$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
פרוטוקול זה מפרט שתי מערכות AAV ומודלים של עכברים לחקירת הביטוי החוץ רחמי של Neurod1 בהקשר של מודל שבץ מוחי ET-1 קל-בינוני. חשוב לקחת בחשבון מספר שלבים קריטיים הקשורים לשבץ ET-1 לצורך שחזור ועקביות הפציעה. יש לקדוח בזהירות חורי בור מבלי לנקב את הדורה מאטר כדי למנוע פציעה כירורגית לא מכוונת. חשוב להשתמש בציוני דרך עקביים, במקרה זה ברגמה, כדי להבטיח אזור עניין דומה (קליפת המוח התחושתית-מוטורית במחקר זה). זה חשוב במיוחד עבור מחקרים המשתמשים בהערכות התנהגותיות מכיוון שמיקום הנגע וגודלו ישפיעו על התוצאות התפקודיות 13,22,25,27. והכי חשוב, קצב ההזרקה של ET-1 והלחץ שמפעיל המנתח על המזרק צריכים להיות עקביים לתוצאות הניתנות לשחזור. יש לציין כי מחט המזרק עלולה להיסתם ויש לנקות אותה בין בעלי חיים כדי להבטיח משלוח מדויק של ET-1. במהלך ניתוח תאים של רקמות, אם לא נצפה נגע שבץ מוחי, סביר להניח שהמחט נסתמה במהלך הניתוח. אם הבעיה נמשכת, השג כמות חדשה של אנדותלין-1 מהיצרן, מכיוון שנצפו בעבר בעיות עוצמה תלויות אצווה.
השלבים להליך הכירורגי למתן AAV דומים לזה של פרוטוקול השראת שבץ ET-1. לפיכך, השיקולים הנ"ל הם קריטיים. בנוסף, הטיטר והנפח הנגיפי של AAV חייבים להיות עקביים כדי להבטיח שניתן להשוות את יעילות ההתמרה בין קבוצות. בפרוטוקול זה ניתנו 1 x 109 GC/μL של AAV עבור המחקר החריף ו-1 x10 10 GC/μL של AAV עבור המחקר הכרוני. חיוני לבחור מינון ויראלי נמוך מספיק כדי למזער ביטוי שגוי של מלאכותיות תוך שהוא עדיין גבוה מספיק כדי להבטיח העברת תאים מספקת, מה שמאפשר זיהוי הבדלים בין קבוצות ניסוי. טווח המינון הנגיפי האופטימלי למחקרים כאלה נקבע כ-107-10 10 GC/μL13,24. טיטרים גבוהים יותר של AAV לא רק מביאים לתיוג נרחב של נוירונים בקבוצת הביקורת, אלא גם הוכחו כגורמים לאסטרוציטוזיס, משבשים את מחסום הדם-מוח ומווסתים תגובות דלקתיות28,29. מחקרים שבדקו מתן גורם שעתוק בתיווך ויראלי לאחר שבץ השתמשו באתרי אספקה שונים לזריקות AAV. מחקר אחד תיאר תיוג מוצלח של תאים מתמרים באמצעות הזרקת AAV בודדת לאתר נגע השבץ13. מחקרים אחרים מכוונים לאזור אחד עד שלושה סביב אזור האוטם30. כאן, AAV הועבר בשלושה מקומות, עם זריקה אחת בקואורדינטות לאתר הזרקת ET-1 ו-2 סביב אתר הנגע (זריקה אחת ב-1.0 מ"מ קדמי וזריקה אחת ב-1.0 מ"מ אחורי) במטרה להמיר אסטרוציטים ריאקטיביים בגבול הגליה הפרילזיונלי9. במהלך ניתוח תאים של רקמה, אם לא נצפו תאים פלואורסצנטיים או מעט מאוד (1-10 תאים/חתך), ייתכן שהמחט נסתמה במהלך ההזרקה, או שה-AAV הופשר בהקפאה יותר מדי פעמים, מה שהוביל להשבתת הנגיף.
יעילות ההתמרה נבדקה בזמנים שונים במודל שבץ קל-בינוני, והתוצאות מראות כי הרבה יותר נוירונים מסומנים במוחות שטופלו ב-Neurod1 הן בתקופה התת-חריפה והן בזמנים הכרוניים שלאחר השבץ. העבודה המוצגת כאן היא הראשונה שמדגימה התמרה של Neurod1 בשלב הכרוני שלאחר שבץ מוחי וחושפת נוירונים המבטאים באופן אקטופי את Neurod1 עד 8 שבועות לאחר השבץ. בעוד שהממצאים לפיהם מספר גדל של נוירונים מתמרים נראים במוחות נפגעי שבץ שקיבלו Neurod1 לעומת וקטורי ביקורת עולים בקנה אחד עם Neurod1 הממלא תפקיד בהמרת AtN, פירוש התוצאות התאיות דורש ידע מוצק של מגבלות הפרדיגמה הניסויית. הרוב המכריע של המחקרים שפורסמו החוקרים המרת AtN משתמשים ב-GFAP כמקדם מכיוון ש-GFAP מווסת באסטרוציטים תגובתיים במחלות ניווניות, כולל שבץמוחי 4,31. עם זאת, הוכח כי ביטוי GFAP נמוך מתרחש גם בתאי עצב32. זה עולה בקנה אחד עם הממצאים שדווחו כאן לפיהם אחוז התאים המתמרים בקבוצת הביקורת (Stroke-Cre) הם נוירונים קיימים32. באופן ספציפי, קבוצות הביקורת של Stroke-Cre בפרוטוקול זה הראו תיוג של 18.43 +/- 3.03% ו-53.05 +/- 5.028% של תאי NeuN+Reporter+, המייצג תיוג של נוירונים קיימים, המצביע על ביטוי מונע GFAP בתאי עצב. ואכן, ביטוי ממוקד של Neurod1 תלוי במספר גורמים, כולל טרופיזם ויראלי. הוכח כי AAV5 מתמיר נוירונים ביעילות שונה באזורי מוח שונים, כולל קליפת המוח התחושתית-מוטורית, מה שמצביע על כך שלסרוטיפים של AAV יש טרופיזם תאים אזורי, אשר צריך להילקח בחשבון במחקרים הגורמים לביטוי חוץ רחמי של גורמי שעתוק31,33. זני עכברים יכולים גם להשפיע על התמרת AAV14,34. מחקר שהשווה התמרת AAV בסטריאטום של עכברים מסוג בר (C57BL/6J) ו-FVB/N מצא טרופיזם תאים משתנה ויעילות התמרה בשני הזנים34.
היתרון של מערכת Cre-Flex הוא שניתן להשתמש בה לתיוג ארוך טווח בעכברים מסוג בר, מה שעשוי להפחית את הנושא של ביטוי Cre לא ספציפי הקיים בשורות עכבר Cre-reporter15,35. החיסרון של מערכת Cre-Flex הוא שביטוי טרנסגנים בלתי תלוי ב-Cre עשוי להתרחש עקב 0.1%-0.8% מהחלקיקים הנגיפיים ששילבו מחדש אתרי LoxP במהלך ייצור הנגיף36. ממצאים אלה מדגישים את החשיבות של ניסויי מעקב אחר שושלת, למשל, תיוג מראש של אסטרוציטים לפני מתן AAV באמצעות קו העכבר Aldh1l1-CreERT2, כדי להבטיח שהמרת AtN לא תהיה מוערכת יתר על המידה בעת דיווח מסקנות15. מחקרים הציעו כי הפעלה של מקדם ה-GFAP האנושי (כפי שנעשה בו שימוש במחקרים אלה) באמצעות ויסות ציס על ידי גנים במורד הזרם (כגון Neurod1) עשויה לגרום לביטוי GFAP בנוירונים אנדוגניים, מה שמוביל למספר גבוה יותר של נוירונים מסומנים בקבוצת הטיפול15,32. יחד, מחקרים אלה והממצאים כאן מדגישים את החשיבות של ניסויי מעקב אחר שושלת, למשל, תיוג מראש של אסטרוציטים או נוירונים לפני מתן AAV, כדי להבדיל בין נוירונים קיימים ואנדוגניים במהלך הניתוח15.
בבחינת הצעדים הבאים שיכולים להפחית את ההתמרה העצבית, סרוטיפים שונים של AAV ו/או שימוש במקדם פחות מופקר ספציפי לאסטרוציטים יהיו שימושיים19. מספר הולך וגדל של דיווחים המתארים הטרוגניות של אסטרוציטים עשוי להשפיע עוד יותר על ספציפיות ביטוי הגנים אם תת-אוכלוסיות שונות של אסטרוציטים רגישות יותר להמרת AtN באופן כללי 37,38,39,40.
גיל בעלי החיים המשמשים במודלים פרה-קליניים של פציעה או מחלה הוא גם שיקול חשוב שעשוי להציג תוצאות משתנות. לדוגמה, במקרה של נוירוטראומה, הגיל יכול להשפיע על תגובתיות האסטרוציטים, מה שישפיע על תוצאות המחקר עבור המרת AtN41. בנוסף, קווי דיווח הניתנים להשראה יכולים לאבד את ספציפיות הביטוי לאורך זמן, מה שיכול להשפיע על מדדי התוצאה42. עד כה, תכנות מחדש בבעלי חיים מבוגרים לא נחקר באופן מקיף43.
הפרוטוקול מתאר מתן AAV בשני שלבים לאחר שבץ מוחי: (1) השלב התת-חריף (לאחר 7 ימים) ו-(2) השלב הכרוני (לאחר 21 יום) לאחר שבץ איסכמי. ביטוי חוץ רחמי של Neurod1 במודל שבץ כרוני לא נבדק; לפיכך, לתצפית כי הרבה יותר נוירונים מסומנים בשלב מאוחר זה יש השלכות חשובות על מחקרים עתידיים שמטרתם לקדם התאוששות משבץ מוחי בשבץ כרוני. מחקרים הבוחנים את הפוטנציאל לביטוי חוץ רחמי של Neurod1 כדי לשפר את תוצאות השבץ יצטרכו לשלב הערכות התנהגותיות, שכן תוצאות תפקודיות לאחר שבץ מוחי הן המדדים הרלוונטיים ביותר מבחינה קלינית להצלחה להתערבות טיפולית 13,22,25,27.
נכון לעכשיו אין טיפולים זמינים לחולים הסובלים ממוגבלויות הנגרמות משבץ מוחי בשלבים התת-חריפים והכרוניים שלאחר השבץ, למעט שיקום, שיש לו תועלת מוגבלת. ביטוי מאולץ של גנים נוירוגניים bHLH בגליה הוכח כמשפר את התוצאות התפקודיות לאחר שבץמוחי 22,30. הממצאים עולים בקנה אחד עם מחקרי תכנות מחדש של AtN המראים כי הביטוי החוץ רחמי של Neurod1 מגביר את ההתמרה העצבית ב-3 ו-7 שבועות לאחר מתן AAV בהשוואה לעכברים שקיבלו את וקטור הביקורת. והכי חשוב, מספר מאמרים תיארו המלצות לבקרות מחקר, עיצוב ופרשנויות בתחום התכנות מחדש של AtN 17,18,19,22. לשם כך, פרוטוקול זה תיאר מערכות AAV ומודלים של עכברים לביטוי חוץ רחמי של גורמי שעתוק לאחר שבץ מוחי, שניתן להשתמש בהם כדי ליידע ולקדם חקירות נוספות על המנגנונים התאיים העומדים בבסיס התצפיות.