RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
באופן מסורתי, תרבית תאים מבוצעת על מצעים מישוריים המחקים בצורה גרועה את הסביבה הטבעית של תאים in vivo. כאן אנו מתארים שיטה לייצור מצעי תרביות תאים עם גיאומטריות מעוגלות רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית וחלבונים חוץ-תאיים מיקרו-פטרייתיים, המאפשרת חקירה שיטתית של חישה תאית של רמזים חוץ-תאיים אלה.
המטריצה החוץ-תאית היא מווסת חשוב של תפקוד התא. רמזים סביבתיים הקיימים במיקרו-סביבה התאית, כגון התפלגות ליגנד וגיאומטריה של רקמות, הוכחו יותר ויותר כממלאים תפקידים קריטיים בשליטה על הפנוטיפ וההתנהגות של התא. עם זאת, רמזים סביבתיים אלה והשפעתם על תאים נחקרים לעתים קרובות בנפרד באמצעות פלטפורמות in vitro המבודדות רמזים בודדים, אסטרטגיה המפשטת בכבדות את המצב המורכב in vivo של רמזים מרובים. גישות הנדסיות יכולות להיות שימושיות במיוחד כדי לגשר על פער זה, על ידי פיתוח מערכי ניסוי הלוכדים את המורכבות של המיקרו-סביבה in vivo , אך שומרים על מידת הדיוק והמניפולציה של מערכות in vitro .
מחקר זה מדגיש גישה המשלבת דפוסים של חלבונים אולטרה סגולים (UV) ומיקרו-פבריקציה של מצעים מבוססי ליתוגרפיה, אשר יחדיו מאפשרים חקירה בתפוקה גבוהה של התנהגויות תאים בסביבות מרובות-חתכים. באמצעות צילום UV ללא מסיכה, ניתן ליצור התפלגויות חלבונים מורכבות ודבקות על מצעי תרביות תאים תלת-ממדיים (תלת-ממדיים) על שבבים המכילים מגוון רמזים גיאומטריים מוגדרים היטב. ניתן להשתמש בטכניקה המוצעת עבור מצעי תרבית העשויים מחומרים פולימריים שונים ובשילוב עם אזורים בתבנית דבק של מגוון רחב של חלבונים. עם גישה זו, תאים בודדים, כמו גם monolayers, יכולים להיות כפופים לשילובים של רמזים גיאומטריים ורמזי הנחיית מגע המוצגים על ידי מצעים דפוס. מחקר שיטתי תוך שימוש בשילובים של חומרי שבבים, תבניות חלבונים וסוגי תאים יכול אפוא לספק תובנות בסיסיות על תגובות תאיות לסביבות רב-תכליתיות.
In vivo, תאים נתונים למגוון רחב של רמזים סביבתיים שיכולים להיות בעלי אופי מכני, פיזיקלי וביוכימי שמקורם במטריצה החוץ-תאית (ECM). רמזים סביבתיים רבים זוהו כממלאים תפקידים חיוניים בוויסות התנהגות התאים, כגון התפשטות, התמיינות והגירה 1,2,3,4,5. אחת התופעות הנחקרות ביותר היא הנחיית מגע, המתארת יישור תאים בתיווך הידבקות לאורך תבניות ביוכימיות או טופוגרפיות אניזוטרופיות הנמצאות על המצע החוץ-תאי 6,7,8,9,10,11. מעבר להכוונת יישור התאים, הוכח כי רמזים להנחיית מגע משפיעים גם על תכונות אחרות של תאים כגון נדידת תאים, ארגון חלבונים תוך-תאיים, צורת התא וגורל התא 12,13,14,15. בנוסף, הארכיטקטורה הגיאומטרית של הסביבה התאית התלת-ממדית זכתה להכרה גם בהשפעתה הרגולטורית על התנהגותהתאים 16,17. בגוף האדם, התאים נחשפים למגוון של גיאומטריות מעוקלות, החל מסיבי קולגן בקנה מידה זעיר, נימים וגלומרולי, ועד לדלקות מזוקליות ועורקים18,19. באופן מעניין, מחקרים במבחנה שנערכו לאחרונה הראו שתאים יכולים לחוש ולהגיב לרמזים פיזיקליים כאלה, מהננו-זירה ועד ל-20,21,22,23.
עד כה, רוב המחקרים שחקרו את תגובת התאים לרמזים סביבתיים בוצעו ברובם באמצעות מערכי ניסוי המבודדים רמזים בודדים. בעוד שגישה זו אפשרה התקדמות אדירה בהבנת המנגנונים הבסיסיים העומדים מאחורי החישה התאית של רמזים סביבתיים, היא משחזרת בצורה גרועה את סביבת in vivo המציגה בו זמנית רמזים מרובים. כדי לגשר על הפער הזה, כדאי לפתח פלטפורמות תרבות שבמסגרתן ניתן לשלוט ברמזים סביבתיים מרובים באופן עצמאי ובו-זמני. תפיסה זו צברה אחיזה גוברת לאחרונה24,25, עם מחקרים המשלבים נוקשות מטריצה וצפיפות ליגנד 26,27,28,29, נוקשות מצע ונקבוביות 30, נוקשות המצע ונפח מיקרוניש תלת-ממדי31, טופוגרפיית פני השטח ורמזי הנחיית מגע 32,33,34 ורמזי הנחיית מגע בקנה מידה ננומטרי עם רמזי הנחיית עקמומיות מזוקליים23., עם זאת, עדיין מאתגר לשלב רמזים להנחיית מגע עם מגוון גיאומטריות תלת-ממדיות באופן מבוקר ותפוקה גבוהה.
פרוטוקול מחקר זה נותן מענה לאתגר זה ומציג שיטה ליצירת מצעי תרביות תאים עם שילוב מבוקר של אזורי דבק בתבנית של חלבוני ECM (רמזים להנחיית מגע) ועקמומיות המצע (רמזים גיאומטריים). גישה זו מאפשרת לנתח את תגובת התאים בסביבה רב-תכליתית ביומימטית באופן שיטתי ובעל תפוקה גבוהה. הידע הנרכש יכול לסייע בהבנה נוספת של התנהגות התאים בסביבות מורכבות וניתן להשתמש בו כדי לתכנן חומרים מאלפים עם תכונות המנווטות את תגובות התאים לתוצאה הרצויה.
פוטו-פטרינג של חלבון תלת-ממדי
יצירת אזורי דבק של חלבוני ECM (רמזים להנחיית מגע) על חומרי תרבית תאים יכולה להתבצע באמצעות מגוון טכניקות, לדוגמה, על ידי דפוס אולטרה סגול עמוק (DEEP-UV) או הדפסה מיקרו-קונקרטית35,36. דפוס UV עמוק עושה שימוש באור UV המוקרן דרך מסכה על חומר פולימרי כדי לפרק פולימרים של פסיבציה במיקומים ספציפיים על מצע תרבית התאים. המצע המעוצב מודגר לאחר מכן עם ליגנד של עניין, וכתוצאה מכך נוצרים אזורי דבק התומכים בהתקשרות תאים ובתרבית במקומות מוגדרים מראש 12,37,38. דרך חלופית להחדרת תבניות חלבונים היא באמצעות הדפסה מיקרו-קונטיקט, שבה חותמות אלסטומריות המכילות צורה רצויה מצופים בחלבון מועדף ונלחצים על מצע תרבית תאים, ובכך מעבירים את ציפוי החלבון שאליו תאים יכולים להיצמד ל-35,37,39,40 . למרבה הצער, מכיוון ששתי הטכניקות מסתמכות על הכנת מסכות ושיטות ליתוגרפיה רכות, הניסויים גוזלים זמן רב ועתירי עבודה, כמו גם מוגבלים מבחינת גמישות התבנית. בנוסף, הן דפוס UV עמוק והן הדפסה מיקרו-קונטיקט מתאימים ביותר לחומרים מישוריים והם קשים מבחינה טכנית, אם לא בלתי אפשריים, לדפוס ליגנדות בסביבה תלת-ממדית.
כדי לשפר את השיטות הקונבנציונליות הללו, Waterkotte et al. שילבו ליתוגרפיה ללא מסיכה, תצהיר אדים כימיים ותרמופורמינג כדי ליצור מצעים פולימריים תלת-ממדיים מיקרו-פטרייתיים41. עם זאת, טכניקה זו מסתמכת על שימוש ביריעות פולימריות הניתנות לתרמופורמציה ומציעה רזולוציה נמוכה של תבנית חלבונים (7.5 מיקרומטר), בעוד שדווח כי תאים מגיבים לתבניות חלבונים גיאומטריות הקטנות עד 0.1 מיקרומטר 2,42. Sevcik et al. תיארו שיטה מבטיחה נוספת לננו-ליגנדות ECM על מצעים המכילים טופוגרפיות של ננו ומיקרומטר43. באמצעות הדפסה מיקרו-קונטקונטקטית, חלבוני ECM הועברו מבולי פולידימתילסילוקסן (PDMS) למצע פולי-רספונסיבי תרמו-רספונסיבי (N-איזופרופילאקרילאמיד) (pNIPAM). לאחר מכן, התכונה התרמו-תגובתית של רשת pNIPAM אפשרה להם להעביר את תבנית החלבון הדו-ממדית (2D) למצע PDMS טופוגרפי (חריצים בעומק 10-100 מיקרומטר), ובכך לשלוט בלוקליזציה של אתרי הידבקות בתכונות טופוגרפיות. עם זאת, לא ניתן לעצב את כל המיקרוטופוגרפיות האפשריות מכיוון שבעיות רטיבות מופחתות מקשות על דפוס מצעים טופוגרפיים עמוקים יותר. דווח כי תעלות עם יחס רוחב-רוחב של עומק לרוחב של 2.4 הן הגבול האולטימטיבי להעברת התבנית בהצלחה למצע הטופוגרפי43. בנוסף, הגמישות של דפוסים משתנים והרזולוציה של התבניות שנוצרו ירודה בשל הדרישה להדפסה מיקרו-קונטקונטקט.
מאמר זה מתאר שיטה המתגברת על צווארי הבקבוק שהוזכרו לעיל ומציעה שיטה גמישה ותפוקה גבוהה ליצירת מצעים מרובי רמזים שיכולים לשמש לתרבית תאים (ראו איור 1). גיאומטריות רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית (צילינדרים, כיפות, אליפסות ומשטחי אוכף) עם עקמומיות הנעה בין ĸ = 1/2500 ל- ĸ = 1/125 μm-1 מתוכננות מראש ומיקרו-פבריקט בשבבי PDMS. לאחר מכן, רמזים להנחיית מגע נוצרים על גבי הגיאומטריות התלת-ממדיות באמצעות מגוון עיצובי תבניות דיגיטליות על ידי שימוש בטכניקת פוטו-פטרינג עם רזולוציה של עד 1.5 מיקרומטר44. לשם כך, שבבי PDMS עוברים בתחילה פסיביזציה כדי למנוע מתאים וחלבונים להידבק; לאחר מכן ניתן להסיר את שכבת הפסיביזציה הזו על ידי שילוב של פוטו-יניטיטור 4-בנזואילבנזיל-טרימתילמוניום כלוריד (PLPP) וחשיפה לאור UV45. מסכה דיגיטלית נועדה לציין את מיקומי החשיפה לקרינת UV, וכך גם את האזור שבו מסירים את שכבת הפסיביציה. חלבונים יכולים להיצמד לאחר מכן לאזורים אלה, מה שמאפשר חיבור תאים. מכיוון שהדפוסים מבוצעים באמצעות מסכה דיגיטלית (ולא פיזית), ניתן ליצור במהירות מגוון דוגמאות ללא הטרחה והעלות הכרוכות בעיצוב וייצור מסכות צילום נוספות. בנוסף, ניתן לעצב על המצע מגוון רחב של חלבוני ECM (למשל, קולגן מסוג I, ג'לטין ופיברונקטין). למרות שפרוטוקול זה מבוצע באמצעות שבבי תרבית תאים העשויים מ- PDMS, ניתן להחיל את העיקרון על כל חומר אחר בעל עניין46.
במחקרים המתוארים בפרוטוקול זה נעשה שימוש בקרטוציטים אנושיים ראשוניים. מחקר זה בוצע בהתאם לעקרונות הצהרת הלסינקי. קרטוציטים ראשוניים בודדו משאריות של רקמות קרנית-רקמות קדבריות אנושיות מניתוחי קרטופלסטיה של ממברנת Descemet, אשר התקבלו ממחלקת הקרנית של המרכז הרב-רקמתי ETB-BISLIFE (Beverwijk, הולנד) לאחר שקיבלו הסכמה מקרב קרובי משפחה של כל התורמים שנפטרו.
הערה: עיין בטבלת החומרים לקבלת פרטים על כל החומרים, הריאגנטים, הציוד והתוכנות המשמשים בפרוטוקול זה.
1. ייצור מצעי תרביות תאים תלת-ממדיות
2. ייצור דגימות PDMS שטוחות (דגימות בקרה)
3. פסיבציה מצעית של מצעי תרבית תאים תלת-ממדית
4. אחסון מצעי תרביות תאים מעוצבים
הערה: ניתן לאחסן מצעי תרביות תאים תלת-ממדיים במהלך שלבים שונים בתהליך.
5. עיצוב מסכות דיגיטליות המשמשות לצילום תמונות
הערה: ניתן לבצע דפוס של מצעים תלת-ממדיים באמצעות מישורי מוקד יחידים או מרובים (ראו איור 3). ניתן להשתמש במישור מוקד יחיד על תכונות שאינן גדולות יותר מהתקן מראה דיגיטלי אחד (DMD, כ-300 מיקרומטר x 500 מיקרומטר) ושאינן גבוהות מדי (50-100 מיקרומטר). במקרה כזה, עצב תבנית דיגיטלית באמצעות מצב TIFF. עבור תכונות החורגות מהממדים של דושן אחד והן גבוהות יחסית, חלקו את התבנית של המצע למספר שלבים. במקרה זה, תבניות מרובות מתוכננות באמצעות מצב PDF שכולם מתמקדים בנפרד במישורי מוקד בודדים.
6. צילום UV של מצעי תרבית תאים תלת-ממדיים
7. דגירה של חלבונים
הערה: מומלץ להשתמש במצעים דגירה טריים של חלבון עבור תרבית תאים. המשך לחלק זה של הפרוטוקול רק אם זריעת התא (שלב 8) נעשית מיד לאחר מכן.
8. זריעת תאים
הערה: פרוטוקול זה משתמש בקרטוציטים ראשוניים אנושיים ובפיברובלסטים עוריים אנושיים. הקרטוציטים נקטפו מרקמת הקרנית האנושית מחולים, בהתאם להנחיות ההולנדיות לשימוש משני בחומרים, ואופיינו בעבר כקרטוציטים47. תאים אלה מתורבתים ב-DMEM בתוספת 5% סרום בקר עוברי (FBS), 1% פניצילין/סטרפטומיצין (P/S), וחומצה 1 mM L-אסקורבית 2-פוספט sesquimagnesium מלח הידרט (ויטמין C) ב-37 °C לכל היותר לארבעה מעברים. פיברובלסטים עוריים אנושיים נרכשו ותרבית ב-DMEM בתוספת 10% FBS ו-1% P/S ב-37 מעלות צלזיוס למשך 15 מעברים לכל היותר. לזריעה של קרטוציטים ופיברובלסטים עוריים על שבב תרבית התאים הפוטו-פטרייתי, נעשה שימוש ב-20,000 תאים לכל שבב.
9. צביעה, רכישת תמונה וניתוח
באמצעות הפרוטוקול המתואר, מצעי תרביות תאי PDMS תלת-ממדיים ניתנים לצילום UV כדי ליצור אזורי דבק מדויקים ותפוקה גבוהה המתאימים לחיבור תאים. בדרך זו, התאים נתונים הן לגיאומטריות המצע הרלוונטיות והן לתבניות ליגנד דביקות בו זמנית. ניתן לנטר בקלות תכונות של תאים כגון כיוון, אזור תא ומספר הידבקויות מוקדיות ולהשתמש בהן כדי להבין טוב יותר את התנהגות התא בסביבות מורכבות דמויות in vivo.
כדי לאמת את אירועי התבנית במצעי PDMS התלת-ממדיים, נמדדו הרכבי פני השטח האטומיים של החומר בשלבים שונים של הפרוטוקול באמצעות ספקטרוסקופיית פוטו-אלקטרונית של קרני רנטגן אטומיות (XPS)48. לסיכום, מדידות ה-XPS הראו את נוכחותן של שרשראות PEG עם אות פחמן מוגבר על דגימות פסיבציה, אשר הופחתה לאחר פוטו-פטרינג. דגירה עם פיברונקטין גרמה לעלייה באות הפחמן, מה שמצביע שוב על הידבקות מוצלחת של חלבון על פני השטח של שבב תרבית התאים. לאחר מכן, רזולוציית התבנית ויישור התכונות התלת-ממדיות אופיינו במגוון בורות קעורים בדוגמת מעגל (ĸ = 1/250 μm-1, ĸ = 1/1,000 μm-1, ו- ĸ = 1/3,750 μm-1, ראו איור 6). מתוך הקרנות בעוצמה המרבית, ניתן להסיק כי תבנית החלבון עוצבה בהצלחה על כל שלוש התכונות התלת-ממדיות. פרופיל העוצמה באיור 6A מראה רזולוציית דפוס גבוהה עם מעברים חדים בין אזורים מעוצבים לאזורים שאינם מעוצבים. בנוסף, הושגה עוצמת חלבון עקבית על פני התבנית השלמה בבור.
הבור הקעור עם ĸ = 1/250 μm-1 עוצב בשיטת מישור המוקד היחיד (תבנית אחת), ואילו הבורות עם ĸ = 1/1,000 μm-1 ו- ĸ = 1/3,750 μm-1 עוצבו באמצעות שניים ושלושה מישורי מוקד (תבניות), בהתאמה. כפי שניתן לראות בהקרנות בעוצמה המרבית באיור 6, שתי השיטות מביאות ליישור מושלם של התבניות על גבי התכונות. לא ניתן להבחין במעברים לא מיושרים בין שני מישורי המוקד והדפוסים השונים.
באמצעות הפרוטוקול המתואר, ניתן ליישם מגוון רחב של עיצובים של תבניות חלבונים על מגוון גיאומטריות (ראו איור 7 ווידאו 1). כדי להמחיש את הרבגוניות של שיטה זו, עוצבו חצאי-גליליים (קמורים וקעורים), משטח אוכף ובור באמצעות קווים ועיגולים ברוחבים שונים. לאחר מכן ניתן להשתמש בחומרים המצולמים לתרבית תאים (ראו איור 7, איור 8, וידאו 2, וידאו 3 ווידאו 4). דוגמה לפיברובלסטים עוריים שעברו תרבית על תבנית (קווי פיברונקטין, אדום, רוחב 5 מיקרומטר ומרווחים של 5 מיקרומטר) קעורה למחצה מוצגת באיור 8, איור 9 ווידאו 4. במהלך הניסוי, התאים חשים ונצמדים למצע תרבית התאים הרב-קוטבי ונשארים בני קיימא לאורך זמן. כפי שניתן לראות מהכתמים האימונופלואורסצנטיים באיור 8, תאים יוצרים הידבקויות מוקדיות (אשכולות וינקולין) בעיקר על קווי הפיברונקטין.
מחקר לדוגמה נוסף העושה שימוש בחומרי תרביות תאים אלה פורסם לאחרונה על ידי קבוצה48 שלנו. במחקר זה, מיופיברובלסטים אנושיים ותאי אנדותל היו נתונים לשילוב של רמזי הנחיית מגע וטופוגרפיות גיאומטריות. In vivo, שני סוגי התאים חווים רמזים של עקמומיות והנחיית מגע ברקמות מקומיות, כגון בכלי הדם האנושיים. על ידי הכפפת התאים במבחנה לסביבה המשלבת את שני הרמזים הסביבתיים, ניתן לשחזר את המצב in vivo , ולספק הבנה מעמיקה יותר של תפקיד המיקרו-סביבה על התנהגות התאים. הודגם כי מיופיברובלסטים אנושיים מתיישרים עם רמזי הנחיית מגע (קווי פיברונקטין מקבילים) על מצעים גליליים קעורים48. עם זאת, על מבנים קמורים עם עקמומיות גוברת, הרמזים הגיאומטריים ביטלו את הרמזים הביוכימיים, מה שמרמז על כך שמיופיברובלסטים יכולים לחוש הן את מידת העקמומיות והן את הסימן של העקמומיות. באופן מעניין, תאי אנדותל יכלו לדבוק רק במצעים הרב-חדים הקעורים ולא במצעי ה-PDMS הקמורים. על מצעים קעורים, בעלי תבנית חלבונים, תאי האנדותל מכוונים לכיוון רמז הנחיית המגע. לידע בסיסי זה במבחנה יש רלוונטיות פיזיולוגית בתחום הנדסת רקמות כלי הדם והוא יכול בסופו של דבר לסייע בתכנון מבנים חכמים להנדסת רקמות.

איור 1: ציר הזמן הניסויי של יישום רמזי הנחיית מגע על מצעי תרביות תאים תלת-ממדיות. ראשית, שבבי תרבית תאים חיוביים מיוצרים מתבנית PDMS שלילית המכילה מגוון של גיאומטריות. PDMS לא מרוסק נשפך לתוך התבנית ונרפא במשך 3 שעות ב 65 °C (65 °F). לאחר מכן, ה-PDMS מטופל ב-O2-פלזמה ומדגר עם PLL ו-mPEG-SVA (כחול, מסומן) כדי להעביר את פני השטח של מצע תרבית התאים. לאחר הכביסה, המצע מתהפך הפוך בטיפה של פוטו-יניטיטור (PLPP, ירוק, מסומן) ו-UV-photopatterned באמצעות גישת LIMAP. כאן, מסיכה דיגיטלית עם תבנית המוגדרת על-ידי המשתמש משמשת כדי לבקע את שכבת הפסיביציה במיקומים מוגדרים. לאחר מכן, ניתן לדוגר תמיסת חלבון (אדום, מסומן) והיא תיצמד רק למקומות שבהם מסירים את שכבת הפסיביציה. תאים שנזרעו על המצע נתונים הן לגיאומטריה והן לדפוסי חלבונים, מה שמאפשר לחקור את התנהגות התאים בסביבות מורכבות המחקות in vivo. קיצורים: PDMS = פולידימתילסילוקסן; mPEG-SVA = מתוקסיפוליאתילן גליקול-סוקינימידיל ולראט; PLPP = 4-בנזואילבנזיל-טרימתילמוניום כלוריד; LIMAP = ספיחה מולקולרית הנגרמת על ידי אור של חלבונים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 2: שלבים שונים במהלך הייצור וההתפשטות של מצע תרביות התאים התלת-ממדיות. תבנית הזכוכית השלילית (#1) תוכננה עם תוכנת תכנון בסיוע מחשב ומיוצרת באמצעות טכניקת כתיבה ישירה של femtosecond-laser. תבנית זו משמשת לייצור שבב PDMS חיובי ביניים (#2) ועובש PDMS שלילי (#3), המשמשים לאחר מכן לייצור שבב תרבית התאים הסופי (#4). קיצור: PDMS = פולידימתילסילוקסן. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 3: המחשה סכמטית של שתי שיטות התבנית. משמאל: צילום UV מתבצע על תכונות קטנות יותר (בערך DMD אחד) באמצעות מישור מוקד יחיד ותבנית. כתוצאה מכך, התכונה המלאה מעוצבת בבת אחת. מימין: כאשר נעשה שימוש בתכונות גדולות יותר (גדול יותר מ-DMD אחד), התבנית מחולקת על פני מישורי מוקד ותבניות מרובים. קיצור: DMD = התקן מראה דיגיטלי. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 4: דוגמה טיפוסית למצע רגיל ומיובש עם דגירה בחלבון. הקרנות בעוצמה מרבית (XY) ותצוגות אורתוגונליות (XZ) של מצעים רגילים ומיובשים עם דגירה בחלבון. בעת שטיפת מצע תרבית תאים בתבנית לאחר הדגירה עם תמיסת חלבון, חשוב תמיד לשמור על הדגימה רטובה. אף על פי שהתבנית זהה בכל התמונות המופיעות בתכונות (ĸ = 1/1,000 μm-1), הג'לטין-פלואורסציין (ירוק) הצטבר ויצר גוש מרכזי כאשר הדגימה הושארה לייבוש למשך מספר שניות. אם הדגימה תמיד נשארת רטובה, ניתן להבחין בדפוסי חלבון נכונים. סרגלי קנה מידה = 100 μm. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 5: תמונות ברייטפילד לאחר הזריעה. קרטוציטים ראשוניים (משמאל) ופיברובלסטים עוריים (מימין) 4 שעות לאחר זריעה על תכונות גיאומטריות תלת-ממדיות (בור קעור של ĸ = 1/1,000 מיקרומטר-1 וחצי-גליליים של ĸ = 1/500, 1/375, 1/250, 1/175 ו-1 /125 μm-1). התוספות השמאליות העליונות מייצגות את תבנית השורה המשמשת ליצירת התבניות של הגיאומטריות. חצים לבנים מציינים תאים מתפשטים שכבר מראים יישור. סרגלי קנה מידה = 250 μm. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 6: אפיון תבניות מעגליות בבורות קעורים. (A) ההטלה בעוצמה המרבית (XY) והראייה האורתוגונלית (XZ) של בור אקונקאב (ĸ = 1/250 μm-1) בתבנית LIMAP (linewidth: 20 μm, רוחב רווח: 20 μm) ודגירה עם ג'לטין-פלואורסצין (ירוק). פרופיל העוצמה לאורך הקו הלבן משורטט כנגד המרחק, ומציג איכות ורזולוציה עקבית של תבנית. (B) דפוסים נוספים המבוצעים בבורות קעורים עם ĸ = 1/1,000 μm-1 ו- ĸ = 1/3750 μm-1, ומראים גמישות במונחים של תכונות גיאומטריות שיכולות לשמש לדפוס. שוב, הן הקרנות העוצמה המרבית (XY) והן התצוגות האורתוגונליות (XZ) מוצגות באופן חזותי. סרגלי קנה מידה = 100 μm. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 7: נתוני מיקרוסקופיה תלת-ממדית של מבנים מעוצבים. דוגמאות אופייניות לחומרים תלת-ממדיים בתבנית תרבית תאים לאחר פוטו-פטריה ותרבית תאים, שהומחשו באמצעות תוכנת עיבוד תלת-ממדית. (A) חצי-צילינדר קמור עם קווים ברוחב 10 מיקרומטר (רודמין-פיברונקטין, אדום) ופערים ברוחב 10 מיקרומטר. סרגל קנה מידה = 5 μm. (B) פיברובלסטים עוריים מוכתמים עבור F-אקטין (ירוק) מתורבתים על סמי-גלילינדר קעור עם קווים ברוחב 20 מיקרומטר (רודמין-פיברונקטין, אדום) ומרווחים ברוחב 20 מיקרומטר. סרגל קנה מידה = 5 μm. (C) משטח אוכף עם קווים ברוחב 20 מיקרומטר (רודמין-פיברונקטין, אדום) ומרווחים ברוחב 20 מיקרומטר. סרגל קנה מידה = 5 μm. (D) בור קעור עם עיגולים קונצנטריים של קווים ברוחב 20 מיקרומטר (ג'לטין-פלואורסציין, ירוק) ומרווחים ברוחב 20 מיקרומטר. שלד ה-F-אקטין של הקרטוציטים האנושיים מוכתם באמצעות פאלואידין ומודגם באדום. סרגל קנה מידה = 200 μm. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 8: צביעה אימונופלואורסצנטית של פיברובלסטים עוריים אנושיים על פיברובלסטים עוריים אנושיים על גבי חצי-גליל קעור פוטו-פוטר, קעורים ( A) (A) של הקרנה בעוצמה מרבית (XY) ומקטעים אורתוגונליים (XZ ו-YZ) של פיברובלסטים עוריים אנושיים שעברו תרבית במשך 24 שעות על תבנית (קווי פיברונקטין, אדום, ברוחב 5 מיקרומטר ו-5 מיקרומטרים) של סמיצילינדר קעור. התאים מוכתמים עבור F-אקטין (magenta), וינקולין (ירוק) וגרעינים (כחול). סרגל קנה מידה = 100 μm. (B) זום-אין של תא הנצמד לסביבה הרב-תכליתית. סרגלי קנה מידה = 50 μm. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 9: תמונות בהילוך מהיר של ברייטפילד של פיברובלסטים עוריים אנושיים על גליל קעור בדוגמת תבנית. החצי-צילינדר הקעור (ĸ = 1/250 μm-1) עוצב בקווים מקבילים (ברוחב 5 מיקרומטר ובפערים של 5 מיקרומטר) והודגם עם רודמין-פיברונקטין לפני זריעת התא. הדמיית ההפסקה בזמן מתחילה שעה אחת לאחר זריעת התאים הראשונית (שמאלה, 0 דקות), כאשר התאים עדיין מעוגלים ואינם דבקים (חצים). לאחר כ-24 שעות (באמצע, 1,420 דקות), התאים דבקו במצע הרב-קוטבי והראו תגובת יישור על פי תבנית הנחיית המגע. הן תגובת היישור והן יכולת הכדאיות של התא נשמרות לאורך כל משך התרבית (מימין, 3,180 דקות). סרגלי קנה מידה = 200 μm. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
סרטון 1: תבנית לדוגמה על מצע גלילי תלת-ממדי. ייצוג תלת-ממדי של גליל קמור בדוגמת רודמין-פיברונקטין (אדום). אנא לחץ כאן כדי להוריד את הסרטון הזה.
סרטון 2: ייצוג תלת-ממדי של פיברובלסטים עוריים שעברו תרבית על מצע גלילי תלת-ממדי (ĸ = 1/500 מיקרומטר-1). פיברובלסטים עוריים תרבית במשך 24 שעות על תבנית (קווי פיברונקטין, אדום, רוחב 10 מיקרומטר ומרווחים של 10 מיקרומטר) חצי-גלילית קמורה. התאים מוכתמים עבור F-אקטין (magenta), וינקולין (ירוק) וגרעינים (כחול). אנא לחץ כאן כדי להוריד את הסרטון הזה.
וידאו 3: ייצוג תלת-ממדי של קרטוציטים אנושיים בתרבית בבור תלת-ממדי מעוצב (ĸ = 1/3,750 μm-1). ייצוג תלת-ממדי של קרטוציטים אנושיים שעברו תרבית במשך 24 שעות בבור קעור ומעוצב (מעגלי ג'לטין, ירוקים, ברוחב 20 מיקרומטר וברווחים של 20 מיקרומטר). התאים מוכתמים עבור F-אקטין (אדום). אנא לחץ כאן כדי להוריד את הסרטון הזה.
וידאו 4: הדמיית בהילוך מהיר של ברייטפילד של פיברובלסטים עוריים אנושיים על גליל קעור בדוגמת תבנית. החצי-צילינדר הקעור (ĸ = 1/250 μm-1) עוצב בקווים מקבילים (ברוחב 5 מיקרומטר ובפערים של 5 מיקרומטר) והודגם עם רודמין-פיברונקטין לפני זריעת התא. ההדמיה בזמן מתחילה שעה אחת לאחר זריעת התאים הראשונית, כאשר התאים מראים היצמדות ראשונית לסביבה הרב-תכליתית. במהלך ההפסקה המלאה, התאים מכוונים בעיקר לאורך רמזי הנחיית המגע, בעוד שחיוניות התא נשמרת. אנא לחץ כאן כדי להוריד את הסרטון הזה.
למחברים אין ניגודי עניינים לחשוף.
באופן מסורתי, תרבית תאים מבוצעת על מצעים מישוריים המחקים בצורה גרועה את הסביבה הטבעית של תאים in vivo. כאן אנו מתארים שיטה לייצור מצעי תרביות תאים עם גיאומטריות מעוגלות רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית וחלבונים חוץ-תאיים מיקרו-פטרייתיים, המאפשרת חקירה שיטתית של חישה תאית של רמזים חוץ-תאיים אלה.
אנו מודים לד"ר נלו פורמיסאנו (מכון MERLN לרפואה רגנרטיבית בהשראת טכנולוגיה) על מתן קרטוציטים ראשוניים אנושיים. עבודה זו נתמכה על ידי ה- InSciTe של Chemelot (פרויקט BM3.02); המועצה האירופית למחקר (מענק 851960); ומשרד החינוך, התרבות והמדע לתכנית הכבידה 024.003.013 "התחדשות מונעת חומרים". המחברים רוצים להודות ל-Alvéole על ההתכתבויות, העזרה ופתרון הבעיות שלהם.
| נוגדן אנטי-וינקולין, דילול חד-שבטי IgG1 | Sigma | V9131 | של עכבר: 1/600 |
| אלבומין בסרום בקר, Fraction V | Roche | 10735086001 | |
| DMEM, גלוקוז גבוה, פירובט | Gibco | 41966029 | |
| DMEM/F-12 + GlutaMAX (1x) | Gibco | 10565018 | |
| DMi8 מיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי | Leica Microsystems | ||
| אתנול | Biosolve | 0005250210BS | |
| סרום בקר עוברי | סרנה | 758093 | |
| Fiji/ImageJ, גרסה v1.53k | www.imageJ.nih.gov | ||
| מדגיש פלואורסצנטי | Stabilo | 4006381333627 | |
| Fluorescin-Label ג'לטין | Invitrogen | G13187 | ריכוז: 0.01% |
| תמיסת פורמלדהיד | Merck | F8775 | |
| כיסויי זכוכית 24 x 60 מ"מ, #1 | VWR | 631-1575 | |
| כיסויי זכוכית, ø = 32 מ"מ, #1 | Menzel-Glä ser | ||
| HCX PL fluotar L 20X/0.40na מיקרוסקופ אובייקטיבי | Leica | 11506242 | |
| HEPES | Gibco | 15630080 | |
| פיברובלסטים עוריים אנושיים | Lonza | CC-2511 | |
| קרטוציטים ראשוניים אנושיים | מכוןMERLN לרפואה | רגנרטיבית בהשראת | |
| טכנולוגיה Illustrator, גרסה 26.0.1 | Adobe | ||
| תנור מעבדה | קרבוליט | ||
| L-חומצה אסקורבית 2-פוספט ססקימגנזיום מלח הידרט | Sigma-Aldrich | A8960 | |
| Leica Application Suite X, גרסה 3.5.7.23225 | Leica Microsystems | ||
| תוכנת לאונרדו, גרסה 4.16 | Alvé | ole | |
| Micro-manager, גרסה 1.4.23 | הדמיה | פתוחה | |
| Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | 81381 | הרכבה בינונית |
| mPEG-succinimidyl valerate MW 5,000 Da | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000 | ריכוז: 50 מ"ג/מ"ל |
| תבנית זכוכית שלילית | FEMTOprint | ||
| NucBlue Live Readyprobes Reagent (Hoechst 33342) | Invitrogen | R37605 | 2 טיפות/מ"ל |
| פניצילין-סטרפטומיצין (10,000 יח'/מ"ל) | ג'יבקו | 15140163 | |
| צלחת פטרי (ø=100 מ"מ) | גריינר ביו-וואן | 664160 | |
| פלואידין אטו 647N | סיגמא | 65906 | דילול: 1/250 |
| פוספט חוצץ מלח | סיגמא | P4417 | |
| פלזמה אשר | Emitech | K1050X | |
| PLPP (פוטו-יוזם) | Alvé | ||
| ole Poly-L-lysine, | סיגמא-אולדריץ' | P4707 | מסונן סטרילי ריכוז: 0.01% |
| PRIMO | Alvé | ||
| פיברונקטין | Cytoskeletn, Inc. | ריכוז FNR01 | : 10 ומיקרו; g/mL |
| נוגדן משני עם Alexa 488, עיזים נגד עכבר IgG1 (H) | בדיקות מולקולריות | A21121 | דילול: 1/300 |
| נוגדן משני עם Alexa 555, עיזים נגד עכבר IgG1 (H) | בדיקות מולקולריות | A21127 | דילול: 1/300 |
| ציפוי ספין | Leurell Technologies Corporation | דגם WS-650MZ-23NPPB | |
| SYLGARD 184 ערכת אלסטומר סיליקון | DOW | 1673921 | |
| מיקרוסקופ קונפוקלי TCS SP8X | Leica Microsystems | ||
| tridecafluoro (1,1,2,2-tetrahydrooctyl) trichlorosilane | ABCR | AB111444 | |
| TrypLE Express Enzyme (1x), ללא פנול אדום | Gibco | 12604013 | |
| Trypsin-EDTA (0.05%), פנול אדום | Gibco | 25300054 |