$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
להלן השלבים הקריטיים בתוך הפרוטוקול. ראשית, תאים צריך לגדול על המנה תרבות כמו טפט כי ביצוע הערכה מורפולוגית של גרעינים שהוכתמו דאפי קשה עבור תאים מרובה שכבות. למטרה זו, בשלב 2.9, מומלץ להעביר זהיר של המנה תרבות לאינקובטור; רעד של המנה תרבות יוצר מערבולת של תאים מושעה שמוביל הריכוז של תאים במרכז המנה תרבות. בנוסף, יש להימנע overconfluence המוביל לתאים מרובה שכבות. למטרה זו, בשלב 2.7, מספר התאים נזרע על המנה תרבות יכול להיות שונה בהתבסס על האוכלוסייה מכפילה את מרווח הזמן בין הקרנה קיבוע וזמן. זרימה של 80 בזמנו של קיבעון מומלץ. שנית, מהירות חשוב הקיבעון, דאפי מכתים (קרי, שלבים 4 ו- 5). חוסר עקביות בין דוגמה לגבי הזמן שנדרשו עבור השלבים יכול להוביל הטרוגניות בעוצמת האות דאפי בתוך האטום, אשר יטשטש את ההערכה מורפולוגי.
בשלב 2.2, ניתן להגדיל את מספר שער גולשת בקערה תרבות; מספר מרבי של ארבע שער גולשת ניתן להניח בקערה 35 מ מ, המספר יכול להיות גדל עוד יותר באמצעות מנות גדולות יותר. הצבת מספר שער גולשת בכל צלחת תרבות מאפשרת את הפעולה יעיל של הזמן קורס הערכה לטיפול נתון (קרי, השער מתעודות משלוח ניתן לאסוף מתוך תרבות קערה אחת בנקודות זמן מרובים עניין).
בשלב 3.2, ניתן לשנות את המינון הקרנה לפי ריבית החוקרים. היישום מינון עקבי שורות תאים מרובים מאפשר השוואת רגישות כל מצב של מוות של תאים clonogenic בין הקווים התא. מצד שני, השימוש של מינונים הישרדות iso-clonogenic עבור כל קו תא מאפשרת השוואה של פרופילים מוות תא clonogenic בין הקווים התא. המינון הישרדות iso-clonogenic יכול להיקבע על ידי וזמינותו להישרדות12clonogenic. הערך10 D, מינון מספק 10% clonogenic הישרדות, היא נקודת קצה של נפוצות עבור המנה הישרדות iso-clonogenic.
בשלב 3.3, הזמן של הקרנה קיבוע ניתן לשנות לפי ריבית החוקרים; זה חשוב כי הזמן. השיא IR-induced אפופטוזיס, קטסטרופה mitotic של הזדקנות ביולוגית הסלולר משתנה על פי שורת התאים וטיפול. במאמר זה, השתמשנו 72 h לאחר הקרנה כנקודת זמן זה יהיה שימושי ביותר עבור ההקרנה הראשונית clonogenic תא מוות הפרופילים, בהתבסס על מחקרים רבים על ידי הקבוצה שלנו ותיאר אחרים כדלקמן1,2, 3 , 4 , 8 , 9: (i) X-ray-induced אפופטוזיס בתאים נוצרו מגידולים מוצקים בעיקר מתרחשת כמה ימים לאחר הקרנה. (ii) X-ray-induced קטסטרופה mitotic בתאי סרטן מתרחשת בולטת השנייה או השלישית מיטוזה לאחר שחרורו מן המעצר זמני מחזור התא המושרה על ידי הקרנה. השחרור מתרחשת בדרך כלל כ- 24 שעות לאחר הקרנה, ולאחר מכן על-ידי mitoses חוזרות ונשנות במרווחים של 24 ח' (iii) X-ray-induced הזדקנות ביולוגית הסלולר הופך לברור לאחר מרווח זמן תלוי שורת התאים המדובר: 2 ימים לאחר הקרנה על כמה מקרים מוקדם, ו 7 ימים לאחר הקרנה עבור רוב שורות תאים. לאחר קבלת תמונה כוללת של התא clonogenic מוות פרופילים של ההקרנה הראשונית, זמן הקורס ניסויים תספק הבהרה מפורטת יותר של הזמן. השיא עבור כל מצב של מוות של תאים clonogenic שורת תאים מסוים ו/או תנאי עניין4.
יצוין, כי דאפי מכתים assay ואת וזמינותו להישרדות clonogenic, שיטה תקן הזהב להערכת רגישות לקרינה, אינם ניתנים להחלפה. אפופטוזיס ולאסון mitotic רק להימשך שעות. לפיכך, דאפי מכתים assay עבור נקודת זמן נתון מזהה ואפופטוזיס ו mitotic קטסטרופה המתרחשת בנקודת הזמן של המבדק. מצד שני, התוצאות של הישרדות clonogenic assay בזמן נתון נקודת לכלול את הסכום הכולל של אפופטוזיס ועל mitotic האסון שהתרחש בזמן תקופת הדגירה של בדרך כלל 10-14 ימים לאחר הקרנה. שונה מן אפופטוזיס, קטסטרופה mitotic, התאים senescent להישאר על המנה תרבות; הם להצטבר בהדרגה לאורך זמן לאחר הקרנה. לכן, התוצאות של שניהם דאפי מכתים assay ואת וזמינותו להישרדות clonogenic משקפים את הסכום הכולל של הזדקנות ביולוגית שאירעו במהלך תקופת הדגירה. חשוב לציין, שחלקן של אפופטוזיס mitotic קטסטרופה, הזדקנות ביולוגית הנגרמת על ידי הקרנה משתנה מאוד לפי תא במינון קו והקרנה. יחדיו, באופן תיאורטי, התוצאות של assay אחד יכול להיתרגם ישירות לאלה של אחרים וזמינותו.
דאפי מכתים assay יש מספר מגבלות. קודם כל, זה נשאר שנוי במחלוקת אם אסון mitotic הוא מצב מובהק של מוות של תאים. בתחום של קרינה הביולוגיה, קטסטרופה mitotic נחשב מצב הגדולות הנוצרות על-ידי אינפרא-אדום של מוות של תאים זה נבדל מנגנונים אחרים של מוות של תאים clonogenic1. מצד שני, אחרים טוענים שאותו אסון mitotic אינה מצב מובהק של מות תאים אלא דווקא תהליך המופיע לפני מות תאים כולל13,של אפופטוזיס ועל נמק-14. לפיכך, אפופטוזיס ולאסון mitotic ייתכן חופפים במידה מסוימת. השני, הקודם מחקרים מראים כי הזדקנות ביולוגית הסלולר יכול להתרחש בהיעדר SAHF כמה שורות תאים וטיפול הגדרות2. -מבחני הנוכחי, שתוכנן במיוחד עבור כל תא clonogenic מצב המוות אמור לשמש כדי להגביר את היציבות של המסקנות של ניסוי נתון. שלישית, דאפי מכתים assay לא יכול להעריך מצבים של מוות של תאים clonogenic שאינם אפופטוזיס, קטסטרופה mitotic או הסלולר הזדקנות ביולוגית (למשל, נמק, autophagy). רביעית, השירות של דאפי מכתים assay כמנבאת גידול בתגובה הקרנות יש לא כבר מבואר במרפאה. מנקודת המבט הזו, וזמינותו להישרדות clonogenic, הבודק את הסכום הכולל של מוות של תאים clonogenic, עדיפה דאפי מכתים assay כי מתאם הקימה בין SF2, השבר ששרד של תאים מוקרן עם 2 Gy צילומי רנטגן, וגם התגובה הגידול הקרנות15. עם זאת, ראוי לציין כי וזמינותו להישרדות clonogenic לא מנוצל באופן נרחב במרפאה, בעיקר בשל הדרישה רמה גבוהה של מומחיות, תקופה ארוכה של זמן (כלומר, 14 ימים) עבור רכישת נתונים. לשם השוואה, ההליך דאפי מכתים assay פשוט יותר, לוקח באופן משמעותי פחות זמן, כ 3-4 ימים, כדי להפיק תוצאות. השירות של ההכתמה דאפיassay כמנבאת גידול בתגובה הקרנות ייבדק במרפאה בעתיד הקרוב.
לסיכום, דאפי מכתים assay הוא הנועד חסכונית בשלב אחד בו זמנית להעריך שלושה מצבים עיקריים של מוות של תאים clonogenic IR-induced. גישה זו מאפשרת על המסך בקלות עבור המצבים של מוות של תאים clonogenic שורות תאים שונים, טיפול הגדרות של נקודות זמן, עם המטרה של שחקרתי את המנגנונים של מוות של תאים התאים היעד ואת תנאי הריבית.