מטרת מחקר זה היא לפתח מודל דיגיטלי תלת-ממדי חדשני של גושים ריאתיים המשמש גשר תקשורת בין רופאים לחולים ומהווה גם כלי חדשני לאבחון מוקדם ולהערכה פרוגנוסטית.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
מטרת מחקר זה היא לפתח מודל דיגיטלי תלת-ממדי חדשני של גושים ריאתיים המשמש גשר תקשורת בין רופאים לחולים ומהווה גם כלי חדשני לאבחון מוקדם ולהערכה פרוגנוסטית.
השחזור התלת-ממדי (3D) של גושים ריאתיים באמצעות תמונות רפואיות הציג גישות טכניות חדשות לאבחון וטיפול בגושים ריאתיים, וגישות אלה זוכות בהדרגה להכרה ואומצו על ידי רופאים וחולים. עם זאת, בניית מודל דיגיטלי תלת-ממדי אוניברסלי יחסית של גושים ריאתיים לאבחון וטיפול היא מאתגרת בשל הבדלי מכשירים, זמני צילום וסוגי קשריות. מטרת מחקר זה היא להציע מודל דיגיטלי תלת ממדי חדש של גושים ריאתיים המשמש גשר בין רופאים לחולים ומהווה גם כלי חדשני לאבחון מוקדם והערכה פרוגנוסטית . שיטות רבות לזיהוי וזיהוי קשריות ריאתיות מונעות בינה מלאכותית משתמשות בטכניקות למידה עמוקה כדי ללכוד את התכונות הרדיולוגיות של גושים ריאתיים, ושיטות אלה יכולות להשיג ביצועים טובים מתחת לעקומה (AUC). עם זאת, תוצאות חיוביות שגויות ושליליות שגויות ממשיכות להוות אתגר עבור רדיולוגים וקלינאים. הפרשנות והביטוי של תכונות מנקודת המבט של סיווג ובדיקה של קשריות ריאה עדיין אינם מספקים. במחקר זה מוצעת שיטה לשחזור תלת-ממדי רציף של הריאה כולה במיקומים אופקיים ועטרתיים על ידי שילוב טכנולוגיות עיבוד תמונה רפואיות קיימות. בהשוואה לשיטות ישימות אחרות, שיטה זו מאפשרת למשתמשים לאתר במהירות גושים ריאתיים ולזהות את תכונותיהם הבסיסיות תוך התבוננות בגושים ריאתיים מנקודות מבט מרובות, ובכך לספק כלי קליני יעיל יותר לאבחון וטיפול בגושים ריאתיים.
השכיחות העולמית של גושים ריאתיים משתנה, אך ההערכה המקובלת היא כי לכ-30% מהמבוגרים יש לפחות קשרית ריאתית אחת הנראית בצילומי חזה1. שכיחות קשריות ריאה גבוהה יותר באוכלוסיות ספציפיות, כגון מעשנים כבדים ובעלי היסטוריה של סרטן ריאות או מחלות ריאה אחרות. חשוב לציין כי לא כל גושי הריאה הם ממאירים, אך יש צורך בהערכה יסודית כדי לשלול ממאירות2. גילוי מוקדם ואבחון של סרטן ריאות חיוניים לשיפור שיעורי ההישרדות, ובדיקות סקר קבועות עם טומוגרפיה ממוחשבת במינון נמוך (LDCT) מומלצות לאנשים בסיכון גבוה. שיטות רבות לזיהוי וזיהוי קשריות ריאתיות 3,4,5,6,7 מונעות בינה מלאכותית משתמשות בטכניקות למידה עמוקה כדי ללכוד את התכונות הרדיולוגיות של גושים ריאתיים, ושיטות אלה יכולות להשיג שטח טוב מתחת לעקומה (AUC) ביצועים. עם זאת, תוצאות חיוביות שגויות ושליליות שגויות ממשיכות להוות אתגר עבור רדיולוגים וקלינאים. הפרשנות והביטוי של תכונות מנקודת המבט של סיווג ובדיקה של קשריות ריאה עדיין אינם מספקים. במקביל, שחזור תלת ממדי של גושים ריאתיים המבוססים על LDCT זכה לתשומת לב גוברת כמודל דיגיטלי עבור סוגים שונים של גושים.
שחזור 3D של גושים ריאתיים הוא תהליך שיוצר ייצוג 3D של גידול קטן או גוש בריאה. תהליך זה כולל בדרך כלל יישום של טכניקות ניתוח תמונה רפואית הממנפות הן מומחיות רפואית והן גישות מודיעין נתונים. המודל הדיגיטלי התלת-ממדי המתקבל מציע תיאור מפורט ומדויק יותר של הגולם, ומאפשר הדמיה וניתוח משופרים של גודלו, צורתו ויחסיו המרחביים עם רקמות הריאה הסובבות אותו 8,9,10,11,12. מידע כזה יכול לסייע באבחון ומעקב אחר גושים ריאתיים, במיוחד אלה החשודים כסרטניים. על ידי הקלה על ניתוח מדויק יותר, שחזור 3D של גושים ריאתיים יש פוטנציאל לשפר את דיוק האבחון וליידע החלטות טיפול.
הקרנה בעוצמה מרבית (MIP) היא טכניקה פופולרית בתחום השחזור התלת-ממדי של גושים ריאתיים ומשמשת ליצירת הקרנה דו-ממדית של תמונה תלת-ממדית 8,9,10,11,12 היא שימושית במיוחד בהדמיה של נתונים נפחיים שחולצו מקבצי הדמיה דיגיטלית ותקשורת ברפואה (DICOM) שנסרקו על ידי CT. טכניקת MIP פועלת על ידי בחירת הווקסלים (היחידות הקטנות ביותר של נתוני נפח תלת-ממדיים) בעוצמה הגבוהה ביותר לאורך כיוון הצפייה והקרנתם על מישור דו-ממדי. התוצאה היא תמונה דו-ממדית המדגישה את המבנים בעלי העוצמה הגבוהה ביותר ומדכאת את אלה בעלי העוצמה הנמוכה יותר, מה שמקל על זיהוי וניתוח תכונות רלוונטיות 9,10,11,12. עם זאת, MIP אינו נטול מגבלות. לדוגמה, תהליך ההקרנה עלול לגרום לאובדן מידע, והתמונה הדו-ממדית המתקבלת עשויה שלא לייצג במדויק את המבנה התלת-ממדי של האובייקט שמתחתיו. עם זאת, MIP נותר כלי רב ערך לדימות והדמיה רפואית, והשימוש בו ממשיך להתפתח עם התקדמות הטכנולוגיה וכוח המחשוב11.
במחקר זה פותח מודל MIP עוקב להדמיית גושים ריאתיים קל לשימוש, ידידותי למשתמש עבור רדיולוגים, רופאים וחולים, ומאפשר זיהוי והערכה של תכונות גושים ריאתיים. היתרונות העיקריים של גישת עיבוד זו כוללים את ההיבטים הבאים: (1) ביטול תוצאות חיוביות שגויות ושליליות שגויות הנובעות מזיהוי דפוסים, המאפשר התמקדות בסיוע לרופאים לקבל מידע מקיף יותר על המיקום, הצורה והגודל התלת-ממדי של גושי ריאה, כמו גם הקשר שלהם לכלי הדם הסובבים אותם; (2) לאפשר לרופאים מומחים לרכוש ידע מקצועי במאפייני קשריות הריאה גם ללא סיוע של רדיולוגים; ו-(3) שיפור יעילות התקשורת בין רופאים למטופלים והערכת פרוגנוזה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: במהלך שלב עיבוד מקדים של נתונים, יש למיין וליירט את נתוני DICOM המקוריים כדי להבטיח תאימות להתקנים שונים ותוצאות עקביות. יכולת כוונון נאותה חייבת להיות שמורה לעיבוד עוצמה, ופרספקטיבה תלת-ממדית רציפה חיונית לתצפית. בפרוטוקול זה מובא תיאור שיטתי של הגישה המחקרית, המפרט מקרה של מטופלת בת 84 עם גושים ריאתיים. מטופלת זו נתנה הסכמה מדעת לאבחנה שלה באמצעות מודלים דיגיטליים ואישרה את השימוש בנתונים שלה למטרות מחקר מדעי. פונקציית שחזור המודל נגזרת מכלי התוכנה PulmonaryNodule (ראה טבלת חומרים לפרטים). אישור אתי התקבל מוועדת האתיקה של בית החולים דונגג'ימן, המסונף לאוניברסיטת בייג'ינג לרפואה סינית (DZMEC-KY-2019.90).
1. איסוף נתונים והכנתם
2. מודל דיגיטלי לשחזור תלת ממדי אופקי
הערה: תת-התהליך 3Dlung_Horizon מבצע בדיקה יסודית של גושים ריאתיים מנקודת מבט אופקית.
3. בניית מודל דיגיטלי תלת ממדי לכל גולם ספציפי
הערה: מספר הפרוסה הוא פרמטר של 3D_Nodules הפונקציה, המשחזר מודל דיגיטלי תלת-ממדי שניתן לצפות בו מכל נקודת מבט.
4. מודל דיגיטלי של שחזור תלת מימד קורונלי
הערה: תת-התהליך Build_3Dlung_Coronal מבוצע כדי להעריך גושים ריאתיים מנקודת מבט קורונלית חלופית, ובכך מסייע לרופאים ולחולים לפתח הבנה מדויקת וכוללנית יותר של המיקום והתכונות של הגושים.
5. פלט וידאו תלת מימד לגושים ריאתיים דומיננטיים
הערה: המרת המודל הדיגיטלי התלת-ממדי האופטימלי של קשרית ריאתית לסרטון תלת-ממדי דינמי מאפשרת לרופאים ולמטופלים להבין טוב יותר את המצב ולקבל החלטות מדויקות, דבר קריטי במיוחד לגיבוש תוכניות טיפול יעילות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כדי להפוך את השיטה לישימה למגוון רחב יותר של התקנים, יש לארגן מחדש את סדר הערימה של כל סריקה בהתבסס על הקואורדינטות הפנימיות של מערכת הקבצים DICOM (איור 1) כדי ליצור את אמצעי האחסון התלת-ממדי הנכון (איור 2). בהתבסס על נתוני הנפח המדויקים, השתמשנו בשחזור אלגוריתמי רציף של MIPs אופקי ועטרה של הריאה של המטופל (איור 4 ואיור 5) לצורך אבחון וטיפול מדויקים בגושים הריאתיים של המטופל.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
להתקני LDCT שונים יש הבדלים משמעותיים ברצפי התמונה של DICOM שהם מפיקים, במיוחד במונחים של ניהול מערכת הקבצים. לכן, כדי לשחזר את המודל הדיגיטלי התלת-ממדי המרכזי של קשרית ריאתית בשלבים מאוחרים יותר של הפרוטוקול, שלב עיבוד הנתונים חשוב במיוחד. בשלב הכנת הנתונים והעיבוד המוקדם (שלב 1.2.2), ניתן למיין נכון את קואורדינטת ציר z של הרצף באמצעות הרצף המוצג באיור 1, אשר יכול לשמש גם כדי לארגן כראוי את סדר התמונה הנכון הדרוש למידול וליצור את הנפח התלת-ממדי הנכון עבור עבודת המידול הבאה. השחזורים התלת-ממ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כלי התוכנה לשחזור מודל קשריות ריאתיות, PulmonaryNodule, הוא תוכנה מסחרית של Beijing Intelligent Entropy Science & Technology Co Ltd. זכויות הקניין הרוחני של כלי תוכנה זה שייכות לחברה. למחברים אין ניגודי עניינים לחשוף.
פרסום זה נתמך על ידי התוכנית הלאומית החמישית לחקר כישרונות קליניים מצוינים ברפואה סינית מסורתית שאורגנה על ידי המנהל הלאומי לרפואה סינית מסורתית (http://www.natcm.gov.cn/renjiaosi/zhengcewenjian/2021-11-04/23082.html).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| MATLAB | MathWorks | 2022ב | מחשוב וויזואליזציה |
| כלים למידול | אינטליגנטי אנטרופיה | ריאתיתNodule V1.0 | בייג'ינג אנטרופיה אינטליגנטית מדע & Technology Co Ltd. מידול לאיחוי CT/MRI |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.