זיהומים בדרכי השתן (UTI) מטילים נטל בריאותי משמעותי ברחבי העולם, ומשפיעים על איכות חייהם של מיליוני אנשים מדי שנה, במיוחד נשיםבנות 1. Escherichia coli אורופתוגני (UPEC) הם הגורם השכיח ביותר ל- UTI1. חולים רבים (כ-20-30%) המפתחים UTI יחוו UTI חוזר (rUTI) תוך 6 חודשים למרות אישור בתיווךאנטיביוטי של הזיהום הראשוני 2. למרבה הצער, עד 5% מהנשים לפני גיל המעבר סובלות מ-3 rUTI או יותר בכל שנה 3,4. אפיזודות עוקבות של rUTI יכולות להיגרם על ידי התמדה של אותו זן UPEC ממקרה המדד 5,6,7,8. נתונים מדגימות אנושיות וממודלים של עכברים מצביעים על כך ש-rUTI באותו זן יכול להיגרם על-ידי UPEC השוכנת בתוך מאגרים שקטים בשלפוחית השתן. בבני אדם, UPEC זוהו בתאי אפיתל ובביופסיות של שלפוחית השתן של חולים עם UTI 9,10,11,12,13. מחקרים בעכברי C57BL/6 הראו כי זנים מסוימים של UPEC יכולים להקים מאגרים תוך-תאיים תוך-תאיים בשלפוחית השתן, כפי שזוהו על ידי מיקרוסקופיה פלואורסצנטית ועל ידי הומוגניזציה ותרבית של רקמת שלפוחית השתן, שנשמרים במשך חודשים לאחר רזולוציה של בקטריוריה 14,15,16. טיפול בשלפוחית השתן עם חומרים הגורמים לפילינג של אפיתל שלפוחית השתן (urothelium), למשל פרוטאמין סולפט17 או chitosan18, לגרום להופעת UPEC ממאגרים לגרום rUTI. נתונים אלה מצביעים על כך שבנשים המחזיקות במאגרי UPEC של שלפוחית השתן כתוצאה מזיהום קודם, חשיפות לשלפוחית השתן שמובילות לפילינג אורותליאלי עלולות לגרום ל-rUTI.
ישנן עדויות הולכות וגוברות לכך שהמיקרוביוטה הנרתיקית תורמת לזיהום בדרכי השתן19,20. Gardnerella vaginalis הוא חבר שכיח הן במיקרוביוטה הנרתיקית והן במיקרוביוטה של השתן 21,22,23,24,25,26,27,28,29. בנרתיק, נוכחות של רמות גבוהות של G. vaginalis קשורה עם דיסביוזה מיקרוביאלית המכונה נרתיק חיידקי (BV), אשר משפיע על ~ 30% מהנשים 30,31,32. נשים עם BV נמצאות בסיכון גבוה יותר לחוות UTI בהשוואה לנשים עם קהילה נרתיקית הנשלטת על ידי לקטובצילוס 33,34,35,36,37. במודלים של עכברים, G. vaginalis גורם לפילינג אפיתל הן בנרתיק38 והן בשלפוחית השתן39. בעכברים C57BL/6 המחזיקים במאגרי שלפוחית השתן של UPEC, שתי חשיפות רצופות של שלפוחית השתן ל-G. vaginalis - אך לא ל-PBS - גורמות לעלייה מחודשת של UPEC ממאגרים כדי לגרום ל-UPEC rUTI. הופעתה מעידה על הופעתם של טיטרים של UPEC בשתן מעכברים שפתרו בעבר את חיידקי UPEC וירידה לאחר מכן בטיטרים הומוגנטיים של שלפוחית השתן של UPEC בהקרבה בהשוואה לחיות בקרה שנחשפו ל-PBS39. באופן מעניין, אין התיישבות מתמשכת על ידי G. vaginalis בשלפוחית השתן. ברוב המכריע של המקרים, שתי חשיפות קצרות, שלכל אחת מהן פחות מ-12 (h) של G. vaginalis בר קיימא בשתן, מספיקות כדי לעורר פילינג אורותליאלי ולקדם rUTI.
פרוטוקול זה מתאר מודל עכברי של rUTI הנגרם על ידי UPEC השוכן במאגרי שלפוחית השתן התוך תאיים, תוך שימוש בחיסון שלפוחית השתן G. vaginalis כדי לגרום להישנות המחלה. ההתקדמות שהושגה על ידי מודל זה היא כי G. vaginalis הוא טריגר ביולוגי רלוונטי מבחינה קלינית של rUTI בהשוואה לחומרים כימיים בשימוש בעבר. יתר על כן, ההישרדות קצרת הימים יחסית של G. vaginalis בדרכי השתן של העכבר מאפשרת לבחון את ההשפעה של חשיפות מיקרוביאליות חולפות על האורותליום, כפי שעלול להתרחש לאחר פעילות מינית. בנוסף להתוויית מודל rUTI, פרוטוקול זה מתאר גם שיטות לציטולוגיה של השתן ולקיבוע והדמיה של שלפוחית השתן באתרה של האורותליום על ידי סריקת מיקרוסקופיית אלקטרונים (SEM).
פרוטוקול זה של UPEC UTI חוזר המושרה על ידי G. vaginalis משתמש בזן UPEC UTI89 הנושא קלטת עמידות לקנאמיצין (UTI89kanR)40. לא כל הזנים של UPEC שנבדקו הצליחו ליצור קהילות חיידקים תוך תאיות במהלך שלב ההדבקה החריפה בעכברים41 ועדיין לא ידוע אם לכל הזנים של UPEC יש את היכולת ליצור מאגרים תוך תאיים סמויים. יש לאשר את היווצרות המאגר לפני השימוש בזנים אחרים של UPEC במודל. פרוטוקול זה משתמש בבידוד G. vaginalis עמיד לסטרפטומיצין ספונטני, JCP8151BSmR38. אינדוקציה של rUTI על ידי JCP8151BSmR דורשת שני חיסונים רציפים של G. vaginalis , בהינתן 12 שעות או 7 ימים (d) בהפרששל 39. האם זנים אחרים של G. vaginalis גורמים לפילינג ו/או ל-UPEC rUTI עדיין יש לקבוע באמצעות מודל זה. חיוני להשתמש בזני UPEC ו-G. vaginalis עם עמידות ידועה לאנטיביוטיקה (כגון קנאמיצין או ספקטינומיצין עבור UPEC וסטרפטומיצין עבור G. vaginalis) מכיוון שניתן להוסיף אנטיביוטיקה לצלחות אגר כדי למנוע צמיחה של מיקרוביוטה של עכברים אנדוגניים שעלולים להפריע אחרת לספירת יחידות יוצרות מושבה (CFU) לניטור זיהום. זה חשוב במיוחד עבור גידול דגימות שתן, כי שתן של עכברים מכיל לעתים קרובות חיידקים אחרים שיכולים לגדול יתר על המידה על צלחות תרבית ללא אנטיביוטיקה. מקורם של חיידקים אנדוגניים אלה בשתן של עכברים אינו ידוע, אך ככל הנראה משקף חיידקים פריאוריתרליים ואורוגניטליים שנלקחו במהלך איסוף השתן.
G. vaginalis הוא חיידק אנאירובי פקולטטיבי, ולכן פרוטוקול זה מתאר גידול G. vaginalis JCP8151BSmR בתא אנאירובי. אם תא אנאירובי אינו זמין, ניתן להשתמש בשיטות אחרות לשמירה על תנאי גדילה אנאירוביים (כגון שקית GasPak במיכל אטום). לחלופין, זנים מסוימים של G. vaginalis (כולל JCP8151BSmR) יגדלו בחממת תרביות רקמה סטנדרטית (5% CO2). בדיוק כפי ששימוש בזני G. vaginalis שאינם JCP8151BSmR דורש בדיקה כדי לוודא שהחיידקים מתנהגים באופן דומה במודל זה, שינוי תנאי הגדילה דורש קביעה אמפירית של משכי זמן אידיאליים לתרבית (על צלחות ובנוזל) וצפיפות אופטית (OD)600 שווה ערך להשגת ריכוזי אינוקולום בני קיימא רצויים. יתר על כן, לא ידוע אם תנאי גדילה משפיעים על הפתוביולוגיה של G. vaginalis.
לבסוף, כאשר שוקלים אם להשתמש במודל זה, החוקרים צריכים להיות מודעים לכך שהוא יכול לדרוש מספר גדול יותר של בעלי חיים לכל קבוצה מאשר מודלים טיפוסיים של עכברי UTI. זאת, בין היתר, משום שאינדוקציה של rUTI דורשת מהעכברים לפתור את הבקטריוריה של UPEC הנגרמת על ידי הזיהום הראשוני של שלפוחית השתן. לפיכך, כל עכבר שאינו מצליח לנקות בקטריוריה (פנוטיפ המעיד בדרך כלל על זיהום כליות מתמשך) אינו נכלל בשלב rUTI של הפרוטוקול. מספר העכברים הדרושים להפעלת מחקרים אלה מושפע גם משיעור הופעת UPEC "ספונטנית" בשתן (12-14% בממוצע). לבסוף, לזני עכברים שונים יש נטיות שונות לפתח בקטריוריה כרונית לעומת היווצרות מאגרים תוך-תאיים42,43. אם משתמשים בזני עכברים שאינם C57BL/6 במודל זה, יש לוודא כי בעלי החיים מפתחים מאגרים תוך תאיים של UPEC.