כדי לבודד nTAECs, אספנו שאיפות קנה נשימה מיילודים שעברו אינטובציה בפגייה והעברנו את השאיפות על קרח למעבדה להמשך עיבוד (איור 1A). לאחר זריעת דגימות השאיבה של קנה הנשימה במדיום גידול אפיתל של דרכי הנשימה (BLEAM-I המכיל מעכבי Rho/Smad, GSK3 ו-mTOR), הופיעו תאים קובואידיים תוך 7-10 ימים. לאחר 14 יום, התאים היו 50%-60% מתלכדים, וכ-21 יום לאחר הציפוי, התאים היו ארוזים בצפיפות ודרשו טריפסיניזציה למעבר והתרחבות לאחר מכן. מעברים סדרתיים של תאים אלה (עד P3) נשמרו בהקפאה בחנקן נוזלי לאחסון לטווח ארוך. התאים (≤ קטע 3) הופשרו לאחר מכן לתרבית ALI.
nTAECs תורבו ב-ALI ברגע שהם הגיעו לסביבות 80%-90% מפגש בצלחת T75 בתנאים שקועים. ביצענו צביעה אימונופלואורסצנטית של חד-שכבת nTAEC ביום 0 של ALI עם הסמנים הספציפיים לתאי הבסיס - ציטוקרטין-5 (KRT5)53 וחלבון הגידול p63 (TP63)54 (איור 1B). ביום 0 של ALI, כמעט כל התאים חיוביים ל-KRT5 ו-TP63, מה שמרמז על פנוטיפ תאי בסיס בדרכי הנשימה עם התמיינות מינימלית. לאחר הקמת ALI, TEER נמדד באמצעות EVOM (איור 1C) וגדל במהירות בשלב המוקדם של תרבית ALI (ALI יום 0 עד 7) כאשר nTAECs החלו ליצור שכבה חד-שכבתית של תאים מקוטבים בוגרים, עם מישור של TEER לאחר מכן בין היום ה-7 ליום ה-28 של ALI (איור 1D). יתר על כן, FITC-dextan של שני משקלים מולקולריים (10 kD ו-20 kD) שימשו להערכת חדירות פרה-תאית במהלך התמיינות ALI והראו ירידה הדרגתית כללית של הקרינה לאורך זמן (איור 1E). זה מתאם עם היווצרות של תא חד-שכבתי בוגר במהלך התמיינות ALI עם ירידה בחדירות למומסים.
במהלך תרבית ALI, תאי הבסיס מתמיינים לשושלות אפיתל בוגרות, הכוללות תאים ריסניים, תאי מועדון שאינם מפרישים ריר ותאי גביע מפרישי ריר39. ניתוח ביטוי גנים של סמנים ספציפיים לתאי אפיתל בוגרים ביום 0 של ALI הראה ביטוי מינימלי עד ללא ביטוי של חלבון קופסת המזלג J155 (FOXJ1, סמן תאים ריסניים), אוטרוגלובין56 (SCGB1A1, סמן תאי מועדון) ומוצין-5AC57 (MUC5AC, סמן תאי גביע; איור 2A), עם עלייה לאחר מכן (ALI ימים 7 ו-28) מרמזת על התמיינות לתת-סוגים בוגרים אלה של אפיתל דרכי הנשימה במהלך תרבית ALI. בנוסף, ביצענו צביעה אימונו-פלואורסצנטית ביום ה-28 של ALI תוך שימוש בסמנים ספציפיים לתאי אפיתל בוגרים והתמיינות אפיתל כמותית המורכבת מתאי אצטיל-טובולין58 (TUBA4A) חיוביים (~22%), תאי מועדון חיוביים SCGB1A1 (~13%) ותאי גביע חיוביים ל-MUC5AC (~3%) כאשר השאר הם תאי בסיס חיוביים ל-KRT5 (~51%) וסוגי תאים נדירים אחרים (איור 2B).
מעכבי Rho ו-Smad שימשו במהלך 7 הימים הראשונים של תרבית ALI (ימי ALI 0 עד 7) ולאחר מכן הוסרו מאמצעי ההתמיינות למשך שארית תקופת תרבית ה-ALI (איור 3A). המשטח האפיקלי של התא חד-שכבתי במהלך תרבית ALI נחשף לאוויר, מה שמאפשר מחקרי הפרעות אטמוספריות. חשיפה להיפראוקסיה של התא החד-שכבתי בוצעה עם 60% O2 ברציפות במשך 7 ימים מהיום ה-7 עד ה-14 באמצעות חממת TriGas. קבוצת הביקורת הוחזקה באינקובטור נפרד עם חשיפה לאוויר בחדר (21% O2). בהתחשב בכוונה העתידית לחקור את ההשלכות ארוכות הטווח (1-2 שבועות לאחר השלמת החשיפה ל-O2) של חשיפה ל-O2 על התפתחות והתחדשות האפיתל של דרכי הנשימה, היה חיוני שהחשיפה ל-O2 לא תגרום באופן חריף לציטוטוקסיות חמורה או לנזק לממברנה במידה שהיא משבשת באופן משמעותי את השכבה החד-שכבתית של תאי ALI. כדי להעריך את הנזק לקרום התא, מדדנו שחרור LDH במדיה הבסיסית ביום ה-14 של ALI, שלא הראה הבדל משמעותי בין היפראוקסיה לבין תרביות שטופלו באוויר בחדר (איור 3B). כדי להעריך עוד יותר אם השפעות ציטוטוקסיות מ-O2 היו משמעותיות מספיק כדי לגרום לאפופטוזיס ב-nTAECs, ביצענו אימונובלוטיקה עבור קספאז-3 כולל וקספאז-359 שסוע על ליזטים של תאים שנאספו מהיפראוקסיה וקבוצות שנחשפו לאוויר בחדר ביום ה-14 של ALI (איור 3C). הביטוי הכולל של קספאז-3 היה דומה בין שתי הקבוצות, וביטוי קספאז-3 שסוע לא זוהה, מה שמצביע על כך ש-7 ימים של חשיפה של 60% ל-O2 לא גרמו לאפופטוזיס ב-nTAECs ביום ה-14 של ALI. בנוסף, תוכננה בקרה חיובית עם דגירה לילית של nTAECs בתנאים שקועים עם ריכוזים הולכים וגדלים של סטאורוספורין (0.5 מיקרומטר, 1 מיקרומטר ו-2 מיקרומטר), חומר ציטוטוקסי וגורם אפופטוזיס. אימונובלוטינג לביטוי קספאז-3 כולל וקספאז-3 שסוע אישר אינדוקציה מוצלחת של אפופטוזיס. כדי למדוד מתח חמצוני הנגרם על ידי חשיפה של 60% O2, בוצעה בדיקת מתח חמצוני תאי עם מדידת עוצמה פלואורסצנטית על חד-שכבות תאי nTAEC ב-ALI 14 (איור 3D). חשיפה להיפראוקסיה גרמה לעלייה משמעותית בעוצמת הפלואורסצנט (מחושבת על ידי פלואורסצנציה כוללת מתוקנת של תאים או CTCF) בהשוואה לתאים שנחשפו לאוויר בחדר, מה שמרמז על מתח חמצוני תאי מוגבר. ניתוח ביטוי גנים של גנים נוגדי חמצון הראה כי 60% O2 גרם לוויסות מוגבר של גנים נוגדי חמצון אלה ביום ה-14 של ALI, כאשר קטלאז, SOD1, SOD2 ו-GPX3 היו מווסתים באופן משמעותי (איור 3E).

איור 1: תאי אפיתל של דרכי הנשימה של קנה הנשימה בילודים (nTAECs) מבודדים בהצלחה משאיבות קנה הנשימה של היילודים ומתורבתים בממשק אוויר-נוזל (ALI). (A) nTAECs שבודדו תוך שימוש בשאיבת קנה הנשימה מיילודים שעברו אינטובציה הועברו במצב שקוע עם תרבית ALI לאחר מכן. (B) תאים נקצרו ביום 0 של ALI לצביעה אימונו-פלואורסצנטית עם סמני תאי בסיס בדרכי הנשימה - KRT5 (אדום) ו-TP63 (אדום). הגרעינים צבועים בכחול עם DAPI. סרגל קנה מידה = 50 מיקרומטר. (C) מדידת התנגדות חשמלית טרנס-אפיתל (TEER) בתוספות תרבית תאים באמצעות מד וולט/אוהם אפיתל (EVOM). (D) TEER נמדד במהלך התמיינות ALI. הנתונים מוצגים כממוצע (n=2 תורמים, 5-10 בארות לתורם לנקודת זמן). פסי שגיאה מצביעים על SEM. (E) בדיקת חדירות טרנס-אפיתל של פלואורסצאין איזותיוציאנט-דקסטרן (FITC-dextran) בוצעה במהלך התמיינות ALI תוך שימוש בשני משקלים מולקולריים