RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Effie E Bastounis1, Fabian E Ortega1, Ricardo Serrano2, Julie A Theriot3
1Department of Biochemistry,Stanford University School of Medicine, 2Department of Mechanical and Aerospace Engineering,University of California San Diego, 3Departments of Biochemistry, Microbiology and Immunology and Howard Hughes Medical Institute,Stanford University School of Medicine
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
פיתחנו assay מבוססי לזיהוי של עיצוב רב טוב עבור בודק את ההשפעה של מטריצה חוץ-תאית נוקשות על זיהום חיידקי של תאים חסיד. Assay הזה הוא תואם cytometry זרימה immunostaining, מיקרוסקופ כוח המתיחה, המאפשרות מדידות כמותיים של אינטראקציות biomechanical בין תאים, מטריצה חוץ-תאית, לבין חיידקים פתוגניים.
מטריצה חוץ-תאית נוקשות כוללת אחת של גירויים מרובים מכני הסביבה כי הם כידוע להשפיע על התנהגות הסלולר פונקציה, גורל באופן כללי. למרות התגובות של סוגי תאים חסיד ויותר מטריצת קשיחות מאפינים, כמה מחסידי הרגישות התאים לזיהום חיידקי תלוי מטריצת קשיחות אינו ידוע במידה רבה, כמו היא ההשפעה של זיהום חיידקי על ביומכניקה של התאים המארחים. אנו משערים כי הרגישות של תאי אנדותל מארח זיהום חיידקי תלוי הנוקשות של המטריקס שבו שוכנים תאים אלה, כי הזיהום של המחשב המארח תאים עם חיידקים ישתנה ביומכניקה שלהם. כדי לבדוק את ההשערות שני אלה, תאי אנדותל שימשו מודל hosts ו ליסטריה חיידק מודל. על ידי פיתוח וזמינותו של הרומן עיצוב רב טוב, אנו מראים כי להיות מוערך באופן כמותי ההשפעה של מטריקס נוקשות על זיהום של תאי אנדותל מאת ל' monocytogenes דרך cytometry זרימה, immunostaining ואחריו מיקרוסקופ. בנוסף, באמצעות מיקרוסקופ כוח המתיחה, ההשפעה של זיהום monocytogenes ל' על המארח תא אנדותל ביומכניקה יכול להילמד. השיטה המוצעת מאפשרת הניתוח של ההשפעה של מכניקה רקמות רלוונטיות על זיהום חיידקי של תאים חסיד, וזה צעד קריטי להבנת יחסי גומלין ביו-מכני תאים, שלהם מטריצה חוץ-תאית, ו חיידקים פתוגניים. שיטה זו ישימה גם מגוון רחב של סוגים אחרים של מחקרים על ביומכניקה תא והתגובה קשיחות המצע איפה זה חשוב להיות מסוגל לבצע משכפל רבים במקביל ניסוי.
תאים ברקמות בעלי חיים ביותר הם בדרך כלל חסיד, הצמדת התאים הסמוכים וגם כדי שלהם מטריצה חוץ-תאית (ECM). המעגנה תאים ECM שלהם הוא קריטי עבור תהליכים תאיים רבים החל תנועתיות תא לתא1,התפשטות והישרדות2. Anchorage הסלולר ל ECM תלוי ECM הרכב והן נוקשות. התאים מגיבים לשינויים האחרונים על ידי באופן דינמי סידור מחדש שלהם שלד התא, התא-ECM ו תא-cell הדבקויות, אשר בתורו אנושות לשנות תא ביומכניקה ופונקציות3,4,5,6 . ECM נוקשות יכול להשתנות בחלל (קרי, מיקום אנטומי), זמן (כלומר, הזדקנות), וכן התהליכים הקשורים pathophysiological (למשל, טרשת עורקים, סרטן, זיהומים, וכו '). למשל, מקובל כי אנדותל תאים המתגוררים על נוקשה-לעומת רך-מטריצות להפעיל כוחות מוגברת שלהם ECM, אחד את השני ולגלות מוגברת תנועתיות והתפשטות7,8. באופן דומה, fibroblasts המתגוררים על מטריצות נוקשה להקנות את כוחות כויץ גבוהה שלהם ECM ולהראות התפשטות מוגברת, תנועתיות ו- ECM ייצור9,10,11. למרות תא מכניקה והתגובה ECM נוקשות נחקרו בהרחבה עבור סוגי תאים שונים, הקשר בין התאים המארחים חסיד, הנוקשות של שלהם ECM, זיהומים חיידקיים הוא עדיין אינו מודע לקיומם.
ללמוד את התפקיד של נוקשות ECM באינטראקציות תא חיידקים-מארח, ל' monocytogenes (Lm) נבחר את הפתוגן מודל. Lm הוא חיידק נפוץ המועבר במזון שיכולים לגרום זיהום סיסטמי במגוון רחב של מחשבים מארחים יונקים. זה פתוגן תאיים עיצוב גבות ניתן להעביר האפיתל במעי לאיברים מרוחקים באמצעות חציית סוגים שונים של כלי הדם endothelia. אם זה מפרה את מחסום דם - מוח, Lm עלולה לגרום לדלקת קרום המוח, כאשר יחצה את השליה, זה יכול לגרום הפלה ספונטנית12,13. Lm יכול להדביק מארח שונים סוגי תאים, באפשרותך לעשות זאת באמצעות אסטרטגיות פתוגניים ברורים. Lm זיהום נחקרה בעיקר בהקשר של תאי אפיתל, בעוד הרבה פחות ידוע על איך יכול להדביק Lm ו מעקף התאים אנדותל המצפים לומן של כלי הדם14,15,16. יתר על כן, לא ידוע עדיין במידה רבה איך הנוקשות של ECM שבו שוכנות תאי אנדותל מודולציה היכולת של Lm לפלוש אלה בתאי המארח להתפשט. באימות Lm ומספר נוסף מינים חיידקי (קרי, parkeri ריקטסיה) לנצל שלד התא אקטין של המחשב המארח תאים הם הדביקו לשניהם לפלוש לתוך הציטופלסמה שלהם וכדי להקל על הפצת לתא17 , 18 , 19. הם להשיג את זה דרך הביטוי של חלבונים המאפשרים להם להתערב עם מסלולים פלמור אקטין מארח וליצור זנבות כוכב השביט אקטין המאפשרים16,שלהם הנעה קדימה20. בעקבות זיהום, שלד התא אקטין של התא המארח צריך לארגן מחדש באופן דינמי באופן מתאפיין עדיין לא לגמרי, פוטנציאל להשפיע על ביומכניקה של התאים מארח כולל את הכוחות הפיזיקליים שהם מפעילים על ECM שלהם ועל כל אחרים. לבחון תהליכים אלה, תאי אנדותל microvascular אדם (HMEC-1) נבחרו כתאי מארח מודל שלוש סיבות: 1. תאי אנדותל ידועים להיות מאוד mechanosensitive כפי שהם נחשפים כל הזמן משתנה סימנים פיזיים21; 2. אסטרטגיות ש-lm מעסיקה להדביק תאי אנדותל הם עדיין אינו מודע לקיומם22; ו- 3. HMEC-1 הם קו תא מונצחים, יכול, לפיכך, להיות בקלות תרבותי ונחשפו לבצע מניפולציות גנטיות.
זיהום חיידקי של התאים המארחים בעיקר למד כבר במבחנה על-ידי זריעת תאי זכוכית או מצעים פוליסטירן הנמצאים באופן משמעותי נוקשה מאשר ה-ECM פיזיולוגיים של רוב התאים12,14,23. כדי לבחון את הזיהום של תאים נזרע על מטריצה נוקשות אשר רלוונטי מבחינה פיזיולוגית וכדי להבהיר את התפקיד של ECM נוקשות על הזיהום של תאים על ידי פתוגנים חיידקיים, עקבנו אחר גישה חדשנית המבוססת על בדיית דק hydrogels microbead-מוטבע לזיהוי של נוקשות tunable על רב טוב צלחות. החידוש של הגישה המוצעת טמון בכך שהיא מאפשרת ניטור תנאים מרובים בו זמנית עקב תבנית רב טוב שלה, כי הוא תואם עם טכניקות מרובות בשל אופן מסוים שסובסטרטים בנויות. HMEC-1 התאים היו נזרע על אלה hydrogels מצופים חלבון, אז נגוע זנים Lm להפוך פלורסנט על הפנמה או הם צורונים פלורסנט. תפקידו של ה-ECM נוקשות על זיהום הרגישות של התאים HMEC-1 המארחים הוערך על ידי cytometry זרימה. בנוסף, מיקרוסקופ immunostaining, קרינה פלואורסצנטית שימשו כדי להבדיל בין חיידקים למביטה והקפדה. לבסוף, מיקרוסקופ כוח המתיחה (TFM) בוצעה בהצלחה כדי לאפיין את ההשפעה של Lm חדירתו הלחצים המתיחה זה תאי אנדותל מארח להפעיל על מטריצות שלהם במהלך זיהום. וזמינותו שהוצגו ניתן לשנות בקלות כדי לאפשר יותר מחקרים על ההשפעה של ECM נוקשות על זיהום הרגישות של תאים חסיד באמצעות שורות תאים שונים או פתוגנים.
