פרוטוקול זה מציג שיטה להערכת אפופטוזיס בתיווך מיני חמצן תגובתיים (ROS) המושרה על ידי תרכובות טבעיות בתאי סרטן ריאות של תאים לא קטנים (NSCLC).
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר מחקר
* These authors contributed equally
פרוטוקול זה מציג שיטה להערכת אפופטוזיס בתיווך מיני חמצן תגובתיים (ROS) המושרה על ידי תרכובות טבעיות בתאי סרטן ריאות של תאים לא קטנים (NSCLC).
מחקר זה בוחן את הפוטנציאל האנטי-סרטני של Pileostegia tomentella, תוך התמקדות מיוחדת ביכולתו לגרום לאפופטוזיס קלאסי בתאי סרטן ריאות של תאים לא קטנים (NSCLC) H1299 באמצעות מסלולים המתווכים על ידי מיני חמצן תגובתיים (ROS). באמצעות גישת בידוד מונחית ביו-אקטיביות, שתי תרכובות פעילות, umbelliferone (UMB) ו-epi-Vogeloside, זוהו כמרכיבים הציטוטוקסיים העיקריים. שתי התרכובות הראו השפעות מעכבות משמעותיות על כדאיות התאים וגרמו למעשה למוות של תאים אפופטוטיים בתאי H1299. חקירות מכניסטיות הראו כי טיפול ב-UMB ואפי-ווגלוזיד הוביל לעלייה ניכרת ברמות ה-ROS התוך-תאי, מה שמרמז על מתח חמצוני כמתווך מרכזי. ניתוח כתמים מערביים חשף רמות מוגברות של קספאז-3 שסוע וירידה בביטוי של החלבון האנטי-אפופטוטי Bcl-2, מה שמעיד על הפעלת המסלול האפופטוטי המיטוכונדריאלי הפנימי. בנוסף, פרופיל טרנסקריפטומי הראה שינויים נרחבים בביטוי הגנים, מה שתמך עוד יותר בשיבוש ההומאוסטזיס התאי. תוצאות אלה מצביעות על כך ש-Pileostegia tomentella ומרכיביו הפעילים מבטיחים כסוכנים טיפוליים פוטנציאליים לסרטן הריאות.
מחלת הסרטן מהווה אתגר עולמי אדיר לבריאות הציבור, המאופיין בשיעור תמותה שנתי משמעותי. סרטן ריאות של תאים לא קטנים (NSCLC) הוא המניע העולמי העיקרי למקרי מוות הקשורים לסרטן, ומהווה כ-85% ממקרי סרטן הריאות1. סרטן, משחק גומלין מורכב מטבעו של תהליכים מולקולריים ותאיים, מושפע באופן קריטי משיבושים בהומאוסטזיס של מיני חמצן תגובתיים (ROS). ROS, הכוללים מחמצנים לא יציבים כגון אניונים סופראוקסיד, רדיקלים הידרוקסיל ומי חמצן, הם תוצרי לוואי של חילוף חומרים תאי תקין ומבצעים פונקציות חיוניות באיתות, התפשטות, בידול ואפופטוזיס2. חוסר איזון בריכוזי ROS יכול לזרז מתח חמצוני, מה שעלול להפעיל מסלולי מוות תאי מתוכנתים, במיוחד אוטופגיה ואפופטוזיס, ובכך לעכב את התפשטות תאי הסרטן והישרדותם3. כתוצאה מכך, ROS מפגינים תפקיד כפול באונקולוגיה, ופועלים הן כמקדמים והן כמדכאים של התקדמות הגידול. בעשור האחרון, האסטרטגיות הטיפוליות של NSCLC התקדמו משמעותית, עם פיתוח של חומרים אנטי-סרטניים חדשים שנועדו לנצל את האופי הדיכוטומי הזה של ROS המייצגיםתחום מחקר תוסס במיוחד.
ידוע כי חומרים אנטי-סרטניים רבים המסונתזים כימית, כגון אדריאמיצין (דוקסורוביצין), ציספלטין וציקלופוספאמיד, גורמים לאפופטוזיס בתאי סרטן על ידי קידום ייצור ROS5. למרות ההתקדמות בטיפולים ממוקדים ונוגדנים אימונותרפיים, כימותרפיה מבוססת פלטינום ממשיכה להיות אבן הפינה של הטיפול בחולי NSCLC. עם זאת, הופעת עמידות ותופעות לוואי שליליות מכימותרפיה מחייבת פיתוח תרופות חדשות נגד NSCLC. כתוצאה מכך, חקר מקורות טבעיים לתרכובות אנטי-סרטניות זוכה להכרה הולכת וגוברת בחשיבותה ובפוטנציאל שלה. מחקרים אחרונים הדגישו כי תמציות צמחים מסוימות ומרכיביהן הפעילים מציגים תכונות אנטי-סרטניות חזקות, המאופיינות ברעילות נמוכה, ספציפיות גבוהה ויכולת להתמקד במספר מסלולים6. יש לציין כי חלק מהתרכובות הטבעיות הללו יכולות לווסת את רמות ה-ROS והאיתות7, ובכך לגרום לאוטופגיה או אפופטוזיס בתאים סרטניים ולהפעיל השפעות טיפוליות 8,9.
Pileostegia tomentella יד. Zucc, צמח רב-שנתי מהסוג Clematis ממשפחת Buttercupaceae, נמצא בעיקר באזורים כמו יפן, צפון קוריאה וסין. מרכיביו השונים של הצמח, לרבות שורשים, גבעולים, עלים ופרחים, ידועים בסגולותיהם הרפואיות, ומציעים יתרונות כמו פינוי חום, ניקוי רעלים, הפחתת נפיחות, שיכוך כאבים והשפעות אנטיבקטריאליות ואנטי דלקתיות. מחקרים אחרונים שפכו אור על הפעילויות האנטי-סרטניות של תמציות או חומרים פעילים של Hoshi Hairy Vine, והדגימו השפעות מדכאות גידול על מגוון סוגי סרטן, כולל גליומה, סרטן השד, המעי הגס וצוואר הרחם10. עם זאת, המנגנונים האנטי-סרטניים הספציפיים של Pileostegia tomentella, במיוחד תפקידו הפוטנציאלי בוויסות ROS כדי לגרום לאוטופגיה או אפופטוזיס בתאים סרטניים, נותרו ברובם לא נחקרו.
למרות העניין המתעורר בתרכובות טבעיות לטיפול בסרטן, המנגנונים הפרו-אפופטוטיים של מרכיבי מפתח מ-Pileostegia tomentella בסרטן הריאות נותרו לא נחקרים. מחקר זה הוא חלוץ בזיהוי וניתוח מכניסטי של umbelliferone ו-epi-Vogeloside כמשפרי אפופטוזיס סלקטיביים תלויי ROS ב-NSCLC.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הריאגנטים והציוד המשמשים במחקר זה מפורטים בטבלת החומרים.
1. הרכב כימי של Pileostegia tomentella וחיזוי מטרות NSCLC
המרכיבים הכימיים של Pileostegia tomentella נותחו באמצעות כרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים בשילוב עם ספקטרומטריית מסה של מלכודת יונים ליניארית (HPLC-LTQ/MS). התמציות הומסו בממיסים מתאימים וסוננו לפני ההזרקה. הפרדה כרומטוגרפית הושגה באמצעות עמודת פאזה הפוכה תחת תוכנית פליטת שיפוע המותאמת למחלקות התרכובת. נתוני ספקטרומטריית מסה נאספו במצב יינון אלקטרוספריי חיובי על פני טווח מסה של 100-1500 m/z. מבנים מולקולריים של תרכובות שזוהו שורטטו באמצעות תוכנת שרטוט כימית גנרית ונשמרו בפורמט SDF. קבצים מבניים אלה הוגשו לכלי חיזוי מטרות מקוון כדי לזהות מטרות ביולוגיות פוטנציאליות, כאשר 20 המטרות המובילות נבחרו לאימות נוסף. מטרות הקשורות ל-NSCLC אוחזרו ממאגר גנים נגיש לציבור. המטרות החופפות משני מערכי הנתונים זוהו כמטרות טיפוליות פוטנציאליות של Pileostegia tomentella.
2. בניית רשת רכיב-יעד
נתוני אינטראקציה בין חלבון לחלבון עבור מטרות חזויות התקבלו ממסד נתונים של אינטראקציה חלבונית בגישה פתוחה. נתוני אינטראקציה יובאו לתוכנת הדמיית רשת כללית כדי לבנות את רשת האינטראקציה בין תרכובת למטרה. מאפיינים טופולוגיים של הרשת, כולל מרכזיות דרגה, בין וקרבה, נותחו באמצעות כלים אנליטיים מובנים לזיהוי צמתים רגולטוריים מרכזיים.
3. ניתוח העשרה במסלול KEGG
העשרה פונקציונלית של חלבוני מטרה חזויים בוצעה באמצעות ניתוח מסלול KEGG באמצעות כלי העשרה זמינים לציבור ותוכנות סטטיסטיות. מסלולים עם ערכי p מותאמים נמוכים מ-0.05 נחשבו משמעותיים. מסלולים משמעותיים שולבו עם נתוני יעד מורכב כדי לבנות רשת אינטראקציה "תרכובת-מטרה-מסלול" באמצעות תוכנת הדמיית רשת גנרית. ניתוח טופולוגיית הרשת הדגיש מרכזי רגולציה ביולוגיים מרכזיים, הממחישים את המנגנונים הרב-רכיביים ומרובי המטרות של Pileostegia tomentella.
4. מיצוי מרכיבי Pileostegia tomentella
גבעולי גפן מיובשים של Corydalis spinosa נטחנו לאבקה דקה. החומר האבקתי הופק עם 70% אתנול בטיפול קולי בטמפרטורת החדר לתקופה מוגדרת. התמצית הגולמית סוננה ורוכזה בלחץ מופחת. חלוקה נוזלית-נוזלית בוצעה באמצעות ממיסים בעלי קוטביות הולכת וגוברת, כולל אתר נפט, אתיל אצטט ו-n-בוטנול. מקטע אתיל אצטט, שהראה את הפעילות הביולוגית הגבוהה ביותר בבדיקות ראשוניות, נאסף, רוכז, יובש בהקפאה ונשמר בטמפרטורה של -20 מעלות צלזיוס עד לשימוש נוסף.
5. קו תאים ותנאי טיפול
קו תאי סרטן הריאות האנושי H1299 תורבת במדיום RPMI 1640 בתוספת 10% סרום בקר עוברי בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס באווירה לחה המכילה 5% CO2. התאים נזרעו בצפיפות מתאימה ואפשרו להם להיצמד למשך הלילה לפני הטיפול. התאים נחשפו לריכוזים משתנים (500 מיקרוגרם/מ"ל, 750 מיקרוגרם/מ"ל ו-1,000 מיקרוגרם/מ"ל) של שתי תרכובות בדיקה, UMB ו-epi-Vogeloside, כמפורט בטבלה 1. לאחר 24 שעות של דגירה בתנאי תרבית סטנדרטיים, התאים נאספו לניתוחים הבאים כדי להעריך את ההשפעות הביולוגיות של התרכובות.
6. בדיקת MTT לכדאיות התא
ההשפעות הציטוטוקסיות של התרכובות הוערכו באמצעות בדיקת MTT קולורימטרית. תאי H1299 נזרעו לתוך צלחות של 96 בארות בצפיפות מוגדרת ואפשרו להם להיצמד למשך הלילה. לאחר מכן התאים טופלו בתרכובות הבדיקה במשך 72 שעות בתנאי תרבית סטנדרטיים. לאחר הטיפול, תמיסה של MTT נוספה לכל באר והודגרה כדי לאפשר לתאים ברי קיימא להמיר MTT לגבישי פורמזן סגולים בלתי מסיסים. לאחר הדגירה, המדיום הוסר, וגבישי הפורמזן הומסו בדימתיל סולפוקסיד (DMSO). הספיגה נמדדה ב-570 ננומטר באמצעות קורא מיקרו-פלטות. ערכי הספיגה תואמים את כדאיות התא, ומספקים הערכה כמותית של ציטוטוקסיות מורכבת.
7. הערכת שלמות הממברנה באמצעות שחרור LDH
שלמות קרום התא הוערכה על ידי מדידת שחרור לקטט דהידרוגנאז (LDH) כאינדיקטור לציטוטוקסיות. תאי H1299 טופלו בתרכובות הבדיקה במשך 24 שעות, 48 שעות או 72 שעות. בכל נקודת זמן, סופרנטנטים תרבית נאספו ועברו בדיקת פעילות LDH על פי פרוטוקול היצרן. מכיוון ש-LDH משתחרר רק מתאים עם ממברנות פגומות, ערכי הספיגה הנמדדים משקפים את היקף הנזק לממברנה שנגרם על ידי התרכובות לאורך זמן.
8. אנליזה ציטומטרית זרימה של אפופטוזיס
אינדוקציה של אפופטוזיס הוערכה על ידי זרימה ציטומטרית באמצעות צביעת Annexin V ו-7-Aminoactinomycin D (7-AAD). לאחר הטיפול בתרכובות הבדיקה, תאי H1299 נאספו על ידי צנטריפוגה, נשטפו במי מלח קרים עם חוצץ פוספט והושעו מחדש במאגר קשירה. לאחר מכן הודגרו התאים עם נספח V מצומד לצבע פלואורסצנטי ו-7-AAD על פי פרוטוקול הצביעה. הדגימות נותחו מיד על ידי ציטומטריית זרימה. שיטה זו אפשרה התמיינות בין תאים ברי קיימא (לא מוכתמים), תאים אפופטוטיים מוקדמים (Annexin V חיובי, 7-AAD שלילי) ותאים אפופטוטיים או נמקיים מאוחרים (חיוביים לשני הכתמים).
9. כימות ROS תוך-תאי
רמות מיני החמצן התגובתי התוך-תאיים (ROS) נמדדו באמצעות מבחן מבוסס פלואורסצנטי. תאי H1299 נזרעו בצלחות של 12 בארות בצפיפות של 1 × 105 תאים לבאר ותרבו עד שהגיעו לכ-80% מפגש. לאחר מכן התאים טופלו בתרכובות המיועדות במשך 72 שעות. לאחר הטיפול, התאים הודגרו עם 1 מיקרומטר של הגשושית הפלואורסצנטית הרגישה ל-ROS 2',7'-dichlorodihydrofluorescein diacetate (DCFH-DA) ב-37 מעלות צלזיוס למשך 30 דקות בחושך. לאחר הדגירה נקצרו תאים, ועוצמת הקרינה נמדדה באורך גל פליטה של 525 ננומטר באמצעות קורא מיקרו-פלטות פלואורסצנטיות. עוצמת הקרינה תואמת את רמות ה-ROS התוך-תאי.
10. PCR כמותי בזמן אמת (RT-qPCR)
תאי H1299 נזרעו בצלחות של 6 בארות בצפיפות של 2 × 105 תאים לבאר ותרבו עד שהגיעו לכ-80% מפגש. לאחר מכן התאים טופלו בתרכובות המיועדות במשך 72 שעות. סך ה-RNA הופק בשיטת פנול-כלורופורם בשימוש נרחב. סינתזת DNA משלימה (cDNA) בוצעה באמצעות ערכת שעתוק הפוך על פי הוראות היצרן. PCR כמותי בזמן אמת (qRT-PCR) נערך באמצעות מערכת PCR בזמן אמת עם פריימרים ספציפיים (מפורטים בטבלה 2). רמות ביטוי הגנים היחסיות חושבו בשיטת Ct השוואתית, כאשר גנים לניהול משק בית שימשו כבקרות פנימיות.
11. אימונובלוטינג לביטוי חלבונים
ניתוח כתמים מערביים נערך על תאי H1299 שגודלו וטופלו. סך החלבון הופק באמצעות מאגר ליזה מתאים, וליזטים הובהרו על ידי צנטריפוגה ב-10,000 × גרם למשך 15 דקות ב-4 מעלות צלזיוס. ריכוזי החלבון נקבעו באמצעות בדיקה ספקטרופוטומטרית. כמויות שוות של חלבון מכל דגימה הופרדו על ידי SDS-PAGE והועברו לקרום פוליווינילידן דיפלואוריד (PVDF). הממברנות נחסמו עם חלב יבש ללא שומן 5% למשך שעתיים בטמפרטורת החדר ולאחר מכן הודגרו למשך הלילה ב-4 מעלות צלזיוס עם נוגדנים ראשוניים ספציפיים ל-Bcl-2, caspase-3, PARP1, BAX, GADHH וטובולין בדילולים אופטימליים. לאחר הכביסה, הממברנות הודגרו בנוגדנים משניים מתאימים למשך שעתיים בטמפרטורת החדר. רצועות חלבון הודגמו וצולמו באמצעות מצע כימילומינסנטי. ניתוח צפיפות בוצע באמצעות תוכנת ניתוח תמונה, ועוצמות הפס נורמלו ל-GAPDH וטובולין כבקרות טעינה.
12. מיקרוסקופיה אימונופלואורסצנטית של Caspase-3
הביטוי והלוקליזציה התת-תאית של קספאז-3, חלבון אפופטוטי מרכזי, הוערכו על ידי צביעה אימונופלואורסצנטית. לאחר הטיפול, תאי H1299 קובעו עם פרפורמלדהיד, חדירו בתמיסת דטרגנט עדינה והודגרו עם נוגדן ראשוני נגד קספאז-3. לאחר מכן הוחל נוגדן משני עם תווית פלואורסצנטית כדי לזהות את אות הנוגדן הראשוני. גרעיני התאים הוכתמו באמצעות צבע פלואורסצנטי קושר DNA. התאים המוכתמים הודגמו תחת מיקרוסקופ פלואורסצנטי. העוצמה וההתפלגות התאית של אות הקרינה סיפקו מידע איכותי ומרחבי על הפעלת קספאז-3, ותמכו במעורבותו בתגובה האפופטוטית הנגרמת על ידי התרכובת.
13. רצף טרנסקריפטומי
כדי לאפיין את תגובת השעתוק התאית לתרכובות הבדיקה, ה-RNA הכולל חולץ מתאי H1299 שטופלו והוערך לשלמות באמצעות שיטות בקרת איכות סטנדרטיות. ספריות ריצוף הוכנו בהתאם לפרוטוקולים שנקבעו והיו נתונים לריצוף תפוקה גבוהה באמצעות פלטפורמת ריצוף מהדור הבא. נתוני ריצוף גולמיים עובדו באמצעות צינור ביואינפורמטיקה קונבנציונלי, שכלל סינון בקרת איכות, התאמה לגנום הייחוס וכימות שפע התעתיק. ניתוח ביטוי גנים דיפרנציאלי נערך כדי לזהות גנים עם שינויים מובהקים סטטיסטית בביטוי לאחר הטיפול. ניתוחי העשרה ומסלול של הגנים המתבטאים באופן דיפרנציאלי בוצעו כדי להבהיר את התהליכים הביולוגיים העיקריים המושפעים מהתרכובות, ובכך לספק סקירה מקיפה של ההשפעות המולקולריות שלהם.
14. ניתוח סטטיסטי
כל הנתונים מבוטאים כממוצע ± סטיית תקן (SD) משלושה ניסויים בלתי תלויים לפחות. המובהקות הסטטיסטית בין הקבוצות נקבעה בשיטות סטנדרטיות, כולל מבחן t של סטודנט או ANOVA חד כיווני, במידת הצורך. ההבדלים נחשבו מובהקים סטטיסטית עבור ערכי P נמוכים מ-0.05.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הקרנה של מרכיבי מפתח של Pileostegia tomentella כנגד סרטן ריאות
סקירה כללית של תכנון הניסוי מוצגת באיור 1. HPLC-LTQ/Orbitrap MS שימש לאפיון שבעה מרכיבים ביו-אקטיביים עיקריים הקיימים ב-Pileostegia tomentella (טבלה 3). לאחר מכן, נערך חיזוי מטרה בסיליקו על תרכובות אלה באמצעות מסד הנתונים SwissTargetPrediction11, וסינן את התוצאות כך שיכללו רק את אלה עם הסתברויות אינטראקציה העולות על 0....
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
סרטן ריאות של תאים לא קטנים (NSCLC) נותר דאגה בריאותית עולמית דחופה, המאופיין בביולוגיה אגרסיבית, התקדמות קלינית מהירה ופוטנציאל גרורתי גבוה, מה שמוביל לעתים קרובות לתוצאות גרועות של המטופלים12. למרות שהתערבויות סטנדרטיות, כגון כריתה כירורגית, הקרנות וכימותרפיה, מציעות תועלת טיפולית במחלה בשלב מוקדם, יעילותן פוחתת בשלבים מתקדמים עקב הופעת עמידות לתרופות ונטל הרעילות המערכתית. הפתוגנזה הבסיסית של סרטן ריאות היא מורכבת ועדיין לא מוגדרת במלואה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגודי אינטרסים להצהיר עליהם.
עבודה זו נתמכה על ידי פרויקט בניית משמעת מפתח ברמה גבוהה של רפואה סינית מסורתית - רוקחות מיעוטים אתניים (בית מרקחת ג'ואנג) מהמינהל הממלכתי לרפואה סינית מסורתית (No. zyyzdxk-2023165); תוכנית טיפוח הכישרונות "פרויקט הנוער" של בית החולים הרפואי הבינלאומי גואנגשי ג'ואנג (מס' 2022001); פרויקט צוות החדשנות הרב-תחומי ברפואה הסינית של גואנגשי (No. GZKJ2309); תוכנית צוות החדשנות לטיפוח כישרונות ברמה גבוהה של אוניברסיטת גואנגשי לרפואה סינית מסורתית (מס' 2022A008); פרויקט המחקר והפיתוח המרכזי של מחלקת המדע והטכנולוגיה של גואנגשי (No. Gui Ke AB21196057); תוכנית הפעולה התלת-שנתית לשנת 2023 לבניית צוות כישרונות ברמה גבוהה של בית החולים הרפואי הבינלאומי גואנגשי ג'ואנג (מס' GZCX20231203, GZCX20231202); האצווה השלישית של "פרויקט צ'יהואנג" תוכנית טיפוח צוות כישרונות ברמה גבוהה של אוניברסיטת גואנגשי לרפואה סינית מסורתית (מס' 202414).
תרומת המחבר:
וון ג'ונג, ליימין ג'יאנג ובינג צ'ינג תרמו באופן שווה לעבודה זו וחולקים את המחבר הראשון. הם היו אחראים בעיקר לתכנון ניסויים, רכישת נתונים ופרשנות של תוצאות. Xiumei Ma ערך ניתוח נתונים ותרם להכנת כתבי היד. שי שיאני, דנג צ'ינגמיי וג'ואו גואנג-יון השתתפו בעיצוב המחקר, איסוף הנתונים ומחקר הספרות. ג'יאנג-צ'ון ווי, המחבר המקביל, פיקח על ניתוח הנתונים ופרשנותו ומילא תפקיד מוביל בניסוח ובתיקון כתב היד.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| נספח V– ערכת זיהוי אפופטוזיס PE / 7-AAD | BD Biosciences | 556547 | זיהוי אפופטוזיס מבוסס ציטומטריית זרימה |
| נוגדן: BAX | אבקם | אב32503 | כתם מערבי לחלבון פרו-אפופטוטי |
| נוגדן: BCL-2 | אבקם | אילן אלכסנדר | כתם מערבי/אימונופלואורסצנציה |
| נוגדן: קספאז-3 שסוע | אבקם | אילן אלכסנדר | כתם מערבי / IF |
| נוגדן: GAPDH | אבקם | אילן אלכסנדר | בקרה פנימית בכתם המערבי |
| נוגדן: PARP1 | אבקם | אילן אלכסנדר | כתם מערבי לסמן אפופטוזיס |
| נוגדן: טובולין | אבקם | אילן אלכסנדר | בקרה פנימית בכתם המערבי |
| ChemDraw | פרקין אלמר אינפורמטיקה | CCG821391 | שרטוט מבנה של מולקולות קטנות |
| מערכת הדמיה כימילומינסנציה | טאנון מדע & טכנולוגיה | טאנון 5200 | להמחשת רצועות חלבון |
| ציטוסקייפ | Cytoscape.org | https://cytoscape.org | בנייה וניתוח של רשתות |
| כתם גרעיני DAPI | סיגמא | D9542 | כתם נגד גרעיני כחול עבור IF |
| דוד | ה-NIH | https://david.ncifcrf.gov | הערות פונקציונליות והעשרת מסלול KEGG |
| DMSO | סיגמא | MFCD00002089 | משמש להמסת גבישי פורמזאן |
| אתנול (למיצוי) | סיגמא | MFCD00003568 | ממס מיצוי בסיוע אולטרסאונד |
| אתיל אצטט | סיגמא | MFCD00009171 | משמש לפיצול ביו-אקטיבי |
| נוגדן משני מצומד FITC | אבקם | אילן אלכסנדר | משמש באימונופלואורסצנציה |
| ציטומטר זרימה | תרמו סיינטיפיק | א29001 | משמש לזיהוי אפופטוזיס ו-ROS |
| מיקרוסקופ פלואורסצנטי | תאגיד אולימפוס | BX53F | להדמיית שקופיות אימונופלואורסצנטיות |
| מייבש הקפאה | תאגיד Labconco | 7670520 | לליופיליזציה ושימור מדגם |
| כרטיסי GeneCard | מכון ויצמן | https://www.genecards.org | מאגר גנים לרלוונטיות למחלה |
| ספקטרומטריית מסה HPLC-LTQ-Orbitrap | תרמו סיינטיפיק | IQLAAEGAAVFACZMAIK | זיהוי תרכובות על ידי MS |
| פלטפורמת ריצוף Illumina NovaSeq | אילומינה בע"מ | 20012850 | משמש עבור RNA-seq |
| ערכת בדיקת ציטוטוקסיות LDH | ביוטיים | ג0016 | למדידת שחרור LDH כאינדיקטור ציטוטוקסיות |
| קורא מיקרופלייט | תרמו סיינטיפיק | VL0000D0 | למדידות ספיגה במבחני MTT ו-LDH |
| ערכת בדיקת כדאיות תאי MTT | ביוטיים | C0009S | משמש לבדיקת MTT להערכת כדאיות התאים |
| מכונת qPCR | תרמו סיינטיפיק | 4485701 | לניתוח ביטוי גנים |
| תוכנת R | קרן R | https://www.r-project.org | מחשוב סטטיסטי והתוויית מסלולים |
| ערכת תמלול הפוך (ערכת RT) | ואזים | מ.ר201 | לסינתזת cDNA |
| ערכת הכנה לספריית RNA-seq | אילומינה בע"מ | 20020594 | הכנת ספרייה לריצוף |
| SwissTargetחיזוי | המכון השוויצרי | http://www.swisstargetprediction.ch | כלי חיזוי מטרה מורכבת |
| SYBR תערובת qPCR ירוקה | ואזים | שאלה 311-02 | עבור PCR כמותי |
| מגיב טריזול (מיצוי RNA) | סיגמא | T3934 | למיצוי RNA כולל |
| מנקה אולטראסוני | ברנסון | M1800-CPXH | למיצוי בסיוע אולטרסאונד |
| מנגנון הכתם המערבי | תרמו סיינטיפיק | א56727 | אלקטרופורזה של ג'ל והעברת חלבונים |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.