כאן, אנו מציגים פרוטוקול להערכת הפעילויות הנוירו-הגנתיות של תרכובות בדיקה ב - Caenorhabditis elegans, כולל צבירה של פוליגלוטמין, מוות עצבי והתנהגות כימואבואידית, כמו גם שילוב מופתי של פנוטיפים מרובים.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
כאן, אנו מציגים פרוטוקול להערכת הפעילויות הנוירו-הגנתיות של תרכובות בדיקה ב - Caenorhabditis elegans, כולל צבירה של פוליגלוטמין, מוות עצבי והתנהגות כימואבואידית, כמו גם שילוב מופתי של פנוטיפים מרובים.
קיפול שגוי הקשור לגיל וצבירה של חלבונים פתוגניים אחראים למספר מחלות נוירודגנרטיביות. לדוגמה, מחלת הנטינגטון (HD) מונעת בעיקר על ידי חזרה על נוקלאוטידים CAG המקודדת מערכת גלוטמין מורחבת בחלבון הנטינגטון. לפיכך, עיכוב של צבירת פוליגלוטמין (polyQ) ובמיוחד, רעילות עצבית הקשורה לצבירה היא אסטרטגיה שימושית למניעת HD ותנאים אחרים הקשורים ל- polyQ. מאמר זה מציג פרוטוקולים ניסיוניים כלליים להערכת יכולת ההגנה הנוירו-טקטיבית של תרכובות בדיקה נגד HD באמצעות מודלים מבוססים של Caenorhabditis elegans מהונדסים של PolyQ. זן AM141 נבחר למבחן הצבירה של PolyQ, שכן ניתן להבחין בקלות בפנוטיפ הקשור לגיל של אגרגטים פלואורסצנטיים בדידים בדופן גופו בשלב הבוגר בשל ביטוי ספציפי לשריר של חלבוני היתוך polyQ::YFP. לעומת זאת, מודל HA759 עם ביטוי חזק של דרכי תנועה מורחבות polyQ בתאי עצב ASH משמש לבחינת מוות עצבי והתנהגות כימואבואידית. כדי להעריך באופן מקיף את יכולת ההגנה הנוירו-הגנתית של תרכובות המטרה, תוצאות הבדיקה לעיל מוצגות בסופו של דבר כתרשים מכ"ם עם פרופיל של פנוטיפים מרובים באופן של השוואה ישירה וצפייה ישירה.
ניוון עצבי מתקדם ב-HD כולל ציד מוטנטי פתוגני עם מתיחה חריגה של פוליQ המקודדת על ידי CAG trinucleotide חוזרת על 1,2,3. חלבוני ציד מוטנטיים עם יותר מ-37 חזרות על גלוטמין נוטים להצטבר ולהצטבר במוחם של חולי HD ומודלים של בעלי חיים 4,5, מה שמוביל בסופו של דבר לניוון עצבי6. למרות חוסר הבהירות לגבי התפקידים של אגרגטים polyQ בפתולוגיה של מחלות5, עיכוב של צבירת polyQ והרעילות הקשורה אליו היא אסטרטגיה טיפולית שימושית עבור HD ומחלות polyQ אחרות 4,7,8.
בשל השימור במסלולי איתות עצביים ובמודלים קלים לבנייה של מחלות מהונדסות, Caenorhabditis elegans נמצא בשימוש נרחב כאורגניזם מודל מרכזי לחקר הפרעות נוירולוגיות 9,10,11,12. לדוגמה, מודלים מהונדסים של C. elegans המבטאים הרחבות polyQ מועדות לצבירה יכולים לחקות באופן אובייקטיבי תכונות דמויות HD כגון אובדן תאי עצב סלקטיביים, היווצרות צבירה ציטופלסמית ופגמים התנהגותיים13. חקירת ההשפעות הפוטנציאליות של דגימות בדיקה כדי להפוך את הפנוטיפים הללו במודלים מבוססים של נמטודות פוליQ הובילה לזיהוי מגוון מועמדים טיפוליים מבטיחים, למשל, פוליסכרידים 7,14,15, אוליגוסכרידים16, מולקולות קטנות טבעיות 17,18, ותמציות צמחיות ונוסחאות19,20.
מתוארים כאן שני מודלים עיקריים של polyQ C. elegans ופרוטוקולים רלוונטיים ליישומים פוטנציאליים כפי שהודגם על ידי המחקר על אסטרגלן, רב-סוכר שבודד מ- Astragalus membranaceus7. עבור בדיקת הצבירה של polyQ ב- C. elegans, המודל המשמש הוא הזן המהונדס AM141, אשר מראה פונקטה פלואורסצנטית מפוזרת בשריר דופן גופה כאשר מגיעה לבגרות עקב הביטוי של חלבון ההיתוך Q40::YFP, מערכת פוליQ של 40 שאריות (polyQ40) שהתמזגה לחלבון פלואורסצנטי צהוב (YFP)21,22 . הזן HA759 שימש לבחינת ההישרדות העצבית וההתנהגות הכימואבואידנטית, שכן הוא מבטא הן את החלבון הפלואורסצנטי הירוק (GFP) והן את Htn-Q150 (מערכת פולי-Q שמקורה בצידטין אנושי של 150 שאריות) בחוזקה בתאי עצב ASH אך חלשה בתאי עצב אחרים, וכתוצאה מכך נוצרה ניוון עצבי מתקדם ומוות של תאי ASH 7,13. סיכום מקיף של הפוטנציאל הנוירו-הגנתי של מועמדים טיפוליים מסופק על ידי שילוב תוצאות מבדיקות שונות.
הערה: ראה טבלה 1 לקבלת המתכונים של פתרונות המשמשים בפרוטוקול זה.
1. הכנת חומרים לבדיקת ה-Caenorhabditis elegans
2. בדיקת צבירה של PolyQ
(1)3. מבחני רעילות עצבית בתיווך PolyQ
(2)
(3)4. יצירת תרשים מכ"ם
זן הפוליק המהונדס AM141 מבטא בחוזקה את חלבוני ההיתוך Q40::YFP בתאי השריר של דופן גופו 7,21. כפי שניתן לראות באיור 1A, ניתן לזהות את הפנוטיפ המצטבר הבדיד של זן זה על ידי פרוטוקול ההדמיה והניתוח האוטומטי המתואר במאמר זה. כמות הצברים של Q40::YFP בנמטודות AM141 עלתה משמעותית לאחר 48 שעות משלב L1. עם זאת, נטייה זו לעלייה עוכבה על ידי טיפול אסטרגלני (איור 1B), המדגים את הפוטנציאל המגן של אסטרגלן מפני צבירה של polyQ. בדרך כלל ניתן להשתמש בנוחות ב- 72 שעות או ב- 96 שעות כנקודות הזמן לספירת צבירה Q40::YFP כדי להעריך את ההשפעה נגד צבירה של דגימות בדיקה. בפרוטוקול זה, האגרגטים הפלואורסצנטיים של נמטודת AM141 נלכדו על ידי מערכת הדמיה אוטומטית, אם כי ניתן להשתמש במיקרוסקופים פלואורסצנטיים גם למטרה זו7.
זן C. elegans HA759 מבטא הן את סמן ה-GFP והן את ה-Htn-Q150 בתאי העצב החושיים ASH שלו, מה שמוביל לאובדן הדרגתי ולתפקוד לקוי של נוירונים אלה11,13. הנמטודות הורכבו על רפידות אגרוז של 2% כדי לקבוע את הכדאיות העצבית של ASH (איור 2A) והוצגו באופן מיקרוסקופי כדי לזהות את תאי העצב של ASH. אובדן פלואורסצנציה של GFP בתאי עצב דו-צדדיים של ASH באזורי הראש של נמטודות מצביע על המוות העצבי של ASH (איור 2B). שיעור ההישרדות של נוירוני ASH בנמטודות HA759 הוא <40% בקבוצת הביקורת לאחר הדגירה בטמפרטורה של 15 מעלות צלזיוס במשך 3 ימים 7,20, מה שמעיד על רעילות עצבית בתיווך פוליQ. לפיכך, ניתן להשתמש במבחן ההישרדות העצבי הזה של ASH כדי להעריך באופן חזותי את ההשפעות של תרכובות בדיקה על נוירוני C. elegans, למשל, ההשפעה הנוירו-הגנתית של אסטרגלן אך לא של פוריה גליקאן (איור 2C).
מכיוון שתפקוד לקוי של התנהגות הוא תסמין קליני מרכזי במחלות polyQ, בדיקת ההימנעות הכימוסנסורית (איור 3A) באמצעות מספר גדול של נמטודות HA759 מתוכננת כבדיקה פשוטה כדי לבחון את ההשפעה של דגימות בדיקה על האובדן התפקודי של נוירוני ASH המתווכים על ידי צבירת polyQ. כפי שניתן לראות באיור 3B, מדד ההימנעות מנמטודות HA759 בקבוצת הביקורת שלא טופלה היה ~0.5, בדומה למה שדווח בעבר14. באופן מעניין, מדד ההימנעות עלה ל->0.6 בנמטודות שטופלו באסטרגלן ב-15 מעלות צלזיוס במשך 3 ימים (איור 3B), מה שמדגים השפעה נוירו-מגנה על הפוליסכריד מפני ליקויים התנהגותיים.
כדי להעריך את היכולת הנוירו-הגנתית הכוללת של תרכובות הבדיקה, ניתן לשלב את הנתונים מהבדיקות הבודדות הנ"ל ולהציגם כתרשים מכ"ם עבור פנוטיפים מרובים, מה שהופך אותם לתכונה מאחדת של פנוטיפים של polyQ המתאימים להשוואה ישירה ולצפייה ישירה. כפי שניתן לראות באיור 4, שטח המשולש בקבוצת הטיפול האסטרגלנית גדול מזה של קבוצת הביקורת, מה שמעיד על ההשפעות האנטי-פולי-פולי-Q של הרב-סוכר.

איור 1: ההשפעה של אסטרגלן על צבירת polyQ40. (A) תמונות מייצגות של נמטודות AM141 לאחר טיפול עם או בלי אסטרגלן במשך 96 שעות בטמפרטורה של 20 מעלות צלזיוס. התמונות הפלורסנטיות (לוחות שמאליים) נרכשו מלוחות של 384 בארות באמצעות מערכת הדמיה וניתוח בעלת תוכן גבוה, וצברי Q40::YFP (לוחות ימניים) זוהו באופן אוטומטי על ידי המערכת. סטים הם התצוגות המוגדלות של תמונות נמטודה המציגות את אגרגטי ה-polyQ. סרגלי קנה מידה = 500 μm. (B) כימות של אגרגטים Q40::YFP. מספר הצברים של Q40::YFP בנמטודות AM141 היה מנוטר באמצעות מערכת ההדמיה בעלת התוכן הגבוה כל 24 שעות במשך 4 ימים לאחר הטיפול עם או בלי אסטרגלן בטמפרטורה של 20 מעלות צלזיוס. כ-100-150 נמטודות בכל קבוצה הובקעו עבור אגרגטים בכל נקודת זמן. התוצאות מוצגות כעקומות מותאמות המבוססות על מספר האגרגטים הממוצע לכל נמטודה. קיצורים: polyQ = פוליגלוטמין; YFP = חלבון פלואורסצנטי צהוב; FITC = פלואורסציין איזותיוציאנט. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 2: ההשפעה של אסטרגלן על מוות עצבי של ASH בתיווך Htn-Q150. (A) דיאגרמה סכמטית של הכנת שקופית אגרוז. (B) מיקרוגרפים מייצגים של נמטודות HA759 עם הישרדות עצבית של ASH ומוות באמצעות הגדלה של פי 400. סרגלי קנה מידה = 20 מיקרומטר. הנמטודות HA759 צולמו באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי לאחר טיפול עם או בלי אסטרגלן בטמפרטורה של 15 מעלות צלזיוס למשך 3 ימים מ-L1. (C) השפעה