דג הזברה הוא מודל חשוב להבנת התפתחות הכליות. כאן, פרוטוקול הכלאה במקום מותאם כדי לזהות ביטוי גנים בזחלי דגי זברה וצעירים במהלך פיתוח mesonephros.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
דג הזברה הוא מודל חשוב להבנת התפתחות הכליות. כאן, פרוטוקול הכלאה במקום מותאם כדי לזהות ביטוי גנים בזחלי דגי זברה וצעירים במהלך פיתוח mesonephros.
דג הזברה יוצר שני מבני כליות בחייו. הנוטה (כליה עוברית) נוצרת במהלך התפתחות עוברית ומתחילה לתפקד ביומיים לאחר ההפריה. המורכב משני נפרונים בלבד, הנוטה משמשת ככליה היחידה במהלך חיי הזחל עד שנדרשת תפקוד כליות נוסף בשל מסת הגוף ההולכת וגדלה. כדי להתמודד עם דרישה גבוהה זו, mesonephros (כליה בוגרת) מתחיל להיווצר במהלך מטמורפוזה. הנפרונים הראשיים החדשים מתמזגים לנוודים ויוצרים לומן מחובר. לאחר מכן, נפרונים משניים מתמזגים לראשונים (וכן הלאה) כדי ליצור רשת הסתעפות במסונפרוס. הרוב המכריע של המחקר מתמקד נוטה בשל הקלות של שימוש בעוברים. לכן, יש צורך לפתח טכניקות ללמוד זחלים מבוגרים וגדולים יותר ודגים צעירים כדי להבין טוב יותר את התפתחות mesonephros. כאן, פרוטוקול הכלאה במקום לניתוח ביטוי גנים מותאם לחדירת בדיקה, שטיפת בדיקות ונוגדנים, והלבנת פיגמנטים כדי לדמיין טוב יותר את mesonephros. הקו מהונדס Tg (lhx1a-EGFP) משמש לתיוג תאי אבות ואת הצינורות הדיסטליים של נפרונים המתהווים. פרוטוקול זה ממלא פער במחקר mesonephros. זהו מודל חיוני להבנת האופן שבו רקמות כליות חדשות נוצרות ומשתלבות עם נפרונים קיימים ומספקות תובנות על טיפולים רגנרטיביים.
עובר דג הזברה הוא מודל חשוב לחקר התפתחות הרקמות בשל גודלו הקטן, השקיפות, הכלים הזמינים וההישרדות שלו ללא הזנה עד חמישה ימים1,2. היא תרמה רבות להבנת התפתחות הכליות ולשימור בין דגי זברה ליונקים3,4,5. הכליה ממלאת תפקיד חיוני בשמירה על הומאוסטזיס נוזלי, סינון הדם והפרשת פסולת6. הנפרון, היחידה התפקודית של הכליה, כולל מסנן דם המחובר לצינור ארוך. בדגי זברה נוצרים שני מבני כליות לאורך כל חייו. הנוטה (הכליה העוברית הזמנית) נוצרת תחילה במהלך ההתפתחות המוקדמת. הוא מורכב משני נפרונים רצים לאורך הציר הקדמי-אחורי והופך לפונקציונלי בסביבות 2 ימים לאחר ההפריה (dpf). התועלת של הנוטה טמונה בפשטות שלה, שיש רק שני נפרונים כי הם בעיקר ליניארי וקל לדמיין (אם כי הצינור המפותל הפרוקסימלי מתחיל סליל בשלושה dpf)3. זה הקל לא רק על מחקרים על התפתחותה המוקדמת מן mesoderm הביניים, אלא גם את דפוס פילוח ותיקון צינורית7,8.
התועלת של דגי זברה מוגבלת לאחר חמישה dpf, כאשר החלמון פוחת והזחלים מסתמכים על האכלה במערכת הימית9. בסביבות 2 שבועות, הזחלים עוברים מטמורפוזה לקטינים, שם נוצרות רקמות חדשות ורקמות ישנות אובדות ו/או מאורגנות מחדש9. זה גם כאשר mesonephros (הכליה הבוגרת הקבועה) יוצר10,11,12. הנפרון הבוגר הראשון נוצר ליד הסומיט השישי, ומתמזג עם הצינורית המוקדמת הדיסטלית של הנוגים. נפרונים נוספים מתווספים אחוריים לעמדה זו בתחילה, אך גם לכיוון הקדמי בהמשך. הנפרונים העיקריים בגל הראשון מתמזגים לצינורות של הנוטים וחולקים לומן משותף להפקיד את הפסולת שלהם. נפרונים משניים נוצרים בגל הבא ומתמזגים לנפרונים ראשיים. תהליך חוזר זה יוצר מסונפרוס המסתעף, דומה במקצת לכליות היונקים. ככל הנראה, הנוטה בסופו של דבר מאבדת את זהות הצינור שלה והופכת לשני צינורות איסוף עיקריים שבהם כל הנפרונים מרוקנים את הפסולת שלהם13.
לפני היווצרותו של הנפרון הבוגר הראשון, תאי אבות יחידים מתחילים להופיע בזחלים ~4 מ"מ (אורך כולל) (~ 10 dpf). תאים אלה, המסומנים בקו מהונדס Tg(lhx1a-EGFP), לדבוק נוטה ונדמה להעביר לאתרים עתידיים של נפרוגנזה. התאים הבודדים מתמזגים לאשכולות, המבדילים לנפרונים חדשים12. לא ברור היכן תאים אלה שוכנים או אילו גנים הם מבטאים לפני תחילתו של mesonephrogenesis.
הבנת התפתחות מסונפרוס מספקת תובנות על כליות היונקים בדרכים שהנואפרוסים אינם יכולים. אלה כוללים היווצרות של אגרגטים נפרוגניים מתאי אבות יחידים, שילוב פונקציונלי של נפרונים חדשים עם קיימים, ומורפוגנזה מסתעפת. עם זאת, ישנן מגבלות לחקר התפתחות פוסט-מבריונית. הזחלים פחות שקופים בשל גודלם הגדול יותר ויש להם פיגמנטציה. ציר הזמן ההתפתחותי אינו סינכרוני בין בעלי חיים בודדים ותלוי מאוד בגורמים סביבתיים, כגון האכלה וצפיפות 9,14. למרות ריאגנטים נוקאאוט קיימים, הם פחות יעילים בזחלים לעומת עוברים15. בפרוטוקול זה, מתוארת שיטת הכלאה במקום לקביעת ביטוי גנים במהלך התפתחות mesonephros של דגי זברה. מספר שלבים מותאמים להגברת ההדמיה של mesonephros וחדירה ושטיפה של הבדיקה ואת הנוגדן. הקו מהונדס Tg (lhx1a-EGFP) משמש יחד עם בדיקה עבור EGFP כדי לתייג תאים יחידים של אבות, אגרגטים נפרוגניים, ואת צינורות דיסטליים של נפרונים המתהווה. שיטה זו תספק הבנה עמוקה יותר של התפתחות mesonephros ותובנה על טיפולים רגנרטיביים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
השימוש בזחלי דגי זברה וצעירים מאושר על ידי IUP IACUC (פרוטוקול #02-1920, #08-1920). פרטי תוכן הפתרון מפורטים ברשימת החומרים.
1. גידול זחלים
הערה: זה ייקח עד 21 ימים או יותר כדי להעלות זחלים וצעירים לשלב של עניין.
2. יום 1 - 2: תיקון זחלים
3. יום 3: מדידת זחלים
4. יום 3 – 4: התייבשות
5. יום 5: התייבשות
6. יום 5: תקציר פרוטאינאז K
7. יום 5: הלבנת
8. יום 5: פרה-ברינדיזציה
הערה: עבור שלבים שבוצעו ב 70 °C (70 °F), חשוב לעבוד במהירות כדי למזער את קירור המשחקון.
9. יום 6: הכלאה בדיקה
10. יום 7: שטיפת גשוש
11. יום 7: חסימה
12. יום 8 – 9: דגירה נוגדנים
13. יום 10 - 11: שטיפת נוגדנים
14. יום 12: כתמים
15. יום 12: הדמיה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
באמצעות הקו מהונדס Tg (lhx1a-EGFP), הוכח כי זה בפרוטוקול הכלאה במקום יעיל בתיוג תאי צאצא כליות ומבנים שונים של נפרון במהלך פיתוח mesonephros. כצפוי, מערכת העצבים המרכזית מסומנת גם בקו מהונדס זה (לא מוצג). הנפרון המסונפירי הראשוני נוצר במהירות של כ-5.2 מ"מ, גב לנטייה (איור 2A), והצינור הדיסטלי של הנפרון הזה מסומן על ידי EGFP10,12. אשכולות אבות קיימים בשלב זה ובהמשך (איור 2A-B
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
שיטת ההכלאה במקום המתוארת כאן נועדה ללמוד פיתוח מסונפרוס. עם זאת, ניתן ליישם אותו כדי לחקור את ההתפתחות של רקמות ואיברים אחרים במהלך מטמורפוזה, כגון המעיים, מערכת העצבים, קשקשים, פיגמנטציה14. בדיקות ניתן ליצור עבור גנים אנדוגניים או סמנים פלואורסצנטיים בקווים מהונדסים.
זה קריטי עבור הזחלים להישאר שלם על מנת להתבונן באיברים וברקמות בהקשר הטבעי שלהם. כדי לשמור על שלמות הרקמה, חשוב למזער את זמן הטיפול בחלבון K. חשוב לקבוע את זמן הטיפול הטוב ביותר עבור כל אצווה חדש...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגודי אינטרסים.
המימון ניתן על ידי האקדמיה למדע של פנסילבניה, וחבר העמים של פנסילבניה ביולוגים, ואוניברסיטת אינדיאנה של פנסילבניה (בית הספר ללימודים מתקדמים ומחקר, המחלקה לביולוגיה, ואת סינתיה Sushak לתואר ראשון ביולוגיה הקרן למצוינות). הקו הטרנסגני Tg (lhx1a-EGFP) סופק על ידי ד"ר ניל הוקריגה (אוניברסיטת פיטסבורג).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| נוגדן אנטי פלואורסצאין | Roche/Sigma-Aldrich | 11426338910 | |
| תמיסת | 0.8% KOH, 0.9% H2O2 | ||
| במגיב חוסם | Roche/Sigma-Aldrich | 11096176001 | שימוש לתמיסת חסימה, הכנה לפי הוראות היצרן |
| מסננת תאים | פישר סיינטיפיק | 22-363-549 | 100 μ m |
| E3 בינוני | 5 מ"מ NaCl, 0.33 מ"מ CaCl2, 0.33 מ"מ MgSO4, 0.17 מ"מ KCl, 0.0001% מתילן | ||
| כחול מניפולטור ריסים | פישר סיינטיפיק | NC1083208 | שימוש למניפולציה של זחלים תמיסת |
| קיבוע | 4% פרפורמלדהיד, 1% DMSO ב-PBS; חום ב-65° C תוך כדי ניעור עד שהאבקה נמסה, ואז להוסיף DMSO לאחר שהיא מתקררת | ||
| סינתזת בדיקה פלואורסצאין | Roche/Sigma-Aldrich | 11685619910 | |
| Fisher Scientific | 03-338B | ||
| אנקפסולציה של Hatchfry | Argent | ||
| Hyb- 50 | % פורממיד, 5X SSC, 0.1% תמיסת | ||
| Tween-20 Hyb+ | HYB-, 5 מ"ג/מ"ל טורולה RNA, 50 ug/mL הפרין | ||
| MAB (10X) | 1 M חומצה מאלית, 1.5 M NaCl, pH 7.5 | ||
| MABT | 1X MAB, 0.1% Tween-20 | ||
| חומצה מאלית | סיגמא-אולדריץ' | M0375 | |
| פרפורמלדהיד | סיגמא אולדריץ' | 158127 | |
| PBS (10X) | 8% NaCl, 0.2% KCl, 1.44% Na2HPO4, 0.24% KH2PO4 | ||
| PBST | 1X PBS, 0.1% Tween-20 | ||
| PBST2 | 1X PBS, 0.2% Tween-20 | ||
| אבקת מזון | מערבבים 2 גרם מכל אחד מספירולינה ואנקפסולון ב-50 מ"ל מים של מערכת הדגים ומנערים היטב | ||
| Proteinase K | Sigma-Aldrich | P5568 | השתמש כדי לחלחל זחלים |
| תמיסת | Proteinase K20 μ גרם/מ"ל, ריכוז סופי של 1% DMSO | ||
| באבקת ספירולינה מיקרו-דקה | ארג'נט | ||
| SSC (20X) | 3 M NaCl, 0.3 M נתרן אצטט נטול מים, pH 7, אוטוקלאב | ||
| SSCT (0.2X) | מדולל מ-20X SSC, 0.1% Tween-20 | ||
| SSCT (2X) | מדולל מ-20X SSC, 0.1% Tween-20 | ||
| Staining buffer | 100 מ"מ Tris pH 9.5, 50 מ"מ MgCl2, 100 מ"מ NaCl, 0.1% | ||
| תמיסת | 200 μ גרם/מ"ל יודוניטרוטרזוליום כלוריד, 200 μ גרם/מ"ל 5-Bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate מלח דיסודיום, במאגר מכתים | ||
| תמיסת | 1 מ"מ EDTA, pH 5.5, ב-PBST | ||
| Torula (שמרים) RNA | Sigma-Aldrich | R6625 | |
| Tricaine | Sigma Aldrich | E10521 | 2%, pH 7 |
| מאגר | 50% פורממיד, 2X SSC, 0.1% Tween-20 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.