פרוטוקול זה מספק תיאור מפורט של הייצור, התרבית והניתוח של לימפומה של תאי מעטפת בפרוסות גידול הידרוג'ל מודפסות בתלת מימד.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מספק תיאור מפורט של הייצור, התרבית והניתוח של לימפומה של תאי מעטפת בפרוסות גידול הידרוג'ל מודפסות בתלת מימד.
לימפומה של תאי מעטפת (MCL) היא ניאופלזמה נדירה ואגרסיבית של תאי B שחוזרת לעתים קרובות ומראה רק תגובה מוגבלת לכימותרפיה קונבנציונלית. אתגר מרכזי במחקר MCL הוא גידול תאי MCL ראשוניים ex vivo, שכן תאים נוטים לעבור אפופטוזיס ספונטני כאשר הם מתורבתים בתרבית תרחיף דו-ממדית. למרות שמודלים תלת מימדיים ידועים כמסכמים טוב יותר את המצב in vivo של גידולים מוצקים, היישום שלהם עדיין נחקר בצורה גרועה בלימפומות. פיתוח מודלים תלת מימדיים המשכפלים את תנאי ה-in vivo של MCL בתוך בלוטת הלימפה יכול לשפר את הישרדותם, להקל על חקר המיקרו-סביבה של MCL-גידול ולחקות את תגובת התרופות in vivo . כאן, הוקם מודל מודפס בתלת מימד של MCL בצורת פרוסות גידול הידרוג'ל, יחד עם שיטת תרבית אופטימלית. פותח תהליך סטנדרטי באמצעות קווי תאי MCL או תאי MCL ראשוניים, שבו התאים טובלים בהידרוג'ל המכיל אלגינט, קולגן מסוג I ומטריצת ממברנת הבסיס על ידי הדפסה ביולוגית לאמבט תמיכה בג'לטין. פרוסות גידול ההידרוג'ל MCL המתקבלות מתורבתות על תומך מסנן כדי לשמור על יציבותן לאורך כל תקופת התרבית. ניתן ליישם טיפולים תרופתיים על המערכת. ניתן לעקוב אחר התגובה של תאים בודדים בתוך פרוסת גידול ההידרוג'ל על ידי הדמיה פלואורסצנטית תלת מימדית חיה בארבעה צבעים. תאי MCL ראשוניים הראו כדאיות יציבה כאשר תרבית בפרוסות גידול ההידרוג'ל. פרוטוקול זה מספק תיאור מפורט של הייצור, התרבית והניתוח של תאי MCL בפרוסות גידול הידרוג'ל. על ידי חיקוי הדוק של מיקרו-סביבת הגידול ושימוש בתרבית ממשק אוויר-נוזל, המודל המוצג משפר את הרלוונטיות הפיזיולוגית בהשוואה לתרבות הדו-ממדית המסורתית. הוא מציע פוטנציאל משמעותי לקידום מחקרים ביולוגיים וטיפוליים של MCL.
לימפומה של תאי מעטפת (MCL) היא לימפומה נדירה ואגרסיבית של תאי B שאינה הודג'קין שמקורה באזור המעטפת של בלוטות הלימפה1. אזור המעטפת מורכב מטבעת של לימפוציטים קטנים המקיפה את מרכז הנבט של זקיק תאי B. בדרך כלל, MCL מראה מהלך קליני אגרסיבי, עם הישנות תכופות לאחר הכימותרפיה הראשונית. בשל הבנה משופרת של היווצרות מחלה1 ופיתוח טיפולים חדשים, כולל אימונוכימותרפיה2, מעכבי טירוזין קינאז3 של ברוטון או צימודי נוגדנים-תרופות4, אפשרויות הטיפול בחולי MCL הובילו לשיפור בשיעורי התגובה והישרדות ממושכת ללא התקדמות. עם זאת, עמידות לתרופות והישנות עדיין הופכות את המחלה לחשוכת מרפא5. חלקית, זו תוצאה של ההטרוגניות שלו והשפעת המיקרו-סביבה של הגידול על התפתחות הגידול ועמידות לתרופות6. אתגר בחקר MCL הוא הקושי לטפח תאי MCL ראשוניים בתרבית תרחיף7, שכן תאים עוברים אפופטוזיס ספונטני ex vivo 4,5. זה מדגיש את הצורך בגישות חלופיות למודל טוב יותר של MCL במודלים פרה-קליניים.
in vivo, גידולים הם מבנים תלת מימדיים (3D) המורכבים ממרכיבים תאיים שונים, כולל תאי גידול, תאי חיסון ותאי סטרומל, כמו גם רכיבים לא תאיים כגון המטריצה החוץ-תאית (ECM). ה-ECM, המורכב ממקרומולקולות כמו קולגן ולמינין, יוצר רשת סיבית מורכבת של סיבים אלסטיים שהיא הידרופילית מאוד, ויוצרת סביבה דמוית ג'ל 2,8,9,10. כדי לשכפל טוב יותר את אלה בתנאי in vivo של גידולים ex vivo, פותחו מגוון מודלים תלת מימדיים. בשנים האחרונות, מודלים אלה הפכו חיוניים לחקר פרמקולוגיה וביולוגיה של סרטן, תוך התמקדות בעיקר בגידולים מוצקים11.
נכון להיום, תחום זה נותר נחקר בצורה גרועה בלימפומות, מכיוון שלתאי סרטן המטולוגיים יש יכולת לגדול הן בתרחיף והן בסביבה סטרומלית כמו בלוטות לימפה, מח העצם או רקמות לימפה משניות12. in vivo, תאי MCL מתפשטים מאזור המעטפת של בלוטות הלימפה לדם או למח העצם, אם כי הם מתרבים בעיקר בתוך בלוטות הלימפה שמהן הם מקורם13,14. בתוך בלוטות הלימפה, תאי MCL מוקפים בתאי T, מקרופאגים ותאי סטרומה מזנכימליים, שכולם הוכחו כשולטים בהישרדות או בתגובה לתרופות של תאי MCL 14,15,16,17,18. יתר על כן, המיקרו-סביבה של MCL-גידול, כמו גם הנקבוביות והתכונות המכניות, הם גורמים חשובים שיכולים להשפיע על תגובות התרופות והעמידות 6,14. לפיכך, נדרשים מודלים תלת-ממדיים סטנדרטיים וניתנים לשחזור של MCL המדמים את המיקרו-סביבה המקומית כדי לחקור MCL ראשוני. עד כה, הוקמו בעיקר מודלים מבוססי תאים כגון ספרואידים או אורגנואידים של תאי MCL ראשוניים 6,19. הם משפרים בהצלחה את הכדאיות והתרבות ארוכת הטווח של תאי MCL ראשוניים. עם זאת, המטריצה החוץ-תאית אינה מיוצגת במודלים אלה. בהקשר זה, הדפסה ביולוגית תלת מימדית מתקדמת מציעה גישה מבטיחה. על ידי הרכבה ישירה של תאים חיים והידרוג'לים, טכנולוגיה זו מאפשרת יצירת מודלים של בלוטות לימפה תלת מימדיות מבוססות הידרוג'ל רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית.
כאן, הוקם מודל מודפס ביולוגי תלת מימדי של MCL בצורת פרוסות גידול הידרוג'ל, יחד עם שיטת תרבית אופטימלית. התאים מוטבעים בפרוסות הידרוג'ל מבוססות קולגן מסוג I, אלגינט ומטריגל על ידי הטבעה הפיכה בצורה חופשית של הידרוג'לים מרחפים (FRESH) הדפסה ביולוגית20. פרוסות גידול ההידרוג'ל מתורבתות על תומך מסנן, המאפשר לתאי MCL לגדול בסביבה המסכמת מקרוב את תנאי ה-in vivo של בלוטת הלימפה.
פרוטוקול זה מספק תיאור מפורט של הייצור, התרבות והניתוח של תאי MCL בפרוסות גידול הידרוג'ל. על ידי שימוש בהדמיה פלואורסצנטית תלת מימדית חיה בארבעה צבעים, ניתן לעקוב אחר הכדאיות או התגובה לתרופות של תאים בודדים בתוך פרוסת גידול ההידרוג'ל. תאי MCL ראשוניים הראו הישרדות משופרת כאשר תרבית בפרוסות גידול ההידרוג'ל. מודל זה מספק כלי לחקר הביולוגיה של MCL והתגובה לטיפול, וסולל את הדרך להבנת השפעות מיקרו-סביבתיות ושונות חולי MCL.
העבודה עם תאי MCL ראשוניים צריכה להיות מאושרת על ידי ועדת האתיקה המקומית. במחקר זה, ועדת האתיקה של הפקולטה לרפואה, אוניברסיטת אברהרד-קרלס ובית החולים האוניברסיטאי טובינגן אישרה איסוף ועבודה של דגימות חולים ותורמים בריאים (מספר פרויקט 159/2011BO2), והתקבלה הסכמה מדעת בכתב מהמטופלים בהתאם להצהרת הלסינקי. תאי ה-MCL העיקריים ששימשו כאן בודדו מבלוטות לימפה שלמות של חולי MCL וכך כללו לא רק תאי MCL, אלא גם תאים אחרים כגון תאי חיסון ופיברובלסטים.
1. הכנת תמיסת ג'לטין לאמבט התמיכה
הערה: תמיסת הג'לטין תשמש כאמבט התמיכה במהלך תהליך ההדפסה הביולוגית התלת מימדית. זה גורם לקישור צולב של הדיו הביולוגי, ומאפשר היווצרות של מבנה תלת מימדי. הכנת תמיסת הג'לטין צריכה להתבצע בתנאים סטריליים בתוך מכסה המנוע של תרבית תאים.
2. הכנת דיו ביולוגי עמוס תאים
3. הדפסה ביולוגית באמבטיה
הערה: במידת האפשר, בצע את תהליך הדפסת התלת מימד בסביבה סטרילית, כגון מתחת למכסה המנוע של תרבית תאים. מדפסת התלת מימד ששימשה שונתה להדפסת FRESH על ידי הוספת מאריך משאבת מזרק, כמתואר בהינטון ואחרים 20.
4. תרבית פרוסות גידול הידרוג'ל וטיפול בהן
5. ניתוח כדאיות של תאים על ידי בדיקת אי הכללת טריפאן כחול
6. הדמיית פלואורסצנציה תלת מימדית חיה בארבעה צבעים
הערה: הצביעה בארבעת הצבעים המשמשת כאן מאפשרת התמיינות בין תאים חיים (חיוביים ל-TMRM), תאים אפופטוטיים (חיובי ל-Caspase-3 פלואורוגני) ותאים מתים (חיוביים ל-PicoGreen)21,22,23. גרעינים מזוהים עם DRAQ5. עם זאת, פרוטוקול זה עשוי להיות מותאם לכל צבע פלואורסצנטי ספציפי אחר הניתן לאור כדי לזהות את הסמנים הביולוגיים, המבנים התאיים או סוגי התאים הנבחרים. לפני הצביעה, ודא שהמיקרוסקופ מסוגל לזהות את אורכי הגל של הפלואורופורים המשמשים לצביעה.
פרוסות גידול ההידרוג'ל המכילות תאי MCL נוצרו עם הפרוטוקול שתואר לעיל. שלבי זרימת העבודה להדפסת תלת מימד ותרבית פרוסות גידול ההידרוג'ל מוצגים באיור 1A. מדפסת התלת מימד ששימשה שונתה להדפסת FRESH על ידי הוספת מאריך משאבת מזרק כמתואר בהינטון ואחרים 20 (איור 1B). עד חמש פרוסות הודפסו בבת אחת (איור 1C) ותורבו על תומך מסנן אחד (איור 1D). מדיום נוסף מתחת לתמיכת המסנן כדי לספק אספקת חומרים מזינים לפרוסות גידול ההידרוג'ל. טיפת מדיום נוספה על גבי כל פרוסת גידול הידרוג'ל כדי למנוע מהם להתייבש. סקירה כללית של חמש פרוסות גידול הידרוג'ל שתרבית על תומך מסנן אחד מוצגת באיור 1E, יחד עם תמונות תקריב של פרוסת הידרוג'ל. במהלך תקופת תרבית של 3 ימים, פרוסות גידול ההידרוג'ל היו יציבות ושמרו על המבנה שלהן (איור 2A). מיד אחרי ההדפסה, בועות אוויר היו נוכחות בפרוסות גידול ההידרוג'ל, אולם הן נעלמו במהלך הגידול (איור 2A).
הכדאיות של קו תאי MCL Jeko-1 שתורבת בפרוסות גידול הידרוג'ל (3D) בהשוואה לתאי Jeko-1 שגודלו בתרבית תרחיף (2D) הוערכה על ידי בדיקת אי הכללה כחולה של טריפן (איור 2B). לאחר 3 ימי תרבית, 80% מהתאים היו ברי קיימא, בהשוואה לכדאיות ראשונית של 88% מתאי Jeko-1 לפני ההדפסה. תאי Jeko-1 שגודלו בדו-ממד שמרו על הכדאיות הראשונית של 88%. לא היה הבדל משמעותי בין תאי Jeko-1 שגודלו בדו-ממד ובתלת-ממד. כדי להעריך אם תאי Jeko-1 מתרבים בפרוסות ההידרוג'ל, נקבע מספר התאים הממוצע של תאי Jeko-1 לכל פרוסת הידרוג'ל (איור 2C). בעוד ש-5x105 תאי Jeko-1 נכללו בכל פרוסה מיד לאחר ההדפסה (d0), מספר זה כמעט הוכפל ל-9.3x105 תאים לאחר 3 ימי תרבית.
התפוצה והסטטוס של תאי Jeko-1 שגודלו בפרוסות הידרוג'ל הוערכו על ידי הדמיה פלואורסצנטית חיה בארבעה צבעים (איור 2D) מיד לאחר ההדפסה או לאחר 3 ימי תרבית. לאחר ההדפסה, שחזורים תלת-ממדיים של פרוסות ההידרוג'ל Jeko-1 הראו התפלגות הומוגנית של תאים. רוב התאים היו חיוביים ל-TMRM, סמן לפוטנציאל הממברנה המיטוכונדריאלית22. מיעוט התאים היו חיוביים לפעילות Caspase-3, סמן לאינדוקציה של אפופטוזיס23, כמו גם לסמן התאים המתים PicoGreen21. לאחר 3 ימי תרבית, נצפתה עלייה במספר התאים לצד היווצרות אשכולות תאים. רוב התאים נשארו חיוביים ל-TMRM, בעוד שרק תאים מעטים נצבעו חיוביים לפעילות Caspase-3 או PicoGreen (איור 2C).
כדי לנתח אם תאי MCL בפרוסות הידרוג'ל מגיבים לכימותרפיה, תאי Jeko-1 שגודלו בתרבית תרחיף (2D) או בפרוסות הידרוג'ל (3D) טופלו בתרופה הכימותרפית Doxorubicin, שהיא חלק מהטיפול הסטנדרטי בחולי MCL24. המבנה הכללי של פרוסות ההידרוג'ל נשמר במהלך הטיפול בדוקסורוביצין (איור 3A). הכדאיות של תאי Jeko-1 שגודלו בפרוסות הידרוג'ל ירדה במינון בהתאם לטיפול בדוקסורוביצין. ה-IC50 של דוקסורוביצין בתאי ג'קו-1 גדל כאשר תאים תרבית בפרוסות הידרוג'ל (IC50=5.8 מיקרומטר) בהשוואה לתאי ג'קו-1 שגודלו בתרבית תרחיף דו-ממדית (IC50=2.0 מיקרומטר; איור 3B). הדמיה פלואורסצנטית חיה בארבעה צבעים הראתה TMRM מופחת ואות PicoGreen מוגבר בתאי Jeko-1 שגודלו בפרוסות הידרוג'ל בתגובה לטיפול בדוקסורוביצין, מה שאישר ירידה בכדאיות הנגרמת על ידי הטיפול. תמונות שהתקבלו מהדמיה פלואורסצנטית חיה בארבעה צבעים שוחזרו בתלת מימד, פולחו על סמך אות גרעיני DRAQ5, ונותחו באמצעות סקריפט Python המתואר בקובץ משלים 1. מסכת סגמנטציה לדוגמה מוצגת באיור משלים 1. מספר התא שזוהה מהאות DRAQ5 שימש לקביעת מספר התא הכולל. מספר התאים החיובי לפעילות TMRM, PicoGreen ו-Caspase-3 שימש לזיהוי אחוז התאים בני הקיימא, המתים או האפופטוטיים, בהתאמה. כימות של צביעת פלואורסצנטיות חיה בארבעה צבעים של תאי Jeko-1 שגודלו בפרוסות הידרוג'ל במשך 3 ימים עם או בלי 9 מיקרומטר דוקסורוביצין הראו כדאיות דומה לבדיקת אי הכללת הטריפן הכחול (טבלה 2).
בנוסף לקווי תאי MCL מבוססים, תאי MCL ראשוניים של שלושה חולי MCL שונים תורבבו בתרבית תרחיף דו-ממדית או בפרוסות הידרוג'ל תלת-ממדיות (איור 4, איור משלים 2). כפי שאומת על ידי פתולוג, כל שלושת ה-MCL (מטופל 1-3) היו בעלי מורפולוגיה קלאסית/שכיחה עם מדדי Ki67 של 20%-50%. תאי ה-MCL הראשוניים כללו את כל סוגי התאים שבודדו מבלוטות הלימפה של חולי MCL ולכן הכילו לא רק תאי MCL אלא גם סוגים אחרים של תאי חיסון או תאי סטרומל. הכדאיות של פרוסות ההידרוג'ל הראשוניות של MCL הוערכה על ידי מבחן ההדרה הכחולה של טריפאן. לאחר 4 ימים של תרבית, תאי MCL ראשוניים בפרוסות הידרוג'ל שמרו על כדאיות של 43.6% (45.7% ביום השלישי) בהשוואה לכדאיות בסיסית של 71.0% לפני ההדפסה (איור 4A). זה מייצג כדאיות מוגברת בהשוואה לתאים שגודלו בתרחיף (2D), שהיו בעלי הישרדות של 19.6% לאחר ארבעה ימי תרבית (28.4% ביום השלישי). כדאיות זו הודגמה על ידי הדמיה פלואורסצנטית חיה בארבעה צבעים, שבה רוב התאים היו חיוביים ל-TMRM וברי-קיימא, בעוד שתת-אוכלוסייה הייתה חיובית לפעילות Caspase-3 ו-PicoGreen, מה שמצביע על אפופטוזיס ומוות תאי, בהתאמה (איור 4B). נתוני הכימות של איור 4B מוצגים בטבלה 2. תאים ראשוניים משני חולי MCL נוספים הראו הישרדות מוגברת של תאים בתרבית בפרוסות ההידרוג'ל (3D) בהשוואה לתרבית התרחיף הדו-ממדית המתאימה (איור משלים 1).

איור 1: זרימת עבודה של הדפסת תלת מימד של פרוסות גידול הידרוג'ל.(A) זרימת עבודה של הדפסת תלת מימד ותרבית של תאים בפרוסות גידול הידרוג'ל. (B) מערך מדפסת המשמש להדפסה ביולוגית תלת-ממדית של פרוסות הידרוג'ל באמבט תומך ג'לטין. (ג) הדפסת שרטוט בתוכנת מדפסת התלת מימד. עד חמש פרוסות הידרוג'ל הודפסו בבת אחת. (D) ייצוג סכמטי של תרבית פרוסות ההידרוג'ל. פרוסות הידרוג'ל תורבבו על תומך פילטר בצלחת של 6 בארות. טיפת מדיום נוספה על גבי כל פרוסת הידרוג'ל כדי לשמור על הלחות שלהם. ניתן לתרבית עד חמש פרוסות הידרוג'ל על תומך מסנן אחד. (E) פרוסות הידרוג'ל מודפסות בתלת-ממד בתרבית על תומך מסנן, כפי שמוצג בתמונת סקירה או בתמונות תקריב. פסי קנה המידה מייצגים 5 מ"מ, 1 מ"מ או 200 מיקרומטר כפי שמצוין. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: תרבית של קו תאים של לימפומה של תאי מעטפת (MCL) בפרוסות הידרוג'ל מודפסות בתלת מימד.(A) תקריב של פרוסת הידרוג'ל מייצגת המכילה את קו תאי ה-MCL Jeko-1 לאחר הדפסה (d0) או לאחר 3 ימי תרבית (d3). סרגל קנה המידה מייצג 1 מ"מ. (B) כדאיות של תאי Jeko-1 שגודלו בתרחיף (2D) או בפרוסות הידרוג'ל (3D) למשך יומיים כפי שהוערך על ידי בדיקת אי הכללה כחולה של טריפאן. מוצג ממוצע ± SD של שלושה ניסויים עצמאיים בהדפסה ביולוגית. (C) מספר תא Jeko-1 הכלול בכל פרוסת הידרוג'ל מיד לאחר ההדפסה (d0) או לאחר עד 3 ימי תרבית (d1-d3). מוצג ממוצע ± SD של שלושה ניסויים עצמאיים בהדפסה ביולוגית. לא נצפה הבדל מובהק סטטיסטית (n.s., p > 0.05, מבחן מאן-וויטני). (D) שחזור תלת מימדי של פרוסות הידרוג'ל Jeko-1 ביום ההדפסה (d0) או אחרי 3 ימי תרבית (d3). המודל נוצר מערימות z של הדמיה פלואורסצנטית תלת מימדית חיה בארבעה צבעים. תאים חיים מוצגים באדום (TMRM), תאים אפופטוטיים בצהוב (פעילות אנזימטית Caspase-3), תאים מתים בירוק (PicoGreen) וגרעינים בכחול (DRAQ5). סרגל קנה המידה מייצג 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: טיפול תרופתי בקו תאי לימפומה של תאי מעטפת (MCL) בפרוסות הידרוג'ל. (A) תקריב של פרוסת הידרוג'ל מייצגת שמכילה את קו תאי ה-MCL Jeko-1 שטופל ב-3 מיקרומטר דוקסורוביצין במשך 3 ימים (d3). סרגל הסולם מייצג 1 מ"מ. (B) תאי Jeko-1 שגודלו בתרחיף (2D) או בפרוסות הידרוג'ל (3D) טופלו בריכוזים הולכים וגדלים של החומר הכימותרפי Doxorubicin במשך יומיים. כדאיות התאים הוערכה על ידי בדיקת אי הכללת טריפאן כחול. מוצג ממוצע ± SD של ארבעה ניסויים עצמאיים בהדפסה ביולוגית. (C) שחזור תלת מימדי של פרוסות הידרוג'ל Jeko-1 שטופלו ב-9 מיקרומטר דוקסורוביצין (Doxo) במשך 3 ימים (d3). המודל נוצר מערימות z של הדמיה פלואורסצנטית תלת מימדית חיה בארבעה צבעים. תאים חיים מוצגים באדום (TMRM), תאים אפופטוטיים בצהוב (פעילות אנזימטית Caspase-3), תאים מתים בירוק (PicoGreen) וגרעינים בכחול (DRAQ5). סרגל קנה המידה מייצג 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: תרבית של תאי MCL ראשוניים בפרוסות הידרוג'ל מודפסות בתלת-ממד. (A) כדאיות של תאי MCL ראשוניים שגודלו בתרחיף (2D) או בפרוסות הידרוג'ל (3D) למשך עד 4 ימים, כפי שהוערך על ידי בדיקת אי הכללה כחולה של טריפאן. מוצגת כדאיות ממוצעת של ניסוי אחד. (B) שחזור תלת מימדי של תאי MCL ראשוניים שגודלו בפרוסות הידרוג'ל (3D) במשך 3 ימים. ערימות Z נוצרו מפרוסות הידרוג'ל שהוכתמו בצביעה חיה בארבעה צבעים ונותחו באמצעות מיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי (CLSM). תאים חיים מוצגים באדום (TMRM), תאים אפופטוטיים בצהוב (פעילות אנזימטית Caspase-3), תאים מתים בירוק (PicoGreen) וגרעינים בכחול (DRAQ5). סרגל קנה המידה מייצג 50 מיקרומטר. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
| כתם | TMRM | DRAQ5 | מצע NucView405 Caspase-3 | פיקוגרין |
| עירור / פליטה | 548 ננומטר/574 ננומטר | 647 ננומטר/681 ננומטר | 429 ננומטר / 469 ננומטר | 488 ננומטר / 520 ננומטר |
טבלה 1: מקסימום עירור/פליטה של הכתמים המשמשים להדמיית פלואורסצנציה תלת מימדית חיה בארבעה צבעים.
| לדוגמה | % מהתאים | ||
| TMRM (תאים ברי קיימא) | PicoGreen (תאים מתים) | Caspase-3 (תאים אפופטוטיים) | |
| Jeko-1 Ctrl | 83 | 23.6 | 18.3 |
| ג'קו-1 דוקסו 9 מיקרומטר | 27.6 | 81.3 | 86.6 |
| מטופל MCL ראשי 1 | 75.2 | 31.1 | 33.1 |
טבלה 2: כימות של שחזורים תלת מימדיים של צביעה חיה בארבעה צבעים של פרוסות גידול הידרוג'ל מתורבתות. פרוסות גידול הידרוג'ל תורבבו במשך 3 ימים והכילו תאי Jeko-1 שגודלו עם או בלי טיפול ב-9 מיקרומטר דוקסורוביצין או תאי MCL ראשוניים (מטופל 1).
איור משלים 1: זיהוי תאים משחזורים תלת מימדיים של צביעה חיה בארבעה צבעים. שחזורים תלת מימדיים של תמונה קונפוקלית המסומנת ב-DRAQ5 המתקבלים מ-(A) צביעה חיה בארבעה צבעים ו-(B) תמונה מפולחת בערוץ זה שנוצרה באמצעות צינור ניתוח ההדמיה של Python. סרגל קנה המידה מייצג 200 מיקרומטר. אנא לחץ כאן להורדת איור זה.
תוספת 2: תרבית של תאי MCL ראשוניים של חולים 2 ו-3 בפרוסות גידול הידרוג'ל.כדאיות של תאי MCL ראשוניים של (A) מטופל 2 או (B) מטופל 3 שתורבת בתרחיף (2D) או בפרוסות הידרוג'ל (3D) למשך עד 4 ימים כפי שהוערך על ידי בדיקת אי הכללה כחולה של טריפאן. מוצגת כדאיות ממוצעת של ניסוי אחד. אנא לחץ כאן להורדת איור זה.
קובץ משלים 1: הוראות לניתוח שחזורים תלת מימדיים המתקבלים מצביעה חיה בארבעה צבעים. אנא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
קובץ משלים 2: סקריפט Python לניתוח שחזורים תלת מימדיים המתקבלים מצביעה חיה בארבעה צבעים. אנא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
קידוד משלים File 1: Stl. קובץ המכיל את התוכנית לפרוסות גידול ההידרוג'ל. אנא לחץ כאן להורדת קובץ זה.
פרוסות גידול ההידרוג'ל המתוארות בפרוטוקול זה מציעות מודל MCL המחקה את מבנה בלוטות הלימפה, ומאפשר לחקור את הישרדות תאי MCL ותגובה לתרופות במיקרו-סביבת גידול תלת מימדית שנוצרת על ידי הדפסה ביולוגית.
שיטות ההדפסה הביולוגית הנפוצות ביותר מבוססות על אקסטרוזיה, שבה דיו ביולוגי נפלט דרך מערכת חלוקה. בהדפסת הזרקת דיו, למשל, דיו ביולוגי מקושר במהירות לאחר התצהיר ליצירת מבנים תלת מימדיים25. עם זאת, גישה זו מגיעה עם מגבלות, במיוחד מבחינת צמיגות החומרים המשמשים והיכולת לערום שכבות. לעומת זאת, הדפסת ביולוגית תלת מימדית שחול משובצת מבוססת מזרק, כגון ההדפסה הביולוגית FRESH המשמשת בפרוטוקול זה, מיישמת גישת ג'ל בג'ל. זה מאפשר הדפסה של דיו ביולוגי בעל צמיגות נמוכה, כמו קולגן, למבנים יציבים, מה שמאפשר לחקות את המיקרו-סביבה המורכבת של הגידול20,26. בעוד שמדפסות תלת מימד שפותחו במיוחד עבור הדפסה ביולוגית יכולות להיות יקרות, השיטה המוצגת כאן מציעה נקודת כניסה נגישה יותר. ניתן להתאים אותו למדפסות שחול סטנדרטיות עם שינויים פשוטים יחסית. ניתן להדפיס שינויים אלה בתלת מימד עם חוטים במחירים סבירים, והעיצובים זמינים כמשאבי קוד פתוח, למשל, על ידי Hinton et al.20. עם זאת, חשוב לציין שהכנת אמבט התמיכה בהידרוג'ל להדפסה ביולוגית FRESH רגישה מאוד לטמפרטורה ודורשת תשומת לב קפדנית במהלך הכנת התרחיץ.
לעתים קרובות, מודלים של גידולים מודפסים בתלת מימד מתורבתים במערכות צפות, חסרות את שיפוע החמצן in vivo 25, או בתרביות שבב מיקרופלואידיות27, הלוכדות רמה גבוהה של מורכבות אך בעלות תפוקה נמוכה ודורשות תחזוקה גבוהה. ניתן להתגבר על מכשולים אלה באמצעות פרוסות גידול ההידרוג'ל המתוארות כאן. ההגדרה של תרבית של עד חמש פרוסות גידול הידרוג'ל בממשק אוויר-נוזל נגזרת מתרבית של פרוסות גידול חתוכות במדויק של גידולים מוצקים28. הממברנה של תמיכת המסנן המשמשת בפרוטוקול זה מורכבת מממברנה פוליטטרפלואורואתילן (PFTE) בגודל נקבוביות של 0.4 מיקרומטר, המאפשרת חילופי חומרים מזינים אך מונעת התקשרות תאית או נדידת תאים29. התרבית על קרום ה-PTFE מספקת תמיכה פיזית לפרוסות כדי לשמור על יציבותן ולמנוע מהן להיקרע או להתפרק. בנוסף, הם מספקים ממשק אוויר-נוזל, המספקים חמצן בעיקר מהאוויר שמעל וחומרים מזינים מהמדיום שמתחת למסנן30. המערכת משלבת אפוא וריאציות מרחביות-זמניות באספקת חומרים מזינים, התפשטות תאים וחמצון, כפי שהן עשויות להתרחש in vivo25. תאי MCL ראשוניים, שגודלו בפרוסות גידול ההידרוג'ל על תומך מסנן, שמרו על כדאיות של מעל 40% למשך 4 ימים, שהייתה עדיפה על הכדאיות שנצפתה בתרבית תרחיף דו-ממדית (איור 3A, איור משלים 2). חקירות נוספות צריכות לבחון האם ניתן להשיג כדאיות ממושכת על ידי הוספת ציטוקינים או גידול משותף עם פיברובלסטים המבטאים CD40L, כפי שתואר בספרואידים ואורגנואידים של גידול ראשוני של לימפומה של תאי B 6,19,30 או תרביות משותפות של תאי MCL ראשוניים עם תאי פיברובלסטים L המבטאים CD40L14. יש לשקול שילוב גישות כאלה בפרוסות גידול ההידרוג'ל כדי לשפר את התרבות של תאי MCL ראשוניים כמו גם את הדמיון למיקרו-סביבה המקומית.
בלוטות הלימפה מכילות רשת מפותחת של סיבי מטריצה חוץ-תאיים. בשל הדפוס שלהם, הם ידועים כסיבים רשתיים. בעיקר, סיבים אלה מורכבים מקולגן ומרכיבים ספציפיים לקרום הבסיס 31,32,33. כדי ליצור מטריצה הדומה למצב in vivo בבלוטות הלימפה, הדיו הביולוגי המשמש ליצירת פרוסות גידול ההידרוג'ל מורכב מקולגן מסוג I ומטריג'ל, המורכב מארבעת חלבוני ה-ECM העיקריים של קרום הבסיס למינין, קולגן IV, אנטקטין ופרלקן34. יתר על כן, אלגינט מתווסף לדיו הביולוגי כדי לייצב את פרוסות גידול ההידרוג'ל, מה שמאפשר תרבית ממושכת והובלה מכלי אחד למשנהו באמצעות מרית. בדיקת הידרוג'לים שונים המכילים קולגן ואלגינט הדגימה את הכדאיות התאית הגבוהה ביותר בשילוב עם פרוסת הידרוג'ל יציבה ועמידה בעת שימוש בדיו ביולוגי עם 0.5% אלגינט ו-20% קולגן (הנתונים לא מוצגים). מלבד הרכיבים, קוטר פרוסת גידול ההידרוג'ל של 0.8 ס"מ דומה עוד יותר לקוטר בלוטת הלימפה הממוצע של 1 ס"מ35. הדמיה תלת-ממדית חיה של פרוסות גידול ההידרוג'ל הראתה עוד פיזור אחיד של תאים (איור 2C).
כאן, היכולת לטפל בפרוסות ההידרוג'ל בתרופות הוכחה על ידי טיפול בדוקסורוביצין, שהוא חלק מטיפול R-CHOP (ריטוקסימאב, ציקלופוספאמיד, דוקסורוביצין, וינקריסטין, פרדניזון), טיפול סטנדרטי לתת-קבוצות של חולי MCL מבוגרים24. בהשוואה לתרביות דו-ממדיות, ניתן לחקור את ההשפעות של מיקרו-סביבת הגידול על השפעות הטיפול בפרוסות גידול ההידרוג'ל. כפי שמוצג באיור 3, תאי Jeko-1 שגודלו בפרוסות הידרוג'ל היו עמידים יותר לטיפול בדוקסורוביצין מאשר תאים בתרבית דו-ממדית. זה עולה בקנה אחד עם תצפיות כי המטריצה החוץ-תאית יכולה להשפיע על תגובות לתרופות ולעתים קרובות לשפר את העמידות לתרופות באמצעות ויסות נוקשות הגידול36, תקשורת תא-תא37 ואספקת תרופות38. בנוסף, ניתוח זרימה ציטומטרי, כמו גם צביעה אימונוהיסטוכימית או אימונופלואורסצנטית מרובה, יכולים לתת תובנות עמוקות יותר לגבי תגובת הטיפול של תאים בודדים בפרוסות גידול ההידרוג'ל.
לסיכום, פרוטוקול זה מתאר את היצירה והתרבות של פרוסות גידול הידרוג'ל, המייצגות מודל בלוטות לימפה תלת מימדיות המחקה את מבנה בלוטות הלימפה התלת מימדיות המקוריות. הוא טומן בחובו פוטנציאל להרחיב את היישום מתאי MCL להתוויות לימפומה ראשוניות אחרות.
מחקר זה נתמך על ידי קרן רוברט-בוש ומשרד המדע, המחקר והאמנויות באדן-וירטמברג (3R-Network BW).
אנו מודים לקרסטין וילק על הסיוע הטכני המצוין שלה וליאנג ז'אנג על עזרתו רבת הערך בניתוח התמונות התלת מימדיות.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| µ-slide 8 באר זכוכית תחתית | ibidi GmbH | 80827 | שקופיות תחתית זכוכית המשמשות להדמיה חיה של פרוסות הידרוג'ל |
| 10x PBS | Carl Roth GmbH + Co.KG | 9150.1 | רכיב דיו ביולוגי |
| 10X RPMI-1640 בינוני | סיגמא-אולדריץ' | ₪245 | רכיב דיו ביולוגי |
| מזרק אטום לגז 2.5 מ"ל דגם 1002 TLL | המילטון | 81420 | מזרק להדפסה ביולוגית |
| מדפסת שחול תלת מימדית, PrintrBot פשוט | Printrbot | שינוי עצמי כדי לאפשר הדפסת דיו ביולוגי | |
| צלחת 6 בארות | Th. Geyer GmbH & Co.KG | 7696790 | תרבות פרוסות ההידרוג'ל |
| מערכות סינון ואקום לבקבוקים, ממברנת PES, 500 מ"ל, 0.22 ומיקרו; גודל נקבוביות M, 70 קרום בקוטר מ"מ | קורנינג בע"מ | 513-3355 | סינון סטרילי של מאגרים |
| סידן כלוריד מיובש | Carl Roth GmbH + Co.KG | T885.2 | רכיב של מאגר כביסה ותמיסת ג'לטין |
| קולגן I מחולדה | קורנינג בע"מ | CLS354249 | רכיב דיו ביולוגי |
| תוכנת Cura גרסה 15.04.5 להדפסת תלת מימד | אולטימייקר | תוכנה המשמשת להדפסת תלת מימד | |
| DRAQ5 | ביוסטטוס בע"מ | DR50050 | כתם להדמיה חיה של פרוסות הידרוג'ל |
| חומצה אתילנדיאמינטטראצטית (EDTA) מלח דיסודיום דיהידראט | סיגמא-אולדריץ' | E5134 | רכיב של מאגר המסת אלגינט |
| מונה תאים אוטומטי EVE | ננו אנטק בע"מ | 10027-452 | מונה תאים |
| פלקון בקטריולוגי צלחות פטרי עם מכסה, קוטר 35 מ"מ | בז | 351008 | ממולא בתמיסת ג'לטין ליצירת אמבט תמיכה להדפסה ביולוגית |
| צינורות פלקון, 50 מ"ל | Sarstedt AG & Co.KG | 62.547.254 | |
| סרום עגל עוברי | סיגמא-אולדריץ' | S0615 | תוסף מדיום תרבית תאים |
| ג'לטין מעור חזיר | סיגמא-אולדריץ' | G1890 | המרכיב העיקרי של תמיסת הג'לטין |
| HEPES, חומצה חופשית, בביולוגיה מולקולרית | Merck KGaA | CAS 7365-45-9 | רכיב של מאגר כביסה ותמיסת ג'לטין |
| קו תאים Jeko-1 MCL | ATCC | CRL-3006 | קו תאי MCL |
| מגבונים מדויקים של KIMTECH Science | תאגיד קימברלי קלארק | 7551 | משמש לשאיבת עודפי מים מתמיסת הג'לטין ולהסרת טיפות מפיית מדפסת התלת-ממד |
| תוכנת LAS X גרסה 3.5.7.23225 | לייקה | תוכנה המשמשת לשחזורי תלת מימד | |
| Leica TCS SP8 מיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי | לייקה | TCS SP8 | מיקרוסקופ קונפוקלי להדמיה חיה |
| צנצנת מייסון, חצי ליטר רגיל, 16 אונקיות | בול קורפוריישן | G001 | צנצנת בה מכינים את תמיסת הג'לטין |
| מטריצת ממברנת הבסיס של Matrigel Growth Factor Reduced (GFR) | קורנינג בע"מ | 356231 | רכיב דיו ביולוגי |
| תוספת תרבית תאים מילית, 0.4 ומיקרו; גודל נקבוביות M | Merck KGaA | פיקמורג 50 | תמיכה בסינון לפרוסות הידרוג'ל |
| מצע NucView 405 Caspase-3, 1 מ"מ ב-1x PBS | ביוטיום | 10405 | כתם להדמיה חיה של פרוסות הידרוג'ל |
| בלנדר מסדרת Oster Professional | אוסטר | BPST02-B00 | בלנדר ליצירת תמיסת ג'לטין |
| פניצילין/סטרפטמיצין | ג'יבקו | 15140163 | תוסף למדיום תרבית תאי MCL |
| Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay-Kits und dsDNA-Reagenzien | Invitrogen | עמ' 7589 | כתם להדמיה חיה של פרוסות הידרוג'ל |
| רוטינה 35 ר | הטיך | 24573 | צנטריפוגה של תאים |
| צנטריפוגה ROTINA 38/38R | הטיך | Z720109 | צנטריפוגציה של תמיסת ג'לטין |
| RPMI-1640+GlutaMAX | ג'יבקו | 61870036 | בסיס מדיום תרבית לתאי MCL |
| נתרן אלגינט | שיתוף פעולה FMC | GQ9109901 | רכיב דיו ביולוגי |
| נתרן כלורי | Merck KGaA | 1.06404 | רכיב של מאגר המסת אלגינט |
| נתרן ציטראט | Carl Roth GmbH + Co.KG | 3580.1 | רכיב של מאגר המסת אלגינט |
| צינוריות יישום קהות Sterican 21G 0.8x22 מ"מ | ב.בראון | 9180109 | זרבובית להדפסת תלת מימד |
| טטרמתילרודמין-מתילאסטר-פרכלורט (TMRM) | סיגמא-אולדריץ' | T5428 | כתם להדמיה חיה של פרוסות הידרוג'ל |
| טריפאן כחול, 0.4% | סיגמא-אולדריץ' | T8154 | כתם לניתוח כדאיות |
| מדחום עמיד למים | VWR | 620-2099 | מדחום לניטור הטמפרטורה של תמיסת הג'לטין |