1. ייצור Hydrogels לזיהוי דו שכבתי דק (PA) על רב טוב צלחות

איור 1 : זיהום חיידקי וזמינותו של התאים המארחים המתגוררים על hydrogels דק דו שכבתי פלורסנט חרוז-מוטבע לזיהוי (PA) של נוקשות בדרגות שונות. א coverslips זכוכית דקה עוברות שינוי כימי כדי לאפשר הידרוג המצורף. B. µL 3.6 של הרשות הפלסטינית תערובות מופקדים על תחתית זכוכית. ג. התערובת מכוסה coverslip זכוכית עגול 12 מ מ כדי לאפשר הפילמור. D. coverslip מוסר עם מזרק המחט. E-µL 2.4 של פתרון הרשות הפלסטינית עם גרגרי הוסיף על גבי השכבה התחתונה, כתרים עם coverslip זכוכית עגול. F. מאגר נוסף בתוך הבאר, coverslip מוסר. G. הקרנת UV עבור 1 h מבטיח עיקור. H. Sulfo SANPAH-המכילים פתרון נוסף על ג'לים, אשר ממוקמות מכן מתחת UV עבור 10 דקות אני. Hydrogels עם מאגר שטופים ואז מתפשט בין לילה עם קולגן אני J. הידרוג הוא equilibrated עם תא מדיה. K. התאים מארח הם נזרע. ל' Lm חיידקים נוספים לפתרון, הזיהום מסונכרן באמצעות צנטריפוגה. ז. 1 h חיידקים לאחר הפגיעה בפתרון נשטפו, הוספת מדיה בתוספת אנטיביוטיקה. N. ב- 4 שעות לאחר הפגיעה, Lm (JAT985) מתחיל ואזוריט. O. HMEC-1 תאים ינותקו מעמוד מטריקס שלהם ואת הפתרונות של העברת צינורות כדי לבצע מדידות cytometry זרימה. שימו לב בימים ובשעות המשוער עבור כל שלב של וזמינותו מסומנות גם. איור זה השתנה מ Bastounis ו- Theriot59. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.

איור 2: AFM מדידות של הרשות הפלסטינית הידרוג נוקשות והפצה של חרוזים. א. הנתונים מראים הצפוי האלסטיות (מידת קשיחות) של הרשות הפלסטינית hydrogels, בהתחשב בכמות של אקרילאמיד bis-אקרילאמיד בשימוש לעומת האלסטיות נמדד באמצעות מיקרוסקופ כוח אטומי (N = 5-6). אופקיות מתארים את הממוצע. לא ניתן למדוד את הנוקשות של hydrogels kPa 0.6 כי hydrogels היו מאוד רך, מודבקת לקצה AFM. B. זוהי תמונת שלב של תאים HMEC-1 confluent ומוטבעים התמונה המתאימה של החרוזים על פני מעייניו הידרוג רכה 3 kPa-PA. ה-HMEC-1 היו נזרע במשך 24 שעות ביממה-ריכוז של 4 x 105 תאים לכל טוב. ג. הדמות הזאת היא אותו הדבר כמו באיור 2B אבל התאים השוכנים במחשב הידרוג הרשות הפלסטינית 70 נוקשה-kPa. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
2. האדם Microvascular תא אנדותל תרבות, זריעה על Hydrogels
3. זיהום של תאי אנדותל Microvascular אדם עם ל' monocytogenes
4. לזרום Cytometry לכמת נוקשות מטריצה חוץ-תאית הרגישות התלויים של התאים המארחים לזיהום
5. Immunostaining של חיידקים חוץ-תאית, מיקרוסקופ, עיבוד תמונה
הערה: גישה זו מלווה כדי להבדיל בין ECM-נוקשות אדהזיה חיידקי התלויים על גבי המשטח התא המארח נגד חיידקי הפנמה (הפלישה) בתוך המחשבים המארחים.

איור 4 : Immunostaining של Lm נגועה HMEC-1 תאים המתגוררים על hydrogels של נוקשות משתנות כדי להבדיל אדהזיה חיידקי נגד הפלישה. תמונות אלה להראות דוגמה ייצוגית דיפרנציאלי immunostaining מציג A. תא גרעינים (דאפי), B. כל החיידקים (GFP), ו- C. החיידקים מבחוץ (אלקסה-546). התאים HMEC-1 היו השוכנים במחשב הידרוג 3-kPa רך. החצים הצבע על חיידקים כי כבר הפנימו, כך מוצגים בלבד לערוץ הצבע הירוק. הנתונים ב- D-F מתייחסים N = 20 תמונות שנלכדו עבור התאים HMEC-1 נגוע המתגוררים על 3 רך-kPa ו 70 נוקשה-kPa hydrogelsלהראות D. החיידק הכולל לכל הגרעינים; E. החיידק למביטה לכל הגרעינים; ו F. היעילות הפלישה (היחס בין חיידקים למביטה הכולל חיידקים). אופקיות מתארים ממוצע של הנתונים. P-ערך מחושב עם הבדיקה Wilcoxon דרגה סכום שאינו פרמטרי. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
6. מיקרוסקופ כוח המתיחה רב טוב, מיקרוסקופיה מתח חד שכבתי

איור 5: תאים הנגועים Lm HMEC-1 להקטין את סדר הגודל של הכוחות המתיחה הם מפעילים על ECM שלהם במהלך זיהום. פאנל A מראה את התמונה שלב, B מראה השדה דפורמציה, ג מראה המתיחה מתח שדה, ומראה D בתחום המתח תאיים של התאים HMEC-1 נגוע השוכנים במחשב הידרוג 20-kPa. סרגלי הצבע של דפורמציה מפות (מיקרומטר), של המתיחה מתח (Pa), ומפות של המתח תאיים מפות (nNµm-1) מוצגים על החלק העליון של מפות חום. העמודות להראות בשלוש נקודות זמן נציג: 3, 8, 18 שעות לאחר הפגיעה. E-H. אותו הדבר כמו לוחות A-D , אבל עבור תאים נגועים Lm-MOI 300. התמונות של החיידק (ערוץ אדום) הם יונחו על הדימויים שלב של התאים. הקלטות TFM נוהלו על ידי הדמיה בארות מרובים בו-זמנית. גודל החלון עבור PIV היה 32 פיקסלים עם חפיפה בין 16. סרגל קנה מידה הוא 32 מיקרומטר. איור זה השתנה מ Bastounis ו- Theriot59. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
7. כמותיים מיקרוסקופ זמן לשגות לתאים להעריך Extracellular-מטריקס-נוקשות התלויים ל' monocytogenes הפצתו דרך אנדותל

איור 6: נתוני זמן לשגות מיקרוסקופ כמותית של Lm הפצתו דרך monolayers HMEC-1 נזרע על מצעים עם 3-kPa ו- 70-kPa נוקשות. א לוח זה מציג עדיין תמונות של שני מוקדים נציג זיהום ב- 0, 200, 400, 600 דקות. הערוץ שלב מתארת monolayers תא HMEC-1, ומתאר הערוץ האדום Lm תאיים (ראה שלב 7 לפרוטוקול). B. חלונית זו מציגה אזור קמור המקיף את המוקד זיהום המותווים כפונקציה של הזמן. אזור המיקוד של המצב 3-kPa (אדום) גדל מהר יותר מזה של 70-kPa (ירוק). ג. לוח זה מראה שהמרחק רדיאלי ממרכז לקצה של המוקד זיהום המותווים כפונקציה של זמן עבור נציג foci זיהום גדל (אדום) monolayers HMEC-1 נזרע על הרשות הפלסטינית סובסטרטים של 3-kPa וקשיחות 70-kPa (ירוק). מהירות רדיאלית (ד ר/dt) הוא קבוע עבור התנאי 3-kPa, אבל biphasic עבור התנאי 70-kPa. ד. נתונים אלה מראים המהירות רדיאלית מינימום 200 הראשון של עשר מוקדים זיהום עצמאית. אדום (3-kPa) וירוק (70-kPa) נקודות נתונים מתארים מורדות שני מוקדים שמתואר הלוחות הקודמים. אופקיות מתארים ממוצע של הנתונים. P-ערך מחושב עם הבדיקה Wilcoxon דרגה סכום שאינו פרמטרי. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
ECM תלויי-נוקשות הרגישות של תאים HMEC-1 לזיהום Lm:
הרשות hydrogels של נוקשות בדרגות שונות, כל משטח מצופה עם קולגן אני, נבנו על לוחות זכוכית רב טוב כפי שמתואר שלב 1 של הפרוטוקול (ראה איור 1). AFM מדידות בוצעו כדי לאשר את הנוקשות המדויק של hydrogels, כפי שתואר לעיל26,27 (ראה איור 2). מחקרים שנעשו בעבר הראו כי הציות המקומי של קרום המרתף של תאי אנדותל יכול לנוע בין 1 kPa (למשל, רקמת המוח) עד 70 kPa (למשל, אבי העורקים)36,37,38, 39 , 40. לכן, בחרנו לבחון את הזיהום של תאים HMEC-1 המתגוררים על מטריצות עם הקשיחות הבאים: 0.6 kPa, 3 kPa, 20 kPa ו 70 kPa. עבור כל הידרוג נוקשות, שש hydrogels היו מפוברק כדי להעריך את הפארמצבטית של התוצאות.
Cytometry זרימה שימש כדי להעריך את הרגישות תלויי-נוקשות ECM של תאים HMEC-1 לזיהום Lm (ראה איור 3). תאים HMEC-1 נדבקו בנגיף זן Lm (JAT985) המבטאת סמן פלורסנט לאחר הפנמה (actAp::mTagRFP), המאפשר זיהוי חיידקים תאיים היחידה (ראה דמויות 1 L - 1N). JAT985 חסרה גם ActA, הפיכת החיידק להתפשט מתא לתא, מאז ActA הכרחי להיווצרות זנב השביט אקטין והפצה חיידקי עוקבות. 7 - 8 שעות לאחר הפגיעה, זיהום התאים HMEC-1 הוערכה באמצעות cytometry זרימה. כדי להבטיח הניתוח של תאים בודדים, היה עיקר חלוקת תא ספירת מגודרת באמצעות פארווערטס לעומת הצד פיזור מגרש, ולאחר מכן צעד המגביל השני היה ביצע כדי לא לכלול תאים כי התערוכה autofluorescence (ראה דמויות 3A - 3 C ). תוצאות ראשוניות מתואר באיור 3 מראים כי זיהום HMEC-1 עם Lm הוא כ כפולה גדולה יותר עבור תאים HMEC-1 המתגוררים על נוקשות hydrogels kPa 70 לעומת התאים השוכנים במחשב hydrogels kPa 0.6 רך (ראה דמויות 3B - תלת-ממד). הרגישות לזיהום Lm מוגברת של תאים HMEC-1 המתגוררים על נוקשות לעומת מטריצות רך יכול להיות בשל: 1. גדל Lm אדהזיה על גבי HMEC-1; 2. Lm מוגבר, פלישת HMEC-1; או 3. שני הנ ל שיתוף המתרחשים. כדי לבדוק חסימות איזה השערה, היו תאים HMEC-1 נזרע על רך (3 kPa) ו hydrogels (70 kPa) נוקשות, נגוע צורונים GFP לבטא Lm (ראה דמויות 4A - 4 C). הדגימות תוקנו זמן קצר לאחר זיהום, החיידקים (adhering) חיצוני היו מוכתמים נוגדנים. באמצעות מיקרוסקופ כמותית, מצאנו כי ישנם חיידקים באופן משמעותי יותר הקפדה על HMEC-1 כאשר התאים מארח שוכנים על נוקשות לעומת ג'ל רך (ראה איור 4D). בקנה אחד עם הנתונים cytometry זרימה, יש חיידקים באופן משמעותי לנחלתו של HMEC-1 כאשר התאים מארח שוכנים על נוקשות לעומת ג'ל רך (ראה איור 4E). אולם, הפלישה היעילות (חיידקים הפנימו/סה כ מספר חיידקים) של Lm לתוך תאים HMEC-1 הוא דומה, ללא התחשבות קשיחות המצע (ראה איור 4F).
מיקרוסקופ כוח המתיחה של תאים הנגועים Lm HMEC-1:
Lm זיהום של תאים HMEC-1 יכול לשנות את ביומכניקה של תאים נגועים המארח, כולל הכוח המצורף ECM שלהם או אחד לשני, המשפיעים על תקינותם מכשול. אנחנו ביקשו להעריך זה יכול להיות המקרה באמצעות מיקרוסקופ כוח המתיחה32 כדי לחשב את כוחות המתיחה תא-ECM ומיקרוסקופיה מתח חד שכבתי41 כדי לחשב את הכוחות tensional תאיים. איור 5 מציג מפות של דפורמציה שדה, שדה מאמץ המתיחה, המתח תאיים שדה של תאים HMEC-1 המתגורר hydrogels 20-kPa-נקודות זמן שונות לאחר הפגיעה. דמויות 5A - 5 D להפנות לתאים נגוע השליטה HMEC-1 ואילו דמויות 5E - 5 שעות יש לפנות HMEC-1 תאים נגועים Lm-ריבוי של זיהום שווה ל- 300 תא חיידקים. עבודה ראשונית זו מרמזת כי תאים נגועים HMEC-1 להפחית את סדר הגודל של התא-ECM שלהם מדגיש תאיים במהלך זיהום עם Lm, ואילו זה לא נצפית עבור תאים נגוע השליטה.
ECM תלויי-נוקשות Lm הפצתו ברחבי monolayers HMEC-1:
מיקרוסקופ זמן לשגות שימש לחקור את האפקט מטריצת קשיחות יש ב- Lm הפצתו דרך monolayers HMEC-1. כמו Lm מתפשט דרך טפט, החיידקים ליצור מוקד הזיהום הגדל כפונקציה של הזמן (ראה איור 6A ואת הסרטונים דמויות 1 ו- 2). האזור של המוקד זיהום נמדד על ידי ציור של קמור, מהקטן לגדול קמורה המצולע שמקיף את ערכה של נקודות, סביב חיידקים42. יש מדד סטנדרטי אין בשדה כדי למדוד את היעילות של ל' monocytogenes התפשטות לתא דרך טפט של התאים המארחים. כדי להעריך את יעילות כפולה, כמה יש לספור את מספר התאים המארחים המוקד זיהום41, לאחרים יש גבולות מצוירות באופן ידני סביב הקבוצה של זיהום מארח תאים43. בחרנו לצייר מצולע קמור סביב החיידקים, כי זה תהליך אוטומטי, התמדה שהמפתחות זול כדי למדוד את היעילות של התפשטות monocytogenes ל' . בעשותם כך, מצאנו ירידה קלה באזור המיקוד זיהום בתאים HMEC-1 נזרע על 70 hydrogels kPa בהשוואה לאלה נזרע על מטריצות kPa 3 (ראה איור 6B ואת הסרטונים דמויות 1 ו- 2). כדי לקבוע את קצב הצמיחה של המוקד זיהום, המרחק רדיאלי הייתה להתוות כפונקציה של הזמן על-ידי לקיחת השורש הריבועי של האזור של המוקד זיהום חילוק זה פאי. טרנספורמציה מתמטית זו מניחה כי הצורה של המוקד זיהום הוא בערך מעגלית44. כדי למדוד את המהירות של הגידול המוקד, קצב השינוי (קרי, המדרון) של המרחק רדיאלי עבור שתי מטריצות 3 - ו 70-kPa נמדדה. גישה זו מבואר כי המוקד זיהום גדל מהר יותר מונוטוני בתאים HMEC-1 נזרע על גבי 3-kPa מטריצות. עם זאת, המוקד גדל איטי באופן משמעותי (הראשון 200 דקות), מעט איטי יותר (200 עד 600 דקות) בתאים נזרע על 70-kPa מטריצות (ראה איור 6C). אכן, ניתוח של נתונים נוספים אישר כי המוקד זיהום גדל, בממוצע, כפולה לאט יותר ב- 70-kPa מטריצות, בעיקר בזמן מינימום 200 הראשונה (ראה איור 6D).

איור 3 : הרגישות תלויי-נוקשות ECM של תאים HMEC-1 Lm לפלישה נמדד באמצעות cytometry זרימה . תאים HMEC-1 נדבקו בנגיף Lm (JAT985), הזיהום נותחה על ידי cytometry זרימה. א. לוח זה מראה צד לעומת פיזור קדימה מגרש עבור תאים HMEC-1 נציג מגיע לבאר בודדת. התפלגות בכמות גדולה של תאים נבחר באמצעות gating כדי לא לכלול פסולת (משמאל) ותא doublets או שלישיות (מימין). B. גרף זה מראה היסטוגרמה של הלוגריתם של עוצמת קרינה פלואורסצנטית Lm בכל תא עבור HMEC-1 מצופה ב kPa 0.6 רך. ג. גרף זה מראה היסטוגרמה של הלוגריתם של עוצמת קרינה פלואורסצנטית Lm בכל תא HMEC-1 מצופה על נוקשות hydrogels kPa 70. היסטוגרמות עבור N = 4-6 משכפל מוצגים בצבעים שונים. היסטוגרמה התאים בקרה uninfected הוא סגול. השער משמש להגדרת מה נגוע מוצגים באדום. למשרד הפנים הוא 100, הזיהום היה המוערך 8 שעות לאחר הפגיעה. ד. הנתונים מראים אחוז תאים נגועים HMEC-1 לעומת הנוקשות הידרוג (N = 5). אופקיות מתארים ממוצע של הנתונים. P-ערך מחושב עם הבדיקה Wilcoxon דרגה סכום שאינו פרמטרי. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.

וידאו איור 1: ההפצה של Lm תאיים (ערוץ אדום) דרך חד שכבתי תא HMEC-1 (שלב) נזרע על מצע 3-kPa. התאים היו עם תמונה של ליבוביץ L-15 מדיה (10% FBS, µg/mL 20 של גנטמיצין) בתוך תא סביבתיים equilibrated כדי הלעפה תרוטרפמט 37. התמונות נאספו כל 5 דקות. מהירות הסרט היא 15 מסגרות/ס אנא לחץ כאן כדי להציג וידאו זה. (לחיצה ימנית כדי להוריד.)

