RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Milad Almasian1, Alireza Saberigarakani1, Xinyuan Zhang1, Brian Lee1, Yichen Ding1,2,3
1Department of Bioengineering,The University of Texas at Dallas, 2Center for Imaging and Surgical Innovation,The University of Texas at Dallas, 3Hamon Center for Regenerative Science and Medicine,UT Southwestern Medical Center
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
הפרוטוקול משתמש במיקרוסקופ מתקדם של יריעות אור יחד עם שיטות מותאמות לניקוי רקמות כדי לחקור מבנים לבביים מורכבים בלבבות מכרסמים, טומן בחובו פוטנציאל גדול להבנת מורפוגנזה לבבית ועיצוב מחדש.
מיקרוסקופ יריעות אור (LSM) ממלא תפקיד מרכזי בהבנת המבנה התלת-ממדי (תלת-ממדי) המורכב של הלב, ומספק תובנות חיוניות לגבי פיזיולוגיה בסיסית של הלב ותגובות פתולוגיות. אנו מתעמקים בזאת בפיתוח ויישום טכניקת LSM כדי להבהיר את המיקרו-ארכיטקטורה של הלב במודלים עכבריים. המתודולוגיה משלבת מערכת LSM מותאמת אישית עם טכניקות ניקוי רקמות, הפחתת פיזור האור בתוך רקמות הלב לצורך הדמיה נפחית. השילוב של LSM קונבנציונלי עם תפירת תמונה וגישות deconvolution multiview מאפשר ללכוד את הלב כולו. כדי להתמודד עם הפשרה המובנית בין רזולוציה צירית לשדה ראייה (FOV), אנו מציגים גם שיטת מיקרוסקופ יריעות אור שנסחף באופן אקסיאלי (ASLM) כדי למזער אור מחוץ למיקוד ולהאיר באופן אחיד את הלב לאורך כיוון ההתפשטות. בינתיים, שיטות ניקוי רקמות כגון iDISCO לשפר את חדירת האור, להקל על הדמיה של מבנים עמוקים ולהבטיח בדיקה מקיפה של שריר הלב לאורך הלב כולו. השילוב של שיטות LSM וניקוי רקמות המוצעות מהווה פלטפורמה מבטיחה לחוקרים בפתרון מבנים לבביים של מכרסמים, טומנת בחובה פוטנציאל גדול להבנת מורפוגנזה לבבית ועיצובה מחדש.
אי ספיקת לב נותרה הגורם המוביל לתמותה ברחבי העולם, בעיקר בשל היעדר יכולת התחדשות של קרדיומיוציטים בוגרים1. הארכיטקטורה המורכבת של הלב ממלאת תפקיד מכריע בתפקודו ומספקת תובנות לגבי תהליכים התפתחותיים. הבנה מעמיקה של מבנה הלב חיונית להבהרת התהליכים הבסיסיים של מורפוגנזה לבבית ועיצוב מחדש בתגובה לאוטם שריר הלב. ההתקדמות האחרונה הוכיחה כי עכברים ילודים יכולים לשחזר את תפקוד הלב לאחר פציעה, בעוד עכברים בוגרים חסרים יכולת התחדשות כזו2. זה מבסס בסיס לחקר רמזים הקשורים לחריגות מבניות ותפקודיות במודלים של עכברים. לשיטות הדמיה מסורתיות, כגון מיקרוסקופיה קונפוקלית, יש מגבלות טכניות, כולל עומק חדירה מוגבל, סכמת סריקה נקודתית איטית ונזקי צילום כתוצאה מחשיפה ממושכת לאור לייזר. אלה מעכבים הדמיה תלת ממדית מקיפה (3D) של הלב השלם. בהקשר זה, מיקרוסקופ גיליון אור (LSM) מתגלה כפתרון רב עוצמה, המציע את היתרונות של הדמיה במהירות גבוהה, נזק מופחת לצילום ויכולות חתך אופטיות יוצאות דופן 3,4,5. התכונות הייחודיות של LSM מציבות אותו כשיטה מבטיחה להתגבר על מגבלות הטכניקות הקונבנציונליות, ומספקות תובנות חסרות תקדיםעל התפתחות הלב ותהליכי שיפוץ 6,7,8.
בפרוטוקול זה, אנו מציגים אסטרטגיית הדמיה המשלבת LSM מתקדם עם גישות מותאמות לניקוי רקמות9, ומאפשרת הדמיה של לבבות עכבר שלמים ללא צורך בתיוג ספציפי ובחתך מכני. אנו מציעים גם כי ניתן לשפר את הדמיית LSM קונבנציונלית באמצעות טכניקות multiview deconvolution10 או מיקרוסקופ גיליון אור (ASLM) 11,12,13,14,15 כדי לשפר את הרזולוציה הצירית. בנוסף, שילוב של תפירת תמונה עם כל אחת מהשיטות הללו יכול להתגבר ביעילות על הפשרה בין רזולוציה מרחבית לשדה ראייה (FOV), ובכך לקדם את ההדמיה של לבבות עכברים בוגרים. השילוב של גישות רבות לניקוי רקמות, כולל שיטות הידרופוביות, הידרופיליות ומבוססות הידרוג'ל, מאפשר חדירת אור עמוקה יותר ללכידת המורפולוגיה של הלב כולו 16,17,18,19.
בעוד שיטות ניקוי מרובות תואמות למערכות LSM הנוכחיות, המטרה היא למזער את פיזור הפוטונים ולהגביר את חדירת האור ברקמות, כמו הלב, על ידי החלפת שומנים בתווך התואם באופן הדוק את מקדם השבירה שלו. iDISCO נבחרה כמייצגת20,21 והותאמה לדימות אוטופלואורסצנטי בפרוטוקול זה הודות לעיבוד המהיר והשקיפות הגבוהה שלה (איור 1A). באופן קולקטיבי, השילוב של גישת LSM המתקדמת עם טכניקות ניקוי רקמות מציע מסגרת מבטיחה לפענוח אנטומיה לבבית מורכבת בלבבות מכרסמים, טומנת בחובה פוטנציאל משמעותי לקידום הבנתנו במורפוגנזה ופתוגנזה של הלב.
פרוטוקולים וניסויים בבעלי חיים אושרו ונערכו תחת פיקוחה של אוניברסיטת טקסס בוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים בדאלאס (IACUC #21-03). במחקר זה נעשה שימוש בעכברי C57BL6, כולל יילודים ביום 1 (P1) שלאחר הלידה ומבוגרים בני 8 שבועות. לא נצפה הבדל בין זכרים לנקבות. כל איסוף הנתונים ועיבוד התמונה לאחר מכן בוצעו באמצעות תוכנות קוד פתוח או פלטפורמות עם רישיונות מחקר או חינוך. המשאבים זמינים מהמחברים על פי בקשה סבירה.
1. הכנת דגימה וניקוי רקמות (6 - 10 ימים)
2. הרכבה לדוגמה (יום אחד)
הערה: במקרה שנעשה שימוש במערכת LSM מסחרית, עקוב אחר הפרוטוקול הספציפי שלה שסופק על ידי החברה כדי לתקן את הלב ולדלג על שלבים 2.1 - 2.9.

3. תפירת תמונה (4-8 שעות)
4. Multiview deconvolution (5 ימים)
5. חומרת מערכת גליונות אור שנסחפה באופן אקסיאלי (יום אחד)
6. סנכרון מערכת גליונות אור שנסחפו באופן אקסיאלי (7 ימים)


LSM הוכח כמטפח מחקרי לב 31,32,33,34,35,36,37 בשל הסיכון המינימלי לנזק לצילום, רזולוציה מרחבית גבוהה וחתך אופטי בניגוד לשיטות הדמיה אופטיות אחרות כגון שדה בהיר וטכניקות סריקה נקודתית 6,8,38,39,40 . לכן, כדי להבין טוב יותר את ארכיטקטורת שריר הלב התלת-ממדית, ביססנו את הפרוטוקול המבוסס על גישות ראשוניות כולל ניקוי iDISCO מותאם, תפירת תמונות, deconvolution multiview ו- ASLM. בעוד שהצגנו תוצאות באמצעות מודלים של עכברים, חשוב לציין שגם חולדות ומודלים אחרים של מכרסמים מתאימים לשיטות המוצעות. פרוטוקול ניקוי הרקמה המותאם מאפשר עיבוד של לב עכבר P1 שקוף תוך 4 ימים ולב עכבר בן 8 שבועות שקוף תוך 7 ימים (איור 1B). צעד זה משמש כנקודת מוצא למזעור בליעת פוטונים ופיזורם בלב שלם. Multiview deconvolution מאפשר שיפור של רזולוציה צירית על ידי מיזוג תמונות מנקודות מבט מרובות למודל יחיד. לאחר הקלטה רציפה של תמונות מ-6 תצוגות של אותו לב, שיטת הדה-קונבולוציה מרובת התצוגות משיגה רזולוציה כמעט איזוטרופית עם רוחב של 4.68 מיקרומטר וצירית של 5.06 מיקרומטר, לאחר 15 שעות של חישוב (איור 8A). כדי לייתר את המורכבות החישובית, התאמנו אישית ASLM מבוסס ETL לתמונה מלבבות עכברים בוגרים ליילודים. שיטה זו מאפשרת לנו לסרוק את שריר הלב באמצעות קרן לייזר ממוקדת היטב, למזער את הרקע הלא ממוקד ולשפר את ניגודיות התמונה בהשוואה לשיטות LSM הקונבנציונליות (איור 8B). עם תכנון ASLM הנוכחי, הרזולוציות הצידיות והציריות הממוצעות של המערכת משיגות 2.18 מיקרומטר ו- 2.88 מיקרומטר, בהתאמה, מה שמאפשר חקירה מעמיקה של טרבקוליציית שריר הלב בחדרים. בנוסף, ניתן להשתמש בתפירת תמונה באופן עצמאי, או בשילוב עם deconvolution multiview או ASLM כדי להרחיב את ה- FOV עבור גדלי דגימה גדולים יותר. שילוב תפירה עם ASLM מאפשר לנו לכסות את כל לב העכבר בן 8 השבועות ברזולוציה אחידה (איור 8C), ומספק פתרון יעיל לחקר חתך הלב כולו.

איור 1: תהליך ניקוי רקמות. (A) השיטה ההידרופובית כוללת התייבשות רקמות, מיצוי שומנים והתאמת אינדקס שבירה באמצעות אתר דיבנזיל (DBE) כממס אורגני. (B) לטבול את הלב בתמיסת 4% פורמלדהיד (PFA) ולייבש אותו עם שיפוע של מתנול ותערובות מים דה-יוניזציה (DI). אקונומיקה של הלב באמצעות 5% H2O2 במתנול ב 4 ° C. מעדנים את הלב עם דיכלורומתאן (DCM) ותמיסת מתנול עד שהדגימה שוקעת לתחתית הצינור. לבסוף, לדגור על הלב ב- DBE על מנת להשיג את מדד השבירה הרצוי. קווי רשת 5 מ"מ. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: סכמטי של מיקרוסקופ יריעות אור שנסחפו באופן אקסיאלי . (A) תא מודפס תלת-ממדי מותאם אישית, (B) מגנט קאמרי, (C) מחזיק מהדק ו-(D) מערכת ASLM. קיצורים: CL: עדשה גלילית; ETL: עדשה אלקטרונית; IL: עדשת תאורה; DL: עדשת זיהוי; FW: גלגל סינון; TL: עדשת צינור. נתון זה שונה מ- Ref16. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: תפירת תמונה ודה-קונבולוציה מרובת תצוגות. (א-ב) תפירת תמונה משמשת לכיסוי כל לבבות העכבר, כאשר לכל אריח יש חפיפה של 10% FOV עם האריחים הסמוכים לו. (C) תבנית תנועה של לב העכבר לתפירת תמונה. (D) חרוזי פלורסנט מודבקים לקצה צינור הזכוכית כדי להקל על רישום התמונה, בעוד הלב ממוקם בתוך צינור הזכוכית המכיל DBE, מה שמאפשר הדמיה בו-זמנית של לב העכבר וחרוזי פלורסנט. (E) דה-קונבולוציה מרובת תצוגות כוללת רכישה של תמונות משש נקודות מבט שונות, שכל אחת מהן אוספת תמונות מכיוונים ייחודיים. (F) נתונים גולמיים של לב עכבר P1 וחרוזים בזוויות שונות של 0°, 60°, 120°, 180°, 240° ו-300°. פסי קנה מידה: 500 מיקרומטר. נתון זה שונהמ-16. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: דיאגרמת בלוקים של מערכת ASLM. שימוש בכרטיס DAQ לסנכרון מצלמת ETL ו-sCMOS. הדיור של מנהל ההתקן ETL נפתח להלחמה של חוטי אות והארקה ל- PCB. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: לוח הבקרה LabView. לוח הבקרה LabVIEW ליצירת טריגרים לסנכרון ETL ופיקסלים מופעלים של מצלמת sCMOS. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: סנכרון המיקוד של גיליון אור עם פיקסלים מופעלים. (A) זיהוי נקודות ההתחלה והסיום של טווח סריקת יריעות האור מושג על-ידי הגדרת המתח המתאים עבור הדק ETL. (B) התוצאה הסינכרונית של חרוזים פלואורסצנטיים ניכרת לאורך האלכסון של התמונה. (ג-ו) הרזולוציה המרחבית הלא אחידה על פני כל ה- FOV נובעת מהפעולה האסינכרונית של ETL עם מצלמת sCMOS. ה-ETL יוזם סריקה (C) מאוחר יותר או (D) מוקדם יותר מהפיקסל שהופעל. (ה-ו) אזור המוקד אינו מקביל לאלכסון של התמונה, דבר המצביע על חוסר תאימות בין מהירויות הסריקה וההפעלה. סריקת ETL (E) מהירה יותר או (F) איטית יותר מטאטוא פיקסלים פעילים ב-sCMOS. סרגל קנה מידה: 200 מיקרומטר. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: פתרון בעיות של ASLM. (A) יריעת האור ממוקמת בדיוק במרחק המוקד של עדשת האיתור. ה-ETL סורק את מוקד גיליון האור לאורך כיוון ההתפשטות תוך סנכרון עם הפיקסל המופעל של חיישן sCMOS. (B) תצוגת XY של חרוזים פלואורסצנטיים כאשר ה-ETL מיושר ומסונכרן כראוי. (ג-ד) תוצאות של חרוזים פלואורסצנטיים במישור המוקד וחוסר מיקוד בתמונות חתך, דבר המצביע על חוסר התאמה בין סריקת ETL והתפשטות לייזר. פסי קנה מידה: 200 מיקרומטר ו-10 מיקרומטר בכניסה. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 8: הדמיה של יריעות אור של לבבות עכברים. (A) תמונה מעובדת בנפח של לב העכבר Multiview deconvolution P1 המדגישה את הטרבקולציה בתוך חלל החדר. (B) תמונות חתך רוחב של לב עכבר בן 8 שבועות שנוצרו על-ידי LSM קונבנציונלי (משמאל) ו-ASLM (מימין). התמונות מוצגות כנתונים גולמיים. (C) שילוב של תפירת תמונה ו-ASLM להדמיית לב עכבר בן 8 שבועות, הכולל 12 אריחים המסודרים ב-3 אריחים אופקית ו-4 אריחים במאונך. סרגל קנה מידה: 500 מיקרומטר. קיצורים: LV: חדר שמאלי, LA: אטריום שמאלי, RV: חדר ימני, ו- RA: אטריום ימני. נתון זה שונה מ- Ref16. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
| פרוצדורה | זמן (לב עכבר P1) | זמן (לב עכבר בן 8 שבועות) | טמפרטורה | |
| תיקון ב-4% PFA | לילה | לילה | 4°C | הכנת דוגמאות |
| יש לשטוף עם 1x PBS | 30 דק' | 30 דק' | RT | |
| יש לשטוף עם 1x PBS | 30 דק' | 30 דק' | RT | |
| יש לשטוף עם 1x PBS | 30 דק' | 30 דק' | RT | |
| הטמעה עם ג'ל אגרוז | 1 שעות | 2 שעות | RT | |
| דגירה ב-20% מתנול/80% מי DI | 1 שעות | 2 שעות | RT | התייבשות |
| דגירה ב-40% מתנול/60% מי DI | 1 שעות | 2 שעות | RT | |
| לדגור ב-60% מתנול/40% מי DI | 1 שעות | 2 שעות | RT | |
| דגירה ב-80% מתנול/20% DI מים | 1 שעות | 2 שעות | RT | |
| לדגור ב-100% מתנול | 1 שעות | 2 שעות | RT | |
| לדגור על מתנול טרי 100% | 1 שעות | 2 שעות | RT | |
| לדגור על מתנול טרי 100% | 10 דק' | 10 דק' | 4°C | דה-פיגמנטציה |
| אקונומיקה עם 5% H2O2/מתנול | לילה | לילה | 4°C | |
| לדגור ב-100% מתנול | 1 שעות | 1 שעות | RT | |
| דליפידט עם 66% DCM/33% מתנול על השייקר | 3 שעות | 3 שעות | RT | דליפידציה |
| לדגור ב-DBE על השייקר | 2 ימים | 5 ימים | RT | התאמת RI |
טבלה 1: שלבי ניקוי רקמות מותאמים אישית להדמיית אוטופלואורסצנטיות.
למחברים אין ניגוד עניינים לחשוף.
הפרוטוקול משתמש במיקרוסקופ מתקדם של יריעות אור יחד עם שיטות מותאמות לניקוי רקמות כדי לחקור מבנים לבביים מורכבים בלבבות מכרסמים, טומן בחובו פוטנציאל גדול להבנת מורפוגנזה לבבית ועיצוב מחדש.
אנו מביעים את תודתנו לקבוצתו של ד"ר אריק אולסון במרכז הרפואי UT Southwestern על שיתוף נדיב של דגמי בעלי החיים. אנו מעריכים את כל ההערות הבונות שסופקו על ידי חברי החממה D ב- UT דאלאס. עבודה זו נתמכה על ידי NIH R00HL148493 (Y.D.), R01HL162635 (Y.D.) ותוכנית UT Dallas STARS (Y.D).
| <חזק>1% אגרוזחזק> | |||
| התכה נמוכה אגרוז | תרמו פישר | 16520050 | |
| מים נטולי יונים | - | ||
| כימיקלים <חזקים>לניקוי רקמות | |||
| 5-Amino-1,3,3-trimethylcyclohexanemethylamine, תערובת של cis ו-trans | Sigma-Aldrich | 118184 | |
| D.E.R.™ 332 | Sigma-Aldrich | 31185 | |
| D.E.R.™ 736 | Sigma-Aldrich | 31191 | |
| Dibenzyl ether (DBE) | Sigma-Aldrich | 33630 | |
| דיכלורומתאן (DCM) | סיגמא-אולדריץ' | 270997 | |
| חרוזי פלואורסצנט | Spherotech | FP-0556-2 | |
| מי חמצן (H2O2) | Sigma-Aldrich | 216736 | |
| מתנול | סיגמא-אולדריץ' | 439193 | |
| פרפורמלדהיד (PFA) | תרמו פישר | 47392 | |
| תמיסת מלח חוצצת פוספט (PBS) | סיגמא-אולדריץ' | 79383 | |
| אשלגן כלורי (KCl) | סיגמא-אולדריץ' | P3911 | |
| <חזק>תוכנה ואלגוריתמיםחזק> | |||
| אמירה | תרמו פישר סיינטיפיק | 2021.2 | |
| BigStitcher | Hö rl et al.22 | ||
| Fiji-ImageJ | Schindelin et al.20 | 1.54f | |
| HCImage Live | Hamamatsu Photonics | 4.6.1.2 | |
| LabVIEW | National Instruments Corporation | 2017 SP1 | |
| רכיבי מפתח של מערכת גיליונות האור המותאמת אישיתחזקה> | |||
| 0.63 - 6.3X זום גוף | אולימפוס | MVX-ZB10 | |
| 10X מטרת תאורה | Nikon | MRH00105 | |
| 1X מטרת זיהוי | Olympus | MV PLAPO 1X/0.25 | |
| 473nm DPSS לייזר | לייזר | טכנולוגיותLRS-0473-PFM-00100-05 | |
| 532nm DPSS לייזר | לייזר טכנולוגיותLRS-0532-PFM-00100-05 | ||
| 589 nm DPSS לייזר | Laserglow Technologies | LRS-0589-GFF-00100-05 | |
| מחבר BNC | מכשיר לאומי | BNC-2110 | |
| עדשה גלילית | Thorlabs | ACY254-050-A | |
| בקר מנוע DC, 4 צירים | Physik Instrumente | C-884.4DC | |
| ETL | Optotune | EL-16-40-TC-VIS-5D-1-C | |
| כבל ETL | Optotune | CAB-6-300 | |
| ETL דרייבר עדשה | Optotune | EL-E-4i | |
| מסנן | Chroma | ET525/30 | |
| מסנן | Chroma | ET585-40 | |
| Chroma | ET645-75 | ||
| גלגל מסנן | מכשיר תריס | LAMBDA 10-B | |
| שלב תרגום ממונע | Physik Instrumente | L-406.20DG10 | |
| שלב תרגום ממונע | Physik Instrumente | L-406.40DG10 | |
| שלב תרגום ממונע | Physik Instrumente | M-403.4PD | |
| NI רב תכליתי I/O | מכשיר לאומי | PCIe-6363 | |
| מצלמת sCMOS | Hamamatsu | C13440-20CU | |
| מנוע צעד | פולולו | 1474 | |
| עדשת צינור | אולימפוס | MVX-TLU |