הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.

מאמר שיטה

מיקרו-בדיקה רדיומטרית תוך-רקמתית למדידת קרינה באתרה ברקמה חיה

1.3K צפיות

DOI:

10.3791/64595

2 ביוני 2023

במאמר זה

סיכום

במאמר זה מתוארת שיטה למדידת קרינה באתרה ברקמה חיה. עבודה זו כוללת פירוט של בניית גשושיות בקנה מידה מיקרו למדידות שונות של קרינה וקרינה, מספקת הדרכה להרכבת רקמה לאפיון קרינה, ומתווה שיטות חישוביות לניתוח הנתונים המתקבלים.

תקציר

אורגניזמים נראים אטומים בעיקר משום ששכבות הרקמה החיצוניות שלהם מתפזרות בחוזקה לאור מאורע; פיגמנטים בעלי ספיגה חזקה, כגון דם, הם בדרך כלל בעלי ספיגה צרה, כך שהנתיב החופשי הממוצע של אור מחוץ לפסגות הספיגה יכול להיות ארוך למדי. מאחר שאנשים אינם יכולים לראות דרך רקמות, הם בדרך כלל מדמיינים שרקמות כמו המוח, השומן והעצם מכילות מעט אור או כלל לא. עם זאת, חלבוני אופסין מגיבים לאור באים לידי ביטוי בתוך רבות מהרקמות הללו, ותפקידיהם אינם מובנים היטב. קרינה פנימית לרקמה חשובה גם להבנת הפוטוסינתזה. לדוגמה, צדפות ענק סופגות חזק אך שומרות על אוכלוסייה צפופה של אצות עמוק ברקמה. התפשטות אור דרך מערכות כמו משקעים וביופילמים יכולה להיות מורכבת, והקהילות האלה יכולות להיות תורמות משמעותיות לפרודוקטיביות של מערכות אקולוגיות. לכן, פותחה שיטה לבניית מיקרו-גשושיות אופטיות למדידת קרינה סקלרית (שטף פוטונים החוצה נקודה) וקרינה יורדת (שטף פוטונים החוצה מישור בניצב) כדי להבין טוב יותר תופעות אלה בתוך רקמה חיה. טכניקה זו ניתנת לטיפול גם במעבדות שדה. מיקרו-גשושיות אלה עשויות מסיבים אופטיים שנמשכים בחום ומאובטחים בפיפטות זכוכית משוכות. כדי לשנות את הקבלה הזוויתית של הבדיקה, כדור בגודל 10-100 מיקרומטר של אפוקסי הניתן לריפוי UV מעורבב עם דו תחמוצת טיטניום מאובטח לאחר מכן לקצה של סיב משוך וגזוז. הבדיקה מוחדרת לרקמה חיה, ומיקומה נשלט באמצעות מיקרומניפולטור. בדיקות אלה מסוגלות למדוד את זוהר הרקמה באתרה ברזולוציות מרחביות של 10-100 מיקרומטר או בקנה מידה של תאים בודדים. גשושיות אלה שימשו לאפיון האור המגיע לתאי השומן והמוח הנמצאים 4 מ"מ מתחת לעורו של עכבר חי ולאפיון האור המגיע לעומקים דומים בתוך רקמת צדפות ענק עשירות באצות חיות.

מבוא

באופן מפתיע, לחיות יבשה ולשוכני אוקיינוס רדודים יש מספיק אור בתוך גופם לפיזיולוגיה חזותית ואפילו פוטוסינתזה. לדוגמה, רמות האור במרכז ראשו של עכבר (מחוץ לרצועות ספיגת ההמוגלובין החזקות) מוחלשות בשלושה או ארבעה סדרי גודל ביחס לעולם החיצון. זה בערך ההבדל בין רמות האור בתוך הבית ובחוץ. לכן, האטימות של רקמה או חומר עקב פיזור חזק אינה זהה לאטימות עקב בליעת אור חזקה. אור יכול להמשיך להתפשט למרחקים ארוכים במערכת פיזור חזק קדימה, בדומה לאור המתפשט דרך מערכות ימיות עם ריכוזים גבוהים של תאים וחלקיקים1. תצפית זו בולטת במיוחד לאור העובדה שחלבוני אופסין באים לידי ביטוי כמעט בכל הרקמות של כל בעלי החיים. לכן, חשוב להבין כיצד והיכן האור נחלש ומפוזר בתוך רקמה חי....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

מחקר זה תואם את כל התקנות האתיות הרלוונטיות של אוניברסיטת ייל בנוגע למחקר בעלי חוליות וחסרי חוליות בבעלי חיים.

1. בניית המיקרו-בדיקה האופטית

  1. בניית שרוול זכוכית, חומר: פיפטה פסטר, 5.75 אינץ' (ראה טבלת חומרים)
    1. בעזרת תפס תנין הניתן להרכבה (טבלת חומרים), הרכיבו את פיפטת הזכוכית בקצה הרחב כך שהקצה המחודד פונה כלפי מטה לכיוון הרצפה וכיוון הפיפטה מאונך לרצפה.
    2. תלו ידית אחיזה מפלסטיק של 50 גרם (טבלת חומרים) מהקצה המחודד של הפיפטה. הניחו כרית של סרט חשמלי בין פיפטה לבין ידית האחיזה כדי לסייע במניעת החלקה.
    3. מחממים את הקצה המחודד של הפיפטה בעזרת לפ....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

פרוטוקול זה מתאר את ההליך לבניית גשושית מיקרו-אופטית שניתן להשתמש בה כדי למדוד את הקרינה היורדת (האור המגיע לנקודה מכיוון אחד) או, בתוספת קצה כדורי מפזר אור, למדוד את הקרינה הסקלרית (האור המגיע לנקודה מכל הכיוונים). בדיקות אלה יכולות למדוד קרינה ברזולוציות מרחביות המתקרבות לסקאלות האורך של תאים בודדים בתוך רקמה חיה. פרוטוקול זה מתאר גם שיטה מייצגת להכנת דגימת רקמה למדידות קרינה באמצעות הגשושית המתוארת ושיטה מייצגת לצפייה וניתוח נתונים.

איור 1 מראה את התפוקה של ייצ.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

פרוטוקול זה מתאר טכניקה לאפיון שיטתי של הסביבה האופטית באמצעות נפח גדול של רקמה חיה ברזולוציה מרחבית בערך בקנה מידה של תאים בודדים. שיטה זולה, גמישה וניתנת לעיבוד שדה זו יכולה להיות שימושית לכל חוקר החוקר את התפשטות האור בתוך מערכות חיות. מניסיון, בהשוואהלשיטות 7 הקיימות, בדיקות אלה דורשות מעט יותר תרגול ומיומנות כדי לבנות אך מביאות לפחות נזק לרקמות וליכולת לאפיין באופן מקיף יותר נפחים גדולים יותר של רקמה צפופה.

שיטה זו מורכבת מארבעה חלקים. החלק הראשון, בניית הגשושית, נ.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

אין ניגודי עניינים.

תודות

המחברים מודים לסאנז והידיניה על שהכיר לנו את עמיתיו של ד"ר יורגנסן ואת עבודתו. מחקר זה נתמך על ידי מענקים ממשרד המחקר הצבאי (מס' W911NF-10-0139), המשרד למחקר ימי (באמצעות פרס MURI מס' N00014-09-1-1053), ופרס NSF-INSPIRE NSF-1343158.

....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
1 אינץ' מרכז מיסב כדורי נסיעות + D11 + A2: D31 + A2: A2: D31אופטיקה אדמונד37-935חלק 2 של מניפולטור להורדת מדגם יריעת
אקריליק בעובי 1/4 אינץ'McMaster-Carr8505K754להכנת מחזיק צלחת פטרי
3/4 אינץ' מהדק קפיץ מיניסדן99693השתמש כמשקל למשיכת סיבים אופטיים
אגרוף ביופסיה 8 מ"מפישר סיינטיפיקNC9324386לדגימת רקמות
לפיד בוטאןמקמאסטר-קארMT-51מקור חום למשיכת סיבים ופיפטה
עדשת קולימציהThorlabsLLG5A1-Aלקולימציה של מקור אור באמצעות מוביל אור נוזלי
אוויר דחוסMcMaster-Carr7437K35לייבוש סיבים משוכים ופיפטה
דבק ציאנואקרילט - נוזליMcMaster-Carr66635A31לאבטחת קצה סיבים מחודדים בחלק העליון של פיפטה משוכה
סרט חשמליMcMaster-Carr76455A21לאבטחת סיבים בפיפטה ולהוספת אחיזה למהדקים
נייר קרבורונדום בדרגה עדינהMcMaster-Carr4649A24משולש קטן על מחזיק סכין exacto עובד היטב
ג'לטיןנוקס10043000048679לאבטחת ביופסיית הרקמה בצלחת
הפטריזכוכית פסטר פיפטפישר מדעי13-678-20Bפיפטת זכוכית חד פעמית באורך 5.75 אינץ'
מזרקי אינסולין, מחט 31GBD320440למריחת דבק
איזופרופנולמקמאסטר-קאר54845T42לניקוי סיבים משוכים ופיפטה
KimwipeCole-Parmerמק"ט 33670-04לניגוב סיבים אופטיים ופיפטה זכוכית
נקייה LED דרייברThorlabsLEDD1Bלהפעלת נוריות ה-UV
מקור אור למדידותCole-ParmerUX-78905-05מקור אור לבן בחום נמוך למדידות
ליניארי XYZ מתלה ציר ושלב פיניוןEdmond Optics55-023חלק 1 של מניפולטור להורדת דגימה
מדריך אור נוזליThorlabsLLG5-4Tלמקור אור במדידות
רגליים מגנטיותSiskiyouMGB 8-32לשימוש עם רצועות מגנטיות
רצועות מגנטיותSiskiyouMS-6.0להרכבה מגנטית למניפולטור לוח אב-טיפוס
#1מניפולטור SiskiyouMX10R4 צירים עם מחזיק פיפטה
עט אטום,גוון חלוןTOP01לצד אטום של סיבים אופטיים כדי למנוע כניסת אור תועה לבדיקה
לוח אב-טיפוס אופטיEdmond Optics03-640להדבקה יציבה של מחזיק בדיקה, דגימה, מיקרוסקופ ומקור אור
סיביםאופטיים Ocean OpticsP-100-2-UV-VISכ-4 סיבים טובים למקור
אור פלזמהThorlabsHPLS345למדידות רדיומטריית רקמות
מהדק צבת פלסטיקMcMaster-Carr5070A11מהדק פלייר המשמש למשקל במשיכת פיפטה
צלחות פטרי פוליסטירןתומס מדעי3488N10מחזיקי דגימות, נפח מספיק כדי להחזיק עובי מדגם בתוספת ~10 מ"מ של ג'לטין למעלה
סכיני גילוחMcMaster-Carr3962A3להפשטת מעיל מסיבים אופטיים
חומר סיכה שמן סיליקוןתומס מדעי1232E30להפחתת החיכוך בין בדיקה לרקמה
תוכנה לניתוח נתוניםMatlabתוכנה נבחרת לניתוח נתונים
ספקטרומטר + ספקטרומטר תוכנתAvantesAvaSpec-2048Lספקטרומטר יכול להיות כל מותג, זה תואם לסיבים אופטיים עם סיום SMA ומגיע עם תוכנה משלו להפעלת הספקטרומטר
אבקת טיטניום דו חמצניסיגמא אולדריץ'718467-100Gלהכנת כדור
פיזורToolour קליפ השולחןToolourToolour0004להחזקת פיפטה בזמן משיכה ולהחזקת בדיקות מוגמרות
מהדקי מוט פעולת הדקmcMaster-Carr51755A2טוב להחזקת סיבים אופטיים תוך כדי משיכה או ריפוי
דבק הניתן לריפוי UVDelo PhotobondGB368להכנת כדור פיזור
מקור אור UVThorlabsM365FP1מקור אור לריפוי דבק בכדור פיזור, זה תואם סיבי sma, עוצמה גבוהה יותר = פחות זמן ריפוי
מקור אור LED לבןThorlabsMCWHF2לאפיון סיבים משוכים וכדור פיזור
מטרי קטן

מקורות

  1. Williams, J. Optical properties of the ocean. Reports on Progress in Physics. 36 (12), 1567-1608 (2001).
  2. Solonenko, M., et al. In vivo reflectance measurement of optical properties, blood ....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

תגיות

In Situ