$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
בידוד רכיבים (איור 1 ואיור 2)
לפני השימוש בצמחי הליבה ובאוכלוסיות התאים בתרבית משותפת של אסמבלואידים, יש לבדוק את המרכיבים האלה תחת המיקרוסקופ (איור 1). צמחי ליבה צריכים להיות בקוטר אחיד (100-200 מיקרומטר) וללא סטיות או קמטים גלויים. תאי אנדותל צריכים להציג צורה מוארכת במגע עם תאים אחרים, מה שהם לא עושים כאשר הם נזרעים בצפיפות נמוכה מדי בגלל תפוקה ראשונית נמוכה מהבידוד. במקרה זה, תאי האנדותל מקבלים צורה עגולה יותר עם שלוחות שלד ציטו-שלד ומתרבים לאט יותר במידה ניכרת. חלקו אותם 1:5 לאחר 7-10 ימים. פיברובלסטים של גידים שבודדו מגידי אכילס מניחים מורפולוגיה עגולה יותר בהשוואה למקביליהם האנושיים תוך 1-2 מעברים (10-14 ימים כל אחד) כאשר הם פוצלו ביחס של 1:6. המקרופאגים קטנים בהרבה מפיברובלסטים או תאי אנדותל ואינם מתרבים לאחר הבידוד. בהתאם אצווה, הצורה שלהם יכולה להשתנות בין פירמידלי עגול.
הפנוטיפים של המרכיבים התאיים אומתו באמצעות ציטומטריית זרימה. נוגדן CD31 מצומד שימש כסמן לתאי אנדותל (איור 2A). קביעת סף הפלואורסצנטיות בהתבסס על דגימת ביקורת לא מוכתמת (אפור), 90.1% ממעבר 1 (P1) ו-48.7% מתאי אנדותל מעבר 2 (P2) זוהו כחיוביים ל-CD31. קו עכבר מהונדס גנטית המבטא יחד את סמן הפיברובלסטים של הגיד Scleraxis לצד חלבון פלואורסצנטי ירוק (ScxGFP) ונוגדן CD146 מצומד שימש לאפיון הפיברובלסטים של הגידים (איור 2B)35,60. לאחר מעבר אחד (P1), 37.3% מהפיברובלסטים היו ScxGFP+CD146-, 0.2% היו ScxGFP+CD146+, 4.3% היו ScxGFP-CD146+, ו-58% היו ScxGFP-CD146-. לאחר שני מעברים (P2), אחוז תאי ScxGFP+CD146 ירד ל-27.6%, אחוז תאי ScxGFP+CD146+ עלה ל-6.9%, אחוז תאי ScxGFP-CD146+ עלה ל-10.6% ואחוז תאי ScxGFP-CD146 ירד ל-54.9%. כדי לזהות ולאפיין את המקרופאגים, נעשה שימוש בנוגדן F4/80 בשילוב עם CD86 ונוגדן CD206 (איור 2C). לאחר בידוד ותרבית, 96.4% מהתאים שמקורם במח עצם היו חיוביים ל-F4/80. מבין התאים החיוביים ל-F4/80, 8.6% היו CD206+CD86-, 23.6% היו CD206+CD86+, 28.3% היו CD206-CD86+, ו-39.4% היו CD206-CD86-. מהירות הקישור הצולבות של קולגן עשויה להשתנות מאצווה לאצווה, ויש לבדוק אותה לפני תחילת הניסויים.
מראה אסמבלואיד (איור 3)
בתנאי תרבית דמויי נגעים (36°C, 20% O2), צמח הליבה נותר ניתן למתיחות מכנית, לא השתנה במראהו, והמשיך להיות ניתן להבחנה חזותית ולהפרדה פיזית מההידרוג'ל שמסביב במשך 21 יום לפחות (איור 3A,B). ההידרוג'ל שמסביב נדחס עם הזמן, כאשר מהירות הדחיסה הייתה תלויה באוכלוסיית התאים שנזרעה לתוכו. פיברובלסטים שמקורם בגיד אכילס כיווצו את ההידרוג'ל הסובב אותם במהירות הגבוהה ביותר, ועשו זאת באופן רדיאלי כאשר הם יצקו הידרוג'ל סביב צמח ליבה ולכל הכיוונים כאשר לא (איור 3B,C). בתחילה, הידרוג'לים נטולי תאים שהונחו סביב צמח ליבה נדחסו גם כן. התכווצות זו נגרמה ככל הנראה על ידי תאים נודדים מצמח הליבה, דבר המצביע על ממשק דינמי חוצה תאים. מאחר שהידרוג'לים נטולי תאים ללא עציץ ליבה מוטבע לא נדחסו באופן ניכר, נראה שהתרומה של התכווצות כתוצאה מאיבוד מים היא זניחה (איור 3B וקובץ משלים 6).
לכן, חוסר בדחיסת הידרוג'ל יכול לשמש לאיתור טעויות בהרכבה האסמבלואידית (כלומר, ריכוזי תאים נמוכים) ויש לבדוק אותו לפני שממשיכים בשיטות קריאה יקרות יותר. בעת ביסוס שיטה זו, טעויות נפוצות בהפחתת ריכוז התאים כללו תאים גוססים בהידרוג'ל החיצוני מכיוון שהם הושארו זמן רב מדי בתמיסת הקרוסלינקינג הקשה יחסית (pH גבוה, טמפרטורה נמוכה) וייבוש צמחי ליבה מכיוון שהזמן בין שאיפה בינונית להזרקת הידרוג'ל היה ארוך מדי, או מכיוון שצמח הליבה היה מהודק גבוה מכדי להיות מוטבע בקולגן.
מיקרוסקופ פלואורסצנטי קונפוקלי: ניתוח כדאיות ומורפולוגיה (איור 3)
לאחר שהוצאו מהמלחציים בעזרת מספריים (איור 3B), ניתן לתקן, לצבוע ולצלם מכלולים באמצעות מיקרוסקופ קונפוקלי בכללותו ללא חתך. כאן, מכלולי ליבה // אנדותל, ליבה // מקרופאגים וליבה // מכלולים פיברובלסטים הוכתמו ב-DAPI (NucBlue) ובאתידיום הומודימר (EthD-1) כדי לנתח את הכדאיות, וב-DAPI וב-F-actin כדי לנתח מורפולוגיה והתפשטות תאים בהידרוג'ל קולגן תלת-ממדי (איור 3D). הכדאיות של מכלולי תאי ליבה // אנדותל (איור 3E) כומתה ונמצאה בדרך כלל נמוכה יותר לאחר הרכבת אסמבלואיד מאשר דווח בעבר עבור מכלולי ליבה // מקרופאגים וליבה // פיברובלסטים84. עם זאת, הכדאיות נשארה יציבה במהלך תרבית האסמבלואיד לפחות עד היום השביעי.
מיקרו-נזק הנגרם באופן מכני ומדידת תכונות מכניות (איור 4)
הברגים והפינים המחוברים למחזיקי המהדק מאפשרים קיבוע של מכלולים מהודקים להתקני מתיחה חד ציריים. מכשיר המתיחה המותאם אישית המשמש כאן מצויד בתא עומס של 10 N ותואר בפרסומים קודמים (איור 4A)22. כל הדגימות היו מותנות מראש עם חמישה מחזורי מתיחה למאמץ של 1% לפני המדידות.
רישום עקומת המאמץ המלאה של צמחי ליבה או מכלולים (איור 4B) יאפשר לכמת את המודולוס האלסטי הליניארי (α), את הלחץ המרבי (β) ואת המאמץ המרבי (у). עם זאת, הוא גם פוגע באופן בלתי הפיך בעציץ הליבה או במכלול, מה שלא מאפשר להעריך את התפתחות האורך של הלחץ המרבי (β) והזן המרבי (у) עבור אותן דגימות (איור 4B). כאן, המודולוס האלסטי הליניארי שימש כמדד ליכולת הדגימה לעמוד בכוחות, שכן מדידה זו דורשת מתיחת הדגימה למאמץ של 2% בלבד, שהוכח בעבר כי אינו גורם להפחתה קבועה במודולוס האלסטי הליניארי18. בפרט, מכלולי תאי אנדותל // נחשפו להליך ההידוק לזן של 2% (בערך קצה האזור האלסטי הליניארי) או 6% זן (בערך הזן המרבי). המיקרו-נזק שנוצר הוערך על-ידי מדידת המודולוס האלסטי הליניארי לפני ואחרי ההליך (איור 4C).
