פרופיל RNA-seq של בלוטות לימפה מנקזות וגרורתיות בסרטן שד HER2 חיובי מזהה את POSTN כסמן פרוגנוסטי

Xiurong Zhang; Fei Xu; Jiehui Yang

doi:10.3791/69570

Research Article

פרופיל RNA-seq של בלוטות לימפה מנקזות וגרורתיות בסרטן שד HER2 חיובי מזהה את POSTN כסמן פרוגנוסטי

DOI:

10.3791/69570

⸱

January 16th, 2026

Xiurong Zhang*¹ , Fei Xu*² , Jiehui Yang¹

¹Department of Breast Surgery, Boai Hospital of Zhongshan, ²Department of Surgery, Boai Hospital of Zhongshan

Summary

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

אנו חושפים תוכנית ממוקדת מטריצה חוץ-תאית ו-PI3K-AKT הבסיס להפצת בלוטות לימפה בסרטן שד HER2 חיובי, ומזהים את POSTN כסמן פרוגנוזה לקויה, התומך בסטרטיפיקציה של סיכון ואסטרטגיות טיפוליות מונחות מסלול.

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

סרטן השד החיובי ל-HER2 הוא אגרסיבי קלינית ולעיתים קרובות מתפשט לבלוטות לימפה אזוריות, אך התוכניות הטרנסקריפטומיות הקשורות להתפשטות בלוטות נשארות לא מוגדרות במלואן. כאן, פרופילנו בלוטות לימפה מנקזות גידול (TDLN) וקשרי לימפה מעורבים בגידול גרורתי (TMLN) משש מטופלות עם סרטן שד חיובי ל-HER2 באמצעות ריצוף RNA (RNA-seq). ניתוח ביטוי דיפרנציאלי בוצע עם DESeq2, תוך שימוש בתיקון Benjamini-Hochberg (FDR < 0.05) וסף שינוי קיפול log2 מוחלט (|log2FC| ≥ 1). זיהינו 237 גנים מבוטאים באופן שונה (182 בוויסות גבוה ו-55 בוויסות נמוך ב-TMLN לעומת TDLN). ניתוחי העשרה פונקציונלית הדגישו אינטראקציה בין מטריצה חוץ-תאית (ECM) לקולטנים, איתות PI3K-AKT, הידבקות מוקדית ומטבוליזם של כולסטרול כמסלולים בולטים הקשורים לבלוטות לימפה גרורות, מה שמרמז על עיצוב מחדש מתואם של ECM והפעלה של איתות במהלך הפצת הצמתים. מבין הגנים המוסדרים ביותר, POSTN הפך למועמד מרכזי ונקשר לתכונות קליניקופתולוגיות שליליות. בקוהורט אימות עצמאי (n = 120), ביטוי POSTN גבוה יותר היה קשור להישרדות נחותה ללא מחלות. ביחד, תוצאות אלו מציבות את POSTN כסמן ביולוגי פרוגנוסטי פוטנציאלי ותומכות במנגנונים ממוקדי ECM ובמנגנונים הקשורים ל-PI3K-AKT כמאפיינים ביולוגיים ניתנים ליישום של גרורות בלוטות לימפה בסרטן שד חיובי ל-HER2.

Introduction

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

סרטן השד (BC) הוא הסרטן המאובחן ביותר בנשים וגורם מוביל לתמותה מסרטן ברחבי העולם, עם נטל משמעותי וגובר בסין¹. כ-15%-20% מהגלולות הם חיוביים ל-HER2 (HER2+), המאופיין בהגברה/ביטוי יתר של ERBB2 ופנוטיפ אגרסיבי עם סיכון גבוה יותר להישנות ומוות ^2,3. למרות שטיפול מערכתי נגד HER2 שיפר משמעותית את התוצאות, חלק ניכר מהמטופלים עדיין חוזרים או מפתחים גרורות, מה שמדגיש את הצורך בסטרטיפיקציה ביולוגית לסיכונים ואפשרויות טיפוליות חדשות⁴.

גרורות בלוטות לימפה (LNM) היא גורם מרכזי בשלב השלבים, בחירת טי....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

מחקר זה אושר על ידי ועדת האתיקה המוסדית ובוצע בהתאם להצהרת הלסינקי ולתקנות המקומיות המסדירות את השימוש בדגימות ביולוגיות אנושיות. מחקר זה אושר על ידי ועדת האתיקה של בית החולים בואאי בג'ונגשאן (KY-2020-012-124). הסכמה מדעת בכתב התקבלה מכל המשתתפים לפני כל הליך ספציפי למחקר.

קבוצות מחקר ודגימות
קבוצת הגילוי כללה רקמות זוגיות של קשרי לימפה מנקזות גידול (TDLN) ורקמות קשרית לימפה גרורתיות (TMLN) שנאספו במהלך הניתוח מ-6 מטופלות עם סרטן שד חיובי ל-HER2. עבור כל מטופל, ה-TDLN התואם הוגדר כבלוטת לימפה מנקזת ללא עדות היסטולוגית לגרורות ושימש כמשוואה לביקורת בתוך המטופל, בעוד שה-TMLN הייתה רקמה גרו....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

קוהורטות ומאפיינים קליניקופתולוגיים
קבוצת הגילוי כללה 6 דגימות TDLN/TMLN זוג, וקוהורט האימות כלל 120 דגימות ארכיון של בלוטות לימפה עם מעקב לאורך זמן. המאפיינים הקליניים-פתולוגיים הבסיסיים של שתי הקבוצה, כולל גיל, גודל הגידול, דרגה, מצב הקולטנים ומצב הצומת, מסוכמים בטבלה 1.

איכות ריצוף ומבנה נתונים גלובלי
כל 12 ספריות הגילוי השיגו ממוצע של כ-30 מיליון זוגות קריאה לכל דגימה, כאשר Q30 ≥ 90% ושיעורי המיפוי >.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

סרטן השד החיובי ל-HER2 מאופיין בפולשניות מוגברת, גרורות תכופות בבלוטות הלימפה (LNM) ותוצאות נחותות למרות הטיפול המערכתי המודרני¹⁵. גורמים קליניים-פתולוגיים קונבנציונליים מסבירים רק חלקית את הפרוגנוזה בתת-סוג זה, ומשאירים פער לסמנים מבוססי ביולוגיה שלוכדים את הסיכון להתפשטות נודלים¹⁶. על ידי פרופיל השוואתי של בלוטות לימפה מנקזות גידול (TDLN) וקשרי לימפה גרורתיות (TMLN) תואמים עם RNA-seq, זיהינו 237 גנים מבוטאים באופן שונה (DEGs) המת.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

המחברים הצהירו שאין ניגודי עניינים בעבודה זו.

Acknowledgements

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

עבודה זו נתמכה על ידי פרויקטי מחקר רפואי של לשכת הבריאות והרווחה העירונית של ג'ונגשאן (2021J452).

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
Name	Company	Catalog Number	Comments
ביואנלייזר	2100-BA	אגילנט, ארה"ב	ציוד להערכת שלמות ה-RNA ובקרת איכות.
DESeq2	לא זמין	R ביו-קונדוקטור	תוכנת ניתוח ביטוי דיפרנציאלי לנתוני RNA-seq.
תוכנת FastQC	לא זמין	בברהם ביואינפורמטיקה	תוכנת בקרת איכות לנתוני RNA-seq להערכת איכות רצפים.
קו התאים HEK293	ATCC-CRL-1573	ATCC, ארה"ב	קו תאי הכליה העובריים האנושיים המשמש לניסויי טרנספקציה.
ערכת qRT-PCR	4385616	תרמופישר, ארה"ב	ערכת PCR כמותית לאימות ביטוי גנים.
ערכת חילוץ RNA	74204	קיאגן, גרמניה	ערכת חילוץ RNA המשמשת לבידוד RNA איכותי מדגימות רקמה.
ערכת ריצוף RNA	RS-122-2001	אילומינה, ארה"ב	ערכת הכנת ספריית RNA לריצוף דגימות RNA.
פלטפורמת ריצוף	NovaSeq 6000	אילומינה, ארה"ב	פלטפורמת ריצוף RNA בתפוקה גבוהה לריצוף ספריות RNA.
ציוד הקפאת רקמות	TFE-300	תרמו פישר, ארה"ב	ציוד להקפאת דגימות רקמה בחנקן נוזלי.
מדחום תמפני	55678-TT	תרמוסיינס, יפן	מדחום מדויק המשמש למדידת טמפרטורת גוף.

References

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Han, B., et al. Cancer incidence and mortality in China, 2022. J Natl Cancer Cent. 4 (1), 47-53 (2022).
Schettini, F., et al. Clinical, pathological, and PAM50 gene expression features of HER2-low breast cancer. NPJ Breast Cancer.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

פרופיל RNA-seq של בלוטות לימפה מנקזות וגרורתיות בסרטן שד HER2 חיובי מזהה את POSTN כסמן פרוגנוסטי

In This Article

Summary

Abstract

Introduction

Protocol

Results

Discussion

Disclosures

Acknowledgements

Materials

References

Reprints and Permissions

Tags

Related Articles