התממשקות מיקרופלואידיקה עם מערכים Microelectrode ללמוד תקשורת עצביים והתפשטות אות עצב

Summary

פרוטוקול זה מטרתו להדגים כיצד לשלב במבחנה microelectrode מערכים להתקנים microfluidic לימוד פוטנציאל הפעולה שידור בתרבויות עצביים. ניתוח נתונים, כלומר זיהוי ואפיון של הפצת פוטנציאל פעולה, הוא שבוצעו באמצעות חדש מתקדם, אך ידידותי למשתמש, זמינה בחופשיות, כלי חישובית.

Abstract

מערכים microelectrode (אותי) נמצאים בשימוש נרחב לימודים תפקוד במבחנה. מכשירים אלו מאפשרים בו-זמניות פולשני הקלטה/גירוי של פעילות אלקטרופיזיולוגיות לתקופות ארוכות. עם זאת, המאפיין של חישה אותות מכל המקורות סביב כל microelectrode יכול להיות שלילי כאשר מנסים להבין תקשורת, אות התפשטות מעגלים עצביים. ברשת העצבית, מספר הנוירונים ניתן להפעיל בעת ובעונה אחת, ניתן ליצור פוטנציאל פעולה חופפים, ומקשה להפלות ולעקוב אחר התפשטות אות. בהתחשב מגבלה זו, הקמנו במבחנה התקנה התמקדו הערכת אלקטרופיזיולוגיות תקשורת, אשר מסוגל לבודד ומגבירים אותות עצב עם רזולוציה גבוהה של יכולות. מאת התממשקות והתקנים microfluidic אותי, אנחנו יכולים להפריד תרבויות עצביים עם יישור ומבוקרות היטב של אקסונים ו- microelectrodes. התקנה זו מאפשרת הקלטות של ספייק התפשטות עם יחס אות לרעש גבוה במשך מספר שבועות. בשילוב עם נתונים המתמחה באלגוריתמים לניתוח, הוא מספק נתונים היסטוריים כימות של תקשורת מספר הקשורים מאפיינים כגון הפצת מהירות הולכה כשל, קצב ירי, anterograde קוצים, וקידוד מנגנונים.

פרוטוקול זה מדגים כיצד ליצור מלכודת תרבות עצביים ממודר מעל המצע משולב אותי כיצד תרבות נוירונים בתוכנית התקנה זו, כיצד להקליט בהצלחה, לנתח ולפרש את התוצאות של ניסויים אלה. כאן, אנו מראים איך הגדרת הוקמה מפשט את ההבנה של תקשורת עצביים והתפשטות אות עצב. פלטפורמות אלה לסלול את הדרך עבור במבחנה דגמים חדשים עם topographies הנדסה ורשת עצביים לשליטה. הם יכולים לשמש בהקשר של תרבויות עצביים הומוגנית, או עם תצורות תרבות משותפת איפה, לדוגמה, התקשורת בין נוירונים סנסוריים סוגי תאים אחרים הנמצאים תחת פיקוח, העריך. תוכנית התקנה זו מספקת תנאים מאוד מעניין ללמוד, לדוגמה, neurodevelopment, מעגלים עצביים, מידע קידוד, גישות הקשורים ניוון מוחיים neuroregeneration.

Introduction

הבנת תקשורת חשמלית של מעגלים עצביים היא צעד מהותי כדי לחשוף את התיפקוד הרגיל, לתכנן אסטרטגיות טיפוליות כדי לטפל בתפקוד. נוירונים לשלב, לחשב, להעביר פוטנציאל פעולה (APs) אשר יפיץ לאורך אקסונים דק שלהם. טכניקות מסורתיות אלקטרופזיולוגים (למשל, מלחציים תיקון) טכניקות עוצמתיות ללמוד פעילות. עצבית אך מוגבלים המבנים התאיים גדולים יותר, כמו סומא או של דנדריטים לעיתים קרובות. טכניקות ההדמיה להציע חלופה ללמוד אותות עצב עם רזולוציה מרחבית גבוהה, אך הם קשים מבחינה טכנית לבצע ולא מאפשרים מדידות לטווח ארוך¹. בהקשר זה, השילוב של מערכים microelectrode (אותי) מיקרופלואידיקה יכולה לתרום תרומה חזק ב לחשוף את המאפיינים הבסיסיים של neuron´s פעילות של אות שידור בתוך רשתות עצביים במבחנה^{2 , 3}.

טכנולוגיה MEA מסתמכות על הקלטות חוץ-תאי של תרבויות עצביים. היתרונות העיקריים של מתודולוגיה אלקטרופיזיולוגיות זו הם יכולתה לתמוך לטווח ארוך, בו זמנית ורישום באתרים מרובים, לא פולשנית דרך³. אותי עשויים מסתיימים, גבוהה מוליך ועמידים בפני קורוזיה microelectrodes נעוץ מצע וופל זכוכית. הם תואמים תא קונבנציונאלי התרבות ביו-ציפויים, אשר באמצעות קידום תא אדהזיה באופן משמעותי להגביר את ההתנגדות איטום בין המצע והתאים^3,4. יתר על כן, הם מגוונים בעיצוב, עשויים להשתנות microelectrodes גודל, גאומטריה, צפיפות. בסך הכל, לי לעבוד ככלים תרבות תא קונבנציונאלי עם היתרון של ומאפשר בו-זמניות הדמיה לחיות, אלקטרופיזיולוגיות הקלטות/גירוי.

השימוש בטכנולוגיה MEA תרם המחקר של תכונות חשובות של רשתות עצביות⁵. עם זאת, קיימות תכונות הטבועות המגבילות את הביצועים של לי ללמוד תקשורת והתפשטות APs במעגל עצביים. אותי לאפשר הקלטות של תאים בודדים ומבנים אפילו subcellular כמו אקסונים, אבל בהשוואה אותות somal, אותות עצב יש יחס אות לרעש נמוך מאוד (SNR)⁶. יתר על כן, המאפיין של חישה חוץ-תאית שדה פוטנציאל מכל המקורות סביב microelectrode כל הסלים המעקב של התפשטות אות במעגל עצביים.

מחקרים שנעשו לאחרונה הראו, עם זאת, כי ההקלטה תנאים טובים יותר יכולה להיות מושגת על ידי כך את microelectrodes מיושרת צר microchannels שבו אקסונים יכולים לגדול. תצורה זו מספקת שעלייה משמעותית SNR כזה כי הפצת האותות עצב יכול להיות בקלות זוהה^{7,8,9,10,11,12, 13}. האסטרטגיה של לכרות ברית microfluidic התקנים עם טכנולוגיית MEA יוצר microenvironment מבודד חשמלית מתאימים להגביר אותות עצב¹¹. יתר על כן, הנוכחות של microelectrodes חישה מרובים לאורך microgroove הוא היסוד עבור זיהוי ואפיון של התפשטות אות עצב.

כזה פלטפורמות במבחנה עם הרשת העצבית מאוד לשליטה topographies ניתן להתאים שאלות מחקר רבות¹⁴. פלטפורמות אלה מתאימים לשמש בהקשר של תרבויות עצביים, אך ניתן להרחיב מהנדס תצורות תרבות משותפת, התקשורת בין הנוירונים סוגי תאים אחרים יכול להיות במעקב ואיפה העריך. תוכנית התקנה זו ובכך מספק תנאים מאוד מעניין לחקור מספר מחקרים עצביות הקשורות כגון neurodevelopment, מעגלים עצביים, קידוד מידע, הקשורים ניוון מוחיים, neuroregeneration. יתר על כן, השילוב שלו עם מודלים המתעוררים של האדם pluripotent המושרה בתאי גזע^15,16 יכול לפתוח אפיקים חדשים בפיתוח של טיפולים פוטנציאליים עבור מחלות אנושיות המשפיעות על מערכת העצבים.

המעבדה שלנו היא באמצעות פלטפורמה זו שילוב microelectrodes עם מיקרופלואידיקה (µEF) כדי להבין תהליכים עצביים ברמת סלולריים ורשת, שההשפעה שלהם פיזיו - ואת מערכת העצבים פיפטות. בהינתן ערך כזה פלטפורמה בתחום של מדעי המוח, המטרה של פרוטוקול זה היא כדי להדגים כיצד ליצור תרבות עצביים ממודר מעל המצע משולב אותי, כיצד תרבות נוירונים ב פלטפורמה זו וכיצד להקליט בהצלחה, לנתח ולפרש את התוצאות של ניסויים אלה. פרוטוקול זה בהחלט יגרום להעשרת ארגז הכלים ניסיוני עבור תרבויות עצביים במחקר של תקשורת עצבית.

Protocol

בכל ההליכים הכרוכים חיות בוצעו על פי האיחוד האירופי (EU) דירקטיבה 2010/63/האיחוד האירופי (משורבב פורטוגזית חקיקה על-ידי Decreto-Lei 113/2013). פרוטוקול נסיוני (0421/000 000 2017) אושרה על ידי ועדת האתיקה של שני פורטוגזית שהסמכות הרשמית על רווחת בעלי חיים וניסוי (Alimentação de Geral-מחפשת ה Veterinária - DGAV), של המוסד המארח.

1. הכנת תרבות תקשורת, פתרונות אחרים

הערה: להכין טרי פתרונות ציפוי ביום של השימוש בו. ניתן לאחסן את פתרונות ציפוי שאינם בשימוש ומדיה תרבות ב-20 ° C או 4 ° C כמפורט להלן.

1. הכינו 10 מיליליטר 0.05% (v/v) הפתרון עובד Poly(ethylene imine) (פיי).
   1. להכין 20 מ של 0.25% (w/v) פיי מניות פתרון על ידי המסת פיי מטוהר (ראה טבלה של חומרים) במים סטריליים.
   2. למהול 2 מ של 0.25% (w/v) פיי מניות פתרון 8 מ ל מים מזוקקים סטריליים. מערבבים היטב ולהשתמש. ניתן לאחסן פתרון שאינו בשימוש ב 4 º C.
2. להכין 1 מ"ל של פתרון laminin 5 µg/mL.
   1. לדלל 5 µL של 1 מ"ג/מ"ל laminin מניות פתרון µL 995 בינוני הבזליים (ראה טבלה של חומרים). מערבבים היטב ולהשתמש. פתרון שאינו בשימוש ניתן לאחסן קפוא ב-20 ° C עד 1-2 שבועות.
3. להכין 1 ליטר של תמיסת מלח מאוזנת של באגירה HEPES האנק (H-HBSS).
   1. להכין 1 מ' HEPES פתרון על ידי המסת 11.9 גר' אבקת HEPES 50 מ של מים הנדסה גנטית. להתאים את ה-pH ל- 7.2.
   2. להכין פתרון H-HBSS (ללא סידן ומגנזיום) על ידי המסת 5.33 מטרים מ מ אשלגן כלורי, מ"מ 0.44 אשלגן פוספט monobasic, מ מ 138 נתרן כלורי, 0.3 מ מ סודיום פוספט dibasic, גלוקוז 5.6 מ מ ב- 800 מ ל מים הנדסה גנטית.
   3. להוסיף 15 מ"ל של 1 מ' HEPES פתרון (הריכוז הסופי של 15 מ מ).
   4. להתאים את ה-pH ל 0.2-0.3 יחידות מתחת ה-pH הרצוי 7.4 באמצעות 1 N HCl או 1 N NaOH. מוסיפים מים הנדסה גנטית כדי להפוך את עוצמת הקול של הפתרון הסופי.
      הערה pH נוטה לעלות במהלך סינון.
   5. לחטא על-ידי סינון באמצעות מיקרומטר 0.22 נקבוביות קרום poly(ether sulfone) (פסי).
4. הכינו 10 מ"ל של H-HBSS המכיל 10% חום-לא פעיל סרום שור עוברית (hiFBS).
   1. למהול 1 מ"ל של hiFBS ב 9 מ ל H-HBSS. מערבבים היטב ולהשתמש. ניתן לאחסן פתרון שאינו בשימוש ב 4 מעלות צלזיוס למשך 3-4 שבועות.
5. להכין 5 מ של 1.5 mg/mL טריפסין פתרון.
   1. מיד לפני שימוש, להתמוסס 7.5 מ"ג של טריפסין ב 5 מ של H-HBSS. לחטא על-ידי סינון באמצעות מיקרומטר 0.22 נקבוביות PES קרום.
6. להכין 50 מ של מדיום שהושלם.
   1. צינור חרוטי 50 מ ל, לערבב mL 48.5 בינוני הבזליים (ראה טבלה של חומרים), 2% (v/v) תוספת של B-27, 0.5 מ מגלוטמין ו 1% עט/דלקת (10,000 פניצילין U/mL ו- 10,000 סטרפטומיצין µg/mL). ניתן לאחסן בינוני שהושלם ב 4 מעלות צלזיוס למשך 3-4 שבועות.

2. Microfluidic והכנת ההתקנים MEA

הערה: בצע את השלבים 2.1-2.11 ביום שלפני תא זריעה.

1. התקנים microfluidic נקיים כדי להסיר את ייצור ופסולת אחרת באמצעות הקלטת ויניל. לחץ בעדינות את הקלטת נגד המכשיר כדי להגיע בכל התחומים של המכשיר.
2. אוויר נקי-פלזמה כר הדשא במשך 3 דקות (0.3 mbar) כדי לנקות את השטח. ולעשות את זה יותר הידרופילית.
3. בקצרה להטביע microfluidic התקנים ב- 70% אתנול, לאפשר להם מילה נהדרת בתוך תא למינארי.
4. מניחים כל מאה מ מ 90 עקר פטרי ולחטא אותם באמצעות 15 דקות של חשיפה אור אולטרה סגול (UV).
5. מעיל MEA במרכז שטח הפנים על ידי המקננת עם 500 µL של 0.05% (v/v) פיי פתרון לפחות שעה ב 37 º C.
   הערה: כפי שתואר על ידי אחרים¹⁷, פיי ציפוי של לי תוצאות בתא פחות התקבצות מאשר באמצעות ציפוי poly(lysine).
6. האחות הפתרון ציפוי פיי מהמשטח MEA. ולשטוף אותי 4 x עם 1 מ"ל של סטרילי מים מזוקקים. יש להיזהר לא לגעת השטח MEA במהלך שטיפת צעדים כמו זו עלולה לגרום נזק האלקטרודות.
7. מונחה על ידי stereomicroscope בתוך תא למינארי, מרכז את השבב MEA ולהוסיף 1 מ"ל של מים סטריליים לאזור המרכזי של MEA.
8. מניחים את המכשיר microfluidic מעל פני השטח MEA.
9. בזהירות ליישר את microgrooves של המכשיר microfluidic עם רשת microelectrode של כר הדשא.
10. כאשר מיושרים כהלכה, בזהירות וארוקן את עודף המים בלי לגעת כר הדשא או המכשיר microfluidic.
11. דגירה של µEFs בין לילה ב 37 מעלות צלזיוס יבש ולאפשר המלא מצורף. כדי להקל על הקובץ המצורף, לחץ בעדינות את המכשיר microfluidic נגד כר הדשא.
    הערה: בצע את שלב 2.12 ביום של התא זריעה.
12. ברגע µEFs התייבשו לגמרי, לטעון את הבארות microfluidic עם µL 150 של 5 µg/mL laminin ציפוי פתרון, דגירה ב 37 מעלות צלזיוס במשך שעתיים לפחות לפני תא זריעה.
    הערה: בעת טעינת µEF עם פתרון laminin, ודא כי הפתרון ממלא את microgrooves. השתמש ואקום כדי להסיר את כל בועות האוויר שעשויים להיות מתנה בתוך microgrooves.

3. לגשת לנתיחה

1. להכין את האזור ניתוח להסרת העובר.
   1. לחטא משטח העבודה מכשירי הניתוח עם 70% אתנול.
      הערה: למרות הקרע הזה הוא לא הליך סטרילי, חיטוי מסייעת להפחית את הסיכון של זיהום.
   2. השתמש חיתול חד פעמיות נקי כדי להגביל את אזור הקרע ופרוס את מכשירי ניתוח להסרת העובר.
   3. להכין 4 צלחות פטרי 90 מ מ מלא עם H-HBSS קרים ומניחים על מגש עם קרח ליד אזור הקרע.
2. המתת חסד עכברוש Wistar בהריון-זמן E-18 על ידי שאיפת פחמן דו-חמצני (CO₂).
3. עם סיום ההליך, להסיר את החיה מן החדר₂ CO ואשר למוות על ידי שיטה המשני של המתת חסד, כגון דימום למוות.
4. במקום הצד הבטני בעלי חיים למעלה על החיתול חד פעמיות, לרסס את הבטן התחתונה עם 70% אתנול ולעשות, בעזרת מלקחיים, מספריים, U-צורה לחתוך דרך העור כדי לחשוף את הרחם.
5. בזהירות להסיר את העוברים מן הרחם על ידי חיתוך של כל רקמת ולמקם אותם באחת צלחות פטרי עם H קר-HBSS.
6. להסיר את כל העובר השק העוברי שלה, בעזרת מלקחיים, מספריים, לערוף את העובר.
7. להעביר את הראש embryo´s צלחת פטרי השני מלא עם H קר-HBSS.
8. חזור על הצעדים 3.6-3.7 כל העובר.
9. לנתח את קליפת המוח הקדם חזיתית.
   1. להעביר את הראש embryo´s של שליש צלחת פטרי.
   2. להשתמש זוג מלקחיים כדי לחשוף את המוח.
   3. להסיר את המוח שלה חלל, לכסות אותו. עם H קר-HBSS.
   4. אם היא קיימת, להסיר ולמחוק את הנורות הריח. קליפת המוח הקדם חזיתית לנתח ולהסיר את קרומי המוח.
   5. להעביר את שברי קליפת המוח הקדם חזיתית צלחת פטרי הרביעי מלא עם H קר-HBSS.
   6. חזור על השלבים 3.9.1 - 3.9.5 עבור כל העובר.

4. קורטיקלית נוירונים דיסוציאציה ותרבות על µEF

הערה: ההליכים הבאים בוצעו בתוך תא למינארי לאחר 15 דקות במחזוריות של עיקור UV. עובד שטח, כמו גם כל החומרים בתוך המנוע צריך להיות קודם לכן נקיים עם 70% אתנול

1. כפי שמתואר בשלב 1.5, לפזר את טריפסין בעבר משוקלל ב 5 מ של H-HBSS ולסנן את הפתרון.
2. לאסוף את השברים קליפת בעבר ביתר סך של 5 מ של H-HBSS. להעביר אותם צינור חרוטי סטרילי 15 מ"ל.
3. להוסיף 2.3 מ ל שזה עתה הוכנו 1.5 mg/mL טריפסין פתרון הצינור המכיל את שברי קליפת המוח.
4. לערבב את המתלים, דגירה ב 37 מעלות צלזיוס למשך 15 דקות (להתסיס בקצרה כל 5 דקות).
5. תפסיק עיכול רקמת ולהתנקות טריפסין.
   1. למחוק את תגובת שיקוע המכיל את טריפסין. הוסף 5 מ של H-HBSS המכיל 10% hiFBS כדי להשבית את טריפסין הנותרים; בעדינות להתסיס.
   2. תן שברי קליפת להתיישב ולאחר מכן למחוק את תגובת שיקוע.
   3. הוסף 5 מ של H-HBSS כדי להסיר את שאריות hiFBS. תן שברי קליפת להתיישב ולמחוק את תגובת שיקוע.
   4. לשטוף שוב את שברי קליפת עם 5 מ של H-HBSS.
   5. תן שברי קליפת להתיישב ולמחוק את תגובת שיקוע. הוסף 5 מ של מדיום עצביים שהושלם.
6. מכנית מביצועם שברי קליפת עם פיפטה serologic 5 מ"ל מאת לאט pipetting למעלה ולמטה במשך 10 - 15 פעמים. אם יש צורך, חזור על הפעולות באמצעות פיפטה של קוטר קטן עד התליה תא הופכים הומוגנית.
7. למחוק את הרקמות undissociated שנותרו על-ידי סינון האבוס התליה תא מסננת תא 40 מיקרומטר.
8. לספור התאים קיימא ולקבוע את צפיפות התאים.
   1. ב- microtube, להוסיף 20 µL של 0.4% (w/v) Trypan Blue כדי השעיה תא µL 20. מערבבים היטב כדי homogenate את הפתרון ולהעביר 10 µL נויבאואר ספירת קאמרית.
   2. לספור התאים קיימא ולקבוע תא צפיפות התאים קיימא.
9. להתאים את צפיפות התאים ל- 3.6 x 10⁷ תאים/מ ל (אם יש צורך, צנטריפוגה תא השעיה).
10. מיד לפני תא זריעה, הסר laminin ציפוי כל בארות µEF. פיפטה µL 50 של בינוני שהושלם מכל קידוח של תא עצב µEF.
11. זרע µL 5 תא השעיה בתוך התא somal µEF. דגירה ב 37 מעלות צלזיוס לשעה כדי לאפשר תאים המצורף המצע.
12. בעדינות למלא כל אחד טוב של µEF בינונית שהושלם ומחוממת. להעביר את µEF חממה מעשיר ב 37 מעלות צלזיוס שסופק עם 5% CO₂.
    הערה: כדי למנוע אידוי מהיר תרבות בינוני, במקום של microtube נפתח מלא מים בתוך הפטרי נושאת את µEF.
13. לשמור על תרבויות עבור התקופה הנדרשת על-ידי החלפת 50% של תרבות בינוני בכל יום שני עד שלישי של תרבות.
    הערה: לאחר הניסויים, מיקרופלואידיקה יכולה להיות מנותקת אותי במועט את µEF במים למשך הלילה. אם יש צורך, מקלפים בעדינות את מיקרופלואידיקה בעזרת מלקחיים. ניתן לנקות אותי על ידי דגירה לילה עם חומר ניקוי מסחרי אנזימטי 1% (v/v) (ראה טבלה של חומרים).

5. הקלטה ספונטנית פעילות. עצבית

הערה: תא עצב בקליפת המוח העוברי תרבויות על אותי להפגין פעילות ספונטנית בדרך כלל ברגע 7 ימים במבחנה (DIV), אך לוקח 2-3 שבועות (DIV 14-21) ועד מבוגרים שהפגינו יציבה פעילות. זה תלוי הנסיין להחליט מתי להתחיל את מדידות אלקטרופיזיולוגיות בהתבסס על מטרות המחקר. ב פרוטוקול זה, ההקלטה של פעילות. עצבית של µEF מומחש באמצעות מערכת הקלטה מסחרית (ראה טבלה של חומרים לפרטים חומרה), עם מודול חימום משולב. עבור ביצוע הקלטות, השתמשנו תוכנה זמינה בחופשיות (ראה טבלה של חומרים לפרטים תוכנה).

1. הפעל את כר הדשא הקלטה המערכת לבין בקר טמפרטורה ולאפשר את צלחת הבסיס מחוממת של מגבר קדם להגיע 37 מעלות צלזיוס.
   הערה: עבור הקלטות לטווח ארוך (> 30 דקות בכל פעם) אחד צריך גם מערכת שומר על אווירה₂ CO.
2. מניחים את µEF על מגבר קדם (headstage).
   הערה: ודא כי השבב MEA מיושר כראוי עם מספר האסמכתא העליונה לקצה הימני. השבב MEA שנשתמש rotationally סימטריים, אבל יישור זה תואם לתקן את הכיוון של פריסת ה-pin של האלקטרודות והתגובה של מזהי חומרה.
3. סגור, להיצמד אליו את המכסה מגבר קדם.
4. כדי להקליט, לפתוח את תוכנת הצריבה ולהגדיר את הפרמטרים הקלטה והנתיב של הזרמים נתוני ההקלטות (עיין במדריך התוכנה לקבלת פרטים על אופן הגדרת ערכת הקלטה).
   הערה: רכישה, בקצב דגימה של-20 קילו-הרץ היא בדרך כלל מספיק עבור מרבית היישומים. תדר דגימה גבוה יותר, מומלץ אם ספייק תזמונים נדרש דיוק רב יותר. אם אחד עומד רק קוצים הרשומה, להגדיר מסנן מעבר גבוה 300 הרץ, אשר להחליש את הרכיבים בתדירות נמוכה יותר של האות. אם נתונים גולמיים ומסוננות נרשמים בו זמנית, זה יהיה להגדיל באופן משמעותי את גודל הקובץ נתונים. . זה תמיד אפשר לעשות סינון מקוון של הנתונים הגולמיים. כדי להפחית את נתוני גודל קובץ אחד יכול גם להגביל microelectrodes שממנו לרשומה (למשל, רק microelectrodes בתוך microgrooves).
5. לחץ על להתחיל DAQ להתחיל קירור והקפאה. בדוק אם התצוגה מראה עקבות ריצה של פעילות, התחל הקלטה.
   הערה: רמת הרעש הוא בדרך כלל מעט גבוה יותר. microelectrodes המתאים microgrooves. אם רמת רעש גבוהה מדי (משרעת השיא אל שיא > 50 µV) או לא יציב, מספר microelectrodes, זה יכול להיות בגלל עפר הפרעה איש קשר טוב pin-pad. בדרך כלל לפתור בעיה זו על-ידי ניקוי בעדינות את רפידות קשר MEA וסיכות מגבר קדם בעזרת ספוגית כותנה לחלח עם 70% אתנול.
6. פתח את הקובץ המוקלט בתוכנת ניתוח (ראה טבלה של חומרים) כדי לחקור במהירות את הנתונים.

6. ניתוח נתונים

הערה: השלבים הבאים מראים כיצד להשתמש בתוכנה µSpikeHunter, חישובית כלי שפותח במעבדה של הלומדים (זמינה בחופשיות על פי בקשה דוא ל pauloaguiar@ineb.up.pt), כדי לנתח נתונים הקליט עם µEF. ממשק משתמש גרפי (איור 2) משמש כדי לטעון את הנתונים, לזהות גלים דקר כציוד, לקבוע את הכיוון שלהם (anterograde או רטרוגרדית) מעריכים הפצת המהירויות. µSpikeHunter הוא תואם HDF5 קבצים שנוצר מתוך הקלטות שהושג באמצעות מערכות MEA2100-משפחה, אשר יכול לשמש בשילוב עם 60 - 120-, 256-אלקטרודה אותי. ההקלטות תוך שימוש רב ערוצית הנסיין ניתן להמיר בקלות את הקבצים HDF5 באמצעות התוכנה זמינה בחופשיות (ראה טבלה של חומרים).

1. לחץ על עיון כדי לבחור את קובץ ההקלטה. לאחר מכן, לחץ על הלחצן ' נתוני קובץ ' כדי לפרט את קצב הדגימה, משך ההקלטה, כמו גם רשימה של הזרמים נתוני ההקלטות (למשל, נתונים גולמיים, נתונים מסוננים).
   הערה: עבור הפצת האמת מהירות אומדנים, מומלץ לבחור את זרם הנתונים הגולמיים לניתוח.
2. בחר microelectrodes (שורה אחת או עמודה המשויך microgroove) לניתוח והגדר את הערך סף גילוי ספייק (שלב חיובי או שלילי) ב 6 x סטיית התקן (SD) של הרעש האות. לחץ על קריאת נתונים כדי להחיל את גלאי האירוע ולקבל את רצפי הפצת שזוהה.
   הערה: אם מתקיימים הקריטריונים, רשימת רצפי הפצת שזוהו ימלא את לוח ניתוח. המשתמש יכול ואז להציג ולהידבר עם מספר כלים לניתוח רצף הפצת, כולל מתח עקבות, הבין-microelectrode קרוס-מתאמים, הפצת יחיד-רצף המהירויות, kymograph של כלי השמעת השמע. למרות ההערכה מהירות התפשטות ניתן להשיג לכל זוג של microelectrodes או כממוצע של האומדנים עבור כל הזוגות, הערכה זו הוא אמין יותר אם הזוג הרחוק ביותר נבחרה.
3. חזור על השלב הקודם עבור ערכות microelectrode עניין. בכל פעם לחץ על לשמור את כל האירועים כדי לחסוך את הזמן ואת משרעת של הקוצים (בכל אחד microelectrodes) על כל רצפי הפצת מזוהה לקובץ CSV.
4. לייבא את קבצי ה-CSV סביבות ניתוח נתונים לצורך ניתוח נוסף של דפוסי הפעילות של התרבות (קצב ירי, למשל , מרווחי זמן בין ספייק).

Results

באמצעות פרוטוקול המתואר כאן, E-18 החולדה הנוירונים קורטיקלית נזרע על µEF מסוגלים לפתח ולהישאר בריאים בתנאים אלו תרבות עבור מעל חודש. ברגע 3 עד 5 ימים בתרבות, נוירונים בקליפת המוח לגדול אקסונים שלהם דרך microgrooves לכיוון תא עצב של µEF (איור 1). לאחר 15 ימים בתרבות, נוירונים בקליפת המוח תרבותי על µEF צפויים להפגין רמות קבועה של פעילות וצפויה התפשטות של פוטנציאל פעולה לאורך microgrooves. בתרבויות עבר (> 14 DIV) נוטים להיות נשלט על ידי מתפוצץ פעילות כמו קונב...

Discussion

פרוטוקול המוצגת כאן מראה כיצד להרכיב את µEF, המורכב מכשיר microfluidic, לי עם עיצובים זמין מסחרית רגילה, וכיצד לנתח את הנתונים המוקלט.

בעת תכנון ניסוי, חוקרים יש לקחת בחשבון כי המודל במבחנה הוא מוגבל על ידי הרשת MEA קבוע, אשר מאלץ את הסדרי microgroove. השימוש של microfluidic מסוים או עיצוב MEA תיקבע בהתאם לצרכים הספציפיים ניסיוני אבל, באופן כללי, הפעולות בהליך צריך להחיל על תצורות שונות µEF.

החלטה קריטית להתבצע לפני הרכבה µEF היא בכוונת המשתמש לשימוש חוזר ב...

Materials

List of materials used in this article

Name	Company	Catalog Number	Comments
B-27 Suplement (50X)	Thermo Fisher Scientific	LTI17504-044
פולי מסועף (אתילן אימין) (PEI), 25 kDa	Sigma-Aldrich	408727	טיהור PEI מסועף על ידי דיאליזה באמצעות ממברנה חתוכה של 2.5 kDa למשך 3 ימים ב-4° C כנגד תמיסת HCl של 5 מ"מ (מתחדשת מדי יום). יש לייבש בהקפאה את ה-PEI המטוהר.
מסננת תאים (40 ומיקרו; m)	Falcon	352340
מיקרו-צינורות חרוטיים (1.5 מ"ל)	VWR	211-0015
חיתול חד פעמי, 60x40 ס"מ	Bastos Viegas SA	455-019
מלקחיים Dumont #5, ישר	כלי מדע עדינים	91150-20
מלקחיים Dumont #5/45	כלי מדע עדינים	11251-35
מלקחיים Dumont #7,	כלים מדעיים עדינים מעוקלים	91197-00
סרום בקר עוברי מומת בחום פרימיום	Biowest	S181BH-500ML
למינין מבית Engelbreth-Holm-Swarm	Sigma-Aldrich	L2020-1MG	הכן תמיסת מלאי למינין ב-1 מ"ג/מ"ל על ידי המסת האבקה בנפח המתאים של מדיום ללא תוסף. אחסן תמיסת למינין בטמפרטורה של -20 מעלות; C בכמויות קטנות (20 ומיקרו; L) כדי למנוע מחזורי הקפאה/הפשרה חוזרים ונשנים.
L-גלוטמין 200mM	Thermo Fisher Scientific	LTID25030-024
Neubauer תא ספירה משופר (המוציטומטר)	Marienfeld	630010
מדיום נוירובזאלי (1X)	Thermo Fisher Scientific	21103-049	מדיום בסיסי המשמש לתרביות עצביות
PDMS מכשירים מיקרופלואידיים	לא ישים	לא ישים	מורכב משני תאי זריעה של תאים המחוברים ביניהם על ידי 20 מיקרו-חריצים עם 450 μ אורך וזמנים; 10 μ גובה וזמנים; 14 μ מידות רוחב M ומופרדות על ידי 86 ומיקרו; m (סה"כ מרווח של 100 μ m).
תמיסת פניצילין-סטרפטומיצין (P/S) (100X)	Biowest	L0022-100
יחידת מסנן מזרק PES (Ø 30 מ"מ), 0.22 ומיקרו; מ		מפוליפרופילן 1730012
, 15 מ"ל	Thermo Fisher Scientific	07-200-886
צינורות חרוטיים מפוליפרופילן, 50 מ"ל	Thermo Fisher Scientific	05-539-13
צינורות סרולוגיים מפוליסטירן דיספוזבל, 10 מ"ל	תרמו פישר סיינטיפיק	1367811D
צנרת סרולוגית פוליסטירן דיספוזבל, 5 מ"ל	Thermo Fisher Scientific	1367811D
סטנדרטי קרום תאית מחודש (2 kDa)	מעבדות ספקטרום	132107
מספריים כירורגיים סטנדרטיים	כלים מדעיים עדינים	91401-14
MEAs מישוריים משולבי מצע (256 מיקרואלקטרודות)	מערכות רב-ערוציות	256MEA100/30iR-ITO	252 אלקטרודות הקלטה טיטניום ניטריד (TiN) ו-4 אלקטרודות ייחוס פנימיות המאורגנות ברשת מרובעת של 16 על 16. כל אלקטרודת הקלטה היא 30 ומיקרו; m בקוטר ובמרווח של 100 &m.
קצה מזרק, 10 מ"ל	Terumo Europe	5100-X00V0
קצה מזרק נעילה, 50 מ"ל	Terumo Europe	8300006682
Terg-A-Zyme	Sigma-Aldrich	Z273287	חומר ניקוי אבקתי פעיל אנזימים המשמש לניקוי MEAs
לוחות תרבית רקמה, 35 מ"מ	StemCell Technologies	27150
צלחות תרבית רקמה, 90 מ"מ	תמיסת פרילאבו	900095
טריפן כחול (0.4%)	סיגמא-אולדריץ'	T8154
טריפסין (1:250)	תרמו פישר מדעי	27250018
סרט ויניל 471	3M	B40071909