מוצגת כאן שיטה/מתקן חסכוניים וניתנים להובלה למדידת התפוקה העיקרית של מחצלות מיקרוביאליות בתנאי טמפרטורה ותאורה בפועל באתרם . מערך הניסוי מבוסס על חומרים זמינים באופן נרחב וניתן להשתמש בו בתנאים שונים תוך שהוא מציע את היתרונות של מודלים מבוססי מעבדה.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
מוצגת כאן שיטה/מתקן חסכוניים וניתנים להובלה למדידת התפוקה העיקרית של מחצלות מיקרוביאליות בתנאי טמפרטורה ותאורה בפועל באתרם . מערך הניסוי מבוסס על חומרים זמינים באופן נרחב וניתן להשתמש בו בתנאים שונים תוך שהוא מציע את היתרונות של מודלים מבוססי מעבדה.
מדידת התפוקה הראשונית באתרה של פריפיטון במהלך שיפוע עונת הגידול יכולה להבהיר את ההשפעה הכמותית של מניעים סביבתיים (בעיקר ריכוז זרחן ועוצמת אור) והרכב המינים על התפוקה הראשונית. פרודוקטיביות ראשונית מונעת בעיקר על ידי עוצמת אור, טמפרטורה, זמינות של חומרי מזון והפצה של המינים היוניים של מערכת הקרבונט במעמקי האזור האופוטי בהתאמה. זוהי מערכת מורכבת שקשה מאוד לדמות במעבדה. דוברה צפה זולה, ניתנת להובלה וקלה לבנייה זו מאפשרת למדוד את הפרודוקטיביות הראשונית באופן מדויק-ישיר בתנאים הטבעיים בפועל. המתודולוגיה מבוססת על מדידת התפוקה הראשונית בזמן אמת באמצעות חיישני חמצן לא פולשניים המשולבים בצנצנות זכוכית אטומות היטב, המאפשרים ניטור מקוון של שטף החמצן ומספקים תובנות חדשות על פעילויות מטבוליות. מדידות עונתיות מפורטות באתרן של פרודוקטיביות ראשונית ברוטו של מחצלות מיקרוביאליות (או אורגניזמים בנטיים אחרים) יכולות לשפר את הידע הנוכחי על התהליכים השולטים בדינמיקת הפרודוקטיביות הראשונית במים לנטיים.
פרודוקטיביות ראשונית היא הכניסה היחידה של פחמן אוטוכטוני למערכות הימיות היוצרות את מארג המזון של המערכת כולה1. לפיכך, הערכה מדויקת של פרודוקטיביות ראשונית היא צעד חיוני לקראת הבנת תפקודן של מערכות אקולוגיות ימיות. אזורים ליטורליים הם אזורים של פרודוקטיביות ראשונית גבוהה ומגוון ביולוגי. בנוסף לפיטופלנקטון, מניחים כי פריפיטון (להלן מחצלות מיקרוביאליות) ומקרו-אצות תורמים באופן משמעותי לפרודוקטיביות הראשונית באזורים ליטורליים2. בשל אורח החיים הססגוני וההטרוגניות המרחבית המשמעותית שלהם, כימות התפוקה הראשונית אינו טריוויאלי.
פרודוקטיביות ראשונית מונעת בעיקר על ידי עוצמת אור, טמפרטורה, זמינות של חומרי מזון והפצה של המינים היוניים של מערכת הקרבונט בעומקים המתאימים של אזורים אופוטיים 3,4. העומק משפיע במידה ניכרת על התפוצה המרחבית של מחצלות מיקרוביאליות. קהילות מיקרוביות חייבות להתמודד עם ההשפעות השליליות של הקרנה גבוהה ושינויי טמפרטורה עונתיים בולטים בעומקים רדודים ועם עוצמת אור נמוכה יותר בעומקים גדולים יותר. בנוסף לשיפוע העומק, אינטראקציות טרופיות דינמיות יוצרות תבניות מרחביות מרובות ומורכבות בקני מידה שונים5. מערכת מורכבת זו מסובכת להדמיה במעבדה. הדרך המדויקת ביותר להסיק את הפעילות המטבולית של יצרנים ראשוניים בודדים מאזורי ליטורל היא להקים ניסויים באתרם.
המתודולוגיה שהוצגה במאמר זה מבוססת על שיטת התא המסורתית 2,6,7, יחד עם דוברה צפה ניתנת להובלה וקלה לבנייה בעלות נמוכה. זה מאפשר מדידה של פרודוקטיביות ראשונית בעומקים שונים תחת ספקטרום האור הטבעי, טמפרטורה והתפלגות שונה של המינים היוניים של מערכת הקרבונט עם העומק. השיטה מבוססת על העיקרון של אור לעומת חמצן בבקבוק כהה, אשר שימש לראשונה למדידת פוטוסינתזה של פיטופלנקטון 6 והוא עדיין בשימוש נפוץ 6,7. הוא משווה את קצב השינוי בחמצן בבקבוקים המוחזקים באור (הכולל את ההשפעות של פרודוקטיביות ראשונית ונשימה) עם אלה המוחזקים בחושך (נשימה בלבד)8. השיטה משתמשת באבולוציה של חמצן (פוטוסינתזה) כפרוקסי לפרודוקטיביות ראשונית. המשתנים הנמדדים הם פרודוקטיביות המערכת האקולוגית נטו (NEP, כשינוי בריכוז O 2 לאורך זמן בתנאי אור) ונשימה של המערכת האקולוגית (RE, כשינוי בריכוז O2 לאורך זמן בחושך). תפוקת המערכת האקולוגית הגולמית (GEP) היא חישוב ההפרש בין השניים (טבלה 1). המונח "מערכת אקולוגית" משמש כאן כדי לציין כי הפרפיטון מורכב מאורגניזמים אוטוטרופיים והטרוטרופיים. השיפור המשמעותי ביותר של שיטה קאמרית מסורתית זו הוא שימוש בחיישנים אופטיים לא פולשניים של חמצן ואופטימיזציה של שיטה פלנקטונית זו בעיקר למדידת פרודוקטיביות ראשונית פריפיטית.
הטכניקה מתוארת בדוגמה של מדידת מחצלות מיקרוביאליות באזור הליטורלי של אגמים חדשים שהתגלו לאחר הכרייה בצ'כיה-מילאדה, מוסט ומדר. הפעילות המטבולית של מחצלות מיקרוביאליות נקבעת באמצעות מדידה ישירה באתרה של שטפי O2 המבוצעת ישירות בעומקים ספציפיים, שם הקהילות הנחקרות מתרחשות באופן טבעי. פעילות הטרוטרופית ופוטוטרופית נמדדת בבקבוקי זכוכית סגורים המצוידים בחיישני חמצן אופטיים לא פולשניים. חיישנים אלה מזהים את הלחץ החלקי של חמצן באמצעות פלואורסצנטיות של צבעים רגישים לאור. הבקבוקים עם מחצלות מיקרוביאליות תלויים ודוגרים על מכשיר צף בעומקים המתאימים. ריכוז החמצן בתוך הבקבוקים נמדד ברציפות בתקופת אור היום מהסירה הקטנה.
דגימות של מחצלות מיקרוביאליות שלמות נאספות ומונחות בבקבוקי דגירה אטומים לגז בעומקים ייעודיים על ידי צוללנים. כל בקבוק מצויד במיקרו-חיישן חמצן אופטי לא פולשני, המנטר את הפרודוקטיביות/הצריכה של O2 לאורך זמן. כל המדידות נעשות בחמישה זוגות כהים/בהירים המשוכפלים בכל עומק. עוצמות הטמפרטורה והקרינה הפעילה פוטוסינתטית (PHAR) נמדדות בעומקים המתאימים לאורך הדגירה. לאחר 6 שעות של דגירה באתרה (שעות אור יום), המחצלות המיקרוביאליות נקטפות מהבקבוקים ומיובשות. שטפי O2 מנורמלים לביומסה מיקרוביאלית. כבקרה, השטפים מתוקנים לשינויים בריכוז O2 בבקבוקים נפרדים אטומים לגז בהירים וכהים (פקדים ריקים) המכילים מי אגם ללא ביומסה מיקרוביאלית של מחצלות. להלן הוראות מפורטות לבניית הדוברה הצפה ולביצוע הניסוי כולו שלב אחר שלב. מאמר זה מציג גם תוצאות מייצגות ממדידות של מחצלות מיקרוביאליות בשני עומקים (1 מ' ו-2 מ'), עם חמישה שכפולים בכל עומק. הטמפרטורה ועוצמת האור בפועל נמדדו במהלך כל הניסוי באמצעות מאגרי נתונים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: לפני הדגימה, קבע את מידת השכפולים בהתבסס על צרכי הפרויקט הכוללים, העיצוב הסטטיסטי או הכמות הצפויה של השתנות הדגימה. חמישה זוגות משוכפלים של בקבוקי דגירה בהירים וכהים מוצעים לניתוח סטטיסטי מדויק וכדי לקחת בחשבון אובדן או שבירה פוטנציאליים של דגימות. הדוברה הניסיונית הצפה המתוארת מתוכננת לשאת חמישה שכפולים ועוד זוג אחד של פקדים ריקים; ראו איור 1 לשרטוט טכני של דוברת הניסוי.

איור 1: שרטוטים טכניים של דוברה הניסויית ושל הציפה הצדדית. (A) מבט מלמעלה: מסגרת הדוברה מורכבת מארבעה חלקי פרופיל L בזווית אלומיניום (כחול) המחוברים זה לזה על ידי ארבעה מוטות שטוחים מאלומיניום (אפור). מצופים XPS (ורוד) מותקנים על המסגרת בשתי נקודות, כל אחת על חלקי האלומיניום המקבילים. שרשראות לבקבוקי דגירה מחוברות למסגרת משני הצדדים באמצעות ווי הצמדה בחורים מקדימים (חיצים אדומים) עם הפרדה של 550 מ"מ ביניהם. שרשראות סופקו עם ווים-הצמדה במרחקים של 1 מ' ו-2 מ' לחיבור בקבוק דגירה (בחר את מיקום ההצמדה-ווים בהתאם לעומק הניסוי). עוגן הבטון מאובטח לחרטום הדוברה, שם שלוחה של 25 מ"מ מאפשרת לשני חורים מקדימים (ראשי חץ צהובים) שישמשו כנקודת חיבור לשרשרת העוגן ולספינת המחקר. המסגרת מורכבת או מתפרקת בקלות באמצעות המפרקים המקבילים בין ארבעת חלקי זווית האלומיניום (ראשי חץ ירוקים). (B) מבט מהצד מראה את השרשראות התלויות עם בקבוקי דגירה תלויים ועוגן בטון (ריבוע חום). (C) הצד XPS לצוף: חתיכות L בזווית מקבילית (כחול) מחוברות באמצעות מוטות שטוחים אנכיים מאלומיניום (אפור). מתחת לחתך ההצלבה, המצוף XPS (ורוד) מותקן עם גדלי החורים הדרושים המצוינים (4 מ"מ). השרשראות התלויות מחוברות עם ווי הצמדה בחורים בקוטר 8 מ"מ (ראש חץ אדום). בחרטום הדוברה נקדחים שני חורים בקוטר 8 מ"מ לתוך האלומיניום התלוי, אחד לאבטחת העוגן לדוברה (ראש חץ צהוב) והשני להעגון ספינת המחקר לדוברה (כחול). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
1. בניית דוברה ניסיונית
הערה: הדוברה הצפה מורכבת משני חלקים שווים המותקנים יחד, ומאפשרים הרכבה/פירוק קלים. את כל החלקים המשומשים ניתן לרכוש בכל שוק תחביבים או חנות המוכרת חומרי בניין.

איור 2: דוברה ניסיונית מורכבת. תצלום של דוברה ניסיונית שהורכבה. ראשי חץ אדומים מראים את החורים לחיבור שרשראות עם בקבוקי דגירה. ראשי החץ הירוקים מצביעים על המקום שבו שני חצאי המצוף מחוברים זה לזה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 3: בקבוקי דגירה. תמונה של שני זוגות בקבוקי דגירה כהים ובהירים תלויים בעומק של 1 מ '. זוג בקבוקים אחד מכיל דגימה של מחצלות מיקרוביאליות שלמות שעדיין גדלות על האבן (ראש חץ אדום). השני הוא הבקבוק הריק עם מי האגם מהעומק בהתאמה. ראש חץ צהוב מצביע על נקודת חיישן החמצן המחוברת לדופן הפנימית של בקבוק הדגירה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
2. התקנה בשטח
3. הכנת בקבוק דגירה
4. איסוף דגימות וטיפול בהן
הערה: צוללנים מבצעים איסוף ידני של דגימות במים עמוקים יותר. במים רדודים, זה יכול להיעשות על ידי שנורקלינג או שכשוך.
5. מדידת התפוקה העיקרית
הערה: האדם היושב בסירה לוקח את התיבה מהצוללן ומבצע את השלבים הבאים.

איור 4: סכימה של מערך הניסוי בשטח. איור של דוברה ניסיונית מעוגנת על פני האגם. בקבוקי הדגירה (0.5 ליטר) עם ביומסה מיקרוביאלית תלויים בשני עומקים שונים (1 מ' ו-2 מ'). הצוללנים אספו דגימות של מחצלות מיקרוביאליות ישירות לתוך בקבוקי הדגירה בעומקים המתאימים. ריכוז החמצן בבקבוקים בודדים נמדד מהספינה. הבקבוקים נשלפים מהמים. ערך ריכוז החמצן נמדד תוך מספר שניות על ידי חיבור כבל אופטי לחיישן החמצן. לאחר מכן מורידים בזהירות את הבקבוקים בחזרה למים. כל ההליך של מדידת שני זוגות של בקבוקי דגירה משני עומקים לוקח ~ 2 דקות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
6. ניתוחים לדוגמה
7. ניתוחי נתונים
) ליחידה סבירה כלשהי.
(1)
(2)
(3)
(4)
(5)
(6)
(7)
, , , ו
- , בהתאמה, 
ניתן לכתוב את המשוואה (8) לחישוב GEP של פרודוקטיביות כ:
(8.1)
(8.2)
(8.3)
מגדיר פרודוקטיביות נטו של מערכות אקולוגיות (איור 5A; כלומר, פרודוקטיביות חמצן נטו ), והמונח
מייצג את סכום הנשימה האוטוטרופית וההטרוטרופית (איור 5B; RE, כלומר, בהנחה ששתי הנשימות דומות בתנאי חושך ואור).
ושניהם
חיוביים, ושניהם
שליליים. אם
הוא חיובי, לבדוק את הנתונים הגולמיים בזהירות עבור חריגות . יכול להיות שלילי תיאורטית כי הפסדים נשימתיים הנגרמים על ידי פעילות הטרוטרופית יכול להיות גבוה יותר מאשר פעילות פוטוסינתטית. 
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

איור 5: פרודוקטיביות נטו וברוטו של מערכות אקולוגיות של מחצלות מיקרוביאליות באור יום. (A) פרודוקטיביות המערכת האקולוגית של רשת בקבוקים קלה: נתוני מהלך הזמן של תפוקת החמצן נטו של מחצלות מיקרוביאליות מהבקבוקים הקלים. השינוי בריכוז החמצן בבקבוקי הדגירה נמדד לאחר שעה אחת באור יום. עיגולים אפורים: בקבוקים עם דגימות של מחצלות מיקרוביאליות. עיגולים לבנים: ב...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המתודולוגיה המתוארת במאמר זה מבוססת על העיקרון של טכניקת החמצן בבקבוק בהיר וכהה בשילוב עם הטכניקה הלא פולשנית של מדידת ריכוז O2 באמצעות חיישני חמצן אופטיים. מערכת זו מאפשרת מדידה מקבילה של הגדרות דגירה שונות מכיוון שניתן להעביר במהירות את הסיב האופטי למדידת O2 מבקבוק לבקבוק. הקהילות הבנטיות מעומקים שונים יכולות להיות שונות בהרכב הטקסונומי ובפריון; מדידתם בו זמנית באופן מקביל יכולה לחסוך זמן ולהפוך את התוצאות למדויקות יותר, ומאפשרת חישוב של פרופילים בעומק שלם שבהם פריפיטון גדל. חיישני חמצן לא פולשניי...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מאשרים כי אין להם ניגודי עניינים לחשוף.
מחקר זה נתמך על ידי הקרן הצ'כית למדע (GACR 19-05791S), RVO 67985939, ועל ידי CAS במסגרת התוכנית של אסטרטגיית AV 21, חיסכון בקרקע והתאוששות. תודה רבה לאונדז'יי סיהלסקי על שצילם את הצילומים בשדה - בלעדיו, הצילומים היו גיהינום מוחלט. הפרויקט לא היה מתאפשר ללא שיתוף פעולה הדוק עם חברות, Palivový Kombinát Ústí s.p. ו- Sokolovská Uhelná, שסיפקו גישה ליישובים הנחקרים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| זווית אלומיניום פרופיל L 40 x 40 מ"מ x 3 מ"מ, אורך 2,000 מ"מ | |||
| מוט שטוח מאלומיניום 40 x 3 x 350 מ"מ | |||
| דלי 15 ליטר עם מילוי בטון | |||
| וו קרבין עם מנעול בורג 50 x 5 מ"מ | |||
| סרט חשמלי שחור | |||
| פוליסטירן מוקצף (XPS) 500 x 200 x 150 מ"מ | |||
| Fibox 3 עקבות LCD | PreSens Precision Sensing GmbH | מד חמצן סיבים אופטיים עצמאי | |
| Hondex PS-7 צליל עומק נייד | הונדקס - הונדה אלקטרוניקה | למדידת מרחקים דרך מים - למדידת עומק קרקעית; https://www.honda-el.net/industry/ps-7e | |
| חיישן חמצן ספוט SP-PSt3-NAU-D5 | PreSens Precision Sensing GmbH | חיישן חמצן אופטי לא פולשני למדידות בתנאים אמיתיים | |
| קאנו לתינוקות SCOUT | https://www.gumotexboats.com/en/scout-standard#0000-044667-021-13/11C GUMOTEX | ||
| 10 x 170 מ"מ עם אגוזים | |||
| בורג 4 x 15 מ"מ עם משושה אגוזים | |||
| בורג 4 x 15 מ"מ עם אגוזי | |||
| ווי הצמדה 50 x 5 מ"מ | |||
| וו פלדה קרבין 50 x 5 מ"מ | |||
| שרשרת פלדה בקוטר חוט 3 מ"מ, חוליה פנימית 5.5 x 26 מ"מ | |||
| שרשרת פלדה, מברשת | |||
| בפינצטה | |||
| 10 x 50 מ"מ | |||
| מכונת כביסה 4 x 10 מ"מ | |||
| מכונת כביסה 4 x 10 מ"מ |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.