מדריך זה למתחילים מציג פרוטוקול כללי להכנת שלפוחיות ענק חד-פעמיות (GUVs) באמצעות שיטת העברת טיפות, דן בשלבים הקריטיים ומספק תובנות שיעזרו להתאמות אפשריות הנדרשות ליישומים שונים, כולל ביולוגיה סינתטית ומיקרו-רובוטיקה.
מאמר שיטה
מדריך זה למתחילים מציג פרוטוקול כללי להכנת שלפוחיות ענק חד-פעמיות (GUVs) באמצעות שיטת העברת טיפות, דן בשלבים הקריטיים ומספק תובנות שיעזרו להתאמות אפשריות הנדרשות ליישומים שונים, כולל ביולוגיה סינתטית ומיקרו-רובוטיקה.
במהלך שני העשורים האחרונים, שיטת העברת הטיפות, הידועה גם בשם אמולסיה הפוכה, אמולסיה כפולה, העברת פאזה או העברת אמולסיה, הוכיחה את עצמה כמועילה להכנת שלפוחיות ענק חד-צדדיות (GUVs) ובמיוחד להעמסתן במטענים שונים, ובכך ממלאת תפקיד מכריע בביולוגיה סינתטית. בגלל יעילות האנקפסולציה ופשטות הביצוע, נעשה בו שימוש נרחב לפיתוח תאים מלאכותיים. שונות גדולה במספר פרמטרים נצפתה בספרות, מה שמוביל לתוצאות משתנות ביותר. זה נובע בחלקו מההתאמות הנדרשות לצרכים וליישומים שונים של שיטה רב-תכליתית זו, אך זה עשוי להיות מבלבל עבור חוקרים שניגשים לטכניקה זו בפעם הראשונה.
כדי לספק למתחילים הבנה בסיסית של השיטה ותפקידם של פרמטרים קריטיים, מוצג פרוטוקול לצד רמזים על העקרונות הפיזיקוכימיים הבסיסיים העומדים בבסיס היווצרות GUV באמצעות העברת טיפות. מדריך צעד אחר צעד זה להכנת GUVs כולל אפוא שיקולים והצעות מעשיות המבוססות על ספרות וניסיון ישיר.
בהתחשב במקורות אפשריים לשונות, כמה היבטים מזוהים כקריטיים: הרגישות של פוספוליפידים לאור, חמצון והידרוליזה; בחירת השמן להמסת פוספוליפידים (תמיסת השומנים או LS); והתאוששות של GUVs לאחר צנטריפוגה. מוצעים אמצעים חסכוניים כדי למזער את ההפרעות של חמצן ולחות באטמוספירה. כדי לסייע בזיהוי שילובים מתאימים של שמן ופוספוליפידים, הפרוטוקול הכללי משלים עם דיון על התכונות הפיזיקוכימיות הרלוונטיות של ה-LS. לבסוף, כדי להימנע מהליכים לא מעשיים, מוצעת שיטה פשוטה ובטוחה להסיר לחלוטין את שלב השמן בבת אחת ולשחזר פיזור GUV נקי. אמצעים אלה מאיצים את יישום ההתאמות להרכבי GUV חדשים, ועשויים להרחיב את אימוצם בביולוגיה סינתטית ובתחומים שכנים, כולל מיקרו-רובוטיקה.
ביישום טכניקה שתוארה קודם לכן לייצור ליפוזומים1, Pautot et al. הקימו פרוטוקול לייצור שלפוחיות ליפידים בקוטרשנע בין 0.1 ל-1 מיקרומטר בקוטר 2. שיטת העברת הטיפות הוכחה במהירות כיעילה בייצור שלפוחיות גדולות עוד יותר, (קוטר העולה על 1 מיקרומטר)3, וצברה פופולריות הולכת וגוברת בשל פשטות הביצוע ויעילות האנקפסולציה הגבוהה. ואכן, בהשוואה לשיטות נפיחות (כגון נפיחות ג'ל או אלקטרופורמציה), פרוטוקול זה מפחית את נפח תמיסת המטען הנדרשת ליצירת מספר דומה של שלפוחיות והפסולת הנלווית4. ניתן להרכיב GUVs מממשקי נוזלים בשיטות חלופיות עם יעילות אנקפסולציה דומה. עם זאת, בהשוואה לאלה המבוססים על שבבים מיקרופלואידיים 5,6 או אנקפסולציה חוצת ממשק טיפות רציפה (cDICE)7, העברת הטיפות מציעה את ההתקנה הפשוטה ביותר במחיר סביר בכל מעבדה עם ציוד בסיסי. יתר על כן, שיטות מיקרופלואידיות עלולות להוביל ל-GUVs עם תכלילי שמן לא רצויים בממברנה. מסיבות אלה, העברת הטיפות הייתה השיטה המועדפת להעמסת GUVs עם מטענים יקרי ערך בתחומי התאים המלאכותיים 3,8,9,10 ולאחרונה, מיקרו-רובוטיקה 11,12.
השיטה מבוססת על יצירת עלוני ממברנות באמצעות ייצוב ממשקי מים/שמן בתיווך פוספוליפידים. ראשית, פוספוליפידים מומסים בשמן (תמיסת שומנים, LS), ואז מכינים תחליב מים בשמן עם התמיסה המימית המכילה את מטען ה-GUV הרצוי (תמיסה פנימית, IS) ב-LS השומני. לאחר מכן האמולסיה מועברת לצינור שבו תמיסה מימית אחרת (הנקראת תמיסה חיצונית, OS) אוזנה בעבר עם LS ליצירת ממשק מים-שמן. GUVs נוצרים כאשר טיפות מים נאלצות לחצות ממשק OS/LS זה על ידי צנטריפוגה: העלון הפנימי של GUVs נוצר על פני השטח של טיפות IS, בעוד שהעלון החיצוני נוצר בין OS ל-LS (איור 1).
גרסאות פרוטוקול רבות תוארו עם פרמטרים המותאמים בהתאם לצרכי הניסוי המותנים. ניסיון נרחב ראשון לייעל את התהליך תואר על ידי Moga et al.13, בעוד ש-Zhang et al. אספו את רוב הדוגמאות הרלוונטיות בסקירה שנערכה לאחרונה14. למרות הפרמטרים הרבים המתוארים המשפיעים על הפרוטוקול, אין אינדיקציה כיצד ניתן לבצע תהליך אופטימיזציה עבור פורמולציה חדשה של GUV, וגם לא את השיטות המומלצות לשחזור ומניפולציה של GUV לאחר הייצור. בהתבסס על הספרות המדעית הזמינה והניסיון הישיר שלנו, אנו מספקים כאן פרוטוקול כללי לייצור GUVs תוך דיון בעקרונות הבסיסיים. על ידי כך, אנו מספקים אינדיקציות שימושיות לאופטימיזציה של פורמולציות GUV חדשות ושני אמצעי זהירות החלים תמיד על הפרוטוקול: הכנת LS בסביבה מבוקרת ושיטה להסרת שלב השמן העליון בקלות לשחזור דגימת GUV נקייה. בחרנו שתי דוגמאות: האחת עם 240 מ"מ סוכרוז כ-IS ו-0.2 מ"מ DOPC בשמן סיליקון AR20 כ-LS (מצב E [ריק], ראה טבלה 1) והשנייה מורכבת מ-0.2% מיקרו-חלקיקי פוליסטירן 1.1 מיקרומטר ב-240 מ"מ סוכרוז כ-IS ו-3.18 מ"מ DOPC בשמן מינרלי כ-LS (מצב P [עם חלקיקים], ראה טבלה 1). שתי הדגימות הופקו עם 240 מ"מ גלוקוז כ-OS. בחרנו באוסמולריות זו כדי להשיג GUVs שבתנאים פיזיולוגיים יש להם קרום שומני רגוע (מתח ממברנה נמוך).

איור 1: ייצוג סכמטי של שיטת העברת הטיפות. (A) מכינים שלוש תמיסות בבקבוקונים נפרדים: פוספוליפידים בשמן (פאזה צהובה) ליצירת תמיסת שומנים, תמיסה המכילה סוכרוז (בציאן) כתמיסה פנימית, ותמיסת גלוקוז שווה ערך (לבן) כתמיסה חיצונית. (B) לאחר מכן LS מעורבב עם ה-IS ליצירת תחליב יציב, ואז (C) ממשק בין OS ל-LS מותר להתאזן לפני (D) האמולסיה נשפכת עליו. (E) טיפות מים נאלצות לחצות את ממשק LS/OS בכוח צנטריפוגלי כדי (F) לאפשר היווצרות של GUVs. הנתון אינו בקנה מידה ונועד לספק רק סכימה של השיטה. קיצורים: LS = תמיסת שומנים; IS = פתרון פנימי; OS = פתרון חיצוני; GUV = שלפוחית חד-שלמית ענקית. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
הערה: אלא אם צוין אחרת, התהליכים מתבצעים בטמפרטורת החדר.
1. הכנת פתרונות
2. ייצור GUV
3. התאוששות GUV
4. תצפית וניתוח מימדים
תכשיר GUV אופטימלי מאופיין בהיווצרות פאזת שמן שקופה וכדור מובהק (איור 4A). במקרים בהם טיפות מים אינן מצליחות להפוך ל-GUVs, הן בדרך כלל קורסות ומשאירות פסולת פוספוליפידים בממשק OS/LS (איור 4C). השפעה זו נגרמת ככל הנראה על ידי הצטברות של פוספוליפידים ומולקולות אחרות משלב השמן, הנובעת משיווי משקל לא מספיק של פוספוליפידים בממשק מים/שמן. עם זאת, למרות היעדר כדור גלוי או נוכחות של פסולת בממשק, GUVs עדיין עשויים להיווצר, מה שמאפשר את המשך התהליך. בעוד ששלבי הכביסה אינם יעילים לחלוטין בהסרת כל פסולת הפוספוליפידים, הם מסייעים באופן משמעותי בסילוק טיפות שמן, ומשפרים את איכות הדגימה הכוללת (השווה איור 6A ואיור 6B).
השימוש ב-LS או LS ישנים שהוכנו בתנאי לחות גבוהה מביא לעתים קרובות להפחתת פיזור GUV עם תפוקה נמוכה יותר ותכולה גבוהה יותר של אגרגטים לא מסודרים שנוצרים ככל הנראה על ידי פוספוליפידים ומולקולות אחרות משלב השמן (איור 6C). עבור LS שהוכן בתנאי לחות גבוהים, ראינו מקדמי שונות מעל 0.8 בייצור GUV (עם דגימות המכילות מעט מאוד GUVs), בעוד שעבור LS שהוכן בתא הכפפות המותאם, מקדם השונות היה מתחת ל-0.5.
תנאי צנטריפוגה שונים עשויים להשפיע על תפוקת ה-GUV ואיכותו. מניתוח איכותני, 20 דקות ב-3,300 × גרם זוהו כמצב טוב עבור GUVs טעוני סוכרוז (דגימה E). הורדת המהירות (45 דקות ב-500 × גרם) הביאה לירידה בתפוקה, בעוד שעלייה (5 דקות ב-16,600 × גרם) הובילה להיווצרות גבוהה יותר של אגרגטים פוספוליפידים לא מסודרים. כוח צנטריפוגלי חלש עשוי למנוע מטיפות רבות לחצות את ממשק OS/LS, ומכאן התפוקה המופחתת, בעוד שכוח חזק עשוי שלא לספק מספיק זמן לארגון הפוספוליפידים על העלון החיצוני במהלך חציית הממשק (איור 7). ניתן לייעל את האנקפסולציה של מיקרו-חלקיקים גם עם התאמות לפרמטרי הצנטריפוגה, בתנאי שצפיפות המסה של המיקרו-חלקיקים תואמת בערך לזו של IS. למטרה זו, הורדת תאוצת הצנטריפוגה (ובתורו הגדלת זמן הצנטריפוגה) מאפשרת אנקפסולציה הומוגנית יותר של חלקיקים, על ידי הימנעות משבירה של הממברנה הפוספוליפידית עקב הכוח שמפעילים החלקיקים המוצקים (דוגמה לאנקפסולציה טובה מוצגת באיור 6D בעוד שהחקירה של פרמטרי צנטריפוגה אופטימליים עדיין נמשכת17).
מכיוון שהדיפוזיה של פוספוליפידים יכולה להיות מושפעת משלב השמן, ניתן להריץ בדיקה איכותית פשוטה כדי להעריך את יציבות האמולסיה (איור 5). בעזרת צבע צביעה (Brilliant Blue FCF) המומס ב-IS כדי לשפר את ההדמיה, ניתן להכין ולצפות באמולסיות עם יחסי מים/שמן שונים לאורך זמן. ניתן לדמיין את אובדן היציבות על ידי הצטברות טיפות מים וכתוצאה מכך הפרדה משלב הנפט. מכיוון שטיפות גדולות (הנראות לעין בלתי) נוטות פחות להיות מומרות ל-GUVs, אנו ממליצים להשתמש בתנאי האמולסיה המספקים את הפרדת הפאזה הנמוכה ביותר.
ניתן לאמת את השפעת הווריאציות בפרוטוקול באמצעות ניתוח התפלגות גודל כמתואר בסעיף פרוטוקול 4: ניתן למדוד את הקוטר של GUVs באמצעות ImageJ מתמונות מיקרוסקופ ניגודיות פאזה, וניתן לנתח את התפלגות הגודל באמצעות סקריפט זמין ב-GitHub16. בעקבות פרוטוקול זה, היה אפשרי, למשל, לצפות בעלייה ב-GUVs עם קטרים גדולים יותר כאשר שמן מינרלי נבחר על פני שמן סיליקון AR20 (איור 8).

איור 2: הגדרת תא כפפות. איור זה מציג את השינויים העיקריים בתא הכפפות להכנת תמיסת השומנים. (א) חיבור כניסה עם חנקן ואקום; (ב) חיבור כניסה לתא הכפפות; (ג) שסתום יציאה; (ד) מכסה נושא מחטים לאידוי ממס; (ה) צינורות דקים לאידוי ממס; (F) חלקיקי סיליקה לספיגת לחות; (ז) פריטים שיש להציב בתא הכפפות: תרמו-היגרומטר דיגיטלי (1), תמיסת שומנים בממס אורגני (2), מחזיק טבעת שעם (3), מזרק זכוכית (4), מכסה פתוח עם מחיצה ומחטים (5), תמיסת שמן (6), בקבוקון כהה פתוח עם מכסה (7), קצות 10 מ"ל (8), פיפטה P10000 (9); (H) קצה צינור יציאה טבול במים; (I) בקבוקון סגור עם מכסה נושא מחטים המחובר לכניסה ויציאה; (J) סכמות של תא הכפפות המותאם. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: מיכל להסרת שמן קלה. שלבים עיקריים בהכנת GUVs במיכל להסרה קלה של השמן לפי סעיף פרוטוקול 2.1. (א) נקדח חור במכסה צינור של 5 מ"ל כדי לאפשר לקצה P1000 להתאים; ואז (ב) הפקק מונח על צינור ריק של 5 מ"ל כשהקצה מוכנס לחור דרך טבעת O. (C) התמיסות מונחות בצינור לפי סעיפי פרוטוקול 2.2 ו-2.3, הקצה מכוסה, והצינור מונח בתוך צינור של 50 מ"ל. GUVs שהוכנו מ-0.2 mM DOPC בשמן סיליקון הועמסו בסוכרוז של 230.7 mM ו-3.1 mM Brilliant Blue FCF כדי לשפר את ההדמיה. (D) אחרי הצנטריפוגה, שלב השמן העליון נלכד בתוך הקצה יחד עם חלק ממאגר ה-GUV (שנראה ציאן בגלל שחלק מהטיפות לא מצליחות להפוך ל-GUVs ומשחררות את הצבע במערכת ההפעלה). הודות למכסה הגומי, ניתן להסיר בקלות את הקצה מצינור ה-5 מ"ל יחד עם תכולת הנוזל, ובכך לאפשר הסרה מהירה וקלה של כל שלב השמן. (E) ניתן לאסוף בקלות את כדור ה-GUV מתחתית הצינור בפיזור ברור, ללא זיהום שמן נראה לעין, כפי שאומת (F) על ידי מיקרוסקופ ניגודיות פאזה. סרגל קנה מידה = 20 מיקרומטר. קיצורים: LS = תמיסת שומנים; IS = פתרון פנימי; OS = פתרון חיצוני; GUV = שלפוחית חד-פעמית ענקית; DOPC = 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: היווצרות GUV. דוגמאות ל-(A) ממשק OS/LS, (B) כדור GUV נקי עם פאזת שמן שקופה, ו-(C) כדור GUV עם פסולת בממשק OS/LS (הפסולת והגלולה נראים אדמדמים מכיוון שה-IS של אוכלוסיית GUV זו הושלם עם 1.65 מ"מ צבע קוקסין חדש כדי לשפר את ההדמיה). קיצורים: LS = תמיסת שומנים; IS = פתרון פנימי; OS = פתרון חיצוני; GUV = שלפוחית חד-שלמית ענקית. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: יציבות אמולסיה עם יחסי שמן ומים בשמן. האיור מציג את היציבות של תחליבים לאורך זמן, בהתאם לסוג השמן ויחס המים/שמן (w/o) בשימוש. ייצוב התמונה הורכב מ-230.7 מ"מ סוכרוז ו-3.1 מ"מ כחול מבריק FCF כדי לשפר את ההדמיה של האמולסיות. תחליבים שהוכנו עם שמן מינרלי פחות יציבים ממקביליהם העשויים משמן סיליקון AR20. השפעה זו מוגברת עוד יותר עם הגדלת יחסי ה-w/o. למרות שתחליבים בשמן סיליקון AR20 יציבים יותר באופן משמעותי, היציבות שלהם פוחתת גם ככל שיחס ה-w/o עולה, כאשר הפרדת פאזה נראית מיד לאחר האמולסיה (שמן סיליקון AR20 ב-10%). אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: תצפית על GUVs עם מיקרוסקופ ניגודיות-פאזה. הגדלה פי 20 של GUVs טעוני סוכרוז שהוכנו מ-LS המורכב מ-3.18 מ"מ DOPC בשמן מינרלי. (א) דגימה שנמצאה לאחר הסרת השמן; (ב) דגימה שנמצאה לאחר שלבי כביסה; (C) תפוקת GUV ירודה המתקבלת מ-LS שהוכן בסביבות עם חמצן ולחות לא מוסדרים; (D) GUVs טעונים במיקרו-חלקיקים. סרגל קנה מידה = 10 מיקרומטר; טיפות שמן מוקפות בעיגול, ודוגמאות לאגרגטים לא מסודרים של פוספוליפידים ומולקולות שמן מסומנות על ידי חץ. קיצורים: LS = תמיסת שומנים; GUVs = שלפוחיות חד-כיווניות ענקיות. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: השפעת תנאי צנטריפוגה שונים על היווצרות GUV. תמונות ניגודיות פאזה של GUVs טעוני סוכרוז שהוכנו עם LS המורכב מ-0.2 מ"מ DOPC בשמן סיליקון AR20. האיור מציג השוואה איכותית של GUVs ב-(A) 16,600 × גרם למשך 5 דקות, (B) 3,300 × גרם למשך 20 דקות, ו-(C) 500 × גרם למשך 45 דקות. בעוד שמהירות צנטריפוגה גבוהה מביאה לנוכחות גבוהה יותר של אגרגטים פוספוליפידים, מהירות צנטריפוגה נמוכה מובילה לתשואה מופחתת. סרגל קנה מידה = 50 מיקרומטר. קיצורים: LS = תמיסת שומנים; GUV = שלפוחית חד-פעמית ענקית; DOPC = 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 8: ניתוח התפלגות גודל. השוואה בין שתי דגימות GUV טעונות סוכרוז שהתקבלו מ-(A) 0.2 מ"מ DOPC בשמן מינרלי ו-(B) 0.2 מ"מ DOPC בשמן סיליקון AR20 (*הדגימה דוללה פי 10 כדי לאפשר הבחנה ברורה של GUVs תחת מיקרוסקופ ניגוד פאזה). הניתוח שבוצע בעקבות סעיף 4 של פרוטוקול מראה התפלגות גודל שהועברה לכיוון קטרים גבוהים יותר עבור דגימת השמן המינרלי ביחס לדגימות שמן סיליקון AR20. עם זאת, התשואה של דגימת הסיליקון גבוהה כמעט פי 20. קיצורים: GUV = שלפוחית חד-שלמית ענקית; DOPC = 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
| צעד | מצב E | תנאי P | תיאור |
| 1.1.1 | 4.11 גרם | 17.11 גרם | מסת סוכרוז |
| 1.1.1 | 2.16 גרם | 2.16 גרם | מסת גלוקוז |
| 1.1.2 | 240 מ"מ | 1000 מ"מ | ריכוז סוכרוז |
| 1.1.2 | 240 מ"מ | 240 מ"מ | ריכוז הגלוקוז |
| 1.3.2 | שמן סיליקון | שמן מינרלי | שלב שמן ל-LS |
| 1.3.2 | מזרק זכוכית 0.1 מ"ל | מזרק זכוכית 0.5 מ"ל | מזרק זכוכית להעברת DOPC בתמיסות כלורופורם |
| 1.3.10 | 63 מיקרוליטר | 500 מיקרוליטר | נפח DOPC בתמיסת כלורופורם |
| 1.3.16 | 10 מ"ל | 5 מ"ל | נפח שמן |
| 2.4.1 | 3300 גרם 20 דקות | 500 גרם 45 דקות | מצב צנטריפוגה |
טבלה 1: וריאציות בפרוטוקול. הטבלה מדווחת על וריאציות לשלבים שונים של הפרוטוקול (המצוין בעמודה הראשונה) להכנת שתי אוכלוסיות GUV שונות: GUVs טעוני סוכרוז (מצב E) ו-GUVs טעונים במיקרו-חלקיקים (מצב P).
| מזהה | השלבים המעורבים | קוטר פנימי (מ"מ) | קוטר חיצוני (מ"מ) | אורך (מ"מ) |
| 1 | 1.2.1; 1.2.3 | 7 | 13 | 50 |
| 2 | 1.2.1; 1.2.4; 1.3.5 | 7 | 13 | 50 |
| 3 | 1.2.1; 1.2.4; 1.3.5 | 7 | 13 | 100 |
| 4 | 1.2.1; 1.2.4; 1.2.5 | 7 | 13 | 2000 |
| 5 | 1.2.1; 1.2.6; 1.3.13 | 7 | 13 | 2000 |
| 6 | 1.2.2; 1.2.7; 1.3.11 | 3 | 7 | 50 |
| 7 | 1.2.2; 1.2.7; 1.3.11 | 3 | 7 | 50 |
| 8 | 1.2.2; 1.2.9; 1.3.11; 1.3.15 | 3 | 7 | 200 |
| 9 | 1.2.2; 1.2.9; 1.3.11; 1.3.15 | 3 | 7 | 200 |
טבלה 2: צינורות לחיבורי גז ואקום בתא הכפפות. הטבלה מפרטת את מידות צינורות הסיליקון המשמשים לחיבור תא הכפפות לקווי החנקן והוואקום. מזהי סימוכין מסופקים כדי להקל על תהליך ההרכבה.
ניתן לחלק את השיטות לייצור GUVs לשתי קבוצות עיקריות: שיטות המבוססות על נפיחות ממצעים באמצעות הידרציה ואלו המבוססות על הרכבה מממשקי נוזלים. שיטות מהקבוצה הראשונה יעילות מאוד במתן אוכלוסיות GUV גדולות לאפיון ביופיזיקלי של ממברנות שומנים או חלבונים טרנסממברניים. לעומת זאת, שיטות כמו העברת טיפות נבחרות בעיקר עבור עטיפת מטען בגלל הצריכה המופחתת של מטענים ויעילות אנקפסולציה גבוהה יותר18.
מסיבה זו, שפע של מטענים שונים נעטפו ב-GUVs, מה שהופך את העברת הטיפות לתהליך ייחוס לתאים מלאכותיים 3,8,9,10 ופתרון אפשרי לבניית מיקרו-רובוטים ביומימטיים חדשים 11,12. כדי לווסת את התכונות הפיזיקוכימיות של ממברנות GUV, ניתן לכלול מולקולות שונות, כגון פוספוליפידים יוניים10, חומצות שומן19, פולימרים כמו PEG20 או כולסטרול21 (אם כי למולקולות הידרופוביות כמו כולסטרול יש זיקה גבוהה לשמן, וכתוצאה מכך שליטה נמוכה יותר בהרכב הממברנה ביחס לשיטות נפיחות22). הפרוטוקול רב תכליתי מספיק כדי לאפשר שינויים אלה, אך לשלבים מסוימים יש השפעה גבוהה יותר מאחרים.
כדי לדון בקריטיות של השיטה, תיארנו כאן פרוטוקול להכנה של שתי אוכלוסיות GUV שונות: תכשיר אחד של GUVs המכילים תמיסת סוכרוז והכנה אחת של GUVs העוטפים מיקרו-חלקיקים. ההבדלים בפרוטוקול מפורטים בטבלה 1 כתנאי E (ריק) ומצב P (עם חלקיקים). שיטה זו מאפשרת היווצרות GUVs על ידי העברת טיפות מים משלב שמן לשלב מים בתהליך דו-יציב המונע על ידי פוספוליפידים23 ומושפע מהתכונות הפיזיקוכימיות של כל שלושת השלבים המעורבים: IS, OS ו-LS.
מבין השלושה, LS הוא הרגיש ביותר בגלל הרגישות של פוספוליפידים לאור, חמצון והידרוליזה 24,25,26. מסיבה זו, השלב הראשוני של אידוי הממס האורגני המשמש לאחסון ארוך טווח של פוספוליפידים ב-20 מעלות צלזיוס (בדרך כלל כלורופורם או מתנול) חייב להתבצע בבקבוקוני ענבר תחת זרימת חנקן או ארגון. אם לא מובטחות רמות לחות נמוכות בסביבת המעבדה, פוספוליפידים עלולים להינזק13, 14, 27. לכן, יש להכין LS בסביבה סגורה כגון תא כפפות או תא כפפות שונה חסכוני המתואר בפרוטוקול זה. לאחר הוספת השמן לסרט השומנים, ניתן להסיר את ה-LS מתא הכפפות, והפירוק המוחלט של הפוספוליפידים מתבצע על ידי מערבולת וחימום התמיסה.
למרות שחלק מהפרוטוקולים כוללים סוניקציה בשלב13 זה, עליות מקומיות בטמפרטורה עלולות להוביל לנזקים שעדיין לא תוארו עבור ניסוחים מסוימים של LS. מסיבה זו, חימום התמיסה באמבט מים עשוי לספק תהליך מבוקר והומוגני יותר. כדי להפחית עוד יותר את הסיכוי לפגיעה ב-LS, פרוטוקול זה מציע שימוש בשתי טמפרטורות שונות: מכיוון שפירוק של LS שהוכן לאחרונה דורש אנרגיה גבוהה יותר מאשר LS שהומס בעבר (עקב אריזה צפופה יותר של מולקולות פוספוליפידים בסרט המפוזר על פני בקבוקון הזכוכית), 80 מעלות צלזיוס מאומצים לפירוק סרט השומן הראשון ו-50 מעלות צלזיוס פשוט להמסת פוספוליפידים ממש לפני השימוש בהם. מכיוון שבדרך כלל נצפית עלייה בשונות הביצועים לאורך זמן עבור 3.18 מ"מ DOPC בשמן מינרלי (איור 4C), שימוש ב-LS תוך שבוע הוא פרקטיקה מומלצת בדרך כלל. עם זאת, שילובים מסוימים של שמן ופוספוליפידים עשויים להאריך את תוחלת החיים, ונראה כי השימוש בתא כפפות משפר גם את היציבות של LS לאורך זמן.
התאמה אישית של ממברנות GUV עם שילובים ספציפיים של פוספוליפידים עשויה לדרוש יישומים מותאמים אישית של הפרוטוקול. כדי לנווט בין כל הווריאציות האפשריות, ניתן לקבל הדרכה מהתכונות הפיזיקוכימיות של ה-LS. הריכוזים המיסלרים הקריטיים (CMC) והדיפוזיביות של פוספוליפידים ב-LS מושפעים מהאינטראקציות הכימיות עם המולקולות בתמיסה28. היווצרות טיפות מים בתחליב IS/LS מושפעת אפוא מהמהירות שבה פוספוליפידים יכולים להתפזר בשלב השמן ולהגיע לממשקי מים/שמן ליצירת שכבה חד-שכבתית יציבה (העלון הפנימי של הממברנה). נצפו הבדלים בדיפוזיביות עבור שני השמנים שנוצלו בפרוטוקול זה, כאשר שמן סיליקון AR20 מספק יציבות גבוהה יותר של תחליב IS/LS (איור 6). מכיוון שהאמולסיה היציבה ביותר עבור שני השמנים נצפתה כאשר מים התפזרו ביחס של 2.5% (עקבי עם תצפיות קודמות בשמן מינרלי13), קבענו זאת כיחס תקף באופן כללי.
עם זאת, מכיוון שיחסים גבוהים יותר יכולים לספק תכונות שימושיות (למשל, POPC בשמן מינרלי הראה מעבר ל-GUVs גדולים יותר13), אנו ממליצים להריץ בדיקה איכותית ראשונית כמו זו שדווחה באיור 6 כדי לקבל תובנות לגבי יציבות האמולסיה ומכאן היעילות הצפויה של האנקפסולציה. כאן, אנו ממליצים לקוראים לא להסתמך על תזמון מדויק או איטרציות של נהלים להיווצרות האמולסיה מכיוון שהיעילות תלויה אך ורק במפעיל או במכשיר המאומץ. במקום זאת אנו מספקים נקודת ביקורת כדי לעזור למפעיל להבין מתי איכות האמולסיה טובה מספיק כדי - לפחות תיאורטית - למקסם את הסיכוי להמיר טיפות ל-GUVs. הדיפוזיביות של פוספוליפידים בשמן משפיעה גם על יכולתם להתארגן מחדש במהלך העברת הטיפות וליצור את העלון החיצוני של ממברנת GUV 2,7,18,29. שלב זה מועדף על ידי שיווי משקל נכון של ממשק LS/OS. בעוד שזמן הדגירה שאומץ על ידי פרוטוקול זה עולה בקנה אחד עם המלצות כלליות18, עם מדידות מתח בין-פנים מדוחות קודמים7 והניסויים הראשוניים שלנו, GUVs שהוכנו עם LS שונה עשויים להפיק תועלת מזמן דגירה ארוך יותר.
היווצרות העלון החיצוני מושפעת גם ממהירות טיפות המים החוצות את ממשק LS/OS, שלב הקשור לצפיפות ולצמיגות של שלושת השלבים30. הבדלי הצפיפות חייבים תמיד לפי הסדר: IS > OS > LS. זה חיוני כדי לאפשר תחילה שקיעה של טיפות IS לכיוון ממשק LS/OS, ולאחר מכן חציית הממשק להמרה ל-GUVs ושקיעתם לכיוון תחתית הצינור. למרות שהתהליך יכול להתרחש באופן ספונטני גם כאשר מים נטולי יונים משמשים הן כ-IS והן כ-OS23, הוצג הבדל בצפיפות בין IS ל-OS לטובת היווצרות GUV31. הזוג הנפוץ ביותר למטרה זו הוא סוכרוז ב-IS וגלוקוז ב-OS: בריכוזים שווי-מולאריים הנדרשים למניעת נזק ל-GUVs הנוצרים עקב עקה אוסמוטית, סוכרוז מספק תמיסה צפופה יותר מגלוקוז. מכיוון שההבדל בצפיפות גדל עם האוסמולריות של תמיסות אלה, התשואה של GUVs משתנה בהתאם, ללא שיפור נוסף שנצפה מעבר ל-600 mOsm13.
תנאי צנטריפוגה אופטימליים קשורים קשר הדוק לצפיפות ולצמיגות של שלושת השלבים ולדיפוזיביות של הפוספוליפידים. בהיעדר אפיון מלא של שלושת השלבים, יש לסנן מספר מצבים. ממבחנים איכותניים (איור 4E ואיור 5) וניתוח שיטתי ראשוני17, ניתן היה להגדיר תנאי צנטריפוגה טובים עבור שתי הדגימות המתוארות בפרוטוקול זה; עם זאת, איכות הדגימות פתוחה לשיפור אם ייבדקו תנאים נוספים. כאשר האיזון בין דיפוזיביות פוספוליפידים ב-LS, לבין הצפיפות והצמיגות של שלושת השלבים אינו נשמר כראוי, לפוספוליפידים אין מספיק זמן לאזן בממשק LS/OS ולהתארגן מחדש בצורה נכונה כאשר טיפות מים נעות לכיוון מערכת ההפעלה. זה מוביל לעתים קרובות להיווצרות משקעים לבנבנים בממשק או ממש מתחתיו, המורכב ככל הנראה מפוספוליפידים ומולקולות אחרות בשלב הנפט הנגררות על ידי טיפות שאינן מצליחות להתאסף ל-GUVs במהלך הצנטריפוגה.
האנקפסולציה של תמיסה הומוגנית יכולה להיות מונעת על ידי הגדלת צפיפות ה-IS תוך שמירה על איזון אוסמוטי עם מערכת ההפעלה (כמו עבור צמד סוכרוז-גלוקוז), אך האנקפסולציה של פיזור מיקרו-חלקיקים דורשת את צפיפות הפאזה המימית כך שתתאים לזו של מיקרו-חלקיקים32. היעילות של עטיפת המטען מושפעת גם מההרכב הכימי של תמיסת המטען/פיזור. דיווחים קודמים הראו השפעה שלילית על תפוקת GUV הנגרמת על ידי הלידים רבים של מתכות אלקליות33 או וריאציות pH13, ככל הנראה בגלל אינטראקציות או תזוזות במטען הנקי של ראשים הידרופיליים זוויטריונים של פוספוליפידים. לכן, עטיפת תגובות ביולוגיות (כגון סינתזת חלבון אנזימטית או נטולת תאים) דורשת לעתים קרובות פשרה, שכן יש להתאים את ריכוזי ה-pH והמלח (כגון KCl או NaCl) לרמות שאינן אופטימליות לתגובה עצמה. עם זאת, אפילו תערובות תגובה מורכבות כגון סינתזת חלבון נטולת תאים ניתנות לשינוי כדילספק תאים מלאכותיים פונקציונליים מבוססי GUV.
מנקודת מבט מעשית, למרות ששיטת העברת הטיפות מציעה תהליך פשוט מאוד, התאוששות של GUVs ממערכת ההפעלה יכולה להוות מגבלות מסוימות. כדי לסייע בהוצאת השמן מהשלב העליון לאחר שלב הצנטריפוגה, ניתן לנצל שני קצות פיפטה להסרה עדינה יותר (שלב פרוטוקול 3.1.1) או בקבוק בוכנר להסרה מהירה יותר כאשר מכינים מספר דגימות (שלב פרוטוקול 3.1.2). עם זאת, מכיוון שהשמן אינו מוסר לגמרי, יש צורך לבצע שלב שטיפה כדי לקבל פיזור GUV נקי (פרוטוקול שלב 3.2). למרות ששלבי הכביסה הביאו להסרה יעילה של טיפות שמן שיוריות ללא אובדן ניכר של GUVs (איור 4A,B), מעבר זה עשוי להיות פחות פשוט עם שמן צמיג מאוד, והוא יכול לגזול זמן רב כאשר מכינים פורמולציות GUV מרובות. תוארה שיטה חלופית לעקיפת הסרת השמן ולשחזור ה-GUV מתחתית הצינור דרך חור מנוקב בעזרת מחט35. עם זאת, תהליך זה עשוי שלא לאפשר התאוששות מלאה של כדור ה-GUV אם הצינור אינו מנוקב במיקום הנכון, ויתרה מכך, הוא עלול להזיק למפעיל.
כדי לעזור להתאוששות ה-GUV, אנו מציגים כאן גישה חדשה ופשוטה להסרת שלב הנפט במהירות. זה מבוסס על לכידת שלב השמן העליון והפחות צפוף בקצה פיפטה מכוסה כך שלאחר הצנטריפוגה ניתן להסיר את הקצה בצורה כזו שלא יטפטף נוזל. אסטרטגיה פשוטה זו מאפשרת הסרה מהירה וקלה של כל שלב השמן בבת אחת, ומפשטת באופן עקבי את השלב הגוזל זמן זה.
כדי להעריך את יעילות הפרוטוקול, יושמו מספר שיטות לזיהוי אוטומטי של GUVs כדי להאיץ את הספירה וניתוח התפלגות הגודל. תיוג GUVs עם בדיקות פלואורסצנטיות מספק אסטרטגיה פשוטה ויעילה המיושמת הן על זרימה ציטומטרית36,37 והן על הדמיית מיקרוסקופ בשילוב עם אלגוריתמים לזיהוי מעגלים 13,37,38,39. לאחרונה, כלים מבוססי בינה מלאכותית לזיהוי אובייקטים נחקרים כדי לשפר את התהליך הזה40,41. עם זאת, צבעים פלואורסצנטיים יכולים להשפיע על תכונות GUV, ובכך להכניס חפצים לניתוח. אם לא כוללים אות פלואורסצנטי הניתן לזיהוי, מיקרוסקופיה נותרה האפשרות האמינה ביותר, כאשר מיקרוסקופיית ניגודיות פאזה היא השיטה המועדפת להדמיה אופטימלית18 ויישום אלגוריתמים לזיהוי מעגלים38.
לחלופין, ניתן לנצל מאפיינים ייחודיים של ניסוחים ספציפיים לאסטרטגיות זיהוי ייחודיות. Hadorn et al., למשל, מינפו את נוכחותם של אלקטרוליטים ב-IS כדי לזהות GUVs עם מונה תאים מבוסס עכבה33. כאשר אף אחת מהשיטות האוטומטיות או הספציפיות לניסוח אינן אפשריות, הערת מעגל ידנית נשארת גיבוי אוניברסלי. במקרים כאלה, ImageJ מציעה כלי מעשי להאיץ את התהליך ולחלץ בקלות מדידות קוטר גולמיות כמתואר בפרוטוקול זה.
למרות האימוץ הרחב של שיטת העברת הטיפות, תשומת לב מועטה מוקדשת לתהליכי האופטימיזציה הנדרשים לניסוחים חדשים של GUV. בעבודה זו, אספנו את המידע הזמין מהספרות כדי ליישם פרוטוקול שיטתי לניווט ופישוט אופטימיזציה זו. מדריך מעשי זה בוחן את העקרונות הבסיסיים הכרוכים בייצור פורמולציות GUV חדשות ובשחזור דגימה מזוהמת בשמן, היבט שלעתים קרובות מתעלמים ממנו בפרוטוקול13,14. בעוד שחיזוי האופטימיזציה שכל ניסוח GUV דורש אינו אפשרי, מדריך זה מספק טיפים ותובנות שימושיות כדי להאיץ את היישום של GUVs חדשים, מה שעלול להוביל ליישומים הכוללים תאים מלאכותיים ומיקרו-רובוטים.
למחברים אין אינטרסים מתחרים להצהיר עליהם.
תוצאות אלו הן חלק מפרויקט CELLOIDS (מיקרו-רובוטים אינטליגנטיים מבוססי חלקיקים בהשראת תאים) שקיבל מימון ממועצת המחקר האירופית (ERC) במסגרת תוכנית המחקר והחדשנות Horizon 2020 של האיחוד האירופי (הסכם מענק מס' 948590). עבודה זו נתמכה בחלקה על ידי הנציבות האירופית באמצעות פרויקט NextGenerationEU BRIEF. אנו מודים למישל איברהימי על התמיכה הטכנית בהקמת תא הכפפות ועל הדיון המועיל על יישום המיכל להסרה קלה של שמן.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 0.22 ומיקרו; ממברנת אסטרי תאית מעורבים M מסנני מזרק | מרק | SLGSVR255F | |
| צינורות 1.5 מ"ל | מחלקה ביולוגית | 06.0279.00 | |
| 100 μ מזרק זכוכית L | מרק | 20737 | |
| 150 מ"ל | אוונטור | 213-1123 | לפחות 3 |
| בקבוקוני זכוכית כהה 20 מ"ל ND24 | אוונטור | 548-9001א | |
| צינורות 2 מ"ל | מחלקה ביולוגית | 07.3534.99 | |
| צילינדר 50 מ"ל | אוונטור | 612-3843 | |
| 500 μ מזרק זכוכית L | המילטון | 549-1166 | |
| שפופרת פלקון 50 מ"ל | מרק | CLS352070 | |
| מזרק 50 מ"ל | פישר סיינטיפיק | 8SS50L1 | |
| צינורות 5 מ"ל | גריינר ביו-וואן | 622201 | |
| 600 מ"ל | אוונטור | 213-1126 | |
| Bü בקבוק CHNER | מרק | Z740682 | |
| טבעות שעם לצלוחיות תחתונות עגולות | אוונטור | 217-1000 | |
| מגבש | דוצ'ר | 080474א | |
| D-(+)-גלוקוז | סיגמא-אולדריץ' | G8270 | |
| D-(+)-סוכרוז | סיגמא-אולדריץ' | S9378 | |
| תרמו-היגרומטר דיגיטלי | בולנדר | V1863-07 | |
| DOPC | מחקר אוונטי | ברקוד 850375ג | |
| מקדחה | דרמל | 4000 | |
| מלח דיסודיום אריוגלאוצין (כחול מבריק FCF) | סיגמא-אולדריץ' | 861146 | |
| מחט מזרק G18 | טרומו | AN1838R1 | |
| מחט מזרק G21 | טרומו | AN2138R1 | |
| תא כפפות | בל-ארט | F50030-0000 | אם זמין, ניתן להשתמש בתא כפפות, אך במעבדות עם רמות לחות נמוכות יתכן שלא יהיה צורך בכך. |
| בוחש מגנטי פלטה חמה | תוכנת מעבדה LLG | 6.263 448 | |
| שמן מינרלי קל | סיגמא-אולדריץ' | 330779 | |
| קוצ'יני חדש | סיגמא-אולדריץ' | 199737 | |
| טבעת O טבעת O מגומי ניטריל, קדח 8 מ"מ, קוטר חיצוני 12 מ"מ | ר.ס. | 196-4863 | |
| מכסי בורג פתוחים עם מחיצה ND24 | אוונטור | 548-0031א | |
| מיקרופיפטה P1000 | פישר סיינטיפיק | 12346132 | |
| מיקרופיפטה P10000 | אוונטור | 89079-978 | |
| מיקרופיפטה P200 | פישר סיינטיפיק | 12326132 | |
| מגבות נייר | אוונטור | KIMB6657 | |
| פרפילם | אוונטור | 291-1214 | |
| קצות פיפטה (1000) | אפנדורף | 0030000919 | |
| קצות פיפטה (10000) | אפנדורף | 0030000765 | |
| קצות פיפטה (200) | אפנדורף | 0030000870 | |
| חלקיקי פוליסטירן, 1.1 ומיקרו; m | סיגמא-אולדריץ' | LB11-1 מ"ל | |
| כובע גומי | ביוקלאס S.r.l. | 12.2300.05 | |
| אטם חרוטי גומי | אוונטור | 217-0211 | |
| מכסי ברגים ND24 | אוונטור | 548-0161א | |
| שמן סיליקון AR20 | סיגמא-אולדריץ' | 10836 | |
| צינור סיליקון (קוטר פנימי 1.6 מ"מ, קוטר חיצוני 3 מ"מ) | ר.ס. | 667-8441 | |
| צינור סיליקון (קוטר פנימי 6 מ"מ, קוטר חיצוני 12 מ"מ) | ר.ס. | 273-2541 | לפחות 6 מ' |
| צומת תלת-כיווני | ר.ס. | 795-405 | |
| צומת דו כיווני | ר.ס. | 419-7287 | |
| שסתום דו כיווני | קלבר | 91280 | |
| מים טהורים במיוחד | תרמו פישר סיינטיפיק | 22934 | כאשר זמין, ניתן להחליף מוצר זה במים מטוהרים באמצעות מערכות Milli-Q |
| מספריים אוניברסליים | בוצ'ם | 4154 |
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה