פרוטוקול זה מתאר מיקרו-הזרקה ואלקטרופורציה in vivo לעריכת גנום בתיווך קריספר מוגבלת אזורית באובידוקט העכבר.
Method Article
פרוטוקול זה מתאר מיקרו-הזרקה ואלקטרופורציה in vivo לעריכת גנום בתיווך קריספר מוגבלת אזורית באובידוקט העכבר.
מודלים של עכברים מהונדסים גנטית (G-GEMM) סיפקו תובנה רבת ערך לגבי תפקוד הגן in vivo בהתפתחות, הומאוסטזיס ומחלות. עם זאת, הזמן והעלות הכרוכים בהקמת המושבה ותחזוקתה גבוהים. ההתקדמות האחרונה בעריכת גנום בתיווך קריספר אפשרה יצירת GEMMs סומטיים (S-GEMMs) על ידי התמקדות ישירה בתא/רקמה/איבר המעניין.
האובידוקט, או החצוצרה בבני אדם, נחשבת לרקמת המקור של סרטן השחלות הנפוץ ביותר, קרצינומה שחלתית סרוטית בדרגה גבוהה (HGSCs). HGSCs מתחילים באזור החצוצרה הדיסטלית לרחם, הממוקמת בסמוך לשחלה, אך לא בחצוצרה הפרוקסימלית. עם זאת, מודלים עכבריים מסורתיים של HGSC מכוונים את האובידוקט כולו, ולכן אינם משחזרים את המצב האנושי. אנו מציגים שיטה של מיקרו-הזרקה של תמיסת DNA, RNA או ריבונוקלאו פרוטאין (RNP) לתוך לומן האובידוקט ואלקטרופורציה in vivo כדי להתמקד בתאי אפיתל ריריים באזורים מוגבלים לאורך האובידוקט. ישנם מספר יתרונות של שיטה זו למידול סרטן, כגון: 1) יכולת הסתגלות גבוהה במיקוד האזור/רקמה/איבר ואזור האלקטרופורציה, 2) גמישות גבוהה בסוגי תאים ממוקדים (גמישות תאית) כאשר משתמשים בשילוב עם מקדמים ספציפיים לביטוי Cas9, 3) גמישות גבוהה במספר התאים המתחשמלים (תדר נמוך יחסית), 4) אין צורך בקו עכבר ספציפי (מידול מחלות חיסוניות), 5) גמישות גבוהה בשילוב מוטציות גנטיות, ו -6) אפשרות לעקוב אחר תאים מחושמלים כאשר משתמשים בשילוב עם קו כתב Cre. לפיכך, שיטה חסכונית זו משחזרת את התחלת הסרטן האנושי.
החצוצרה, הנקראת אובידוקט בעכברים, היא מבנה צינורי המחבר את הרחם לשחלה. הוא ממלא תפקיד חיוני ברבייה של יונקים, ומספק את הסביבה להפריה פנימית ולהתפתחות טרום השרשה 1,2. למרות חשיבותו, מעט ידוע על תפקודו והומאוסטזיס, בין היתר בשל פיתוח טכניקות הפריה חוץ גופית העוקפות כל בעיית פוריות הקשורה לאיבר זה3. עם זאת, הוכר כי נגעים טרום סרטניים של קרצינומה שחלתית סרוסית בדרגה גבוהה (HGSC), היסטוטיפ אגרסיבי של סרטן השחלות המהווה כ -75% מקרצינומה בשחלות ו -85% ממקרי המוות הקשורים4, מוגבלים לאפיתל החצוצרה הדיסטלית 5,6,7,8 . זה מצביע על כך שלא כל התאים בגופנו רגישים באותה מידה לעלבונות אונקוגניים, אלא רק תאים ייחודיים/רגישים בכל רקמה/איבר הופכים לתא המקור בסרטן – מה שנקרא גמישות תאית9. לאורך קווים אלה, הוכח כי תאי האפיתל של החצוצרה הדיסטלית, הממוקמת בסמוך לשחלה, נבדלים משאר הצינור10,11. לפיכך, מודלים עכבריים מסורתיים של HGSC, המכוונים לכל התאים באובידוקט, אינם משחזרים את המצב האנושי. במחקר שנערך לאחרונה, השתמשנו בשילוב של עריכת גנום בתיווך קריספר, אלקטרופורציה של אובידוקט in vivo ומעקב אחר שושלת מבוססת Cre כדי לגרום בהצלחה ל- HGSC על ידי מוטציה של ארבעה גנים מדכאי גידול באובידוקט 12,13 של עכבר דיסטלי. כתב יד זה מציג פרוטוקול שלב אחר שלב המתאר הליך זה של מיקרו-הזרקה ואלקטרופורציה in vivo כדי להתמקד באפיתל הרירית של העכבר oviduct.
לשיטה זו מספר יתרונות. ניתן להתאים אותו לרקמות / איברים אחרים, כולל פרנכימה של איברים14. למרות שניתן להשתמש בגישות אחרות להעברת גנים in vivo כמו מערכות לנטי-ויראליות ואדנו-ויראליות כדי להשיג מיקוד ספציפי דומה לרקמות/איברים, אזור המיקוד מותאם בקלות רבה יותר באמצעות גדלים שונים של אלקטרודות מסוג טוויטר להעברה מבוססת אלקטרופורציה. בהתאם לריכוז ה-DNA/RNA/ריבונוקלאו פרוטאינים (RNPs), פרמטרי אלקטרופורציה וגודל האלקטרודות, ניתן לשנות את מספר התאים המתחשמלים. יתר על כן, ניתן לכוון לסוגי תאים ספציפיים כאשר משתמשים בהם בשילוב עם פרומוטורים לביטוי Cas9, ללא צורך מוחלט במודלים של עכברים מהונדסים גנטית (G-GEMM). בנוסף, בניגוד למערכות העברת נגיפים, אלקטרופורציה מאפשרת העברת פלסמיד מרובה לתאים בודדים ופחות אילוץ בהחדרת גודלDNA 15. בדיקות סקר In vivo של מוטציות גנטיות יכולות להתבצע בקלות יחסית גם בשל גמישות גבוהה זו. יתר על כן, תאים electroporated ניתן לעקוב או לעקוב כאשר שיטה זו משמשת בשילוב עם שורות כתב Cre כגון Tdtomato או קונפטי16,17.
בעלי החיים שוכנו בכלובי מיקרו-בידוד סטטיים עם משטחי פילטר, הממוקמים בחדר ייעודי המכיל ארון בטיחות ביולוגית מסוג II. כל עבודת בעלי החיים בוצעה בהתאם להנחיות המוסדיות ואושרה על ידי ועדת הטיפול בבעלי חיים של הפקולטה לרפואה ומדעי הבריאות באוניברסיטת מקגיל (AUP #7843).
1. הכנת מחט מיקרו-הזרקה

איור 1: הכנת מחט מיקרו-הזרקה. (A,B) צינור נימי משוך עם קצה מחודד (A) שנחתך כדי ליצור פתח (B). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
2. הכנת חומר ההרדמה להזרקה תוך צפקית
3. הכנת אזור הניתוח
4. הכנת התמיסה והמחט להזרקה

איור 2: הכנת אזור ניתוח. (A) הגדרת אזור ניתוח בתוך ספסל נקי. (B) מערך מיקרוסקופ דיסקציה ומיקרומניפולטור לאדם ימני. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
5. חשיפת מערכת הרבייה הנשית
6. הזרקת אובידוקט In vivo ואלקטרופורציה

איור 3: חשיפה נשית לדרכי הרבייה ומיקרו-הזרקה . (A) מיקום חתך קו האמצע (מוצג כקו צהוב) בצד הגבי של עכבר Rosa-LSLtdTomato. (B) חשיפה נשית לדרכי הרבייה. כרית השומן הודקה באמצעות מהדק בולדוג סטרילי כדי לעגן את המערכת ולשמור אותה חשופה. (ג,ד) תמונות מייצגות של הזרקת אובידוקט in vivo . מחט מיקרו-הזרקה הוחדרה לאמפולה הדיסטלית (שכותרתה AMP), ו-100% טריפאן כחול מסונן הוזרק לתוך לומן האובידוקט בזמן שדרכי העיכול היו חשופות (C). תמונה מייצגת של אובידוקט מנותח, המדגימה כי תמיסת טריפאן כחול מוזרק מתפשטת ברחבי לומן האובידוקט הדיסטלי והפרוקסימלי (D). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 1 ואיור 2 מתארים את הכנת מחט המיקרו-הזרקה ואת הגדרת אזור הניתוח, בהתאמה, עבור מיקרו-הזרקה in vivo ואלקטרופורציה של האובידוקט של העכבר. במהלך הניתוח, מערכת הרבייה הנשית נחשפה דרך חתכים שבוצעו בעור הגבי (איור 3A) ובדופן הגוף של עכבר Rosa-LSLtdTomato מורדם (Gt(ROSA)26Sortm14(CAG-tdTomato)Hze/J)17. מהדק בולדוג הודק על כרית השומן שמעל מערכת העיכול כדי לשמור עליה חשופה ומעוגנת (איור 3B). תמיסת הזרקה המכילה פלסמידים PCS2 CreNLS18 בריכוז של 400 ננוגרם/מיקרוליטר הוזרקה לאמפולה (המסומנת AMP) של האובידוקט המפותל והורשתה להתפזר לאורך לומן האובידוקט (איור 3C,D). למרות שפלסמידים מסוג PCS2 CreNLS שימשו ליצירת תוצאות מייצגות בכתב יד זה, ניתן להשתמש בשיטה המתוארת עם DNA/RNA/RNPs הניתנים להחלפה בקלות בתמיסת ההזרקה לעריכת גנים בתיווך CRISPR/Cas באובידוקט העכבר. לאחר מכן, הונחו אלקטרודות מסוג פינצטה בקוטר 1 מ"מ או 3 מ"מ, כך שהאובידוקט הדיסטלי היה בין האלקטרודות לצורך העברה מבוססת אלקטרופורציה.
האובידוקט נקטף 4 ימים לאחר הניתוח ונמתח על ידי הסרת המזוסאלפינקס כדי להמחיש ספציפיות אלקטרופורציה. באמצעות אלקטרודות מסוג טוויטר בקוטר 1 מ"מ או 3 מ"מ, אזור המטרה, שסומן ב-TdTomato, הוגבל לאפיתל האובידוקט הדיסטלי (איור 4A,D). גודלו של אזור מטרה זה נשלט עוד יותר על ידי שימוש באלקטרודות בגדלים שונים. באמצעות שימוש באלקטרודות מסוג טוויטר 3 מ"מ, כיוונו לאזור גדול בהרבה של AMP (איור 4B,C), בהשוואה למיקוד רק בקצה הדיסטלי ביותר, INF (איור 4E,F), באמצעות אלקטרודות מסוג טוויטר 1 מ"מ. האובידוקט שנקטף תוקן, טופל בשיפוע סוכרוז וחולק באמצעות קריוסטט לצורך ניתוחים מפורטים. הקטעים הוכתמו ב-Hoescht 33342 וב-Phalloidin כדי להכתים את הגרעינים ואת השלד הציטו-שלד בהתאמה, ואז הם צולמו באמצעות מיקרוסקופ קונפוקלי סורק נקודתית. באזור היעד, תאים מחושמלים, המסומנים על-ידי TdTomato, חולקו באופן אקראי בין תאים שאינם מחושמלים (TdTomato-ve) (איור 4G). נוסף על כך, תאים מחושמלים הוגבלו לאפיתל הרירית ולא נמצאו בשכבת הסטרומה או השריר הבסיסית (איור 4G,H). לבסוף, כדי לאשר עריכת גנים בתיווך CRISPR-Cas, ניתן לבודד תאי TdTomato+ve על ידי מיון תאים המופעלים על ידי פלואורסצנטיות (FACS) לבידוד DNA וריצוף MiSeq12.

איור 4: תיקוף הזרקה מוצלחת in vivo ואלקטרופורציה של תאי אפיתל אובידוקט, 4 ימים לאחר הניתוח. (A-C) אלקטרופורציה באמצעות אלקטרודות מסוג טוויטר בגודל 3 מ"מ. האובידוקט שוחרר על ידי הסרת המזוסאלפינקס להדמיה טובה יותר של ספציפיות אלקטרופורציה (A). אזור האלקטרופורציה, שזוהה על ידי ביטוי TdTomato, הוגבל לאובידוקט הדיסטלי, שכותרתו AMP (B,C). (ד-ו) אלקטרופורציה באמצעות אלקטרודות מסוג טוויטר בגודל 1 מ"מ. האובידוקט שוחרר על ידי הסרת המזוסאלפינקס להדמיה טובה יותר של ספציפיות אלקטרופורציה (D). אזור האלקטרופורציה הוגבל לאינפונדיבולום (המסומן INF), הקצה הדיסטלי ביותר של האובידוקט (E,F). (ז,ח) חתך רוחבי של האובידוקט הדיסטלי 4 ימים לאחר אלקטרופורציה עם פלסמידים PCS2 CreNLS. תאים מחושמלים שסומנו ב-TdTomato (G) הוגבלו לחד-שכבה אפיתל (H). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
שלבים מכריעים בפרוטוקול מפורט זה הם מיקרו-הזרקה של תמיסת DNA/RNA/RNP לתוך לומן האובידוקט ובקרה על חוזק ושטח האלקטרופורציה. דליפת תמיסת DNA/RNA/RNP במהלך מיקרו-הזרקה עלולה לגרום לטרנספקציה של אזורים/תאים לא רצויים. להתחשמלות עקבית ויעילה, עדיף למלא את לומן האובידוקט בתמיסה (איור 3C,D). הסיבה לכך היא שאזור האלקטרופורציה נשלט בעיקר על ידי גודל האלקטרודה ומיקומה. אלקטרופורציה חלשה מפחיתה את מספר התאים המתחשמלים, ואלקטרופורציה קשה עלולה לגרום להתחשמלות של תאים לא רצויים או לשבש את מבנה הרקמה. ניתן לשנות את מספר התאים המחושמלים על ידי התאמת ריכוז תמיסת DNA/RNA/RNP או פרמטרים של אלקטרופורציה. עם זאת, מכיוון שמתח גבוה/ייצור חום במהלך אלקטרופורציה עלול לפגוע ברקמה, יש לבדוק פרמטרים אלה לפני השימוש בעכברים חיים/מורדמים. לבסוף, בשל אופיו התובעני של הליך זה, מומלץ לתרגל חשיפה למערכת העיכול ומיקרו-הזרקה בעכברים מתים לפני ביצוע ניתוח זה בעכברים חיים/מורדמים.
ידוע כי גנים מרובים מעורבים בהתחלת סרטן, ולכן, שחזור אירוע זה דורש שינוי רב אללי של מספר גנים. בנוסף, ידוע גם כי לא כל התאים רגישים באותה מידה למוטציות אונקוגניות9. מודלים של סרטן, אם כן, דורשים קווי עכבר Cre ספציפיים כדי להשיג שליטה הדוקה על עלבונות אונקוגניים. עם זאת, זמינותם וסגולותם גורמת לאתגרים שונים, כולל השפעות ברקמות לא ממוקדות וקטלניות19. יתר על כן, G-GEMM מסורתיים כרוכים בעלויות תחזוקה גבוהות ודורשים זמן ליצירת קווי עכבר. הפיתוח של טכנולוגיית עריכת גנום CRISPR/Cas9 ושיפור העברת הגנים לתאים סומטיים ספציפיים אפשרו לנו להתגבר על בעיות אלה. בפרוטוקול זה, אנו מציגים שיטת העברת DNA/RNA/RNP למניפולציה של גנום סומטי שניתן להשתמש בה למידול סרטן, ללא צורך מוחלט בקווי עכבר ספציפיים12. על-ידי הזרקת תמיסות DNA/RNA/RNP לתוך הלומן ושימוש בגדלים שונים של אלקטרודות מסוג טוויטר להעברה מבוססת אלקטרופורציה, אזורים מוגבלים באפיתל הרירית של העכבר ממוקדים (איור 4A-F). זה שימושי במיוחד במידול ייזום של HGSCs שמקורם בקצה הדיסטלי של החצוצרה.
שיטת המיקרו-הזרקה ואלקטרופורציה in vivo המוצגת היא רב-תכליתית ביותר למיקוד רקמות/איברים באמצעות לומן. פרנכימה של איברים ניתנת למיקוד גם בשיטה זו14. גישות להעברת נגיפים, כמו מערכות לנטי-ויראליות ואדנו-ויראליות, יכולות לשמש גם למטרות דומות. עם זאת, היתרונות של אלקטרופורציה על פני גישות משלוח ויראלי הם: 1) העברת פלסמיד מרובים לתאים בודדים, 2) אין הגבלה על גודל הכנס15, ו -3) שליטה קלה על האזור ועיתוי המסירה. בנוסף, ניתן לשפר את ספציפיות המיקוד באמצעות מקדמים ספציפיים לשושלת. זה לפעמים קשה במערכות ויראליות בגלל המגבלה על אריזות ויראליות.
כטבעה של אלקטרופורציה, תאי אפיתל מחושמלים משולבים באופן אקראי עם תאים בריאים ולא ערוכים (איור 4G). עם זאת, פסיפס זה בתאים מהונדסים גנטית ולא מהונדסים יכול להיות יתרון לחקר התחלת סרטן, מכיוון שהוא משחזר את האופי הספורדי של התחלת סרטן מוקדמת בתוך מיקרו-סביבה חיסונית. ניתן להתאים את התדירות של תאים אלקטרופורטיים על ידי שינוי ריכוזי תמיסת DNA/RNA/RNP ו / או פרמטרים אלקטרופורציה. באמצעות עריכת גנים בתיווך CRISPR-Cas בשילוב עם הפרוטוקול המוצג, קל לסנן גנים מרובים וליצור דפוסים הטרוגניים של מוטציות/שילובים אלליים בגנים ממוקדים; זה שימושי במיוחד במידול סוגי סרטן המציגים מספר ניכר של שינויים גנומיים כמו HGSCs20,21. יתר על כן, על ידי ריצוף גנים ממוקדים במהלך התקדמות הסרטן, ניתן לעקוב אחר האבולוציה השבטית in vivo של גידולים וגרורות בעכברים חיסוניים12.
למחברים אין מה לחשוף.
המחברים מודים לקייטי טנג ולד"ר מתיו ג'יי פורד על אספקת פלסמידים המשמשים ליצירת תוצאות מייצגות ואופטימיזציה של פרוטוקולים. K.H. נתמך על ידי Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS) מענק דוקטורט, קרן דונור, דלתא Kappa Gamma World Fellowship, המרכז לחקר רבייה ופיתוח (CRRD), יו א 'בורק, רולאנד ומרסל גוסלין, ואלכסנדר McFee סטודנטים לתואר שני.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| 0.22 ומיקרו; יחידת סינון סטרילית M | LifeGene | SF0.22PES | |
| 1 מ"ל מזרק | Terumo Medical Corportation | SS-01T | |
| 1 מ"מ אלקטרודות מסוג פינצטה | BEX CO., LTD | ||
| 3 מ"מ אלקטרודות מסוג פינצטה | BEX CO., LTD | ||
| 30G x 1/2 מחט | BD | 305106 | מחט מחוברת למזרק 1 מ"ל בעת שימוש בהרדמה או משכך כאבים להזרקה. |
| מלקחיים של אדסון | פישר סיינטיפיק | 10-000-451 | |
| מזרק בלחץ אוויר | BD | B302995 | מחובר למיקרומניפולטור; כפי שמוצג באיור 2B |
| משכך כאבים | - | קרפרופן, מינון: 5 מ"ג/ק"ג. | |
| אנטיספטי | קרדינל בריאות | OMEL0000017 | באקסדין: 2% כלורהקסידין ב-70% איזופרופיל אלכוהול |
| אברטין (2,2,2-טריברומו-אתנול) - חומר הרדמה | סיגמא אולדריץ' | T48402-25G | |
| מיקרומניפולטור מהדק הר | AD מכשירים | MM-33 | |
| מלקחיים משוננים מעוקלים | פישר NC0696845 | ||
| מיקרוסקופ | ניתוחZeiss | SteREO Discovery.V8 | Apochromat S, 0.63X, FWD 107 מ"מ. LED KL 200 מצורף לתאורה עליונה, מסומן כמקור אור באיור 2B. |
| חומר סיכה לעיניים | משחת אלקון-סיסטן | (משחת עיניים חומר סיכה) | |
| מחטי נימי זכוכית | Sutter Instrument Co. | B100– 50-10 | קוטר חיצוני: 1 מ"מ, קוטר פנימי: 0.5 מ"מ, אורך: 10 ס"מ |
| המוסטטים הרטמן | פישר סיינטיפיק | 50-822-711 | |
| כרית חימום/דיסק | - | כרית חימום מיקרוגל למיטת חיות מחמד SnuggleSafe שימשה בפרוטוקול זה. יש לחמם במיקרוגל למשך 2-5 דקות, ולבדוק עם גב הכפפה. | |
| תושבת מגנטית למיקרומניפולטור | מכשירי AD | MB-B | משמש לשמירה על מיקרומניפולטור תושבת המהדק יציב וזקוף במהלך ההזרקה. |
| מהדק מיקרו בולדוג | פישר סיינטיפיק | 50-822-230 | 3 ס"מ |
| חולץ מיקרופיפטה | Sutter Instrument Co. | P-97 | P-97 חולץ מיקרופיפטה מסוג בוער/חום. התוכנית בשימוש: P = 500, חום = 576, PULL = 50, VEL = 80, DEL = 70 |
| צלחת פטרי | ב-Fisher Scientific | 263991 | ניתן להשתמש בפטריכלים מזכוכית חיטוי/סטרילית. |
| תמיסת מלח חוצצת פוספט (PBS) | Bio Basic Inc. | PD8117 | 10X PBS דולל ל-1X עם מים DI. חיטוי לפני השימוש. |
| מחולל דופק/אלקטרופורטור | BEX CO., LTD | CUY21 EDIT II | הגדרות אלקטרופורציה: 30 וולט, 3 פולסים, מרווח של 1 שניות, P. אורך = 50 אלפיות השנייה, חד קוטבי |
| Rosa-LSLtdעכברי עגבניות | מעבדת ג'קסון | 7914 | Gt(ROSA)26Sortm14(CAG-tdTomato)Hze/J |
| מספריים לנתיחה חדה-קהה | פישר סיינטיפיק | 28251 | |
| מספריים חיתוך חדים מחודדים | פישר סיינטיפיק | SDI130 | |
| - | ניתן להשתמש גם בקרם להסרת שיער. | ||
| תפרים קלועים משי | Ethicon | 682G | 3/8 עיגול, מד: 5-0, גודל מחט: 18 מ"מ, אורך חוט: 75 ס"מ. ניתן להשתמש גם בסיכות. |
| מלקחיים מחודדים עם קצה אולטרה-דק | פישר סיינטיפיק | 12-000-122 | |
| נייר סופג דק | Kimberly-Clark Professional | 34120 | Kimwipes |
| Trypan blue | STEMCELL Technologies | 7050 | מסונן באמצעות 0.22 ומיקרו; מסנן סטרילי M לפני השימוש במיקרו-הזרקה. |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request Permission