במאמר זה מתוארת שיטה למדידת קרינה באתרה ברקמה חיה. עבודה זו כוללת פירוט של בניית גשושיות בקנה מידה מיקרו למדידות שונות של קרינה וקרינה, מספקת הדרכה להרכבת רקמה לאפיון קרינה, ומתווה שיטות חישוביות לניתוח הנתונים המתקבלים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
במאמר זה מתוארת שיטה למדידת קרינה באתרה ברקמה חיה. עבודה זו כוללת פירוט של בניית גשושיות בקנה מידה מיקרו למדידות שונות של קרינה וקרינה, מספקת הדרכה להרכבת רקמה לאפיון קרינה, ומתווה שיטות חישוביות לניתוח הנתונים המתקבלים.
אורגניזמים נראים אטומים בעיקר משום ששכבות הרקמה החיצוניות שלהם מתפזרות בחוזקה לאור מאורע; פיגמנטים בעלי ספיגה חזקה, כגון דם, הם בדרך כלל בעלי ספיגה צרה, כך שהנתיב החופשי הממוצע של אור מחוץ לפסגות הספיגה יכול להיות ארוך למדי. מאחר שאנשים אינם יכולים לראות דרך רקמות, הם בדרך כלל מדמיינים שרקמות כמו המוח, השומן והעצם מכילות מעט אור או כלל לא. עם זאת, חלבוני אופסין מגיבים לאור באים לידי ביטוי בתוך רבות מהרקמות הללו, ותפקידיהם אינם מובנים היטב. קרינה פנימית לרקמה חשובה גם להבנת הפוטוסינתזה. לדוגמה, צדפות ענק סופגות חזק אך שומרות על אוכלוסייה צפופה של אצות עמוק ברקמה. התפשטות אור דרך מערכות כמו משקעים וביופילמים יכולה להיות מורכבת, והקהילות האלה יכולות להיות תורמות משמעותיות לפרודוקטיביות של מערכות אקולוגיות. לכן, פותחה שיטה לבניית מיקרו-גשושיות אופטיות למדידת קרינה סקלרית (שטף פוטונים החוצה נקודה) וקרינה יורדת (שטף פוטונים החוצה מישור בניצב) כדי להבין טוב יותר תופעות אלה בתוך רקמה חיה. טכניקה זו ניתנת לטיפול גם במעבדות שדה. מיקרו-גשושיות אלה עשויות מסיבים אופטיים שנמשכים בחום ומאובטחים בפיפטות זכוכית משוכות. כדי לשנות את הקבלה הזוויתית של הבדיקה, כדור בגודל 10-100 מיקרומטר של אפוקסי הניתן לריפוי UV מעורבב עם דו תחמוצת טיטניום מאובטח לאחר מכן לקצה של סיב משוך וגזוז. הבדיקה מוחדרת לרקמה חיה, ומיקומה נשלט באמצעות מיקרומניפולטור. בדיקות אלה מסוגלות למדוד את זוהר הרקמה באתרה ברזולוציות מרחביות של 10-100 מיקרומטר או בקנה מידה של תאים בודדים. גשושיות אלה שימשו לאפיון האור המגיע לתאי השומן והמוח הנמצאים 4 מ"מ מתחת לעורו של עכבר חי ולאפיון האור המגיע לעומקים דומים בתוך רקמת צדפות ענק עשירות באצות חיות.
באופן מפתיע, לחיות יבשה ולשוכני אוקיינוס רדודים יש מספיק אור בתוך גופם לפיזיולוגיה חזותית ואפילו פוטוסינתזה. לדוגמה, רמות האור במרכז ראשו של עכבר (מחוץ לרצועות ספיגת ההמוגלובין החזקות) מוחלשות בשלושה או ארבעה סדרי גודל ביחס לעולם החיצון. זה בערך ההבדל בין רמות האור בתוך הבית ובחוץ. לכן, האטימות של רקמה או חומר עקב פיזור חזק אינה זהה לאטימות עקב בליעת אור חזקה. אור יכול להמשיך להתפשט למרחקים ארוכים במערכת פיזור חזק קדימה, בדומה לאור המתפשט דרך מערכות ימיות עם ריכוזים גבוהים של תאים וחלקיקים1. תצפית זו בולטת במיוחד לאור העובדה שחלבוני אופסין באים לידי ביטוי כמעט בכל הרקמות של כל בעלי החיים. לכן, חשוב להבין כיצד והיכן האור נחלש ומפוזר בתוך רקמה חי....
