הפרוטוקול המפורט שלנו מתאר את היצירה והשימוש במודל מעי על שבב מתקדם, המדמה רירית מעיים אנושית עם מבנים תלת-ממדיים וסוגי תאים שונים, ומאפשר ניתוח מעמיק של תגובות חיסוניות ותפקודים תאיים בתגובה להתיישבות מיקרוביאלית.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
הפרוטוקול המפורט שלנו מתאר את היצירה והשימוש במודל מעי על שבב מתקדם, המדמה רירית מעיים אנושית עם מבנים תלת-ממדיים וסוגי תאים שונים, ומאפשר ניתוח מעמיק של תגובות חיסוניות ותפקודים תאיים בתגובה להתיישבות מיקרוביאלית.
פותח מודל מתקדם של מעי על שבב המשחזר מבנים אפיתל-ממדיים דמויי וילוס אורגנוטיפיים ודמויי קריפטה. המודל החיסוני כולל תאי אנדותל של וריד הטבור האנושי (HUVEC), תאי אפיתל מעי Caco-2, מקרופאגים שוכנים ברקמות, ותאים דנדריטיים, המתארגנים בעצמם בתוך הרקמה, ומשקפים מאפיינים של רירית המעי האנושית. היבט ייחודי של פלטפורמה זו הוא יכולתה לשלב תאי חיסון ראשוניים אנושיים במחזור, מה שמשפר את הרלוונטיות הפיזיולוגית. המודל נועד לחקור את תגובת מערכת החיסון של המעי להתיישבות וזיהום חיידקיים ופטרייתיים. בשל גודל החלל המוגדל שלו, המודל מציע קריאות פונקציונליות מגוונות כגון בדיקות חלחול, שחרור ציטוקינים וחדירת תאי מערכת החיסון, והוא תואם למדידת אימונופלואורסנציה של מבנים תלת ממדיים הנוצרים על ידי שכבת תאי האפיתל. הוא מספק בזאת תובנות מקיפות על התמיינות תאים ותפקודם. פלטפורמת מעי-על-שבב הדגימה את הפוטנציאל שלה בהבהרת אינטראקציות מורכבות בין פונדקאיות של מיקרוביוטה חיה לבין רקמה מארחת אנושית בתוך פלטפורמת שבב ביולוגי מיקרופיזיולוגית.
מערכות איבר-על-שבב (OoC) מייצגות טכניקה מתפתחת של תרבית תאים תלת-ממדית המסוגלת לגשר על הפער בין תרבית תאים דו-ממדית קונבנציונלית לבין מודלים של בעלי חיים. פלטפורמות OoC מורכבות בדרך כלל מתא אחד או יותר המכילים תאים ספציפיים לרקמות הגדלים על מגוון רחב של פיגומים כגון ממברנות או הידרוג'לים1. המודלים מסוגלים לחקות פונקציה אורגנוטיפית מוגדרת אחת או יותר. משאבות מאפשרות זילוח מיקרופלואידי רציף של מדיום תרביות תאים לסילוק תוצרי פסולת תאית, אספקת גורמי תזונה וגדילה לשיפור התמיינות התא ויצירה מחדש של תנאים חיוניים in vivo. עם שילוב של תאי חיסון, מערכות OoC יכולות לחקות תגובה חיסונית אנושית במבחנה2. עד כה, מגוון רחב של איברים ויחידות פונקציונליות הוצגו1. מערכות אלה כוללות מודלים של כלי הדם3, ריאות4, כבד 2,5 ומעי 6 שניתן להקל עליהם לבדיקות סמים 5,7 ומחקרי זיהום 6,8.
אנו מציגים כאן מודל מעי על שבב אנושי המשלב תאי אפיתל אנושיים היוצרים טופוגרפיה תלת-ממדית אורגנוטיפית של מבנים דמויי וילוס ודמויי קריפטה בשילוב עם רירית אנדותל ומקרופאגים שוכני רקמות. המודל מתורבת בשבב ביולוגי מחורר מיקרופלואידית בפורמט של שקופית מיקרוסקופית. כל ביו-שבב מורכב משני חללים מיקרופלואידים נפרדים. כל חלל מחולק על ידי קרום פוליאתילן טרפתאלט נקבובי (PET) לחדר עליון ותחתון. הממברנה עצמה משמשת גם כפיגום לצמיחת התאים מכל צד. נקבוביות הממברנה מאפשרות הצלבה תאית ונדידת תאים בין שכבות התא. ניתן לגשת לכל תא באמצעות שתי יציאות בגודל מנעול פיתוי. לחלופין, יציאה נוספת בגודל של מנעול מיני-לואר יכולה לספק גישה לתא העליון או התחתון (איור 1).
פלטפורמת OoC מציעה מספר קריאות שניתן לקבל מניסוי יחיד. המעי על שבב מותאם לשילוב תרבית תאים תלת-ממדית מחוררת, ניתוח שפכים ומיקרוסקופ פלואורסצנטי כדי להעריך ביטוי סמן תאים, קצב חילוף חומרים, תגובה חיסונית, נשאות מיקרוביאלית וזיהום, ותפקוד מחסום 3,6,8. המודל כולל תאים חיסוניים שוכנים ברקמה ומגע ישיר של מיקרואורגניזמים חיים עם הרקמה המארחת, דבר המהווה יתרון בהשוואה למודלים אחרים שפורסמו9. יתר על כן, תאי אפיתל מתארגנים בעצמם למבנים תלת-ממדיים המספקים ממשק רלוונטי מבחינה פיזיולוגית להתיישבות עם מיקרוביוטה חיה6.
פרוטוקול זה דורש גישה ל~20 מ"ל דם טרי לכל שבב ביולוגי מתורמים בריאים כדי לבודד מונוציטים אנושיים ראשוניים. כל התורמים נתנו הסכמה כתובה ומודעת להשתתף במחקר זה, אשר אושר על ידי ועדת האתיקה של בית החולים האוניברסיטאי יינה (הרשאה מספר 2018-1052-BO). לפרטים על החומרים, עיין בטבלת החומרים. לפרטים על הרכב כל הפתרונות והמדיה, עיין בטבלה 1.
1. הערות כלליות לטיפול בשבבים ביולוגיים

איור 1: ייצוג סכמטי של מודל מעי על שבב. (A) השבב הביולוגי מוצג במבט רוחבי. (B) הממד של השבב הביולוגי כולו, כמו גם של קרום ה-PET השטוח והנשלף גלוי. הנפח הכולל של החדר העליון, כולל היציאות בגודל מנעול הלואר הנשי, הוא 290 μL ו-270 μL עבור התא התחתון בהתאמה. (C) ניתן לראות הרכב סכמטי של השבב הביולוגי של המעי, אפיתל הגידול התלת-ממדי הדומה למבנים דמויי וילוס ודמויי קריפטה, כולל תאי חיסון ממוינים ושכבת ריר. הצד השני של קרום ה-PET מכוסה בחד-שכבה אנדותלית. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: סקירה סכמטית של ציר הזמן של בניית המודל והגדרת הניסוי. איור זה מציג את הסקירה הסכמטית של הפרוטוקול המוצג. הליכים חשובים, כגון זריעת תאים ואתגר אפיתל עם LPS מסומנים על ידי חצים. קיצורים: HUVECs = תאי אנדותל ורידיים טבוריים אנושיים; LPS = lipopolysaccharide. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
2. עיקור שבבים ביולוגיים
3. HUVECs קציר וזריעה
הערה: תאי אנדותל ורידי הטבור האנושי (HUVECs) בודדו מחבל הטבור כפי שפורסם לפני10.
4. איסוף נסיוב אנושי ובידוד מונוציטים שמקורו בתאי דם חד-גרעיניים היקפיים (PBMC)
הערה: מרכזיות ה-PBMC בודדו כמתואר ב-Mosig et al.11.
5. זריעת מונוציטים
6. C2BBe1 קציר וזריעה
הערה: גבול מברשת Caco-2 המבטא תאים 1 (C2BBe1)12 משמשים עד מעבר 35 ונלקחים מצלוחיות של 80-90% מפגש. תמונת שדה בהיר מייצגת של תרבית C2BBe1 מוצגת באיור 3C.

איור 3: מורפולוגיה של תאים של HUVECs, מונוציטים ו-C2BBe1 לפני הזריעה בשבב הביולוגי. איור זה מציג תמונות שדה בהיר מייצגות של מקורות התאים השונים המשמשים לאורך הפרוטוקול. התמונות צולמו במיקרוסקופ שדה בהיר הפוך באמצעות הגדלה של פי 10. כל סוגי התאים, (A) HUVECs, (B) מונוציטים ו-(C) C2BBe1 טופחו בתרבית תאים חד-שכבתית דו-ממדית כמתואר בסעיפי הפרוטוקול הספציפיים שלהם. פסי קנה מידה = 200 מיקרומטר. קיצורים: HUVECs = תאי אנדותל ורידיים טבוריים אנושיים; PBMCs = תאי דם חד-גרעיניים היקפיים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
7. חיבור למשאבה פריסטלטית וזילוח מעגלי

איור 4: ביו-שבב מחובר למשאבה פריסטלטית. מוצגת דוגמה לשבב ביולוגי המחובר למשאבה פריסטלטית. תאי אפיתל C2BBe1 מעובדים בתא התחתון (C2-medium אדום נמצא במאגרים שבחזית) ואילו HUVECs מעובדים בחדר העליון (EC-מותאם-בינוני צהבהב נמצא במאגרים מאחור). אמצעי תרביות התאים השונים אינם מתערבבים בשל תפקוד המחסום של הרקמה הגדלה. הביו-שבב מחובר למשאבה הפריסטלטית באופן כזה שהתווך זורם מהמאגר אל החלל. מכאן, התווך זורם חזרה למאגר דרך הצינור באמצעות המשאבה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
8. LPS - התניה של מחסום האפיתל
9. גישה לרקמה לשיטות קריאה שונות
10. הערכת חדירות באמצעות דיפוזיה FITC-dextran
הערה: ניתן לנתח את פונקציית המחסום של הרקמה באמצעות בדיקת חדירות FITC-dextran לאחר ניתוק המשאבה הפריסטלטית. הערכת החדירות של FITC-dextran אומצה על ידי Deinhardt-Emmer et al.4.
11. צביעת אימונופלואורסנציה
הערה: ניתן לחקור את הרקמה החיה באופן מיקרוסקופי. לטיפול קל יותר, אנו ממליצים על ניתוק השבב הביולוגי מהמשאבה הפריסטלטית ועל שימוש במטרות למרחקים ארוכים במיקרוסקופ הפוך. כניתוח נקודת קצה, ניתן לקבע את הרקמה בתוך השבב הביולוגי עבור הליכים כמו צביעה אימונופלואורסצנטית.
תוצאות מייצגות אלה מראות את שכבות הרקמה הנפרדות של מודל המעי על שבב. הם מוכתמים immunofluorescent כמתואר בסעיף פרוטוקול 11. התמונות צולמו במיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי או פלואורסצנטי קונפוקלי כערימות z ועובדו להקרנה אורתוגונלית. עיין בטבלת החומרים לקבלת פרטים על ההגדרה והתוכנה המיקרוסקופית. איור 5 מראה את שכבת כלי הדם, חד-שכבה אנדותל יוצרת מחסום, המורכבת מ-HUVECs ומקרופאגים. סמנים תאיים מייצגים כגון VE-Cadherin וגורם פון וילברנד עבור תאי האנדותל ו- CD68 עבור המקרופאגים מוכתמים. שכבת האפיתל התלת-ממדית המורכבת מתאי C2BBe1 מוצגת באיור 6 ובאיור 7. שלמות הרקמה מאושרת על ידי צביעה של E-Cadherin ו- ZO-1. ניתוח מפורט של כל סמני הרקמה הצפויים וקיטוב רקמות ניתן למצוא ב- Maurer et al.6. איור 8 מראה תמונה לדוגמה ללא צמיחה תלת-ממדית של מבנים דמויי וילוס מעיים. בהשוואה לשכבת תאים תלת-ממדית טיפוסית (איור 6), מספר הגרעינים המוכתמים מצטמצם מאוד, ותאים נמצאים רק בשכבה אחת-שכבתית. פנוטיפ ספציפי זה נוצר על ידי הוספת מעכב היסטון deacetylase למדיום תרבית התא המעכב את התפשטות התאים. חדירות המחסום מוערכת על ידי בדיקת חלחול באמצעות FITC-dextran. החדירות גדלה עם זיהום ב-C. albicans הפתוגני האופורטוניסטי, כפי שניתן לראות באיור 9A. זיהום גורם לשחרור מוגבר של ציטוקינים IL-1β, IL-6, IL-8 ו-IL-10 לסופרנאטנט התווך של כלי הדם (איור 9B)8.

איור 5: צד כלי דם מקובע של המעי על שבב. תמונה אימונופלואורסצנטית מייצגת של מחסום כלי הדם לאחר חמישה ימים של זילוח. הרקמה הייתה מקובעת במתנול. מחסנית z של חתכים של 1 מיקרומטר נלקחה במיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי, ומוצגת הקרנה מקסימלית אורתוגונלית של מחסנית z זו. (A) דנ"א בתוך גרעינים הוכתם ב-DAPI. (B) מקרופאגים מובחנים לחלוטין שמקורם במונוציטים מבטאים CD68 ומפוזרים בכל רקמת כלי הדם. (C) HUVECs יוצרים שכבה חופפת המראה את שלמות הרקמה על ידי היווצרות צמתים נצמדים כגון VE-Cadherin. בנוסף, (D) גורם פון וילברנד מבוטא מאוד על ידי HUVECs. לבסוף, (E) כל הסמנים מוצגים בשכבת-על. פסי קנה מידה = 100 מיקרומטר. קיצורים: DAPI = 4',6-diamidino-2-phenylindole; HUVECs = תאי אנדותל ורידיים טבוריים אנושיים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: צד אפיתל מקובע של המעי על שבב. תמונה אימונופלואורסצנטית מייצגת של שכבת תאי האפיתל המקוטבת לאחר 5 ימים של זילוח המבטא את חלבוני הצומת E-Cadherin ו- ZO-1. הרקמה הייתה מקובעת במתנול. מחסנית z של מקטעים של 1 מיקרומטר נלקחה במיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי. מוצגת הקרנה מקסימלית אורתוגונלית של ערימת z זו. (A) דנ"א בגרעינים הוכתם ב-DAPI. מחסום אפיתל הדוק מתפתח על ידי היווצרות של (B) צמתים נצמדים, מוכתמים ב- E-Cadherin, ו- (C) צמתים הדוקים אפיים, מוכתמים ב- ZO-1. צמתים הדוקים וצמתים נצמדים מתמקמים יחד בקרום התא האפיקאלי, כפי שניתן לראות בתמונת הכיסוי (D). פסי קנה מידה = 100 מיקרומטר. קיצור: DAPI = 4',6-diamidino-2-phenylindole. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: צד אפיתל מקובע של המעי על שבב עם צמיחה דמוית וילוס. תמונה אימונופלואורסצנטית מייצגת של שכבת תא האפיתל התלת מימדית לאחר שישה ימים של זילוח. הרקמה הייתה מקובעת בקיבוע של קרנוי. מחסנית z של חתכים של 1 מיקרומטר צולמה במיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי, ו-(A) מוצגת הקרנה מקסימלית אורתוגונלית של מחסנית z זו. DNA בגרעינים הוכתם בהוכסט. בנוסף, הרקמה הוכתמה באגלוטין נבט חיטה, לקטין, המכתים מוצין אנושי. (B) הצמיחה התלת-ממדית של מבנים דמויי וילוס ודמויי קריפטה של האפיתל יכולה להיות מזוהה בחתכי x ו-y של ערימת z. פסי קנה מידה = 50 מיקרומטר. קיצור: WGA = נבט חיטה agglutinin. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 8: צד אפיתל מקובע של המעי על שבב ללא צמיחה דמוית וילוס (villus). תמונה אימונופלואורסצנטית מייצגת של שכבת תאי האפיתל שטופלה בחומצה הידרוקסמית סוברוילאניליד (SAHA), מעכב היסטון דאצטילאז, המונע התפשטות תאים. הרקמה הייתה מקובעת במתנול. מחסנית z של מקטעים של 1 מיקרומטר נלקחה במיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי. מוצגת הקרנה מקסימלית אורתוגונלית של ערימת z זו. (A) דנ"א בגרעינים הוכתם ב-DAPI. ב-(B) צמתים צמודים מוכתמים ב-E-Cadherin, וב-(C) צמתים הדוקים מוכתמים ב-ZO-1. צמתים הדוקים וצמתים צמודים מתמקמים זה בזה, כפי שניתן לראות בתמונת הכיסוי (D). פסי קנה מידה = 100 מיקרומטר. קיצור: DAPI = 4',6-diamidino-2-phenylindole. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 9: תגובה חיסונית תלוית פתוגן של תאי מערכת החיסון המולדת המשולבים: איור זה שונה מ-Kaden et al.8. מודל מעי-על-שבב שאינו נגוע (-) או נגוע (+) ב-C. albicans SC5314 נותח עבור (A) חדירות עם FITC-Dextran (3-5 kDa) ו-(B) הפרשת ציטוקינים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
| פתרון/בינוני | הרכב | |
| תמיסת מלאי קולגן | 0.5 מ"ג/מ"ל קולגן IV ב-0.5 מ"מ חומצה אצטית | |
| איזו-חיץ | PBS -/-, 1 מ"ג/מ"ל חלק אלבומין בסרום בקר V, 2 mM EDTA | |
| מדיום התמיינות מונוציטים | תא המטופויטי בינוני + 10% סרום אוטולוגי אנושי + 10 ng/mL גורם מגרה מושבת מקרופאגים רקומביננטי (M-CSF) + 10 ng/mL גרנולוציטים-מקרופאגים רקומביננטיים גורם מגרה מושבה (GM-CSF) | |
| טריפסין דיסוציאציה מגיב | 0.25% טריפסין + 1 mM EDTA ב PBS -/- | |
| מגיב ניתוק מונוציטים | 4 מ"ג/מ"ל לידוקאין + 5 מ"מ EDTA ב-PBS -/- | |
| מדיום ממוזג EC | EC-medium + 10% סרום אוטולוגי אנושי +10 ng/ml M-CSF + 10 ng/mL GM-CSF | |
| C2-בינוני | DMEM גלוקוז גבוה (4.5 גרם / ליטר) + 10% FBS + 1% גלוטמקס + 1% MEM תמיסת חומצות אמינו לא חיוניות + 1 mM נתרן פירובט + 10 מיקרוגרם / מ"ל הולו-טרנספרין אנושי | |
| תמיסת מלאי של איזותיוציאנט פלואורסצאין (FITC)-דקסטרן | 1 מ"ג/מ"ל ב-C2-medium שחומם מראש ללא פנול אדום | |
| פתרון חוסם וחדיר | 3% סרום חמורים רגיל (NDS) + 0.1% סאפונין ב- PBS +/+ | |
| פתרון צביעה | 0.3% סרום חמור רגיל (NDS) + 0.1% סאפונין ב- PBS +/+ | |
| תמיסת כביסה | 0.1% של saponin ב PBS +/+ | |
| הקיבעון של קרנוי | 60% אתנול, 30% כלורופורם, 10% חומצה אצטית קרחונית | |
טבלה 1: רשימה והרכב של פתרונות המשמשים בפרוטוקול זה. קיצור: PBS -/- = מלח חוצץ פוספט של דולבקו ללא מגנזיום וסידן.
הפרוטוקול המוצג מפרט את הצעדים הדרושים ליצירת מודל מעי על שבב חיסוני. תיארנו טכניקות ספציפיות ושיטות קריאה אפשריות כגון מיקרוסקופ אימונופלואורסצנטי, ניתוח ציטוקינים ומטבוליטים, ציטומטריית זרימה, ניתוח חלבונים וגנטיקה, ומדידת חדירות.
המודל המתואר מורכב מ- HUVECs ראשוניים, מקרופאגים שמקורם במונוציטים ותאים דנדריטיים שמקורם במונוציטים בתרבית משותפת עם שכבה תלת ממדית של תאי אפיתל מעיים המייצגים היבטים של אוכלוסיות המפרישות ריר, סופגות, אנטרואנדוקריניות ודמויות תאי פאנת, כפי שתואר לפני 6,14. יש לזכור כמה נקודות קריטיות בעת ביצוע שלבי הפרוטוקול. בכל השלבים, יש למנוע היווצרות בועות אוויר בתוך המערכת המיקרופלואידית. לכן, תמיד פיפטה הפוכה (לקחת את הנפח מהתחנה השנייה ולחלק רק עד התחנה הראשונה) בעת טיפול ביו-שבב או צינור. כדי למנוע לחץ גבוה או כוחות גזירה על תאים בתוך השבב הביולוגי, יש תמיד לבצע פיפטה עדינה ולשמור על החדר הנגדי סגור בעת צנרת בביו-שבב (למשל, בעת החלפת התווך בתא העליון, סגור את התא התחתון עם התקעים המתאימים). השבב הביולוגי מאפשר זריעת תאים משני צידי קרום PET. לפיכך, ניתן להקים את המודל עם מבנים דמויי וילוס מעיים מתחת לקרום ה-PET או לגדול על הממברנה כלפי מעלה. בהתאם לעניין המחקרי, לכיוון זה או אחר של התאים יש יתרונות מסוימים במונחים של אינטראקציה פיזית, כגון התקשרות תאים בסיוע כוח הכבידה של תאים במחזור המושעה בתווך הזרימה.
בשל זרימת התווך המיקרופלואידית, תאי המעי המקוטבים יוצרים רקמה תלת ממדית הדומה למבנים דמויי קריפטה ודמויי וילוס, המעצבים מחסום רקמות אפיקלי עמוק על ידי רשת צפופה של צמתים הדוקים וצמתים6. בנוסף, תאי מערכת החיסון המולדת המשולבים מגבירים את תפקוד מחסום המעי ומאפשרים חקירה מפורטת של תגובות ציטוקינים ותאי מערכת החיסון כלפי גירויים שונים, כולל תגובות חיסוניות ספציפיותלתורם 3,6. המודל מציע פלטפורמה רלוונטית מבחינה פיזיולוגית לחקר קומנסלים מיקרוביאליים (למשל, לקטובצילוס רמנוסוס6) ופתוגנים (למשל, Candida albicans 6,8) של המעי האנושי. המודל מונף כדי לחקור מנגנונים של שינויים בהרכב חיידקי המעי וויסות התגובה החיסונית הרירית6. במחקר הדגמנו כיצד לשחזר את הסבילות החיסונית הפיזיולוגית של לומן המעי ולתמוך בהתיישבות הומיאוסטטית על ידי מיקרואורגניזמים חיים. יתר על כן, טרום התיישבות של הצד הלומינלי של המודל עם פרוביוטיקה Lactobacillus rhamnosus הפחיתה את פלישת הרקמה של קנדידה אלביקנס והגבילה את הטרנסלוקציה שלה לתא כלי הדם, בדומה למצב in vivo. המחקר הוכיח את הפוטנציאל של המודל לחקר אינטראקציות מיקרוביאליות, תגובות חיסוניות ומנגנוני פתוגניות של המעי בתנאים פיזיולוגיים רלוונטיים במבחנה.
עם זאת, לפלטפורמת השבבים הזו יש מגבלות, כלומר שימוש בתאי מעי שמקורם בסרטן, שאינם מסוגלים לייצג באופן מלא את המעי האנושי, ושימוש בתאי אנדותל וחיסון ראשוניים. ניתן לקבוע תנאי תרבות היפוקסיים על ידי טיפוח המודל באינקובטור היפוקסיה בתנאים מחוררים כדי לשקף טוב יותר את מצב in vivo של המעי האנושי.
בהשוואה לפלטפורמות OoC אחרות, כגון מודל "gut-on-a-chip" שפורסם על ידי Kim et al.14,15 מספר התאים הראשוני המרכיב את מודל הרקמה המוצג גבוה בערך פי 10. זה, למשל, מאפשר ניתוח סימולטני של עד שלושה לוחות צביעה immunofluorescence בתוך ניסוי יחיד. מספרי התאים הגדולים יותר מייעלים עוד יותר את ניתוחי נקודות הקצה, כולל ציטומטריית זרימה, ניתוח כתמים מערביים ומבחני מדף סטנדרטיים אחרים, הדורשים סופרנאטנטים של תרביות תאים כגון פרופיל ציטוקינים ומדידת לקטט דהידרוגנאז (LDH). השגת קריאות מרובות מניסוי יחיד מפחיתה את העלויות הכוללות ואת זמן הניסוי. פתרונות חומרה מהמדף ממגוון רחב של יצרנים זמינים הודות לפלטפורמת השבבים המתוקננת הכוללת ממשקים וטביעות רגל בתעשייה (פורמט שקופיות מיקרוסקופי של השבב, יציאות בפורמט נעילת luer ומיושרות על מטריצת באר 96). זה כולל גם קרומים רבים מחומרים שונים וגדלי נקבוביות. גודל הנקבוביות יכול להשפיע על גדילת התאים ושלמות הרקמה16 וכן על נדידת תאים.
לסיכום, פרוטוקול זה מציג מודל מעי-על-שבב מפורט וניתן להתאמה המשכפל מרכיבים חיוניים בסביבת המעי האנושית. הוא מספק פלטפורמה ניתנת להרחבה ויעילה לביצוע מחקר מקיף על מיקרוביוטת המעי ועל רקמת המאכסן במעי, עם דגש מיוחד על תגובות החיסון של המאכסן ופתופיזיולוגיה של המעי. לפיכך, המודל מסוגל לגשר על הפער בין מודלים מסורתיים במבחנה לבין הביולוגיה האנושית, מה שהופך אותו לכלי חיוני למחקרים מעמיקים על ביולוגיה של המעי.
מ.ר. הוא מנכ"ל Dynamic42 GmbH ומחזיק במניות החברה. א.ס.מ היא יועצת מדעית של Dynamic 42 GmbH ומחזיקה במניות בחברה.
העבודה נתמכה כספית על ידי מרכז המחקר השיתופי PolyTarget 1278 (מספר פרויקט 316213987) ל- V.D.W. ו- A.S.M. A.F. ו- A.S.M. כמו כן, מכירים בתמיכה כספית על ידי אשכול המצוינות "איזון המיקרווורס" במסגרת אסטרטגיית המצוינות של גרמניה - EXC 2051 - Project-ID 690 390713860. ברצוננו להודות לאסטריד טנרט ולמעבדת Jena Biophotonic and Imaging Laboratory (JBIL) על שסיפקו לנו גישה למיקרוסקופ סריקת הלייזר הקונפוקלי שלהם ZEISS LSM980. איור 1C ואיור 2 נוצרו עם Biorender.com.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| צלחת 96 באר שחורה, תחתית שקופה | Thermo Fisher | 10000631 | חומרים מתכלים |
| חומצה אצטית | Roth | 3738.4 | כימיקלים |
| Alexa Fluor 488 AffiniPure, חמור, נגד עכבר IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 715-545-150 | נוגדן משני צביעת כלי דם וצביעה אפיתל |
| Alexa Fluor 647 AffiniPure, חמור, אנטי ארנב IgG (H+L) | Jackson מחקר חיסוני | 711-605-152 | נוגדן משני צביעת אפיתל |
| Alexa Fluor 647, חמור, אנטי ארנב IgG (H+L) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | A31573 | נוגדן משני צביעת כלי דם |
| Axiocam ERc5s מצלמה | Zeiss | 426540-9901-000 | ציוד טכני |
| בזאלי בינוני MV, פנול ללא אדום | Promocell | C-22225 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| Biochip | Dynamic 42 | BC002 | חומרים מתכלים מיקרופלואידיים |
| BSA שבר V | Gibco | 15260-037 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| C2BBe1 (שיבוט של Caco-2) | ATCC | CRL-2102 | מקור תאי אפיתל |
| כלורופורם | סיגמא | C2432 | כימיקלים |
| CO2 חממה | Heracell | 150i | ציוד טכני |
| קולגן IV משליה אנושית | Sigma-Aldrich | C5533 | מתכלים לתרבית תאים |
| Coverslips (24 x 40 מ"מ; #1.5) | Menzel-Glä ser | 15747592 | חומרים מתכלים |
| Cy3 AffiniPure, חמור, אנטי עזים IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 705-165-147 | נוגדנים משניים צביעת כלי דם |
| Cy3 AffiniPure, חמור, אנטי חולדות IgG (H+L) | Jackson Immuno Research | 712-165-150 | נוגדן משני צביעת אפיתל |
| Descosept PUR | Dr.Schuhmacher | 00-323-100 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| DMEM גלוקוז גבוה | Gibco | 41965-062 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| DMEM גלוקוז גבוה ללא פנול אדום | Gibco | 31053028 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| DPBS (-/-) | Gibco | 14190-169 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| DPBS (+/+) | Gibco | 14040-133 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| תמיסת EDTA | Invitrogen | 15575-038 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| מדיום גידול תאי אנדותל | Promocell | C-22020 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| תוספי תזונה בינונית לצמיחת תאים | אנדותל Promocell | C-39225 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| אתנול 96%, לא מפורק | Nordbrand-Nordhausen | 410 | כימיקלים |
| סרום בקר עוברי | invitrogen | 10270106 | תרבית תאים חומרים מתכלים |
| פלואורסצאין איזותיוציאנט (FITC)-דקסטרן (3-5 kDa) | Sigma Aldrich | FD4-100MG | כימיקלים |
| הרכבה פלואורסצנטית בינונית | Dako | S3023 | כימיקלים |
| גנטמיצין (10 מ"ג/מ"ל) | Sigma Aldrich | G1272 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| תוסף GlutaMAX (100x) | Gibco | 35050061 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| Histopaque | Sigma-Aldrich | 10771 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| Hoechst (bisBenzimid) H33342 | Sigma-Aldrich | 14533 | צביעת אפיתל |
| (5 מ"ג/מ"ל) טרנספרין, הולו, פלזמה אנושית | Millipore | 616397 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| רקומביננטי אנושי GM-CSF | Peprotech | 300-30 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| אנושית רקומביננטי M-CSF | Peprotech | 300-25 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| מכשיר תאורה | Zeiss | HXP 120 C | הגדרת מיקרוסקופ פלואורסצנטי |
| מיקרוסקופ סריקת לייזר | Zeiss | CLSM980 | הגדרת מיקרוסקופ פלואורסצנטי |
| לידוקאין הידרוכלוריד | סיגמא-אולדריץ' | L5647 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| ליפופוליסכריד (LPS) | סיגמא | L2630 | מתכלים לתרבית תאים |
| מגבוני Loftex | חומרים | מתכלים | Loftex |
| חיבור נמוכים (PS, 5 מ"ל) | מתאם מתכלה | לואר של Falcon | 352052 |
| לכובע העליון (M) | Bi Tec | M3003 | חומרים מתכלים מיקרופלואידיים |
| תקעי מיני לואר זכר, שורה של ארבעה, PP, | חנות שבבים מיקרופלואידית | 09-0556-0336-09 | חומרים מתכלים מיקרופלואידיים |
| MEM תמיסת חומצות אמינו לא חיוניות | Gibco | 11140 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| מתנול | רוט | 8388.2 | כימיקלים |
| מיקרוסקופ | Zeiss | Axio Observer 5 | הגדרת מיקרוסקופ פלואורסצנטי |
| שקופיות מיקרוסקופ | Menzel | MZ-0002 | חומרים מתכלים |
| חד שבטיים, עכבר, נוגדן CD68 אנטי אנושי ( KP1) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | 14-0688-82 | נוגדן ראשוני מכתים כלי דם |
| מונוקלונלי, חולדה, נוגדן E-Cadherin אנטי אנושי (DECMA-1) | Sigma-Aldrich, Millipore | MABT26 | נוגדן ראשוני אפיתל מכתים |
| Multiskan Go קורא צלחת | Thermo Fisher | 51119300 | ציוד טכני |
| סרום חמור רגיל | ביוזול | LIN-END9010-10 | כימיקלים |
| חתך אופטי | Zeiss | ApoTome | הגדרת מיקרוסקופ פלואורסצנטי |
| פניצילין-סטרפטומיצין (10,000 U/mL) | Gibco | 15140-122 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| תקעים | Cole Parmer | GZ-45555-56 | חומרים מתכלים מיקרופלואידיים |
| פוליקלונליים, עזים, נוגדן VE-Cadherin אנטי אנושי | R& D Systems | AF938 | נוגדן ראשוני צביעת כלי דם |
| פוליקלונלי, ארנב, אנטי אנושי פון ווילברנד פקטור נוגדן | Dako | A0082 | נוגדן ראשוני מכתים כלי דם |
| פוליקלונלי, ארנב, נוגדן ZO-1 אנטי אנושי | תרמו פישר מדעי, Invitrogen | 61-7300 | נוגדן ראשוני אפיתל מכתים |
| ספק כוח מיקרוסקופ | Zeiss | Eplax Vp232 | הגדרת מיקרוסקופ פלואורסצנטי |
| מיקרוסקופ פרימוברט | Zeiss | 415510-1101-000 | ציוד טכני |
| Reglo ICC משאבה פריסטלטית | Ismatec | ISM4412 | ציוד טכני |
| SAHA (Vorinostat) | Sigma Aldrich | SML0061-25MG | כימיקלים |
| Saponin | Fluka | 47036 | כימיקלים |
| S-Monovette, 7.5 מ"ל Z-Gel | Sarstedt | 01.1602 | חומרים מתכלים |
| S-Monovette, 9.0 מ"ל K3E | Sarstedt | 02.1066.001 | חומרים מתכלים |
| נתרן פירובט | Gibco | 11360-088 | מתכלים לתרבית תאים |
| מיכל 4.5 מ"ל | ChipShop | 10000079 | חומרים מתכלים מיקרופלואידיים |
| כתם כחול טריפן 0.4% | Invitrogen | T10282 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| Trypsin | Gibco | 11538876 | חומרים מתכלים לתרבית תאים |
| צינורות | מתכלים מיקרופלואידיים | דינמיים 42 | ST001 |
| פינצטה (Prä zisionspinzette DUMONT abgewinkelt Inox08, 5/45, 0,06 מ"מ) | Roth | K343.1 | חומרים מתכלים |
| נבט חיטה אגלוטינין (WGA) | Thermo Fisher Scientific, Invitrogen | W32464 | צביעת אפיתל |
| X-VIVO 15 | Lonza | BE02-060F | חומרים מתכלים לתרבית תאים, מדיום תאים המטופויאטיים |
| Zellkultur Multiwell Platten, 24 באר, | גריינר סטרילי Bio-One | 662 160 | חומרים מתכלים |
| Zellkultur Multiwell Platten, 6 באר, סטרילי | Greiner Bio-One | 657 160 | חומרים מתכלים |
| Zen Blue Software | Zeiss | גרסה 3.7 | מיקרוסקופיה תוכנה |