מאמר שיטה

אנקפסולציה מהירה של שלד ציטוסקי משוחזר בתוך בועיות יונילאמלריות ענקיות

DOI:

10.3791/63332

⸱

10 בנובמבר 2021

 ,  ,  ,  , 
1Department of Mechanical Engineering, University of Michigan, Ann Arbor, 2John A. Paulson School of Engineering and Applied Sciences, Harvard University, 3Department of Cellular and Molecular Biophysics, Max Planck Institute of Biochemistry, 4Department of Biomedical Engineering, University of Michigan, Ann Arbor, 5Department of Biophysics, University of Michigan, Ann Arbor, 6Cellular and Molecular Biology Program, University of Michigan, Ann Arbor

* These authors contributed equally

במאמר זה

סיכום

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

מאמר זה מציג שיטה פשוטה לייצור מהיר של שלפוחיות חד-שכבתיות ענקיות עם חלבוני שלד ציטוסקטליים עטופים. השיטה מוכיחה את עצמה כיעילה לשילוב מחדש מלמטה למעלה של מבנים ציטוסקטליים באינטראקציות כליאה וציטוסקלטון-ממברנה.

תקציר

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

שלפוחיות חד-שכבתיות ענקיות (GUVs) משמשות לעתים קרובות כמודלים של ממברנות ביולוגיות ולכן הן כלי נהדר לחקר תהליכים תאיים הקשורים לממברנה במבחנה. בשנים האחרונות, אנקפסולציה בתוך GUVs הוכיחה את עצמה כגישה מועילה לניסויים חוזרים בביולוגיה של התא ובתחומים קשורים. הוא מחקה טוב יותר את תנאי הכליאה בתוך תאים חיים, בניגוד לשיקום ביוכימי קונבנציונלי. לעתים קרובות לא קל ליישם שיטות לעטיפה בתוך GUVs, ושיעורי ההצלחה יכולים להיות שונים באופן משמעותי ממעבדה למעבדה. טכניקה אחת שהוכחה כמוצלחת לעטוף מערכות חלבונים מורכבות יותר נקראת אנקפסולציה רציפה של ממשק טיפות (cDICE). כאן מוצגת שיטה מבוססת cDICE לעטיפה מהירה של חלבוני שלד ציטוסקטליים ב-GUVs עם יעילות אנקפסולציה גבוהה. בשיטה זו, ראשית, טיפות שומנים-חד-שכבתיות נוצרות על ידי תחליב של תמיסת חלבון בעלת עניין בתערובת שומנים/שמן. לאחר שמוסיפים אותם לתוך תא מודפס בתלת-ממד מסתובב, טיפות חד-שכבתיות אלה עוברות דרך מונו-שכבתי שומנים שני בממשק מים/שמן בתוך החדר כדי ליצור GUVs המכילים את מערכת החלבון. שיטה זו מפשטת את ההליך הכולל של אנקפסולציה בתוך GUVs ומאיצה את התהליך, ובכך מאפשרת לנו להגביל ולהתבונן באבולוציה הדינמית של הרכבת הרשת בתוך בועיות דו-שכבתיות של שומנים. פלטפורמה זו שימושית לחקר המכניקה של אינטראקציות שלד-ממברנה ציטוסקית בכליאה.

מבוא

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

תאי דו-תאי ליפידים משמשים כתאים סינתטיים לדוגמה לחקר תגובות אורגניות סגורות ותהליכים מבוססי ממברנה או כמודלים נשאים ביישומי אספקת תרופות 1,2. ביולוגיה מלמטה למעלה עם רכיבים מטוהרים דורשת מערכות ניסוי מינימליות כדי לחקור תכונות ואינטראקציות בין ביומולקולות, כגון חלבונים ושומנים 3,4. עם זאת, עם התקדמות התחום, יש צורך גובר במערכות ניסוי מורכבות יותר המחקות טוב יותר את התנאים בתאים ביולוגיים. אנקפסולציה ב- GUVs היא גישה מעשית שיכולה להציע חלק מהתכונות דמויות התאים הללו על ידי מתן דו-שכבת שומנים מעוותת וחדירה באופן סלקטיבי ומרחב תגובה מוגבל. בפרט, שחזור חוץ גופי של מערכות שלד ציטוסקטליות, כמודלים של תאים סינתטיים, יכול להפיק תועלת מאנקפסולציה בתאי ממברנה5. חלבונים ציטוסקטליים רבים נקשרים ומתקשרים עם קרום התא. מכיוון שרוב מכלולי השלד הציטוסקטליים יוצרים מבנים המשתרעים על פני כל התא, צורתם נקבעת באופן טבעי על ידי כליאה בגודל תא6.

שיטות שונות משמשות ליצירת GUVs, כגון נפיחות 7,8, היתוך שלפוחית קטן 9,10, העברת תחליב11,12, סילון פועם13, וגישות מיקרופלואידיות אחרות14,15. למרות ששיטות אלה עדיין בשימוש, לכל אחת מהן יש את המגבלות שלה. לפיכך, גישה חזקה ופשוטה עם תפוקה גבוהה של אנקפסולציה GUV היא רצויה מאוד. אף על פי שטכניקות כגון נפיחות ספונטנית ואלקטרוסוולינג מאומצות באופן נרחב ליצירת GUVs, שיטות אלה תואמות בעיקר להרכבי שומנים ספציפיים16, מאגרי ריכוז מלח נמוכים17, גודל מולקולרי אנקפסולנטי קטן יותר18, ודורשים נפח גבוה של האנקפסולנט. התמזגות של שלפוחיות קטנות מרובות לתוך GUV היא שלילית מטבעה מבחינה אנרגטית, ולכן דורשת ספציפיות בהרכבי שומנים טעונים9 ו/או חומרים חיצוניים הגורמים לאיחוי, כגון פפטידים19 או כימיקלים אחרים. העברת תחליב ושיטות מיקרופלואידיות, לעומת זאת, עשויות לדרוש ייצוב טיפות באמצעות פעילי שטח והסרת ממסים לאחר היווצרות דו-שכבתית, בהתאמה18,20. המורכבות של מערך הניסוי והמכשיר בטכניקות מיקרופלואידיות כגון סילון פועם מטילים אתגר נוסף21. cDICE היא שיטה מבוססת אמולסיה הנגזרת מעקרונות דומים המסדירים העברת תחליב22,23. תמיסה מימית (תמיסה חיצונית) ותערובת שומנים-שמן מרובדים על ידי כוחות צנטריפוגליים בתא גלילי מסתובב (תא cDICE) היוצרים ממשק רווי שומנים. טפטוף של טיפות מימיות חד-שכבתיות של שומנים חד-שכבתיים לתוך תא ה-cDICE המסתובב גורם לרוכסן של דו-שכבתי כאשר טיפות חוצות את הממשק רווי השומנים אל תוך התמיסה המימית החיצונית22,24. גישת cDICE היא טכניקה חזקה עבור אנקפסולציה של GUV. עם השיטה המתוקנת המוצגת, לא רק תפוקת השלפוחית הגבוהה האופיינית ל- cDICE עם זמן אנקפסולציה קצר משמעותית (כמה שניות) מושגת, אלא שזמן יצירת GUV המאפשר תצפית על תהליכים תלויי זמן (למשל, היווצרות רשת ציטוסקטלית של אקטין ציטוסקלית) מצטמצם באופן משמעותי. הפרוטוקול לוקח בערך 15-20 דקות מההתחלה לאיסוף GUV והדמיה. כאן, יצירת GUV מתוארת באמצעות שיטת cDICE שעברה שינוי לעטיפת חלבונים קושרי אקטין ואקטין (ABPs). עם זאת, הטכניקה המוצגת ישימה לתמצות מגוון רחב של תגובות ביולוגיות ואינטראקציות עם ממברנות, החל מהרכבת ביופולימרים, דרך ביטוי חלבונים ללא תאים וכלה בהעברת מטען מבוססת היתוך ממברנה.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. הכנת תערובת שמן-שומנים

הערה: הצעד צריך להתבצע במכסה אדים בהתאם לכל הנחיות הבטיחות לטיפול בכלורופורם.

  1. קח 0.5 מ"ל של כלורופורם בבקבוקון זכוכית 15 מ"ל. הוסיפו 88 μL של 25 מ"ג/מ"ל דיאוליאויל-פוספוכולין (DOPC), 9.3 μL של 50 מ"ג/מ"ל כולסטרול, ו-5 μL של 1 מ"ג/מ"ל דיאוליאויל-פוספואתנולמין-ליסאמין-ליסמין רודמין B (רודמין PE) (ראו טבלת חומרים) לתוך בקבוקון הזכוכית של 15 מ"ל.
    הערה: השברי השומה הסופיים של DOPC וכולסטרול בשמן סיליקון/מינרלי הם 69.9% ו-30%, בהתאמה. נקבע כי 20-30 מול% כולסטרול הוא ריכוז אופטימלי לנזילות הממברנה וליציבות של GUVs שנוצרו באמצעות הטכניקה המוצגת25,26. מבחינה פיזיולוגית, ערכים אלה נמצאים היטב בטווח ריכוזי הכולסטרול המצויים בקרוםהפלזמה של תאי יונקים 6. מלאי שומנים נרכשים כפתרונות בכלורופורם ומאוחסנים בטמפרטורה של -20 מעלות צלזיוס. בקבוקוני מלאי שומנים צריכים להיות מאוכלסים לטמפרטורת החדר לפני שהם נפתחים.
  2. פיפטה 7.2 מ"ל של שמן סיליקון ו-1.8 מ"ל של שמן מינרלי בבקבוקון שני של 15 מ"ל (ראו טבלת חומרים). בדרך כלל, זה צריך להיעשות בתא כפפות בלחות נמוכה, בעיקר אם נעשה שימוש חוזר בשמן המינרלי.
  3. מערבבים את השמנים על ידי מערבולת במהירות הסיבוב המרבית (3200 סל"ד) למשך 10 שניות, מוסיפים את התערובת לבקבוקון המכיל את תערובת השומנים בכלורופורם ומניחים אותה מיד על מערבל המערבולות. מערבולת ל-10-15 שניות במהירות הסיבוב המרבית (3200 סל"ד). תערובת השומנים בשמן שנוצרת צריכה להיות מעט עכורה, שכן השומנים אינם מומסים במלואם בשמן אלא מפוזרים כאגרגטים קטנים24.
  4. שים את פיזור השומנים בשמן בסוניקטור אמבטיה (ראה טבלת חומרים) עם הספק על-קולי של 80 W ותדר הפעלה של 40 קילוהרץ בטמפרטורת החדר למשך 30 דקות. יש להשתמש בתערובת באופן מיידי או לאחסן בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס למשך 24 שעות לכל היותר.

2. יצירת שלפוחית

  1. הרכיבו את הפיר המודפס בתלת-ממד (קובץ משלים 1) העשוי משרף שחור (ראו טבלת חומרים) על לוח ההתעוררות של הספסל והגדירו את מהירות הסיבוב ל-1,200 סל"ד.
  2. הרכיבו את תא ה-cDICE המודפס בתלת-ממד (קובץ משלים 2) העשוי משרף שקוף (ראו טבלת חומרים) על הפיר (איור 1A,B).
  3. הכן פתרונות אקטין וחלבונים קושרי אקטין (ABP) בנפרד בנפח כולל של 20 μL.
    1. הכן 1-10 מיקרומטר של אקטין במאגר אקטין כדורי (G-buffer), כולל 10% ATTO 488 אקטין (ראה טבלת חומרים).
      הערה: 1x G-buffer מורכב מ-5 mM של Tris-HCl, pH 8.0 ו-0.2 mM של CaCl2.
    2. הוסיפו חיץ פילמור אקטין נימה (F-buffer) כדי להתחיל בפולימריזציה של אקטין על קרח. שמור את הפתרונות על קרח כדי להאט את הפילמור של אקטין לפני הוספת crosslinker.
      הערה: מאגר F 1x מכיל 50 mM של KCl, 2 mM של MgCl2, ו-3 mM של ATP ב-10 mM של Tris, pH 7.5.
    3. המתן במשך 15 דקות כדי לאפשר ייזום של פילמור אקטין על קרח לפני שתוסיף לינקרים צולבים בעלי עניין ביחס הטוחנת הרצוי. שמור את התמיסה על קרח עד לעטיפה.
    4. הכינו חלבונים קושרי אקטין (ABPs) בנפרד במיקרו-צינור (איור 1C).
      הערה: שלב זה מבוצע כאשר שילוב של ABPs (למשל, מיוזין, α-אקטינין, fascin, Arp2/3 complex) מתמצת עם אקטין 25,26,27. במקרים כאלה, הכמות הרצויה של כל ABP נלקחת מהמלאי שלה ומתווספת למיקרו-טיוב המיועד ל-ABPs. מכיוון שהפתרון הכולל הוא להיות 20 μL, יש להכין ציטוטים מלאי של ABPs כך שהכמות הרצויה של תערובת ה- ABP הכוללת לא תעלה על 5-6 μL. ה- ABP היחיד המשמש בתוצאות המייצגות כאן הוא קסם, שהכנתו מוזכרת להלן.
      1. Aliquot 1.57 μL של fascin מתוך 1.75 מ"ג /מ"ל של מלאי fascin (ראה טבלת חומרים), ולהוסיף ישירות לתמיסת אקטין בשלב 2.7. זה מתאים 2.5 μM של fascin בתמיסה.
  4. הוסף 7.5% ממדיום גרדיאנט הצפיפות (ראה טבלת חומרים) לתמיסת האקטין כדי ליצור גרדיאנט צפיפות בין הפאזה החיצונית והפנימית מימית כדי להקל על שקיעת GUV.
  5. מחלקים 700 μL של התמיסה החיצונית של 200 mM של גלוקוז לתוך החדר (איור 1D, משמאל).
    הערה: התנודות של התמיסה הפנימית קובעות את ריכוז הגלוקוז. עבור ניסויים אלה, האוסמולריות של התמיסה הפנימית היא ~ 200 mOsm, ולכן תמיסת גלוקוז של 200 mM משמשת כפתרון החיצוני.
  6. הוסיפו כמות מספקת של תערובת שמן שומנים (>3 מ"ל בהתבסס על גודל התא) לתוך התא עד למילוי של 60%-80% מהתא (איור 1D, מימין). ייווצר ממשק בין תערובת השומנים-שמן לבין התמיסה החיצונית.
  7. העברת ABPs (שהוכן בשלב 2.3.4) לפתרון אקטין. באמצעות פיפטה רגילה של 100-1000 μL, מעבירים מיד את ה-700 μL של תערובת השומנים-שמן לתערובת האקטין-ABP (איור 1E, משמאל). פיפטה למעלה ולמטה 8 פעמים כדי ליצור טיפות חד-שכבתיות בגודל תא בקוטר של 7-100 מיקרומטר (איור 1E, אמצע).
    הערה: יש להשלים את שלב 2.7 תוך מספר שניות כדי להימנע מכל הרכבה של רשת אקטין לפני האנקפסולציה. לכן, לפני ביצוע הצעד, ודא כי קצות פיפטה כבר מוכנסים לתוך pipettes מוכן להעביר את התערובות.
  8. באמצעות אותה פיפטה של 100-1000 μL, מיד מחלקים את כל האמולסיה לתא המסתובב. טיפות ירכשו עלון שני של שומנים על ידי חציית מונו-שכבת השומנים בממשק הפתרון החיצוני של השמן, ובכך ייצרו GUVs (איור 1E, מימין).
  9. מוציאים את התא מצלחת הערבוב ומשליכים את רוב תערובת השומנים-שמן על ידי הטיית התא במיכל הפסולת כך שחלק גדול מתערובת שמן השומנים מנוקז מהפתח הגדול שבמרכז התא.
    הערה: בדרך זו, תערובת שמן השומנים נמשכת מהתא, תוך הימנעות מערבוב של תערובת שמן שומנים עם התמיסה החיצונית בשלב הבא.
  10. החזיקו את התא כשהמכסה שלו פונה לכיוון המשתמש. פתחו את מכסה התא והטו מעט את התא לכיוון המשתמש. הממשק בין התמיסה החיצונית המכילה GUVs לבין תערובת שמן השומנים נראה מפתח התא (שם נמצא המכסה).
  11. באמצעות פיפטה, אספו מספיק תמיסות חיצוניות המכילות GUVs וחלקו 50-300 מיקרול' של הפתרון החיצוני לצלחת של 96 בארות כדי להשיג צפיפות מתאימה של GUVs.
    הערה: בעקבות פרוטוקול זה, בסך הכל כ-2 x 105 GUVs משוחררים בפתרון החיצוני בתוך התא. פיזור ה-GUV לא כומת; עם זאת, הקוטר של כ -90% של GUVs הוא בטווח של 12-30 μm. GUVs עם כל קוטר בטווח של 7-50 מיקרומטר ניתן למצוא באוכלוסייה. בהתאם למדיום שיפוע הצפיפות העטוף, גודל ה-GUV ועומק הפתרון בלוח הבאר, לוקח ל-GUVs 2-15 דקות להתיישב על פני השטח. התשואה של GUVs עם חבילות אקטין משוחזרות היא כ -90%.

3. הדמיה ושחזור תמונה בתלת-ממד

  1. הגדר את לוחית הבאר 96 על הבמה של מיקרוסקופ הפוך המצויד ביחידת קונפוקל של דיסק מסתובב (או סריקת לייזר), EMCCD או מצלמת sCMOS, ועדשת מטרה טבילת שמן 60x (ראה טבלת חומרים).
  2. התמקד בכל אזור עניין (ROI) וקח רצף תמונות z-stack מה- ROI עם מרווח z-step של 0.5 מיקרומטר.
    הערה: מכיוון שניתן לעקור מעט את ה-GUVs על פני השטח לאורך זמן, מומלץ לצלם קבוצה מרובת אורכי גל של תמונות בכל מישור z אם מצלמים פלואורופורים מרובים, כלומר לצלם קבוצה של תמונות של 561 ננומטר ו-488 ננומטר בכל נתיב z בכל פעם כדי ללכוד תמונות ATTO 488 actin ו-Rhod PE.
  3. שמור כל רצף תמונה של z-stack בתבנית .tiff.
  4. פתח רצף תמונות בעל עניין בתוכנת עיבוד תמונה (ImageJ/Fiji). זהה את התמונה בעוצמה הגבוהה ביותר. החזק את "ctrl+shift+c" כדי לפתוח את החלון בהירות וניגודיות ולחץ על איפוס.
  5. מתפריט ImageJ/Fiji, עבור אל נתח > הגדר קנה מידה והזן את המרחק הפיזי הידוע ואת היחידה שלו עבור כל פיקסל תמונה.
  6. מתפריט ImageJ/Fiji, עבור אל Image > Stacks > פרויקט תלת-ממד כדי לשחזר תמונה תלת-ממדית ממחסנית z. הגדר את "שיטת ההקרנה" כנקודת בהירות, "ריווח פרוסות (μm)" כ - 0.5, וסימן ביקורת אינטרפולציה. ניתן להשתמש באפשרויות ברירת המחדל עבור שאר ההגדרות.
    הערה: ייתכן שמרווחי z במיקרוסקופים מסוימים אינם מכוילים, והתנועה בפועל בכיוון z עשויה להיות שונה במקצת מהמרווח z שהוזן (כלומר, 0.5 מיקרומטר). במקרים כאלה, ניתן להשתמש בדגימת כיול תלת-ממדית כגון מיקרו-ספירות פלואורסצנטיות בקוטר ידוע כדי לקבל את מרווח ה-z בפועל. ערך זה ישמש אפוא כ"מרווח פרוסות (μm)" עבור הקרנה תלת-ממדית.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

כדי להדגים את הדור המוצלח של GUVs של שלדיים באמצעות הפרוטוקול הנוכחי, נבנו מחדש מבנים של צרור קסין-אקטין ב-GUVs. Fascin הוא קרוסלינקר קצר של חוטי אקטין היוצר צרורות אקטין נוקשים המיושרים במקביל ומטוהר מ- E. coli כחלבון היתוך גלוטתיון-S-טרנספראז (GST)26. 5 μM של אקטין שוחזר לראשונה, כולל 0.53 μM של ATTO488 אקטין במאגר פילמור אקטין ו-7.5% ממדיום שיפוע הצפיפות. עם הוספת קסין בריכוז של 2.5 מיקרומטר ועטיפת תערובת הפאסין-אקטין, נוצרו מבני צרור אקטין ב-GUVs. רצפי תמונה קונפוקליים של Z-stack של מ...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

שיטות שונות ליצירת GUVs נחקרו ליצירת תאים סינתטיים עם זאת, המורכבות של ההליכים, זמן ממושך להשגת אנקפסולציה, הגבלת סוגי שומנים והרכב מולקולרי של האנקפסולנט, הצורך בכימיקלים לא פיזיולוגיים כדי להקל על אנקפסולציה, תפוקת GUV נמוכה וחוסר עקביות ביעילות האנקפסולציה המשיכו לאתגר חוקרים בתחום זה. בהתחשב במגוון הרחב של מחקרים פוטנציאליים שניתן להתחיל בביולוגיה סינתטית מלמטה למעלה, גישת אנקפסולציה חלקה של GUV בתפוקה גבוהה התואמת להרכבי שומנים שונים ויכולה לתמצת כל מולקולות ללא קשר לגודלן עשויה לדרבן הזדמנויות חדשות לחקור מערכות סי...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

המחברים מצהירים על היעדר ניגודי עניינים.

תודות

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

APL מכיר בתמיכה של מלגת מחקר של הומבולדט לחוקרים מנוסים ומהקרן הלאומית למדע (1939310 1817909) ומהמכונים הלאומיים לבריאות (R01 EB030031).

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
18:1 Liss Rhod PE ליפיד בכלורופורםAvanti Polar Lipids810150C
96 Well אופטי Btm בור פולימרBase ThermoFisher Scientific165305
אקטין משריר השלד של ארנבשלד ציטוAKL99-A
ATTO 488-אקטין משריר השלד של ארנבHypermol8153-01
מיקרו-צינורות אקסיגנס (200 ומיקרו; L)פישר סיינטיפיק14-222-262לטיפול ב- ABPs
שרף שחורFormlabsRS-F2-GPBK-04
כולסטרול (אבקה)Avanti Polar Lipids700100P
CholoroformSigma Aldrich67-66-3
שרף שקוףFormlabsRS-F2-GPCL-04
CSU-X1 יחידת סורק קונפוקליYOKOGAWACSU-X1
מדיום שיפוע צפיפות (Optiprep)Sigma-AldrichD1556
DOPC ליפיד בכלורופורםAvanti Polar Lipids850375C
Fascinתוצרת ביתN/A
F-bufferתוצרת ביתN/A
Fisherbrand מיקרו-צינורות (1.5 מ"ל)פישרסיינטיפיק05-408-129
FS02 SonicatorFischer ScientificFS20
G-bufferתוצרת ביתN/A
גלוקוזSigma-Aldrich158968
מצלמת iXon X3 אנדורDU-897E-CS0
שמן מינרליAcros Organics8042-47-5
אולימפוס IX81 מיקרוסקופ הפוךאולימפוסIX21
Olympus PlanApo N 60x מיקרוסקופ שמן אובייקטיביOlumpus1-U2B933
שמן סיליקוןSigma-Aldrich317667

מקורות

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Groaz, A., et al. Engineering spatiotemporal organization and dynamics in synthetic cells. Wiley Interdisciplinary Reviews: Nanomedicine and Nanobiotechnology. 13 (3), 1685(2021).
  2. Diltemiz, S. E., et al. Use of artificial cells as drug carriers. Materials Chemistry Frontiers. 5, 6672-6692 (2021).
  3. Liu, A. P., Fletcher, D. A. Biology under construction: In vitro reconstitution of cellular function. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 10 (9), 644-650 (2009).
  4. Ganzinger, K. A., Schwille, P. More from less - bottom-up reconstitution of cell biology. Journal of Cell Science. 132 (4), 227488(2019).
  5. Bashirzadeh, Y., Liu, A. P. Encapsulation of the cytoskeleton: Towards mimicking the mechanics of a cell. Soft Matter. 15 (42), 8425-8436 (2019).
  6. Blanchoin, L., Boujemaa-Paterski, R., Sykes, C., Plastino, J. Actin dynamics, architecture, and mechanics in cell motility. Physiol reviews. 94 (1), 235-263 (2014).
  7. Angelova, M. I., Dimitrov, D. S. Liposome electroformation. Faraday Discussions of the Chemical Society. 81, 303-311 (1986).
  8. Tsumoto, K., Matsuo, H., Tomita, M., Yoshimura, T. Efficient formation of giant liposomes through the gentle hydration of phosphatidylcholine films doped with sugar. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 68 (1), 98-105 (2009).
  9. Bailey, A. L., Cullis, P. R. Membrane fusion with cationic liposomes: Effects of target membrane lipid composition. Biochemistry. 36 (7), 1628-1634 (1997).
  10. Haluska, C. K., Riske, K. A., Marchi-Artzner, V., Lehn, J. M., Lipowsky, R., Dimova, R. Time scales of membrane fusion revealed by direct imaging of vesicle fusion with high temporal resolution. Proceedings of the National Academy of Sciences. 103 (43), 15841-15846 (2006).
  11. Nishimura, K., Suzuki, H., Toyota, T., Yomo, T. Size control of giant unilamellar vesicles prepared from inverted emulsion droplets. Journal of Colloid and Interface Science. 376 (1), 119-125 (2012).
  12. Pautot, S., Frisken, B. J., Weitz, D. A. Production of unilamellar vesicles using an inverted emulsion. Langmuir. 19 (7), 2870-2879 (2003).
  13. Stachowiak, J. C., Richmond, D. L., Li, T. H., Liu, A. P., Parekh, S. H., Fletcher, D. A. Unilamellar vesicle formation and encapsulation by microfluidic jetting. Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (12), 4697-4702 (2008).
  14. Noireaux, V., Liu, A. P. The new age of cell-free biology. Annual Review of Biomedical Engineering. 22, 51-77 (2020).
  15. Ho, K. K. Y., Murray, V. L., Liu, A. P. Engineering artificial cells by combining HeLa-based cell-free expression and ultrathin double emulsion template. Methods in Cell Biology. , 303-318 (2015).
  16. Akashi, K., Miyata, H., Itoh, H., Kinosita, K. Preparation of giant liposomes in physiological conditions and their characterization under an optical microscope. Biophysical Journal. 71 (6), 3242-3250 (1996).
  17. Méléard, P., Bagatolli, L. A., Pott, T. Giant unilamellar vesicle electroformation: From lipid mixtures to native membranes under physiological conditions. Methods in Enzymology. 465, 161-176 (2009).
  18. Walde, P., Cosentino, K., Engel, H., Stano, P. Giant vesicles: Preparations and applications. ChemBioChem. 11 (7), 848-865 (2010).
  19. Pécheur, E. I., Martin, I., Ruysschaert, J. M., Bienvenüe, A., Hoekstra, D. Membrane fusion induced by 11-mer anionic and cationic peptides: A structure− function study. Biochemistry. 37 (8), 2361-2371 (1998).
  20. Morigaki, K., Walde, P. Giant vesicle formation from oleic acid/sodium oleate on glass surfaces induced by adsorbed hydrocarbon molecules. Langmuir. 18 (26), 10509-10511 (2002).
  21. Majumder, S., Wubshet, N., Liu, A. P. Encapsulation of complex solutions using droplet microfluidics towards the synthesis of artificial cells. Journal of Micromechanics and Microengineering. 29 (8), 83001(2019).
  22. Abkarian, M., Loiseau, E., Massiera, G. Continuous droplet interface crossing encapsulation (cDICE) for high throughput monodisperse vesicle design. Soft Matter. 7 (10), 4610-4614 (2011).
  23. Van de Cauter, L., et al. Optimized cDICE for efficient reconstitution of biological systems in giant unilamellar vesicles. ACS Synthetic Biology. 10 (7), 1690-1702 (2021).
  24. Claudet, C., In, M., Massiera, G. Method to disperse lipids as aggregates in oil for bilayers production. The European Physical Journal E. 39 (1), 1-6 (2016).
  25. Bashirzadeh, Y., Wubshet, N. H., Liu, A. P. Confinement Geometry tunes fascin-actin bundle structures and consequently the shape of a lipid bilayer vesicle. Frontiers in Molecular Biosciences. 7, 610277(2020).
  26. Bashirzadeh, Y., et al. Actin crosslinker competition and sorting drive emergent GUV size-dependent actin network architecture. Communications Biology. 4, 1136(2021).
  27. Bashirzadeh, Y., Moghimianavval, H., Liu, A. P. Encapsulated actomyosin patterns drive cell-like membrane shape changes. bioRxiv. , (2021).
  28. Litschel, T., et al. Reconstitution of contractile actomyosin rings in vesicles. Nature Communications. 12 (1), 1-10 (2021).
  29. Vitale, S. A., Katz, J. L. Liquid droplet dispersions formed by homogeneous liquid− liquid nucleation:"The Ouzo effect.". Langmuir. 19 (10), 4105-4110 (2003).
  30. Pautot, S., Frisken, B. J., Weitz, D. A. Engineering asymmetric vesicles. Proceedings of the National Academy of Sciences. 100 (19), 10718-10721 (2003).
  31. Deshpande, S., Dekker, C. On-chip microfluidic production of cell-sized liposomes. Nature Protocols. 13 (5), 856-874 (2018).
  32. Deshpande, S., Caspi, Y., Meijering, A. E. C., Dekker, C. Octanol-assisted liposome assembly on chip. Nature Communications. 7, 10447(2016).
  33. Wubshet, N. H., Bashirzadeh, Y., Liu, A. P. Fascin-induced actin protrusions are suppressed by dendritic networks in GUVs. Molecular Biology of the Cell. 32 (18), 1634-1640 (2021).

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה

בקש הרשאה

תגיות

cDICE

מאמרים קשורים