שונים של FITC-dextan (10 kD ו-20 kD). תמיסת FITC-dextran (10 kD או 20 kD) נוספה לתא האפיקלי, ותוספות תרבית התאים הודגרו בטמפרטורת החדר למשך 60 דקות. הקרינה בתקשורת התא הבסיסית נמדדה באופן ספקטרופוטומטרי בלוחות של 96 בארות. פלואורסצנטי רקע (מדיה HBTEC) הופחת ממדידות הבדיקה כדי לקבל ערך פלואורסצנטי מתוקן (מבוטא באחוזים בהשוואה לערכי יום 0). הנתונים הוצגו כממוצע (n=2 תורמים, שלוש בארות לתורם לנקודת זמן עבור כל משקל מולקולרי של FITC-dextran). קווי שגיאה מציינים SEM. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: תאי אפיתל של דרכי הנשימה של קנה הנשימה בילודים (nTAECs) עוברים התמיינות רירית במהלך תרבית ממשק אוויר-נוזל (ALI). (A) תאים נאספו בימים 0, 7 ו-28 של ALI לניתוח qPCR של סמנים ספציפיים לתאי אפיתל: ציטוקרטין-5 (KRT5) עבור חלבון בסיסי, קופסת מזלג J1 (FOXJ1) עבור ריסים, רחם (SCGB1A1) עבור מועדון ומוצין-5AC (MUC5AC) עבור תאי גביע. הביטוי היחסי של כל גן נקבע בשיטת δCt עם GAPDH כבקרה אנדוגנית. הנתונים הוצגו כממוצע (מ-n = 3 תורמים, שלוש בארות לתורם לנקודת זמן). פסי שגיאה מצביעים על SEM. ניתוח סטטיסטי בוצע תוך שימוש ב-ANOVA דו-כיווני עם ניתוח פוסט-הוק של Tukey, *p=0.0114, ***p=0.0005, ***p<0.0001. (B) צביעה אימונו-פלואורסצנטית של תאי בסיס (KRT5, אדום), ריסניים (אצטיל-טובולין או TUBA4A, ירוק), מועדון (SCGB1A1, אדום) וגביע (MUC5AC, ירוק) בוצעו ביום ה-28 של ALI כדי לכמת את התמיינות האפיתל. הגרעינים צבועים בכחול עם DAPI. נתונים עבור אחוז (%) תאים חיוביים המוצגים כממוצע (n=2 תורמים, שתי תוספות תרבית תאים לכל תורם, 6-8 תמונות לא חופפות לכל שקופית, מינימום 3000 תאים שנספרו בכל שקופית). קווי שגיאה מציינים SEM. סרגל קנה המידה = 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: היפראוקסיה גורמת לעקה חמצונית תאית בתאי אפיתל של דרכי הנשימה של קנה הנשימה בילודים (nTAECs) אך אינה גורמת לנזק משמעותי לקרום התא או לאפופטוזיס. (A) ציר זמן ניסיוני לחשיפה להיפראוקסיה של nTAECs באמצעות חממת Trigas. החשיפה לחמצן החלה לאחר שהמעכבים הוסרו מאמצעי ההתמיינות ביום ה-7 של ALI ונמשכה במשך 7 ימים (יום 7 עד 14 של ALI). (B) המדיה הבסיסית נאספה לבדיקת שחרור LDH כדי להעריך את הנזק לקרום התא בין הקבוצה שנחשפה ל-60% O2 (היפראוקסיה) ביום ה-14. הנתונים הוצגו כנקודות נתונים בודדות (ספיגה מתוקנת) עם קווים המציינים את הממוצע הכולל עבור כל קבוצה, n=3 תורמים מסומנים בעיגולים שחורים, ריבועים ומשולשים עם ארבע בארות לכל תורם, בהתאמה. ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות מבחן t לא מזווג, p=0.6184. (C) תאים נקצרו ביום ה-14 של ALI, ובוצע אימונובלוטינג לסמנים של אפופטוזיס (קספאז-3 וקספאז-3 שסוע) כדי להשוות את התגובות בין אוויר החדר ל-nTAECs שנחשפו ל-O2. בקרה חיובית לבדיקה תוכננה על ידי דגירה של nTAECs בן לילה עם סטאורוספורין (Stau 0.5 מיקרומטר, 1 מיקרומטר ו-2 מיקרומטר) או בקרת רכב (Veh Ctrl) במצב תרבית שקועה. תאים נאספו לאימונובלוט עם נוגדן קספאז-3 כולל ונוגדני קספאז-3 שסועים. דנסיטומטריה בוצעה עם α-טובולין כגן משק בית. הנתונים הוצגו כממוצע (מ-n=2-3 תורמים, באר אחת עד שתיים לכל תורם). קווי שגיאה מציינים SEM. נעשה שימוש במבחן t לא מזווג כדי להשוות את הביטוי הכולל של caspase-3 בין אוויר החדר לקבוצת 60% O2 , p=0.4. נעשה שימוש ב-ANOVA חד-כיווני כדי להשוות את הביטוי הכולל של caspase-3 ו-caspase-3 שסוע בין קבוצות שנחשפו ל-Veh Ctrl ו-Stau, *p<0.05, ***p<0.0005. (D) בדיקת CM-H2DCFDA לעקה חמצונית תאית בוצעה ביום ה-14 של ALI עם תוספות תרבית תאים שנקטפו מאוויר החדר ו-nTAECs שנחשפו ל-O2. מוצגות תמונות מיקרוסקופיה פלואורסצנטיות מייצגות של תוספות תרבית תאים חשופות לאוויר החדר (בקרה) ו-60% O2 (היפראוקסיה). פלואורסצנציה כוללת מתוקנת של תאים (CTCF) חושבה כדי להשוות מתח חמצוני תאי בין אוויר בחדר ל-60% nTAECs שנחשפו ל-O2. נתוני CTCF מוצגים כנקודות נתונים בודדות עם קו המציין את הממוצע הכולל עבור כל קבוצה, 6-7 תמונות לקבוצה מ-2 תורמים בודדים (עיגולים שחורים וריבועים) עם שתי בארות לכל תורם. ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות מבחן t לא מזווג, *p<0.05. סרגל קנה מידה = 50 מיקרומטר. (E) תאים נאספו ביום ה-14 של ALI מאוויר החדר, ובוצעו בארות חשופות להיפראוקסיה לניתוח qPCR של גנים של עקה חמצונית, כולל קטלאז, סופראוקסיד דיסמוטאז 1 ו-2 (SOD1 ו-SOD2), גלוטתיון פרוקסידאז 1, 2 ו-3 (GPX1, GPX2 ו-GPX3). נתוני שינוי הקיפול של כל גן נקבעו בשיטת δCt עם 18s rRNA כבקרה אנדוגנית. הנתונים הוצגו כממוצע (מ-n=3 תורמים, שתי בארות לכל תורם). קווי שגיאה מצביעים על SEM. ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות מבחן t לא מזווג, *p<0.05, **p=0.006. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
| רכיב מדיה | כמות | ריכוז סופי |
| בלאם-איי | | |
| מדיה של BLEAM | 500 מ"ל | |
| תוספת HLL | 1.25 מ"ל | 500 מיקרוגרם/מ"ל אלבומין בסרום אנושי 0.6 מיקרומטר חומצה לינולאית; 0.6 מיקרוגרם/מ"ל לציטין |
| ל-גלוטמין | 15 מ"ל | 6 מ"מ |
| תמצית P | 2 מ"ל | 0.4% תמצית יותרת המוח בקר |
| TM1 | 5 מ"ל | 1 מיקרומטר אפינפרין; 5 מיקרוגרם/מ"ל טרנספרין 10 ננומטר טריודוטירונין; 0.1 מיקרוגרם/מ"ל הידרוקורטיזון 5ng/mL גורם גדילה אפידרמיס (EGF) 5 ננוגרם/מ"ל אינסולין |
| נורמוצין | 1 מ"ל | 0.1 מ"ג/מ"ל |
| י-27632 | עשוי להשתנות בהתאם למספר האצווה | 5 מיקרומטר |
| A83-01 | עשוי להשתנות בהתאם למספר האצווה | 1 מיקרומטר |
| צ'יר 99021 | עשוי להשתנות בהתאם למספר האצווה | 0.4 מיקרומטר |
| רפמיצין | עשוי להשתנות בהתאם למספר האצווה | 5 ננומטר |
| HBTEC | | |
| מדיה HBTEC | 500 מ"ל | |
| נורמוצין | 1 מ"ל | 0.1 מ"ג/מ"ל |
| HBTEC-I | | |
| מדיה HBTEC | 500 מ"ל | |
| נורמוצין | 1 מ"ל | 0.1 מ"ג/מ"ל |
| י-27632 | עשוי להשתנות בהתאם למספר האצווה | 5 מיקרומטר |
| A83-01 | עשוי להשתנות בהתאם למספר האצווה | 0.5 מיקרומטר |
טבלה 1: רכיבי מדיה עבור מדיום דרכי הנשימה של הסימפונות עם מעכבים (BLEAM-I), מדיה ALI של תאי אפיתל סימפונות/קנה הנשימה האנושיים עם מעכבים (HBTEC-I) ו-HBTEC.
| בקבוק תרבית תאים/מוסיף תרבית תאים | 804G מדיה ממוזגת תאים (mL) |
| בקבוק T25 | 3 מ"ל |
| בקבוק T75 | 5 מ"ל |
| תוספת תרבית תאים 24 בארות (0.4 מיקרומטר גודל נקבוביות, 0.33 ס"מ2 שטח פנים) | 400 מיקרוליטר |
טבלה 2: נפחים של מדיה מותנית מטריצה שמקורה בתאים 804G הנדרשים עבור צלוחיות תרבית ותוספות תרבית תאים.