בשל היעדר סמנים מוחלטים לזיהוי אוכלוסיית NSC in vivo, ניתוח NSCs התבסס בעיקר על התבוננות בהתנהגות של תאים שבודדו מנישות נוירוגניות בתנאי ex vivo . עבודתם החלוצית של ריינולדס וייס הניחה את היסודות על ידי קביעת תנאי תרבית מדויקים, המאפשרים בידוד והרחבה של תאים בודדים מרקמת SVZ עכברית צעירה (בת חודשיים) בתנאים שאינם דביקים. תאים אלה מופצים בדרך כלל בתווך נטול סרום המכיל EGF ו- bFGF, תנאים המונעים לחלוטין התמיינות לנוירונים ולגליה תוך קידום התפשטות. ואכן, בתנאי תרבית אלה9, רוב התאים מתים בימים הראשונים בתרבית, אך תת-קבוצה קטנה מתחילה להתחלק ויוצרת בעיקר נוירוספרות צפות9. דיסוציאציה אנזימטית ותת-תרבית של צברי תאים אלה מאפשרים התפשטות תרבית, ומדגימים את יכולת ההתחדשות העצמית של תרביות אלה.
יש לציין כי תרביות נוירוספריות מראות פוטנציאל התפשטות עם תוספת של EGF בלבד, בעוד שתאי גזע עצביים הגדלים בתווך המכיל bFGF בלבד אינם מראים התפשטות תאים לטווח ארוך30. שתי הראיות מצביעות על EGF כמיטוגן העיקרי להתחדשות עצמית של המל"ל. עם זאת, נוכחותם של EGF ו- bFGF במדיום התרבית משפרת את יכולת ההתחדשות העצמית של NSCs31, כמו גם תורמת לאיזון פוטנציאל ההתמיינות לאסטרוציטים, נוירונים ואוליגודנדרוציטים 32,33,34,35. יתר על כן, השימוש בתערובת מוגדרת של הורמונים וגורמים במקום חלופות מסחריות להשלמת המדיום מבטיח את האיכות הגבוהה ואת יכולת השחזור של תרביות המל"ל. בתנאים אלה, תרביות NSC של עכברים יכולות להמשיך כשורות תאים יציבות מבלי לעבור הנצחה. אף על פי כן, דאגה בתרביות נוירוספריות היא הפוטנציאל של אוכלוסיות תאים מתפשטות לעבור טרנספורמציות גנטיות, תוך עקיפת מנגנוני ויסות מחזור התא ולהוביל לפנוטיפ בן אלמוות. לכן, למרות שתרביות נוירוספריות ניתנות להרחבה רבה, תרביות מעבר ל-10 מעברי מבחנה מושלכות בדרך כלל למחקרים, מכיוון שהן עשויות לעבור הזדקנות משוכפלת, ותאים עם תוכן כרומוזומלי חריג או דינמיקת גדילה לא סדירה עשויים להופיע. יתר על כן, השימוש בתרבויות נוירוספריות מבוססות לטווח ארוך חייב להיות מנוטר ברציפות. תרבויות נוירוספריות מציעות גם הזדמנות לבחון את המאפיינים והפוטנציאל שלהן בסביבה מבוקרת, ומספקות סביבה מדויקת ומתכווננת יותר שניתן לווסת ולנטר בצורה מדויקת יותר מאשר in vivo. באמצעות ניתוח קלונוגני או אוכלוסייה במבחנה, ניתן לכמת את יכולות ההתחדשות העצמית וההתרבות של תאים אלה, מה שמקל על זיהוי המנגנונים הבסיסיים השולטים בתכונות אלה.
עם זאת, למרות רשימת היתרונות הגדולה של עבודה עם מל" לים במבחנה, אופיו של פרוטוקול טיפוח זה ועדינותו של המל"ל מהווים אתגר בתחום. לדוגמה, מספר הנוירוספרות הראשוניות הנוצרות במהלך דיסקציה טיפוסית יכול להשתנות באופן משמעותי בהתאם למיומנות ולדיוק של הנסיין. תוצאות הנוירוספרות הראשוניות ממחישות שונות זו במספר הנוירוספרות הראשוניות המתקבלות מה-SVZ של עכברים בני חודשיים, בטווח שבין 500 ל-3000 נוירוספרות. גורמים שונים עשויים לתרום לשונות זו. ראשית, דיוק הדיסקציה ממזער רקמות פרנכימליות לא רצויות, המעכבות היווצרות כדור ראשוני. שנית, יצירת חתיכות קטנות של רקמת SVZ מאפשרת עיכול אנזימטי יעיל וטריטורציה, ובכך מפחיתה את אובדן התאים. זה מדגיש את הצורך בתרגול מוקדם מספיק של פרוטוקול הדיסקציה ופיתוח מכוונן של עיבוד רקמות במהלך הקמת תרביות נוירוספרה.
מגבלה נוספת של תרביות אלה נעוצה בעובדה שנוירוספרות יכולות לכלול גם תאי גזע עצביים וגם תאי אב, מה שמקשה על ההבחנה בין שתי אוכלוסיות אלה בתוך תרבויות ראשוניות. בעוד שסמנים שונים כמו GFAP, Nestin, Musashi ו-SOX2 דווחו כמבוטאים על ידי NSCs8, אף אחד מהם לא היה קשור באופן בלעדי ל-NSCs. טכניקות FACS מתפתחות המבוססות על ביטוי אנטיגן בפני השטח של התא אפשרו בידוד של NSCs וצאצאיהם. מחקרים אלה הוכיחו כי אבות מגבירי מעבר אינם מסוגלים ליצור נוירוספרות במעבר25,36. לכן, בעוד שהקשר בין תאי SVZ לבין תאים יוזמי נוירוספירה דורש עידון נוסף 18,19,20,21,22,23, היכולת של נוירוספרות לעבור באופן סדרתי לאורך תקופה ממושכת עשויה לשקף את נוכחותם של תאי גזע עצביים בתרביות.
מערכת תרבית נוירוספרית זו שימשה מודל חזק לחקר ההשפעה של מסלולי איתות וביטוי גנים בשמירה על יכולת ההתחדשות העצמית של NSC במבחנה15,29. גישה אחת לחקור היבטים אלה כוללת הדבקה של NSCs כדי לבטא יתר על המידה או להפיל גנים ספציפיים. ניתן להשיג זאת באמצעות טכניקות שונות, כולל שיטות ויראליות ולא ויראליות. בעוד שווקטורים נגיפיים משיגים לעתים קרובות יעילות העברת גנים גבוהה, יש להם מגבלות חשובות, כגון דרישות הבטיחות הגבוהות וייצור וקטורים הגוזל זמןרב 26. לעומת זאת, שיטות טרנספקציה קלאסיות כמו ליפופקציה ואלקטרופורציה משיגות שיעורי טרנספקציה נמוכים מאוד, מה שהופך אותן לבלתי ישימות עבור תאים קשים להעברה. טכנולוגיית הנוקלאופקציה מציעה גישה ידידותית למשתמש על ידי שילוב פתרונות נוקלאופקציה ספציפיים לסוג התא עם פרמטרים חשמליים ייחודיים לכל סוג תא37,38. זה מבטיח העברת DNA ישירות לתוך גרעין התא39, ומאפשר את שילוב ה- DNA באופן בלתי תלוי במחזור התא. כתוצאה מכך, נוקלאופקציה מתגלה כטכניקה בת קיימא להעברת תאים קשים להעברה כגון NSCsעכבר 28,40.
מגבלה אחת של שיטה זו היא כי מינימום של 2 x 106 תאים מומלץ והכרחי עבור כל nucleofection, אם כי בתנאים אופטימליים, מספר נמוך יותר של תאים ניתן להשתמש לכל nucleofection יחיד (כלומר, 5 × 105 תאים). חסרון נוסף של השיטה הוא שהאיכות והריכוז של הדנ"א המשמש לנוקלאופקציה משפיעים באופן משמעותי על יעילות העברת הגנים. מומלץ מאוד להשתמש בדנ"א מוכן ללא אנדוטוקסין כדי למנוע תמותת תאים מוגברת כתוצאה מנוכחות אנדוטוקסין. בנוסף, שימוש ביותר מ-6 מיקרוגרם של דנ"א כולל לנוקלאופקציה יכול להפחית באופן משמעותי הן את יעילות העברת הגנים והן את יכולת הקיום של התא. לבסוף, מתן פולס חשמלי הוא גם קריטי להישרדותם של תאים נוקלאופקטים.
בעבודה זו, הדגמנו את המניפולציה של ביטוי הגן Snrpn על ידי שימוש באסטרטגיה הכרוכה בהפחתת הוויסות של ביטויו באמצעות פלסמידים אפיזומליים. פלסמידים אלה אינם משולבים בגנום של התאים, וככל שתאי גזע גזעיים ממשיכים להתרבות במבחנה, הדנ"א שהוחדר ידולל לאחר מכן לאורך חלוקת התא, ובכך יאבד את השפעת המניפולציה הגנטית. לכן, אסטרטגיה זו היא בעלת ערך כדי ללמוד את ההשפעה של שינוי חריף בתקופה קצרה או לתאי תאריך לידה במבחנה. קיימות חלופות מסוימות להערכת השפעה ממושכת יותר של הפרעה גנטית. לדוגמה, מערכת אינטגרטיבית כגון piggyBAC מבוסס טרנספוזון יכול לשמש. מערכת זו מורכבת מהחדרת רצף הקידוד הרצוי הכלול בפלסמיד המוקף ברצפים הניתנים לטרנספוזיה וקו-נוקלאופקט התאים עם פלסמיד המכיל את הרצף עבור האנזים טרנספוזאז41. לחלופין, ניתן להשתמש בטרנספוזונים או במערכות CRISPR/Cas.
פיתוח נוסף של טכנולוגיות הדבקה יהיה צעד חשוב לקראת מבחני תפוקה גבוהה כדי להעריך את תפקידם של גנים שונים על הפיזיולוגיה של תאי גזע עצביים בוגרים. בשילוב עם שיטות טיהור והרחבה מתוחכמות יותר ויותר, מחקרים אלה יאפשרו הבנה של הביולוגיה במבחנה של תאי גזע גזעיים בוגרים והשוואת ההבדלים הביולוגיים בין נוירוספרות צפות לבין NSCs in vivo.