מגנה של אסטרגלן מפני מוות עצבי של ASH בתיווך פולי-Q. פוריה גליקאן, רב-סוכר מפוריה קוקוס, שימש כבקרה. הנתונים מוצגים כאמצעים ± SD של שלושה שכפולים, המייצגים יותר משלושה ניסויים בלתי תלויים. הניתוח הסטטיסטי בוצע באמצעות מבחן t דו-זנב לא מזווג, דו-זנב, כדי להשוות נתונים של קבוצת הביקורת עם אלה של קבוצות האסטרגלן והפורייה גליקן. *עמ' < 0.05; ns = אין משמעותי. קיצור: GFP = חלבון פלואורסצנטי ירוק. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 3: ההשפעה של אסטרגלן על תפקוד התנהגותי לקוי בתיווך Htn-Q150. (A) דיאגרמה סכמטית של לוחית בדיקת ההימנעות. (ב) תוצאות מייצגות של בדיקת הימנעות. מדד ההימנעות הוגדר כיחס בין הנמטודות באזור N למספר הכולל של הנמטודות על הלוח. התוצאות מוצגות כאמצעים ± SD של שלושה שכפולים, המייצגים שלושה ניסויים עצמאיים. ניתוח סטטיסטי של מדד ההימנעות בוצע באמצעות מבחן t לא מזווג, בעל שני זנבות. **עמ' < 0.01. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 4: יכולת ההגנה העצבית הכוללת של אסטרגלן. נתונים משלושה מבחנים שונים מיובאים לתוכנת OriginPro כדי ליצור תרשים מכ"ם, המוצג כדי ליצור פרופיל של ההשפעה הכללית של אסטרגלן על פנוטיפים מרובים המתווכים על ידי polyQ. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
טבלה 1. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
מכיוון שצבירת polyQ ופרוטאוטוקסיות הן תכונות חשובות של הפרעות polyQ, כגון מחלת הנטינגטון13, אנו ממליצים על שימוש במספר מודלים ושיטות כדי להעריך באופן מקיף את יכולת ההגנה הנוירו-טכנולוגית של תרכובות הבדיקה, כולל בדיקת הצבירה של polyQ בזן AM141, מבחן ההישרדות העצבי ASH בזן HA759, ומבחן ההימנעות הכימוסנסורית בזן HA759. הפרוטוקולים שהוצגו כאן שימשו להערכת יכולות ההגנה הנוירו-טקרטיבית של דגימות בדיקה מפני רעילות polyQ, כולל השפעות מעכבות הן על צבירת polyQ והן על רעילות עצבית נלווית 7,14,15,16,17,19,20, מה שמדגים את הפוטנציאל שלהם בגילוי תרופות עבור HD ומחלות פוליQ אחרות.
מערכת הדמיה וניתוח אוטומטית מוצגת לזיהוי וספירה של אגרגטים של polyQ במבחן הצבירה של polyQ. לשיטה זו יש את היתרונות של היותה בתפוקה גבוהה וחסכונית בזמן ומביאה לירידה משמעותית בשגיאות סובייקטיביות בתהליך הספירה המייגע. עבור צלחת שלמה של 384 בארות, לוקח רק <1 שעות כדי לסיים את הרכישה והניתוח של התמונה. עם זאת, שיטת ההדמיה המיקרוסקופית הקונבנציונלית הראתה גם ביצועים דומים במעבדה זו ללא שימוש במכשיר ההדמיה האוטומטי7.
סך של 100-150 נמטודות לכל טיפול מומלצות במבחן צבירה טיפוסי Q40::YFP עבור כל נקודת זמן, אשר ניתן לבצע בבארות משוכפלות המכילות 10-15 נמטודות כל אחת. עם זאת, יש לציין כי זחלי L1 עשויים להיות רגישים יותר לטיפולים מסוימים או לריכוזים גבוהים יותר. לכן, מינונים גבוהים יותר של תרכובות בדיקה עשויים לעכב את גדילתן, מה שיוביל לתוצאות חיוביות כוזבות עקב צמיחה איטית, ולכן, צבירת polyQ מאוחרת. בדרך כלל, ניתן לבצע בדיקת פינוי מזון כדי לתת מענה לחשש זה ולהבטיח את טווח הריכוזים המתאים של תרכובותהבדיקה 23.
הנמטודות המהונדסות HA759 המשמשות בבדיקות נוירוטוקסיות של polyQ מבטאות את OSM-10::GFP ו- Htn-Q150, מה שמאפשר לזהות באופן חד משמעי נוירונים חושיים של ASH דו-צדדיים. לפיכך, הישרדות הנוירונים של ASH מוערכת על ידי נוכחות או היעדר ביטוי GFP; בדרך כלל, כ-40-75% מתאי העצב של ASH בנמטודות הבקרה מתים23,24. באופן מעניין, הרקע המוטנטי הגנטי pqe-1 (משפר פוליגלוטמין-1) בזן HA759 (pqe-1; Htn-Q150) מאיץ רעילות בתיווך פולי-Q, מה שמוביל למותם של רוב נוירוני ה-ASH תוך שלושה ימים, אפילו ב-15 מעלות צלזיוס, ולכן זן זה גדל ב-15 מעלות צלזיוס עבור בדיקת ההישרדות העצבית, כפי שדווח בעבר23,24.
אובדן תפקודי של נוירוני ASH בנמטודות HA759 עלול להתרחש לפני גילוי מוות תאי וצבירת חלבונים13; לפיכך, בדיקת התנהגות ההימנעות האוסמוטית חיונית להערכת רעילות בתיווך polyQ. כדי למזער את ההשפעה הפוטנציאלית של נמטודות HA759 פחות פעילות בטמפרטורה נמוכה על ניסויים התנהגותיים, לוחות בדיקת ההימנעות מודגרים באינקובטור לח של 23 מעלות צלזיוס ולא בטמפרטורה של 15 מעלות צלזיוס כמו במבחן ההישרדות העצבי באמצעות זן זה. בנוסף, דווח כי נמטודות מהונדסות Htn-Q150/OSM-10::GFP רגישות מאוד למגע באף; לפיכך, זיהוי חלופי של תפקוד נוירוני ASH הוא מבחן מגע האף13.
המחברים מצהירים כי אין להם אינטרסים כלכליים מתחרים.
אנו מודים לחברים לשעבר במעבדת הואנג שעזרו לפתח ולשפר את הפרוטוקולים המשמשים במאמר זה, במיוחד להנרוי ג'אנג, לינגיון שיאו ויאנשיה שיאנג. עבודה זו נתמכה על ידי פרויקט 111 (מענק מספר B17018) והקרן למדעי הטבע של מחוז חביי (מענק מספר H202020207002).
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| C. elegans זנים | |||
| AM141 rmIs133 [unc-54p::Q40::YFP] | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/AM141 | |
| HA759 rtIs11 [osm-10p::GFP + osm-10p::HtnQ150 + dpy-20(+)] | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/HA759 | |
| E. coli זנים | |||
| NA22 | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/NA22 | |
| OP50 | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/OP50 | |
| Reagent | |||
| Agar | Shanghai EKEAR Bio-Technology Co., Ltd. | EQ1001-500G | https://www.ekear.com |
| Agarose | Biowest | 111860 | |
| בוטנדיון | סינופארם ריאגנט כימי ושות', בע"מ | 80042427 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/d027c00e64c9404d9aa41391fbb59 5d0 |
| כולסטרול | סיגמא-אולדריץ' | C8667 | https://www.sigmaaldrich.cn/CN/zh/product/sigma/c8667?context=product |
| גליצרול | אלאדין ושות', בע"מ | G116203 | https://www.aladdin-e.com/zh_cn/g116203.html |
| פפטון | גואנגדונג HuanKai מדע וטכנולוגיה מיקרוביאלית ושות', בע"מ | 050170B | https://www.huankai.com/show/21074.html |
| נתרן אזיד | סינופארם ריאגנט כימי ושות', בע"מ | 80115560 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/5e981aa807664e26af 551e96ff5f07cd |
| נתרן הידרוקסיד | סינופארם מגיב כימי ושות', בע"מ | 10019718 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/450dfdb1132a4d8a817 d3d8c68ec25e6 |
| תמיסת נתרן היפוכלוריט | מפעל ריאגנטים כימיים גואנגג'ואו | 7681-52-9 | http://www.chemicalreagent.com/product/DetailProduct.aspx?id=125 |
| טריפטון | אוקסואיד בע"מ | LP0042B | https://www.thermofisher.cn/order/catalog/product/LP0042B#/LP0042B |
| תמצית שמרים | אוקסואיד בע"מ | LP0021B https://www.thermofisher.cn/order/catalog/product/LP0021B#/LP0021B | |
| <חזק>ציוד | |||
| 384 בארות צלחת תרבית תאים | Nest Biotechnology Co., Ltd. | 761001 | https://www.cell-nest.com/page94?_l=en&product_id=85 |
| צלחת תרבית תאים 48 בארות | Nest Biotechnology Co., Ltd. | 748001 | https://www.cell-nest.com/page94?_l=en&product_id=85 |
| 90 מ"מ צלחת פטרי | סנגון ביוטק (שנחאי) ושות', בע"מ | F611003 | https://www.sangon.com/productDetail?productInfo.code=F611003 |
| אוטוקלאב | Panasonic | MLS-3781L-PC | |
| מיקרוסקופ ניתוח | צ'ונגצ'ינג אופטי ושות', בע"מ | ZSA0745 | |
| http://www.coicuop.com/plus/view.php?aid=64 מיקרוסקופ פלואורסצנטי | גואנגג'ואו מיקרו-שוט אופטי טכנולוגיה ושות', בע"מ | Mshot MF31-LED | https://www.mshot.com/article/442.html |
| מערכת הדמיה בעלת תוכן גבוה | מכשירים מולקולריים | ImageXpress | https://www.moleculardevices.com/products/cellular-imaging-systems#High-Content-Imaging |
| Microcentrifuge | GeneCompany | ||
| דיגיטלית מיקרוסקופ https://www.genecompany.com/index.php/Home/Goods/goodsdetails/gid/189.html GENESPEED X1גואנגג'ואו מיקרו-שוט אופטי טכנולוגיה ושות', בע"מ | MS60 | https://www.mshot.com/article/677.html | |
| מיקרוגל | מידאה קורפ | M1-211A | https://www.midea.cn/10000/10000000001 00511264425.html |
| Parafilm M | Sigma-Aldrich | P7793-1EA | https://www.sigmaaldrich.cn/CN/en/product/sigma/p7793?context=product |
| Shaker | Zhicheng Inc. | ZWY-2102C | http://www.zhicheng.net/Product/0865291356.html |
| Software | |||
| תוכנה לרכישת וניתוח תמונות | Molecular Devices | MetaXpress | https://www.moleculardevices.com/products/cellular-imaging-systems/acquisition-and-analysis-software/metaxpress-OriginPro |
| OriginLab Corp. | גירסה 9.8.5.204 | 1. מבוא לתוכנה: https://www.originlab.com/index.aspx?go=Products/Origin 2. הוראות ליצירת תרשים מכ"ם: https://www.originlab.com/doc/Origin-Help/RadarChart-Graph 3. מדריך וידאו ליצירת תרשים מכ"ם: https://www.originlab.com/videos/details.aspx?pid=1813 |
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה