$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
מחסום האפיתל במערכת העיכול ממלא תפקיד מרכזי בהפרדת אנטיגנים ופתוגנים לומינליים מתאי הרקמות הבסיסיים1. פגיעה אפיתל ופצעים ריר לראות בתנאים פתולוגיים כגון מחלות מעי דלקתיות (IBD), איסכמיה, או פציעה כירורגית קשורים עם תסמינים קליניים הכוללים שלשולים, ירידה במשקל, דם בצואה, וכאבי בטן. בתגובה לפציעה, תאי אפיתל נודדים ומתרבים כדי לאפיתל מחדש ולתקן פגמים במחסום הרירית. רזולוציה של דלקת והחזרת שלמות הרירית חיוניים להקמה מחדש של הומאוסטזיס הרירית במעיים ולתפקד2,3,4.
מודלים שונים של בעלי חיים שימשו כדי לחקור את המנגנונים המולקולריים הבסיסיים הקשורים לפגיעה במחסום האפיתל במעיים. מודלים מבוססים היטב וישימים בקלות של קוליטיס המושרה כימית נמצאים בשימוש נרחב, במיוחד במחקרים הקשורים לפגיעה דלקתית כגון מחלות מעי דלקתיות. דגם קוליטיס מורין נפוץ, ניתן לשחזור ואמין מעסיק נתרן גופרתי (DSS) בתיווך פגיעה במעי הגס ודלקת. חומרת המחלה משתנה בהתאם לזן העכבר, מינון של DSS, אורך ניהול DSS, ומשקל מולקולרי של DSS5,6,7.
נזק ריר מעיים במהלך קוליטיס DSS מוערך בדרך כלל באמצעות מדד פעילות המחלה (DAI), ציון מרוכב שנקבע על ידי ירידה במשקל, תוכן דם צואה, ועקביות צואה. תכולת הדם בצואה יכולה להיות מיקרוסקופית (מזוהה באמצעות בדיקת חומצה guaiac צואה) או מקרוסקופי; עקביות צואה מסווגת קשה, רך, או נוזלי (כלומר, שלשול)5,8. ניקוד של פרמטרים קליניים אלה יכול להיות סובייקטיבי ועשוי להשתנות בהתאם לניסיון של המשתמש והטיה, אם כי בסך הכל, הנתונים מספקים מידע אמין ולכן נמצא בשימוש נרחב על ידי חוקרי IBD. לעומת זאת, אין שיטה מקובלת להערכה היסטולוגית של נזקי ריר. לרוב, אזורים נבחרים של המעי הגס נבדקים על ידי פתולוג מיומן וציון בהתבסס על מספר פרמטרים הכוללים בדרך כלל פגיעה בקריפטה וחדירת לויקוציטים9,10,11. עם זאת, מכיוון שמספר הפרמטרים שנחקרו וכמות הרקמות שנותחו משתנה במידה ניכרת בין דוחות בודדים, ההסתגלות של מחקרים רבים שפורסמו מוגבלת. כדי להפחית את הטיית הצופה ולשפר את הקונקורדנציה הבין-מחקרית, פרוטוקול ניקוד היסטולוגי אידיאלי צריך: 1) לכלול את כל אורך המעי הגס, שכן דלקת הרירית במעיים היא לרוב משתנה ולדלג על נגעים נפוצים, 2) להגביל ניתוח לפרמטרים ספציפיים מפתח קל לפרשנות כדי להפחית את הסובייקטיביות, 3) להקל על עיבוד מהיר ועקבי של מספר גדול של דגימות, ו 4) להשתמש בכלים זמינים ובמחיר סביר נרחב לרכישת נתונים, ניתוח ומצגת.
כאן אנו מתארים טכניקה לעבד את המעי הגס כולו או קטעים ארוכים של המעי הדק בתצורת "רול שוויצרי" יחד עם השימוש במערכת ניקוד בסיוע מחשב חינם כדי לנתח דלקת ריר מעיים ונזק בגלל קוליטיס הנגרמת על ידי DSS.