כאן אנו מציגים פרוטוקול לייצור ואימות פונקציונלי של תאי קולטן אנטיגן כימרי (CAR)-T רגישים להיפוקסיה. פרוטוקול זה מציג את הדור מבוסס הלנטיוירוס של תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה ואת אפיונם, כולל אימות של ביטוי CAR תלוי היפוקסיה וציטוטוקסיות סלקטיבית.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
כאן אנו מציגים פרוטוקול לייצור ואימות פונקציונלי של תאי קולטן אנטיגן כימרי (CAR)-T רגישים להיפוקסיה. פרוטוקול זה מציג את הדור מבוסס הלנטיוירוס של תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה ואת אפיונם, כולל אימות של ביטוי CAR תלוי היפוקסיה וציטוטוקסיות סלקטיבית.
מחקרים מקיפים הוכיחו את ההבטחה של טיפול תאי קולטן אנטיגן כימרי T (CAR-T) בטיפול בממאירויות המטולוגיות. עם זאת, הטיפול בגידולים מוצקים נותר מאתגר, כפי שמודגם על ידי חששות הבטיחות המתעוררים כאשר תאי CAR-T תוקפים תאים נורמליים המבטאים את אנטיגני המטרה. חוקרים בחנו גישות שונות לשיפור הסלקטיביות של הגידול בטיפול בתאי CAR-T. אסטרטגיה מייצגת אחת לאורך קו זה היא בניית תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה, אשר מתוכננים על ידי היתוך תחום פירוק תלוי חמצן למויטי CAR ומתוכננים להשיג ביטוי CAR גבוה רק בסביבה היפוקסית - מיקרו-סביבה גידולית (TME). מאמר זה מציג פרוטוקול ליצירת תאי CAR-T כאלה והאפיון התפקודי שלהם, כולל שיטות לניתוח השינויים בביטוי CAR וביכולת ההרג בתגובה לרמות חמצן שונות שנקבעו על ידי תא אינקובטור נייד. תאי ה-CAR-T שנבנו צפויים להדגים ביטוי CAR וציטוטוקסיות באופן רגיש לחמצן, ובכך לתמוך ביכולתם להבחין בין TME היפוקסי לבין רקמות נורמליות נורמוקסיות לצורך הפעלה סלקטיבית.
טיפול בתאי T (CAR-T) קולטן אנטיגן כימרי היווה פריצת דרך משמעותית בטיפול בסרטן. מאז שמנהל המזון והתרופות האמריקאי (FDA) אישר את הטיפול הראשון ב-CAR-T לטיפול בלימפומה מתקדמת/עמידה ובלוקמיה לימפובלסטית חריפה בשנת 2017, 1,2,3, 10 טיפולי CAR-T המכוונים ל-CD19 או אנטיגן להבשלת תאי B (BCMA) קיבלו אישור ברחבי העולם4. עם זאת, למרות מחקר מקיף, שחזור היעילות יוצאת הדופן של טיפול CAR-T בטיפול בממאירויות המטולוגיות נותר מאתגר עבור היישום שלו על גידולים מוצקים 5,6,7,8.
מיקרו-סביבה של גידול מדכא חיסון (TME) היא התורמת העיקרית ליעילות הירודה של CAR-T בסביבת הגידול המוצק. TME מעכב את פעילותם והישרדותם של תאי CAR-T עקב מחסור בחומרים מזינים, היפוקסיה, pH חומצי והצטברות פסולת מטבולית 9,10,11,12. עוינות נוספת מגיעה מחדירת תאים מדכאי חיסון כגון תאי T רגולטוריים (Tregs), תאים מדכאים שמקורם במיאלואידים (MDSCs) ומקרופאגים הקשורים לגידול (TAM), אשר, לצד תאי הגידול, מפרישים ציטוקינים מדכאי חיסון הגורמים לעיכוב נוסף של תאי CAR-T ברגע שהם נכנסים לגידול13,14.
מלבד היעילות הטיפולית הבלתי מספקת, בעיות בטיחות הן עקב אכילס נוסף של תאי CAR-T בהתמודדות עם גידולים מוצקים15,16. החשש הבטיחותי נובע מכך שאף אחד מהאנטיגנים הספציפיים לגידול (TSA) שזוהו עד כה אינו מוגבל אך ורק לתאי הגידול. במילים אחרות, האנטיגנים הקשורים לגידול (TAA) שנבחרו כמטרה של CAR, למרות שהם מראים ביטוי גבוה יותר בתאי הגידול, מבוטאים לעתים קרובות גם על ידי רקמות נורמליות17. לכן, השפעות מחוץ לגידול עלולות להתרחש כתוצאה מהפעלה בלתי צפויה של תאי CAR-T על זיהוי יעיל של רקמות נורמליות, מה שמוביל לתסמונת שחרור ציטוקינים (CRS), תסמונת אנצפלופתיה הקשורה ל-CAR-T (CRES)18, ותוצאות שליליות אחרות19.
אסטרטגיות רבות נחקרו כדי למנוע השפעות כאלה, כולל הפחתת הזיקה של CAR כדי לאפשר לתאי CAR-T להבחין בין תאי גידול לתאים נורמליים בהתבסס על רמות הביטוי של TAA הממוקד; צייד תאי CAR-T במתג כיבוי, כגון גן התאבדות או סמן חיסול כדי לקדם את חיסולם בעת הפעלה בלתי צפויה; חלוקת אותות CD3ζ ואותות קו-סטימולטוריים לשני תאי CAR, שהפעלתם הסימולטנית נדרשת כתוצאה מכך להפעלה יעילה של תאי CAR-T; שימוש במעגל סינתטי מבוסס Notch (synNotch) המגביל את פעילותם של תאי CAR-T לתאי מטרה המבטאים יחד שני TAA שונים; והנדסת תאי CAR-T להשגת רגישות TME על ידי יישום מנגנון לכוונון ביטוי CAR לרמזים סביבתיים משתנים 20,21,22,23,24,25,26.
שיקול מרכזי באפשרות רגישות TME שתוארה לעיל הוא רמת החמצן הנמוכה ב- TME עקב ההתרבות המהירה של תאי הגידול. התאמתם של תאי הגידול להיפוקסיה תלויה בהפעלת גורם היפוקסיה-אינדוקציה-1 (HIF-1), גורם שעתוק הטרודימרי המורכב מתת-יחידה אינדוקטיבית, HIF-1α, ותת-יחידה המבוטאת באופן קונסטיטוטיבי, HIF-1β27. בתנאים נורמוקסיים, חלבון HIF-1α עובר יוביקוויטינציה ופירוק פרוטאזומלי מהיר, תלוי בתחום הפירוק תלוי החמצן שלו (ODD)28. כאשר אספקת החמצן התאית מוגבלת, HIF-1 מתייצב ומפעיל את השעתוק של גני המטרה במורד הזרם שלו על ידי קשירה לאלמנטים של תגובת היפוקסיה (HREs)29. בהתחשב באופי של ODD ו- HRE כאלמנטים רגישים לחמצן, הם נחקרו כדי לממש את הביטוי המותנה של מכוניות בתוך TME30 היפוקסי. כאן, אנו מציגים פרוטוקול המתמקד בשיטות לאפיון פנוטיפי ופונקציונלי של תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה, ולפניו תיאור קצר של תכנון CAR והליכי ההכנה של תאים אלה. פרוטוקול זה מתכוון לספק קו מנחה שימושי לניצול CAR מגיב להיפוקסיה ליצירת תאי CAR-T עם רעילות מחוץ לגידול.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
במחקר זה, HER2-BBz-ODD, מכונית רגישה להיפוקסיה המכוונת ל- HER2 (מזהה גן: 2064) הושוותה למקבילתה הרגילה, HER2-BBz. השרטוטים של שתי המכוניות מודגמות באיור 1A, אשר מראה כי HER2-BBz-ODD נגזר מ-HER2-BBz על-ידי הוספת רצף ה-ODD למסוף C של CD3ξ. בניית וקטורים לנטי-ויראליים המבטאים את שני ה-CARs ויצירת הלנטיוירוס המתאים על ידי טרנספקציית תאים 293T תוארה בעבר31.
1. יצירת תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה על ידי זיהום לנטיויראלי
2. הערכת ביטוי CAR תלוי חמצן בתאי CAR-T באמצעות ציטומטריית זרימה
3. ניתוח תלות בחמצן של ביטוי CAR בתאי Jurkat T מהונדסים על ידי כתם מערבי
4. הערכה חוץ גופית של התלות בחמצן של ציטוטוקסיות המתווכת על ידי תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה
×100 (1)5. איתור הפרשת IL-2 ו-IFN-γ על ידי תאי CAR-T רגישים להיפוקסיה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מיזוג תחום ה-ODD של HIF-1α ל-CAR moiety מייצג אסטרטגיה ראשונית ליצירת CAR רגיש להיפוקסיה. המכונית הממוקדת ב-HER2 הרגישה להיפוקסיה שנותחה במחקר זה, בשם HER2-BBz-ODD, נבנתה באמצעות אסטרטגיה זו על-ידי שילוב רצף ה-ODD ב-HER2-BBz הקונבנציונלי שלה (איור 1A). במחקר זה השתמשנו בהתמרה לנטיויראלית כדי לבטא HER2-BBz-ODD CAR או HER2-BBz CAR, ולאחר מכן בחנו את רגישותם לחמצן בשני סוגי תאים: PBMCs אנושיים ותאי Jurkat T.
הבדיקה הראשונה היא ביטוי של CAR בתנאים היפוקסיים לעומת תנאי...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
חששות בטיחות הם נושאים משמעותיים שיש לטפל בהם כדי שכל טיפול בתאי CAR-T יתקדם לשימוש קליני. ניצול התכונות הייחודיות של תאי הגידול או TME הפך לכיוון מחקר עיקרי המתמקד בפיתוח תאי CAR-T המכוונים לרקמות הגידול באופן סלקטיבי. תכנון CAR-T רגיש להיפוקסיה הוא אסטרטגיה אטרקטיבית בכיוון זה, עם מספר גישות שנבחנות, כולל זו שהוצגה במחקר זה - מיזוג ה- CAR moiety עם תחום חלבון ה- ODD המתרחש באופן טבעי עם חישת היפוקסיה. גישה חלופית כוללת החלפת מקדם מכונן המשמש בדרך כלל להנעת ביטוי CAR באלמנט תגובת היפוקס...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגודי עניינים להצהיר.
עבודה זו נתמכה על ידי מענקים מהתוכנית הלאומית למחקר ופיתוח מפתח של סין (2016YFC1303402), המגה-פרויקט הלאומי על מחלות זיהומיות מרכזיות (2017ZX10202102, 2017ZX10304402-002-007), והתוכנית הכללית של ועדת הבריאות העירונית של שנחאי (201740194).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| צינור צנטריפוגה 1.5 מ"ל | QSP | 509-GRD-Q | Supernatants ותאים cellection פרוטוקול שלב 2,3,4 |
| 10% ExpressCast PAGE | NCM biotech | P2012 | Immunoblotting פרוטוקול שלב 3 |
| 10x PBS | NCM ביוטק | 20220812 | תרבית תאים פרוטוקול שלב 4 |
| 10 מ"ל פיפטה | Yueyibio | YB-25H | צנרת פרוטוקול שלב 1 |
| 10xTRIS-Glycine-SDS מאגר אלקטרופורזה | אפיזים | 3673020 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| צינור צנטריפוגה 15 מ"ל | Thermo Scientific | 339650 | Supernatants and cells cellection פרוטוקול שלב 1 |
| 25 ס"מ2 פרוטוקול EasYFlask | Thermo Scientific | 156367 | תרבית תאים שלב 3,4 |
| 4x חלבון SDS PAGE טעינת מאגר | Takara | 9173 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| צלחות תרבית רקמות עם תחתית שטוחה 6 בארות | Thermo Scientific | 140675 | T Culture פרוטוקול שלב 1 |
| 96 בארות צלחות תרבית רקמה שחורות עם תחתית שטוחה | Greiner | 655090 | בדיקת ציטוטוקסיות פרוטוקול שלב 4 |
| צלחות ELISA 96 בארות | קורנינג | 3590 | פרוטוקול ELISA שלב 5 |
| שייקר צלחות 96 בארות | QILINBEIER | MH-2 | Shake פרוטוקול שלב 4 |
| 96 בארות צלחות תרבית רקמות תחתונות U | Thermo Scientific | 268200 | Supernatants cellection פרוטוקול שלב 4,5 |
| נוגדן נגד FLAG | Sigma | F1804-50UG | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| קרבינול | פרוטוקול Sinopharm | 10010061 | Immunoblotting שלב 3 |
| חממת פחמן דו חמצני | Thermo Scientific | 360 | תרבית תאים פרוטוקול שלב 1,2,3,4 |
| צלחת ספירת תאים | Hausser scientific | 1492 | פרוטוקול ספירת תאים שלב 1,3,4 |
| ערכת IgG של עכבר CELLection Pan Mouse Thermo | Scientific | 11531D | עכבר IgG חרוזים מגנטיים פרוטוקול שלב 1 |
| צנטריפוגה | תרמו מדעית | 75002432 | תרבית תאים פרוטוקול שלב 1,3,4 |
| מערכת הדמיית ג'ל כימילומינסנציה | BIO-RAD | 12003154 | Immunoblotting פרוטוקול שלב 3 |
| תמיסת קובלט כלוריד (0.5 M) | bioleaper | BR4000203 | מצב היפוקסי פרוטוקול שלב 2,3,4 |
| DMEM | Corning | 10-103- | CV פרוטוקול תרבית תאים שלב 4 |
| איזון אלקטרוני | Sartorius | PRACTUM612-1CN | משקל פרוטוקול שלב 5 פרוטוקול |
| FBS | BI | 04-001-1ACS | תרבית תאים שלב 3,4 |
| עכבר GAPDH mAb | ABclonal | AC002 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| מכשיר אלקטרופורזה ג'ל | BIO-RAD | 1645070 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| קוראי מיקרופלייט GloMax | Promega | GM3000 | פרוטוקול שלב 4 פרוטוקול |
| עיזים נגד עכבר IgG (H+L) | פרוטוקול Yeasen | P1126151 | Immunoblotting שלב 3 |
| צנטריפוגה מיקרו-הקפאה במהירות גבוהה | eppendorf | 5810 | פרוטוקול תרבית תאי R שלב 1 |
| IFN-&גמא אנושי; ELISA Set | BD | 555142 | פרוטוקול ELISA שלב 5 פריטים: IFN-&gamma אנושי רקומביננטי; תקן ליופיליזציה, זיהוי נוגדנים ביוטין אנטי אנושי IFN-וגמא; לכידת נוגדנים מטוהרים אנטי אנושיים IFN-&גמא;, מגיב אנזים סטרפטווידין-חזרת פרוקסידאז מצומד (SAv-HRP) |
| אנושי IL-2 ELISA סט | BD | 555190 | ELISA פרוטוקול שלב 5 פריטים: תקן ליופיליזציה אנושי רקומביננטי IL-2, זיהוי נוגדנים ביוטין אנטי אנושי IL-2, לכידת נוגדנים מטוהרים אנטי-אנושיים IL-2, מגיב אנזים סטרפטווידין-חזרת פרוקסידאז מצומד (SAv-HRP) |
| IL-15 | מו"פ D systems | P40933 | פרוטוקול תרבית תאי T שלב 1 |
| IL-21 | נובופרוטאין | GMP-CC45 | פרוטוקול תאי T תרבית שלב 1 |
| IL-7 | מו"פ מערכות D | P13232 | תאי T תרבית פרוטוקול שלב 1 |
| מיקרוסקופ הפוך | פרוטוקול תרבית תאים אולימפוס | CKX41 | תרבית תאים פרוטוקול שלב 1,3,4 |
| פרוטוקול Jurkat | ATCC | TIB-152 | CAR-Jurkat construction שלב 3 פרוטוקול |
| LSRFortessa | LSRFortessa | Flow Cytometry שלב 2 | |
| מערכת | בדיקת לוציפראזPromega | E1501 | לוציפראז מדווח בדיקה פרוטוקול שלב 4 פריטים: מאגר ליזה פסיבי, מצע לוציפראז גחלילית |
| קורא מיקרופלייט | BioTek | HTX | ELISA פרוטוקול שלב 5 |
| נייד CO2/O2/N2 תא חממה | סין מכשיר חדשנות ושות', בע"מ. | Smartor118 | מצב היפוקסי פרוטוקול שלב 2, 3, 4 |
| עכבר אנטי-הקסה היסטידין תג | סיגמא | SAB2702218 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| NcmBlot מאגר העברה מהירה | NCM ביוטק | WB4600 | Immunoblotting |
| NcmECL Ultra | NCM ביוטק | P10300 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 פריטים: NcmECL Ultra Luminol/Enhancer Reagent (A), NcmECL מגיב מי חמצן אולטרה מיוצב (B) |
| צלחות שטוחות 48 בארות מצופות NovoNectin | Novoprotein | GMP-CH38 | תאי CAR-T בנייה פרוטוקול שלב 1 |
| סט טבליות OPD (o-phenylenediamine dihydrochloride) | Sigma | P9187 | מגיב מצע פרוטוקול שלב 5 פריטים: טבלית OPD (רדיד כסף), טבלית מי חמצן אוריאה (רדיד זהב) |
| מצומד PE אנטי-DYKDDDDK | Biolegend | 637310 | פרוטוקול זרימה ציטומטריה שלב 2 |
| פרוטאמין סולפט | Sigma | P3369-1OG | פרוטוקול זיהום לנטי-וירוס שלב 1 |
| סמן חלבון 10 KDA-250 KDa | Epizyme | WJ102 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 |
| עכבר NA/LE מטוהר אנטי-אנושי CD3 | BD | 566685 | תאי T תרבית פרוטוקול שלב 1 |
| עכבר NA/LE מטוהר אנטי-אנושי CD28 | BD | 555725 | תאי T תרבית פרוטוקול שלב 1 |
| פרוטוקול קרום PVDF | Millipore | 168627 | Immunoblotting שלב 3 פרוטוקול |
| RPMI 1640 | Corning | 10-040-CVRC | תרבית תאים שלב 3 |
| אבקת חלב רזה | Yeasen | S9129060 | פרוטוקול Immunoblotting שלב 3 פרוטוקול |
| SKOV3-Luc | ATCC | HTB-77 | בדיקת ציטוטוקסיות שלב 4 פרוטוקול |
| Trypsin-EDTA | NCM biotech | C125C1 | תרבית תאים שלב 4 פרוטוקול |
| 30189328 | סינופארם | Immunoblotting שלב 3 | |
| אמבט מים | keelrein | NB014467 | פרוטוקול חימום שלב 1 |
| X-VIVO 15 | LONZA | 04-418Q | תרבית לימפוציטים ללא סרום בינוני פרוטוקול שלב 1 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.