פרוטוקול זה מציג מבחן בזמן אמת מבוסס התנגדות לכימות את יכולת ההרג הסדרתי וההתמדה של תאי CAR T תחת גירוי אנטיגן כרוני, תוך שילוב שיטת שטיפת לוחות לשימוש חוזר חסכוני בלוחות הבדיקה.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מציג מבחן בזמן אמת מבוסס התנגדות לכימות את יכולת ההרג הסדרתי וההתמדה של תאי CAR T תחת גירוי אנטיגן כרוני, תוך שילוב שיטת שטיפת לוחות לשימוש חוזר חסכוני בלוחות הבדיקה.
טיפול בתאי קולטני אנטיגן כימרי (CAR) חולל מהפכה בטיפול במלמאירויות המטולוגיות ספציפיות. עם זאת, חלק משמעותי מהמטופלים חווים הישנות עקב אובדן אנטיגן, ירידה באנטיגן או תשישות תאי T. אתגרים אלו מדגישים את הצורך בבדיקות פונקציונליות שיכולות להעריך את יכולת ההרג וההתמדה של תאי CAR T תחת גירוי אנטיגן כרוני. בדיקות הרג סדרתי, שמודדות את יכולת תאי CAR T לחסל שוב ושוב מטרות גידול, מספקות תובנות חשובות לגבי העמידות והעוצמה של תגובות תאי CAR T.
כאן, אנו מציגים בדיקה מבוססת התנגדות באמצעות מערכת ניתוח תאים בזמן אמת (RTCA) לכימות רצח סדרתי בתאי CAR T במבחנה. תאי הגידול עוברים זריעה חוזרת ומורשים להיצמד ללוחות E ספציפיים לבדיקה לפני הוספת תאי CAR T ביחס אפקטור למטרה (E:T) מוגדרים. הפלטפורמה עוקבת באופן רציף אחר חיוניות תאי הגידול ללא תוויות, ולוכדת ציטוטוקסיות דינמית ברזולוציה זמנית גבוהה. הקריאות המרכזיות כוללות קינטיקה של מדד התאים (CI), קצב השמדת תאי הגידול, וזמן הפינוי למטרה. הירידה ההדרגתית ביכולת ההרג שנצפתה לאחר פגיעות חוזרות במטרה של גידול משמשת כסימן לתפקוד לקוי של תאי CAR T נרכשים, המכונה לעיתים תשישות תאי T. יחד, מדדים אלו מאפשרים הערכה מדויקת של תפקוד תאי CAR T ביחסי E:T שונים ומאפשרים השוואה ישירה בין מבנים או טיפולים משותפים שונים של תאי CAR T לאורך זמן.
כדי לשפר את היעילות בעלויות, פיתחנו הליך שטיפת לוחות שמאפשר שימוש חוזר בלוחות E של הבדיקה מבלי לפגוע בביצועי הבדיקה או בשלמות הנתונים. זרימת העבודה האופטימלית מפחיתה את עלות הבדיקה תוך שמירה על עמידות אנליטית. גישה זו מאפשרת הערכה פרה-קלינית משתלמת וניתנת להרחבה של תפקוד תאי CAR T, ומקלה על שיפורים בעיצוב טיפול בתאים.
טיפול בתאי T מסוג קולטני אנטיגן כימרי (CAR) חולל מהפכה באימונותרפיה בסרטן עם הצלחה קלינית מרשימה במגוון ממאירות המטולוגית כגון לוקמיה לימפואידית כרונית, לוקמיה לימפובלסטית חריפה, לימפומה גדולה מסוג B ומיאלומה נפוצה 1,2,3,4,5. מאז האישורים הרגולטוריים הראשונים, מספר מוצרי תאי CAR T והמטופלים שטופלו גדל בהתמדהב-6. בהתאם למוצר הספציפי ולאינדיקציה הקלינית, מינוני עירוי טיפוסיים נעים בין כ-2 × 106ל-5 × 108תאי CAR+ T לכל מטופל7. מינוני עירוי גבוהים נדרשים להשגת ניקוי יעיל של גידול ושליטה ארוכת טווח במחלה, אך הם קשורים לאתגרים קליניים ומעשיים. מספר תאים גדול עלול להעלות את הסיכון לתופעות לוואי חמורות כמו תסמונת שחרור הציטוקינים (CRS) ותסמונת הנוירוטוקסיות הקשורה לתאי אפקטור חיסון (ICANS), שתיהן יכולות להיות תלויות במינון8. בנוסף, ייצור מספיק של תאי CAR T פונקציונליים הוא אתגר עבור מטופלים מטופלים מטופלים מוקדמים או עם לימפודדות כבדה, והתהליך עלול להיות תובעני לוגיסטית ויקר למרכזי טיפול9.
