כאן אנו מציגים פרוטוקול לבניית מערכת איבר-על-שבב (OOC) שנועדה לחקות כריתת ריאות. מערכת זו חוקרת את המתאם הפוטנציאלי בין פגיעה בגליקוקליקס לסיבוכים לאחר כריתת ריאות.
מאמר שיטה
כאן אנו מציגים פרוטוקול לבניית מערכת איבר-על-שבב (OOC) שנועדה לחקות כריתת ריאות. מערכת זו חוקרת את המתאם הפוטנציאלי בין פגיעה בגליקוקליקס לסיבוכים לאחר כריתת ריאות.
גליקוקליקס אנדותל (GCX), שכבה עשירה בפחמימות המצפה את פני השטח הלומינליים של תאי אנדותל, ממלאת תפקיד מרכזי בוויסות התגובות התאיות לגירויים. הוא מורכב מחלבונים טרנסממברניים המשמשים כמתמרים מכניים לתגובות תאיות. בעוד שהוא שומר באופן טבעי על מבנהו ויציבותו בתנאים הומאוסטטיים, חשיפה למתח גזירה גבוה עלולה לגרום לנזק עם השלכות רבות. השפעות כלליות של מתח גזירה על תאי אנדותל נחקרו, אך ההיקף וההשפעה של מתח גזירה על מערכות כלי הדם, במיוחד לאחר כריתת ריאות, לא נחקרו היטב. כדי לחקור זאת, ננקטה גישה מקיפה, הכוללת יצירת מודל CAD של כלי דם ריאתיים לפני ואחרי כריתת ריאות. תוך שימוש בהדמיית נוזלים חישובית, אזורי מפתח של מתח ולחץ גזירה מוגברים זוהו ושוכפלו במערכת איבר על שבב (OOC). תאי אנדותל מיקרו-וסקולריים של ריאות אנושיות (HLMVECs) נזרעו על תבנית בצורת החלקים שנבחרו כדי לאפיין את ההשפעות של מתח גזירה מוגבר במבחנה. לאחר ניסויים, HLMVECs עברו צביעה חיסונית כדי להעריך באופן איכותי את בריאות GCX תחת מתחים רגילים ומוגברים הנגרמים על ידי כריתת ריאות. השילוב של מודלים חישוביים וניתוח ניסיוני משפר את ההבנה שלנו כיצד שינויים במתח הגזירה משפיעים על GCX, ומבהיר את השפעותיהם על תפקוד כלי הדם וסיבוכים לאחר הניתוח.
כריתת ריאות היא התערבות כירורגית פולשנית ובעלת סיכון גבוה המבוצעת לחילוץ הריאה הימנית או השמאלית1. הליך זה משמש בדרך כלל כאופציה טיפולית למחלות קשות שונות כגון סרטן ריאות, שחפת ריאתית ופציעות ריאה טראומטיות2. בעוד שההליך מבטיח, הוא מהווה סיכונים משמעותיים, המודגשים על ידי שיעורים מוגברים של סיבוכים לאחר הניתוח החל מהפרעות קצב ועד בצקות ריאות1.
לכריתת ריאות יש השפעה עמוקה על הדינמיקה הקרדיווסקולרית על ידי הפניית כל תפוקת הלב של הלב לריאה הנותרת3. ידוע כי ניתוב מחדש זה של זרימת הדם מגביר את הלחץ ואת מתחי הגזירה בתוך כלי הדם הריאתיים הנותרים4. עם השינויים העצומים הללו בדפוסי זרימת הדם, הגליקוקליקס האנדותל (GCX) ממלא תפקיד מרכזי בחישת השינויים הללו בדפוסי זרימת הדם5.
ה-GCX היא שכבה דמוית ג'ל המווסתת את הפעילות הביוכימית בתגובה לשינויים בסביבתה 6,7. הוכח כי ביטויו עולה עם חשיפה ממושכת לזרימה אחידה ויורד עם חשיפה לזרימה מופרעת בהשוואה לתרבית סטטית 8,9. ה-GCX מציג עובי משתנה הנע בין 0.1-1 מיקרומטר על פני כל כלי הדם ומתפקד כשכבת מכני-טרנסדוקציה חיונית המצפה את תאי האנדותל של כלי הדם10. הרשת מורכבת משכבה צפופה של סוכרים, שומנים וחלבונים, כפי שמוצג באיור 1. סוכרים אלו נקשרים ליצירת גליקנים, שיכולים להתקיים בחופשיות בזרם הדם או מחוברים לחלבונים או לשומנים, וכתוצאה מכך נוצרים פרוטאוגליקנים, גליקופרוטאינים או גליקוליפידים 7,11. פרוטאוגליקנים מורכבים משרשראות גליקוזאמינוגליקן (GAG), הנקשרות לקרום התא באמצעות חלבוני פלזמה או קולטנים. GAGs אלה כוללים הפראן סולפט (HS), חומצה היאלורונית (HA), כונדרואיטין סולפט (CS), דרמטן סולפט וקראטן סולפט12. הפראן סולפט הוא ה-GAG השולט, ומהווה למעלה מ-50% מכלל ה-GAGs המצויים ב-GCX. שרשראות צד אלו יכולות להתחבר לחלבוני ליבה משובצים, הכוללים גליפיקנים (מעוגנים על ידי גליקוזילפוספטידילינוזיטול) וסינדקנים (עם תחום משתרע על פני הממברנה), יחד עם CD44 (קולטן הידבקות פני השטח). הקומפלקסים שתוארו לעיל ממלאים תפקיד מכריע בוויסות גורמי גדילה, תגובות אנטי דלקתיות, הקלה על הרחבת כלי הדם ושליטה בחדירות כלי הדם13.

איור 1: דיאגרמת רכיבי GCX. סכמטי המייצג את מרכיבי הגליקוקליקס האנדותל. סכימה זו מציגה את הגליקוקליקס האפיקלי, שנמצא על לומן הכלי, ומראה את הפרוטאוגליקנים והגליקופרוטאינים הקשורים לממברנה. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
למרות שהקשר המדויק בין כריתת ריאות לנזק GCX אינו נחקר היטב, קיים מתאם סביר בין דפוסי זרימת הדם המשתנים הנגרמים על ידי כריתת ריאות לבין שלמות ה-GCX. ידוע כי הפרעה בזרימת הדם בכלי הדם גורמת נזק ל-GCX6. שיערנו כי הפרעה מוגברת בזרימה ושינויים במתח הגזירה בכלי הדם הנותרים לאחר כריתת ריאות עלולים לגרום נזק ל-GCX לאורך זמן. הידרדרות מואצת זו עלולה לזרז סיבוכים ותחלואה לאחר הניתוח, ובכך להגדיל את הסיכונים הגלומים בבריאותו הכללית של המטופל13.
פרוטוקול זה נועד לדגמן את כלי הדם הריאתיים לאחר כריתת ריאות, בהתאם להליך הכללי המתואר באיור 2. סימולציות נוזלים נערכו על מודל תכנון בעזרת מחשב המשחזר כלי דם ריאתיים אנושיים עם ובלי כריתת ריאות. המודלים של כריתת ריאות נוצרו על ידי תכנון כלי דם ריאתיים תלת מימדיים בתוכנת מידול תלת מימדית, בהתבסס על ממדים שנגזרו מסריקות CT ונתוני ספרות, ולאחר מכן פישוטם עוד יותר עבור סימולציות זרימה בתוכנת דינמיקת נוזלים חישובית (CFD). הסימולציות זיהו תחומי עניין ספציפיים, שנבחרו לפי אזורים שבהם מתח הגזירה הוגבר במודלים של כריתת ריאות בהשוואה לביקורת. תחומי עניין אלה נבחרו לשכפול לבניית מודל במבחנה . המודל במבחנה השתמש בעיצוב תא נוזלי כדי לדמות חלקים מרובים של כלי דם עם גיאומטריה רגילה וגיאומטריית כריתת ריאות כדי לדמות את ההבדל בתנאי הזרימה.
תאי אנדותל מיקרו-וסקולריים של ריאות אנושיות (HLMVECs) תורבבו על מצעי פולידימתילסילוקסן מצופים פיברונקטין (PDMS), שעוצבו כדי לחקות אזור התפצלות נבחר. אמצעי תרבית תאי אנדותל מיקרו-וסקולרי הוחדרו דרך המערכת באמצעות משאבה פריסטלטית. לבסוף, התאים וה-GCX תוקנו, הוכתמו במערכת החיסון עם נוגדן מכתים GCX, והודגמו באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי כדי להעריך את מצבם לאחר חשיפה לזרימת נוזלים. ניתן למצוא ציר זמן כללי של הפרוטוקול בטבלה 1.

איור 2: רצף פיתוח OOC. רצף של פיתוח מערכת OOC חדשה לחקר ההשפעות של כריתת ריאות ריאות (1) סריקת CT שנוצרה מכלי דם ריאתיים אנושיים. (2) גיאומטריית סריקת CT המשמשת לזיהוי אזורי עניין עבור מודל CAD תלת מימדי. (3) סימולציות זרימת נוזלים לקביעת גיאומטריות מעניינות למודל במבחנה . (4) תבנית PDMS מעוצבת המכילה תחומי עניין מתוצאות סימולציה (5) עובש מוכנס למארז אקרילי לתיקון תבנית לזילוף (6) הגדרת תא זרימה הושלמה (7) הגדרת תא זרימה מלאה הועברה לחממה (8) תמונות Brightfield ופלורסנט שצולמו לאחר חשיפה למתח גזירה. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
טבלה 1: ציר זמן כללי לפרוטוקול. רצף כללי של ביצוע שלבים בתוך הפרוטוקול עם משך ממוצע (h) של כל שלב. אנא לחץ כאן להורדת טבלה זו.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחקר זה השתמש בנתוני הדמיה של טומוגרפיה ממוחשבת (CT) מספרות קודמת14 שנאספו בהתאם לסטנדרטים האתיים המוסדיים והפדרליים. כל נתוני ההדמיה שהוזכרו קיבלו הסכמה מדעת מהמשתתפים, לאחר אישור מועצת הביקורת המוסדית (IRB) כדי להבטיח הגנה על זכויות המשתתפים ופרטיותם.
1. מידול כלי דם ריאתיים בתוכנת CAD
2. סימולציה של זרימת נוזלים
הערה: שלב זה מועיל באיתור אזורים של מתח גזירה שונה לאחר כריתת ריאות כדי לבחור את גיאומטריית כלי הדם לשכפול עבור מערכת המבחנה . בנוסף, רישיון התוכנה חייב לתמוך במודול הייבוא.
3. הכנת תבניות PDMS

איור 3: שרטוט CAD תלת-ממדי של כלי דם בקרה. מידות, במ"מ, של מודל כלי הדם הבקרה בתצוגה עליונה ובמבט מהצד. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: ציור CAD תלת מימדי של כלי דם לכריתת ריאות. מידות, במ"מ, של מודל כלי הדם לכריתת ריאות בתצוגה עליונה ובמבט מהצד. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: יצירת תבניות PDMS. יצירת תבניות PDMS. (A) תבניות PLA מודפסות בתלת-ממד לניסויי בקרה (כתום) וכריתת ריאות (ירוק). (B) משקל שקילה עם חומרים לייצור PDMS. (ג) יציקת תערובת ה-PDMS (בסיס 10:1 + חומר ריפוי) לתוך התבניות המודפסות בתלת מימד. (D) הסרת גז PDMS בתא ואקום. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
4. תרבית תאים וזריעה


איור 6: הצמדת תבניות PDMS ללוחות. שלבים בסיסיים בהצמדת כלי הדם PDMS ללוחות תרבית תאים. (A) חומרים הנדרשים להצבת חצאי כלי דם PDMS בלוחות תרבית. (B) שתי חתיכות של סרט דבק דו-צדדי מונחות באלכסון בכל צלחת תרבית סטרילית. (C) חצאי כלי דם PDMS המותקנים על גבי הדבק הדו-צדדי. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: זריעת HLMVECs לתוך תבניות PDMS. שלבים לזריעת HLMVECs בכלי דם PDMS. (A) מלאו את כלי הדם 150-300 מיקרוליטר ב-20 מיקרוגרם/מ"ל פיברונקטין. (B) שאפו עודפי פיברונקטין באמצעות טכניקת ברז ההטיה. (C) חבר את הקצוות של מחצית כלי הדם PDMS עם תקעים מודפסים בתלת מימד. (D) זרע 500-600K תאים במדיה של 300 מיקרוליטר לכל מחצית כלי דם. (E) הניחו חצאי PDMS באינקובטור למשך 1-2 שעות כדי להקל על חיבור התאים. (F) כסה את חצאי ה-PDMS במדיה ובתקעים להסרת תקעים. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
5. הרכבה והפעלה של מערכת הזרימה

איור 8: בניית שבב הזרימה. בניית שבב הזרימה. (A) שאיבה של מדיה מלוח תרבית התאים. (B) PDMS יורד בחצי לאחר שאיפת התקשורת. (ג) הסר חצאי PDMS מהצלחת עם חומרים אחרים הדרושים לבניית השבב (תקע, מסנן מזרק, חלקי צינורות בגודל 1/2 אינץ', איטום סיליקון, ברגים פי 10 ובלוקים אקריליים). (ד) הנח את חצאי ה-PDMS בבלוקים האקריליים ומרח איטום סיליקון על המקומות המסומנים באדום. (ה) הנח את הצינור בחיתוכים המתאימים. (F) חבר את חצאי תא הזרימה וחבר את התקע ומסנן המזרק. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 9: הגדרת מערכת זרימה. הגדרת מערכת הזרימה. מערכת הזרימה השלמה בנויה באמצעות צינורות, מחברי צינורות, משאבה פריסטלטית, מאגר מזרק, מעמד תמיכה ושבב הזרימה. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 10: תחול מערכת זרימה. תחול מערכת הזרימה במדיה. (א) הגדרה פשוטה של מערכת הזרימה ללא מדיה. (ב) פקק הגומי מוסר ממאגר המזרק, והמדיה מתווספת ברציפות עד למילוי הצינור ויש 20-30 מ"ל של מדיה עודפת במאגר. (ג) מערכת זרימה מוכנה עם מדיה HLMVEC. נוצר עם BioRender.com אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
6. תיקון ומכתים
7. הדמיה
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
התוצאות ממחקר המצב היציב של זרימה למינרית של סימולציה נוזלית הראו עלייה במתח הגזירה בהתפצלויות מסוימות במודלים של כריתת ריאות בהשוואה למודל הבקרה, המוצג באיור 11. בשלב 2.8 של הפרוטוקול, האזורים האדומים מציינים אזורים של מתח גזירה גבוה, בעוד שהאזורים הכחולים מראים אזורים של מתח גזירה נמוך.

איור 11: ת...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מודלים וסקולריים הם תחום חדש וחשוב לחקירה. יצירה מוצלחת של מודל כלי דם מדויק טומנת בחובה הבטחה גדולה לקידום תחום הנדסת הרקמות ופיתוח תרופות. מאמר זה מתאר שיטה חדשה ליצירת מערכת כלי דם OOC שניתן להשתמש בה כדי לחקות כריתת ריאות או כל מערכת כלי דם או גיאומטריה אחרת כדי לחקור קשר פוטנציאלי בין ליקוי GCX לסיבוכים לאחר כריתת ריאות. בקנה מידה רחב יותר, מתודולוגיה זו יכולה להיות ישימה גם לחיקוי מערכות כלי דם אחרות על ידי התאמת הגיאומטריה או מצבי מחלה אחרים, כגון טרשת עורקים או מפרצת.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים שאין ניגודי אינטרסים.
המחברים מבקשים להביע את תודתנו העמוקה למחלקה להנדסה ביו-רפואית של המכון הפוליטכני וורצ'סטר על תמיכתם והדרכתם. ברצוננו להודות במיוחד למייגן אוולט, ג'ון מרטל וסודיש ונגאט על המאמצים המשותפים והרעיונות החדשניים ששיפרו מאוד את האיכות והכדאיות של מחקר זה. בנוסף, ברצוננו להודות לסמנתה קוקיארו ולאודיה רטאן על תרומתם במעבדה ועל התמיכה והסיוע החיוניים שלהם.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| #8-32 x 3/4 אינץ' בורג מכונה מצופה אבץ עם ראש עגול משולב (8 חבילות) | אוורבילט | 204274613 | - |
| 0.25% EDTA-טריפסין | תרמו-פישר סיינטיפיק | 25200056 | - |
| צינורות צנטריפוגה פוליפרופילן סטריליים חרוטיים 15 מ"ל | תרמו סיינטיפיק | 12-565-269 | - |
| צלחת 35x10 מ"מ, Nunclon Delta | תרמו סיינטיפיק | 153066 | - |
| צינורות צנטריפוגה פוליפרופילן סטריליים חרוטיים 50 מ"ל | תרמו סיינטיפיק | 12-565-271 | - |
| פקקי גומי שונים | פישרברנד | 14-132 | |
| צלוחיות מטופלות בתרבית תאים BioLite (25 ס"מ^2) | תרמו סיינטיפיק | 12-556-009 | - |
| צלוחיות שטופלו בתרבית תאים BioLite (75 ס"מ^2) | תרמו סיינטיפיק | 12-556-010 | - |
| COMSOL מולטיפיזיקה | COMSOL | לא ישים | - |
| דבק דו צדדי | 3 דקות | 16758005 | - |
| זכוכית כיסוי מדעית של אפרדיה ריצ'רד-אלן | תרמו סיינטיפיק | 22-050-218 | - |
| סרום בקר עוברי | תרמו-פישר סיינטיפיק | A5256701 | - |
| פיברונקטין | תרמו-פישר סיינטיפיק | 33016015 | 20 μ דילול גרם/מ"ל |
| אמבטיות מים בקרה דיגיטלית של Fisherbrand Isotemp: דגם 210 | פישרברנד | 15-462-10ש | - |
| מזרק סטרילי פישרברנד (60 מ"ל) | פישרברנד | 14-955-461 | - |
| תאי אנדותל מיקרו-וסקולריים של ריאות אנושיות | סיגמא אולדריץ' | 540-05א | - |
| מיקרוסקופ פלורסנט Keyence BZX810 | קיינס | לא ישים | - |
| ערכת אלסטומטר סיליקון Krayden Dow Sylgard 184. שקוף, (1.1 ליברות) | דאו | 4019862 | - |
| יריעת אקריליק יצוקה של מרגה סיפטה בעובי 1/2 אינץ', 48x96 אינץ' | מרגה צ'יפטה | לא ישים | - |
| ראש משאבה Masterflex L/S Easy-Load II | מאסטרפלקס | 77200-50 | |
| צינורות משאבה מדויקים של Masterflex L/S, סיליקון מרפא פלטינה, L/S 16; 25 רגל | מאסטרפלקס | 96410-16 | - |
| משאבה פריסטלטית סטנדרטית Masterflex L/S | מאסטרפלקס | 07522-20 | |
| מיקרופיפטה 0.2 עד 2 μ L | פישרברנד | FBE00002 | - |
| מיקרופיפטה 10 עד 100 μ L | פישרברנד | FBE00100 | - |
| מיקרופיפטה 100 עד 1000 μ L | פישרברנד | FBE01000 | - |
| מיקרופיפטה 5 עד 50 μ L | פישרברנד | FBE00050 | - |
| מדיום גידול תאי אנדותל מיקרו-וסקולרי (500 מ"ל) | סיגמא - אולדריץ' | 111-500 | - |
| מסנני מזרק סטריליים של Nalgene | תרמו סיינטיפיק | 725-2520 | - |
| מיקרוסקופ פלואורסצנטי Nikon Eclipse TS-100 | ניקון | NI-TS100 | |
| תמיסת מלח עם חומצת פוספט (DPBS, 10X), הנוסחה של Dulbecco | תרמו סיינטיפיק | J61917. K3 | - |
| Prusament PLA פרוסה גלקסי שחור 1 ק"ג | פרוסה | PRM-PLA-GLX-1000 | - |
| מיקרוסקופ היברידי מורד, זקוף והפוך, גלה את אקו | הד | 76376-746 | - |
| איטום סיליקון | לוקטיט | 908570 | - |
| סולידוורקס | דאסו סיסטמס | לא ישים | |
| צנרת סרולוגית חד פעמית מפוליסטירן סטרילי עם פס זכוכית מגדלת (10 מ"ל) | פישרברנד | 13-678-11E | - |
| צנרת סרולוגית חד פעמית מפוליסטירן סטרילי עם פס זכוכית מגדלת (25 מ"ל) | פישרברנד | 13-678-11 | - |
| צנרת סרולוגית חד פעמית מפוליסטירן סטרילי עם פס זכוכית מגדלת (50 מ"ל) | פישרברנד | 13-678-11ו | - |
| צנרת סרולוגית חד פעמית מפוליסטירן סטרילי עם פס זכוכית מגדלת (5 מ"ל) | פישרברנד | 13-678-11ד | - |
| סטרפטווידין, אלקסה פלואור 488 מצומד | Invitrogen | S32354 | |
| סטרפטווידין, אלקסה פלואור 488 מצומד | Invitrogen | S32354 | - |
| מאגר מזרקים | ב.ד. | 300865 | |
| Thermo Scientific Alfa Aesar 1LT אלבומין, בקר, Fraction V, 35% סולן., דרגת ריאגנט, ללא חומצות שומן, עם אזיד כחומר משמר | תרמו סיינטיפיק | N12H004 | - |
| מחברי צינורות | פישרברנד | 01-000-161 | - |
| מדיום הרכבה VECTASHIELD Antifade עם DAPI | וקטשילד | H-1200-10 | - |
| חממת VWR מעטפת מים CO2 | אוונטאר | 10810-744 | - |
| נוגדן ביוטיניל WGA | וקטור | ב-1025 | - |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה