Erratum: Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development

527 צפיות

3 במרץ 2017

במאמר זה

סיכום

An erratum was issued for Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development.

The human RCTEC/RCTE cell stocks used here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 were originally provided by Dr. Loghman-Adham (then at St. Louis University) to co-author Dr. Wandinger-Ness (University of New Mexico) through an MTA in 2001. The SV40 immortalized human RCTEC/RCTE cells were characterized as being of distal tubule cell line as detailed in Loghman-Adham et al., 2003. On the basis of recent short tandem repeat (STR) DNA sequencing (Performed by IDEXX BioResearch) of the earliest passages of the RCTEC/RCTE cell stocks it became evident the cells were of mixed lineage. Further analyses of PCR products using QIAxcel capillary electrophoresis demonstrated the presence of a canine product. The product was sequenced and established to be of canine origin. A set of canine specific STR markers were compared to the sample and showed that the sample had a genetic profile with 92% identity to the MDCK cell line.  Later cell stocks that were used in the present publication were STR profiled and showed drift to 100% MDCK lineage. Despite being of canine origin, rather than human as was previously thought, MDCK is similarly a distal tubule epithelial cell line. For this reason, previous interpretation and conclusions drawn using these cells here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 remain sound, but for purposes of rigor, reproducibility and experimental validation by others we report on this misidentification. This information will also be reported for listing on the International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) database (http://iclac.org).

תקציר

An erratum was issued for Epithelial Cell Repopulation and Preparation of Rodent Extracellular Matrix Scaffolds for Renal Tissue Development.

The human RCTEC/RCTE cell stocks used here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 were originally provided by Dr. Loghman-Adham (then at St. Louis University) to co-author Dr. Wandinger-Ness (University of New Mexico) through an MTA in 2001. The SV40 immortalized human RCTEC/RCTE cells were characterized as being of distal tubule cell line as detailed in Loghman-Adham et al., 2003. On the basis of recent short tandem repeat (STR) DNA sequencing (Performed by IDEXX BioResearch) of the earliest passages of the RCTEC/RCTE cell stocks it became evident the cells were of mixed lineage. Further analyses of PCR products using QIAxcel capillary electrophoresis demonstrated the presence of a canine product. The product was sequenced and established to be of canine origin. A set of canine specific STR markers were compared to the sample and showed that the sample had a genetic profile with 92% identity to the MDCK cell line.  Later cell stocks that were used in the present publication were STR profiled and showed drift to 100% MDCK lineage. Despite being of canine origin, rather than human as was previously thought, MDCK is similarly a distal tubule epithelial cell line. For this reason, previous interpretation and conclusions drawn using these cells here and in Caralt et al., 2015, Uzarski et al., 2015 remain sound, but for purposes of rigor, reproducibility and experimental validation by others we report on this misidentification. This information will also be reported for listing on the International Cell Line Authentication Committee (ICLAC) database (http://iclac.org).

פרוטוקול

תיקון (erratum) פורסם עבור אוכלוסייה מחודשת של תאי אפיתל והכנת פיגומים של מטריקס חוץ-תאי ממכרסמים לפיתוח רקמת כליה.

מלאי תאי ה-RCTEC/RCTE האנושיים ששימשו כאן ובמאמרים של Caralt et al., 2015 ו-Uzarski et al., 2015 סופקו במקור על ידי ד"ר Loghman-Adham (באותה עת באוניברסיטת סנט לואיס) למחבר השותף ד"ר Wandinger-Ness (אוניברסיטת ניו מקסיקו) באמצעות MTA בשנת 2001. תאי ה-RCTEC/RCTE האנושיים המונצחים על ידי SV40 אופיינו כשורת תאים של צינור מרוחק (distal tubule), כפי שפורט ב- Loghman-Adham et al., 2003. על בסיס ריצוף DNA של חזרות קצרות בתتابع (STR) שנערך לאחרונה (על ידי IDEXX BioResearch) למעברים המוקדמים ביותר של מלאי תאי ה-RCTEC/RCTE, התברר כי התאים הם ממוצא מעורב. ניתוחים נוספים של תוצרי PCR באמצעות אלקטרופורזה קפילרית ב-QIAxcel הדגימו נוכחות של תוצר כלבי. התוצר עבר ריצוף ונקבע כי הוא ממקור כלבי. סט של סממני STR ספציפיים לכלבים הושוו לדגימה והראו כי לדגימה יש פרופיל גנטי עם 92% זהות לשורת התאים MDCK.  מלאי תאים מאוחרים יותר ששימשו בפרסום הנוכחי עברו פרופיל STR והראו סחיפה ל-100% שורת תאי MDCK. למרות היותם ממקור כלבי, ולא אנושי כפי שחשבו בעבר, MDCK היא באופן דומה שורת תאים אפיתליאליים של צינור מרוחק. מסיבה זו, הפרשנויות והמסקנות הקודמות שהוסקו באמצעות תאים אלו כאן ובמאמרים של Caralt et al., 2015 ו-Uzarski et al., 2015 נשארות תקפות, אך למטרות של דיוק, הדירות ותיקוף ניסיוני על ידי אחרים, אנו מדווחים על זיהוי שגוי זה. מידע זה ידווח גם לצורך רישום במאגר הנתונים של הוועדה הבינלאומית לאימות שורות תאים (ICLAC) (http://iclac.org).

גילויים

No conflicts of interest declared.

הדפסות חוזרות והרשאות

תגיות

MDCKDNA STR