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר זה תואם את כל התקנות האתיות הרלוונטיות של אוניברסיטת ייל בנוגע למחקר בעלי חוליות וחסרי חוליות בבעלי חיים.
1. בניית המיקרו-בדיקה האופטית
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מתאר את ההליך לבניית גשושית מיקרו-אופטית שניתן להשתמש בה כדי למדוד את הקרינה היורדת (האור המגיע לנקודה מכיוון אחד) או, בתוספת קצה כדורי מפזר אור, למדוד את הקרינה הסקלרית (האור המגיע לנקודה מכל הכיוונים). בדיקות אלה יכולות למדוד קרינה ברזולוציות מרחביות המתקרבות לסקאלות האורך של תאים בודדים בתוך רקמה חיה. פרוטוקול זה מתאר גם שיטה מייצגת להכנת דגימת רקמה למדידות קרינה באמצעות הגשושית המתוארת ושיטה מייצגת לצפייה וניתוח נתונים.
איור 1 מראה את התפוקה של ייצ.......
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מתאר טכניקה לאפיון שיטתי של הסביבה האופטית באמצעות נפח גדול של רקמה חיה ברזולוציה מרחבית בערך בקנה מידה של תאים בודדים. שיטה זולה, גמישה וניתנת לעיבוד שדה זו יכולה להיות שימושית לכל חוקר החוקר את התפשטות האור בתוך מערכות חיות. מניסיון, בהשוואהלשיטות 7 הקיימות, בדיקות אלה דורשות מעט יותר תרגול ומיומנות כדי לבנות אך מביאות לפחות נזק לרקמות וליכולת לאפיין באופן מקיף יותר נפחים גדולים יותר של רקמה צפופה.
שיטה זו מורכבת מארבעה חלקים. החלק הראשון, בניית הגשושית, נ.......
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אין ניגודי עניינים.
המחברים מודים לסאנז והידיניה על שהכיר לנו את עמיתיו של ד"ר יורגנסן ואת עבודתו. מחקר זה נתמך על ידי מענקים ממשרד המחקר הצבאי (מס' W911NF-10-0139), המשרד למחקר ימי (באמצעות פרס MURI מס' N00014-09-1-1053), ופרס NSF-INSPIRE NSF-1343158.
....הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 1 אינץ' מרכז מיסב כדורי נסיעות + D11 + A2: D31 + A2: A2: D31 | אופטיקה אדמונד | 37-935 | חלק 2 של מניפולטור להורדת מדגם יריעת |
| אקריליק בעובי 1/4 אינץ' | McMaster-Carr | 8505K754 | להכנת מחזיק צלחת פטרי |
| 3/4 אינץ' מהדק קפיץ מיני | סדן | 99693 | השתמש כמשקל למשיכת סיבים אופטיים |
| אגרוף ביופסיה 8 מ"מ | פישר סיינטיפיק | NC9324386 | לדגימת רקמות |
| לפיד בוטאן | מקמאסטר-קאר | MT-51 | מקור חום למשיכת סיבים ופיפטה |
| עדשת קולימציה | Thorlabs | LLG5A1-A | לקולימציה של מקור אור באמצעות מוביל אור נוזלי |
| אוויר דחוס | McMaster-Carr | 7437K35 | לייבוש סיבים משוכים ופיפטה |
| דבק ציאנואקרילט - נוזלי | McMaster-Carr | 66635A31 | לאבטחת קצה סיבים מחודדים בחלק העליון של פיפטה משוכה |
| סרט חשמלי | McMaster-Carr | 76455A21 | לאבטחת סיבים בפיפטה ולהוספת אחיזה למהדקים |
| נייר קרבורונדום בדרגה עדינה | McMaster-Carr | 4649A24 | משולש קטן על מחזיק סכין exacto עובד היטב |
| ג'לטין | נוקס | 10043000048679 | לאבטחת ביופסיית הרקמה בצלחת |
| הפטריזכוכית פסטר פיפט | פישר מדעי | 13-678-20B | פיפטת זכוכית חד פעמית באורך 5.75 אינץ' |
| מזרקי אינסולין, מחט 31G | BD | 320440 | למריחת דבק |
| איזופרופנול | מקמאסטר-קאר | 54845T42 | לניקוי סיבים משוכים ופיפטה |
| Kimwipe | Cole-Parmer | מק"ט 33670-04 | לניגוב סיבים אופטיים ופיפטה זכוכית |
| נקייה LED דרייבר | Thorlabs | LEDD1B | להפעלת נוריות ה-UV |
| מקור אור למדידות | Cole-Parmer | UX-78905-05 | מקור אור לבן בחום נמוך למדידות |
| ליניארי XYZ מתלה ציר ושלב פיניון | Edmond Optics | 55-023 | חלק 1 של מניפולטור להורדת דגימה |
| מדריך אור נוזלי | Thorlabs | LLG5-4T | למקור אור במדידות |
| רגליים מגנטיות | Siskiyou | MGB 8-32 | לשימוש עם רצועות מגנטיות |
| רצועות מגנטיות | Siskiyou | MS-6.0 | להרכבה מגנטית למניפולטור לוח אב-טיפוס |
| #1 | מניפולטור Siskiyou | MX10R | 4 צירים עם מחזיק פיפטה |
| עט אטום, | גוון חלון | TOP01 | לצד אטום של סיבים אופטיים כדי למנוע כניסת אור תועה לבדיקה |
| לוח אב-טיפוס אופטי | Edmond Optics | 03-640 | להדבקה יציבה של מחזיק בדיקה, דגימה, מיקרוסקופ ומקור אור |
| סיבים | אופטיים Ocean Optics | P-100-2-UV-VIS | כ-4 סיבים טובים למקור |
| אור פלזמה | Thorlabs | HPLS345 | למדידות רדיומטריית רקמות |
| מהדק צבת פלסטיק | McMaster-Carr | 5070A11 | מהדק פלייר המשמש למשקל במשיכת פיפטה |
| צלחות פטרי פוליסטירן | תומס מדעי | 3488N10 | מחזיקי דגימות, נפח מספיק כדי להחזיק עובי מדגם בתוספת ~10 מ"מ של ג'לטין למעלה |
| סכיני גילוח | McMaster-Carr | 3962A3 | להפשטת מעיל מסיבים אופטיים |
| חומר סיכה שמן סיליקון | תומס מדעי | 1232E30 | להפחתת החיכוך בין בדיקה לרקמה |
| תוכנה לניתוח נתונים | Matlab | תוכנה נבחרת לניתוח נתונים | |
| ספקטרומטר + ספקטרומטר תוכנת | Avantes | AvaSpec-2048L | ספקטרומטר יכול להיות כל מותג, זה תואם לסיבים אופטיים עם סיום SMA ומגיע עם תוכנה משלו להפעלת הספקטרומטר |
| אבקת טיטניום דו חמצני | סיגמא אולדריץ' | 718467-100G | להכנת כדור |
| פיזורToolour קליפ השולחן | Toolour | Toolour0004 | להחזקת פיפטה בזמן משיכה ולהחזקת בדיקות מוגמרות |
| מהדקי מוט פעולת הדק | mcMaster-Carr | 51755A2 | טוב להחזקת סיבים אופטיים תוך כדי משיכה או ריפוי |
| דבק הניתן לריפוי UV | Delo Photobond | GB368 | להכנת כדור פיזור |
| מקור אור UV | Thorlabs | M365FP1 | מקור אור לריפוי דבק בכדור פיזור, זה תואם סיבי sma, עוצמה גבוהה יותר = פחות זמן ריפוי |
| מקור אור LED לבן | Thorlabs | MCWHF2 | לאפיון סיבים משוכים וכדור פיזור |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.