הצעד הראשון לזיהוי טיפולים יעילים בסרטן הוא הבחירה של סיסוקסיות cytotoxicity חזקה, משוחדת שניתן להשתמש בה כדי לבחון את ההשפעה של הטיפול. בחירה נפוצה לניסויים בתפוקה נמוכה היא הדרה של צבע כחול trypan מתאי חיים. שיטה זו מועדפת כי היא מאפשרת שיטה יחסית משוחדת לכמת את הישרדות התא. טריפאן כחול מפזר באופן פסיבי לתוך תאים שהמברנות שלהם בסכנה, אבל זה חסום ביעילות מלהיכנס לתאים בריאים1. המנה של התאים החיים ואת התאים הכולל מייצג את הכדאיות אחוז, אשר מצביע על היעילות של הטיפול. החיסרון המשמעותי ביותר של ה-trypan Blue assay הוא שהוא אינו מתאים באופן גרוע לתודולוגיות בתפוקה גבוהה. יש לו יחס אות לרעש נמוך יחסית וכתמים ממושכים יכולים לגרום לחפצים בשל הכתמה של תאים קיימא. כתוצאה מכך, הדרה כחול trypan הוא בדרך כלל, אבל לא תמיד2, ירד לספירה ידנית. זה עושה את זה איטי מדי ומציג את האפשרות החזקה של הטיה בשל שיפוט סובייקטיבי של החוקר (אלא אם כן ספירות מסנוור או עצמאי משמשים, אשר להפחית עוד יותר את תפוקת המעבדה). באופן כללי, התפוקה של תפוקה זו אינה מספיקה לגילוי סמים מודרני.
הכדאיות, שבדרך כלל יש לה תפוקה הרבה יותר גבוהה, מאפשרת לחוקרים לעקוף מגבלה זו, אך מגיעים עם אזהרות משמעותיות (ראה טבלה 1). שיטות אלה בדרך כלל נופלות לשתי קבוצות. קבוצה אחת מורכבת מאסרים צבעוניים המבוססים על הפונקציה של אנזימי רדוקס תאיים. מצעים חסרי צבע או שאינם פלורסנט מומרים למוצרים מלאי חיים שניתן לכמת באמצעות ספקטרופוטומטר. דוגמאות קלאסיות כוללות מלחי טרטאזוליום (MTT, WST-1, XTT וכו') ורסזורין. קטגוריה זו כוללת גם תסדירות זוהרות המשתמשות בלוציפרין כדי להעריך את רמת ה-ATP. לנתונים מסוג זה יש את המגבלה הבסיסית שהם מודדים את חילוף החומרים התאי, שהוא לא יכולת הכדאיות הסלולרית כשעצמה. זה די נפוץ עבור תאים להיות התרכך בתנאים שליליים, אבל עדיין לשמור על היכולת לחלק3,4,5. לדוגמה, תאי גזע סרטניים הם לעתים קרובות יחסית מטבוליתהרהיות 6,7,8,9, והם צפויים להיות קשה לומר באמצעות טכניקות אלה. יעילות של טיפולים המים נזק לתפקוד המיטוכונדריאלי, כגון רוב המיטוקנים, גם צפוי להיות מוערך יתר על המידה באופן משמעותי.
מתודולוגיה חלופית ממנפת את המאפיינים הכימיים של חומרים שונים המאפשרים להם לחצות או לא לחצות קרום ביולוגי. דוגמה אחת היא כתמים גרעיניים כגון SYTOX או פרודיד פרופידיום (PI). קטגוריה זו כוללת גם מאמרים הדומים בקונספט אך שונים בתפקודם, כגון ההירוגנאז של הקטט (LDH), המודד את שחרורו של LDH לתוך המילייה החוץ-תאי כאינדיקטור של נמק תאי (איור 1, טבלה 1). ההתאסות האלה מסוגלות יותר להבחין בין תאים לא פעילים מבחינה מטבולית לבין תאים מתים.
| תסה/צבע | זוהו סוגים של מוות בתאים | ציוד נחוץ | תכונות עיקריות |
| MTT, CKK-8, אלמר בלו (רזורין) | אפופטוזיס/נמק | ספקטרופוטומטר | זול, מהיר; תסה נקודת קצה; תלוי בפעילות של אנזימים (מיטוכונדריאלי באופן בלעדי במקרה של MTT) ואינו מפלה בין מצבי מוות של תאים1,10
|
| שחרור LDH | נמק | ספקטרופוטומטר | מהיר, ללא תלות בפעילות אנזימים מיטוכונדריאליים; יקר לבדיקות בתפוקה גבוהה; מזהה תאים נמקים עם קרום פלזמה מופשר11,12
|
| כחול טריפאן (ש"ב) | אפופטוזיס/נמק | מיקרוסקופ | תא מושלם; אינו מפלה בין מצבי מוות של תאים; עבודה ולא מתאים להקרנה בתפוקה גבוהה; קשה יותר לשימוש עם תאים נדבקים; נוטה לשיפוט סובייקטיבי של המשתמש, אך נחשב לשיטת מדידת הכדאיות הסטנדרטית של התא13
|
| תפוז ים עצין (AO) | אפופטוזיס/נמק/ | מיקרוסקופ פלואורסצי | צבע חומצה גרעין עם תכונות ספקטרליות ייחודיות, יכול להבחין בין אפופטוזיס ונמק/נמק14
|
| נקרופטוזיס (נמק) |
| הוצ'סט 33342, DAPI | אפופטוזיס | מיקרוסקופ פלואורסציטי או ציטומטר זרימה | חדיר לתא; לא הולם בכוחות עצמו כדי לפקח על מוות תאים; שימושי להכתמה ב- co; יכול לשמש כדי להעריך עיסוק כרומטין ופיצול גרעין אפופטוזיס מוקדם; ניתן לזווג עם פרודיד פרופידיום להבחין אפופטוזיס מן הנמק15,16
|
| פרופידיום לודיד(פי אי) | אפופטוזיס/נמק מאוחר | מיקרוסקופ פלואורסציטי או ציטומטר זרימה | מנטרל תאי מושלם; מזהה הן אפופטוזיס מאוחר והן מצב נמק של מוות תא17. רעיל וחמלי לאחר דגירה ארוכה פעמים18
|
שולחן 1 . רשימת ההתארות של ציטו-אקסיות. Cytotoxicity assays, שחלקם שימשו במחקר זה, המפורטים יחד עם התיאור הקצר של התכונות העיקריות שלהם.
מחקרים שנעשו לאחרונה הראו כי חילוף החומרים המיטוכונדריאלי משתנה בכמהסוגי סרטן 19,20,21,22,23,24,25. לדוגמה, לוקמיה מיאלואידית חריפה (AML) הוצגו כדי להגן על המסה המיטוכונדריאלית שלהם, תוכן mtDNA, ונשימה מיטוכונדריאלית כדי לענות עלדרישות האנרגיה שלהם 19,26,27. מצד שני, כמה גידולים מוצקים מאופיינים בתפקוד מיטוכונדריאלי, או ליתר דיוק "תכנות מחדש חילוף חומרים", כגון downregulation של חלבונים מיטוכונדריאלי מעורב OXPHOS או ירידה בתכנים mtDNA, כי היה קשור פולשניות גידול, פוטנציאל גרורתי והתנגדות לתרופות מעוררות אפופטוזיס28,29. יתר על כן, לאחרונה, יש כבר עניין מוגבר באמצעות תרכובות מגוונות מכנית המשפיעים על תפקוד המיטוכונדריאלי (נקרא בדרך כללמיטוקאן 30),כטיפוליו פוטנציאליים עבור סוגי סרטן מסוימים. תרופות אלה מתמקדות סינתזה ATP, DNA מיטוכונדריאלי, OXPHOS, ו- ROS ייצור, כמו גם פרו אפופטוטי ואנטי אפופטוטי חלבונים הקשורים המיטוכונדריה30,31. מספר מחקרים הראו כי גישה זו יש הבטחהמשמעותית 19,32,33,34. עם זאת, סטיות מטבוליות אלה בביולוגיה של תאים סרטניים או טיפולים פילוח מיטוכונדריה עשוי להשפיע באופן משמעותי על הכדאיות המקובלת המבוססת על פונקציונליות מיטוכונדריאלית.
כאן, פרוטוקול ממוטב לתגרה גרעינית דיפרנציאלית מתואר. הפרוטוקול מאפשר קביעה מהירה ומדויקת של רעילות ציטוקוקסיות של מיטוקנים או השילובים שלהם עם תרכובות אחרות. Hoechst 33342 הוא צבע גרעיני חדיר לתא כי בקלות חוצה קרום התא להכתים DNA, המאפשר את ספירת התא הכוללת כדי להשיג. על ידי כתמים שותף עם PI, אשר רק נכנס הגרעין של תאים מתים, את חלקם של חיים (Hoechst בלבד) ומת (מוכתם בשניהם) תאים ניתן לקבוע במדויק. פרוטוקול זה מחדד את assayשפורסם 35 על ידי הוספת שלב אופטימיזציה של ריכוז הצבע (על ידי הצלבת תוצאות עם שיטת טריפאן כחול orthogonal) וצנטריפוגציה של הצלחת לפני הדמיה. מאז קווי תא רבים הם חצי דבק או מושעה, צנטריפוגציה מגדילה את חלקם של תאים התמונה ומשפר מאוד את הדיוק. ל-assay יש מספר יתרונות, כולל כתמים אלה אינם דורשים הסרת מדיה או כביסה. תערובת הצבע גם זולה, קלה להכנה ותואם למערכות צנרת רב-ערוציות/רובוטיות.
לאחר תאים כבר מוכתם, הם תמונה עם מיקרוסקופ אוטומטי. זה יש את היתרון הנוסף של יצירת רשומה קבועה של התמונות שניתן לנתח מחדש מאוחר יותר ואת ההשפעות של תרכובות מסוימות ניתן להעריך מחדש על ידי בדיקה חזותית של תמונות שנתפסו. לאחר שהושגו תמונות, ניתן לספור תאים באופן ידני או באמצעות כל אחת מחבילות תוכנה שונות, כולל הן בחינם (למשל, ImageJ, CellProfiler וכו') ותוכנה מסחרית (לדוגמה, Metamorph, Gen5 וכו'). ספירת תאים אוטומטית עדיפה בדרך כלל מאחר שצינורות ספירת תאים אוטומטיים שפותחו כראוי מדויקים יותר ומוטה פחות מספירת תאים ידנית. הם גם מתעלמים בצורה יעילה יותר מפסולת תאים או ממתחמים לא מסיסים. פיתוח של צינורות אלה הוא בדרך כלל פשוט והוא פשוט על ידי היעילות של הכתמים בשימוש. הפלט הוא כמותי מאחר שמספר התאים המתים בפועל מחושב באופן אוטומטי ביחס למספר תא כולל, וניתן להחיל ספי סף שונים כדי להגדיל או להקטין את המחרוזת שלזיהוי 35. לנוחיותכם, נכללים פרמטרים ממוטבים לספירת תאים באמצעות Gen5 v. 3.00 תואם תוכנת Cytation 5 Cell Imaging קורא מרובה מצבים.