בהתאם לניסויים שנערכו בעבר תוך ניצול צמחי ליבה חד-תרבותיים, מכלולי תאי ליבה // אנדותל שמרו על המודולוס האלסטי הליניארי שלהם למשך 14 יום לפחות כאשר גודלו בתרבית בתנאי נישה כמו-הומיאוסטטיים (29°C, 3% O2) ונחשפו לזנים שאינם עולים על 2%18,21. באשר לגירוי בסיסי מכני, נראה כי המתיחה הסטטית המופעלת דרך המלחציים מחקה במידה מספקת את רמות המאמץ המקוריות שחוו יחידות הליבה של הגידים in vivo כדי למנוע תהליכים קטבוליים הקשורים בדרך כלל לפריקת מטריצה87. ואכן, את הירידה ההדרגתית והמובהקת סטטיסטית של המודולוס האלסטי הליניארי שנצפתה במכלולי תאי אנדותל // שנחשפו לזן של 6% ניתן לייחס לפריקת המטריצה הנובעת ממיקרו-נזק מטריצה המושרה מכנית.
בעת ביצוע ניסויים אלה, חשוב למנוע את התייבשות של assembloid. כאן, הם היו עטופים בנייר autoclaved ו רטוב, אבל שיטות אחרות יכול גם להיות קיימא בהתאם התאימות שלהם עם מכשיר מתיחה בשימוש. מכיוון שהחיכוך בין מהדקי המתכת לעציץ הליבה מוגבל, הוסף פיסות נייר קטנות בין המתכת לעציץ הליבה במהלך ההידוק כדי למנוע החלקה ועקוב מקרוב אחר תהליך המתיחה כדי לזהות ולהרחיק צמחי ליבה ומכלולים שהחליקו על הליבה.
ניתוח שעתוק ספציפי לתא והפרשה ספציפית לאסמבלואיד (איור 5 ואיור 6)
בקבוצה הראשונה של ניסויי ליבה חד-תרבותיים שהוצגו כאן, הוערכה יציבות ביטוי גני הליבה לאחר בידוד explant כדי לנתק את הבידוד מהשפעות הניסוי (איור 5A). אף על פי שמספרי העתקה גבוהים יותר נחוצים למסקנות מדויקות, הביטוי של Vegfa ו- Mmps גדל מאוד בצמחי ליבה מבודדים טריים תוך שעות לאחר בידוד הצמח כאשר גודלו בתרבית בתנאי נישה דמויי נגע (37 ° C, 20% O2).
ניאו-וסקולריזציה היא סימן היכר מרכזי של מחלת גידים ותיקון שיכול, בחלקו, להיות מונע על ידי תאי אנדותל המופעלים על ידי גורמים פרו-אנגיוגניים (כלומר, גורם גדילה אנדותל וסקולרי, Vegfa) המופרשים על ידי ליבת הגיד תחת היפוקסיה88. כאשר בוחנים את השלב הראשון של הדיבור הפוטנציאלי הזה (איור 5B), נמצא כי הביטוי הן של Vegfa והן של סמן ההיפוקסיה Carbonic Anhydrase 9 (Ca9) היה מובהק סטטיסטית מוגבר בצמחים חד-תרבותיים תחת מתח חמצן נמוך (3% O2) בהשוואה לצמחים חד-תרבותיים תחת מתח חמצן גבוה (20% O2). בינתיים, נראה כי מתח החמצן הנמוך לא גרם לשינויים בביטוי של סמני פיברובלסטים בגידים כגון Scleraxis (Scx) וקולגן-1 (Col1a1). יחד, תוצאות אלה מזהות תאים שושבי ליבה כתורמים סבירים לאיתות פרו-אנגיוגני בנישה היפוקסית.
לאחר מכן, ההפעלה של תאי אנדותל על ידי איתות ליבה פרו-אנגיוגני הוערכה בתרבית משותפת של אסמבלואיד תאי ליבה // אנדותל תחת מתח חמצן גבוה (20% O2) ונמוך (3% O2). למרבה המזל, ההרכב המודולרי של מכלולים מאפשר ניתוח שעתוק ספציפי לתא לאחר תרבית על-ידי הפרדה פיזית של צמח הליבה מהידרוג'ל הקולגן החיצוני (איור 6A). בצמח הליבה (איור 6D), ביטוי Vegfa אושר שוב כעולה תחת מתח חמצן נמוך, אם כי ההשפעה על סמנים היפוקסיים אחרים כגון Fgf2 הייתה פחות ברורה ודורשת מספרי שכפול גבוהים יותר למסקנות מדויקות. בנוסף, הביטוי של סמנים פרו-דלקתיים כגון Tnf-α וסמנים לפירוק מטריצה חוץ-תאית כגון Mmp3 ירד בליבה תחת מתח חמצן נמוך. בהידרוג'ל החיצוני שנזרע בתחילה עם תאי אנדותל (איור 6E), נוכחות של צמח ליבה חי (aC) הפחיתה את ביטוי Vegfa תחת מתח חמצן נמוך, אך לא תחת מתח חמצן גבוה. בנוסף, נוכחות של explant ליבה devitalized (dC) תחת מתח חמצן נמוך גם לא להפחית ביטוי vegfa . תחת מתח חמצן נמוך, ביטוי Tnf-α בהידרוג'ל החיצוני היה דומה סביב aC/dC אך גדל תחת מתח חמצן גבוה סביב צמחי ליבה חיים. ביטוי Fgf2 ירד בכל התנאים בהשוואה להידרוג'ל החיצוני עמוס תאי אנדותל שהורכב סביב צמח ליבה שעבר סטייה תחת מתח חמצן גבוה אך לרוב תחת מתח חמצן נמוך. ביטוי Mmp3 היה הגבוה ביותר סביב צמחי ליבה חיים תחת מתח חמצן גבוה והנמוך ביותר סביב צמחי ליבה סוטים תחת מתח חמצן נמוך. בסך הכל, נראה כי תאי האנדותל שעברו תרבית משותפת מגיבים הן לצמח הליבה הפעיל, המסוגל ליזום דיבור צולב והן לשינויים ברמות החמצן. ניתוח תמלול מקיף יותר יקל על הבהרת התרומות שלהם.
המודולריות של מערכת האסמבלואיד מאפשרת אינטגרציה של תאים מהונדסים גנטית המכילים גנים פלואורסצנטיים. כאן, תאי אנדותל שבודדו מעכברי Pdgfb-iCreER mG89 נזרעו לתוך תא ההידרוג'ל. תאים אלה מבטאים במשותף את תת-היחידה b (Pdgfb) של גורם גדילה הנגזר מטסיות דם של סמן תאי אנדותל לצד חלבון פלואורסצנטי ירוק משופר (EGFP), אשר גורם לתאי אנדותל המבטאים Pdgfb להיראות ירוקים תחת המיקרוסקופ (איור 6C). באמצעות שיטה זו, נוכחותם של תאי אנדותל המבטאים Pdgfb אושרה כנשמרת במשך 7 ימים בתרבית (37 מעלות צלזיוס) ונראתה בלתי תלויה במתח חמצן (20% O2 לעומת 3% O2).
כדי לנתח את ההפרשה של אסמבלואידים, מדיום התרבית המשמש בהתאמה לליבה // ללא תאים ולליבה // פיברובלסט, ליבה // מקרופאגים, או ליבה // תרבית משותפת של תאי אנדותל הוחלף במקבילו נטול הסרום שלושה ימים לפני ששאף והקפיא את הסופרנאטנט המועשר כעת בסוד (איור 6A). זמן העשרה זה הספיק כדי לזהות ציטוקינים כגון גורם גדילה אנדותל כלי דם (VEGF) עם בדיקת MSD, כפי שמוצג כאן עבור צמחי ליבה ומכלולי ליבה // פיברובלסטים שגודלו בתרבית בתנאי נישה דמויי נגעים (איור 6B).
שיקולים חשובים בעת ניתוח ההפרשות והתעתיקים של צמחי ליבה ומכלולים נוגעים לשימוש בבקרות נאותות. לצמחי ליבה טריים שבודדו יש ערך מוגבל, שכן במיוחד הביטוי שלהם של Vegfa ו-Mmps עולה מאוד תוך שעות לאחר הבידוד (איור 5A). צמחים מותאמי זמן המוקפים בהידרוג'ל נטול תאים מתאימים יותר כבקרות לביטוי הגנים של תא הליבה. עבור הידרוג'ל חיצוני, הידרוג'לים עמוסי תאים שגודלו בתרבית ללא צמח ליבה הם בקרות נחותות בהשוואה להידרוג'לים עמוסי תאים שגודלו סביב צמחי ליבה סוטים (קובץ משלים 7), בעיקר משום שהם נדחסים לצורות עגולות במקום הידרוג'לים מוארכים אשר משנים מאוד את המורפולוגיה של התא (איור 3A).

איור 1: בידוד והרכבה של רכיבי הרכבה כדי ליצור מודל in vivo crosstalk. צמחי ליבת הגידים הוצאו מזנבות עכברים, נחתכו והודקו. שרירי הרגליים של עכבר (כלומר, שרירי ארבע ראשי (QF), גסטרוקנמיוס (G) וטיביאליס קדמי (TA)) עוכלו כדי לבודד תאי אנדותל שגודלו לאחר מכן בתרבית פלסטיק של תרבית רקמה. גידי אכילס (AT) עוכלו גם הם כדי לבודד פיברובלסטים של גידים, שלאחר מכן תורבתו על פלסטיק של תרבית רקמות. מח העצם מהטיביה ועצם הירך נשטף מהעצמות. לאחר מכן, המונוציטים המבודדים גודלו בתרבית פלסטיק בתרבית רקמה והתמיינו למקרופאגים נאיביים. תמונות מיקרוסקופ האור (10x) מתארות את הופעתם של צמחי ליבה, תאי אנדותל, פיברובלסטים של גידים ומקרופאגים מיד לפני שילובם במכלולים. במהלך ההרכבה, התאים שגודלו בתרבית על פלסטיק הוכנסו לתרחיף ולאחר מכן נזרעו לתמיסת קולגן-1 (1.6 מ"ג/מ"ל). לאחר מכן, תערובת התא-הידרוג'ל נוצקה סביב צמח הליבה המהודק ופולימרית במשך 50 דקות ב -37 מעלות צלזיוס לפני הוספת מדיום תרבית. תנאי התרבית נשלטו באמצעות מלחציים (מתח מכני) והגדרות האינקובטור (ריכוז חמצן, טמפרטורה). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: אפיון של רכיבי אסמבלואיד תאי. (A) אנליזה ציטומטרית של זרימה מייצגת של תאי אנדותל שמקורם בשריר לאחר מעבר אחד (P1, שורה עליונה) ושני מעברים (P2, שורה תחתונה). הספירות עבור תאים לא מוכתמים (אפורים) ומוכתמים CD31 (ירוק) נורמלו למודאליים. האחוזים ניתנים עבור הקבוצה המוכתמת ב- CD31. (B) אנליזה ציטומטרית של זרימה מייצגת של פיברובלסטים שמקורם בגיד אכילס לאחר מעבר אחד (P1, שורה עליונה) ושני מעברים (P2, שורה תחתונה). הצירים מדווחים על עוצמות פלואורסצנטיות של תאים לא מוכתמים (אפורים) ותאים המבטאים ScxGFP ומוכתמים בנוגדנים CD146 (צבעי הקשת). (C) ניתוח ציטומטרי של זרימה מייצגת של מקרופאגים שמקורם במח עצם לאחר תרבית. בשורה העליונה, הספירות של תאים לא מוכתמים (אפורים) ומוכתמים F4/80 (ירוק) נורמלו למודאליים. האחוזים ניתנים עבור הקבוצה המוכתמת F4/80. הגרף בשורה התחתונה מדווח על עוצמות פלואורסצנטיות של תאים לא מוכתמים (אפור) ותת-קבוצה F4/80+ של תאים המוכתמים בנוגדני CD206 ונוגדנים CD86 (צבעי הקשת). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: הדמיה ומראה של אסמבלואיד. (A) תצלומים מייצגים שצולמו ביום 0 (d0) וביום 21 (d21) של תרבית (37°C, 20% O2) מראים התכווצות רב-ממדית של הידרוג'ל המכיל פיברובלסטים חיצוניים ללא אקספלנט ליבה מוטבע ודחיסה רדיאלית חזקה של הידרוג'ל המכיל פיברובלסטים חיצוניים סביב צמח ליבה. (B) תצלומים מייצגים שצולמו ביום ה-21 (d21) של תרבית (37°C, 20% O2) מראים הבדלים במהירות הדחיסה בין הידרוג'לים נטולי תאים, הידרוג'לים נטולי תאים היצוקים סביב צמח ליבה, והידרוג'לים עמוסי פיברובלסטים בגידים היצוקים סביב צמח ליבה. (C) תמונות מיקרוסקופ האור המייצגות (10x) שצולמו ביום 0 (d0) וביום 21 (d21) של תרבית (37°C, 20% O2) מצביעות על שינויים אורכיים בנוכחות אוכלוסיות תאים ועל מהירות הדחיסה של קולגן הידרוג'ל (HG) סביב צמח הליבה (E) בליבה // נטולת תאים ובליבה // תרבית משותפת של אסמבלואיד פיברובלסט. הייצוג הסכמטי מתאר את ההבדלים בדחיסת הידרוג'ל בין ליבה // אסמבלואיד נטול תאים לבין ליבה // פיברובלסט אסמבלואיד קו-תרבית. (D) תמונות מייצגות של מיקרוסקופ קונפוקלי שצולמו ביום 7 (d7) של ליבה // תא אנדותל, ליבה // מקרופאגים, וליבה // תרבית משותפת של אסמבלואיד פיברובלסט (37°C, 20% O2). תמונות בשורה השמאלית מתארות מכלולים עם גרעיני תאים מוכתמים בכחול (DAPI) ותאים מתים מוכתמים בוורוד (Ethidium homodimer-1). שתי השורות האחרות מתארות מכלולים עם גרעיני תאים מוכתמים בכחול (DAPI) וחוטי אקטין בירוק (F-actin). (E) קופסאות המתארות את הכדאיות המכומתת של מכלולי תאי ליבה // אנדותל ביום 1 (d1) וביום 7 (d7) של תרבית משותפת. N = 5. הצירים העליונים והתחתונים מתאימים לרביעון הראשון והשלישי (אחוזונים 25 ו-75) והאמצעי לחציון. השפם משתרע מהציר העליון/התחתון עד לערך הגדול ביותר/הקטן ביותר שאינו עולה על פי 1.5 מהטווח הבין-רבעוני. ערכי P: n.s.p > 0.05. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: גירוי מכני של מכלולים ומדידת תכונות מכניות של אסמבלואיד. (A) תיאור גרפי של התקן המתיחה בהתאמה אישית הכולל את פלטפורמות מחזיק המהדק, חיישן כוח ומנוע צעד. התמונה המצולמת מציגה מכלול המורכב על מכשיר המתיחה עם מלחציים. מכסה של צינור פלסטיק 15 מ"ל (Ø: 17 מ"מ) המשמש לקנה מידה. (B) גרף המתאר עקומות מתח/מאמץ מייצגות עבור צמחי ליבה (כחול בהיר) ומכלולים (אדום בהיר). ניתן לחלץ מהנתונים את המודולוס האלסטי הליניארי (α), הלחץ המרבי (β) והמאמץ המרבי (у) כדי לאפיין באופן מכני את צמח הליבה או האסמבלואיד. (C) גרף המציג את המודולוס האלסטי הליניארי (Emod) של מכלולי תאי ליבה // אנדותל שגודלו בתרבית משותפת (29°C, 3% O2) במשך מסלול זמן של 14 יום לאחר שהודקו (קו מוצק), הודקו ונמתחו לזן 2% L0 (קו מקווקו), או הודקו ונמתחו לזן 6% L0 (קו מקווקו) בתחילת הניסוי. N = 5. נקודות הנתונים נורמלו למודולוס האלסטי הליניארי הראשוני לפני המתיחה וכולן מוצגות כממוצע (±sem). ערכי P: *p < 0.05, **p < 0.01. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: שינויים בתעתיק הליבה לאחר בידוד ותרבות בתנאי נישה שונים. (A) תרשים פיזור המתאר את שינויי הקיפול בביטוי גנים Vegfa, Mmp13 ו-Mmp3 בצמחים חד-תרבותיים (37°C, 20% O2) של ליבת מורין פולטים 2 שעות, 4 שעות, 6 שעות ו-8 שעות לאחר בידודם מהזנב. שינויי הקיפול בנקודות הזמן המתאימות נורמלו לביטוי הגן שעתיים לאחר הבידוד. N = 2. (B) קופסאות המתארות את שינויי הקיפול בביטוי הגנים Ca9, Vegfa, Scx ו-Col1a1 בצמחי ליבה שעברו תרבית חד-תרבותית תחת מתח חמצן נמוך (3% O2) נורמלו והושוו לאלה שעברו תרבית חד-תרבותית תחת מתח חמצן גבוה (20% O2). N = 5-6. הצירים העליונים והתחתונים של הקופסאות מתאימים לרביעון הראשון והשלישי (אחוזונים 25ו-75) והאמצעי לחציון. השפם משתרע מהציר העליון/התחתון עד לערך הגדול ביותר/הקטן ביותר שאינו עולה על פי 1.5 מהטווח הבין-רבעוני. נקודות נתונים המשמשות לנורמליזציה מתוארות כנקודות שחורות ונקודות נתונים בודדות כנקודות אדומות. ערכי P: **p < 0.01, ***p < 0.001. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: ניתוח הפרשה ספציפית להרכבה ושעתוק ספציפי למדור. (A) תצלום מייצג המראה את האסמבלואיד ביום 7 (d7), כאשר נלקחו דגימות הפרשה ושעתוק ותיאור זרימת העבודה הבסיסית. (B) ריכוז VEGF (pg/mL) בסופרנאטנט של מכלולי ליבה // נטולי תאים וליבה // פיברובלסטים לאחר 7 ימים של תרבית משותפת (37°C, 20% O2) המתוארים כתרשימי קופסה. N = 6. (C) תמונות מייצגות במיקרוסקופ קונפוקלי של מכלולי תאי ליבה // אנדותל לאחר 7 ימים של תרבית משותפת (37°C) תחת מתח חמצן גבוה (20% O2) ומתח חמצן נמוך (3% O2). גרעיני התא מוכתמים בכחול (DAPI), ותאי האנדותל המשובצים מבטאים במשותף חלבון פלואורסצנטי ירוק משופר (EGFP) לצד תת-יחידה b (Pdgfb) של סמן תאי אנדותל. הקו המקווקו מציין את הממשק התאי בין צמח הליבה (E) לבין הידרוג'ל עמוס תאי אנדותל (HG). (D) תרשים פיזור המתאר את שינויי הקיפול בביטוי הגנים Vegfa, Tnf-α, Fgf2 ו-Mmp3 בתא הליבה ממכלולי תאי ליבה // אנדותל שגודלו בתרבית משותפת תחת מתח חמצן נמוך (3% O2) נורמלו והושוו לאלה שגודלו בתרבית תחת מתח חמצן גבוה (20% O2). N = 2. (E) תרשים פיזור המתאר את שינויי הקיפול בביטוי הגנים Vegfa, Tnf-α, Fgf2 ו-Mmp3 בתא החיצוני של מכלולי תאי ליבה // אנדותל עם ליבה חיה (aC) או ליבה מעוותת (dC) בתרבית משותפת תחת מתח חמצן גבוה (20% O2) ומתח חמצן נמוך (3% O2). שינויי הקיפול בתנאים המתאימים נורמלו לתא החיצוני של מכלול תאי ליבה // אנדותל עם ליבה סווטה (dC) בתרבית משותפת תחת מתח חמצן גבוה (20% O2). N = 3-4. ב-B, הצירים העליונים והתחתונים של הקופסאות מתאימים לרביעון הראשון והשלישי (אחוזונים 25 ו-75) והאמצעי לחציון. שפם משתרע מהציר העליון / התחתון לערך הגדול / הקטן ביותר לא יותר מ -1.5 פעמים הטווח הבין-רבעוני. חריגים מתוארים כנקודות שחורות. ערכי P: *p < 0.05. ב- D וב- E, נקודות הנתונים המשמשות לנורמליזציה מתוארות כנקודות שחורות, ונקודות נתונים בודדות מתוארות כנקודות אדומות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
טבלה 1: דרישות קלט עבור מערכות מודל של מחלות גידים ופציעות. רשימה של גורמי מחלת גידים ראשוניים ומניעים משניים הותאמה למבחר פרמטרי קלט שהטרקטיביות שלהם היא מרכזית למידול מחלת גידים ופציעה. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
טבלה 2: דרישות פלט עבור מערכות מודל מחלות גידים ופציעות. מבחר סימני היכר של מחלת גידים הותאמו למבחר פרמטרים של פלט שהכימות שלהם הוא מרכזי לפרשנות התנהגות של מחלת גידים ומודל פגיעה. אנא לחץ כאן כדי להוריד טבלה זו.
קובץ משלים 1: קובץ .stl עבור מחזיקי המהדק, תחנת ההרכבה ותבניות התא. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 2: תוכנית מחזיק מהדק ימני. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 3: תוכנית מחזיק מהדק שמאלי. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 4: תוכנית פלטפורמת ההרכבה לחץ כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 5: תוכנית מלחציים ממתכת. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 6: תמונה המציגה התכווצות הידרוג'ל ללא תאים. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.
קובץ משלים 7: תמונה המציגה גרעין חריג. אנא לחץ כאן כדי להוריד קובץ זה.