אנו מציגים פרוטוקול לטכניקת בדיקה אימונוסורבית המקושרת לאנזים סנדוויץ' שונה כדי למדוד כמותית שני מרכיבים של שרידי מלכודת חוץ-תאיים של נויטרופילים, מיילאופרוקסידז מצומד-DNA וקומפלקסים של דנ"א מצומד אלסטאז נויטרופילים, הנגזרים מנויטרופילים פעילים.
מאמר שיטה
אנו מציגים פרוטוקול לטכניקת בדיקה אימונוסורבית המקושרת לאנזים סנדוויץ' שונה כדי למדוד כמותית שני מרכיבים של שרידי מלכודת חוץ-תאיים של נויטרופילים, מיילאופרוקסידז מצומד-DNA וקומפלקסים של דנ"א מצומד אלסטאז נויטרופילים, הנגזרים מנויטרופילים פעילים.
גירויים מסוימים, כגון מיקרואורגניזמים, גורמים לנויטרופילים לשחרר מלכודות חוץ-תאיות של נויטרופילים (NETs), שהם בעצם מבנים דמויי רשת המורכבים מדנ"א עם חלבוני גרגירים, כגון myeloperoxidase (MPO) ואלסטאז נויטרופילים (NE), וחלבונים ציטופלזמיים וציטו-שלד. למרות שהעניין ב- NETs גדל לאחרונה, אין שיטת בדיקה רגישה ואמינה זמינה למדידת NETs במסגרות קליניות. מאמר זה מתאר בדיקה אימונוסורבנטית המקושרת לאנזים סנדוויץ' שונה כדי למדוד כמותית שני מרכיבים של NETs במחזור, MPO-DNA וקומפלקסים NE-DNA, שהם רכיבים ספציפיים של NETs ומשוחררים לחלל החוץ תאי כתוצרי פירוק של NETs. הבדיקה משתמשת בנוגדנים חד-שבטיים ספציפיים עבור MPO או NE כנוגדנים ללכידה ונוגדן זיהוי ספציפי ל- DNA. MPO או NE נקשר לאתר אחד של נוגדן הלכידה במהלך הדגירה הראשונית של דגימות המכילות מתחמי MPO-DNA או NE-DNA. בדיקה זו מראה ליניאריות טובה ודיוק גבוה בין בדיקות ותוך מבחנים. השתמשנו בו ב-16 חולי COVID-19 עם תסמונת מצוקה נשימתית חריפה נלווית ומצאנו כי ריכוזי ה-MPO-DNA וה-NE-DNA בפלזמה היו גבוהים משמעותית מאשר בפלזמה שהתקבלה מקבוצת ביקורת בריאה. בדיקת זיהוי זו היא שיטה אמינה, רגישה ביותר ושימושית לחקירת המאפיינים של NETs בפלזמה אנושית ובתרבית-על.
מאמר זה מתאר שיטה לכימות היווצרות מלכודת נויטרופילים חוץ-תאיים (NET) בנוזלים ביולוגיים באמצעות בדיקת אימונוסורבנט מקושרת אנזים סנדוויץ' (ELISA) כדי לזהות קומפלקסים של מיאלופרוקסידאז (MPO) ואלסטאז נויטרופילים (NE) עם DNA 1,2. NETs מורכבים מעמוד שדרה של DNA המעוטר בפרוטאזות אנטי-מיקרוביאליות שמקורן בגרגרי נויטרופילים 3,4. הן קומפלקסים MPO-DNA והן NE-DNA הם מרכיבים חשובים וספציפיים של NETs והם משוחררים לחלל החוץ תאי כתוצרי פירוק של NETs 3,4.
מלבד תפקידם הפיזיולוגי החשוב בהגנה אנטי-מיקרוביאלית3, ל-NETs יש גם השפעות פתולוגיות שונות4,5, כולל קידום טרומבוגנזה6 והחמרה באלח דם7. בהתאם לכך, רשתות צוברים תשומת לב לאחרונה. עם זאת, כימות in vivo של NETs הוכח כמאתגר בשל היעדר שיטת בדיקה כמותית רגישה ואמינה.
קיימות מספר שיטות, כולל מדידה ישירה של NETs במיקרוסקופ פלואורסצנטי8,9 וציטומטריית זרימה 10 ומדידה עקיפה של דנ"א נטול תאים במחזור, נוקלאוזומים והיסטון H3 ציטרולינציה, אך לכל שיטה יתרונות ומגבלות משלה11. למרות שהשיטה המיקרוסקופית האימונופלואורסצנטית היא ספציפית ל- NETs ומראה בבירור את הלוקליזציה ואת מידת היווצרות ה- NET, הדגימות מוגבלות לרקמת ביופסיה וחומרים מופרשים. יתר על כן, שיטה זו צריכה להתבצע על ידי חוקרים מיומנים ודורשת זמן רב לקבלת תוצאות. מדידת רמות במחזור של רכיבים הקשורים ל- NET באמצעות ציטומטריית זרימה היא קלה ומספקת תוצאות במהירות; עם זאת, השיטה אינה ספציפית ל- NETs12.
אנו13 ואחרים1,2 פיתחנו בדיקה רגישה ואמינה ביותר למדידת רכיבי NET במחזור, MPO-conjugated או NE-conjugated DNA, בפלזמה אנושית עם טכניקת ELISA שונה המשתמשת בנוגדנים ספציפיים עבור MPO או NE כנוגדנים ללכידה ונוגדן זיהוי ספציפי ל- DNA. בדיקה זו יכולה לשמש גם ex vivo כדי לזהות רכיבי NET בסופרנאטנטים של תרביות תאים המשתחררים על ידי נויטרופילים פעילים בתגובה לגירוי phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר זה נערך בהתאם להצהרת הלסינקי ואושר על ידי מועצות הסקירה המוסדיות של האוניברסיטה הרפואית אאיצ'י (2017-H341, 2019-H137). התקבלה הסכמה מדעת בכתב מכל משתתף.
1. הכנת מגיב
הערה: כדי לבצע את בדיקת הכריך ELISA, הריאגנטים מוכנים כמתואר להלן.
2. איסוף ואחסון דוגמאות
3. שיטת Assay
הערה: השלבים לביצוע הבדיקה מתוארים בפירוט להלן.
4. סטטיסטיקה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
שיטה זו השתמשה בכריך ELISA עם נוגדנים חד-שבטיים אנטי-MPO, אנטי-NE ואנטי-דנ"א כדי למדוד דנ"א הקשור ל-MPO ול-NE (איור 1). בשיטה זו, הבארות של צלחת מיקרוטיטר צופו בנוגדן חד-שבטי ספציפי ל-MPO או NE ספציפי כדי ללכוד MPO הקשור ל-DNA ו-NE הקשור ל-DNA, כמו גם MPO ו-NE שאינם קשורים ל-DNA. כדי לחשב את מקדם השונות התוך-מבחני (CV), בוצעו מדידות כפולות בתוך אותה צלחת עבור 30 דגימות שנאספו מחולי COVID-19 וקבוצת ביקורת בריאה, וה-%CV חושב כממוצע של המדידות הכפולות; כדי לחשב את קורות החיים בין הבדיקות (כלומר...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תיארנו שיטת סנדוויץ' ELISA שבה MPO או NE נקשרים לאתר אחד של נוגדן הלכידה במהלך הדגירה הראשונית של דגימות המכילות מתחמי MPO-DNA או NE-DNA. לאחר השטיפה, "הכריך" הושלם על ידי דגירה של הדגימות עם נוגדן חד שבטי הקשור לפרוקסידז נגד DNA. לאחר הסרת נוגדן משני לא קשור, מצומד הפרוקסידז הכבול מזוהה על ידי תוספת של מצע כרומוגני ABTS peroxidase, אשר מניב תוצר סופי מסיס שניתן לקרוא ספקטרופוטומטרית ב 405 ננומטר. הליניאריות הטובה והדיוק הגבוה בין הבדיקות והתוך בדיקות מצביעים על כך שבדיקת ELISA המתוארת במאמר זה ובאחרים<...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כל הנתונים שנוצרו ו / או נותחו במהלך מחקר זה כלולים במאמר זה שפורסם. המחברים מצהירים כי אין להם אינטרסים מתחרים.
המחברים מודים לד"ר הוק מוחמד אמינול על סיועו בעיון בכתב היד.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| פולימורפים חד-שלביים | תאגיד כימי ומדעי מדויק | AN221725 | בידוד PMN מדם אנושי. |
| צלחת מיקרוטיטר 96 בארות | Thermo Fisher Scientific | 467466 | תמיסת |
| חיץ ABTS | Sigma-Aldrich Merck | 11 204 530 001 | מכיל נתרן פרבוראט, חומצת לימון ודיסודיום מימן פוספט. |
| טבליות ABTS | סיגמא-אולדריץ' Merck | 11 204 521 001 | כל טבליה מכילה 5 מ"ג מצע ABTS ו-60 מ"ג חומרים לרכב. |
| כיסוי פלסטיק דביק, נוגדן Axygen | Thermo Fisher Scientific | 14222348 | |
| Anti-MPO | Sigma-Aldrich Merck | 07-496-I | חנות ב-2-8 מעלות צלזיוס יציבה למשך שנה. המין המארח הוא ארנב. |
| נוגדן אנטי-NE, שיבוט AHN-10 | Sigma-Aldrich Merck | MABS461 | Store בטמפרטורה של 2-8 מעלות צלזיוס יציב למשך שנה. המין המארח הוא עכבר. |
| אלבומין סרום בקר | מדע ביו-רפואי | BR-220700081 | אלבומין משבר בקר V. חנות ב 2– 8 מעלות צלזיוס יציב למשך שנתיים. |
| חנות DNase I | New England BioLabs | M0303M | ב -20 מעלות; C |
| IgG, ארנב, בקרת איזוטיפ | GENETEX, Inc. | GTX35035 | לאחסן כתמיסה מרוכזת ב-2– 8 מעלות צלזיוס. |
| IgG1, בקרת איזוטיפ עכבר, שיבוט Ci4 | Merck | MABC002 | יש לאחסן כתמיסה מרוכזת ב-2– 8 מעלות צלזיוס. |
| צינור איסוף דם ליתיום הפרין | Becton Dickinson וחברת | ||
| Microplate מערבל | כתאגיד אחד | NS-P | |
| Microplate Reader | מכשירים מולקולריים | SpectraMax 190 | כל קורא לוחות מיקרו-פלטות המסוגל לקרוא אורכי גל מ-405– 490 ננומטר יכול להשתמש. |
| יישום קורא מיקרו-פלטות | מכשירים מולקולריים SoftMax | pro | |
| פרוקסידאז מצומד נוגדן נגד DNA, זיהוי מוות תאי ELISA | Roche אבחון | 1154467500 | בקבוק 2. אחסן ב-2– 8 מעלות צלזיוס יציב למשך שנה. |
| Phorbol 12-myristate 13-acetate | Sigma-Aldrich Merck | P8139 | הפעלת PMN מדם אנושי. |
| תמיסת חוצץ פוספט | Takara Bio | T9181 | יש לאחסן בטמפרטורת החדר. יציב למשך 6 חודשים. |
| SigmaPlot v14.5 | Systat Software Inc. סן חוזה, קליפורניה, ארה" | ||
| נתרן אזיד | Fujifilm Wako Chemicals | 190-14901 | יש לאחסן בטמפרטורת החדר. |
| t-אוקטילפנוקסיפוליאתוקסיאתנול, פוליאתילן גליקול טרט-אוקטילפניל אתר | פוג'יפילם, Wako Chemicals | 9002-93-1 | יש לאחסן בטמפרטורת החדר. |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה