מאמר שיטה

שיפור האמינות הביו-בנקאית של גידול הערמונית באמצעות טכניקת דגימה משופרת ואפיון היסטולוגי

DOI:

10.3791/65635

⸱

17 בנובמבר 2023

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 
1Department of Pathology, Hospital Universitario y Politécnico La Fe, 2Department of Urology, Hospital Universitario y Politécnico La Fe, 3Biobanco La Fe, Instituto de Investigación Sanitaria La Fe, 4Department of Medicine, Jaume I University of Castellon, 5Department of Surgery, University of Valencia, 6Department of Pathology, University of Valencia

* These authors contributed equally

במאמר זה

סיכום

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

פרוטוקול זה מתאר שיטה להקל על איסוף דגימות מדגימות כריתת ערמונית רדיקלית. המטרה היא למפות, לאפיין ולנתח במיקרו-מאקרו דגימות רקמה מהדגימות על סמך קריטריונים אנטומופתולוגיים לפני אחסונן בביובנק.

תקציר

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

רכישת דגימות רקמת גידול טריות ומאופיינות היטב היא קריטית לביצוע מחקרי "אומיקס" איכותיים. עם זאת, זה יכול להיות מאתגר במיוחד בהקשר של סרטן הערמונית (PC) בשל האופי הייחודי של איבר זה ואת ההטרוגניות הגבוהה הקשורים גידול זה. מצד שני, אפיון היסטופתולוגי של דגימות לפני אחסונן מבלי לגרום לשינויים משמעותיים ברקמה הוא גם אתגר מסקרן. במסגרת זו אנו מציגים שיטה חדשה לרכישה, מיפוי, אפיון וניתוח מיקרו של רקמת ערמונית מנותחת על פי קריטריונים אנטומופתולוגיים.

בניגוד לפרוטוקולים שפורסמו בעבר, שיטה זו מפחיתה את הזמן הדרוש לניתוח היסטופתולוגי של דגימת הערמונית מבלי לפגוע במבנה שלה, שהוא קריטי להערכת שולי הניתוח. יתר על כן, הוא מאפשר תיחום ודיסקציה מיקרו-מאקרו של דגימות רקמת ערמונית טריות, תוך התמקדות באזורים גידוליים היסטולוגיים המוגדרים על ידי קריטריונים פתולוגיים כגון ציון גליסון, נגעים מקדימים (neoplasia intraepithelial intraepithelial בדרגה גבוהה - PIN), ונגעים דלקתיים (prostatitis). דגימות אלה מאוחסנות לאחר מכן בביובנק לצורך ניתוחי מחקר עוקבים.

מבוא

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

סרטן הערמונית (PC) הוא הסרטןהשני בשכיחותו בקרב גברים וגורם המוות המובילהחמישי בעולם1. הטיפול והפרוגנוזה של המטופל תלויים בבימוי ובדירוג (ציון גליסון) של הגידול, כפי שמעידים שיעורי ההישרדות הגבוהים יותר של 5 שנים של גידולים מקומיים ונמוכים (דירוג גליסון 6) (99%) בהשוואה לציוני גליסון גבוהים וגידולים גרורתיים (31%)2.

הישנות מקומית של PC וכישלון טיפול נקשרו להטרוגניות הגנטית הגבוהה האופיינית של גידול זה מסוג3. בנוסף, PC נחשבת למחלה מולטיפוקלית עם מספר מוקדי גידול בעלי מאפיינים מורפולוגיים, היסטולוגיים ומולקולריים שונים4, אשר עשויים לנבוע באופן עצמאי או לנבוע מאב קדמון משותף של תאי גידול5. מחקרים קודמים הראו כי התפתחות הגידול שונה בין חולים בהתבסס על מניעים גנטיים ספציפיים שיכולים לקדם גרורות או להגביל את שושלת התאים לערמונית5. לכן, אפיון מולקולרי של מוקדי הגידול השונים חיוני לא רק למתן אבחנה ופרוגנוזה מדויקות יותר, אלא גם להתאמת טיפול יעיל ומותאם אישית לחולה.

בהקשר זה, המחקר הביו-רפואי וגישות מולטי-אומיקה אינטגרטיביות מציעים הזדמנויות חסרות תקדים לסווג סרטן לתת-סוגים שונים, לזהות סמנים ביולוגיים אבחוניים ופרוגנוסטיים ולגלות סמנים הקשורים לתגובה לטיפול. יתר על כן, גישות אלה תורמות להבנה טובה יותר של הביולוגיה של מחלה זו 6,7. דגימות ביולוגיות, בין אם רקמות או נוזלים ביולוגיים, ניתנות לניתוח באמצעות פלטפורמות מולטי-אומיות שונות (גנומיקה, תעתוק, פרוטאומיקה, מטבולומיקה וכו ') כדי לחשוף את התכונות הביולוגיות העומדות בבסיס הפתופיזיולוגיה של הסרטן, ובכך להתמודד עם המגבלות הנוכחיות הקשורות להטרוגניות גנטית ופנוטיפית6. עם זאת, חשוב לקחת בחשבון כי איכות הנתונים הנגזרים ממחקרי אומיקס תלויה באיכות הדגימות שנאספו מגידולים, אפיונן המדויק ועיבודן ואחסונןלאחר מכן 8.

בהקשר זה, השגת רקמת PC טרייה למחקר מציבה אתגר מתודולוגי בשל הקושי בדגימה מוצלחת של הגידול9. שיטות קודמות כללו דגימה אקראית לאחר כריתה רדיקלית של הערמונית, שהניבה תוצאות גרועות10. עם זאת, גישות עדכניות יותר משלבות פרוטוקולים ממוקדים המבוססים הן על דימות תהודה מגנטית (MRI) והן על נתוני ביופסיה, וכתוצאה מכך יעילות משופרת באיסוף דגימות הגידול11.

מצד שני, אפיון היסטופתולוגי של דגימות לפני אחסונן ללא שינוי משמעותי ברקמה מציב גם הוא אתגר מעניין. כתוצאה מכך, במקרים רבים, הקביעה ההיסטופתולוגית של הדגימות מתבצעת לאחר ניתוחן (למשל, HR 1H NMR metabolomic analysis)12. פרקטיקה זו כרוכה בהוצאות מיותרות, צריכת זמן ואובדן של מספר משמעותי של דגימות שבסופו של דבר אינן נכללות בניתוח (למשל, דגימות שלאחר ניתוח היסטופתולוגי מתבררות כלא דגימות גידול). במקרים אחרים, האפיון ההיסטופתולוגי של הדגימות מתבצע לפני ניתוחן. למעשה, כמה מחקרים קודמים ניסו לתקנן שיטות למתן דגימות מחקר מייצגות באיכות גבוהה מדגימות כריתת ערמונית רדיקלית עבור גנומיקה ומטבוליקה13,14. עם זאת, יעילות הדגימה גבוהה משמעותית כאשר היא מבוצעת מקטעים שכבר אושרו היסטולוגית (88%) המשבשים את הרקמה, בהשוואה כאשר היא מבוצעת מקטעים לא מאושרים (45%)1.

כאן, מתודולוגיה חדשה מוצגת כדי להתגבר על מגבלות אלה, במטרה להשיג דגימות PC טריות ומאופיינות היטב לפני אחסון בביובנק. שיטה זו פותחה באמצעות מאמצים משותפים בין שירותים קליניים שונים (אורולוגיה, פתולוגיה וביובנק בית החולים לה פה). חשוב להדגיש כי ביובנקים ממלאים תפקיד חיוני באיסוף, עיבוד, שימור ואחסון של דגימות ביולוגיות תוך הבטחת האיכות הגבוהה של דגימות ונתונים, כמו גם עמידה בדרישות אתיות ומשפטיות 8,15,16.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

שיטה זו פותחה באמצעות מאמצים משותפים הכוללים שירותים קליניים שונים (אורולוגיה, פתולוגיה וביובנק בית החולים לה פה). המחקר נערך בהתאם להנחיות מוסדיות, לאומיות ובינלאומיות לרווחת האדם, והוא קיבל אישור מוועדת האתיקה למחקר ביו-רפואי בבית החולים לחקירת סניטריה Universitario y Politécnico La Fe (ולנסיה, ספרד). כל הדגימות אוחסנו בביובנק של בית החולים לה פה (PT13/0010/0026). הנוהל הכולל מפורט באיור 1.

figure-protocol-1
איור 1: תכנית ההליך הכוללת. ייצוג סכמטי של ההליך המדורג המתואר בסעיף הפרוטוקול. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

1. מיקוד הגידול

  1. לפני הניתוח, השתמש בדימות תהודה מגנטית מולטי-פרמטרי או בי-פרמטרי (mpMRI או bpMRI)17,18 כדי לאתר את הגידול ולמפות את מיקומו בתוך בלוטת הערמונית. שלב את המידע המתקבל מ- MRI עם ממצאים מאולטרסאונד טרנס-רקטלי או בדיקה רקטלית אם האחרון מניב תוצאות צורמות.
  2. כדי לשפר את לוקליזציה של הגידול, סקור את התוצאות של ביופסיות ערמונית טרנס-רקטליות מונחות אולטרסאונד לפני הניתוח ומונחות MRI.
    הערה: בהליך האבחון של סרטן הערמונית, ביופסיות נלקחות ישירות מהערמונית באמצעות גישה טרנס-רקטלית. ביופסיות אלה כוללות דגימה שיטתית מהערמונית (הכוללת גלילים המפוזרים בכל רחבי הבלוטה) וצילינדרים המכוונים ישירות לממצאים חשודים ב-MRI. כדי למקד את שליפת הדגימות הללו, נעשה שימוש באולטרסאונד טרנס-רקטלי, המשולב עם ממצאי MRI באופן קוגניטיבי ("היתוך קוגניטיבי") או עם "תוכנת היתוך אמיתית של MRI-אולטרסאונד" כאשר היא זמינה.

2. כריתה רדיקלית של הערמונית ואיסוף הערמונית

  1. בצע כריתת ערמונית רדיקלית מתוקננת בסיוע רובוטי באמצעות גישה טרנספריטונאלית, בהתאם לצעדים המתוארים על ידי Huynh et al.19.
    1. התחל עם גישה לבטן, אינספלציה ומיקום יציאת המצלמה (ראה טבלת חומרים). מקם את חמש היציאות הנותרות תחת ראייה ישירה. הגדר pneumoperitoneum ל 12 מ"מ.
    2. שחררו את שלפוחית השתן על ידי חיתוך הצפק ונתחו את החלל הפרירקטלי.
    3. פתחו את הפאשיה של האגן מכל צד.
    4. לבצע דיסקציה מלאה של ההיבטים הקדמיים והצדדיים של הערמונית ושלפוחית השתן.
    5. בצע את פתיחת צוואר שלפוחית השתן, זהה וחתך את השופכה הפרוקסימלית כדי לקבל גישה להיבטים האחוריים של הערמונית ושלפוחית השתן.
    6. לנתח את שלפוחית הזרע ואת חלל פי הטבעת19.
    7. לנתח את ההיבטים הרוחביים של הערמונית, חוסך את צרורות neurovascular.
    8. להבטיח hemostasis של כלי בחלל retropubic.
    9. מנתחים את הקודקוד וחותכים את השופכה הדיסטלית.
    10. להשלים את anastomosis vesicourethral.
    11. לחלץ את הערמונית ולבצע את סגירת החתך19.
  2. לאסוף את הערמונית הטרייה במיכל יבש. חשוב מאוד לא לתקן או להטמיע פרפין את הדגימה לדוגמה.
  3. העבירו את הדגימה הכירורגית הטרייה, הכוללת את הערמונית כולה, לביובנק לעיבוד דגימה.

3. עיבוד ערמונית ואיסוף דגימות

  1. בחר אזורי ערמונית ממוקדים לדגימה בהתבסס על מידע על מיקום הגידול שנלקח מ- mpMRI לפני הניתוח, תוצאות ביופסיה לפני הניתוח ומישוש ישיר של דגימת כריתת הערמונית. רשום מידע זה בטופס הכולל נתוני זיהוי מטופלים, אזורי ערמונית שנדגמו לבסוף ומספר הדגימות שנאספו.
    הערה: כאשר ממצאי MRI, תוצאות ביופסיה לפני הניתוח ומישוש ישיר של דגימת הערמונית תואמים זה לזה, יש לכוון את כל הדגימות למיקום זה או אחר (בין 4 ל -6 גלילים). אם יש אי התאמה, להגדיל את מספר הצילינדרים בנפרד להתמקד בכל האזורים החשודים להיות מושפעים על ידי כל השיטות האלה.
  2. השתמש במחט אוטומטית חד פעמית (מנתח) כדי לאחזר דגימות גליליות מהאזורים שנבחרו (שלב 1.1). לאחר מכן, לזהות (פתולוג) את האזור החיצוני של הצילינדר, להדק את הגליל עם מלקחיים רקמות, להניח אותו על שקופית, ולסמן את האזור החיצוני עם דיו רקמות. חזור על תהליך זה עם כל הצילינדרים שנלקחו.
  3. מניחים את הצילינדרים שנאספו בצורה אופקית על דיסק מחזיק דגימה (ראה טבלת חומרים) מלא בתווך הטבעה קריוסטטי ומעבירים אותם לפלטת קירור מיקרוטום לחיתוך.
  4. לאחר שהונח על הצלחת, חבר את דיסק מחזיק הדגימה לצ'אק הדגימה, וחתך אותו בתנועות זהירות של הגלגל בעקבות השלבים הבאים:
    1. השתמש בתרכובת טמפרטורת החיתוך האופטימלית (תרכובת OCT, ראה טבלת חומרים) כדי להטביע את דגימת הרקמה לפני חתך קפוא על מיקרוטום-קריוסטט.
    2. לאחר מכן, חתכו את הדגימה באמצעות קריוסטט-מיקרוטום בטמפרטורה של -25°C. אספו קטעי רקמה דקים בצורת גליל (10 מיקרומטר) על שקופיות מיקרוסקופ מטופלות. הקפד לאסוף רק כמה מיקרונים של רקמה כדי להבטיח כמות מספקת של רקמת גידול שלמה לאחסון בביובנק.
    3. אסוף שניים או שלושה מקטעים דקים בכל שקופית והכתים אותם ידנית כדי לשלוט בצבע הסופי. עינו של הטכנאי מבטיחה צביעה אופטימלית, וניתן לבצע כל צביעה מחדש נדרשת. בצע את השלבים הבאים
      1. יש לתקן שקופיות באתנול 96%, ללחלח במים מזוקקים ולהכתים עם המטוקסילין האריס (ראו טבלת חומרים) למשך דקה אחת כדי להכתים את הגרעינים. הסר עודף hematoxylin על ידי שטיפת שקופיות עם מים מזוקקים.
      2. טפלו במגלשות עם 30% אמוניום הידרוקסיד כדי להפוך את ההמטוקסילין לכחול. יש להסיר את עודפי התמיסה בשטיפות של מים מזוקקים.
      3. שקופיות צביעה עם eosin (ראה טבלת חומרים) במשך 30 שניות.
      4. לאחר מכן, יש לייבש את המגלשות עם טיטרציות הולכות וגדלות של אלכוהול, לנקות עם קסילן (100%), ולהרכיב אותם עם DPX (תערובת של דסטירן, פלסטיסייזר וקסילן, המשמש כאמצעי הרכבה סינתטי של שרף המחליף קסילן-בלסם, ראה טבלת חומרים). במהלך שלבים אלה, טבלו את המגלשות והוציאו אותן מצנצנת תמיסת קופלין.
      5. לבסוף, הניחו מכסה על גבי הרקמה המוכתמת והשתמשו בתווך בעל מקדם שבירה מתאים (ראו טבלת חומרים) לצפייה תחת מיקרוסקופ.

4. אפיון לדוגמה

  1. לנתח את הדגימה תחת מיקרוסקופ אור (פתולוג), להבחין בין אזורי קרצינומה ולקבוע את ציון גליסון של הגידול. לתעד את כל הנתונים הללו ולסמן את אזורי הגידול המדויקים בשקופיות.
  2. במהלך שלב זה, תייג את השקופית עם המיקום המדויק של הגידול וציון גליסון20 המתאים לו. כמו כן, סמן את המיקום של PIN (Prostatic Intraepithelial Neoplasm) בהתבסס על זיהוי מורפולוגי.

5. דגימה מיקרו-מאקרו-דיסקציה ואחסון

  1. סמן בבירור רכיבים היסטולוגיים שונים עם סמנים ברורים על השקופית (פתולוג) וקשר אותם ישירות עם רקמה קפואה על הדיסק.
  2. לאחר מכן, באמצעות להב כירורגי, מאקרו-מיקרו לנתח את האזורים של הדגימה המסומנים על השקופית בתוך דיסק OCT, לחלק אותם לרקמת גידול, peri-tumoral, PIN, ורקמת ערמונית רגילה.
  3. כאשר מדיום ההטבעה מתחיל להפשיר, טפל ברקמה עם מלקחיים והנח אותה לתוך cryotubes מסומן כראוי.
    הערה: אחסן בזהירות כל קטע מנותח בתוך הצינור המתאים, לאחר האבחנה ההיסטולוגית של פרוסות ההקפאה.
  4. אחסן את ה- cryotubes המסומנים עם דגימות היסטולוגיות מאופיינות במלואן בביובנק ב- -80 °C לשימוש עוקב במחקרים.
    הערה: השלבים המתוארים בסעיף זה יכולים להתבצע על ידי טכנאי מיומן תחת פיקוחו של הפתולוג. הדגימה הכירורגית צריכה להיות מועברת לביובנק בהקדם האפשרי כדי למנוע התפרקות רקמות וחומצות גרעין. על פי מדריכי הייחוס, יש לעשות מאמצים להימנע מזמן איסכמיה ממושך (>30 דקות)21. הדגימות יכולות להישמר בביובנק ללא הגבלת זמן כל עוד נשמרים עקרונות איכות הדגימה.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

התוצאות מראות כי טכניקה זו אפשרה להשיג חומר גידולי ב-61% מהמקרים שנחקרו (25 מתוך 41 מקרים) (טבלה 1).

טבלה 1: נתונים היסטופתולוגיים של דגימות מחקר. סיכום נתונים היסטופתולוגיים עבור הדגימות ששימשו במחקר. גליל האבחון מתייחס לדגימת ביופסיית הערמונית המתקבלת למטרות אבחון, ואילו הגליל המעובד מתאים לגליל המתקבל מדגימת כריתת הערמונית למטרות מחקר. ND: אין נתונים; LL: לובולה שמאלית; RL: לובולה ימנית; TTB: נטל הגידול הכולל.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

בכל מחקר, השגת דגימות איכותיות היא דרישה חיונית להפחתת הטיות שיטתיות ולהשגת תוצאות אמינות22. לכן, יש לקחת בחשבון בקרה על משתנים פרה-אנליטיים כגון הטמפרטורה שבה הדגימות מעובדות ומאוחסנות, הזמן שחלף מאיסוף הדגימות ועד לאחסון, השימוש בחומרים מעוקרים או ההשפעות שיכולות להיות להוספת חומרים משמרים או תוספים אחרים על הדגימות בכל פרוטוקול הכולל דגימות ביולוגיות. לא רק מפתח זה, אלא גם זיהוי נכון וקודיפיקציה של דגימות, כמו גם אפיון פתולוגי שלהם, הם קריטיים. אחרת, ייתכן שיהיה מספר גדול של דגימות באיכות גבוהה...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

המחברים מצהירים כי אין ניגוד עניינים.

