | פישר סיינטיפיק | 08-772-1B | |
| Opti-MEM | Life Technologies | 11058021 | מדיה טרנספקציה |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה