פרוטוקול זה מתאר שיטות לחקר אירועים המונעים על ידי FcγRIIIa בתאי NK בתיווך נוגדנים. טכניקות אלה מאפשרות הערכה של מנגנוני פעולה פוטנציאליים של נוגדנים טיפוליים, אשר מוצע להיות ADCC1,2. באופן ספציפי, שיטות אלה מספקות גמישות בחקר מסלולי איתות מולקולריים ותהליכים תאיים האחראים על ADCC. הם גם מאפשרים התבוננות של פונקציות משפיעות אחרות, כגון ייצור chemokine וציטוקינים. בנוסף, שיטות אלה מאפשרות זיהוי של סמנים ביולוגיים פוטנציאליים ומולקולות שעשויות להיות ממוקדות כדי לווסת את ADCC.
הבסיס לפרוטוקול זה הוא גירוי מלאכותי של תאי NK באמצעות FcγRIIIa עם נוגדנים בהיעדר תאי יעד. תאי יעד הקשורים לנוגדנים משמשים בדרך כלל לקידום הקישור הצולב של קולטני Fc כדי ליצור פלטפורמה המניעה אפקטים איתות ובמורד הזרם. במקום זאת, crosslinking מתבצע באמצעות נוגדן שרשרת אור אנטי אנושית ב- assay זה, תוך עקיפת הצורך בתאי יעד כדי לעורר את תאי NK. ללא תאי יעד, ניתן לייחס את התוצאות והתצפיות ישירות לתאי ה- NK, בהנחה שתהליך הטיהור מוצלח.
חשוב לציין, שימוש בנוגדן שרשרת אור אנטי אנושי כדי לחצות את הנוגדן אינו מפריע לזיקה המחייבת של חלק Fc עבור FcγRIIIa, אינטראקציה המכתיבה את עוצמתהתגובה 10,11,12,13. ואכן, מחקרים הראו כי נוגדנים אפוקוסילציה להגדיל ADCC בשל הזיקה המוגברת שלהם FcγRIIIa10,11,12,13. מחקרים מאוחרים יותר הראו כי זיקה מוגברת זו אינה מושפעת משרשרת האור האנטי-אנושית תחליף נוגדנים משני וניתן להשתמש בה כדי ללמוד את הבסיס ל- ADCC8מוגבר . כדי להבטיח שתא ה-NK מגורה באמצעות קישור צולב של הנוגדן, יש לכלול שני פקדים שליליים: 1) נוגדן טיפולי רק ללא נוגדן המשני של שרשרת האור האנטי-אנושית, ו-2) נוגדן שרשרת האור המשני נגד בני אדם בלבד. בשני המקרים, אין ליצור פונקציית איתות או אפקט.
שיטה זו מספקת גם גמישות לחקר ההשפעות של נוגדנים טיפוליים על מעכבי מולקולות קטנות. ניתן להוסיף את המדכא לפני הצלבה עם הנוגדן המשני, כך שלמשוכב יש זמן לתקוף את מטרתו. עם זאת, מחקרים צריכים להתבצע כדי לקבוע את הזמן האופטימלי של טיפול מקדים מעכב; לכן, המדכא יש השפעה מקסימלית על גירוי. עם זאת, החוקרים עשויים גם לבחור ללמוד את ההשפעות של מעכב לאחר גירוי. במקרה זה, המעכב עשוי להתווסף לאחר crosslinking כדי ללמוד כיצד הוא משפיע על אותות ותהליכים שכבר נוצרו. יחד, השיטה המתוארת כאן מספקת גמישות מקסימלית בחקר ההשפעות הקומבינטוריות של מעכבי מולקולות קטנות שונות עם נוגדנים טיפוליים.
כאמור, מגוון של קריאות ניתן לבצע לאחר גירוי. סופג מערבי יכול להתבצע כדי ללמוד איתות באמצעות SDS-PAGE ומערכות העברת ממברנה מספקים שונים. באופן דומה, ניתן להעריך ביטוי גנים גם בשיטות מיצוי RNA שונות, ריאגנטים של שעתוק הפוך וכלי ביטוי גנים. לבסוף, כתמים עבור חלבון תאי או חוץ תאי יכול להתבצע גם שבו דגימות ניתן לנתח באמצעות ציטומטרים זרימה שונים. עבור כתמי ציטוקינים תאיים ו- CD107a (שלב 3.4, אשר ניתן להעריך בו זמנית), יש להוסיף מונסין ו / או ברפלדין A כדי למקסם אותות. השתמשנו בפלטפורמות שונות עבור כל מטרה ניסיונית ועדיין ראינו תוצאות דומות. לכן, ניתן להשלים את השיטה עם ריאגנטים שונים, פלטפורמות, מכשירים, בהתאם למחקר.
זמן הקישור המקושר לגירוי יהיה תלוי במטרה של המחקר. אם מחקרי איתות רצויים, זמן גירוי הצלבה טיפוסי הוא בין 2 דקות ל -10 דקות. pAKT, pPRAS40 ו pERK1/2 פסגות הצטברות ב 2 דקות ונעלם לאחר 10 דקות8,9. עבור מחקרים פונקציונליים (כלומר, אלה מעורבים ייצור chemokine / ציטוקינים), תאים חייב להיות מגורה לפחות 30 דקות, בהתאם ניתוח9. ניתוח ביטוי גנים גם דורש בדרך כלל 30 דקות של גירוי9. יש לנקוט זהירות בעת שימוש בביטוי גנים RANTES כהקראה, כמו ייצור MRNA RANTES אינו תלוי בהפעלה תעתיק שכן הוא כבר מאוחסן בתאים לתרגום מהיר ושחרור של חלבון על גירוי25. Degranulation, לעומת זאת, דורש לפחות 3 שעות של גירוי. למרות תצפיות כלליות אלה, החוקרים צריכים לבצע מחקרים קינטיים כדי לקבוע את זמן הגירוי האופטימלי עבור מולקולות מסוימות של עניין.
באופן דומה, חוקרים צריכים titrate נוגדן של עניין כדי לקבוע את הריכוז האופטימלי כי נוגדנים עם פרטים שונים להיקשר FcγRIIIa עם זיקות שונות, גם אם הם מאותו איזוטיפ. לדוגמה, rituximab ו trastuzumab הם שניהם איזוטיפ IgG1 אבל trastuzumab נקשר חזק יותר פולימורפיזם valine של FcγRIIIa מאשר rituximab26,27. הבדל זה זיקה עלול להוביל להבדלים תפקודיים, כגון degranulation, כפי שנצפו במחקרים שפורסמו8.
קביעת הריכוז האופטימלי חשובה גם בגלל הזיקה הנמוכה שיש לחלק ה- Fc של הנוגדן עבור FcγRIIIa. זה עלול לגרום לשטוף את הנוגדן מאז הפרוטוקול כולל שטיפה צעדים לאחר כריכה של הנוגדן לקולטן Fc. הדבר עלול להוביל לחוסר רגישות בבחונים, כפי שעולה מהאחוז הנמוך של תאים חיוביים CD107a לאחר גירוי (איור 5). עם זאת, קביעת הריכוז האופטימלי צריכה לספק ביטחון כי התוצאות אינן נובעות מחוסר רגישות. בנוסף, התאים מופעלים בבירור בבדיקות הביוכימיות והתפקודיות המשתמשות בתאים בתפזורת לעומת קריאות תאים בודדים (איור 2, איור 3, איור 6).
הפרוטוקול מוגבל גם שכן הוא אינו מחקה לחלוטין את המתרחש מבחינה פיזיולוגית. נוגדן K האנטי-אנושי המשני המשמש הוא לחקות את הקישורים הצולבים הנוצרים על ידי אנטיגן היעד לידי ביטוי בתאים. כאן, כמות רוויה של נוגדן משני מתווספת כדי ליצור את התגובה המרבית. עם זאת, תאי יעד נפרדים יבטאו רמות שונות של אנטיגן, אשר ישפיעו על קישור צולב ותגובה. נכון לעכשיו, פלטפורמה זו אינה ממוטבת כדי לחקות את ההשפעות של רמות ביטוי אנטיגן שונות.
גורם נוסף שיש לקחת בחשבון בעת ביצוע ניסויים אלה הוא שונות בין תורם לתורם בשל רקע גנטי שונה והיסטוריה חיסונית בקרב אנשים. לכן, יש לנקוט זהירות בעת השוואת תגובות תאי NK מתורמים שונים על פני אותן עבירות. באופן דומה, רק מסקנות כלליות צריכות להיעשות כאשר נעשה שימוש בתורמים שונים.
בסך הכל, השיטה המתוארת היא פלטפורמת גירוי פשוטה וגמישה לחקר אירועים מונעי נוגדנים FcγRIIIa בתאי NK. זה שימש כדי להבין טוב יותר את הבסיס עבור ADCC מוגבר ויעילות נצפתה עם נוגדנים אפוקוסילציה8. שיטה זו הועסקה גם במחקר המשלב נוגדנים טיפוליים ומעכבי מולקולות קטנות PI3K9. בנוסף, מנגנון לא ידוע בעבר לייצור chemokine וציטוקינים מוסדר על ידי pS6 זוהה9. לכן, מחקרים עתידיים באמצעות פלטפורמת איתות מלאכותית זו יכולים לרהור עוד יותר מנגנוני רגולציה עבור פונקציות אפקט מונע על ידי FcγRIIIa. זה עשוי גם לזהות מולקולות חדשות חשובות עבור מנגנונים אלה, כמו גם תפקידים חדשים עבור מולקולות ידועות.