תודות

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

א.ל. מאשר חוזה פוסט-דוקטורט "מרגריטה סאלאס" (מספר 21-076), ו-MAM-T חוזה מחקר "מריה זמבראנו" (מספר MAZ/2021/03 UP2021-021). שני החוזים מומנו על ידי האיחוד האירופי - הדור הבא של האיחוד האירופי.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
מלקחיים של CadiereאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 471049. 18 שימושים.
שקופיות קונבנציונליותKnittel Glass2021טחון/קצה חלבי
Cryostat microtomeThermo Fisher Scientific---Criostato CryoStar NX50
CryotubesGreiner Bio-One GmbHRef.: 122280.CRYO S. PP, עם מכסה בורג, סטרילי. 
מערכת כירורגית דה וינצ'יאינטואיטיביתPN1052082-US 10/2021XI
דגם מכשירי דיסקציהבאייר---שתי פינצטה ולהב כירורגי 
DPX יוקיט Medizin- und Labortechnik GmbH6.00.01.0001.0001.06.01.01
EosinAgilent157252
מלקחיים דו-קוטביים FenestratedאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 471205. 14 חיים.
כוח דו קוטביאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 471405. 12 שימושים.
מקפיאיםתרמו סיינטיפיקדגם 907. -80 º C
HematoxylinAgilent157251
Inmunohistochemistry SlidesAgilent-DakoK802021-2
נהג מחט גדולאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 471006. 15 שימושים.
מלקחיים דו קוטביים של מרילנדאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 471172. 14 שימושים.
מיקרוסקופאולימפוס---אולימפוס cx40
להבי מיקרוטוםPFM רפואיa35
מספריים מעוקלים מונופולארייםאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 470179. 10 שימושים.
OCT compoundNEG-50LOT.117340
PlusSpeed S מכשיר ביופסיה חד פעמי עם קצה משופעPeter Pflugbeil GmbH PSS-1825-S
מלקחיים ProGaspאינטואיטיביPN1052082-US 10/2021מספר חלק: 471093. 18 שימושים.
מחזיק מדגם דיסקDavidson Cryo Chuck. BradleyProducts30 מ"מ 
דיו טישוPelikan2021דיו 4001 שחור מבריק (301168)
XylolQuimipurRef. 169

מקורות

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Rawla, P. Epidemiology of prostate cancer. World Journal of Oncology. 10 (2), 63-89 (2019).
  2. Epstein, J. I. The 2019 Genitourinary Pathology Society (GUPS) white paper on contemporary grading of prostate cancer. Archives of Pathology & Laboratory Medicine. 145 (4), 461-493 (2021).
  3. Zhang, W. Intratumor heterogeneity and clonal evolution revealed in castration-resistant prostate cancer by longitudinal genomic analysis. Translational Oncology. 16, 101311(2022).
  4. Haffner, M. C., et al. Genomic and phenotypic heterogeneity in prostate cancer. Nature Reviews Urology. 18 (2), 79-92 (2021).
  5. Woodcock, D. J. Prostate cancer evolution from multilineage primary to single lineage metastases with implications for liquid biopsy. Nature Communications. 11 (1), 5070(2020).
  6. Heo, Y. J., Hwa, C., Lee, G. H., Park, J. M., An, J. Y. Integrative multi-omics approaches in cancer research: from biological networks to clinical subtypes. Molecules and Cells. 44 (7), 433-443 (2021).
  7. Menyhárt, O., Győrffy, B. Multi-omics approaches in cancer research with applications in tumor subtyping, prognosis, and diagnosis. Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, 949-960 (2021).
  8. Annaratone, L. Basic principles of biobanking: from biological samples to precision medicine for patients. Virchows Archiv. 479 (2), 233-246 (2021).
  9. King, C. R., Long, J. P. Prostate biopsy grading errors: A sampling problem. International Journal of Cancer. 90 (6), 326-330 (2000).
  10. Jayadevan, R., Zhou, S., Priester, A. M., Delfin, M., Marks, L. S. Use of MRI-ultrasound fusion to achieve targeted prostate biopsy. Journal of Visualized Experiments. 146, e59231(2019).
  11. Heavey, S., et al. Use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking. Journal of Visualized Experiments. 152, 60216(2019).
  12. Panach Navarrete, J. Estudio metabolómico en tejido prostático y orina para el diagnóstico y pronóstico del cáncer de próstata. , https://roderic.uv.es/handle/10550/81853 (2022).
  13. Bertilsson, H., et al. A new method to provide a fresh frozen prostate slice suitable for gene expression study and MR spectroscopy. The Prostate. 71 (5), 461-469 (2011).
  14. Show SOP - Biospecimen Research Database. , https://brd.nci.nih.gov/brd/sop/show/522 (2022).
  15. Dagher, G. Quality matters: International standards for biobanking. Cell Proliferation. 55 (8), e13282(2022).
  16. Yüzbaşıoğlu, A., Özgüç, M. Biobanking: sample acquisition and quality assurance for "omics" research. New Biotechnology. 30 (3), 339-342 (2013).
  17. Carpagnano, F. A. Multiparametric MRI: local staging of prostate cancer. Current Radiology Reports. 8 (12), 27(2020).
  18. Christophe, C. Prostate cancer local staging using biparametric MRI: assessment and comparison with multiparametric MRI. European Journal of Radiology. 132, 109350(2020).
  19. Huynh, L. M., Ahlering, T. E. Robot-assisted radical prostatectomy: a step-by-step guide. Journal of Endourology. 32 (S1), S28-S32 (2018).
  20. van Leenders, G. J. L. H., et al. The 2019 International Society of Urological Pathology (ISUP) consensus conference on grading of prostatic carcinoma. The American Journal of Surgical Pathology. 44 (8), e87-e99 (2020).
  21. Liu, A., Collins, C. C., Diemer, S. M. Biobanking metastases and biopsy specimens for personalized medicine. Journal of Biorepository Science for Applied Medicine. 3, 57-67 (2015).
  22. Ellervik, C., Vaught, J. Preanalytical variables affecting the integrity of human biospecimens in biobanking. Clinical Chemistry. 61 (7), 914-934 (2015).
  23. Arellano, H. L., Castillo, C. O., Metrebián, B. E. Diagnostic agreement of the Gleason score in needle biopsy and radical prostatectomy and its clinical consequences. Rev Méd Chile. 132 (8), 971-978 (2004).
  24. Torres Caparó, D. A. Concordancia en los valores de gleason en biopsia prostática transrectal y en prostatectomia radical en pacientes con cáncer de próstata del Hospital Cirujano Mayor Santiago Távara entre enero 2010 - junio del 2018. , Universidad Ricardo Palma. https://repositorio.urp.edu.pe/handle/20.500.14138/1886 (2019).
  25. Chavolla-Canal, A. J., et al. Concordancia del puntaje de Gleason en biopsia transrectal de próstata vs prostatectomía radical. Revista Mexicana de Urología. 81 (2), 1-10 (2021).
  26. Fan, X. J., et al. Impact of cold ischemic time and freeze-thaw cycles on RNA, DNA and protein quality in colorectal cancer tissues biobanking. Journal of Cancer. 10 (20), 4978-4988 (2019).
  27. Vaswani, A., et al. Comparative liquid chromatography/tandem mass spectrometry lipidomics analysis of macaque heart tissue flash-frozen or embedded in optimal cutting temperature polymer (OCT): Practical considerations. Rapid communications in Mass Spectrometry: RCM. 35 (18), e9155(2021).
  28. Zhang, W., Sakashita, S., Taylor, P., Tsao, M. S., Moran, M. F. Comprehensive proteome analysis of fresh frozen and optimal cutting temperature (OCT) embedded primary non-small cell lung carcinoma by LC-MS/MS. Methods (San Diego, Calif). 81, 50-55 (2015).
  29. Boyd, A. E., Allegood, J., Lima, S. Preparation of human tissues embedded in optimal cutting temperature compound for mass spectrometry analysis. Journal of Visualized Experiments. 170, e62552(2021).

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה

בקש הרשאה

תגיות

מאמרים קשורים