למרות אתגרים אלו, טיפולי תאי CAR T המיועדים ל-CD19 משיגים שיעורי הפוגה מלאה של 70%-90% בחולים עם ממאירות תאי B שנפלו או עמידים, ומדגימים השפעה קלינית טרנספורמטיבית 10,11,12. עם זאת, טיפול בתאי CAR T מתמודד עם אתגרים רלוונטיים שמגבילים את יעילותו לטווח הארוך. מכשולים מרכזיים כוללים אובדן או ירידה בוויסות האנטיגן, עמידות לא מספקת של תאי CAR T ועייפות תפקודית9. תשישות תאי T ב-CAR - המאופיינת ביכולת רבייה מופחתת, פגיעה בפעילות אנטי-גידולית והתמדה לקויה - מהווה סיבה חיונית לאי-תגובה ולהישנות13. תאי CAR T מותשים מגיעים עם תפקוד אפקטור מופחת, ביטוי מתמשך של קולטנים מעכבים, וייצור ציטוקינים פגום עקב חשיפה כרונית לאנטיגנים ומיקרוסביבות גידול מדכאות חיסון14. מחקרים קליניים הראו כי אובדן ההתמדה התפקודית של תאי CAR T קשור לסיכון מוגבר להישנות 11,15,16,17. מכיוון שפעילות ממושכת ב-vivo נראית כמנבא מרכזי להצלחה טיפולית, הבנת העמידות והיכולת ההרג המתמשכת של מוצרי תאי CAR T היא מטרה חשובה הן במחקר פרה-קליני והן במחקר תרגומי. מעניין במיוחד הוא היכולת של תאי CAR T לזהות וללזה תאי גידול לאורך תקופות ממושכות – מה שמכונה 'הרג סדרתי' – שכן תכונה זו מספקת מדד פונקציונלי להתמדה ועמידות לעייפות18.
מאמר זה מספק פרוטוקול מפורט לביצוע בדיקות הרג סדרתי באמצעות פלטפורמת ההתנגדות xCELLigence Real-Time Cell Cell Analysis (RTCA), כולל הליך שטיפה אופציונלי שמאפשר שימוש חוזר בלוחות הבדיקה, המכונים גם E-plates, ובכך משפר את יעילות העלות מבלי לפגוע בביצועי הבדיקה. ההיגיון בפיתוח פרוטוקול כזה נובע ממגבלות בבדיקות ציטוטוקסיות קונבנציונליות, שבדרך כלל מציעות רק קריאות סטטיות בנקודת קצה. גישות נפוצות, כגון שחרור כרום-51, בדיקות לקטט דה-הידרוגנאז (LDH), או בדיקות היתכנות מבוססות ציטומטריית זרימה, דורשות תוויות, כוללות תהליכי עבודה עתירי עבודה, ומוגבלות לנקודות זמן מוגדרות18,19. חשוב מכך, הם אינם יכולים ללכוד בקלות קינטיקה דינמית של הרג במהלך גירוי ממושך או חשיפה מרובת לאנטיגן, מצב הקשור ישירות להתמדה של תאי CAR T ולעייפות תפקודית18.
פלטפורמת xCELLigence RTCA מתמודדת עם פערים אלו על ידי מתן ניטור קינטי בזמן אמת, ללא תוויות ובזמן אמת של עמידות תא המטרה באמצעות התנגדות חשמלית20. תאי המטרה הדביקים של הגידול מוזרעים על לוחות E מצופים זהב במיקרואלקטרודות, כאשר ההצמדה והתרבות שלהם מגבירה את ההתנגדות הנמדדת, המדווחת כמדד התאים (CI)21. בעת הריגה בתיווך CAR T, תאי המטרה נהרגים ומתנתקים, מה שמוביל לירידה מהירה בהתנגדות20. קריאה בזמן אמת זו מאפשרת הערכה רציפה של ציטוטוקסיות במשך שעות או ימים ללא צורך בתוויות או חומרים נוספים22. תאי CAR T, שהיו לא דבקים, אינם תורמים לאות ההתנגדות, מה שמאפשר הפרדה נקייה בין קריאות האפקטור למטרה23. מכיוון שהנתונים נרשמים ברציפות, חוקרים יכולים לבצע פרוטוקולי גירוי רב-סבבים שבהם תאי T של CAR מועברים ונחשפים שוב ושוב לתאי מטרה טריים של גידול, מה שמאפשר מדידה ישירה של התפתחות יכולת ההרגלאורך זמן. זה מחקה את המפגשים החוזרים של אנטיגן שתאי CAR T חווים ב-vivo ומספק קריאה פונקציונלית של היכולות הציטוטוקסיות שלהם.
מבחן הרג סדרתי מבוסס אימפדנס זה מתאים במיוחד לחוקרים שמעריכים את תפקוד תאי CAR T בהקשרים פרה-קליניים, כולל אופטימיזציה של מבנה, השוואות פונקציונליות ובדיקות עוצמה. פרוטוקול זה דורש את מערכת xCELLigence RTCA ושימוש ב-E-Plate 96. למרות שהוא חל באופן רחב על מודלים דבקים של גידול, הוא אינו מתאים ישירות לתרביות השעיה ללא אסטרטגיות קיבוע או קשירה. מכיוון שמדידות התנגדות לבדן משקפות רק את ההיצמדות והחיוניות לתאי היעד, מומלץ לבצע ניתוחים משלימים כגון ציטומטריית זרימה או בדיקות ציטוקינים כדי לאפיין באופן מלא את הפעלה, התרבות ודינמיקת התשה של תאי CAR. הפרוטוקול כולל שלבים ייעודיים המאפשרים איסוף תאים וסופרנטנטים לקריאות נוספות אלו, ומאפשרים הערכה מקיפה יותר של תפקוד תאי CAR T.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: פרוטוקול זה מותאם ל-E-Plate 96 ודורש מערכת xCELLigence RTCA. תאי הגידול הדבקים נזרעים בלילה מראש כדי להגיע לשלב הגידול הלוגריתמי בזמן הוספת תאי CAR T. בהתאם לקו תאי הגידול ולצפיפות הזריעה, ניתן לקצר את התקופה ל-6 - 9 שעות, מה שמאפשר הוספת אפקטור באותו יום. אם תהליך העבודה השני מתבצע, ציר הזמן היומי הנומינלי המתואר בפרוטוקול משתנה, והמשתמשים צריכים להתאים את לוח הזמנים בהתאם. קו-קולטורות נשמרות במשך 48 שעות לפני שתאי CAR T מועברים לתאי גידול שצופים זה עתה, מה שדורש שתי עמדות לוחות במכשיר xCELLigence והחלפת ציפוי תאי הגידול והוספת אפקטור כל יומיים. תאי CAR T צריכים להיווצר בהתאם לנהלים מוסדיים או פרוטוקולים מבוססים. בקצרה, תאי T הדם ההיקפיים מבודדים תחת תקנים אתיים מאושרים, מועברים בתנאי בטיחות ביולוגית מתאימים, ומוערכים ליעילות ויכולת המעבר באמצעות ציטומטריית זרימה או בדיקות QC מקבילות. בדיקות xCELLigence אינן צריכות להתבצע כאשר יעילות הטרנסדוקציה של CAR נמוכה מ-20%, שכן יעילות נמוכה יותר עלולה להוביל להגברת הרקע והרג לא ספציפי על ידי תאים לא מועברים, מה שעלול לעוות את עקומות הצמיחה של הגידול. כל טיפול בתא צריך להתבצע בתנאים סטריליים במכסה זרימה למינרי. מדיה יכולה לשמש לפי תקן המעבדה או לפי המלצת הספק. אלא אם צוין אחרת, תאים מודגרים בטמפרטורה של 37°C באטמוספירה לחה המכילה 5% CO₂. למרות ששיטה זו מותאמת לתאי CAR T, ניתן ליישם אותה גם על תאי אפקטור מבוססי מתלה ומטרות דבקות.
1. הכנה והתעלמות (יום 1)
2. סבב 1: זריעת תאי גידול (יום 1)
3. סבב 1: טיפול בתאי T ב-CAR (יום 2)
4. סבב 2: זריעת תאי גידול (יום 3)
5. סיבוב 2: העברת תא T של CAR ללוחית E השנייה (יום 4)
6. המשך מבחן הרצח הסדרתי (ימים 5 - 10 ואילך)
7. איסוף נתונים וטיפול בלוחות אלקטרוניים
8. אופציונלי: שטיפת לוחות אלקטרוניים לשימוש חוזר
הערה: שלב אופציונלי זה מאפשר שימוש חוזר בלוחות ה-E של xCELLigence כדי להפחית עלויות ניסוי. שימוש חוזר מומלץ רק אם התכונות החשמליות של לוח ה-E נשארות יציבות לאורך הניסויים ועד שבארות בודדות נכנסות לטווח הבסיס המקובל. יש לעקוב אחרי כל נהלי הבטיחות, במיוחד בעת טיפול בנתרן הידרוקסיד (NaOH). בדקו ויזואלית את פלטות ה-E לאחר הכביסה כדי לזהות תקלות פוטנציאליות באלקטרודות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ביצוע מוצלח של הפרוטוקול מניב קריאות מבוססות התנגדות שחוזרות המשקפות את חיוניות תאי הגידול ואת הציטוטוקסיות של תאי CAR T לאורך זמן. צמיחת התאים וציטוטוקסיות הוערכו באמצעות מערכת RTCA מסחרית. הנתונים הוצגו כמדד תאים מנורמל (NCI), שחושב על ידי חלוקת ה-CI בכל נקודת זמן ב-CI בזמן נרמול נבחר. זמן הנרמול נקבע מיד לפני הוספת תאי האפקטור. זמן הפינוי מוגדר כמרווח עד שה-NCI מגיע לאפס לאחר הוספת אפקטור. NCI מחושב על ידי תוכנת RTCA וניתן לייצא אותו לניתוח נוסף, כולל קצב הרג וזמן לאישור, באמצעות תוכנות סטטיסטיות כמו GraphPad Prism. נ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מתאר שיטה להערכת ציטוטוקסיות המתווכת על ידי תאי CAR T במהלך מספר סבבים של חשיפה לאנטיגן באמצעות פלטפורמת xCELLigence RTCA. על ידי מתן מדידה לאורך זמן של חיוניות תאי הגידול באמצעות אימפדנס, גישה זו לוכדת תגובות ציטוטוקסיות חזרתיות - המכונות הרג סדרתי - בפורמט רציף וללא תוויות. הפרוטוקול נועד לנטר כיצד תפקוד אפקטור תאי T משתנה לאורך זמן בתגובה לאתגרים חוזרים של תאי הגידול, ומספק תובנות לגבי פרמטרים כמו התמדה תפקודית, תשישות מוקדמת ודינמיקת הריגה כוללת (איור...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
SK קיבלה שכר כבוד מ-Plectonic, TCR2 Inc., Miltenyi, Galapagos, Cymab, Novartis, Regeneron, BMS ו-GSK. SK הוא ממציא של מספר פטנטים בתחום האימונו-אונקולוגיה. SK קיבלה דמי רישיון מ-TCR2 Inc ומ-Carina Biotech. SK קיבלה תמיכה מחקרית מ-TCR2 Inc., Tabby Therapeutics, Catalym GmbH, Plectonic GmbH ו-Arcus Bioscience עבור עבודות שאינן קשורות לכתב היד. כל שאר המחברים מצהירים שאין להם אינטרסים מתחרים.
TT, SM ו-NTTN קיבלו מענקים מ-Else-Kröner Fresenius Stiftung (IOLIN). NTTN קיבלה מענקים נוספים מ-Friedrich-Baur-Stiftung ומ-German Cancer Aid (AvantCAR.de). MPT נתמכת על ידי קרן מוניקה קוצנר והמועצה האירופית למחקר (MSCA Fellowship 101106951). SK נתמכת על ידי תוכנית הדוקטורט הבינלאומית 'i-Target: immunotargeting of Cancer' (במימון רשת האליטה של בוואריה), מרכז מחקר הסרטן הבווארי (BZKF) (TANGO to S.K.), Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, מספר מענק: KO5055-2-1 ו-KO5055/3-1), ברית מחקר המלנומה (מספר מענק 409510), רשת ההכשרה מארי סקלודובסקה-קירי לאופטימיזציה של טיפול תאי T אימוץ בסרטן (ממומנת על ידי תוכנית Horizon 2020 של האיחוד האירופי; מענק 955575), רשת ההכשרה מארי סקלודובסקה-קירי למעקב ושליטה בתאי חיסון טיפוליים בסרטן (ממומנת על ידי תוכנית Horizon של האיחוד האירופי, מענק 101168810), Else Kröner-Fresenius-Stiftung (IOLIN), German Cancer Aid (AvantCAR.de), Wilhelm-Sander-Stiftung, Ernst Jung Stiftung, Institutional Strategy LMUמצוין של LMU מינכן (במסגרת יוזמת המצוינות הגרמנית), Go-Bio-Initiative, פרס m4 של משרד הכלכלה של בוואריה, Bundesministerium für Bildung und Forschung, EUROSTAR-Programm, המועצה האירופית למחקר (Starting Grant 756017, PoC Grant 101100460 ו-CoG 101124203), על ידי SFB-TRR 338/1 2021-452881907, קרן Fritz-Bender, קרן Deutsche José Carreras Leukämie Fund, קרן הקטור, קרן המחקר הבווארית (BAYCELLATOR), קרן מוניקה-קוצנר, קרן ברונו והלנה יוסטר (360° CAR), קרן ד"ר רוריינסקי וקרן בריג'יט וד"ר קונסטנצה וגנר
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| BxPC3 | ATCC | CRL-1687 | |
| E-Plate 96 | Agilent | 300600910 | |
| תוכנת RTCA Pro (Basic) | Agilent | לא זמין | גרסה 2.6.1 |
| xCELLigence RTCA MP - (מספר לוחות) | Agilent | לא זמין |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה