פרוטוקול זה מייעל את הייצור הווקטורי הרטרו-ויראלי ואת התמרת תאי T מורין, ומאפשר ייצור יעיל של תאי CAR-T בעכבר.
פרוטוקול זה מייעל את הייצור הווקטורי הרטרו-ויראלי ואת התמרת תאי T מורין, ומאפשר ייצור יעיל של תאי CAR-T בעכבר.
טיפולים תאיים מהונדסים המשתמשים בתאי קולטן אנטיגן כימרי (CAR)-T השיגו יעילות יוצאת דופן באנשים עם ממאירויות המטולוגיות ונמצאים כעת בפיתוח לטיפול בגידולים מוצקים מגוונים. עד כה, ההערכה הראשונית של תוצרי תאי CAR-T חדשים התרחשה בעיקר במודלים של גידולי קסנוגרפט באמצעות עכברים מדוכאי חיסון. גישה זו נבחרה כדי להקל על קליטה מוצלחת של תאי CAR-T אנושיים בסביבה הניסויית. עם זאת, מודלים סינגניים של עכברים, שבהם גידולים ותאי CAR-T נגזרים מאותו זן עכבר, מאפשרים הערכה של טכנולוגיות CAR חדשות בהקשר של מערכת חיסון מתפקדת ומיקרו-סביבה מקיפה של הגידול (TME). הפרוטוקול המתואר כאן נועד לייעל את תהליך ייצור תאי CAR-T בעכבר על ידי הצגת שיטות סטנדרטיות להתמרה רטרו-ויראלית ולתרבית תאי T ex vivo . השיטות המתוארות בפרוטוקול זה יכולות להיות מיושמות על מבני CAR אחרים מעבר לאלה המשמשים במחקר זה כדי לאפשר הערכה שגרתית של טכנולוגיות CAR חדשות במערכות הכשירות למערכת החיסון.
טיפולים מאומצים בתאי T המבטאים קולטני אנטיגן כימריים (CARs) חוללו מהפכה בתחום האימונותרפיה לסרטן על ידי רתימת כוחה של מערכת החיסון הנרכשת כדי להתמקד ספציפית בתאי סרטן חיוביים לאנטיגןולחסל אותם 1. בעוד ההצלחה של טיפולים בתאי CAR-T המכוונים לממאירויות של תאי B אוששה קלינית, מחקרים פרה-קליניים שבוצעו במודלים של בעלי חיים נותרו חיוניים לפיתוח CARs חדשים המכוונים לגידולים מוצקים. עם זאת, יעילות קלינית מוגבלת הוכחה באינדיקציות גידול מוצקות עד כה, ומתברר יותר ויותר כי מודלים פרה-קליניים בודדים אינם מנבאים במדויק את הפרמקודינמיקה והיעילות הקלינית של תרופה חיה 2,3. לכן, החוקרים החלו להרחיב את המחקר הפרה-קליני של תוצרי תאי CAR-T כך שיכלול הערכות מקבילות בקסנוגרפט ובמודלים סינגניים של סרטן אנושי וסרטן מורין, בהתאמה.
בניגוד למודלים של קסנוגרפט, שבהם גידולים אנושיים ותאי T מושתלים בעכברים מדוכאי חיסון, מודלים סינגניים מאפשרים לבחון תגובות של תאי CAR-T בהקשר של מערכת חיסון מתפקדת. באופן ספציפי, עכברים בעלי כשירות חיסונית הנושאים גידולים סינגניים מספקים מערכת לחקר האינטראקציה בין תאי T שהועברו באופן מאומץ לבין מילייה ספציפי להקשר - כולל מקרופאגים הקשורים לגידול (TAMs) ותאי T רגולטוריים (Tregs) הידועים כמדכאים את תפקוד תאי T במיקרו-סביבה של הגידול (TME)4,5,6. יתר על כן, מודלים סינגניים מציעים פלטפורמה נוספת להערכת רעילות ממוקדת, מחוץ לגידול, ואינטראקציה של תאי CAR-T עם גורמים מארחים שעלולים להוביל לרעילות נוספת, כולל תסמונת שחרור ציטוקינים7.
למרות יתרונות אלה, מספר המחקרים הסינגניים בתאי CAR-T נותר מוגבל. יש לציין כי מודלים סינגניים דורשים הנדסה אוטולוגית של תאי CAR-T מאותו זן עכבר ולכן מהווים אתגר נוסף בשל היעדר מתודולוגיה להתמרה יעילה של תאי T מורין והרחבת ex vivo 2,8. פרוטוקול זה מתאר את השיטות להשגת ביטוי CAR יציב באמצעות ייצור וקטורים רטרו-ויראליים והתמרה אופטימלית של תאי T. סכמה של התהליך כולו מוצגת באיור 1. השימוש בגישה זו מדגים התמרה רטרו-ויראלית יעילה של תאי CAR-T מורין והשגת ביטוי CAR גבוה ללא צורך בריכוז נגיפי באמצעות אולטרה-צנטריפוגה. אסטרטגיות לשינוי ספציפיות האנטיגן של מבנה CAR נדונות בנוסף לביטוי משותף של טרנסגנים נוספים.
כל ההליכים בבעלי חיים בוצעו באישור הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים (אוניברסיטת קולומביה, פרוטוקולים AC-AABQ5551 ו-AC-AAAZ4470) באמצעות עכברות BALB/c או CF57BL/6 בנות 6-8 שבועות במשקל של בין 20-25 גרם. בעלי החיים התקבלו ממקור מסחרי (ראו טבלת חומרים). פרוטוקול זה בנוי סביב "הימים שלאחר ההפעלה" של תאי T מורין, וייצור נגיפים מתחיל ביום -2. רטרו-וירוס יכול להיות מאוחסן ב -80 ° C לאחר הייצור הראשוני, ולשימוש עתידי של פרוטוקול זה, ניתן להתחיל עם שלב 2, בידוד תאי T והפעלה ביום 0.
1. ייצור וקטור רטרו-ויראלי
הערה: המוצרים הנגיפיים נעשו פגומים בשכפול על ידי הפרדת גני האריזה לשני פלסמידים נפרדים (ראה טבלת חומרים), מה שמקטין מאוד את הסבירות לאירועי רקומבינציה וייצור לא מכוון של וירוס כשיר שכפול.
2. בידוד תאי T מורין
3. התמרת תאי T מורין
הפרוטוקול המתואר כאן נועד לתקנן את תהליך התמרה של תאי T מורין ליצירת תאי CAR-T עכבריים. איור 1 מספק תיאור מפורט של השלבים המעורבים. התהליך מתחיל בייצור וקטורים רטרו-ויראליים באמצעות טרנספקציה משותפת של רכיבים נגיפיים לתאי Phoenix Eco. איור 2 מספק תמונה של הצפיפות האופטימלית של תאי Phoenix Eco ביום הטרנספקציה. תאי T מבודדים מופעלים 24 שעות לאחר הטרנספקציה, או "יום 0" של פרוטוקול זה, כהכנה להתמרה ביום 1. לאחר הטרנסדוקציה, תאי CAR-T מתורבתים בנוכחות IL-7 ו- IL-15 אנושיים רקומביננטיים כדי להשיג הרחבת קיפול מספקת תוך שימור אוכלוסיות זיכרון תאי גזע.
השימוש בערכת בידוד תאי T המומלצת (ראו טבלת חומרים) עם פרוטוקול זה מניב טוהר תאי T של <98% לפני הטרנסדוקציה, כפי שנקבע על-ידי ציטומטריית זרימה (איור 3A). יתר על כן, ניתן להשיג שיעורי ביטוי CAR ניתנים לשחזור של 65%-75% באמצעות פרוטוקול זה והווקטור הרטרו-ויראלי pMSCV שונה כדי לבטא את מבנה ה-CAR ממקדם PGK (איור 3B,C). קביעה של טיטר רטרו-ויראלי מגלה טיטרים של עד ~2 x 107 TU/mL וביטוי CAR של 74% עם 1/3rd של supernatant נגיפי שנקצר לאחר טרנספקציה משותפת של pMSCV עם pCL-Eco (איור משלים 1).
לבסוף, תרבית ex vivo עם 10 ננוגרם/מ"ל של IL-7 ו-IL-15 מובילה להתרחבות של בערך פי 15, וכתוצאה מכך ~150 x 106 תאי T עד יום 10 לאחר ההפעלה מטחול יחיד (איור 3D). תרבית עם IL-7 ו-IL-15 מובילה לתדרי תאי T דומים מסוג CD8+ ו-CD4+ (איור 3E) ולאוכלוסיות זיכרון תאי גזע שמורות שנקבעו על-ידי ביטוי CD62L+CD44 לאחר 10 ימים של תרבית ex vivo (איור 3F).

איור 1: סקירת פרוטוקולים. לוח עליון: סקירה סכמטית של ציר הזמן של הפרוטוקול. לוח תחתון: הוראות שלב אחר שלב לייצור וקטור רטרו-ויראלי והתמרה של תאי T בעכבר. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: צפיפות תאים אופטימלית עבור טרנספקציה. תמונה במיקרוסקופ ברייטפילד של תאי Phoenix Eco בצפיפות האופטימלית לפני ההדבקה עם pMSCV ו-pCL-Eco. צולם באמצעות עדשת 10x אובייקטיבית. סרגל קנה מידה = 200 מיקרומטר. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: ייצור תאי Murine CAR-T ותרבית ex vivo. (A) תרשים ציטומטריית זרימה המראה את התדירות של תאי +CD3 BALB/c לאחר בידוד תאי T מורין. (B) ייצוג סכמטי של הווקטור הרטרו-ויראלי pMSCV המשמש לביטוי GFP-CAR בתאי T מורינים. (C) היסטוגרמות ציטומטריית זרימה המדגימות ביטוי פני שטח CAR על תאי T של עכבר לאחר הדגירה עם sfGFP מטוהר. UT, ללא טרנספורמציה. (D) קפל את התפשטות תאי CAR-T עד היום ה-10 לאחר ההפעלה ותרבית עם IL-17 ו-IL-15 אנושיים רקומביננטיים. בערך 8 x 106 תאי T מורין הופעלו לפני ההתמרה והגיעו בערך 1.28 x 108 ביום 10 לאחר ההפעלה. (E) תרשים ציטומטריית זרימה המראה את התדירות של תאי CAR-T CD8+ ו- CD4+ ביום ה- 10 לאחר ההפעלה. (F) תרשים ציטומטריית זרימה המדגים את התדירות של אוכלוסיות זיכרון תאי CD8+ T שנקבעה על ידי ביטוי פני השטח CD62L ו- CD44. זיכרון תאי גזע (TSCM) מאופיין על ידי CD62L + CD44-, זיכרון מרכזי (TCM) על ידי CD62L + CD44+ וזיכרון אפקט (TEM) על ידי CD62L-CD44+ . אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
טבלה 1: ניסוח מדיה של תרבית תאים. פרטי הניסוח של מדיית תרבית התא המשמשת בפרוטוקול. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
איור משלים 1: ביטוי פני השטח של CAR וטיטרים רטרו-ויראליים. (A) היסטוגרמות ציטומטריית זרימה המראות ביטוי פני שטח של CAR על תאי T מסוג BALB/c לאחר הדגירה עם sfGFP מטוהר. רטרו-וירוס נוצר על ידי הדבקת תאי Phoenix Eco עם pMSCV_PGK_mGFP28z בשילוב עם pCL-Eco ו-pMD2.G (I), pCL-Eco (II) או לבד (III). תאי T הומרו ברטרו-וירוס מדולל כפי שצוין. (B) טיטרים רטרו-ויראליים הנקבעים על ידי ביטוי פני השטח של תאי T מותמרים. יחידות התמרות (TU)/mL חושבו באמצעות הנוסחה: (N∙F∙D)/V, כאשר N הוא מספר התאים המומרים (1 x 105), F הוא התדירות של תאי CAR+ , D הוא גורם הדילול, ו- V הוא נפח ההולכה במ"ל (0.2 מ"ל). אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 1: רצף וקטורי ביטוי pMSCV. הרצף של GFP28z CAR ורצפי איגוף (נטוי) בווקטור הביטוי pMSCV, כאשר אתרי האנזימים NotI ו-BamHI מסומנים בכחול. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
פרוטוקול זה מתאר את השלבים והריאגנטים הדרושים להתמרה רטרו-ויראלית של תאי T מורין כדי ליצור תאי CAR-T עבור מחקרי in vivo . אופטימיזציה של תנאי התמרה רטרו-ויראלית משיגה ביטוי CAR חזק ללא צורך בריכוז נגיפי באמצעות אולטרה-צנטריפוגה או ריאגנטים נוספים. עם זאת, ישנם שינויים מרובים שניתן ליישם על מתודולוגיה זו.
בעוד פרוטוקול זה מתאר את הדור לדוגמה של CAR ספציפי GFP, שיטות אלה יכולות להיות מותאמות כדי ליצור תאי CAR-T עכבר המכוונים לכל אנטיגן חוץ-תאי של עניין. הווקטור הרטרו-ויראלי pMSCV_PGK המשמש במחקר זה מאפשר שחרור יעיל של רצף ננו ספציפי ל-GFP על ידי עיכול אנזימטי עם NotI ו-BamHI וניתן להחליפו בתחום זיהוי אנטיגן המוגדר על-ידי המשתמש כגון scFv, ננו-גוף או תחום קושר ליגנדים (קובץ משלים 1). כדי להקל על הערכת ביטוי CAR חלופי, מומלץ לתכנן מכוניות עם תג אפיטופ N-terminal, כגון תגי Myc (EQKLISEEDL) או Flag (DYKDDDDK), אשר ניתן לזהות באמצעות נוגדנים מצומדים פלואורסצנטית12. יתר על כן, המחקר הנוכחי מדגים ייצור של טרנסגן יחיד; עם זאת, שילוב של פפטידים המתנתקים מעצמם (רצפי 2A) או אתרי כניסה פנימיים של ריבוזום (IRES) יאפשר ייצור משותף של טרנסגנים מרובים, כולל טכנולוגיות נוספות לשיפור תפקוד תאי T in vivo 8,13,14.
למרות שפרוטוקול זה פותח כדי לבטל את הצורך בציוד מיוחד על ידי השמטת אולטרה-צנטריפוגה (24,000 x גרם, 2 שעות, 4 מעלות צלזיוס), ראוי לציין כי ריכוז הסופרנאטנט הנגיפי יכול להשיג טיטרים נגיפיים גבוהים יותר ולהפחית את נפח הנגיף הדרוש להשגת ביטוי CAR גבוה8. פרוטוקול זה גם מייעל את הייצור הווקטורי הרטרו-ויראלי על ידי השגת טיטרים נגיפיים גבוהים (~ 2 x 10,7 TU/mL) וביטוי CAR יציב ללא צורך בקביעת טיטר נגיפי לפני השימוש. עם זאת, בנוסף להקלה על התקינה, קביעת טיטר נגיפי לפני התמרה של תאי T עשויה גם להגדיל את הכדאיות של תאי T על ידי הפחתת רעילות פוטנציאלית הנגרמת על ידי ריכוזים נגיפיים גבוהים שלא לצורך10,15.
תוספת של IL-7 ו- IL-15 מומלצת לקידום התרחבות תאי T ולשימור אוכלוסיות זיכרון תאי T; עם זאת, IL-2 אנושי רקומביננטי עשוי לשמש כחלופה כדי להפחית את מספר הריאגנטים הדרושים לתרבות ex vivo 16,17,18,19. אף על פי כן, השיטות ליצירת תאי CAR-T המתוארות כאן נותרו מוגבלות על ידי ההתפשטות הדלה יחסית של תאי T מורינים. עם זאת, ניתן לשפר עוד יותר את האמצעים לשיפור הכדאיות של תאי T שנדונו לעיל על ידי הכללת תוספים נוספים ו-2-ME במדיום תרבית mTCM לאורך תהליך הטרנסדוקציה20. בעוד ששינויים אלה עשויים לשפר את התרחבות תאי T מפי 15 עד פי20 פי 20, הם עשויים לגרום ליעילות התמרה נמוכה יותר ולביטוי CAR מופחת.
בסופו של דבר, הייצור של תאי CAR-T מורין מאפשר פיתוח מודלים סינגניים להערכת תפקוד תאי CAR-T בתוך מערכת חיסון שלמה - מה שמקל על הערכה ספציפית להקשר של עוצמתם, עמידותם ובטיחותם. ואילו מודלים בעכברים מדוכאי חיסון מאפשרים מחקרים פרה-קליניים חשובים של מוצר תאי T אנושיים המכוון לאנטיגן של גידול אנושי. השילוב של מערכות מודל משלימות אלה יהיה הכרחי להבנת המורכבות של הביולוגיה של תאי CAR-T, אופטימיזציה של עיצובי CAR חדשים, ובסופו של דבר תרגום ממצאים פרה-קליניים לטיפולים קליניים יעילים.
לא הוכרז על ניגוד עניינים.
אנו מודים לל. ברוקמן על הביקורת על כתב היד. עבודה זו נתמכה על ידי NIH 1R01EB030352 ו- UL1 TR001873.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 0.45 μ מסנני | m MilliporeSigma SLHVR33RS | ||
| מזרק 1 מ"ל | פישר סיינטיפיק | 14-955-450 | |
| צינורות מיקרוצנטריפוגה 1.5 מ"ל | פישר סיינטיפיק | 05-408-135 | |
| מזרק 10 מ"ל | BD | 14-823-16E | |
| 100 μ m מסננת | קורנינג | 07-201-432 | |
| 15 ס"מ TC כלי תרבית תאים מטופלים | ThermoFisher Scientific | ||
| צינורות חרוטיים 15 מ"ל | פלקון | 14-959-70C | |
| 40 μ מסננת M | קורנינג | 07-201-430 | |
| צינורות חרוטיים 50 מ"ל | פלקון | 14-959-49A | |
| 70 μ מסננת m | קורנינג | 07-201-431 | |
| Attune NxT זרימה ציטומטר | תרמו-פישר סיינטיפיק | ||
| BALB/C, בן 6-8 שבועות | מעבדת ג'קסון | 651 | |
| B-מרקפטואתנול | ג'יבקו | 21985023 | |
| סרום בקר אלבומין | GOLDBIO | A-420-500 | |
| DMEM | ג'יבקו | 11965092 | |
| תמיסת מלח פוספט (PBS) של Dulbecco, ללא סידן ומגנזיום | גיבקו | 14-190-250 | |
| מגנט DynaMag-2 | Invitrogen | 12-321-D | |
| מגנט EasySep | Stemcell Technologies | 18000 | |
| ערכת בידוד תאי T של עכבר EasySep | Stemcell Technologies | 19851 | |
| מאגר FACS | BD | BDB554657 | |
| סרום בקר עוברי (FBS) | קורנינג | MT35011CV | |
| GlutaMAX | Gibco | 35-050-061 | |
| G-REX6 | Wilson Wolf | 80240M | |
| תמיסת חיץ HEPES | ג'יבקו | 15-630-080 | |
| IL-15 רקומביננטי אנושי | Miltenyi Biotec | 130-095-765 | |
| רקומביננטי אנושי IL-2 | Miltenyi Biotec | 130-097-748 | |
| recombinant IL-7 | Miltenyi Biotec | 130-095-363 | |
| Lipofectamine 3000 | Invitrogen | L3000008 | |
| MEM תמיסת חומצות אמינו לא חיוניות | Gibco | 11140-050 | |
| עכבר Anti-CD3 BV421 | Biolegend | 100228 | |
| עכבר Anti-CD3 / CD28 Dynabeads | Gibco | 11-453-D | |
| עכבר נגד CD4 BV605 | BD | 563151 | |
| עכבר נגד CD44 APC | Biolegend | 103011 | |
| עכבר אנטי-CD62L PE-Cy7 | Tonbo | 60-0621-U025 | |
| עכבר נגד CD8 APC-CY7 | Tonbo | 25-0081-U025 | |
| Nikon Ti2 עם מצלמת Prime 95B | ניקון | ||
| לא מטופל 24 צלחות באר | CytoOne | CC7672-7524 | |
| Opti-MEM | Gibco | 31-985-062 | |
| pCL-Eco | Addgene | #12371 | |
| תמיסת פניצילין/סטרפטומיצין | Gibco | 15-070-063 | |
| תאי פניקס אקו | ATCC | CRL-3214 | |
| pMDG.2 | Addgene | #12259 | |
| pMSCV_PGK_GFP28z | לא ישים | הופק על ידי R.LV. | |
| sfGFP מטוהר | N/A | מיוצר על ידי R.LV. | |
| RetroNectin ('מגיב התמרה') | Takara Bio | T100B | |
| RPMI 1640 | Gibco | 21875 | |
| פיפטה סרולוגית 10 מ"ל | פישר סיינטיפיק | 13-678-11E | |
| פיפטה סרולוגית 25 מ"ל | פישר סיינטיפיק | 13-678-11 | |
| פיפטה סרולוגית 5 מ"ל | פישר סיינטיפיק | 13-678-11D | |
| נתרן פירובט | Gibco | 11-360-070 | |
| TC מטופל 24 צלחות באר | קורנינג | 08-772-1 | |
| טריפאן כחול | ג'יבקו | 15-250-061 |