הפרוטוקול הנוכחי מתאר את השיטה לניתוח פלורת מעיים באמצעות ריצוף גנים 16S rRNA מבוסס Illumina ומספק מסגרת להערכת היעילות של decoctions צמחים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
הפרוטוקול הנוכחי מתאר את השיטה לניתוח פלורת מעיים באמצעות ריצוף גנים 16S rRNA מבוסס Illumina ומספק מסגרת להערכת היעילות של decoctions צמחים.
על מנת לחקור באופן ראשוני את ההשפעות של Desmodium caudatum על דלקת הקבה ופלורת המעי בחולדות, הוקם מודל חולדות גסטריטיס כרונית בשיטת הנתרן סליצילאט הקלאסית. 18 חולדות SPF חולקו לשלוש קבוצות: קבוצת הביקורת (קבוצה C), קבוצת המודל (קבוצה M) וקבוצת הטיפול (קבוצה T). חלקים פתולוגיים של דופן הקיבה נלקחו מחולדות בכל קבוצה. יתר על כן, ריכוזי הגסטרין והמלונדיאלדהיד בסרום של חולדות בכל קבוצה נקבעו על ידי ELISA. בנוסף, ההשפעות של D. caudatum על פלורת המעי של חולדות עם גסטריטיס נחקרו באמצעות השוואה מפורטת של קהילות חיידקי מעיים בשלוש הקבוצות, תוך שימוש בריצוף גנים 16S rRNA מבוסס Illumina. התוצאות הצביעו על כך שמרתח D. caudatum יכול להפחית את התוכן malondialdehyde ולהגדיל את התוכן gastrin. יתר על כן, D. caudatum מרתח נמצא כדי לשפר את המגוון ואת שפע של הצומח במעיים, הפעלת השפעה חיובית על הטיפול בגסטריטיס על ידי ויסות ושחזור הצומח במעיים.
דלקת קיבה כרונית (CG), אחת המחלות הקליניות הנפוצות ביותר, מאופיינת בשינויים דלקתיים כרוניים ומתמשכים באפיתל רירית הקיבה, אשר מותקף לעתים קרובות שוב ושוב על ידי גורמים פתוגניים שונים1. שיעור ההיארעות של CG מדורג במקום הראשון מבין כל סוגי מחלות הקיבה, ומהווה 40% עד 60% משיעור שירותי החוץ במחלקה לגסטרואנטרולוגיה2. יתר על כן, שיעור ההיארעות בדרך כלל עולה עם הגיל, במיוחד אצל אנשים בגיל העמידה ומעלה3. אין ספק, CG מפחית באופן משמעותי את איכות החיים של אנשים, מדגיש את הצורך הקריטי לגלות סוכנים טיפוליים חדשים.
מחקרים רבים דיווחו כי התרחשות והתפתחות של CG קשורות להפרשת הורמונים במערכת העיכול, כגון גסטרין (GAS)4,5. GAS, הורמון פפטידי נפוץ במערכת העיכול, מגרה תאים להפריש חומצת קיבה על ידי קידום שחרור היסטמין מאאוזינופילים. בנוסף, זה משפר את התזונה ואת אספקת הדם של רירית הקיבה, קידום התפשטות של רירית קיבה ותאים קודקודיים6. לכן, גסטרין יכול לשמש אינדיקטור כדי להעריך את רמת הפיתוח של CG. יתר על כן, תוצרי חמצון שומנים המופעלים על ידי תחמוצות תגובתיות יכולים להפעיל תאים דלקתיים, מה שמוביל ל- CG. מלונדיאלדהיד (MDA), סמן חמצון שומנים, הוא אינדיקטור נפוץ למדידת מידת העקה החמצונית. הוא משקף את רמת הרדיקלים החופשיים ברירית הקיבה במידה מסוימת. רמת מד"א יכולה להצביע על התקפה של חומצות שומן בלתי רוויות ברירית הקיבה המקומית הנגרמת על ידי רדיקלים חופשיים 7,8.
מיקרואקולוגיה של המעי מורכבת ממיליוני מיקרואורגניזמים השוכנים במעי המארח, וממלאים תפקיד חיוני בשמירה על בריאות המארח ובוויסות חסינות המארח. פלורת מעיים בריאה, המאופיינת בעושר גבוה, מגוון ותפקוד מיקרוביוטה יציב, פועלת כמחסום מגן מפני פלישת מיקרואורגניזמים פתוגניים על ידי השתתפות בחילוף החומרים. הפרעות בפלורת המעי גורמות לאנשים להיות רגישים יותר למחלות עיכול חריפות וכרוניות 9,10. בשנים האחרונות הטיפול במיקרוביוטה למחלות במערכת העיכול התקדם במהירות והוכיח יעילות משמעותית11. לסיכום, ההתחשבות בפלורת המעי היא מכרעת בהבנה ובטיפול במחלות במערכת העיכול.
כמרכיב חיוני באוצר הבלום של הרפואה הסינית המסורתית, לחומרים רפואיים עממיים יש משמעות רבה לפרקטיקה הקלינית ולמודרניזציה של הרפואה הלאומית. השורשים וכל החלקים של Desmodium caudatum (Thunb.) DC. נמצא בשימוש נרחב להקלה על אי נוחות בקיבה באזור Beichuan Qiang בעיר Mianyang במשך תקופה ממושכת. מאמרים מסוימים מצביעים על הבסיס המדעי לטיפול במחלות במערכת העיכול עם D. caudatum, ומציינים את השפעותיו כגון המוסטאזיס, נוגדי חמצון והגנה על מערכת העיכול 12,13,14. עם זאת, בשל היעדר מחקר מעמיק, לא נקבע מנגנון פרמקודינמיקה קלינית. מאמר זה נועד ללמוד את ההשפעות של D. caudatum בטיפול דלקת הקבה המבוססת על הורמונים במערכת העיכול ואת הצומח במעיים, מתן בסיס ליישום קליני רציונלי שלה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הנהלים לטיפול ושימוש בבעלי חיים אושרו על ידי ועדת האתיקה של אוניברסיטת מיאניאנג הרגילה, וכל התקנות המוסדיות והממשלתיות הרלוונטיות הנוגעות לשימוש אתי בבעלי חיים נשמרו בקפידה. במחקר הנוכחי נעשה שימוש בחולדות SPF (מין קונמינג, זכר ונקבה כאחד, במשקל 180-220 גרם). בעלי החיים התקבלו ממקור מסחרי (ראו טבלת חומרים). כל בעלי החיים שוכנו בסביבה נטולת פתוגנים וסיפקו גישה למזון .
1. הכנת ריאגנטים
2. קיבוץ וניהול
3. קטע פתולוגי של דופן הקיבה
4. קביעת הורמונים במערכת העיכול בסרום
5. מיצוי DNA כולל בצואה והגברה וטיהור PCR
6. רצף
הערה: שלב 6 ושלב 7 מבוצעים בהתאם לשיטות20,21 שפורסמו בעבר.
7. עיבוד נתוני רצף
8. ניתוח סטטיסטי
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תוצאות החלק הפתולוגי של דופן הקיבה מתוארות באיור 1. בהשוואה לקבוצה C, קבוצה M הציגה ניוון קל של דופן הקיבה ודלקת קלה. עם זאת, בהשוואה לקבוצה M, קבוצה T לא הראתה דלקת ניכרת, מטאפלזיה של המעי או ניוון. זה מצביע על כך D. caudatum מרתח יכול ביעילות לשפר את דלקת הקבה.
תוצאות בדיקת ההורמונים במערכת העיכול בסרום מוצגות באיור 2. תכולת המלונדילדהיד (MDA) הייתה גבוהה משמעותית בקבוצה M מאשר בקבוצה C. לאחר הטיפול עם מרתח ד caudatum
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
D. caudatum, תרופה עממית נפוצה על ידי לאום צ'יאנג12, הראתה יעילות משמעותית בטיפול במחלות במערכת העיכול. עם התקדמות המחקר הפרמקולוגי המודרני, חוסר האיזון של הצומח הנובע מחוסר איזון מיקרואקולוגי במערכת העיכול מזוהה כגורם מפתח במחלות עיכול חריפות וכרוניות22,23. מיקרואורגניזמים מסוימים במערכת העיכול ממלאים תפקיד מכריע בשמירה על איזון דינמי בגוף, והורמונים בסרום משקפים את המצב הפיזיולוגי והפתולוגי של הגוף. לכן, המחקר מתמקד בפלורת המעי ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין מה לחשוף.
עבודה זו מומנה על ידי פרויקטי המו"פ המרכזיים של מחלקת המדע והטכנולוגיה של מחוז סצ'ואן (2020YFS0539).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| ניתוח גיוון אלפא | Mothur 1.30.2 | ||
| ערכת מיצוי ג'ל חומצה דאוקסיריבונוקלאית (DNA) AxyPrep | אקסיג'ן ביוסיינס | AP-GX-50 | |
| ניתוח מגוון בטא | Qiime 1.9.1 | ||
| מקרר קריוגני | מקפיא Forma-86C ULT Desmodium | ||
| caudatum | בית החולים לרפואה סינית מסורתית של Beichuan Qiang Autonomous County | ||
| E.Z.N.A. ערכת קרקע | Omega Bio-tek | D5625-01 | |
| Illumina MiSeq | Platform Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250 | ||
| ספקטרום Multiskan | SpectraMax i3 | ||
| OTU אשכול | Uparse 7.0.1090 | ||
| סטטיסטיקת OTU | Usearch 7.0 | ||
| PCR מכשיר | TransGen AP221-02 | ||
| PCR מכשיר ABI | GeneAmp 9700 | ||
| QuantiFluor-ST דו-גדילי מערכת DNA (dsDNA) | Promega Corp. | ||
| סיווג רצף ביאור | RDP מסווג 2.11 | ||
| נתרן סליצילאט | סצ'ואן Xilong כימיקלים ושות', בע"מ | 54-21-7 | |
| חולדות SPF | צ'נגדו דאשו בעלי חיים ניסיוניים ושות', בע"מ | ||
| SPSS 18.0 | IBM |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.