סרטון איור 2: הפצת Lm תאיים (ערוץ אדום) דרך חד שכבתי תא HMEC-1 (שלב) נזרע על מצע 70-kPa. התאים היו עם תמונה של ליבוביץ L-15 מדיה (10% FBS, µg/mL 20 של גנטמיצין) בתוך תא סביבתיים equilibrated ל- 37 מעלות צלזיוס. התמונות נאספו כל 5 דקות. מהירות הסרט היא 15 מסגרות/ס אנא לחץ כאן כדי להציג וידאו זה. (לחיצה ימנית כדי להוריד.)
| מודול האלסטיות (E, kPa) | אקרילאמיד % (מ- 40% מניות) | Bisacrylamide % (מ- 2% מניות) |
| 0.6 | 3 | 0.045 |
| 3 | 5 | 0.075 |
| 10 | 10 | 0.075 |
| 20 | 8 | 0.195 |
| 70 | 10 | 0.45 |
טבלה 1. ההרכב של לזיהוי (PA) hydrogels של קשיות שונות. בטבלה זו, האחוז של פתרון אקרילאמיד 40% מניות, ואת האחוז במניה 2% פתרון bis-אקרילאמיד להשגת מנדנד נתון (האלסטיות, E) הם הצביעו על עמודות שונות.

חומר משלים 1. חישוב של מתח תאיים מדגיש המתיחה מחושב. אנא לחץ כאן כדי להוריד את הקובץ.
המחברים אין לחשוף.
פיתחנו assay מבוססי לזיהוי של עיצוב רב טוב עבור בודק את ההשפעה של מטריצה חוץ-תאית נוקשות על זיהום חיידקי של תאים חסיד. Assay הזה הוא תואם cytometry זרימה immunostaining, מיקרוסקופ כוח המתיחה, המאפשרות מדידות כמותיים של אינטראקציות biomechanical בין תאים, מטריצה חוץ-תאית, לבין חיידקים פתוגניים.
אנו מודות מ תחתונה, ר' Lamason, מ Rengaranjan, חברי המעבדה Theriot שלהם לדיונים ותמיכה ניסיוני. עבודה זו נתמכה על ידי NIH R01AI036929 (J.A.T.), HHMI (J.A.T.), לאחווה גילהם HHMI מחקר מתקדם (F.E.O.), את סטנפורד בוגר אחווה (F.E.O.) של איגוד הלב האמריקאי (E.E.B.). Cytometry זרימה בוצעה במתקן סטנפורד משותפים FACS.
| <חזק>ריאגנטיםחזקים> | |||
| נתרן הידרוקסיד כדורי פישר | S318-500 | ||
| (3-אמינופרופיל) טריאתוקסילאן | סיגמא | A3648 | |
| 25% גלוטרלדהיד | סיגמא | G6257-100 מ"ל | |
| 40% אקרילאמיד | סיגמא | A4058-100 מ"ל | |
| תמיסת ביס-אקרילאמיד (2% משקל / נפח) | פישר סיינטיפיק | BP1404-250 | |
| פלואורוספירות מיקרוספירות שעברו שינוי קרבוקסילאט, 0.1 μ m, פלואורסצנט צהוב-ירוק (505/515) | Invitrogen | F8803 | |
| אמוניום פרסולפט | פישר | BP17925 | |
| TEMED | Sigma | T9281-25ML | |
| Sulfo-SANPAH | Proteochem | c1111-100 מ"ג | |
| קולגן, תמיסה מסוג I מחולדה | סיגמא | C3867-1VL | |
| דימתיל סולפוקסיד (DMSO) | J.T. Baker | 9224-01 | |
| HEPES, חומצה חופשית | J.T. Baker | 4018-04 | |
| L-15 בינוני של לייבוביץ, ללא פנול אדום | Thermofischer | 21083027 | |
| MCDB 131 בינוני, ללא גלוטמין | Life Technologies | 10372019 | |
| Foundation סרום בקר עוברי, אצווה: A37C48A | Gemini Bio-Prod | 900108 500 מ"ל | |
| גורם גדילה אפידרמיס, EGF | Sigma | E9644 | |
| הידרוקורטיזון | Sigma | H0888 | |
| L-גלוטמין 200 מ"מ | פישר | SH3003401 | |
| DPBS 1X | פישר | SH30028FS | |
| ג'נטמיצין סולפט | MP ביו-רפואי | 194530 | |
| קלורמפניקול | סיגמא | C0378-5G | |
| DifcoTM אגר, מגורען | BD | 214530 | |
| BBL TM עירוי מוח-לב | BD | 211059 | |
| Hoechst 33342, טריהידרוכלוריד, טריהידראט - תמיסה של 10 מ"ג/ul במים | Invitrogen | H3570 | |
| פורמלדהיד 16% | מיקרוסקופ אלקטרונים | בדרגת EM15710-S | |
| נוגדן אנטי-ליסטריה מונוציטוגנס | Abcam | ab35132 | |
| נוגדן משני IgG (H+L) נגד ארנב עיזים, Alexa Fluor® 546 מצומד | Thermofischer | A-11035 | |
| 0.25% טריפסין-EDTA , פנול אדום | תרמופישר | 25200056 | |
| קולגנאז מ- CLOSTRIDIUM HISTOLYTIC | Sigma | C8051 | |
| סטרפטומיצין סולפט | Fisher Scientific | 3810-74-0 | |
| סוכרוז | Calbiochem | 8510 | |
| נתרן דודציל סולפט | Thermofischer | 28364 | |
| MES אבקת | Sigma | M3885 | |
| KCl | J.T. Baker | 3040-05 | |
| MgCl2 | J.T. Baker | 2444-1 | |
| EGTA | Acros | 40991 | |
| <חזק>ציוד מעבדה חד פעמיחזק> | |||
| 12 מ"מ זכוכית עגולה כיסויים | פישרברנד | 12-545-81 | מס' 1.5 כיסוי | 10 מ"מ קוטר זכוכית | |
| תחתית זכוכית לא מצופה 24 צלחות באר | מטק | P24G-1.5-13-F | |
| צינורות פוליסטירן 5 מ"ל עם 35 μ מכסה מסננת תא M | צלוחיות פלקון | 352235 | |
| T-25 | פלקון | 353118 | |
| שפופרות חרוטיות 50 מ"ל | פלקון | 352070 | |
| שפופרות חרוטיות 15 מ"ל | פלקון | 352196 | |
| פיפטות סרולוגיות חד פעמיות (1 מ"ל, 2 מ"ל, 5 מ"ל, 10 מ"ל, 25 מ"ל) | פיפטות זכוכית פלקון | 357551 | |
| פסטר | VWR | 14672-380 | |
| קצות פיפטות (1-200 μ l, 101-1000 μ l) | דנוויל | P1122, P1126 | |
| כפפות בדיקה ללא אבקה | Microflex | XC-310 | |
| Cuvettes חיידקים | Sarstedt | 67.746 | |
| סכיני גילוח | VWR | 55411-050 | |
| מחט מזרק | BD | 305167 | |
| בקבוקי עיקור 0.2um | Thermo Scientific | 566-0020 | |
| 20 מזרקי מ"ל | BD | 302830 | |
| מסנני 0.2um Thermo | Scientific | 723-2520 | |
| מקלות עץ | Grainger | 42181501 | |
| Saran wrap | Santa Cruz Biotechnologies | sc-3687 | |
| צלחות חיידקים | פלקון | 351029 | |
| <חזק>ציוד מעבדה גדול/לא חד פעמיחזק> | |||
| ברדס תרבית רקמות | בייקר | SG504 | |
| המציטומטר | סיגמא | Z359629 | |
| חממת חיידקים | תרמו מדעי | IGS180 | |
| חממת תרביות רקמות | NuAire | NU-8700 | |
| מיקרוסקופ ניקון דיאפוט הפוך 200 אפיפלואורסצנטי | ניקון | NIKON-DIAPHOT-200 | |
| חממת כלובים | הייסון | מותאם אישית | |
| סקנפורד מנתח FACScan | סטנפורד ו-Cytek שדרגו את FACScan | Custom | |
| Pipette Aid | Drummond | 4-000-110 | |
| Pipettors (10 μ l, 200 μ l, 1000ul) | גילסון | F144802, F123601, F123602 | |
| מד pH | מטלר טולדו | 30019028 | |
| מלקחיים | FST | 11000-12 | |
| 1 ליטר בקבוק | פישרברנד | FB5011000 | |
| מכונת חיטוי | Amsco | 3021 | |
| צלחת מגנט לערבב | Bellco | 7760-06000 | |
| מוטות ערבוב מגנט | Bellco | 1975-00100 | |
| ספקטרופוטומטר | בקמן | DU 640 | |
| Scanford FACScan מנתח | Cytek Biosciences | מותאם אישית סטנפורד ו-Cytek FACScan | משודרג |
| < תוכנה>חזקהחזקה> | |||
| תוכנת מיקרוסקופ (μ מנהל) | Open Imaging | ||
| Matlab | Matlab Inc | ||
| Flowjo | FlowJo, LLC | ||
| תוכנת ניתוח תמונות אוטומטית, CellC | https://sites.google.com/site/cellcsoftware/ | התוכנה זמינה בחינם. ניתן להשיג קבצים הניתנים להפעלה וקודי מקור של MATLAB בכתובת https://sites.google.com/site/cellcsoftware/ |